OM TESTEN OM VIRKSOMHEDEN

Transkript

1 OM VIRKSOMHEDEN Sequenom Laboratories er et datterselskab, som er 100 % ejet af Sequenom, Inc. Det er et CAPakkrediteret og CLIA-certificeret laboratorium (Clinical Laboratory Improvement Amendment) med speciale i molekylær diagnostik, som er dedikeret til at forbedre patienters resultater ved at tilbyde revolutionerende laboratorieudviklede tests til mange forskellige prænatale tilstande. Sequenom Laboratories er med lanceringen af MaterniT21-testen til detektering af føtale anomaliteter pioner indenfor NIPT og tilbyder en lang række prænatale tests. SEQUENOM, MaterniT, MaterniT21 og Sequenom Laboratories er varemærker tilhørende Sequenom, Inc. Alle andre varemærker tilhører deres respektive ejere. 201 Sequenom Laboratories. Alle rettigheder forbeholdes. OM TESTEN Testen MaterniT GENOME er en laboratorieudviklet test, som er udviklet af og udelukkende valideres og udføres af Sequenom Laboratories. Testen er ikke godkendt af U.S. Food and Drug Administration (FDA), som er USA's føderale fødevare- og lægemiddelmyndighed. Selvom laboratorieudviklede tests til dato endnu ikke er underlagt de amerikanske FDA-bestemmelser, er det et krav, at laboratoriet er certificeret i henhold til Clinical Laboratory Improvement Amendments (CLIA) for derved at garantere testens kvalitet og validitet. Sequenom Laboratories er certificeret under CLIA som værende kvalificeret til at udføre meget komplicerede kliniske laboratorietests og er endvidere akkrediteret af College of American Pathologists. Ingen test er perfekt. På trods af at MaterniT GENOME-testens resultater er meget nøjagtige, kan der forekomme diskortante resultater, herunder ukorrekte forudsigelser om fosterets køn pga.: placentamosaikker, maternelle eller føtale mosaikker, tumorer, en tvilling der dør i livmoderen, forudgående organtransplantation af moderen eller andre årsager. Testning af cellefrit DNA (cf-dna) kan ikke erstatte den nøjagtighed og præcision, som prænatal diagnosticering med en moderkagebiopsi (CVS) eller en fostervandsprøve kan give. En patient med et positivt testresultat i en MaterniT GENOME-test bør henvises til genetisk rådgivning og tilbydes invasiv prænatal diagnosticering for at få bekræftet testresultaterne. En negativ MaterniT GENOME-test er ikke en garanti for en uberørt graviditet. Der kan forekomme inkonklusive resultater, og årsager hertil kan inkludere, men er ikke begrænset til, utilstrækkelig sekventeringsdækning, støj eller artefakter i området, amplifikations- eller sekventeringsfejl, eller utilstrækkelig føtal fraktion. MaterniT GENOME-testen har ikke til formål at detektere graviditeter med risiko for neuralrørsdefekter eller abdominalvægsdefekter. cf-dna-testning for anomaliteter i hele kromosomet (herunder kønskromosomer) og for anomaliteter i kromosommaterialet kan potentielt føre til detektion af både føtale og maternelle genomiske anomaliteter, som kan have mindre, eller ingen, klinisk betydning. Når betydningen af et positivt eller inkonklusivt svar skal vurderes, kan det involvere både invasiv prænatal testning og ekstra undersøgelser af moderen. Sådanne undersøgelser kan føre til, at der opdages kromosomanomalier eller anomalier i kromosommateriale, som lejlighedsvis kan associeres med god- eller ondartede maternelle svulster. cf-dna-undersøgelser kan ikke fuldstændigt nøjagtigt identificere føtale triplodier, balancerede translokationer eller den præcise placering af kromosommaterialers duplikationer eller deletioner; Disse kan detekteres med prænatal diagnose ved brug af fostervandsprøve eller moderkagebiopsi. Muligheden for at rapportere resultater kan påvirkes af det maternelle body mass index (BMI), den maternelle vægt og/eller maternel systemisk lupus erythematosus (SLE). Resultater fra denne testtype - både fordele og begrænsninger - skal drøftes med kvalificeret sundhedspersonale. Beslutninger om graviditeten, herunder svangerskabsafbrydelse, bør ikke udelukkende tages på baggrund af resultaterne fra denne test. REFERENCER 1. Di Gregorio E, et al. Large cryptic genomic rearrangements with apparently normal karyotypes detected by array-cgh. Mol Cytogenet. 201;7(82). 2. Zhao C, et al. Detection of fetal subchromosomal abnormalities by sequencing circulating cell-free DNA from maternal plasma. Clin Chem. 201 Apr;1(): R

