Figur 1: Strukturelt kort over plasmiderne pyeast og pmamal anvendt til undersøgelse af
|
|
- Karina Axelsen
- 7 år siden
- Visninger:
Transkript
1 Opgave 2 juni 1999 DNA rekombination er vigtig for eukaryote celler i forbindelse med meiosen. Samtidig er rekombination mellem fremmed DNA og endogen DNA essentiel i fremstillingen af transgene organismer hvad enten det drejer sig om mus, gær eller bakterier. Til undersøgelse af rekombinationsprocessen i mammale celler og i gær celler blev de to i Figur 1 viste plasmider fremstillet. Figur 1: Strukturelt kort over plasmiderne pyeast og pmamal anvendt til undersøgelse af rekombinationsprocessen i gær henholdsvis i mammale celler. LEU2, β-isopropylmalate dehydrogenase genet med promotor fra gær; hprt 5, human hprt cdna svarende til exon 1-3; hprt 3, human hprt cdna svarende til exon 8-9; Neo R, gen der bibringer den mammale celle resistens overfor kanamycin analogen G418; P, promotor; Amp R, et β-lactamase gen; ORI, et E. coli replikations origin. Størrelsen af pyeast og pmamal er angivet under hvert plasmid. XhoI-hprt5 -HindIII fragmentet er 1,5 kb medens HindIII-PNeo R -Hprt3 -XhoI fragmentet er 2,0 kb. En gærstamme med genotypen leu2 (en punktmutation i LEU2) blev transformeret med uskåret pyeast. Leucin autotrofe gærceller blev isoleret. DNA fra 42 forskellige transformanter og fra den ikke-transformerede gærstamme blev restriktionsskåret med HindIII, og der blev fremstillet ét Southern blot med en pyeast probe og ét Southern blot med en Amp probe. Resultatet er vist i Figur 2. En mammal cellelinje blev transficeret med XhoI skåret pmamal og selekteret for G418 resistens. Kromosomal DNA fra 10 forskellige transfektanter blev restriktionsskåret med HindIII og der blev fremstilllet et Southern blot med en Neo specifik probe. Resultatet af Southern blottet er vist i Figur 3.
2 Figur 4 viser et restriktionskort over LEU2 regionen i gær og hprt regionen i menneske. Figur 2: Southern blot af HindIII skåret DNA fra 42 gærkloner opnået ved transformation af en gærstamme med plasmid pyeast falder i tre forskellige klasser, I, II og III. DNA fra klasse I og klasse III transformanter gav altid det samme Southern blot, medens størrelsen af det med pilen markerede bånd varierede i størrelse blandt klasse II transformanter. De anvendte prober og gærstammer er angivet øverst i figuren. Størrelsen af de fremkomne bånd er angivet i kb. Til højre er angivet den fraktion af det totale antal transformanter, der udgøres af den enkelte klasse. Figur 3: Southern blot af HindIII skåret DNA fra 10 mammale cellekloner opnået ved transfektion af en mammal cellelinje med plasmid pmamal. Størrelsen af de enkelte bånd er angivet i kb. En Neo specifik probe er anvendt.
3 Figur 4: A, restriktionskort over LEU2 regionen i gær; B, restriktionskort over hprt regionen i menneske. Størrelsen af udvalgte restriktionsfragmenter er angivet i kb. Spm. A: Giv ud fra data og information i Figur 1, 2 og 4 dine fortolkninger af de i figur 2 viste Southern blots (eventuelt ved brug af en tegning). Spm. B: Hvad viser Figur 2 og Figur 3 om integrationen af plasmider i genomet på gærceller henholdsvis mammale celler? For at identificere begrænsende trin i den homologe rekombinationsproces i mammale celler blev der anvendt en CHO (chinese hamster ovary cells) cellelinje indeholdende to kopier af DHFR (dihydrofolate reduktase) genet og en CHO cellelinje (CHO800) indeholdende 800 kopier af DHFR genet. Til tranfektion af de to cellelinjer blev der anvendt det DNA fragment, der er vist i Figur 5. Figur 5: DNA fragment til transfektion af CHO cellelinjer. DHFR 5, en del af 5 enden af DHFR genet fra hamster; DHFR 3, en del af 3 enden af DHFR genet fra hamster; Neo R, gen der bibringer mammale celler resistens mod G418; HSV-TK, thymidin kinase genet fra herpes simplex genet. Transfektion af CHO celler med DNA fragmentet i Figur 5 giver anledning til to forskellige klasser af transfektanter.
4 Spm. C: Beskriv, hvorledes der kan isoleres CHO transfektanter fra de to nævnte klasser. Tabel 1 angiver resultatet af 3 uafhængige transfektioner af CHO cellelinjen henholdsvis CHO800 cellelinjen med DNA fragmentet i Figur 5. I II III CHO CHO800 CHO CHO800 CHO CHO800 neo neo + tk homolog 15/19 12/36 4/4 9/31 38/68 25/54 homolog/ 15/ /500 4/1330 9/ / /2160 total CHO800/ CHO Tabel 1: Resultatet af transfektion af CHO800 henholdsvis CHO celler med DNA fragmentet fra Figur 5. Neo +, antal neomycin resistente celler; neo + tk -, antal G418 og gancyklovir resistente celler; homolog, den fraktion af neo + tk - celler der ved Southern blot viste sig at være homologe rekombinanter; homolog/total; antal homologe rekombinanter divideret med det totale antal G418 resistente transfektanter. Spm. D: Hvad viser data i Tabel 1 omkring faktorer, der har indflydelse på den homologe rekombinationsfrekvens i mammale celler. For at undersøge ligheder/forskelle i den homologe rekombinationsproces mellem gær og mammale celler, fremstilledes de to i Figur 6 viste DNA fragmenter. Disse fragmenter blev blandet i forholdet 1:1 og brugt til at transformere to haploide gærstammer med genotypen leu2 lys2 (begge punktmutationer). Den ene gærcelle (WYL161)indeholder en kopi af leu2 genet medens den anden (WYL162) indeholder otte kopier af leu2 genet. Begge stammer indeholder en kopi af lys2 genet. Resultatet af to sådanne forsøg er vist i Tabel 2.
