Årsrapport vedrørende laboratorieundersøgelser af materiale fra svin på DTU Veterinærinstituttet og Laboratorium for svinesygdomme i Kjellerup

Transkript

1 Årsrapport 203 vedrørende laboratorie af materiale fra svin på DTU Veterinærinstituttet og Laboratorium for svinesygdomme i Kjellerup Juni 204

2 Indhold. Indledning Data og materiale Undersøgelser af diagnostiske prøver Undersøgelser og resultater af overvågningsprøver Undersøgelser af eksportprøver på DTU Vet

3 . Indledning Formålet med denne rapport er at foretage opgørelse af data fra DTU Veterinærinstituttet (DTU Vet) og Laboratorium for Svinesygdomme, Videncenter for Svineproduktion, Kjellerup (VSP Kjellerup) fra 203 med henblik på at skabe et overblik over forekomsten af infektiøse sygdomme i den danske svineproduktion. Rapporten fokuserer på oprindelse og omfang af materialer, nes art og antal samt resultater fra indsendelser til de to laboratorier. For DTU Vet data er der foretaget opdeling af data efter hensigten af indsendelserne, som er kategoriseret i eksport, overvågning og diagnostik. For VSP Kjellerup data foretages der ikke registreringer af hensigten med indsendelserne, men her gælder det i overvejende grad, at de serologiske vedrører overvågning af visse SPF-relevante sygdomme og de øvrige vedrører primært diagnostik af endemiske sygdomme. 2. Data og materiale Tabel, 2 og 3 viser antal indsendelser, prøver og på DTU Vet. Indsendelser til DTU Vet vedrører histopatologiske, bakteriologiske, parasitologiske, serologiske og virologiske. Indsendelser til VSP Kjellerup vedrører patologiske, bakteriologiske og serologiske. Tabel 4 viser antal indsendelser til VSP Kjellerup fordelt på materiale. Det nøjagtige antal blodprøver undersøgt af VSP Kjellerup var det ikke muligt at opgøre pga. begrænsninger i laboratoriesystemet. Tabel. indsendelser, prøver og på DTU Vet 203 Hensigt indsendelser prøver Eksport Diagnostik Overvågning Andre Totalt Tabel 2. Oprindelse af indsendelser til DTU Vet 203 Indsendelsestype indsendelser prøver Praksis VSP-laboratorium Slagteri Andet Kan være private firmaer, offentlige institutioner, universiteter m.m. 3

4 Tabel 3. prøver per indsendelseshensigt af forskellige materialer indsendt til DTU Vet 203 Hensigt Blod Fæces Kadaver Organer Næsesvaber Eksport Diagnostik Overvågning Andre Total Tabel 4. prøver af forskellige materialer indsendt til VSP Kjellerup 203 Blod Fæces Kadavere Organer Næsesvabere Organer, USK* VSP Ukendt *) Udvidet Sygdoms Kontrol af organer udtaget på slagteri (lunger, maver og reproduktionsorganer) eller af grise fra farestalden indsendt fra besætninger. Der var 866 indsendelser med organer Figur viser placering af svinebesætninger i Danmark. Blå besætninger (2.7) indsendte prøver til DTU Vet. Røde besætninger (.562) til VSP Kjellerup. Grønne besætninger (.284) indsendte til begge laboratorier. Grå besætninger indsendte ikke prøver til nogen af dem. En del af de prøver, som tilgår DTU Vet er prøver fra VSP Kjellerup til supplerende (typebestemmelser, serologi, histologi, FISH, IHC, PCR). Figuren viser, at prøverne bliver sendt fra hele landet og at grise fra alle geografiske områder er undersøgt på et diagnostisk laboratorium i

5 Figur. Placering af svinebesætninger i Danmark i 203. Blå besætninger indsendte prøver til DTU Vet; røde besætninger til VSP Kjellerup, grønne besætninger indsendte til begge laboratorier og grå besætninger indsendte ikke prøver til nogen af dem. 5

