Biosensor. by Biotech Academy. Øvelsesvejledning

Størrelse: px
Starte visningen fra side:

Download "Biosensor. by Biotech Academy. Øvelsesvejledning"

Transkript

1 Biosensor by Biotech Academy Øvelsesvejledning

2 Vigtig information om brug af biosensor kittet for undervisere Før øvelsen startes, er det vigtigt at underviseren har læst følgende erklæring og lærervejledningen, som kan tilgås via: Brugen af dette kit, indeholdende alle BioBricks, kloningsenzymer og E. coli bateriestamme er godkendt til brug i undervisning i genteknologi i biologi, bioteknologi A, teknikfag og teknologi A på STX, HTX og HF. Aftalen med Arbejdsstyrelsen indebærer, at undervisningen skal varetages af en gymnasielærer, som har en biologisk uddannelsesbaggrund mindst svarende til de af VTU udstukne faglige mindstekrav i biologi og som har gennemført et af Arbejdstilsynets godkendte kompetencegivende kurser i eksperimentel genteknologi af 2 dages varighed. Når eksperimenter, som er omfattet af aftalen, gennemføres i forbindelse med enkeltfaglig eller tværfaglig undervisning, har gymnasielæreren ansvar for, at forsøgene gennemføres efter de gældende retningslinjer. De gentologiske forsøg må kun udføres, dersom der senest 3 uger forud for arbejdet med forsøgene (herunder forarbejdet) er indsendt en indberetning til Undervisningsministeriets fagkonsulent i bioteknologi på det indberetningsskema, der indgår som en del af aftalen. Ved indberetning indsendes altid en udfyldt forside og mindst ét udfyldt bilag. Indberetningsskemaets forside skal underskrives af både den for forsøgenes udførelse ansvarlige lærer og skolens rektor/leder. Indberetningsskemaet kan findes på: Det er et krav, at du som lærer registrerer dig på: Under tilmeldingen skal der angives et kodeord. Kodeordet er blevet sendt til den registrerede kontaktperson på skolen. Findes skolen ikke på listen over tilmeldte skoler, kan skolen tilmeldes ved at skrive til: biosensor@bio.dtu.dk. Biosensor kittet sendes til skolen én gang umiddelbart efter tilmeldingen. Kittet kan bruges i minimum 3 år, hvis det er opbevaret korrekt. Biotech Academy kan ikke stilles ansvarlig for holdbarheden af kittet. Biotech Academy forventer, at både underviseren og eleverne registrerer deres biosensorer via hjemmesiden. Biosensor kittet kan udsendes omkostningsfrist til gymnasierne, fordi Biotech Academy har modtaget støtte fra private fonde og virksomheder. Biotech Academy s fremtidige mulighed for at udvikle spændende naturvidenskabeligt undervisningsmateriale afhænger af at kunne afrapportere til fonde og virksomheder. Derudover kan andre gymnasielever bruge resultaterne som inspiration til deres egne forsøg. side 1 of 21

3 Velkommen til Biotech Academy s Biosensor øvelse Forestil dig, at du kunne designe en bakteriel biosensor, som kan hjælpe læger med at detektere kræft tidligere og derved rede liv, eller en bakterie, som kan finde plastik i havet og nedbryde det, eller måske noget helt tredje. I biosensor øvelsen skal du ikke blot forestille dig, hvordan du kan bruge bioteknologi til at løse problemstillinger. Du designe din egen biosensor og dernæst lave og teste den i laboratoriet. Du vil bruge de samme bioteknologiske metoder, som forskere og universitetsstuderende bruger. Det tager én dag at lave biosensoren. Når du har testet din biosensor, kan du dele den med andre elever og danske universitetsstuderende. Du kan også være heldig, at din biosensor bliver indsendt til igem - den største internationale konkurrence for syntetisk biologi. Vi håber, at øvelsen vil inspirere dig til at se, hvordan bioteknologi kan bruges til at løse nationale og globale udfordringer. Ved hjælp af biosensor kittet kan du lave mere en 500 biosensorer. Hvilken biosensor du laver er helt op til dig. Det er dog ikke muligt at detektere alt med biosensor kittet. Har du en god ide til en biosensor kan du deltage i den årlige Biosensor konkurrence med din ide. Hvis din idé er den bedste, laver vi biosensoren ved hjælp af DNA syntese og udsender den til alle gymnasierne, som deltager i biosensor øvelsen. Hvis det alt sammen er lidt overvældende, så husk at du kan finde videoer som beskriver, hvad en biosensor er og hvordan du designer den på: Vi håber, at det bliver sjovt. God fornøjelse! Hilsen Pernille og Viktor fra Biotech Academy Projektet er sponsoreret af: Novozymes A/S, Lundbeckfonden, New England Biolabs, BioNordika A/S, Otto Mønsted Fond og SnapGene side 2 of 21

4 Indhold og opbevaring af biosensor kittet Biotech Academy udsender gratis Biosensor kittet til danske gymnasier. Kittet indeholder kloningsenzymer, BioBricks og E. coli bakterier til en værdi over DKK. Da Biotech Academy er en non-profit organisation drevet af danske universitetsstuderende, er det kun muligt at sende ét biosensor kit ud per gymnasium. Kittet indeholder nok kloningsenzymer til at lave op til 200 biosensorer og kan holde i minimum 3 år. Vi håber derfor, at I vil passe godt på kittet, så andre elever på jeres gymnasium kan få glæde af det i flere år. Det er derfor vigtigt, at I opbevarer kittet korrekt. Kittet udsendes i to dele. Den første del udsendes af Biotech Academy i samarbejde med EduForce ved Danmarks Tekniske Universitet. Dette kit indeholder: E. coli bakteriestamme opbevares ved -20 eller -80 C Godkendt K12 stamme til brug i øvelsen. Cellerne er opløst i 15% glycerol. Det er bedst at opbevare dem ved -80 C BioBricks (biosensor gener) opbevares ved -20 C Plasmid og yndlingsgenet findes alle i 1.5 ml tuber. Tuberne er markeret med et bogstav (A-H) efterfuldt af et tal (1-12). Kontrol plasmider og biosensorer Kan bruges til at teste dine kompetente E. coli celler eller hvis du ikke vil lave din egen biosensor. Kontrol plasmiderne findes på samme plade som BioBricks. 10 mg/ml chloramphenicol (1%) opløst i 96% ethanol opbevares ved -20 C Antibiotika til selektion af E. coli biosensor transformanter. E. coli stammen som er udsendt er ikke resistent. Fryseboks DNA primere opbevares ved -20 C Disse kan bruges til at lave mere af en BioBrick, hvis man løber tør. Kloningsenzymerne er udsendt af New England Biolabs og deres danske samarbejdspartner BioNordika. Biotech Academy giver besked til BioNordika, når et biosensor kit skal udsendes. Kittet indeholder: Restriktionsenzymer opbevares ved -20 C EcoRI, XbaI, PstI og SpeI. Med kittet kommer en lille fryseboks. Opbevar altid enzymerne i boksen, når du tager dem ud af fryseren. Stil dem tilbage så snart du er færdig med dem. T4 DNA-ligase opbevares ved -20 C side 3 of 21

5 Brug fryseboksen til at holde enzymet koldt, når du skal bruge det. Buffer til restriktionenzymer (CutSmart og Buffer 2.1) opbevares ved -20 C Kan tøs op ved stuetemperatur. Buffer til T4 DNA-ligase opbevares ved -20 C Kan tøs op ved stuetemperatur. Denne buffer er ikke så stabil ved gentagne optøgninger, så vi anbefaler,at man (første gang man bruger kittet), anvender et lille trick, som er beskrevet under. Flyder til vandbad Kittet skal opbevares ved -20 C. Når kloningsenzymerne tages ud af fryseren skal de altid opbevares på is eller i den lille fryseboks, som følger med i kittet. Tag først kloningsenzymerne ud, lige før de skal tilsættes. Kloningsenzymerne skal altid tilsættes som det sidste. Når kloningsenzymerne er tilsat, bør de straks sættes tilbage i fryseren. Bufferne til kloningsenzymerne skal tø på is. Tag dem ud cirka 30 minutter før du skal bruge dem. Bufferne til kloningsenzymerne er meget stabile bortset fra T4 DNA ligase bufferen, da den indeholder ATP. Ved gentagne optøning og nedfrysning, mister T4 DNA ligase bufferen sin aktivitet. Vi anbefaler derfor, at pipettere T4 DNA ligase bufferen ud i mindre portioner (tuber eller PCR rør). På denne måde optøs kun en lille del af bufferen hver gang. Det er ikke muligt at lave 200 af den samme (fx lilla) biosensor, da der i kittet kun er dele til at lave 20 af den samme biosensor. Løber I tør for en biosensor del (BioBrick) er det muligt at lave mere af delen vha. PCR. Der skal som minimum være 0.5 L BioBrick tilbage som skal bruges som template, så sørg altid for at der er lidt tilbage i tuben, når I er færdige. Ønsker I at lave mere end 200 biosensorer, skal I bruge mere af T4 DNA ligase. På Biosensor projektets hjemmeside kan I finde guide til, hvordan dette kan bestilles. side 4 of 21

