En forsker har lavet et cdna insert vha PCR og har anvendt det følgende primer sæt, som producerer hele den åbne læseramme af cdna et:
|
|
- Ingelise Jessen
- 8 år siden
- Visninger:
Transkript
1 F2011-Opgave 1. En forsker har lavet et cdna insert vha PCR og har anvendt det følgende primer sæt, som producerer hele den åbne læseramme af cdna et: Forward primer: 5 CC ATG GGT ATG AAG CTT TGC AGC CTT GCA 3 og Reverse primer: 5 GGT GGA ATT CCG TTT TAG AGA CAG CGG CAA AAG3 (codon er fra cdna et (kursiv) er vist i primerne som blokke á tre nukleotider). Efter endt PCR, blev PCR produktet og en pet-vektor, petm-13 (figur 1-1), skåret med restriktionsenzymerne NcoI and EcoRI (genkendelsessekvenserne er indikeret med fed skrift i primersekvenserne; NcoI and EcoRI skærer ikke i cdna sekvensen), og blandet sammen i en ligeringsreaktionsmix. Ligeringsreaktionsmixen blev anvendt til at transformere E. coli stammen BL21(DE3), og de transformerede celler blev pladet ud på en LB-agar plade indeholdende kanamycin, som petm-13 bærer et resistensgen for. Men, der kom ingen kolonier på agarpladen selv ved gentagne forsøg. En kontrol med intakt vektor gav det forventede antal transformanter. 1) Forklar, hvad der kan være årsag til den manglende transformation. Hvad kan forskeren gøre for at få transformation med rekombinant vektor? Svar: Problemet er, at forskeren har glemt at sætte nogle ekstra baser foran NcoI sitet i forward primeren. Det medfører, at NcoI, der jo er en endonuclease, ikke kan skære i det endelige PCR produkt i 5 -enden af cdna et (set i forhold til mrna). Så han er nødt til at gentage hele forsøget med en ny primer 1, hvor der er et antal baser før NcoI sitet. Endelig fik forskeren løst problemet med manglende transformation; men nu fik han et nyt problem, da han udtrykte klonen: Det proteinprodukt, som blev produceret var meget større end man ville forudsige ud fra cdna et åbne læseramme. 2) Hvad er problemet med insertet? Hvordan kan forskeren løse dette problem? Svar: Forskeren har glemt at inkludere stop codon, da han designede primeren. Reverse primerne mangler en sekvens, som er komplementær til stopcodon. Så en sådan skal tilføjes en ny reverse primer, og hele forsøget skal gentages. 3) Design et primersæt, som kan anvendes til at lave et PCR produkt, som når det indsættes i NcoI and EcoRI skæringsstederne giver en konstruktion fra hvilket cdna et kan udtrykkes med et N-terminalt His-tag. Svar: Forward primer: 5 CC ATG GGT cac cat cac cat cac cac ATG AAG CTT TGC AGC CTT GCA 3. De seks histidin-codons indføjes umiddelbart før den kodende del af cdna et. Som reverse primer anvendes den, som laves i spm 2, altså den med stop-codon. 1
2 Figur 1-1. Multiple cloning site området i petm-13 ekspressions vektoren. Opgave 2 En forsker har isoleret meget små mængder af et protein fra en blodprøve fra en antilope. Proteinet er blevet delvist sekventeret vha massespektrometri, og nu vil han gerne isolere en fuldlængde cdna klon, som koder for proteinet for at kunne udtrykke nok protein til at foretage en karakterisation af dets funktion. Han forsøger derfor at isolere cdna med mrna fra leverceller, blodkarvægge og leukocytter, men uden held. 1) Hvordan kan forskeren med udgangpunkt i peptid-sekvenser finde ud af, i hvilket væv genet for proteinet transkriberes? Svar: Forskeren kan isolere RNA fra en masse forskellige væv, - lave et Northern blot med det og hybridisere til Northern blottet med prober lavet ud fra de kendte aminosyresekvenser. Husk, at proberne skal være komplementære til mrna. Dvs., at proberne skal laves som komplementære til 2
3 den kodende sekvens, som er den, der direkte back-translateres fra aminosyrerne med de mulige codons. Forskeren er i stand til at isolere cdna ved RT-PCR baseret på degenererede primere lavet ud fra aminosyresekvenser i forskellige peptider. Han finder dog ud af, at han mangler noget af 5 -enden af cdna et (den ende, som svarer til 5 -enden af mrna). 2) Hvordan kan forskeren fastslå, at det isolerede cdna sandsynligvis ikke er fuld-længde cdna? Svar: Når han sekventerer cdna et, ser han ikke noget, der kan minde om en start methionin. Der er åben læseramme helt fra 5 enden og ned til stop codon. Han kan evt. også se, at det stykke cdna, som han har fået isoleret ikke i længde svarer til det, han ville forvente ud fra resultaterne af Northernblottet i spm 1. Forskeren kan ikke få en 5 RACE til at fungere og laver derfor en såkaldt guess-mer primer ud fra den N-terminale sekvens af proteinet. Med denne primer og en primer syntetiseret ud fra den kendte del af cdna sekvensen laver han et forsøg med PCR på kromosomalt DNA. Her får han et produkt, som han vil have sekventeret. Firmaet, som foretager sekventeringen vil have leveret i alt 