6 3. Undersøgelser af diagnostiske prøver Indsendelser vedrørende diagnostik omfatter prøver, som er blevet indsendt af dyrlæger med henblik på afklaring af infektiøse årsager til et sygdomsproblem. Tabel 5. for nogle specifikke virus udført på DTU Vet ved PCR i 203 Patogen positive PCV Influenza PPV 69 3 PRRS Heraf 452 fra Luftvejspakken, som er en samlet undersøgelse for M. hyopneumoniae, PCV2 og influenza. Tabel 6 viser antal indsendelser til VSP Kjellerup hvor Salmonella blev påvist i relation til afklaring af klinisk sygdom. De fleste positive indsendelser var med påvisning af Salmonella Typhimurium og monofasisk Salmonella Typhimurium. Det er særligt bemærkelsesværdigt, at der i 5 sager (fra 3 besætninger) blev påvist Salmonella Choleraesuis. I perioden blev Danmark anset fri for Salmonella Choleraesuis, mens der i 202 blev påvist Salmonella Choleraesuis i én svinebesætning. Tabel 6. indsendelser til VSP Kjellerup hvor Salmonella blev påvist i relation til afklaring af klinisk sygdom Salmonella serotype Salmonella Typhimurium 25 Salmonella 4,5,2:i:- (Monofasisk Typhimurium) 7 Salmonella 4,2:i:- (Monofasisk Typhimurium) 3 Salmonella Derby Salmonella Choleraesuis, var Kunzendorf 5 Salmonella Infantis 2 Salmonella Livingstone 2 Salmonella 4.2:b:- (Monofasisk Typhimurium) Salmonella Agona 6

7 I tabel 7 vises antal indsendelser til VSP-Kjellerup med de hyppigste fund af patogene bakterier. Der er en lang række bakteriefund af mere sporadisk forekomst, som ikke er inkluderet i tabellen. Tabel 7. indsendelser til VSP-Kjellerup, med påvisning af bakterier Beskrivelse Bakterier isoleret fra luftvejene Actinobacillus pleuropneumoniae 65 Bordetella bronchiseptica 22 Haemophilus parasuis påvist 57 Pasteurella multocida påvist 2 Tarmbakterier Brachyspira hyodysenteriae 0 Brachyspira pilosicoli 8 Clostridium perfringens 06 Lawsonia intracellularis 46 E. coli type - 80 E. coli serotype O38 5 E. coli serotype O39 32 E. coli serotype O4 8 E. coli serotype O49 38 E. coli serotype O57 5 E. coli serotype O64 4 Salmonella 2 75 Andre Bakterier Arcanobacterium pyogenes 8 Erysipelothrix rhusiopathiae Staphylococcus aureus Staphylococcus hyicus 2 Streptococcus dysgalactiae ssp. Equisimilis 7 Streptococcus suis, type 2 44 Streptococcus suis, type 7 25 Streptococcus suis, type 8 7 Streptococcus suis, anden type 2 Detaljer om typebestemmelser i tabel. 2 Salmonella isoleret fra indsendelser vedrørende afklaring af klinisk sygdom. 7

8 Tabel 8. for specifikke bakterier udført på DTU Vet. Bakteria positive Brachyspira hyodysenteriae, FISH 23 9 Brachyspira pilosicoli, FISH 6 2 Brachyspira spp., FISH Haemophilus parasuis, PCR Lawsonia, IHC Lawsonia, PCR Leptospira spp., IHC 42 Mycoplasma hyopnemonia, PCR Heraf 452 fra Luftvejspakken Resultaterne af Diarrepakken ved PCR er præsenteret i tabel 9. Diarrepakken indeholder for E. coli Fimbrietype F4 (K88), E. coli Fimbrietype F8 (F07), Lawsonia intracellularis, Brachyspira pilosicoli og PCV2. PCV2 blev dog taget ud af diarrepakken ultimo 203. Der blev udført 225 ved diarrepakken (Tabel 9). Undersøgelser og resultater af sokkeprøver ved PCR er præsenteret i tabel 0. Sokkeprøver er poolet fæces indsamlet ved at påføre en filtsok på støvlerne og vandre gennem alle stier i én sektion. Prøven undersøges ved kvantitative PCR for samme agens som ved diarrepakken. Sokkemetoden blev introduceret ultimo 203. Tabel 9. og resultater af PCR- diarrepakke Patogen positive E. coli Fimbrietype F4 (K88) E. coli Fimbrietype F8 (F07) Lawsonia intracellularis Brachyspira pilosicoli PCV