6 Biosensor øvelsen I gennem hele øvelsen skal du bruge Biosensor projektets online portal: Du og din gruppe vil få jeres eget login til hjemmesiden tilsendt, når I er blevet oprettet af jeres underviser. Øvelsen består af fire dele og kan med fordel udføres i grupper på 3-4 elever, som er interesseret i de samme bioteknologiske problemstillinger Design Lav biosensor i laboratoriet Test biosensor i laboratoriet Upload rapport Hvad er en biosensor? En biosensor er en bakterie, som kan detektere et input og give et respons. Vi har lavet en video, som forklarer, hvad en biosensor er. Se den på: side 5 of 21

7 1. Design biosensor Vælg ét detektionsgen og ét responsgen. Du kan finde inspiration til detektions og responsgener via BioBrick Explorer på: For at lave biosensoren skal du vide, hvor på biosensor pladen du kan finde dine dele. Hver detektions- og responsgen har sit eget koordinat, som består af et bogstav (A-H) og et tal (1-12). Det kan være en god idé, at se om der allerede er nogle andre, som har lavet en biosensor, som har samme detektionsgen. Du kan nemlig bruge andre elevers rapporter som inspiration til, hvordan du kan teste din biosensor. Du må selvfølgelig gerne lave en biosensor, som allerede er lavet før. Når jeres gruppe har besluttet jer for, hvilken biosensor I gerne vil lave, skal jeres lærer oprette jer som gruppe. I skal bruge et gruppenavn, når I logger ind. Jeres gruppenavn skal være unikt. Når I er logget ind kan I lave en ny biosensor. Klik på jeres gruppenavn i øverst højre hjørne og vælg Dashboard. Klik nu på Opret ny biosensor. Vælg et detektionsgen og responsgen fra listen og find på et navn til jeres biosensor. I skal desuden også udfylde: Problemformulering Hvorfor I har valgt at lave netop denne biosensor? Det er en god ide at have gjort sig nogle tanker om, hvordan man kan teste biosensoren i deløvelse 4. Det skal I nemlig selv beslutte jer for. Risikobeskrivelse Er nogen risiko forbundet med jeres biosensor? Biosensoren et plasmid, som er indsat i en E. coli bakterie (GMO). Man må aldrig tage GMO uden for laboratoriet. Beskriv hvordan I vil sikre jer, at jeres biosensor ikke forlader laboratoriet under øvelsen. Måske har I også en god ide til, hvordan man kan bruge biosensoren i den virkelige verden uden at risikere, at den slipper ud i det fri? Plasmidet, som indsættes i bakterien indeholder et resistensgen, som gør at E. coli bakterien er resistens over for antibiotikummet chloramphenicol. Er der nogen potentielle risici forbundet med dette? I kan finde mere information om etik og sikkerhed i forbindelse med arbejde med GMO på hjemmesiden. Biotech Academy har en øvelse om antibiotika resistens. Her kan I også finde information om risici: er-vira-og-antibiotikaresistens/teori/antibiotika-og-resistens side 6 of 21

8 2. Lav biosensor i laboratoriet Den eksperimentelle del af øvelsen er delt op i tre dele. På biosensor projektets hjemmeside kan du finde videoer, som viser, hvordan øvelsen foregår. Del Eksperiment Tid 2.a Klipning af plasmid og gen med restriktionsenzymer 2 timer 2.b Ligering af plasmider 1.5 time 2.c Transformation af E. coli (GMO protokol) 3 timer Du kan vælge at udføre hele øvelsen på én dag eller over flere dage. Efter hver deløvelse er det muligt at stoppe øvelsen. Det eneste du skal gøre er at sætte reaktionen (PCR rør eller 1.5 tube) i fryseren. Øvelse 2.c er GMO øvelse og der skal derfor hanvendes dækpapir på arbejdspladsen. Al affald skal smides i en autoklaveringspose til GMO affald og lokalet skal mærkes inden øvelsen må påbegyndes. Til øvelsedelen 2.c skal der forberedes kompetente E. coli celler Underviseren bør gøre dette før øvelsen (skal startes senest dagen før øvelse 2.c udføres). Kompetente celler er celler som kan optage DNA. E. coli bakterie cellerne gøres kompetente ved at behandle dem med en saltopløsning. Baggrund På kan du finde videoer som beskriver, hvad der sker i øvelsen. Du kan også finde videoer, hvor du kan se, hvordan man udfører øvelserne i laboratoriet. Figuren på næste side viser, hvad der sker i øvelsen: side 7 of 21

9 Figur mangler I øvelse 2.a klippes de to plasmid dele med forskellige restriktionsenzymer. Et restriktionsenzym er et enzym, som kan genkende et bestemt stykke DNA. Forskellige restriktionsenzymer genkender forskellige DNA-sekvenser og klipper forskelligt i DNA et. Når de klippe produceres sticky ends, som gør, at den ene DNA streng er lidt længere end hinanden. Plasmidet og dit yndlingsgen er designet sådan, at når man klipper med restriktionsenzymer produceres overhang, som passer sammen (se figur). Det betyder, at når man i øvelse 2.b tilsætter et enzym kaldet DNA ligase, som kan lime DNA sammen, så produceres der et rundt plasmid. Udover at biosensoren indeholder plasmidet også et replication origin, som er nødvendigt for at plasmidet kan blive i cellen og en resistensgen, som gør E. coli bakterier, som indeholder resistensgenet, modstandsdygtige overfor antibiotikummet chloramphenicol. side 8 of 21

10 2.a Klipning af plasmid og gen med restriktionsenzymer = 2 timer Til hver biosensor skal du bruge 2 reaktioner: 1 til plasmidet og 1 til dit yndlingsgen. De skal hver klippes med to restriktionsenzymer: Plasmid: SpeI + PstI Yndlingsgen: XbaI + PstI God ide: Er I flere grupper, som skal bruge det samme yndlingsgen? Hver reaktion er 8 ul, men I skal kun bruge 4 ul i øvelse 2.b. I skal bruge hele reaktionen med plasmid (8 ul), men kun 4 ul af den med jeres yndlingsgen. Det er derfor muligt at deles for at spare på kittet. Hvad er et mastermix? Et mastermix er ligesom en portion pandekagedej. Det er besværligt at lave dej til en pandekage, da det ikke er nemt at tilsætte 1/10 æg. Det samme gælder for genteknologi. Hver reaktion indeholder 0.2 L restriktionsenzym. Det er næsten umuligt at pipettere medmindre man har en meget lille pipette. Skal man lave 5 forskellige biosensorer kan man derfor lave et mastermix til 5 reaktioner. Så skal man pipettere 1.0 L enzym i stedet for 0.2 L. Ulempen er, at der normalt aldrig er nok til 5 reaktioner. Ligesom pandekagedej, så forsvinder der lidt. Man skal derfor lave mastermix til n+1 reaktioner, hvor n er antallet af reaktioner. Når man laver et mastermix skal man tilsætte alt undtagen DNA (husk at tilsætte enzymet til sidst) og pipettere 4 L ud i en tube til hver gruppe. Hvorfor skal restriktionsenzymerne inaktiveres? I øvelse 2.b skal plasmidet blandes med dit yndlingsgen. Hvis man ikke har inaktiveret restriktionsenzymerne inden, så klipper XbaI i plasmidet og SpeI i yndlingsgenet. Det betyder, at man ikke kan samle biosensoren. side 9 of 21

11 Protokol: Du skal bruge følgende dele fra biosensor kittet: Plasmid: A1 plasmid vektor, som genet sættes ind i. Yndlingsgen (find koordinat på NEB Buffer 2.1 Fryseboks Husk at restriktionsenzymerne først skal tages ud lige inden de skal tilsættes. Opbevar dem på is eller i fryseboksen: Restriktionsenzym XbaI Restriktionsenzym SpeI Restriktionsenzym PstI Du skal desuden bruge: Autoklaveret demineraliseret vand PCR-tube eller 1.5 ml Eppendorf-tube En varmeblok eller varmeskab indstillet til 37C. (Hvis laboratoriet har en PCR-maskine, kan den med fordel bruges.) Pipetter og pipettespidser Is Fremgangsmåde: 1. Angiv hvilke koordinat du skal bruge: Plasmid A1 Yndlingsgen 2. Fyld en bøtte med is. Optø NEB Buffer 2.1 og BioBrick-pladen på is. Det tager cirka 30 minutter. 3. Imens du venter, udregn hvor meget der skal tilsættes af hver reagens til mastermixet. Husk at lave til én ekstra. Vælg en gruppe, som laver mastermixet. Tilsæt først vand og buffer. Sæt låg på tuben og så let på den for at blande. Man kan også blande ved at pipettere op og ned, men så risikere man at danne en masse luftbobler. Stil restriktionsenzymerne i den lille fryseboks som medfølger (eller på is). Pipetter enzymet. Enzymet er opløst i glycerol, så der sidder ofte også enzym på siden af pipettespidsen. (Husk at skifte pipettespids før du pipetterer det næste enzym!) Bland forsigtigt mastermixet ved at slå på tuben. Plasmid Yndlingsgen side 10 of 21