2 VIDEN- SKAB OM VIDEN UDEN PARALLEL x y x y Non-invasiv prænatal test til føtale kromosomanomalier i hele genomet 1 Laboratorier 13 QUALITY OF SCIENCE 12 7

3

4 17 3 DIT OG VORES MÅL: AT GIVE ALLE PATIENTER DEN MEST AVANCEREDE BEHANDLING. For at hjælpe dig med at opnå målet: Den laboratorieudviklede test MaterniT GENOME, som er en ny non-invasiv prænatal test (NIPT), der analyserer alle kromosomer i genomet. For første gang nogensinde fås en NIPT, som giver dig denne hidtil uopnåelige viden, og som giver dig mulighed for behandle patienterne efter en helt ny standard. Testen MaterniT GENOME er den eneste NIPT til hele genomet, som giver viden på karyotype niveau X Y MaterniT GENOME analyserer alle kromosomer 1 1 Maks. kromosomområder, der analyseres af andre NIPT'er

5 FÅ MERE VIDEN END NOGENSINDE FØR MaterniT GENOME-testen begynder med en almindelig blodprøve, der kan tages så tidligt som i 10. gestationsuge. Selvom det ikke er en føtal karyotype, er det på nuværende tidspunkt den eneste NIPT, der kan give en informationsmængde, som hidtil kun har været mulig at få fra en karyotype-analyse. Den giver informationer om, hvorvidt der er mistet eller tilføjet kromosommateriale 7 Mb i genomet. Testen analyserer også syv klinisk vigtige mikrodeletion-områder. Ved at kombinere øget sekventeringsdybde med branchens førende ekspertise tilbyder MaterniT GENOME en bred dækning ulig andre non-invasive prænatale tests på markedet. KOMPLICERET VIDENSKAB. UKOMPLICERET RAPPORTERING. MaterniT GENOME-testen leverer en sofistikeret DNA-analyse på ukompliceret vis. Den enkle rapporteringmåde er designet til at lette kommunikationen mellem dig og din patient. Hvert kromosommål får et særskilt resultat, der enten er positivt eller negativt. INDHOLD RESULTAT INDHOLD RESULTAT AUTOSOMALE ANEUPLOIDIER Trisomi 21 (Downs syndrom) Trisomi 18 (Edwards syndrom) Trisomi 13 (Pataus syndrom) Andre autosomale aneuploidier Kønskromosomaneuploidier Fosterets køn Monosomi X (Turners syndrom) XYY (cobsens syndrom) XXY (Klinefelters syndrom) XXX (Tri-X-syndrom) Forenelig med hunkøn ANTAL KOPIEREDE VARIANTER 7 Mb I HELE GENOMET Øget/tabt 7 Mb Positiv UDVALGTE MIKRODELETIONS 22q11 deletion (forbundet med DiGeorge 1q11 deletion (forbundet med Prader-Willi / Angelman syndromerne) 11q23 deletion (forbundet med cobsens 8q2 deletion (forbundet med Langer-Giedion p1 deletion (forbundet med Cri-du-chat p1 deletion (forbundet med Wolf-Hirschhorn 1p3 deletionsyndromet KRO 1 Duplikation Rapporten indeholder et ideogram over kromosomer, som viser abnormale resultater for at lette forståelsen p3.2 p3 p3.2 p33 p32.2 p3.3 p31.3 p31.1 p22.2 p3.1 p21 p3.3 p13.2 p12 q11 p3.1 q21 p32.3 p32.1 p31.2 q23.1 q23.3 q2.1 q2.3 p22.3 p22.1 p13.3 p13.1 p11 q32.1 q32.3 q12 q22 q23.2 q2 q2.2 q31 q32.2 q1 q2.1 q2.3 q2.2 q3 q Beskrivelse: Der observeredes en anslået 1,3 Mb stigning i kromosom 1-materiale, hvilket tyder på en duplikation i området p3.3-p3.1.