9 Tabel 0. og resultater af PCR- sokkeprøver Patogen positive E. coli Fimbrietype F4 (K88) 25 7 E. coli Fimbrietype F8 (F07) 25 Lawsonia intracellularis 25 4 Brachyspira pilosicoli 25 5 Tabel. typebestemmelser på DTU Vet af bakterie isolater modtaget fra VSP Kjellerup Bakterie positive Actinobacillus pleuropneumoniae, antal prøver totalt 76 Type Type Type Type Clostridium perfringens, antal prøver totalt Type A 09 Type C Staphylococcus hyicus, antal prøver totalt Toxin type A 0 Toxin type B 0 Toxin type C 0 Toxin type D 0 Toxin type ip E. coli, antal prøver totalt 93 F LT 93 STA 93 2 STB 93 VT2e og resultaterne af typebestemmelser udført på DTU Vet for bakterie isolater modtaget fra VSP Kjellerup er præsenteret i tabel. Undersøgelser for Staphylococcus hyicus toxiner udføres specielt i forbindelse med bestilling af autovaccine mod sodeksem/eksudativ dermatitis hos pattegrise. let var usædvanligt lavt i 203. Undersøgelser for E. coli virulensfaktorer (fimbrier og toxiner) udføres især i forbindelse med mistanke om ødemsyge, og derfor er fund af fimbrietype F8 og verotoxin2e (VT2e) de hyppigste fund. 9

10 Serologiske for endemiske virus og for bakterier udført på DTU Vet er præsenteret i tabel 2 og 3. De fleste serologiske for virusinfektioner vedrørte Svineinfluenza, og hovedparten af de serologiske for bakterieantistoffer vedrørte Actinobacillus pleuropneumoniae. Det er kun en mindre andel af for de anførte infektioner, der er markeret som diagnostik på indsendelsen, og langt de fleste indsendelser af blodprøver vedrører overvågning eller eksport, jf. tabeller i de følgende afsnit. Tabel 2. Serologiske for endemiske virus på DTU Vet Sygdom positive Svineinfluenza PCV PPV PRRS-EU-IPT 3 45 PRRS-US-IPT 9 37 PRRS-EU-ELISA PRRS-US-ELISA Porcin respiratorisk coronavirus 6 9 Tabel 3. Serologiske for bakterier-antistoffer, DTU Vet Bakteria positive Actinobacillus pleuropneumoniae serotype 89 0 Actinobacillus pleuropneumoniae serotype Actinobacillus pleuropneumoniae serotype Actinobacillus pleuropneumoniae serotype Actinobacillus pleuropneumoniae serotype Actinobacillus pleuropneumoniae serotype Actinobacillus pleuropneumoniae serotype 0 70 Actinobacillus pleuropneumoniae serotype Actinobacillus pleuropneumoniae type 2, 6, H.parasuis 9 35 Lawsonia intracellularis Leptospira bataviae 4 0 Leptospira bratislava Leptospira grippotyphosa 0 0 Leptospira tarassovi 0 0 Leptospira pomona Mycoplasma hyopneumoniae 2,

11 4. Undersøgelser og resultater af overvågningsprøver Indsendelser i denne kategori inkluderer prøver i forbindelse med avl- og opformering, prøver fra KSstationer, SPF sundhedskontrol og overvågningsprøver ifølge aftaler med Fødevarestyrelsen. Serologiske og resultater for eksotiske virus udført på DTU Vet er præsenteret i tabel 4. Denne tabel er desuden suppleret med antal for svinepestvirus udført ved PCR. Der blev udført for Aujeszky-virus og for klassisk svinepest-virus. Alle blev bekræftet som negative. Serologiske og resultater for endemiske virus udført på DTU Vet er præsenteret i tabel 5. Undersøgelser for PRRS udgjorde langt den største andel i denne gruppe. Tabel 4. Serologiske og resultater for eksotiske virus på DTU Vet Sygdom positive Aujeszky-virus Porcin epidemisk diarre virus 0 0 Klassisk svinepest virus Transmissible gastroenteritis virus Swine vesicular disease virus 305 Svinepest, undersøgt ved PCR 07 0 Falske positive. Besætningerne blev bekræftet negative ved efterfølgende foretaget af Fødevarestyrelsen. Tabel 5. Serologiske for endemiske virus på DTU Vet Sygdom positive Svineinfluenza PCV PPV 20 0 PRRS-EU-IPT PRRS-US-IPT PRRS-EU-ELISA PRRS-US-ELISA Tabel 6 viser antal og positive for bakterie-antistoffer, som er blevet udført på DTU Vet i relation til overvågningsprøver. Actinobacillus pleuropneumoniae udgør det største antal analyser med for samtlige serotyper (Tabel 6).