12 Reagens Volumen Mastermix Reagens Volumen Mastermix ddh 2 O 2.8 L ddh 2 O 2.8 L 10x Buffer L 10x Buffer L Plasmid 0.2 L Yndlingsgen 4.0 L PstI 0.2 L PstI 0.2 L SpeI 4.0 L XbaI 0.2 L Total volumen 8.0 L Total volumen 8.0 L 4. Hver gruppe pipetterer 4 L af hver master mix ud i hver sin tube. Marker tuberne med P/plasmid eller Y/yndlingsgen samt grupper nummer. 5. Tilsæt 4 L plasmid til tuben markeret med P/plasmid 6. Tilsæt 4 L yndlingsgen til tuben markeret med Y/yndlingsgen 7. Inkuber reaktionen ved 37C i en time (temperatur hvor restriktionsenzymerne er aktive), hvorefter restriktionsenzymerne skal inaktiveres ved 80C i 20 minutter. Hvis I bruger en PCR-maskine kan i derfor indstille et program. Hvis I ikke bruger en PCR-maskine kan I i stedet bruge et varmeskab eller varmeblok. 8. Efter 1 time gå direkte til del 2.b eller opbevar tuben i fryseren ved -20C indtil næste øvelsesdag. side 11 of 21

13 Spørgsmål til øvelsen: 1. Tegn genkendelsessekvensen for restriktionsenzym PstI, XbaI og SpeI Du finder den på: Indtast navnet på restriktionsenzymet i søgefeltet i øverste højre hjørne. Fx er genkendelsessekvensen for EcoRI: Hjælp: For nogle enzymer findes der to versioner fx EcoRI og EcoRI-HF. Nogle gange kommer restriktionsenzymer til at klippe forkert. HF står for High-Fidelity og betyder, at nogle forskere hare modificeret enzymerne, så de ikke laver ligeså mange fejl. Genkendelsessekvensen er stadig den samme. 2. Hvilke to restriktionsenzymer (PstI, XbaI, SpeI) producerer sticky ends, som kan limes sammen? (Husk at A altid parrer med T og C altid parrer med G). 3. Hvad betyder de her logoer? Du kan finde logoet inde på et af restriktionsenzymerne. Prøv at klikke på det. 4. En ven har givet dig noget restriktionsenzym, men din ven kan ikke huske om det er PstI eller PstI-HF. Hvilken buffer vil du vælge til din klipning? Hjælp: Restriktionsenzymer er kun aktive, hvis de er i en bestemt buffer. NEB har 5 forskellige buffere: Buffer 1.1, 2.1, 3.1, 4.1 og CutSmart bufferen, som de fleste restriktionsenzymer er aktive i. Du kan se, aktivteten af dit restriktionsenzym ved at søge på restriktionsenzymet. Cirka halvvejs nede på siden står aktiviteten angivet. side 12 of 21

14 2.b Ligering af plasmid T4 DNA-ligase er et enzym, som limer DNA-stykker sammen. Enzymet kræver ATP, som er tilsat til bufferen. Protokol Du skal bruge følgende dele fra biosensor kittet: T4 DNA-ligase buffer T4 DNA-ligase (Skal først tages ud af fryseren lige før den skal bruges) Du skal desuden bruge: De to klipninger fra øvelse 2.a Autoklaveret demineraliseret vand PCR-tube eller 1.5 ml Eppendorf-tube Pipetter og pipettespidser Is Fremgangsmåde: 1. Fyld en bøtte med is. Tø T4 DNA-ligasen på is. Det tager cirka 30 minutter. 2. Bland følgende dele sammen i den rækkefølge, som de er angivet i skemaet. Tag T4 DNA-ligasen ud af fryseren lige før du skal bruge den. Transporter den i den lille fryseboks eller på is og stil den tilbage, så snart du er færdig med den. Reagens ddh 2 O T4 DNA-ligase buffer Klipning af plasmid Klipning af yndlingsgen T4 DNA-ligase Total volumen Reaktion 5.5 L 2.0 L 8.0 L 4.0 L 0.5 L 20.0 L 3. Lad reaktionen stå ved stuetemperatur på bordet i 30 minutter. Enzymet er aktivet ved stuetemperatur, men den optimale aktivitet er ved 16C. Reaktionen kan evt. sættes i en PCR maskine. 4. Fortsæt derefter direkte til transformationen (del 1.d) eller opbevar ligeringen i fryseren - 20C indtil næste øvelsesdag. side 13 of 21

15 2.c Transformation GMO-øvelse: I denne del af øvelsen arbejdes der med GMO. Arbejdspladsen skal derfor dækkes med papir, alt affald skal i en autoklaveringspose til GMO affald, og øvelseslokalet skal mærkes. Obs! Denne del af øvelsen kræver, at de kompetente E. coli bakterieceller er klar. Dette tager 2 dage. Den øvelsesansvarlige bør stå for eksperimentet. Protokollen findes i lærervejledningen. Cellerne kan forberedes lang tid inden (flere måneder) og opbevares ved -80C. Der skal desuden forberede sterile LB agarplader med chloramphenicol og sterilt SOC medie til forsøget (se lærervejledningen). Efter at plasmidet er liggeret sammen er det nu klart til at blive transformeret ind i E. coli bakterieceller. Plasmidet kommer ind i cellerne vha. et kort heat shock ved 42C. I langt de fleste tilfælde kommer plasmidet dog ikke ind i cellerne derfor er der millioner af celler i hver tube. For at være sikker på, at det kun er de celler, som har fået plasmidet ind, som kan gro, anvender man selektion. Plasmidet psb1a3 indeholder et gen, som gør cellerne resistente over for antibiotikummet chloramphenicol. Transformationen plades derfor på agarplader med chloramphenicol. Hver gruppe skal lave tre transformationer: biosensoren samt en positiv kontrol. Den positive kontrol er et plasmid med et rødt farvegen. Hvis der er gået noget galt i øvelse 2.a eller 2.b, vil man stadig få kolonier for den positive kontrol. Hvis man får hvide kolonier på den positive kontrol, så ved man er noget er gået galt. Biosensor: Din legering fra øvelse 2.b Positiv kontrol: Positiv kontrol (plasmid) side 14 of 21

16 Protokol Du skal bruge følgende dele fra biosensor kittet: BioBrick pladen. Den positive kontrol er i brønd H12 (nederste højre hjørne) Flyder Du skal desuden bruge: 2 tuber med kompetente E. coli celler (se lærervejledning) Din biosensor (øvelse 2.b) 2 LB agarplader med 10 g/ml chloramphenicol Sterilt SOC medie (se lærervejledning) Pipetter og pipettespidser Is Vandbad eller varmeblok indstillet til 42C Drigalskyspatel Bunsenbrænder Fremgangsmåde: Dag 1: 1. Klargør din arbejdsplads. Læg papir på arbejdspladsen og opstil en autoklaveringspose til GMO-affald. Lokalet skal været mærkes. 2. Hver gruppe skal bruge 2 tuber med kompetente celler (50 L i hver). Hvis cellerne er forberedt inden, tag cellerne ud af fryseren og stil dem direkte på is. 3. Optø cellerne langsomt på is (tager cirka 5-20 minutter) 4. Marker tuberne med Biosensor og positiv kontrol. Husk også gruppe nr. 5. Tilsæt 5 L af det legerede plasmid/biosensor (fra øvelse 2.c) til tuben markeret med Biosensor. 6. Tilsæt også 0.5 L af det positive kontrol plasmid til tuben positiv kontrol. 7. Mix forsigtigt DNA og celler ved at vende tuben om forsigtigt 3 gange. Undgå at holde på bunden af tuben, hvor cellerne er. Så varmer du dem op. 8. Lad cellerne stå på is i 30 minutter. 9. Varm varmeblokken eller vandbad op til 42C. 10. Efter 30 minutter flyt alle tuberne til vandbadet/varmeblokken i nøjagtig 30 sekunder. 11. Tag straks rørene op af varmeblokken og placer dem på is i 5 minutter. 12. Pipeter 950 L sterilt SOC medie ud i hver tube. 13. Inkuber transformationen ved 37C i 2 timer for at give E. coli cellerne tid til at udtrykke antibiotika resistensgenet. 14. Tænd bunsenbrænderen. I de næste steps arbejd tæt på bunsenbrænderen, så udpladningen af celler foregår sterilt. side 15 of 21

17 15. Pipeter 200 L af cellerne (husk at mixe cellerne og LB mediet først) ud på en agarplade med 10 g/ml chlorampenicol. Husk at navngive pladerne (bunden af pladerne), så du kan kende forskel. 16. Dyp spatelen i ethanol og hold den ind under bunsenbrænderen. Tag den ud, så den kan køle af. Tryk den forsigtigt ned på agarpladen et sted, hvor der ikke er celler, så du er sikker på, at den er kold. Hvis den stadig er meget varm vil alle cellerne dø. Brug så spatelen til at plade cellerne ud over hele pladen. Du kan holde låget til petriskålen tæt over pladen, så du mindsker risikoen for kontaminering. 17. Lad pladerne tørre tæt på bunsenbrænderen med låget halvt af. 18. Når pladerne er tørre vend dem rundt, så bunden er op ad og put dem i en pose. Inkuber plasticposen ved 37C til næste dag eller alternativt ved stuetemperatur på lab-bænken i 3 dage. Dag 2: 1. Kig på dine plader. Tæl antallet af kolonier på hver af de tre plader og indfør numrene i skemaet under. Den positive kontrol er rød, da den indeholder et farvegen. Du skal tælle, hvor mange røde og hvor mange hvide kolonier, der er på den positive kontrol. Hvis du har valgt en lugt (banan eller lime), så er du nødt til at gro dine kolonier op i en kultur. Det gør du ved at tilsætte lidt af en koloni til en LB kultur ml og gro den natten over. Husk at kulturen er GMO, så du skal arbejde sterilt og autoklavere kulturen bagefter. Du kan finde vejledninger til groning af kultur på Biosensor hjemmesiden Biosensor Positiv kontrol Antal kolonier 2. Opbevar pladerne med kolonier i en tillukket pose i køleskabet. Husk at agaren skal vende opad. Det forhindrer at pladerne udtørrer. Når du er færdig med forsøget alle agarpladerne og posen smides i GMO affaldsbeholderen og autoklaveres. side 16 of 21