5 Figur 6: Stukturen af de to DNA fragmenter der anvendes til transformation af en leu2 lys2 gærstamme. De to fragmenter indeholder kun de to geners kodende regioner og ingen promotorer. Stamme antal leu2 kopier antal Leu+ transformanter antal Lys+ transformanter WYL WYL WYL WYL Tabel 2: Resultaterne fra to uafhængige transformationer af WYL161 henholdsvis WYL162 med ækvimolære mængder af de to i Figur 6 viste DNA fragmenter. Spm. E: Hvad viser data i Tabel 2 omkring faktorer, der har indflydelse på den homologe rekombinations-frekvens i gær? For yderligere undersøgelse af homolog rekombination blev der fremstillet det i Figur 7 viste plasmid. Plasmidet blev restriktionsskåret med BglII og transformeret i en ura3 gærstamme. Der blev isoleret plasmid DNA fra de opnåede uracil autotrofe transformanter.
6 Figur 7: Plasmid pp450 til undersøgelse af rekombination mellem et kanin P450 gen og et muse P450 gen. URA3, gær URA3 gen; 2μ, gær 2μ origin; Amp R, ampicillin resistens gen; Ori, E. coli replikationsorigin; pgal, galaktose inducerbar promotor; kp450, kanin P450 cdna; mp450, muse P450 cdna. BglII sitet adskiller de to P450 cdna stykker, der sidder som et direct repeat. Spm. F: Beskriv hvorledes plasmidet i Figur 7 kan anvendes til at studere homolog rekombination i gær. Figur 8 viser en alignment af kanin P450 cdna og mus P450 cdna. Positioner, hvor plasmidet i Figur 7, har givet overkrydsninger mellem kanin og mus P450 er indrammede.
7 Figur 8: Alignment af kanin og mus P450 cdna. Angivet er de positioner, hvor der er observeret overkrydsning mellem de to cdna er i ovenfor beskrevne gærsystem. Lodrette streger angiver nukleotider, der er identiske i mus og kanin. Spm. G: Hvad viser figur 8 omkring den homologe rekombinations-proces i gær?
8 Opgave 2 Mutationer i AIRE (auto-immun-regulator-gene) genet forårsager et monogent, autoimmunt syndrom APECED, som er karakteriseret ved tab af immunologisk tolerence overfor en række organspecifikke antigener. AIRE genet koder for et 57,5 kda stort protein. For at undersøge aktiviteten af AIRE proteinet blev de i Figur 1 viste plasmider konstrueret. SV40 P GAL4 DNA AIREcDNA G G G T CAT Figur 1: Strukturen af plasmider anvendt til undersøgelse af AIRE proteinets in vivo aktivitet. Det første plasmid indeholder en konstitutiv SV40 promotor fusioneret til en in frame fusion mellem cdna kodende for det DNA bindende domæne af GAL4 proteinet fra gær og AIREcDNA. Det andet plasmid indeholder tre GAL4 responselementer (angivet med G ), en TATA box (angivet med T ) og CAT cdna. Spm. A: Beskriv hvorledes de i Figur 1 viste plasmider kan anvendes til at teste den biologiske funktion af AIRE proteinet. For yderlige at få oplysninger om den aktive form af AIRE proteinet blev det i Figur 2 viste eksperiment udført.
9 Figur 2: En bestemt mængde in vitro fremstillet [ 35 S]-mærket AIRE protein blev blandet med 25, 50 eller 100 μl af et GST-AIRE fusionsprotein eller GST. GST (gluthation-s-transferase) har høj affinitet for gluthation. Efter inkubation natten over med Sepharosekugler koblet til gluthation blev de enkelte prøver centrifugeret, bundfaldet vasket og opløst i SDS-PAGE sample buffer. Resultatet af den efterfølgende SDS-PAGE separation blev visualiseret ved PhosphorImage analyse og er vist i Figuren. Input angiver påsætning af en større mængde in vitro fremstillet [ 35 S]-mærket AIRE protein end den, der er brugt til GST forsøgene. Pilen angiver positionen af AIRE proteinet. Spm. B: Hvad viser data i Figur 2? For at undersøge AIRE promotoren blev der fremstillet de i Figur 3 viste plasmider. Figur 3: Strukturen af plasmider indeholdende forskellige regioner af AIRE promotoren fusioneret til et luciferase reportergen (LUC). Transkriptionsstartsitet er markeret med en pil. Størrelsen af promotorfragmenterne er regnet fra transkriptionsstartsitet. Luciferase aktiviterne 24 timer efter transfektion i COS-7 celler (en abenyrecellelinje) er angivet med sorte søjler og i TEC1A3 celler (en human thymus epitel cellelinje) er angivet med hvide søjler. Samtlige luciferase plasmider er cotransficeret med et β-galaktosidase reporter plasmid. Alle resultater er således normaliserede til den samme transfektionseffektivitet. Luciferase aktiviteterne er angivet relativt til aktiviteten opnået med det promotorløse luciferase reporterplasmid nederst i Figuren.
10 AP-1 probe Spm. C: Beskriv, hvorledes du ville klone 1235 basepar opstrøms for transkriptionsstartsitet af det humane AIRE gen. Spm. D: Hvad viser data i Figur 3? En bioinformatisk analyse af AIRE promotoren afslører tilstedeværelse af en potentiel GC box, en potentiel CCAAT box, et potentielt bindingssite for transkriptionsfaktoren AP-1 og en potentiel TATA box. For at undersøge disse boxes potentielle betydning for aktiviteten af AIRE promotoren, blev der lavet EMSA forsøg. Data i Figur 4 viser resultaterne af EMSA assays på AP-1 sitet. Intet ekstrakt kold AP-1 probe kold uspecifik probe mut. AP-1 probe anti-jun-antistof anti-fos-antistof Figur 4: Resultatet af EMSA assay med kerneeskstrakt fra TEC1A3 celler og forskellige oligonukleotider og antistoffer. Intet ekstrakt, radioaktiv AP-1 oligo uden kerneekstrakt; AP-1 probe, radioaktiv AP-1 oligo + kerneekstrakt; kold AP-1 probe, radioaktiv AP-1 probe samt 100 ganges molært overskud af kold AP-1 oligo + kerneekstrakt; kold uspecifik probe, radioaktiv AP-1 probe ganges molært overskud af en oligo uden AP-1 site + kerneekstrakt ; mut. AP-1 probe, radioaktiv oligonukleotid hvor AP-1 sitet er muteret + kerneekstrakt; anti-jun-antistof, radioaktiv AP-1 oligo samt anti-jun-antistof + kerneekstrakt; anti-fos-antistof, radioaktiv AP1-oligo samt anti-fos-antistof + kerneekstrakt. De nøgne oligonukleotider er kørt ud af gelen og ses ikke. Spm. E: Hvad viser data i Figur 4?