3 μg PCR fragment i en koncentration af 0.2 μg/μl. Forskeren har i alt 50 μl oprenset PCR fragment og har udtaget 5 μl PCR fragment og fortyndet op til 100 μl med vand og målt absorbansen af fortyndingen ved 260 nm til ) Hvor mange μg PCR fragment havde forskeren ialt? Og hvordan får han lavet en opløsning af PCR fragmentet, som er 0.2 μg/μl? Svar: Konc. i kuvetten er 0.08 x 50 μg/ml, dvs. 4 μg/ml. Dvs., at koncentrationen i plasmidpreparationen (de 50 μl) er 20 gange højere (80 μg/ml), fordi prøven, som blev udtaget til OD-målingen blev fortyndet 20 gange (5 μl i et totalvol på 100 μl). Altså har forskeren i alt i de 50 μl: 50 μl x 80 μg/ml eller 0.05 ml x 80 μg/ml, altså 4 μg. For at få en koncentration på 0.2 μg/μl må prøven opkoncentreres (dens konc. er jo 0.08 μg/μl). DNA et kan fældes med ethanol eller køres over en silikasøjle og opløses henholdsvis elueres i 20 μl vand for at give en konc på 0.2 μg/μl (4 μg/20 μl. I sekvensen kan han godt genkende noget af den sekvens, der ligger nedstrøms i forhold til 3 enden af den N-terminale primer, og han ser faktisk en sekvens, som kan translateres til en af de mange aminosyre-sekvenser, som han har bestemt; men desværre er der ikke som forventet en åben læseramme gennem hele PCR fragmentet. 4) Forklar hvad der kan være årsagen til, at han får et PCR produkt, men at det ikke har en åben læseramme (antag at der ikke er sket mutationer under PCR). 3
4 Svar: Husk, at han har anvendt genomisk DNA som template til sin PCR. Dvs., at der er introns med. Han har sandsynligvis lavet PCR hen over en eller flere introns. Når der er en intron, er der yderst sjældent en åben læseramme gennem intron en. Forskeren ser også noget underligt i sekvensen af PCR produktet. Der er tre steder i sekvensen, hvor der er to overlappende toppe i samme position. 5) Forklar dette fænomen (antag, at der ikke er sket mutationer under PCR). Svar: Det, han ser, er, at individet, som han har taget DNA et fra, er heterozygot i tre positioner. Når han laver PCR på genomisk DNA (eller for den sags skyld også cdna) som her, kan man komme ud for at se eksempler på to allel er, fordi der jo laves PCR af alt det mulige template DNA, hvor der ikke bliver skelnet mellem allel er, når de ligger internt i et PCR produkt, som jo er milliarder af individuelle fragmentmolekyler lavet ud fra alle de matchende template molekyler, som fandtes i DNA preparationen til at starte med. Opgave 3 Under en oprensning af enzymer fra E. coli havde forskeren inkuberet et radioaktivt mærket dobbeltstrenget DNA fragment samt forskellige nødvendige buffere og reagenser med en af sine fraktioner fra et E. coli celleekstrakt. Efter nogle timers inkubation agarosegel-separerede hun DNA'et og lavede et autoradiografi. Forsøget blev udført to gange med to forskellige restriktionsfragmenter. I et forsøg (bane 1 og 2 i figur 3-1) anvendte hun et DNA fragment isoleret efter skæring med SmaI. I et andet forsøg (bane 3 og 4 i figur 3-1) anvendte hun et DNA fragment isoleret efter skæring med EcoRI. Restriktionsfragmenterne var begge 100 bp lange. Figur 3-1. Autoradiografi af radioaktivt mærket DNA separeret efter inkubation med E. coli celleekstrakt (Se ovenstående tekst for forklaring). Bane 1 og 3 er DNA fragmenter før inkubation med celleekstrakt, medens bane 2 og 4 er DNA separeret efter inkubation med celleekstrakt. 1) Giv en forklaring på det observerede resultat? Forklar herunder, hvad forskellen er på de to slags restriktionsfragmenter, der blev anvendt i de to forsøg? (sekvensen af fragmenterne er uden betydning). 4
5 Svar: Det, hun observerer, er aktiviteten af E. coli DNA ligase. Den kan ikke ligere blunt end DNA (SmaI-fragmentet), men gerne sticky end DNA (EcoRI-fragmentet). Ved elektroforese af en plasmid DNA preparation i en agarose gel ses ofte to bånd på gelen. Nedenfor er vis resultatet af en agarose gelelektroforese af ubehandlet plasmid DNA (bane 1) og EcoRI behandlet plasmid DNA (bane 2). bane 1 bane 2 2) Identificér de tre bånd, som ses på gelen, og forklar forskellen i mobilitet imellem dem. Svar: I bane 1 ses den oprindelige plasmid preparation. Her ses to bånd, hvoraf det nederste er supercoiled plasmid, mens det øverste er relaxet eller nicked plasmid. I bane 2 ses lineariseret plasmid, som vandrer langsommere end supercoiled plasmid. 3) Selvom restriktionsenzymer udtrykkes inde i bakterieceller, ødelægger de ikke cellens eget DNA. Hvorfor ikke? Svar: Bakterierne har såkaldte restriktionssystemer, dvs., at de i tilknytning til et givet restriktionsenzym har en tilknyttet methylase, som oftest gør, at genkendelsessekvenserne ved methylering ikke kan skæres, eller som i sjældnere tilfælde gør, at kun genkendelsessteder kan skæres. 5
Spm. A: Hvad viser data i Figur 1?