18 Spørgsmål til øvelsen 1. Hvordan ser kolonierne ud for din biosensor? (Er de farvede? Hvorfor er de farvede?) 2. Hvorfor tilsætter man antibiotika til agarpladerne? (Hvordan tror du, at pladerne vilel se ud, hvis der ikke var antibiotika på?) 3. Hvis der er både er røde og hvid/gullige kolonier på den positive plade, hvad betyder det så? (Man bør altid lave en positiv/negativ kontrol, så man ved om ens eksperiment virker) 4. Der er cirka Hvorfor skal man altid la? side 17 of 21

19 3. Test af biosensor GMO-øvelse: I denne del af øvelsen arbejdes der med GMO. Arbejdspladsen skal derfor dækkes med papir, alt affald skal i en autoklaveringspose til GMO affald, og øvelseslokalet skal mærkes. Du kan allerede se om din biosensor virker næste dag, hvis kolonierne får en farve. De forskellige farvegener er ikke altid lige hurtige til at udvikle farven. Du kan læse på biosensor hjemmesiden om dit farvegen og se, hvor lang tid det tager før, man kan se farven. Du kan også læse andre gruppers rapporter og se, hvornår de så farven. Nogle farvegener skal aktiveres af UV lys. UV lys kan være skadeligt, derfor skal du have beskyttelsesudstyr på efter samme forholdsregler, som når man tager billeder af DNA/agarosegeler. Enzymerne i kittet er tagget med et rødt farvegen. Det betyder, at du også næste dag kan se om din biosensor har virket, men da du har valgt en enzym kan du bagefter teste enzymet. Du kan læse mere under hvert enzym på biosensor hjemmesiden. Obs! Denne del af forsøget er valgfrit. Det er ikke nødvendigt at teste din biosensor, men denne del af projektet giver dig også mulighed for at være kreativ. Har du en god idé til hvordan man let kan måle? Protokol til vækstforsøg og måling af absorbans måling og/eller enzymaktivitet Du skal bruge følgende fra kittet: Antibiotikum chloramphenicol (1% i ethanol) Derudover skal du bruge: Plastik falcon tube eller glastube til groning af E. coli celler LB-medium Sterile podenåle eller autoklaverede tændstikker Pieptter og pipettespidser Protokol til vækstforsøg 1. Klargør din arbejdsplads. Læg papir på arbejdspladsen og opstil en autoklaveringspose til GMO-affald. Lokalet skal været mærkes. Tænd bunsenbrænderen. 2. Tilsæt LB-medium og chloramphenicol til væksttuben. 5 ml kultur er nok til enzymassay, men hvis du skal måle absorbans kan du bruge 10 ml. Du skal tilsætte chloramphenicol til en koncentration på 10 µg/ml. Det svarer til 10 µl 1% chloramphenicol i 10 ml. 3. Dyp en steril tandstik eller podenål i en koloni og tilsæt den til vækstmediet. Luk tuben. side 18 of 21

20 4. Kun til måling af absorbans: Tag 1 ml kultur ud til måling af absorbans. Mål med det samme. Dette er nulprøven ved 0 timer. Husk at bruge 1 ml LB medium til at nulstille spektrofotometeret med. 5. Inkuber tuben ved 37 C under ryst. 6. Tag prøver hver time. Husk, at når absorbansen er over 1.2 skal du fortynde kulturen for at få en nøjagtig måling. Du kan måle, hvor hurtigt bakterierne vokser ved at måle absorbansen ved 600 nm. 7. Efter forsøget et stoppet skal alle prøver hældes i en glasflaske til GMO affald. Flasken skal autoklaveres. side 19 of 21

21 4. Upload rapport Du skal uploade din rapport på Du skal være logge ind. Du indsætte billeder, youtube videoer og links. Derudover kan ud uploade et billede og et Ecxel dokument med dine målinger fra test af biosensoren. Alle som besøger hjemmesiden kan se din rapport. Hvis du hellere vil skrive på engelsk må du også gerne dette. Det er helt okay at linke til andres resultater, men husk at angive dine kilder. Din risikobeskrivelse og problemformulering bliver integreret i din færdige rapport, men derudover skal rapporten indeholde: Resumé Metode Resultater Diskussion og konklusion Til sidst skal din rapport godkendes af din lærer. Selvom dette er den sidste del af øvelsen, er den faktisk det vigtigste. Andre elever, lærere og gymnasier kan nemlig bruge dine resultater og gode idéer til deres egne projekter. På denne måde håber Biotech Academy, at landets gymnasier kan dele deres opfindelser, opdagelser og interessante projekter. Derfor har vi valgt, at give en pris og præmie til både dne bedste rapport og den bedste biosensor idé. Biotech Academy og DTU s igem tjekker godkendte rapporter og vælger de bedste rapport ud. Du kan læse mere på Er du i tvivl om, hvad du skal skrive kan du finde inspiration i allerede uploadede rapporter på Du kan finde svarerne til spørgsmålene fra øvelsen på: Til sidst håber vi, at du selvfølgelig vil uploade billeder af din biosensor. Du kan bruge tag #biosensor og #biotechacademy. side 20 of 21

Opdateret d. 17. august Biosensor. Niveau 1. Øvelsesvejledning

Opdateret d. 17. august Biosensor. Niveau 1. Øvelsesvejledning Opdateret d. 17. august 2017 Biosensor Niveau 1 Øvelsesvejledning Vigtig information om brug af Biosensor-kittet for undervisere Før øvelsen startes er det vigtigt, at underviseren har læst følgende erklæring

Læs mere

Biosensor Niveau 1 Øvelsesvejledning

Biosensor Niveau 1 Øvelsesvejledning Opdateret august 2018 Biosensor Niveau 1 Øvelsesvejledning Vigtig information om brug af Biosensor-kittet for undervisere Før øvelsen startes er det vigtigt, at underviseren har læst følgende erklæring

Læs mere

Dette er en kladde til et genoptryk af Eksperimentel Genteknologi fra 1991. Ideer, rettelser og forslag modtages gerne. Kh Claudia.

Dette er en kladde til et genoptryk af Eksperimentel Genteknologi fra 1991. Ideer, rettelser og forslag modtages gerne. Kh Claudia. Transformation af E.coli K 12 Version 3. marts 2009 (C) Claudia Girnth-Diamba og Bjørn Fahnøe Dette er en kladde til et genoptryk af Eksperimentel Genteknologi fra 1991. Ideer, rettelser og forslag modtages

Læs mere

Elevvejledning pglo transformation

Elevvejledning pglo transformation Introduktion til transformation Elevvejledning pglo transformation I denne øvelse skal du lære fremgangsmåden ved genetisk transformation. Husk på, at et gen er et stykke DNA, der indeholder informationer

Læs mere

Mælkesyrebakterier og holdbarhed

Mælkesyrebakterier og holdbarhed Mælkesyrebakterier og holdbarhed Formål Formålet med denne øvelse er at undersøge mælkesyrebakteriers og probiotikas evne til at øge holdbarheden af kød ved at: 1. Undersøge forskellen på bakterieantal

Læs mere

Regnskovens hemmeligheder

Regnskovens hemmeligheder Center for Undervisningsmidler, afdeling København Regnskovens hemmeligheder Øvelsesvejledning Formål Et gen for et kræfthelbredende protein er blevet fundet i nogle mystiske blade i regnskoven. Forskere

Læs mere

Green Fluorescent Protein (GFP) Oprensning af GFP

Green Fluorescent Protein (GFP) Oprensning af GFP 1 Green Fluorescent Protein (GFP) Oprensning af GFP Katalognummer 166-0005EDU www.biorad.com Oversat og bearbejdet af Birgit Sandermann Justesen, Nærum Gymnasium Revideret februar 2010. Kontakt: Birgitjustesen@gmail.com

Læs mere

Mælkesyrebakterier og holdbarhed

Mælkesyrebakterier og holdbarhed Mælkesyrebakterier og holdbarhed Navn: Forsøgsvejledning Mælkesyrebakterier og holdbarhed Formål med forsøget Formålet med denne øvelse er at undersøge mælkesyrebakteriers og probiotikas evne til at øge

Læs mere

Ligerings- og transformationsmodul inklusiv plasmidoprensning og restriktionsanalyse

Ligerings- og transformationsmodul inklusiv plasmidoprensning og restriktionsanalyse Biotechnology Explorer Ligerings- og transformationsmodul inklusiv plasmidoprensning og restriktionsanalyse Katalog nr. 166-5015EDU explorer.bio-rad.com Kopiering kun tilladt til undervisningsbrug Bemærk:

Læs mere

Test dit eget DNA med PCR

Test dit eget DNA med PCR Test dit eget DNA med PCR Navn: Forsøgsvejledning Formål med forsøget Formålet med dette forsøg er at undersøge jeres arvemateriale (DNA) for et transposon kaldet Alu. Et transposon er en DNA sekvens,

