DCB Tekniske anbefalinger BLOD_v4/

Transkript

1 ANBEFALINGER FOR BLOD TIL DANSK CANCERBIOBANK BLOD Data om laboratoriet Som baggrundsinformation om prøvetagning registreres følgende i registreringsmodulet for Dansk CancerBiobank (DCB): Centrifugeringstid, g-tal og centrifugeringstemperatur (stuetemperatur eller 4 C). Det anbefales at centrifugere ved 2000 g (g=rcf), 10 min, 4 C. (g=0, *r*rpm 2, eksempelvis 4500 RPM ved rotorradius 9 cm svarer til 2038 g). Klotningstemperatur for serum-rør/serum-gel-rør (stuetemperatur eller 4 C) optimalt 4 C. Producent og katalognummer for blodprøverør, mikrorør og fryser. Fryserindretning i form af antal søjler (racks), bokse og antal positioner i den enkelte boks. Fryser kan navngives, mens forkortelse tildeles automatisk af webmodul. Fryser, racks og bokse i fryser mærkes med etiketter udskrevet fra DCB registreringsmodul (Tabel 1). Frysere oprettes lokalt eller centralt afhængig af brugerrettigheder i registreringsmodulet. Praktisk procedure Håndtering (Figur 1,Tabel 2) DCB gemmer korresponderende blod- og vævsprøver. Blodprøver tages indenfor maksimalt 14 dage før operation/behandlingsstart. I tilfælde af længere tidsinterval anbefales fornyet blodprøvetagning. Veneblod tappes i laboratoriets gængse EDTA-rør samt serum-rør/serum-gel-rør, der behandles som laboratoriets andre blodprøver. Som standard anbefales serum-rør; ved længere transport før håndtering kan som alternativ anvendes serum-gel-rør, der da centrifugeres før transport. Efter modtagelse i laboratoriet opbevares blodprøver optimalt ved 4 C, indtil de præpareres. Det anbefales, at man tilstræber en maksimal håndteringstid på 3 timer regnet fra blodprøvetagning til indfrysning. Blodprøver, der modtages udenfor normal arbejdstid, bør stå på køl til næste dag. Dato og klokkeslæt for blodprøvetagning, modtagelse i laboratoriet og nedfrysning registreres. Tidspunkt for centrifugering kan evt. registreres. Der opbevares fraktioner af: 1 EDTA-fuldblod, 2 EDTA-plasma, 1 EDTA-buffy coat og 4 serum (Tabel 3). Ved begrænset kapacitet/materiale er prioriteringsrækkefølgen fuldblod serum plasma/buffy coat. Mikrorør til opbevaring af prøver bør være forsynet med tætsluttende skruelåg med gummi O- ring. Det anbefales at anvende mikrorør og skruelåg, der er certificeret fri for DNaser, RNaser og humant DNA. Det anbefales at bruge handsker ved håndtering af prøver i laboratoriet. Se Tabel 4 for vejledende indkøbsinformationer vedr. utensilier.