11 Data i Figur 5 viser resultatet af transfektionsstudier af luciferase reportergenet fusioneret til en vildtype eller muteret AIRE promotor. Figur 5: Resultater af transient transfektion af COS-7 celler (sorte søjler) eller TEC1A3 celler (hvide søjler) med de viste plasmider. Alle resultater er normaliserede til den samme transfektionseffektivitet. Luciferase aktiviteterne er sat til 100% for vildtype promotoren. Mutationer, i de viste promotor elementer, er angivet med krydser. Spm. F: Hvad viser data i Figur 5? Figur 6 viser en beregning af antallet af CpG dinukleotider i AIRE promotoren i forhold til det forventede antal. Data i Figur 6 viser også resultatet af et methyleringsforsøg. Et plasmid indeholdende 1235 basepar af vildtypepromotoren fusioneret til luciferase reportergenet blev methyleret in vitro med SssI methylase, som methylerer cytosiner i CpG dinukleotider. Efter transient transfektion med methyleret henholdsvis ikke-methyleret DNA blev de i Figur 6 viste luciferase aktiviteter bestemt.
12 Figur 6: A, en opgørelse over forholdet mellem det observerede antal CpG dinukleotider og det forventede antal CpG dinukleotider i AIRE promotoren. B, resultatet af transient transfektion med en ikke-methyleret AIRE promotor-luciferase reportergen-fusion (pap1235) eller en methyleret AIRE promotor-luciferase-reportergen-fusion (SssI methylated pap1235) TECC1A3 celler. Resultaterne er normaliserede til den samme transfektionseffektivitet. Spm. G: Diskuter kort resultaterne i Figur 6?
Spm. B: Hvad viser data i Figur 2?
Opgave 1 Kernereceptorer (nuclear receptors) udgør en familie af ligandaktiverede transkriptionsfaktorer, der regulerer transkription af en række gener, som respons på tilstedeværelse af f.eks.lipofile
Læs mereSpm. A: Hvad viser data i Figur 1?
Opgave 1 Leptin er et plasma proteinhormon der primært produceres af og secerneres fra fedtceller (adipocytter). Leptin, der er kodet af ob (obecity) genet, er 16 kda stort. Leptins fysiologiske funktion
Læs mereBesvarelse til opgave 1 januar 1999 Spm. A: Spm. B:
Besvarelse til opgave 1 januar 1999 Spm. A: Vi må lave et genomisk bibliotek i en lambdafag, cosmid, BAC eller YAC plasmid. Til dette vil vi skære det genomiske DNA partielt med Sau3A, så vi får stykker
Læs mereLøsninger til opgaverne den Spm. A: Spm. B Spm. C:
Løsninger til opgaverne den 12-9-07 Spm. A: Her er vi i en situation at det eneste der kendes til vores receptor er, at den kan binde en ligand, som vi har til rådighed i en radioaktiv mærket version.
Læs mereCYP7A1 (0,1 nm) CYP7A1 (0nM) UBIC (0,1 nm)
Opgave 1 Leveren spiller en central rolle i lipid metabolismen og i opretholdelse af lipid homeostasen i hele kroppen. Lipidmetabolismen er fejlreguleret hos blandt andet svært overvægtige personer samt
Læs mereBesvarelse af opgaverne til den Spm.A: efter TGA TCA Spm. B:
Besvarelse af opgaverne til den 20-9-06 Spm.A: Her vil vi gerne sætte et relativt lille stykke DNA (FLAG) sammen med et relativt stort stykke (PRB1). Det lille stykke er for lille til at vi kan PCR amplificere
Læs meredatp, dctp, dgtp, dttp, [α 32 P]-dCTP urinstofholdig polyacrylamid gel røntgen film
Opgave 1 Denne opgave omhandler osteoblast differentiering. Osteoblast celler er involveret i opbygning af knoglevæv. Osteoblast celler dannes ud fra såkaldte calvarial celler. For at forstå det molekylære
Læs mereOpgave 1 Spm. A: Spm. B:
Opgave 1 Familien af TM7 receptorer (receptorer med 7 transmembrane segmenter) udgør ud fra genomsekvensen den største proteinfamile i C. elegans. Det samme må forventes at gælde i pattedyr. Imidlertid
Læs mereFigur 1: A, nukleotidsekvensen af starten og slutningen af RPB1 genet. Initierings- og terminerings
Opgave 2 juni 2004 Eukaryote celler indeholder 3 forskellige RNA polymeraser. Hver RNA polymerase er ansvarlig for transkription af bestemte klasser af gener. Ud fra mutationsanalyse i bagegær (Saccharomyces
Læs mereEn forsker har lavet et cdna insert vha PCR og har anvendt det følgende primer sæt, som producerer hele den åbne læseramme af cdna et:
F2011-Opgave 1. En forsker har lavet et cdna insert vha PCR og har anvendt det følgende primer sæt, som producerer hele den åbne læseramme af cdna et: Forward primer: 5 CC ATG GGT ATG AAG CTT TGC AGC CTT
Læs mereAugust Krogh Building Copenhagen University. Universitetsparken 13 2100 Copenhagen OE PAPedersen@aki.ku.dk
Per Amstrup Pedersen Institute of Molecular Biology August Krogh Building Copenhagen University Universitetsparken 13 2100 Copenhagen OE PAPedersen@aki.ku.dk En genteknologisk værktøjskasse. Version 2007
Læs mereVelkommen. Test dit eget DNA med PCR. Undervisningsdag på DTU Systembiologi. Undervisere:
Velkommen Test dit eget DNA med PCR Undervisningsdag på DTU Systembiologi Undervisere: Hvem er I? 2 DTU Systembiologi, Danmarks Tekniske Universitet Hvilke baser indgår i DNA? A. Adenin, Guanin, Cytosin,
Læs mereVelkommen. Test dit eget DNA med PCR. Undervisningsdag på DTU Systembiologi. Undervisere: Sebastian, Louise og Ana
Velkommen Test dit eget DNA med PCR Undervisningsdag på DTU Systembiologi Undervisere: Sebastian, Louise og Ana Hvem er I? 2 DTU Systembiologi, Danmarks Tekniske Universitet Dagens program 9:00 10:00 Introduktion
Læs mereOpgave 1 november 2004
Opgave 1 november 2004 Nedenfor er vist nukleotidsekvensen af cdna kodende for eif2α genet fra mus. Serin nummer 51 (S51) kan fosfoyleres af en eller flere eif2α kinaser. For at undersøge den biologiske
Læs mereLøsninger til opgaverne den Opgave 2 januar 2003 Spm. 1:
Løsninger til opgaverne den 6-9-06 Opgave 2 januar 2003 Spm. 1: Fidusen er her at vi kender den primære struktur af glukoamylasen fra tre forskellige svampe, en ascomycet, en basidiomycet og en zygomycet.