Læs mere

Test dit eget DNA med PCR

Test dit eget DNA med PCR Test dit eget DNA med PCR Navn: Forsøgsvejledning Side 1 af 8 Formål med forsøget Formålet med dette forsøg er at undersøge jeres arvemateriale (DNA) for et transposon kaldet Alu. Et transposon er en DNA

Læs mere

Masseeksperiment Jagten på de gode bakterier Protokol: Trin for trin-guide til selve eksperimentet

Masseeksperiment Jagten på de gode bakterier Protokol: Trin for trin-guide til selve eksperimentet Masseeksperiment 2018 Jagten på de gode bakterier Protokol: Trin for trin-guide til selve eksperimentet Protokol Trin for trin guide til selve eksperimentet Masseeksperimentet kan gennemføres i uge 38,

Læs mere

Test dit eget DNA med PCR

Test dit eget DNA med PCR Test dit eget DNA med PCR Navn: Forsøgsvejledning Side 1 af 8 Formål med forsøget Formålet med dette forsøg er at undersøge jeres arvemateriale (DNA) for et transposon kaldet Alu. Et transposon er en DNA-sekvens,

Læs mere

Proteinelektroforese af GFP Suppleringskit til pglo

Proteinelektroforese af GFP Suppleringskit til pglo Proteinelektroforese af GFP Suppleringskit til pglo Katalognummer nr. 166 0013EDU www.bio rad.com Oversat og bearbejdet af Birgit Sandermann Justesen, Nærum Gymnasium, Nærum Hovedgade 30, 2850 Nærum Birgitjustesen@gmail.com

Læs mere

Test dit eget DNA med PCR

Test dit eget DNA med PCR Test dit eget DNA med PCR Forsøgsvejledning Navn: Side 1 af 7 Formål med forsøget Formålet med dette forsøg er at undersøge jeres arvemateriale (DNA) for et transposon kaldet Alu. Et transposon er en DNA

Læs mere

Konkurrence mellem to bakteriearter

Konkurrence mellem to bakteriearter 1 Biologi-forsøg: Populationsbiologi/evolution Konkurrence mellem to bakteriearter Forsøget undersøger, hvordan en ydre miljøfaktor (temperatur) påvirker konkurrencen mellem to forskellige arter. I dette

Læs mere

FORSØG ØL verdens første svar på anvendt

FORSØG ØL verdens første svar på anvendt FORSØG ØL verdens første svar på anvendt bioteknologi Biotech Academy BioCentrum-DTU Søltofts Plads DTU - Bygning 221 2800 Kgs. Lyngby www.biotechacademy.dk bioteket@biocentrum.dtu.dk INDHOLDSFORTEGNELSE

Læs mere

pglo-transformationskit

pglo-transformationskit Katalog nummer 166-0003-EDU pglo-transformationskit arac ori pglo bla GFP Oversat og bearbejdet af Birgit Sandermann Justesen og Lars Moeslund, 2004 Brugen af dette kit til undervisningsbrug skal varetages

Læs mere

DNA origami øvelse 2013. DNA origami øvelse

DNA origami øvelse 2013. DNA origami øvelse DNA origami øvelse Introduktion I denne øvelse bruger vi DNA origami teknikken til at samle en tavle af DNA med dimensioner på 70 nm x 100 nm. Tavlen dannes af et langt enkeltstrenget DNA molekyle, der

Læs mere

pglo-transformationskit

pglo-transformationskit 1 Katalog nummer 166-0003-EDU www.bio-rad.com pglo-transformationskit arac ori pglo bla GFP Oversat og bearbejdet af Birgit Sandermann Justesen og Lars Moeslund, 2007 Revideret november 2009. Kontakt:

Læs mere

Regnskovens hemmelighed

Regnskovens hemmelighed 1 Regnskovens hemmelighed Katalognummer 1660006-EDU www.bio-rad.com Oversat og bearbejdet af Birgit Sandermann Justesen, Nærum Gymnasium Revideret februar 2010. Kontakt: Birgitjustesen@gmail.com Brugen

Læs mere

Undersøgelse af forskellige probiotiske stammer

Undersøgelse af forskellige probiotiske stammer Undersøgelse af forskellige probiotiske stammer Formål Formålet med denne øvelse er: 1. At undersøge om varer med probiotika indeholder et tilstrækkeligt antal probiotiske bakterier, dvs. om antallet svarer

Læs mere

Test dit eget DNA med PCR

Test dit eget DNA med PCR Test dit eget DNA med PCR Navn: Forsøgsvejledning Side 1 af 8 Formål med forsøget Formålet med dette forsøg er at undersøge jeres arvemateriale (DNA) for et transposon kaldet Alu. Et transposon er en DNA-sekvens,

Læs mere

FORSØG ØL verdens første svar på anvendt

FORSØG ØL verdens første svar på anvendt FORSØG ØL verdens første svar på anvendt bioteknologi Biotech Academy BioCentrum-DTU Søltofts Plads DTU - Bygning 221 2800 Kgs. Lyngby www.biotechacademy.dk bioteket@biocentrum.dtu.dk INDHOLDSFORTEGNELSE

Læs mere

Find enzymer til miljøvenligt vaskepulver

Find enzymer til miljøvenligt vaskepulver Find enzymer til miljøvenligt vaskepulver Enzymer, der er aktive under kolde forhold, har adskillige bioteknologiske anvendelsesmuligheder. Nye smarte og bæredygtige produkter kan nemlig blive udviklet

Læs mere

GAPDH PCR modul Manual

GAPDH PCR modul Manual GAPDH PCR modul Manual Katalog nr. 166-5010EDU explorer.bio-rad.com Kopiering kun tilladt til undervisningsbrug Bemærk: Kittet indeholder temperaturfølsomme dele. Åbn derfor straks kassen og læg de pågældende

Læs mere

Biotechnology Explorer

Biotechnology Explorer Biotechnology Explorer Green Fluorescent Protein (GFP) Oprensnignskit Katalognummer 166-0005-EDU www.bio-rad.com For teknisk service bedes du ringe til dit lokale Bio-Rad kontor Office or in the U.S. Call

Læs mere

Biotechnology Explorer

Biotechnology Explorer Biotechnology Explorer Genes in a Bottle Kit DNA Extraction Module Lav et halssmykke med dit eget DNA Katalognr.: 166-2000EDU Dertil kan man købe ekstradele, hvis der skal laves halskæder til eleverne.

Læs mere

DNA origami øvelse DNA origami øvelse

DNA origami øvelse DNA origami øvelse DNA origami øvelse Introduktion I denne øvelse bruger vi DNA origami teknikken til at samle en tavle af DNA med dimensioner på 70 nm x 100 nm. Tavlen dannes af et langt enkeltstrenget DNA molekyle, der

Læs mere

En forsker har lavet et cdna insert vha PCR og har anvendt det følgende primer sæt, som producerer hele den åbne læseramme af cdna et:

En forsker har lavet et cdna insert vha PCR og har anvendt det følgende primer sæt, som producerer hele den åbne læseramme af cdna et: F2011-Opgave 1. En forsker har lavet et cdna insert vha PCR og har anvendt det følgende primer sæt, som producerer hele den åbne læseramme af cdna et: Forward primer: 5 CC ATG GGT ATG AAG CTT TGC AGC CTT

Læs mere

Biotechnology Explorer. Regnskovens hemmelighed

Biotechnology Explorer. Regnskovens hemmelighed Biotechnology Explorer Regnskovens hemmelighed Katalognummer 166-0006-EDU explorer.bio-rad.com For teknisk service bedes du ringe til dit lokale Bio-Rad kontor Office or in the U.S. Call 1-800-4BIORAD

Læs mere

Elektroforese. Navne: Rami Kassim Kaddoura Roman Averin Safa Sarac Magnus Høegh Jensen Frederik Gaarde Lindskov

Elektroforese. Navne: Rami Kassim Kaddoura Roman Averin Safa Sarac Magnus Høegh Jensen Frederik Gaarde Lindskov Elektroforese Navne: Rami Kassim Kaddoura Roman Averin Safa Sarac Magnus Høegh Jensen Frederik Gaarde Lindskov Klasse: 1.4 Fag: Biologi Vejleder: Brian Christensen Skole: Roskilde tekniske gymnasium, Htx

Læs mere

Biosensor Niveau 1. Teori

Biosensor Niveau 1. Teori Biosensor Niveau 1 Teori Inden du starter... For at kunne forstå teorien som ligger til grund for en biosensor er det vigtigt at du har styr på nogle generelle mikro/molekyler biologiske principper, begreber

Læs mere

Analyse af proteiner Øvelsesvejledning

Analyse af proteiner Øvelsesvejledning Center for Undervisningsmidler, afdeling København Analyse af proteiner Øvelsesvejledning Formål At separere og analysere proteiner i almindelige fødevarer ved brug af gelelektroforese. Teori Alle dele

Læs mere

DNA origami øvelse. Introduktion. DNA origami øvelse 3 timer 2018

DNA origami øvelse. Introduktion. DNA origami øvelse 3 timer 2018 DNA origami øvelse Introduktion I denne øvelse bruger vi DNA origami teknikken til at samle en tavle af DNA med dimensioner på 70 nm x 100 nm. Tavlen dannes af et langt enkeltstrenget DNA molekyle, der

Læs mere

Konkurrence mellem to bakteriearter

Konkurrence mellem to bakteriearter 1 Biologi-forsøg: Populationsbiologi/evolution Konkurrence mellem to bakteriearter Forsøget undersøger, hvordan en ydre miljøfaktor (temperatur) påvirker konkurrencen mellem to forskellige arter. I dette

Læs mere

Biotechnology Explorer

Biotechnology Explorer Biotechnology Explorer pglo Transformationskit Katalognummer 166-0003-EDU explorer.bio-rad.com Dette kit skal opbevares ved stuetemperatur Kopiering af enhver del af dette dokument er kun tilladt til undervisningsbrug

Læs mere

Bestemmelse af celletal

Bestemmelse af celletal Bioteknologi 2, Tema 3 Forsøg 4 Bestemmelse af celletal Mange klassiske mikrobiologiske metoder har til formål at undersøge hvor mange mikroorganismer man har i sin prøve. Det undersøger man gennem forskellige

Læs mere

BIOZYMER ØVELSE 3 BEKÆMP DIN β-lactamase - TEST DIN EGEN MEDICIN!