2 Registrering og mærkning af blodprøver Blodfraktioner registreres online i DCB registreringsmodul via patientens CPR-nr. Som basisoplysninger for den enkelte prøve registreres følgende: Blodprøvetagende laboratorium (SOR afdelingskode), evt. eksternt prøvenr., tidspunkter for materiale udtaget af patient og for materiale modtaget i laboratoriet, kræfttype i form af formodet primært organ (Tabel 5) oplysninger om patientsamtykke til opbevaring af materiale i biobank, transporttemperatur samt projektoplysninger ved evt. tilknytning til forskningsprojekt (navn på projektet samt eventuelt projekt ID). Evt. afvigelser fra nærværende standard operating procedures (fx temperaturændring, apparatursvigt, optøningsepisoder) registreres i registreringsmodulet under supplerende oplysninger. Registreringsmodulet tildeler hver prøve et unikt biobank løbenummer - det næste ledige fra en national nummerrulle, f. eks. 02DK : metodik for blodnummer = nummerrulle DK: Danmark : Afdelingsklassifikationskode (SKS) for indleverende afdeling = laboratorium 11: årstal (2011) 00: anvendes ikke for blod : biobank blodprøvenummer fra national nummerrulle, så tallet vil altid være højere end sidst tildelte nummer.00: altid 00 for blod (anvendes kun for væv) -01: biobank materialenummer, ingen reference til -type..02: biobank fraktionsnummer. Det pågældende materiales fraktioner nummereres fortløbende - alt efter antal fraktioner - med 01 som den første (anbefalet 8 fraktioner hørende til hvert materiale) Fra registreringsmodulet udskrives etiketter til mikrorør til opbevaring af prøver (Tabel 3). Af etiketten fremgår år og biobank blodprøvenummer, materiale- og fraktionsnummer, afdelingskode, biobankcenter, formodet primært organ, fraktionstype og evt. eksternt prøvenummer (i eksemplet rekvisitionsnummer fra LIMS). Biobank blodprøvenummer er samtidig indeholdt i 2D stregkoden. Det eksterne prøvenummer kan f. eks. anvendes til at sikre prøveidentitet ved håndtering af flere prøver på én gang ved at koble den pågældende prøve med den medfølgende blodprøveseddel fra Labka. Opbevaring Serum og plasma opbevares ved -80 C. Fuldblod og buffy coat opbevares ved -20 C, alternativt ved -80 C. Fryser, racks og bokse i fryser mærkes med etiketter udskrevet fra DCB registreringsmodul (Tabel 1) Frysere tilkobles alarm for temperaturstigning samt instruks for aktion ved driftsstop. Det anbefales endvidere at udarbejde instruks for manuel overvågning af frysere, samt at tilslutte frysere et system for enten temperatur logning, hvor den absolutte temperatur hen over døgnet fremgår, eller et system hvor evt. afvigelser udover fastsatte grænseværdier kan ses.

3 Fyldte vanddunke placeret i en halvtom fryser kan forsinke optøning af prøver i tilfælde af driftsstop. En tom -80 C reservefryser skal være til rådighed til brug ved driftsstop; reservefryseren anbefales at være forafkølet.

4 Figur 1. Blodprøver Dansk CancerBiobank 1 9 ml EDTA rør LILLA 2 ~9 ml serum / 2 ~8 ml serum gel ,5 ml EDTA-fuldblod Fuldblod afpipetteres Centrifugering Centrifugering ml EDTA-plasma 04 Buffy coat (hvidt mellemlag) ml serum 1 EDTA-buffy coat Prioritering: Fuldblod serum plasma/buffy coat

5 Blodfraktioner i Dansk CancerBiobank Tabel 1. Etiketter til fryser Fryser Rack Boks Påsættes bund og låg (2 etiketter udskrives automatisk) Tabel 2. Oversigt Prøvetagningsrør Håndtering Fraktioner til opbevaring Slutopbevaring Afpipettering af velblandet fuldblod 1 1,5 ml EDTA-fuldblod -20 C eller -80 C 1 ~9 ml K2-EDTA rør Centrifugering Afpipettering af plasma 2 2 ml EDTA-plasma -80 C Afpipettering af buffy coat* 1 1,5 ml EDTA-buffy coat* -20 C eller -80 C Koagulation 30 min. 2 ~8 ml serum rør/serum-gel rør Centrifugering Afpipettering af serum 4 2 ml serum -80 C * Buffy coat: nederste del af plasma, hvide mellemlag og øverste del af erythrocytter Tabel 3. Klargøring af mikrorør optimalt 8 fraktioner (rør)/deltager Fraktion Antal Etiket eksempel Oplysninger på etiket Fuldblod 1 år, biobank blodprøvenummer afdelingskode, materiale- og Plasma 2 fraktionsnummer biobankcenter Buffy coat 1 formodet primært organ fraktionstype Serum 4 evt. eksternt prøvenummer 2D kode med biobank blodprøvenummer