Læs mereBiologi opgave Opsamling: Cellebiologi (Bioanalytiker modul3)
1 Delphine Bonneau Biologi opgave Opsamling: Cellebiologi 1-6 Pelle har spist en kæmpe stor kage, og efterfølgende stiger hans blodsukker. Derfor sender kroppen besked til de endokrine kirtler i bugspytkirtlen
Læs mereRestriktionsenzymer findes Genkendelsessekvens
Restriktionsenzymer Skanning Restriktionsenzymer findes i bakterier (forsvarsmekanisme) IKKE i eukaryote celler 3-5 - 5-3 - Restriktionsenzyme Genkendelsessekvens Palindromisk Otto, Anna, radar Madam I
Læs mereAvl på honningbier det genetiske grundlag I
Avl på honningbier det genetiske grundlag I Egenskaber ved alle levende væsner bestemmes af 2 ting: Arv Miljø Grundlaget for alt avlsarbejde er at mange egenskaber nedarves. Hvad er arv og hvad er miljø
Læs mereBananfluer og nedarvning
Bananfluer og nedarvning Teori: Bananflue-genetik Bananfluens livscyklus Bananfluen, Drosophila melanogaster, har været brugt til at studere genetik i mere end 100 år. Denne diploide organisme har fuldstændig
Læs mereDette er en kladde til et genoptryk af Eksperimentel Genteknologi fra 1991. Ideer, rettelser og forslag modtages gerne. Kh Claudia.
Transformation af E.coli K 12 Version 3. marts 2009 (C) Claudia Girnth-Diamba og Bjørn Fahnøe Dette er en kladde til et genoptryk af Eksperimentel Genteknologi fra 1991. Ideer, rettelser og forslag modtages
Læs mereElevvejledning pglo transformation
Introduktion til transformation Elevvejledning pglo transformation I denne øvelse skal du lære fremgangsmåden ved genetisk transformation. Husk på, at et gen er et stykke DNA, der indeholder informationer
Læs mereGAPDH PCR modul Manual
GAPDH PCR modul Manual Katalog nr. 166-5010EDU explorer.bio-rad.com Kopiering kun tilladt til undervisningsbrug Bemærk: Kittet indeholder temperaturfølsomme dele. Åbn derfor straks kassen og læg de pågældende
Læs mereNDRG2 s Interaction with Api5
Naturvidenskabeligt Basisstudium Roskilde Universitet 2. semesterprojekt Juni 2012 Hus 13.1 NDRG2 s Interaction with Api5 NDRG2 s interaktion med Api5 Gruppe 12: Freya Armstrong Annaleigh Ohrt Fehler Cecilie
Læs mereOpgave 1 Listeria. mørkviolette bakteriekolonier, se figur 1a. og b. 1. Angiv reaktionstypen for reaktion. 1 vist i figur 1b.
Opgave 1 Listeria Bakterien Listeria monocytogenes kan være sygdomsfremkaldende for personer, der i forvejen er svækkede. For at identificere Listeria kan man anvende indikative agarplader. Her udnyttes
Læs mereBilag A Ordforklaringer
Bilag A Aldersstandardisere Justere talmateriale, så kræftudvik- 16, 17, 18 lingen kan sammenlignes uanset forskelle i aldersfordelingen, f.eks. mellem to lande. Allel De to "ens" genkopier i alle celler
Læs mereGenerne bestemmer. Baggrundsviden og progression: Niveau: 8. klasse. Varighed: 12 lektioner
Generne bestemmer Niveau: 8. klasse Varighed: 12 lektioner Præsentation: Generne bestemmer er et forløb om genernes indflydelse på individet. I forløbet kommer vi omkring den eukaryote celle, celledeling,
Læs mereBioteknologi A. Gymnasiale uddannelser. Vejledende opgavesæt 1. Mandag den 31. maj 2010 kl. 9.40-14.40. 5 timers skriftlig prøve
Vejledende opgavesæt 1 Bioteknologi A Gymnasiale uddannelser 5 timers skriftlig prøve Vejledende opgavesæt 1 Mandag den 31. maj 2010 kl. 9.40-14.40 Side 1 af 8 sider pgave 1. Genmodificeret ris Vitamin
Læs mereVEROCYTOTOKSIN-PRODUCERENDE BAKTERIOFAGER I E. COLI
VEROCYTOTOKSIN-PRODUCERENDE BAKTERIOFAGER I E. COLI Specialeprojekt i Biologi-bioteknologi, KU Patricia Espenhain Sørensen 13. juni 2017 RATIONALE Verocytotoxin-producerende E. coli (VTEC) / (STEC) - Vigtig
Læs mereGenetiske Aspekter af HCM hos Kat. - en introduktion til forskningsprojektet
Genetiske Aspekter af HCM hos Kat - en introduktion til forskningsprojektet Cand. scient. Mia Nyberg, ph.d. stud. mnje@life.ku.dk IMHS, Det Biovidenskabelige Fakultet, Københavns Universitet, Klinisk Biokemisk
Læs mereTest dit eget DNA med PCR
Test dit eget DNA med PCR Forsøgsvejledning Navn: Side 1 af 7 Formål med forsøget Formålet med dette forsøg er at undersøge jeres arvemateriale (DNA) for et transposon kaldet Alu. Et transposon er en DNA
Læs mereTest dit eget DNA med PCR