BIOZYMER ØVELSE 3 BEKÆMP DIN β-lactamase - TEST DIN EGEN MEDICIN! BIZYMER ØVELSE 3 BEKÆMP DIN β-lactamase - TEST DIN EGEN MEDICIN! FAGLIG BAGGRUND For at få det maksimale udbytte af denne øvelse er det en forudsætning, at teorien bag enzymer, enzymkinetik og resistensmekanismer

Læs mere

Kapitel 1 Genteknologi (1/6)

Kapitel 1 Genteknologi (1/6) Kapitel 1 Genteknologi (1/6) Transformation FOTO: SØREN LUNDBERG FORMÅL At isolere plasmider fra plasmidbærende bakterier og overføre dem til andre bakterier. TEORI Transformation er den teknik, hvor generne

Læs mere

Dyrkning af svampe fra ost

Dyrkning af svampe fra ost Dyrkning af svampe fra ost Forord Velkommen til øvelsen Dyrkning af svampe fra ost der hører til undervisningsmaterialet Svampe laver din ost. Øvelsen er udarbejdet af Julie Mahler Nilsson med uundværlig

Læs mere

STUDERENDES ØVELSESARK TIL EKSPERIMENT A: NATURLIGE NANOMATERIALER

STUDERENDES ØVELSESARK TIL EKSPERIMENT A: NATURLIGE NANOMATERIALER STUDERENDES ØVELSESARK TIL EKSPERIMENT A: NATURLIGE NANOMATERIALER Navn: Dato:.. MÅL: - Lær om eksistensen af naturlige nanomaterialer - Lysets interaktion med kolloider - Gelatine og mælk som eksempler

Læs mere

Vejledning til brug af i-bogen Biologi i udvikling

Vejledning til brug af i-bogen Biologi i udvikling Vejledning til brug af i-bogen Biologi i udvikling I-bogen Biologi i udvikling er baseret på et system hvor lærerne har en lærerbog og eleverne hver deres personlige elevbog. En interessant konsekvens

Læs mere

Vejledning: AMUUDBUD.DK

Vejledning: AMUUDBUD.DK Vejledning: AMUUDBUD.DK Henvendt til uddannelsesinstitutioner Websiden amuudbud.dk bruges af uddannelsesinstitutioner til at ansøge om godkendelse til at udbyde AMU. Du skal have modtaget en e-mail med

Læs mere

Algedråber og fotosyntese

Algedråber og fotosyntese Algedråber og fotosyntese Fotosyntesen er en utrolig kompleks proces, som kan være svær at forstå. Heldigvis kan fotosyntesen illustreres på en måde, så alle kan forstå, hvad der helt præcist foregår i

Læs mere

KAN PLASTIK NEDBRYDES?

KAN PLASTIK NEDBRYDES? KAN PLASTIK NEDBRYDES? Øvelsen består af flere dele Lav selv bioplast Design et nedbrydningsforsøg 1. Lav selv bioplast Teori Den plastik, der er i din smartphone, er forskellig fra plasten i din tandbørste

Læs mere

Vejledning til skoletjenesten.dk for institutioner

Vejledning til skoletjenesten.dk for institutioner Vejledning til skoletjenesten.dk for institutioner Indhold Login: Hvordan logger man ind på sin institutions side? (2 steps)... 2 Om -siden: Hvordan udfylder man sin pædagogiske profiltekst (7 steps)...

Læs mere

Protokol for genetisk bestemmelse af ABO blodtyper

Protokol for genetisk bestemmelse af ABO blodtyper Page1 Udarbejdet i samarbejde mellem: Kåre Lehmann, Annabeth Høgh Petersen, Anne Rusborg Nygaard og Jørn M. Clausen Page2 VIGTIGT: SKIFT PIPETTE SPIDSER/TIPS EFTER HVER GANG!! Så undgår du at forurene

Læs mere

DNA origami øvelse DNA origami øvelse

DNA origami øvelse DNA origami øvelse DNA origami øvelse Introduktion I denne øvelse bruger vi DNA origami teknikken til at samle en tavle af DNA med dimensioner på 70 nm x 100 nm. Tavlen dannes af et langt enkeltstrenget DNA molekyle, der

Læs mere

Forsøgsprotokol til larveforsøg: Tilsætning af 3 dage gamle larver til gødning inficeret med patogene bakterier

Forsøgsprotokol til larveforsøg: Tilsætning af 3 dage gamle larver til gødning inficeret med patogene bakterier Forsøgsprotokol til larveforsøg: Tilsætning af 3 dage gamle larver til gødning inficeret med patogene bakterier Formål: at undersøge udviklingen i mængden af tilsatte patogene bakterier til hønsegødning.

Læs mere

[BESØGSSERVICE INSTITUT FOR MOLEKYLÆRBIOLOGI OG GENETIK, AU]

[BESØGSSERVICE INSTITUT FOR MOLEKYLÆRBIOLOGI OG GENETIK, AU] Enzymkinetik INTRODUKTION Enzymer er biologiske katalysatorer i alle levende organismer som er essentielle for liv. Selektivt og effektivt katalyserer enzymerne kemiske reaktioner som ellers ikke ville

Læs mere

De fremstillede transformerede kloner kan eventuel analyseres som beskrevet i punkt C.

De fremstillede transformerede kloner kan eventuel analyseres som beskrevet i punkt C. 11. juni UVM sags nr. 166.471.021 AT jnr. 20050002257 Aftale mellem Undervisningsministeriet og Arbejdstilsynet om retningslinjer for godkendte forsøg med genteknologi i henhold til Bekendtgørelse om genteknologi

Læs mere

STUDERENDES ØVELSESARK TIL EKSPERIMENT B: FLYDENDE KRYSTALLER

STUDERENDES ØVELSESARK TIL EKSPERIMENT B: FLYDENDE KRYSTALLER Navn: Dato:.. STUDERENDES ØVELSESARK TIL EKSPERIMENT B: FLYDENDE KRYSTALLER MÅL: - Forstå selv-samlingskonceptet. - Forstå måden et materiale opfører sig på, på makroskala, er afhængig af dets struktur

Læs mere

Som substrat i forsøgene anvender vi para nitrophenylfosfat, der vha. enzymet omdannes til paranitrofenol

Som substrat i forsøgene anvender vi para nitrophenylfosfat, der vha. enzymet omdannes til paranitrofenol Enzymkinetik Introduktion I disse forsøg skal I arbejde med enzymet alkalisk fosfatase. Fosfataser er meget almindelige i levende organismer og er enzymer med relativt bred substrat specificitet. De katalyserer

Læs mere

PCR (Polymerase Chain Reaction): Opkopiering af DNA

PCR (Polymerase Chain Reaction): Opkopiering af DNA PCR (Polymerase Chain Reaction): Opkopiering af DNA PCR til at opkopiere bestemte DNA-sekvenser i en prøve er nu en af genteknologiens absolut vigtigste værktøjer. Peter Rugbjerg, Biotech Academy PCR (Polymerase

Læs mere

Biotechnology Explorer

Biotechnology Explorer Biotechnology Explorer Oprensning af genomisk DNA fra plantemateriale Manual Katalog nr. 166-5005EDU explorer.bio-rad.com Oversat og bearbejdet af Birgit Sandermann Justesen, Nærum Gymnasium, februar 2009

Læs mere

Laboratorieprotokol for manuel isolering af DNA fra 0,5 ml prøve

Laboratorieprotokol for manuel isolering af DNA fra 0,5 ml prøve Laboratorieprotokol for manuel isolering af DNA fra 0,5 ml prøve Til isolering af genomisk DNA fra indsamlingssætserierne Oragene - og ORAcollect. Du kan finde flere sprog og protokoller på vores webside

Læs mere

Lærervejledning til Stop Madspild Produktion

Lærervejledning til Stop Madspild Produktion Lærervejledning til Stop Madspild Produktion VELKOMMEN TIL I Stop Madspilds digitale forum gennemgår dine elever tre faser: Research, Findings og Produktion, før deres medieproduktioner er klar til at

Læs mere

Plasmidoprensning med kogemetode Oprensning af plasmid DNA med kogemetode for brug til transformation og restriktionsanalyse