12 Tabel 7 viser antal prøver og positive prøver, antal indsendelser og antal indsendelser med positive prøver for de serologiske, som blev udført på VSP Kjellerup i 203 for hhv. Actinobacillus pleuropneumoniae serotype 2, 6 og 2, samt Mycoplasma hyopneumoniae og PRRS. Tabel 6. Serologiske for bakterier-antistoffer, DTU Vet Bakteria positive Actinobacillus pleuropneumoniae serotype Actinobacillus pleuropneumoniae serotype Actinobacillus pleuropneumoniae serotype Actinobacillus pleuropneumoniae serotype Actinobacillus pleuropneumoniae serotype Actinobacillus pleuropneumoniae serotype Actinobacillus pleuropneumoniae serotype 9 0 Actinobacillus pleuropneumoniae serotype Actinobacillus pleuropneumoniae serotype 0 Actinobacillus pleuropneumoniae serotype Actinobacillus pleuropneumoniae type 2, 6, H.parasuis Lawsonia intracellularis Leptospira bataviae 0 0 Leptospira bratislava Leptospira icterohaemorrhagiae 0 0 Leptospira pomona 20 0 Mycoplasma hyopneumoniae Tabel 7. Serologiske på VSP Kjellerup prøver positive prøver indsendelser indsendelser med positive prøver AP AP AP M. hyopneumoniae PRRS De serologiske er overvejende en del af SPF sundhedsovervågningen, men en mindre andel har karakter af diagnostik i forbindelse med afklaring af sygdomsproblemer i besætningerne 2

13 5. Undersøgelser af eksportprøver på DTU Vet Indsendelser vedrørende eksport bliver undersøgt på DTU Veterinærinstituttet og bliver indsendt fra dyrelægepraksis eller fra SPF Sundhedskontrollen. I 203 blev der undersøgt et mindre antal eksportprøver på et udenlandsk laboratorium, som ikke indgår i opgørelsen. Tabel 8 viser antal og positive resultater for influenza og PRRS ved PCR og for Pasteurella multocida toxin ved PMT-ELISA. Tabel 9 viser antal for Brucella ved forskellige serologiske analysemetoder. Tabel 8. Undersøgelser for influenzavirus, PRRSv og PMT Patogen positive Influenza ved PCR 8 3 PRRS ved PCR 79 0 Pasteurella multocida toxin ved ELISA Undersøgelse af næsesvaberprøver Tabel 9. Undersøgelser for Brucella spp. Bakterie positive Brucella, dyrkning fra organpools 2 0 Brucella, SAT, blodprøver Brucella, Rose-Bengal, blodprøver Falske positive. Besætningerne blev bekræftet negative ved efterfølgende bakteriologiske Tabel 20 viser antal og positive resultater for serologiske for virussygdomme som blev udført på DTU Vet i relation til eksport. Det fleste af ne vedrørte klassisk svinepest. serologiske og resultater for bakterie-antistoffer i relation til eksport er præsenteret i tabel 2. 3

14 Tabel 20. Serologiske for virussygdomme, DTU Vet Sygdom positive Aujeszky-virus Klassisk svinepest virus Swine vesicular disease virus Porcin epidemisk diarre virus 2 0 Transmissible gastroenteritis virus PRRS-EU-IPT 46 6 PRRS-US-IPT 46 PRRS-EU-ELISA PRRS-US-ELISA Falske positive. Besætningerne blev bekræftet negative ved efterfølgende foretaget af Fødevarestyrelse Tabel 2. Serologiske for bakterie-antistoffer Bakteria positive Mycoplasma hyopneumoniae Actinobacillus pleuropneumoniae serotype Actinobacillus pleuropneumoniae type 2, 6, Leptospira spp