Opgave 1 Leptin er et plasma proteinhormon der primært produceres af og secerneres fra fedtceller (adipocytter). Leptin, der er kodet af ob (obecity) genet, er 16 kda stort. Leptins fysiologiske funktion
Læs meredatp, dctp, dgtp, dttp, [α 32 P]-dCTP urinstofholdig polyacrylamid gel røntgen film
Opgave 1 Denne opgave omhandler osteoblast differentiering. Osteoblast celler er involveret i opbygning af knoglevæv. Osteoblast celler dannes ud fra såkaldte calvarial celler. For at forstå det molekylære
Læs mereLøsninger til opgaverne den Opgave 2 januar 2003 Spm. 1:
Løsninger til opgaverne den 6-9-06 Opgave 2 januar 2003 Spm. 1: Fidusen er her at vi kender den primære struktur af glukoamylasen fra tre forskellige svampe, en ascomycet, en basidiomycet og en zygomycet.
Læs merePCR (Polymerase Chain Reaction): Opkopiering af DNA
PCR (Polymerase Chain Reaction): Opkopiering af DNA PCR til at opkopiere bestemte DNA-sekvenser i en prøve er nu en af genteknologiens absolut vigtigste værktøjer. Peter Rugbjerg, Biotech Academy PCR (Polymerase
Læs mereBesvarelse til opgave 1 januar 1999 Spm. A: Spm. B:
Besvarelse til opgave 1 januar 1999 Spm. A: Vi må lave et genomisk bibliotek i en lambdafag, cosmid, BAC eller YAC plasmid. Til dette vil vi skære det genomiske DNA partielt med Sau3A, så vi får stykker
Læs mereLøsninger til opgaverne den Spm. A: Spm. B Spm. C:
Løsninger til opgaverne den 12-9-07 Spm. A: Her er vi i en situation at det eneste der kendes til vores receptor er, at den kan binde en ligand, som vi har til rådighed i en radioaktiv mærket version.
Læs mereSide%1%af%14% Eksamen: Bioinformatik It og Sundhed 27 Jan 2011 kl 9-13
Side1af14 Eksamen: Bioinformatik It og Sundhed 27 Jan 2011 kl 9-13 Navn: Studie nummer: Dette eksamenssæt vil også kunne ses som en pdf fil nederst på kursus-hjemmesiden udfor den sidste dag d. 27 Jan
Læs mereMaterialeliste: Ready-to-loadTM DNA prøver til elektroforese. Medfølgende reagenser og tilbehør. Egne materialer
Elevvejledning 1 Materialeliste: Ready-to-loadTM DNA prøver til elektroforese A B C D E F Plasmid DNA (uskåret) Plasmid skåret med Bgl I Plasmid skåret med Eco RI Lambda DNA (uskåret) Lambda DNA skåret
Læs mereOpgave 1 Slankemidler
Opgave 1 Slankemidler Overvægt er et stigende problem i den vestlige verden, og der er derfor udviklet forskellige slankemidler. Et eksempel på et slankemiddel er Orlistat. Den kemiske struktur af Orlistat
Læs mereSide 1 af 13. Eksamen: Bioinformatik It og Sundhed 27 Jan 2011 kl 9-13
Side1af13 Eksamen: Bioinformatik It og Sundhed 27 Jan 2011 kl 9-13 Navn: Studie nummer: Dette eksamenssæt vil også kunne ses som en pdf fil nederst på kursus-hjemmesiden udfor den sidste dag d. 27 Jan
Læs mereVelkommen. Test dit eget DNA med PCR. Undervisningsdag på DTU Systembiologi. Undervisere:
Velkommen Test dit eget DNA med PCR Undervisningsdag på DTU Systembiologi Undervisere: Hvem er I? 2 DTU Systembiologi, Danmarks Tekniske Universitet Hvilke baser indgår i DNA? A. Adenin, Guanin, Cytosin,
Læs mereTest dit eget DNA med PCR
Test dit eget DNA med PCR Navn: Forsøgsvejledning Formål med forsøget Formålet med dette forsøg er at undersøge jeres arvemateriale (DNA) for et transposon kaldet Alu. Et transposon er en DNA sekvens,
Læs mereGAPDH PCR modul Manual
GAPDH PCR modul Manual Katalog nr. 166-5010EDU explorer.bio-rad.com Kopiering kun tilladt til undervisningsbrug Bemærk: Kittet indeholder temperaturfølsomme dele. Åbn derfor straks kassen og læg de pågældende
Læs mereRestriktionsenzymer findes Genkendelsessekvens
Restriktionsenzymer Skanning Restriktionsenzymer findes i bakterier (forsvarsmekanisme) IKKE i eukaryote celler 3-5 - 5-3 - Restriktionsenzyme Genkendelsessekvens Palindromisk Otto, Anna, radar Madam I