Test dit eget DNA med PCR Navn: Forsøgsvejledning Side 1 af 8 Formål med forsøget Formålet med dette forsøg er at undersøge jeres arvemateriale (DNA) for et transposon kaldet Alu. Et transposon er en DNA
Læs mereat du trænes i at genkende aminosyrer i en simpel proteinstruktur (pentapeptid = lille protein bestående af 5 (penta) aminosyrer)
Elevvejledning til det Virtuelle Kræftlaboratorium Det Virtuelle Kræftlaboratorium stiller krav til en grundig forståelse af det centrale dogme inden for molekylærbiologien, hvordan DNA oversættes til
Læs mereRegnskovens hemmeligheder
Center for Undervisningsmidler, afdeling København Regnskovens hemmeligheder Øvelsesvejledning Formål Et gen for et kræfthelbredende protein er blevet fundet i nogle mystiske blade i regnskoven. Forskere
Læs mereDanmarks Tekniske Universitet
Side 1 of 14 Danmarks Tekniske Universitet Skriftlig prøve, den 21/1-2013 Kursus navn: Kursus nr. 27633 Introduktion til Bioinformatik Tilladte hjælpemidler: Alle "Vægtning" Angivet ved de individuelle
Læs mereDanmarks Tekniske Universitet
Side 1 of 13 Danmarks Tekniske Universitet Skriftlig prøve, den 22/2-2013 Kursus navn: Introduktion til SystemBiologi Tilladte hjælpemidler: Alle "Vægtning" Angivet ved de individuelle opgaver. Kursusansvarlig
Læs mereTo modeller af NDRG2 proteinet: RCSB Protein Data Bank
2009 Roskilde Universitet Naturvidenskabelige Basisstudium 4. Semesters Projekt To modeller af NDRG2 proteinet: RCSB Protein Data Bank Bassam Tawfik Florian Malte Hermann Kenneth Ege Jørgensen Lena de
Læs mereBIOZYMER ØVELSE 3 BEKÆMP DIN β-lactamase - TEST DIN EGEN MEDICIN!
BIZYMER ØVELSE 3 BEKÆMP DIN β-lactamase - TEST DIN EGEN MEDICIN! FAGLIG BAGGRUND For at få det maksimale udbytte af denne øvelse er det en forudsætning, at teorien bag enzymer, enzymkinetik og resistensmekanismer
Læs mereTest dit eget DNA med PCR
Test dit eget DNA med PCR Navn: Forsøgsvejledning Side 1 af 8 Formål med forsøget Formålet med dette forsøg er at undersøge jeres arvemateriale (DNA) for et transposon kaldet Alu. Et transposon er en DNA-sekvens,
Læs merePCR (Polymerase Chain Reaction): Opkopiering af DNA
PCR (Polymerase Chain Reaction): Opkopiering af DNA PCR til at opkopiere bestemte DNA-sekvenser i en prøve er nu en af genteknologiens absolut vigtigste værktøjer. Peter Rugbjerg, Biotech Academy PCR (Polymerase
Læs mereTest dit eget DNA med PCR
Test dit eget DNA med PCR Navn: Forsøgsvejledning Formål med forsøget Formålet med dette forsøg er at undersøge jeres arvemateriale (DNA) for et transposon kaldet Alu. Et transposon er en DNA sekvens,
Læs mereBIOLOGI A-NIVEAU NY ORDNING. Tirsdag den 19. august 2008. Kl. 09.00 14.00 STX082-BIA STUDENTEREKSAMEN AUGUST 2008
STUDENTEREKSAMEN AUGUST 2008 BIOLOGI A-NIVEAU Tirsdag den 19. august 2008 NY ORDNING Kl. 09.00 14.00 Af opgaverne 1, 2, 3 og 4 skal tre og kun tre af opgaverne besvares STX082-BIA Undervisningsministeriet
Læs mereAnalyse af proteiner Øvelsesvejledning
Center for Undervisningsmidler, afdeling København Analyse af proteiner Øvelsesvejledning Formål At separere og analysere proteiner i almindelige fødevarer ved brug af gelelektroforese. Teori Alle dele
Læs mereKapitel 1 Genteknologi (1/6)
Kapitel 1 Genteknologi (1/6) Transformation FOTO: SØREN LUNDBERG FORMÅL At isolere plasmider fra plasmidbærende bakterier og overføre dem til andre bakterier. TEORI Transformation er den teknik, hvor generne
Læs mereBiosensor Niveau 1. Teori
Biosensor Niveau 1 Teori Inden du starter... For at kunne forstå teorien som ligger til grund for en biosensor er det vigtigt at du har styr på nogle generelle mikro/molekyler biologiske principper, begreber
Læs mereKrydsning af mangelmutanter Krydsninger af haploide gæstammer med gendefekter
Claudia Girnth-Diamba, Bjørn Fahnøe og Barbara Wilken Krydsning af mangelmutanter Krydsninger af haploide gæstammer med gendefekter Indledning Livscyklus Gærceller har en særlig livscyklus. De kan formere
Læs mereBIOLOGI HØJT NIVEAU. Torsdag den 10. august 2000 kl. 9.00-14.00
STUDENTEREKSAMEN AUGUST 2000 2000-6-2 BIOLOGI HØJT NIVEAU Torsdag den 10. august 2000 kl. 9.00-14.00 Af de store opgaver 1 og 2 må kun den ene besvares. Af de små opgaver 3, 4, 5, 6 og 7 må kun to besvares.