Plasmidoprensning med kogemetode Oprensning af plasmid DNA med kogemetode for brug til transformation og restriktionsanalyse www.volvoxdk.dk C. Girnth-Diamba og B. Fahnøe, 2010 Claudia Girnth-Diamba og Bjørn Fahnøe Solrød Gymnasium, Solrød Center 2 DK 2680 Solrød Strand, Denmark E: sgcg@solgym.dk og sgbf@solgym.dk Plasmidoprensning

Læs mere

Manual til at redigere på stafetforlivet.dk for holddeltagere

Manual til at redigere på stafetforlivet.dk for holddeltagere Manual til at redigere på stafetforlivet.dk for holddeltagere Indhold Sådan tilmelder du dig et hold... 2 Sådan logger du ind på hjemmesiden... 4 Har du glemt dit kodeord?... 5 Sådan ser du oplysninger

Læs mere

KRIMINALDETEKTIVEN GERNINGSSTEDETS GÅDE PCR

KRIMINALDETEKTIVEN GERNINGSSTEDETS GÅDE PCR KRIMINALDETEKTIVEN GERNINGSSTEDETS GÅDE Elevvejledning PCR PCR trin for trin PCR involverer en række gentagne cykler, der hver består af følgende tre trin: Denaturering, primer påsætning og forlængelse

Læs mere

COOP brugermanual til Podio BRUGERMANUAL. til Podio. 23. februar 2015 Side 1 af 38

COOP brugermanual til Podio BRUGERMANUAL. til Podio. 23. februar 2015 Side 1 af 38 BRUGERMANUAL til Podio 23. februar 2015 Side 1 af 38 INDHOLDSFORTEGNELSE HVAD ER PODIO?... 3 HVAD KAN VI PÅ PODIO?... 4 Aktivitet... 4 Bestyrelsesmøder... 4 Arrangementer & aktiviteter... 5 Opslagstavle...

Læs mere

Vejledning til indmeldelse af ordblinde for skoler og institutioner

Vejledning til indmeldelse af ordblinde for skoler og institutioner Vejledning til indmeldelse af ordblinde for skoler og institutioner Indhold 1. Introduktion... 2 2. Hvem kan benytte indmeldelsesportalen?... 2 3. Sådan opretter du dig på indmeldelsesportalen... 2 1.

Læs mere

VELKOMMEN 3. KOM GODT I GANG 4 Log ind 5 Kontrolpanel 6 Tilpas profil 7 Tilknyt hold 8 Tilknyt fag 9

VELKOMMEN 3. KOM GODT I GANG 4 Log ind 5 Kontrolpanel 6 Tilpas profil 7 Tilknyt hold 8 Tilknyt fag 9 VEJLEDNING 1.0 Indhold VELKOMMEN 3 KOM GODT I GANG 4 Log ind 5 Kontrolpanel 6 Tilpas profil 7 Tilknyt hold 8 Tilknyt fag 9 SÅDAN OPRETTER DU EN QUIZ 10 Quiz info 11 Tilføj spørgsmål 12 Tilføj formel til

Læs mere

Manual til Rsiden.dk for rygestoprådgivere

Manual til Rsiden.dk for rygestoprådgivere 1 Manual til Rsiden.dk for rygestoprådgivere Muligheder på Rsiden.dk www.rsiden.dk er en side, som skal samle alle de relevante dokumenter, informationer og kurser til rygestoprådgivere på et sted. Der

Læs mere

Kom godt i gang www.pengeuge.dk

Kom godt i gang www.pengeuge.dk Kom godt i gang www.pengeuge.dk Denne vejledning gennemgår: 1. Log på med sikkerhedskode (kun til oprettelse af kontaktpersoner) 2. Opret og login kontaktperson 3. Rediger profil og skift password 4. Vælg

Læs mere

Vejledning til indmeldelse af ordblinde for skoler og institutioner

Vejledning til indmeldelse af ordblinde for skoler og institutioner Vejledning til indmeldelse af ordblinde for skoler og institutioner Indhold 1. Introduktion... 2 2. Hvem kan benytte indmeldelsesportalen?... 2 3. Sådan opretter du dig på indmeldelsesportalen... 2 1.

Læs mere

Øvelse med tarmkræftceller i kultur.

Øvelse med tarmkræftceller i kultur. Øvelse med tarmkræftceller i kultur. Baggrund Hver 3. dansker bliver ramt af kræft, inden de er blevet 75 år. Tyktarmskræft er den 3. hyppigste kræftform hos både mænd og kvinder, hvor henholdsvis 7.3

Læs mere

SÅDAN DELTAGER DU I DA VINCI-KONKURRENCEN UNGDOMSUDDANNELSERNE

SÅDAN DELTAGER DU I DA VINCI-KONKURRENCEN UNGDOMSUDDANNELSERNE SÅDAN DELTAGER DU I DA VINCI-KONKURRENCEN UNGDOMSUDDANNELSERNE Da Vinci-konkurrencen Da Vinci er for elever på HTX, STX, EUX eller EUD, som f.eks. har undervisning i teknologi, naturvidenskabelige fag

Læs mere

Manual til Rsiden.dk for koordinatorer

Manual til Rsiden.dk for koordinatorer 1 Manual til Rsiden.dk for koordinatorer Muligheder på Rsiden.dk www.rsiden.dk er en side, som skal samle alle de relevante dokumenter, informationer og kurser til rygestoprådgivere og koordinatorer på

Læs mere

Algedråber og fotosyntese lærervejledning

Algedråber og fotosyntese lærervejledning Algedråber og fotosyntese lærervejledning Kære lærer Først og fremmest tak fordi du har tænkt dig at bruge dette forsøg som en del af din undervisning. Dette dokument er en komplet vejledning til dig,

Læs mere

Vejledning: Sådan bruger du LIS. Hjerteforeningens landsindsamling 2018

Vejledning: Sådan bruger du LIS. Hjerteforeningens landsindsamling 2018 Vejledning: Sådan bruger du LIS Hjerteforeningens landsindsamling 2018 I vejledningen finder du følgende HVAD ER LIS?... 3 HVORDAN LOGGER JEG IND I LIS?... 3 SÅDAN ER LIS OPBYGGET... 3 OVERSIGT OG DATA...

Læs mere

Sæt eksperimentet op i din baghave. Hjælp forskerne MYREJAGTEN. VEJLEDNING For hele familien. Deltag i konkurrencen

Sæt eksperimentet op i din baghave. Hjælp forskerne MYREJAGTEN. VEJLEDNING For hele familien. Deltag i konkurrencen Hjælp forskerne Sæt eksperimentet op i din baghave MYREJAGTEN VEJLEDNING For hele familien Deltag i konkurrencen VELKOMMEN TIL MYREJAGTEN Tak fordi du deltager i eksperimentet og hjælper os med at gøre

Læs mere

Manual til at redigere på stafetforlivet.dk for holdkaptajner

Manual til at redigere på stafetforlivet.dk for holdkaptajner Manual til at redigere på stafetforlivet.dk for holdkaptajner Indhold Sådan opretter du et hold... 2 Sådan logger du ind på hjemmesiden... 4 Har du glemt dit kodeord?... 5 Sådan redigerer og ser du oplysninger

Læs mere

Tak for jeres deltage i projektet Den Store Plantejagt, der har som mål at øge elevernes kendskab

Tak for jeres deltage i projektet Den Store Plantejagt, der har som mål at øge elevernes kendskab Februar 2017 Den Store Plantejagt Tak for jeres deltage i projektet Den Store Plantejagt, der har som mål at øge elevernes kendskab til biodiversitet med fokus på den danske flora og fauna gennem undervisning

Læs mere

Velkommen til HK Extranet... 2 Adgang til HK Extranet... 2 Brugeroprettelse... 2 Log ind på siden... 3 Glemt kode... 3 Ændring af navn, ,

Velkommen til HK Extranet... 2 Adgang til HK Extranet... 2 Brugeroprettelse... 2 Log ind på siden... 3 Glemt kode... 3 Ændring af navn,  , Velkommen til HK Extranet... 2 Adgang til HK Extranet... 2 Brugeroprettelse... 2 Log ind på siden... 3 Glemt kode... 3 Ændring af navn, e-mail, brugernavn eller kode... 3 Opret aktivitet... 4 Grundlæggende

Læs mere

FSFIs lynguide til DFRs elektronisk bevissystem

FSFIs lynguide til DFRs elektronisk bevissystem FSFIs lynguide til DFRs elektronisk bevissystem Dette er en kort guide i anvendelsen af Dansk Førstehjælpsråd elektroniske bevissystem. Guiden viser og forklarer hvordan du som instruktør og medlem af

Læs mere

Brug af Office365 med Onedrive, nyeste Officepakke mv

Brug af Office365 med Onedrive, nyeste Officepakke mv Egedal Gymnasium og HF september 2014 Brug af Office365 med Onedrive, nyeste Officepakke mv Dette dokument beskriver, hvordan du kan opnå adgang til nogle resurser i skyen og hente ny software. Hvordan

Læs mere

Lærervejledning Til internet-spillet Kræftkampen og undervisningshæftet Hvorfor opstår kræft? Biologi 8.-9. klasse

Lærervejledning Til internet-spillet Kræftkampen og undervisningshæftet Hvorfor opstår kræft? Biologi 8.-9. klasse kraeftkampen.dk Kræftens Bekæmpelse Lærervejledning Til internet-spillet Kræftkampen og undervisningshæftet Hvorfor opstår kræft? Biologi 8.-9. klasse Hvorfor arbejde med Kræft? Erhvervsskolernes Forlag

Læs mere

DIGITALE REFUSIONSSEDLER

DIGITALE REFUSIONSSEDLER DIGITALE REFUSIONSSEDLER Der er to måder at udfylde refusionssedler på din smartphone eller tablet: Guide 1: Til dig, der vil udfylde refusionssedler på den nemme måde! Guide 2: Til dig, der vil udfylde

Læs mere

Her er en lille vejledning, som viser dig, hvordan de gode historier kommer fra folks hoveder, gennem din mikrofon og ind på www.dr.dk/historier.