Læs mereTest dit eget DNA med PCR
Test dit eget DNA med PCR Forsøgsvejledning Navn: Side 1 af 7 Formål med forsøget Formålet med dette forsøg er at undersøge jeres arvemateriale (DNA) for et transposon kaldet Alu. Et transposon er en DNA
Læs mereDNA origami øvelse 2013. DNA origami øvelse
DNA origami øvelse Introduktion I denne øvelse bruger vi DNA origami teknikken til at samle en tavle af DNA med dimensioner på 70 nm x 100 nm. Tavlen dannes af et langt enkeltstrenget DNA molekyle, der
Læs mereVelkommen. Test dit eget DNA med PCR. Undervisningsdag på DTU Systembiologi. Undervisere: Sebastian, Louise og Ana
Velkommen Test dit eget DNA med PCR Undervisningsdag på DTU Systembiologi Undervisere: Sebastian, Louise og Ana Hvem er I? 2 DTU Systembiologi, Danmarks Tekniske Universitet Dagens program 9:00 10:00 Introduktion
Læs mereBesvarelse af opgaverne til den Spm.A: efter TGA TCA Spm. B:
Besvarelse af opgaverne til den 20-9-06 Spm.A: Her vil vi gerne sætte et relativt lille stykke DNA (FLAG) sammen med et relativt stort stykke (PRB1). Det lille stykke er for lille til at vi kan PCR amplificere
Læs mereModul 3: Sandsynlighedsregning
Forskningsenheden for Statistik ST01: Elementær Statistik Bent Jørgensen Modul 3: Sandsynlighedsregning 3.1 Sandsynligheder................................... 1 3.2 Tilfældig udtrækning fra en mængde........................
Læs mereUdarbejdet af Anna-Alexandra Grube Hoppe
METODER - BIOKEMI For medicinstuderende - Panuminstituttet UDARBEJDET AF ANNA-ALEXANDRA GRUBE HOPPE RESTRIKTIONSENZYM ANALYSE (E: 329-330) Restriktionsenzym analyse er en metode, der bruges til at kortlægge
Læs mereProtokol for genetisk bestemmelse af ABO blodtyper
Page1 Udarbejdet i samarbejde mellem: Kåre Lehmann, Annabeth Høgh Petersen, Anne Rusborg Nygaard og Jørn M. Clausen Page2 VIGTIGT: SKIFT PIPETTE SPIDSER/TIPS EFTER HVER GANG!! Så undgår du at forurene
Læs mereDNA origami øvelse DNA origami øvelse
DNA origami øvelse Introduktion I denne øvelse bruger vi DNA origami teknikken til at samle en tavle af DNA med dimensioner på 70 nm x 100 nm. Tavlen dannes af et langt enkeltstrenget DNA molekyle, der
Læs mereDM01 DM01. 4. Obl. Afl. Jacob Christiansen, 130282, jacob.ch@mail.tdcadsl.dk. D12, Elias 13/5-2003. Side 1 af 7
DM01 DM01 4. Obl. Afl. Jacob Christiansen, 130282, jacob.ch@mail.tdcadsl.dk D12, Elias 13/5-2003 Side 1 af 7 DM01 Indholdsfortegnelse: BILAG:...2 1 FORMÅL:...3 2 KLASSER:...4 2.1 DNA2:...4 2.1.1 METODER:...4
Læs mereDNA origami øvelse. Introduktion. DNA origami øvelse 3 timer 2018
DNA origami øvelse Introduktion I denne øvelse bruger vi DNA origami teknikken til at samle en tavle af DNA med dimensioner på 70 nm x 100 nm. Tavlen dannes af et langt enkeltstrenget DNA molekyle, der
Læs mereTest dit eget DNA med PCR
Test dit eget DNA med PCR Navn: Forsøgsvejledning Side 1 af 8 Formål med forsøget Formålet med dette forsøg er at undersøge jeres arvemateriale (DNA) for et transposon kaldet Alu. Et transposon er en DNA
Læs mereAugust Krogh Building Copenhagen University. Universitetsparken 13 2100 Copenhagen OE PAPedersen@aki.ku.dk
Per Amstrup Pedersen Institute of Molecular Biology August Krogh Building Copenhagen University Universitetsparken 13 2100 Copenhagen OE PAPedersen@aki.ku.dk En genteknologisk værktøjskasse. Version 2007
Læs mereStudienummer: MeDIS Exam 2015. Husk at opgive studienummer ikke navn og cpr.nr. på alle ark, der skal medtages i bedømmelsen
MeDIS Exam 2015 Titel på kursus: Uddannelse: Semester: Videregående biokemi og medicinudvikling Bachelor i Medis 5. semester Eksamensdato: 26-01-2015 Tid: kl. 09.00-11.00 Bedømmelsesform 7-trin Vigtige
Læs mereProtokol for genetisk bestemmelse af ABO blodtyper