Læs mereBiologi B oven på C. Nationalparkens Økologi. Rusmidler. Evolution og Infektionssygdomme. C-niveau forventes kendt
Undervisningsbeskrivelse til 2q3ab BiB1 2012/2013 Stamoplysninger til brug ved prøver til gymnasiale uddannelser Termin Termin hvori undervisningen afsluttes: Maj-juni 12/13 Institution Uddannelse Fag
Læs mereReplikation af Vibrio cholerae kromosom II origin, oricii Vc
Replikation af Vibrio cholerae kromosom II origin, oricii Vc [Replication of Vibrio cholerae chromosome II origin, oricii Vc ] Molekylærbiologisk bachelormodulprojekt Roskilde Universitet Efteråret 2009
Læs mereGensplejsning af byg uden brug af selektionsgener
Gensplejsning af byg uden brug af selektionsgener Genetisk modificerede planter indeholder som regel gener, som gør planten modstandsdygtig overfor enten et ukrudtsmiddel eller et antibiotikum. Disse gener,
Læs mereBIOLOGI HØJT NIVEAU. Mandag den 13. august 2001 kl
STUDENTEREKSAMEN AUGUST 2001 2001-6-2 BIOLOGI HØJT NIVEAU Mandag den 13. august 2001 kl. 9.00-14.00 Af de store opgaver 1 og 2 må kun den ene besvares. Af de små opgaver 3, 4, 5 og 6 må kun to besvares.
Læs mereKrydsning af mangelmutanter Krydsninger af haploide gæstammer med gendefekter
Claudia Girnth-Diamba, Bjørn Fahnøe og Barbara Wilken Krydsning af mangelmutanter Krydsninger af haploide gæstammer med gendefekter Indledning Livscyklus Gærceller har en særlig livscyklus. De kan formere
Læs mere# Problemet med genetisk ustabilitet
Forskningsnyheder om Huntingtons Sygdom På hverdagssprog Skrevet af forskere. Til det globale HS-fællesskab Et DNA-reparerende protein ændrer stabiliteten af lange CAG-områder i det muterede gen for Huntingtons
Læs mereBIOZYMER ØVELSE 2 OPRENSNING AF PROTEINER
BIOZYMER ØVELSE 2 OPRENSNING AF PROTEINER FAGLIG BAGGRUND Det forudsættes, at den grundlæggende teori bag rekombinant protein ekspression og proteinopresning er bekendt. For dette henvises til undervisningsmateriale
Læs mereNye og traditionelle metoder i planteforædling. Søren K. Rasmussen Institut for Plante- og Jordbrugsvidenskab, 27. september 2016
Nye og traditionelle metoder i planteforædling Søren K. Rasmussen Institut for Plante- og Jordbrugsvidenskab, 27. september 2016 12-10-2016 2 Traditionel forædling Vælge forældrene Krydse forældrene Selektere
Læs mereDNA methylering i GNAS1-genet
DNA methylering i GNAS1-genet Mia Rauff Projekt forskerspirer 2017 Sundhedsvidenskab 1 Indhold Indledning... 3 Afgrænsning og problemformulering... 3 Metodevalg og teori... 4 DNA-methylering... 4 Metodevalg...
Læs mereTest dit eget DNA med PCR
Test dit eget DNA med PCR Navn: Forsøgsvejledning Side 1 af 8 Formål med forsøget Formålet med dette forsøg er at undersøge jeres arvemateriale (DNA) for et transposon kaldet Alu. Et transposon er en DNA-sekvens,
Læs mereBIOLOGI HØJT NIVEAU. Mandag den 9. august 2004 kl
STUDENTEREKSAMEN AUGUST 2004 2004-6-2 BIOLOGI HØJT NIVEAU Mandag den 9. august 2004 kl. 9.00-14.00 Af de store opgaver 1 og 2 må kun den ene besvares. Af de små opgaver 3, 4, 5 og 6 må kun to besvares.
Læs mereProteinkompleksdannelse mellem tumorssuppresorproteinet, hndrg2, og antiapoptose mapi5-sekvenser
Proteinkompleksdannelse mellem tumorssuppresorproteinet, hndrg2, og antiapoptose mapi5-sekvenser (PROTEIN COMPLEX FORMATION BETWEEN THE TUMORSUPPRESSOR PROTEIN hndrg2 AND THE SEQUENES OF ANTIAPOPTOSIS
Læs mereDanmarks Tekniske Universitet
Side 1 of 17 Danmarks Tekniske Universitet Skriftlig prøve, den 21/1-2013 Kursus navn: Kursus nr. 27633 Introduktion til Bioinformatik Tilladte hjælpemidler: Alle "Vægtning" Angivet ved de individuelle
Læs mereDNA origami øvelse. Introduktion. DNA origami øvelse 3 timer 2018
DNA origami øvelse Introduktion I denne øvelse bruger vi DNA origami teknikken til at samle en tavle af DNA med dimensioner på 70 nm x 100 nm. Tavlen dannes af et langt enkeltstrenget DNA molekyle, der
Læs mereBIOLOGI A-NIVEAU NY ORDNING. Tirsdag den 20. maj 2008. Kl. 09.00 14.00 STX081-BIA STUDENTEREKSAMEN MAJ 2008
STUDENTEREKSAMEN MAJ 2008 BIOLOGI A-NIVEAU Tirsdag den 20. maj 2008 NY ORDNING Kl. 09.00 14.00 Af opgaverne 1, 2, 3 og 4 skal tre og kun tre af opgaverne besvares STX081-BIA Undervisningsministeriet Side
Læs mereBakteriers immunsystem
FORSKNING 25 Bakteriers immunsystem åbner døren til en ny æra for biologien Bakteriers immunforsvar mod virus kaldet CRISPR-Cas viser vejen til en teknologi, der rummer et enormt potentiale indenfor bioteknologien.