6 Tabel 4. Indkøbsinformationer (vejledende) Blodprøverør K2-EDTA Blodprøverør K3-EDTA Blodprøverør Serum Blodprøverør Serum-gel Blodvender Etiket til 2,0ml mikrorør Produkt Størrelse Producent Katalognr. Leverandør Kontakt BD Vacutainer EDTA-rør (K2) Vacuette. K2-EDTA Venosafe plastikrør K2-EDTA Vacuette. K3-EDTA Venosafe plastikrør K3-EDTA BD Vacutainer Serum-rør Vacuette. Serum Clot Activator Venosafe plastikrør Serum BD Vacutainer Serumseparations-rør SST TM II Advance (Gel) Vacuette. Serum Sep Clot Activator (Gel) Venosafe plastikrør Serum Gel MIXER MINI NUTATING 230V EU. Minimikser med 3D bevægelse Polyamide coated nylon, klæbestof permanent akryl, godkendt til -196 C Volumen 10 ml Volumen 9 ml Becton Dickinson Greiner Bio-One BD Hettich Volumen 9 ml Terumo VF-109SDK Terumo Volumen 9 ml Greiner Bio-One Hettich Volumen 4 ml Terumo VF-054STK Terumo Volumen 10 ml Volumen 9 ml Becton Dickinson Greiner Bio-One BD Hettich Volumen 9 ml Terumo VF-109SP Terumo Volumen 8,5 ml Volumen 8 ml Becton Dickinson Greiner Bio-One BD Hettich Volumen 8 ml Terumo VF-108SAS Terumo 38,1mm 19,05mm Rullestørrelse stk. Brady THT VWR - Bie & Berntsen A/S Chemo Electric A/S Tlf Tlf Tlf Tlf Tlf Tlf Tlf Tlf Tlf Tlf Tlf Tlf Tlf Pris, DKK (marts 2013) Listepris 2750,- (maj 2011) DKK 1.905,- Obs. Etiketten overlapper sig selv rundt om mikrorør

7 Etiket til 2,0ml mikrorør Produkt Størrelse Producent Katalognr. Leverandør Kontakt Polyester klæbestof akryl 310 testet til -40 C 20mm 25mm 3M (3M label 7816E) Klimax A/S Fryserrack til 11 æsker/bokse Buch & Holm Fryseæske Mikrorør 1,5 ml Mikrorør 2,0 ml PP Neonorange PP Rød PP Neongul PP Hvid U.skruelåg Polypropylene u.fod m.grad. Neutr. U.skruelåg Polypropylene u.fod m.grad. Neutr. 52x130mm 9x9rum 52x130mm 9x9rum 52x130mm 9x9rum 52x130mm 9x9rum 1,5ml pose á 500 stk 2,0ml pose á 500 stk Scientific Specialties Inc. Scientific Specialties Inc. NA-KEA50- C81NO NA-KEA50-C81RE NA-KEA50-C81NY NA-KEA50- C81WH SS SS Pipetter Transferpipetter 3,5 ml Sarstedt Skruelåg Skruelåg til mikrorør Neutral, m. O-ring (findes også i farver) Scientific Specialties Inc. SS Hounisen laboratorieudstyr In Vitro Tlf Tlf Pris, DKK (marts 2013) Stykpris 25 øre ved min stk. (okt. 2009) 20,70 20,70 20,70 20,70 98,- 98,- > 500 stk. 0,27 kr/stk. >2000 stk. 0,16 kr/stk. 186,- Obs. Overlap laves ved at låse med blank etiket rundt om mikrorør Stykpris ved køb af min. 15 stk. Oplys tilbud nr Stykpris ved køb af min. 15 stk. Oplys tilbud nr Stykpris ved køb af min. 15 stk. Oplys tilbud nr Stykpris ved køb af min. 15 stk. Oplys tilbud nr Pris pr. pose ved køb af min. 10 poser. Oplys tilbud nr Pris pr. pose ved køb af min. 10 poser. Oplys tilbud nr Pris pr. pose ved køb af min. 10 poser. Oplys tilbud nr

8 Tabel 5. Formodet primært organ (cancertype) i Dansk CancerBiobank Analregionen Andet Appendix Binyre Blod Blodkar Bronchie og lunge Cervix uteri Colon Corpus uteri Esophagus Galdeveje Hjerte Hud og subcutis Knoglemarv Knogler og led Lever Lymfeknude Mamma Milt Mund, læbe og tunge Muskler, sene og bløddele Nervesystem Nyre Næse, bihule og nasopharynx Ovarium Pancreas Penis Pharynx Placenta Pleura Prostata Rectum Spytkirtel Testis Thyreoidea og parathyreoidea Tonsil Tuba Uterina, parametrium Tyndtarm Urinveje og blære Vagina Ventrikel og oment Vulva Øje Øre