Page1 Udarbejdet i samarbejde mellem: Kåre Lehmann, Annabeth Høgh Petersen, Anne Rusborg Nygaard og Jørn M. Clausen Page2 VIGTIGT: SKIFT PIPETTE SPIDSER/TIPS EFTER HVER GANG!! Så undgår du at forurene
Læs mereTrin 1: Oprensning af genomisk DNA (DeoxyriboNucleicAcid)
Trin 1: Oprensning af genomisk DNA (DeoxyriboNucleicAcid) (Denne del tager ca. 3 timer, max 14 prøver) ELEVVEJLEDNING forsøgskasse nr. 1 AAU Oprensning af DNA-prøven foregår gennem fem trin, se figur 1:
Læs mereRegnskovens hemmeligheder
Center for Undervisningsmidler, afdeling København Regnskovens hemmeligheder Øvelsesvejledning Formål Et gen for et kræfthelbredende protein er blevet fundet i nogle mystiske blade i regnskoven. Forskere
Læs mereSide 1 af 14. Eksamen: Bioinformatik It og Sundhed 27 Jan 2011 kl 9-13
Side 1 af 14 Eksamen: Bioinformatik It og Sundhed 27 Jan 2011 kl 9-13 Navn: Studie nummer: Dette eksamenssæt vil også kunne ses som en pdf fil nederst på kursus-hjemmesiden udfor den sidste dag d. 27 Jan
Læs mereTest dit eget DNA med PCR
Test dit eget DNA med PCR Navn: Forsøgsvejledning Side 1 af 8 Formål med forsøget Formålet med dette forsøg er at undersøge jeres arvemateriale (DNA) for et transposon kaldet Alu. Et transposon er en DNA-sekvens,
Læs mereTest dit eget DNA med PCR
Test dit eget DNA med PCR Navn: Forsøgsvejledning Side 1 af 8 Formål med forsøget Formålet med dette forsøg er at undersøge jeres arvemateriale (DNA) for et transposon kaldet Alu. Et transposon er en DNA-sekvens,
Læs mereBioteknologi A. Studentereksamen. Af opgaverne 1 og 2 skal begge opgaver besvares. Af opgaverne 3 og 4 skal en og kun en af opgaverne besvares.
Bioteknologi A Studentereksamen Af opgaverne 1 og 2 skal begge opgaver besvares. Af opgaverne 3 og 4 skal en og kun en af opgaverne besvares. frs111-btk/a-31052011 Tirsdag den 31. maj 2011 kl. 9.00-14.00
Læs mereSpm. B: Hvad viser data i Figur 2?
Opgave 1 Kernereceptorer (nuclear receptors) udgør en familie af ligandaktiverede transkriptionsfaktorer, der regulerer transkription af en række gener, som respons på tilstedeværelse af f.eks.lipofile
Læs mereDNA origami øvelse DNA origami øvelse
DNA origami øvelse Introduktion I denne øvelse bruger vi DNA origami teknikken til at samle en tavle af DNA med dimensioner på 70 nm x 100 nm. Tavlen dannes af et langt enkeltstrenget DNA molekyle, der
Læs mereNOD2 ekspression i tarmepitelceller
Roskilde Universitet, Den Naturvidenskabelige Bacheloruddannelse, Hus nr. 14 NOD2 ekspression i tarmepitelceller 2. semesterprojekt - forår 2015 Gruppe 6: Joachim Wittrup Højris Jensen Nicholas Philip
Læs mereLigerings- og transformationsmodul inklusiv plasmidoprensning og restriktionsanalyse
Biotechnology Explorer Ligerings- og transformationsmodul inklusiv plasmidoprensning og restriktionsanalyse Katalog nr. 166-5015EDU explorer.bio-rad.com Kopiering kun tilladt til undervisningsbrug Bemærk:
Læs mereNDRG2 s Interaction with Api5
Naturvidenskabeligt Basisstudium Roskilde Universitet 2. semesterprojekt Juni 2012 Hus 13.1 NDRG2 s Interaction with Api5 NDRG2 s interaktion med Api5 Gruppe 12: Freya Armstrong Annaleigh Ohrt Fehler Cecilie
Læs mereBIOTEKNOLOGI HØJT NIVEAU
STUDENTEREKSAMEN 2007 2007-BT-1 BITEKNLGI HØJT NIVEAU Torsdag den 31. maj 2007 kl. 9.00 14.00 Sættet består af 1 stor og 2 små opgaver samt 1 bilag i 2 eksemplarer. Det ene eksemplar af bilaget afleveres
Læs mereFaktor V Leiden mutation
Faktor V Leiden mutation Formål: finde ud af om individ har mutation i faktor V Leiden gen (missense: arginin glutamin) Materiale: oprens DNA fra leukocytter Metode: PCR med specifikke primere, oprens,
Læs mereDette er en kladde til et genoptryk af Eksperimentel Genteknologi fra 1991. Ideer, rettelser og forslag modtages gerne. Kh Claudia.