Læs mereFORKOMST OG EFFEKTER AF HORMONFORSTYRRENDE KEMIKALIER I DANSKE VANDLØB
AARHUS UNIVERSITET Den 8. December 2010 FORKOMST OG EFFEKTER AF HORMONFORSTYRRENDE KEMIKALIER I DANSKE VANDLØB Pia Lassen, Seniorforsker Danmarks Miljøundersøgelser, Aarhus Universitet FORMÅL Formålet
Læs mereHOXA9 og CDX2 i relation til leukæmi
HOXA9 og CDX2 i relation til leukæmi Gruppe 5 Kristina Berg, Mathilde Schmidt, Ninette Jensen, Sabrina Wielsøe & Sophie Tolstrup 2. Semesterprojekt, Forår 2013 Roskilde Universitet, Nat. Bach, 2. semester,
Læs mereCisgen byg med bedre fosfatudnyttelse
Cisgen byg med bedre fosfatudnyttelse Seniorforsker Inger Bæksted Holme Aarhus Universitet, Science and Technology, Institut for Molekylærbiologi og Genetik, Afgrødegenetik og Bioteknologi Hypotese Det
Læs mereForberedelse til erhvervspraktikophold i fluelaboratoriet
Forberedelse til erhvervspraktikophold i fluelaboratoriet Efteråret 2012 Ole Kjærulff 1 Om bananfluen Mød den sortmavede elsker! Bananfluen hedder på latin Drosophila melanogaster, med tryk på so og ga
Læs mereUniversity of Copenhagen. Markørfrie GMO ved hjælp af rekombination Grønlund, Jesper T. ; Bach, Inga Christensen; Grasser, Klaus
university of copenhagen University of Copenhagen Markørfrie GMO ved hjælp af rekombination Grønlund, Jesper T. ; Bach, Inga Christensen; Grasser, Klaus Published in: Planteforskning.dk Publication date:
Læs mereEksamensspørgsmål Biologi C maj-juni 2014 Sygeeksamen: 4cbicsy1
Eksamensspørgsmål Biologi C maj-juni 2014 Sygeeksamen: 4cbicsy1 HF og VUC Nordsjælland. Helsingørafdelingen Lærer: Lisbet Heerfordt, Farumgårds Alle 11, 3520 Farum, tlf. 4495 8708, mail: lhe@vucnsj.dk.
Læs mereSide 1 of 11. Kursus navn: Kursus nr Introduktion til Bioinformatik
Side 1 of 11 Danmarks Tekniske Universitet Skriftlig prøve, den 22/1-2015 Kursus navn: Kursus nr. 27633 Introduktion til Bioinformatik Tilladte hjælpemidler: Alle "Vægtning" Angivet ved de individuelle
Læs merePrøver Evaluering Undervisning
Prøver Evaluering Undervisning Biologi og geografi Maj-juni 2011 Indhold Indledning 2 Formålet med de digitale afgangsprøver i biologi og geografi 2 Biologi 2 Geografi 3 Opgavekonstruktion og parallelopgaver
Læs mereDesigner-mus designer-menneske. Ernst-Martin Füchtbauer Institut for Molekylærbiologi og Genetik, Aarhus Universitet
Designer-mus designer-menneske Ændring i det menneskelige genom er der et formål? Ernst-Martin Füchtbauer Institut for Molekylærbiologi og Genetik, Aarhus Universitet Tidslinie 1958 Kloning af dyr (frø)
Læs mereMarkørfrie GMO ved hjælp af rekombination
Markørfrie GMO ved hjælp af rekombination Under fremstilling af genetisk modificerede planter indsættes som regel gener, som gør planteceller modstandsdygtige overfor et antibiotikum eller et ukrudtsmiddel.
Læs mere3u BI, terminsprøve (Bio A)
3.u BI, terminsprøve, 2018 MV 3u BI, terminsprøve (Bio A) Torsdag den 12/4, 2018, kl. 9-14. Af opgaverne 1, 2, 3, og 4 skal tre, og kun tre, afleveres Tilladte hjælpemidler: Bøger, kompendier, noter, lommeregner.
Læs mereCellemembrantransportprocesser
1. Cellemembrantransportprocesser 1. En redegørelse for forskellige celletypers opbygning og de måder stoffer kan transporteres hen over cellemembranen. 2. En forklaring af hvordan en nerveimpuls opstår
Læs mereUndervisningsbeskrivelse
Undervisningsbeskrivelse Stamoplysninger til brug ved prøver til gymnasiale uddannelser Termin Institution Uddannelse Fag og niveau Lærer(e) Hold Termin hvori undervisningen afsluttes: maj-juni 2015 Marie
Læs mereartus EBV QS-RGQ-kit Ydelsesegenskaber Maj 2012 Sample & Assay Technologies Analysefølsomhed plasma artus EBV QS-RGQ-kit, Version 1,
artus EBV QS-RGQ-kit Ydelsesegenskaber artus EBV QS-RGQ-kit, Version 1, 4501363 Kontroller, om der er nye revisioner med elektronisk mærkning på www.qiagen.com/products/artusebvpcrkitce.aspx inden udførelse
Læs mereBioteknologi A. Studentereksamen. Af opgaverne 1 og 2 skal begge opgaver besvares. Af opgaverne 3 og 4 skal en og kun en af opgaverne besvares.
Bioteknologi A Studentereksamen Af opgaverne 1 og 2 skal begge opgaver besvares. Af opgaverne 3 og 4 skal en og kun en af opgaverne besvares. frs111-btk/a-31052011 Tirsdag den 31. maj 2011 kl. 9.00-14.00
Læs mereBIOLOGI HØJT NIVEAU. Mandag den 11. august 2003 kl. 9.00-14.00
STUDENTEREKSAMEN AUGUST 2003 2003-6-2 BIOLOGI HØJT NIVEAU Mandag den 11. august 2003 kl. 9.00-14.00 Af de store opgaver 1 og 2 må kun den ene besvares. Af de små opgaver 3, 4, 5 og 6 må kun to besvares.