Her er en lille vejledning, som viser dig, hvordan de gode historier kommer fra folks hoveder, gennem din mikrofon og ind på www.dr.dk/historier. Til ambassadørerne Her er en lille vejledning, som viser dig, hvordan de gode historier kommer fra folks hoveder, gennem din mikrofon og ind på www.dr.dk/historier. Intro: Når folk dukker op ved dit arrangement,

Læs mere

Sådan bruger du Facebook

Sådan bruger du Facebook Sådan bruger du Facebook 1 Sådan kommer du på Facebook 2 Oprettelse af en Facebook-profil 3 Opsætte privatindstillinger, så kun venner kan følge med 4 Søge efter venner og bekendte 5 Skrive beskeder både

Læs mere

Munkekærskolen Tjørnholmvej 10 2680 Solrød Strand www.munkekaerskolen.dk eller www.munkekaer.dk E-mail: munkekaerskolen@solrod.dk Tlf.

Munkekærskolen Tjørnholmvej 10 2680 Solrød Strand www.munkekaerskolen.dk eller www.munkekaer.dk E-mail: munkekaerskolen@solrod.dk Tlf. Munkekærskolen Tjørnholmvej 10 2680 Solrød Strand www.munkekaerskolen.dk eller www.munkekaer.dk E-mail: munkekaerskolen@solrod.dk Tlf. 5618 2600 Forældreintra 1 September 2007 Vejledning for forældre ForældreIntra

Læs mere

FAGKOMPETENCER.DK Kom godt i gang som elev/bruger i systemet

FAGKOMPETENCER.DK Kom godt i gang som elev/bruger i systemet FAGKOMPETENCER.DK Kom godt i gang som elev/bruger i systemet V 1.0 December 2016 DF Indhold Introduktion... 3 Oprettelse som elev... 3 Gennemgang af kompetenceoversigten... 8 Emne områder... 8 Registrering

Læs mere

Indhold Registrering på forum... 2 Opret Indlæg... 5 Besvar Indlæg... 7 Ændringer af brugerindstillinger... 9 Tips & Tricks... 11

Indhold Registrering på forum... 2 Opret Indlæg... 5 Besvar Indlæg... 7 Ændringer af brugerindstillinger... 9 Tips & Tricks... 11 Indhold Registrering på forum... 2 Opret Indlæg... 5 Besvar Indlæg... 7 Ændringer af brugerindstillinger... 9 Tips & Tricks... 11 Registrering på forum Ved første besøg på Abildgaardkredsens forum møder

Læs mere

Installation af DATABOKS online backup manager

Installation af DATABOKS online backup manager Installation af DATABOKS online backup manager For at kunne tage fjern-backup skal du installere en online backup manager på din maskine. Den skal bl.a. bruges til at bestemme hvilke filer, databaser og

Læs mere

Tlf. +45 7027 1699 Fax + 45 7027 1899

Tlf. +45 7027 1699 Fax + 45 7027 1899 Firmaordninger I firmaoversigten kan du holde styr på dit kundekartotek samt disses bookinger. Der kan desuden oprettes andre firmaer end dit eget. Herved kan der udbydes særlige ydelser på med egne arbejdstider.

Læs mere

DNA-smykke Simpel ekstraktion af DNA fra kindceller fra mennesket, som er velegnet til at bruge i et halssmykke

DNA-smykke Simpel ekstraktion af DNA fra kindceller fra mennesket, som er velegnet til at bruge i et halssmykke 145678 John Schollar and Dean Madden National Centre for Biotechnology Education, University of Reading Science and Technology Centre, Earley Gate, Reading RG6 6BZ UK E: J.W.Schollar@reading.ac.uk Simpel

Læs mere

Bilag 1 Kort over udledninger

Bilag 1 Kort over udledninger Bilag 1 Kort over udledninger 5 6 4 3 7 8 2 1 1 Sygehus + husspildevand 2 Husspildevand 3 Havn + husspildevand 4 Royal Greenland 5 Husspildevand 6 Husspildevand 7 Chokoladefabrikken 8 Dumpen Bilag 2 -

Læs mere

FAGKOMPETENCER.DK Kom godt i gang som elev/bruger i systemet

FAGKOMPETENCER.DK Kom godt i gang som elev/bruger i systemet FAGKOMPETENCER.DK Kom godt i gang som elev/bruger i systemet V 1.0 December 2016 DF Indhold Introduktion... 3 Oprettelse som elev... 3 Gennemgang af kompetenceoversigten... 8 Emne områder... 8 Registrering

Læs mere

2. Gennemgå de offentligt tilgængelige sider. Hvad kan man finde hvor!

2. Gennemgå de offentligt tilgængelige sider. Hvad kan man finde hvor! Forslag til Web kursus indhold. 1. Hvordan finder man vores side? 2. Gennemgå de offentligt tilgængelige sider. Hvad kan man finde hvor! 3. Gennemgå hvordan man bliver oprettet som medlem og får adgang

Læs mere

E 10: Fremstilling af PEC-solceller

E 10: Fremstilling af PEC-solceller E 10: Fremstilling af PEC-solceller Formål Formålet med forsøget er at fremstille PEC (Photo Electro Chemical) solceller ud fra vinduesruder, plantesaft, hvid maling og grafit fra en blyant. Apparatur

Læs mere

ESLC prøveredskaber: Vejledning for elever (DK)

ESLC prøveredskaber: Vejledning for elever (DK) ESLC prøveredskaber: Vejledning for elever (DK) Indholdsfortegnelse 1 INDLEDNING 3 2 PRØVERNE 3 2.1 Log in 3 2.2 Lydtjek til lytteprøven 5 2.3 Under prøven 5 3 Prøvens opgaver 7 3.1 Lytteopgaver 7 3.2

Læs mere

Manual til Den Elektroniske Portefølje i Almen Medicin Tutorlægens udgave

Manual til Den Elektroniske Portefølje i Almen Medicin Tutorlægens udgave Manual til Den Elektroniske Portefølje i Almen Medicin Tutorlægens udgave Til Tutorlægen Velkommen til den elektroniske portefølje. Den er blevet til i dialog mellem Dansk selskab for almen medicin og

Læs mere

Produktion af biodiesel fra rapsolie ved en enzymatisk reaktion

Produktion af biodiesel fra rapsolie ved en enzymatisk reaktion Produktion af biodiesel fra rapsolie ved en enzymatisk reaktion produceres fra rapsolie som består af 95% triglycerider (TG), samt diglycerider (DG), monoglycerider (MG) og frie fedtsyrer (FA). Under reaktionen

Læs mere

cpos Online Quickguide Version Sct. Norberts Skole https://sctnorberts.cposonline.dk/

cpos Online Quickguide Version Sct. Norberts Skole https://sctnorberts.cposonline.dk/ cpos Online Quickguide Version 1.1.8 Sct. Norberts Skole https://sctnorberts.cposonline.dk/ SÅDAN OPRETTER DU EN BRUGER... 3 SÅDAN LOGGER DU IND... 5 SÅDAN INDBETALER DU PENGE PÅ ET KANTINEKORT... 6 SÅDAN

Læs mere

FAGKOMPETENCER.DK Kom godt i gang som vejleder i systemet

FAGKOMPETENCER.DK Kom godt i gang som vejleder i systemet FAGKOMPETENCER.DK Kom godt i gang som vejleder i systemet V 1.1 Juli 2017 DF Indhold Introduktion... 3 Sådan logger du på systemet som vejleder... 3 Oversigten... 5 Rediger en elevs oplysninger... 6 Opret

Læs mere

Den digitale Underviser. Clouds. Dropbox

Den digitale Underviser. Clouds. Dropbox Den digitale Underviser Clouds Dropbox Indhold Indhold... 1 Dropbox... 1 Installer Dropbox... 2 Åbn Dropbox fra egen computer... 2 Åbn Dropbox fra en anden computer... 3 Lagre filer i Dropbox (offline

Læs mere

Pralemappen.dk Din online portfolio Brugerhåndbog til elever Brugerhåndbog til elever

Pralemappen.dk Din online portfolio Brugerhåndbog til elever Brugerhåndbog til elever www.pralemappen.dk v5 side 1 af 10 Indholdsfortegnelse Velkommen til din pralemappe 1.1 Introduktion...side 3 1.2 Grundlæggende funktioner...side 3 1.3 Dine data...side 3 1.4 Sidens opbygning...side 4

Læs mere

Manual til at redigere på stafetforlivet.dk for holdkaptajner

Manual til at redigere på stafetforlivet.dk for holdkaptajner Manual til at redigere på stafetforlivet.dk for holdkaptajner Indhold Sådan opretter du et hold... 2 Sådan logger du ind på hjemmesiden... 4 Har du glemt dit kodeord?... 5 Sådan redigerer og ser du oplysninger

Læs mere