Transformation af E.coli K 12 Version 3. marts 2009 (C) Claudia Girnth-Diamba og Bjørn Fahnøe Dette er en kladde til et genoptryk af Eksperimentel Genteknologi fra 1991. Ideer, rettelser og forslag modtages
Læs mereat du trænes i at genkende aminosyrer i en simpel proteinstruktur (pentapeptid = lille protein bestående af 5 (penta) aminosyrer)
Elevvejledning til det Virtuelle Kræftlaboratorium Det Virtuelle Kræftlaboratorium stiller krav til en grundig forståelse af det centrale dogme inden for molekylærbiologien, hvordan DNA oversættes til
Læs mereBIOZYMER ØVELSE 3 BEKÆMP DIN β-lactamase - TEST DIN EGEN MEDICIN!
BIZYMER ØVELSE 3 BEKÆMP DIN β-lactamase - TEST DIN EGEN MEDICIN! FAGLIG BAGGRUND For at få det maksimale udbytte af denne øvelse er det en forudsætning, at teorien bag enzymer, enzymkinetik og resistensmekanismer
Læs mereBiologi opgave Opsamling: Cellebiologi (Bioanalytiker modul3)
1 Delphine Bonneau Biologi opgave Opsamling: Cellebiologi 1-6 Pelle har spist en kæmpe stor kage, og efterfølgende stiger hans blodsukker. Derfor sender kroppen besked til de endokrine kirtler i bugspytkirtlen
Læs mereSide 1 of 12. Kursus navn: Kursus nr Introduktion til Bioinformatik
Side 1 of 12 Danmarks Tekniske Universitet Skriftlig prøve, den 20/1-2014 Kursus navn: Kursus nr. 27633 Introduktion til Bioinformatik Tilladte hjælpemidler: Alle "Vægtning" Angivet ved de individuelle
Læs mere# Problemet med genetisk ustabilitet
Forskningsnyheder om Huntingtons Sygdom På hverdagssprog Skrevet af forskere. Til det globale HS-fællesskab Et DNA-reparerende protein ændrer stabiliteten af lange CAG-områder i det muterede gen for Huntingtons
Læs mereCYP7A1 (0,1 nm) CYP7A1 (0nM) UBIC (0,1 nm)
Opgave 1 Leveren spiller en central rolle i lipid metabolismen og i opretholdelse af lipid homeostasen i hele kroppen. Lipidmetabolismen er fejlreguleret hos blandt andet svært overvægtige personer samt
Læs mereFigur 1: Strukturelt kort over plasmiderne pyeast og pmamal anvendt til undersøgelse af
Opgave 2 juni 1999 DNA rekombination er vigtig for eukaryote celler i forbindelse med meiosen. Samtidig er rekombination mellem fremmed DNA og endogen DNA essentiel i fremstillingen af transgene organismer
Læs mereBiosensor Niveau 1. Teori
Biosensor Niveau 1 Teori Inden du starter... For at kunne forstå teorien som ligger til grund for en biosensor er det vigtigt at du har styr på nogle generelle mikro/molekyler biologiske principper, begreber
Læs mereTEST 1. Almen Cellebiologi 2004/2005
TEST 1 Almen Cellebiologi 2004/2005 Hvilken af følgende udsagn er forkerte? a) kun planteceller har en cellevæg b) planteceller har microtubuli c) planteceller har chloroplaster d) planteceller har actin
Læs mereDanmarks Tekniske Universitet
Side 1 of 14 Danmarks Tekniske Universitet Skriftlig prøve, den 21/1-2013 Kursus navn: Kursus nr. 27633 Introduktion til Bioinformatik Tilladte hjælpemidler: Alle "Vægtning" Angivet ved de individuelle
Læs mereOpdateret d. 17. august Biosensor. Niveau 1. Øvelsesvejledning
Opdateret d. 17. august 2017 Biosensor Niveau 1 Øvelsesvejledning Vigtig information om brug af Biosensor-kittet for undervisere Før øvelsen startes er det vigtigt, at underviseren har læst følgende erklæring
Læs mereKromosomer med genet: Genotype (= arveformel): RR Rr rr Fænotype (= fremtoning): Rød Rød Hvid
Kromosomer med genet: R R R r r r Genotype (= arveformel): RR Rr rr Fænotype (= fremtoning): Rød Rød Hvid P-generation: Kønsceller: RR rr Meiose R R r r Befrugtning F 1-generation: Meiose Rr Rr Kønsceller:
Læs mereBioteknologi A. Gymnasiale uddannelser. Vejledende opgavesæt 1. Mandag den 31. maj 2010 kl. 9.40-14.40. 5 timers skriftlig prøve
Vejledende opgavesæt 1 Bioteknologi A Gymnasiale uddannelser 5 timers skriftlig prøve Vejledende opgavesæt 1 Mandag den 31. maj 2010 kl. 9.40-14.40 Side 1 af 8 sider pgave 1. Genmodificeret ris Vitamin
Læs mere3u BI, terminsprøve (Bio A)
3.u BI, terminsprøve, 2018 MV 3u BI, terminsprøve (Bio A) Torsdag den 12/4, 2018, kl. 9-14. Af opgaverne 1, 2, 3, og 4 skal tre, og kun tre, afleveres Tilladte hjælpemidler: Bøger, kompendier, noter, lommeregner.
Læs mereSide 1 of 13. Kursus navn: Kursus nr Introduktion til Bioinformatik
Side 1 of 13 Danmarks Tekniske Universitet Skriftlig prøve, den 20/1-2014 Kursus navn: Kursus nr. 27633 Introduktion til Bioinformatik Tilladte hjælpemidler: Alle "Vægtning" Angivet ved de individuelle
Læs mereStruktur og funktion af gener
Molekylærbiologi og genetik S4, F2008 f Malene Munk Jørgensen Emne: Struktur og funktion af gener Link: undervisningsplanen for S4-molekylærbiologi og genetik MMJ, VI niversity ollege Bioanalytikeruddannelsen
Læs mereAugust 2016 Outbreak Copyright: Lise Junker Nielsen & Allan Haurballe. Foto og illustrationer: Colourbox Kontakt:
OutBreak 1 August 2016 Outbreak Copyright: Lise Junker Nielsen & Allan Haurballe. Foto og illustrationer: Colourbox Kontakt: lisej@bmb.sdu.dk Undervisningsforløbet og tilhørende forsøg udføres på eget
Læs mereElektroforese. Navne: Rami Kassim Kaddoura Roman Averin Safa Sarac Magnus Høegh Jensen Frederik Gaarde Lindskov
Elektroforese Navne: Rami Kassim Kaddoura Roman Averin Safa Sarac Magnus Høegh Jensen Frederik Gaarde Lindskov Klasse: 1.4 Fag: Biologi Vejleder: Brian Christensen Skole: Roskilde tekniske gymnasium, Htx
Læs mereLaboratorieprotokol for manuel isolering af DNA fra 0,5 ml prøve
Laboratorieprotokol for manuel isolering af DNA fra 0,5 ml prøve Til isolering af genomisk DNA fra indsamlingssætserierne Oragene - og ORAcollect. Du kan finde flere sprog og protokoller på vores webside
Læs mereBIOZYMER ØVELSE 2 OPRENSNING AF PROTEINER
BIOZYMER ØVELSE 2 OPRENSNING AF PROTEINER FAGLIG BAGGRUND Det forudsættes, at den grundlæggende teori bag rekombinant protein ekspression og proteinopresning er bekendt. For dette henvises til undervisningsmateriale
Læs mereUndersøgelse af forskellige probiotiske stammer
Undersøgelse af forskellige probiotiske stammer Formål Formålet med denne øvelse er: 1. At undersøge om varer med probiotika indeholder et tilstrækkeligt antal probiotiske bakterier, dvs. om antallet svarer
Læs mereFORSØG ØL verdens første svar på anvendt
FORSØG ØL verdens første svar på anvendt bioteknologi Biotech Academy BioCentrum-DTU Søltofts Plads DTU - Bygning 221 2800 Kgs. Lyngby www.biotechacademy.dk bioteket@biocentrum.dtu.dk INDHOLDSFORTEGNELSE
Læs mereBiosensor Niveau 1 Øvelsesvejledning
Opdateret august 2018 Biosensor Niveau 1 Øvelsesvejledning Vigtig information om brug af Biosensor-kittet for undervisere Før øvelsen startes er det vigtigt, at underviseren har læst følgende erklæring
Læs mereAfrapportering for projektet Helt nye stivelseskartofler genereret ved Præcis Genom-Editering
Afrapportering for projektet Helt nye stivelseskartofler genereret ved Præcis Genom-Editering Projektperiode januar december 2018 Deltagere Andreas Blennow (projektleder), Bent Larsen Petersen, Elisabeth
Læs mereLivets molekylære kode
4. ÅR R. 2 / 2006 Livets molekylære kode -kemi og biologi mødes D livets molekylære kode D findes i alle levende organismer og indeholder koden til organismen informationer, der afgør om organismen er