Læs mereDansk resumé for begyndere
Dansk resumé for begyndere Dansk resumé for begyndere Dette afsnit introducerer bakteriel genregulation for enhver uden forudgående kendskab til dette emne. Alle nødvendige, videnskabelige betegnelser
Læs mereNormalfordelingen og Stikprøvefordelinger
Normalfordelingen og Stikprøvefordelinger Normalfordelingen Standard Normal Fordelingen Sandsynligheder for Normalfordelingen Transformation af Normalfordelte Stok.Var. Stikprøver og Stikprøvefordelinger
Læs mereUndervisningsbeskrivelse fra august 2014
Undervisningsbeskrivelse fra august 2014 Stamoplysninger til brug ved prøver til gymnasiale uddannelser Termin Oktober 2015 Institution Hansenberg Gymnasium Uddannelse Fag og niveau Lærer(e) Hold HTX Bioteknologi
Læs mereArvelige sygdomme. Blodtyper. Testosteron
Arvelige sygdomme Med udgangspunkt i vedlagte bilagsmateriale og relevant eksperimentelt arbejde skal du holde et oplæg om arvelige sygdomme som f.eks. cystisk fibrose. Kom herunder ind på sygdommens genetiske
Læs mereCellen og dens funktioner
Eksamensopgaver Biologi C, 17bic80 6. og 7. juni 2018 1 Cellen og dens funktioner 1. Redegør for hvordan eukaryote og prokaryote celler i hovedtræk er opbygget, herunder skal du gøre rede for forskelle
Læs mereBIOLOGI HØJT NIVEAU. Onsdag den 10. maj 2000 kl. 9.00-14.00
STUDENTEREKSAMEN MAJ 2000 2000-6-1 BIOLOGI HØJT NIVEAU Onsdag den 10. maj 2000 kl. 9.00-14.00 Af de store opgaver 1 og 2 må kun den ene besvares. Af de små opgaver 3, 4, 5, 6 og 7 må kun to besvares. STORE
Læs mere27611 Eksamen Sommer 2007
- Side 1 af 10-27611 Eksamen Sommer 2007 Dette sæt indeholder 4 opgaver. En online version af opgavesættet vil være tilgængeligt fra kursets lektionsplan, under selve eksamen (25. Maj 2007 klokken 9:00
Læs mereFaktor V Leiden mutation
Faktor V Leiden mutation Formål: finde ud af om individ har mutation i faktor V Leiden gen (missense: arginin glutamin) Materiale: oprens DNA fra leukocytter Metode: PCR med specifikke primere, oprens,
Læs merepglo-transformationskit
Katalog nummer 166-0003-EDU pglo-transformationskit arac ori pglo bla GFP Oversat og bearbejdet af Birgit Sandermann Justesen og Lars Moeslund, 2004 Brugen af dette kit til undervisningsbrug skal varetages
Læs mereUdarbejdet af Anna-Alexandra Grube Hoppe
METODER - BIOKEMI For medicinstuderende - Panuminstituttet UDARBEJDET AF ANNA-ALEXANDRA GRUBE HOPPE RESTRIKTIONSENZYM ANALYSE (E: 329-330) Restriktionsenzym analyse er en metode, der bruges til at kortlægge
Læs mereGodkendelse produktionslokale genetisk modificerede Escherichia coli
Immunitrack ApS Københavns Biocenter Ole Maaløes Vej 5 2200 København N Pesticider og Genteknologi J.nr. MST-6840-00021 Ref. johpe Den 04. august 2015 Godkendelse af produktionslokale og genetisk modificerede
Læs mereBiologien bag epidemien
Biologien bag epidemien Af Niels Kristiansen, biologilærer, Grindsted Gymnasium Sygdomme kan smitte på mange måder. Enten via virus, bakterier eller parasitter. I det følgende vil vi koncentrere os om
Læs mereDNA origami øvelse 2013. DNA origami øvelse
DNA origami øvelse Introduktion I denne øvelse bruger vi DNA origami teknikken til at samle en tavle af DNA med dimensioner på 70 nm x 100 nm. Tavlen dannes af et langt enkeltstrenget DNA molekyle, der
Læs mereKromosomer med genet: Genotype (= arveformel): RR Rr rr Fænotype (= fremtoning): Rød Rød Hvid
Kromosomer med genet: R R R r r r Genotype (= arveformel): RR Rr rr Fænotype (= fremtoning): Rød Rød Hvid P-generation: Kønsceller: RR rr Meiose R R r r Befrugtning F 1-generation: Meiose Rr Rr Kønsceller:
Læs mereSvarark for (navn) Skole: Opgave 22 besvares DIREKTE her i opgaven.
Opgave 22 besvares DIREKTE her i opgaven. 22. Den røde farve i kød skyldes myoglobin som er et globulært protein. Myoglobin indeholder ligesom hæmoglobin en organisk gruppe (hæm) med en tilknyttet jern(ii)-ion
Læs merepglo-transformationskit
1 Katalog nummer 166-0003-EDU www.bio-rad.com pglo-transformationskit arac ori pglo bla GFP Oversat og bearbejdet af Birgit Sandermann Justesen og Lars Moeslund, 2007 Revideret november 2009. Kontakt:
Læs mereProteinelektroforese af GFP Suppleringskit til pglo
Proteinelektroforese af GFP Suppleringskit til pglo Katalognummer nr. 166 0013EDU www.bio rad.com Oversat og bearbejdet af Birgit Sandermann Justesen, Nærum Gymnasium, Nærum Hovedgade 30, 2850 Nærum Birgitjustesen@gmail.com
Læs mereTilpas: Hurtig adgang
Tilpas: Hurtig adgang Genveje, Se skærmtips Se tips Hold alt tasten nede. Og brug bogstaver Word Fanen Filer PDF dokument Brug skabelon Visninger Husk Luk ved fuldskærmsvisning Brug zoom skyder Marker,
Læs mereUndervisningsbeskrivelse
Undervisningsbeskrivelse Stamoplysninger til brug ved prøver til gymnasiale uddannelser Termin Institution Uddannelse Fag og niveau Lærer(e) Termin hvori undervisningen afsluttes: maj-juni, 2012 Skive
Læs mere1. Afrikansk plante med mulig gavnlig virkning på diabetes type II. 2. Bestemmelse af genomer hos forskellige arter organismer
Eksamensspørgsmål til biobu juni 2012 1. Afrikansk plante med mulig gavnlig virkning på diabetes type II Forklar hvordan insulin er opbygget, dets dannelse og virkemåde. Hvad er årsagen til diabetes type
Læs mereBanan DNA 1/6. Formål: Formålet med øvelsen er at give eleverne mulighed for at se DNA strenge med det blotte øje.
Banan DNA Formål: Formålet med øvelsen er at give eleverne mulighed for at se DNA strenge med det blotte øje. Baggrundsviden: Om vi er mennesker, dyr eller planter, så har alle organismer DNA i deres celler.
Læs mere