6 GÅ VIDERE END PRÆNATAL KARYOTYPE-ANALYSE Afdækning ved hjælp af prænatal karyotypering er ofte dårligere end karyotypering via perifer blodprøve. Kryptiske deletions eller duplikationer, der er større end 7 Mb, opdages af og til ikke i en rutinemæssig prænatal karyotype¹, og de kliniske konsekvenser heraf kan være fatale eller føre til komplekse, alvorlige føtale anomaliteter. MaterniT GENOME-testen tilbyder en ny kapabilitet indenfor noninvasive tests, da den på tværs af genomet finder > 9 % af deletions eller duplikationer på 7 Mb. Det gør den til den mest omfattende føtale kromosomtest, der er tilgængelig til dato. Føtal karyotype-test MaterniT GENOME-test Analyserer alle kromosomer Kræver en invasiv procedure Nej Detekterer store, ubalancerede translokationer Vi forstår, at den avancerede rapportering om genetik kan give udfordringer i forbindelse med rådgivning af patienter, især når der er brug for flere oplysninger i forhold til et bestemt resultat. Du kan få støtte i form af konsultationer med vores eksperter indenfor genetisk rådgivning, så du kan få den dybere forståelse, du har brug for. Hvis du har spørgsmål om MaterniT GENOME-testen, eller du ønsker at tale med en genetisk rådgiver om resultaterne, er du velkommen til at kontakte os på genome@sequenom.com Detekterer markører på kromosomerne Detekterer balancerede translokationer eller inversioner Detekterer tilføjede eller mistede kromosomer så små som 7 Mb Detekterer udvalgte mikrodeletions Nej Nej Nej Detekterer triplodier Nej Betragtes som diagnostisk Nej

7 GÅ FORREST INDENFOR DIT FELT MaterniT GENOME-testen kobler førende teknologi med viden uden parallel for at tilbyde de mest videnskabeligt avancerede informationer, der er tilgængelige med en non-invasiv test. Det er et banebrydende værktøj, som komplimenterer din ekspertise og gør dig i stand til at forbedre din praksis og din patientbehandling.

8 SEQUENOM LABORATORIES HISTORIE MED ANSVARLIG INNOVATION INDENFOR NIPT Kromosomanomalier i hele genomet Første NIPT Trisomi 21 Trisomi 18 Trisomi 13 Fosterets køn Flerfoldsgraviditeter Kønskromosomaneuploidier Mikrodeletions: 22q, 1q, p, 1p3 Trisomi 22 Trisomi 1 Flere mikrodeletions: 11q, 8q, p RESULTATER DU KAN STOLE PÅ Sequenom Laboratories historie er fyldt med ansvarlig innovation, hvor alle nye fremskridt indenfor NIPT er karakteriseret af pålidelige resultater og understøttet af ekstensive valideringsundersøgelser. Valideringstests af MaterniT GENOME-testen bygger på denne historie, der supplerer tidligere arbejde indenfor analyser af hele genomet for at sikre meget præcise resultater. PRÆSTATION FOR HELE GENOMET PRÆSTATIONSEVALUERING Præstation SENSITIVITET 100 % 92,9 % 80 % 0 % 0 % 20 % 0 % SPECIFICITET > 99,9 % 98,1 % > 99,9 % 99, % > 99,9 % 7-10 Mb 11-1 Mb 1+ Mb Hændelsesstørrelse HÆNDELSER FOR KROMOSOMMATERIALE FOR HELE GENOMET TRISOMIER 21, 18, 13, KØNSKROMOSOMANEUPLOIDIER OG FOSTERETS KØN Første undersøgelse af hele genomet Tidligere arbejde 2 var første skridt på vejen til analyse af hele genomet Anvendt genomisk DNA, maternelle plasmablandinger Titreringsserier for at imitere distribution af føtal fraktion Ekstensiv modellering med ISCA-data Brugte ISCA-database som kilde til >2.000 hændelser in silico modellering af disse hændelser i >1.000 maternelle plasmasekvenser Muliggjorde over 2 millioner analyser Bistod til forståelsen af resultater fra algoritmer Analytisk validering x flere gdna-prøver analyseret sammenlignet med tidligere arbejde Prøver med mikroarray eller karyotypt bekræftede hændelser Titreringsserier for at imitere distribution af føtal fraktion Målt præstation bekræftet med in silico modellering Ækvivalensundersøgelse Undersøgelse med 8 kliniske prøver Sekventeringsdybde x 2 i forhold til MaterniT21 PLUS Sammenlignede resultater fra MaterniT21 PLUS med resultater fra MaterniT GENOME for trisomierne 21, 18, 13, kønskromosomaneuploidier, fosterets kønsklassifikation 100 % konkordans mellem de to tests