Læs mereMælkesyrebakterier og holdbarhed
Mælkesyrebakterier og holdbarhed Formål Formålet med denne øvelse er at undersøge mælkesyrebakteriers og probiotikas evne til at øge holdbarheden af kød ved at: 1. Undersøge forskellen på bakterieantal
Læs mereKortlægning af interaktion mellem IFN λ3 og IL- 10R2
Kortlægning af interaktion mellem IFN λ3 og IL- 10R2 Et eksperimentelt bachelor projekt i molekylærbiologi Af Sanne Ea Jørgensen 20084660 Ved associated professor Rune Hartmann Molekylærbiologisk institut
Læs mereVi går derfor ud fra, at I ved, at DNA molekyler er meget lange molekyler
DNA-profil analyse Indledning DNA-profil analyser eller i daglig tale DNA-fingeraftryk er en metode, der bruges, når man skal finde ud af, hvem der er far et barn, hvis der altså er flere muligheder. Det
Læs mereOpgave 1 november 2004
Opgave 1 november 2004 Nedenfor er vist nukleotidsekvensen af cdna kodende for eif2α genet fra mus. Serin nummer 51 (S51) kan fosfoyleres af en eller flere eif2α kinaser. For at undersøge den biologiske
Læs mereBiosensor. by Biotech Academy. Øvelsesvejledning
Biosensor by Biotech Academy Øvelsesvejledning Vigtig information om brug af biosensor kittet for undervisere Før øvelsen startes, er det vigtigt at underviseren har læst følgende erklæring og lærervejledningen,
Læs mereDanmarks Tekniske Universitet
Side 1 of 17 Danmarks Tekniske Universitet Skriftlig prøve, den 21/1-2013 Kursus navn: Kursus nr. 27633 Introduktion til Bioinformatik Tilladte hjælpemidler: Alle "Vægtning" Angivet ved de individuelle
Læs mereOpgave 1 Spm. A: Spm. B:
Opgave 1 Familien af TM7 receptorer (receptorer med 7 transmembrane segmenter) udgør ud fra genomsekvensen den største proteinfamile i C. elegans. Det samme må forventes at gælde i pattedyr. Imidlertid
Læs mereNr 1. Fra gen til protein
Nr 1 Fra gen til protein Med udgangspunkt i vedlagte illustrationer bedes du besvare følgende: Hvordan er sammenhængen mellem DNA ets nukleotider og proteinets aminosyrer? Beskriv hvad der sker ved henholdsvis
Læs mereEksamensspørgsmål til biocu til mandag d. 10. juni 2013
Eksamensspørgsmål til biocu til mandag d. 10. juni 2013 Nr. 1. Fra gen til protein. Hvordan er sammenhængen mellem DNA ets nukleotider og proteinets aminosyrer? Beskriv hvad der sker ved henholdsvis transskription
Læs mereDansk resumé for begyndere
Dansk resumé for begyndere Dansk resumé for begyndere Dette afsnit introducerer bakteriel genregulation for enhver uden forudgående kendskab til dette emne. Alle nødvendige, videnskabelige betegnelser
Læs mereTo modeller af NDRG2 proteinet: RCSB Protein Data Bank
2009 Roskilde Universitet Naturvidenskabelige Basisstudium 4. Semesters Projekt To modeller af NDRG2 proteinet: RCSB Protein Data Bank Bassam Tawfik Florian Malte Hermann Kenneth Ege Jørgensen Lena de
Læs mereOpgave 1 Listeria. mørkviolette bakteriekolonier, se figur 1a. og b. 1. Angiv reaktionstypen for reaktion. 1 vist i figur 1b.
Opgave 1 Listeria Bakterien Listeria monocytogenes kan være sygdomsfremkaldende for personer, der i forvejen er svækkede. For at identificere Listeria kan man anvende indikative agarplader. Her udnyttes
Læs mereKapitel 1 Genteknologi (1/6)
Kapitel 1 Genteknologi (1/6) Transformation FOTO: SØREN LUNDBERG FORMÅL At isolere plasmider fra plasmidbærende bakterier og overføre dem til andre bakterier. TEORI Transformation er den teknik, hvor generne
Læs mere11. nationale biologiolympiade 2015. Tirsdag den 11. november 2014 Varighed: 90 minutter
11. nationale biologiolympiade 2015 Tirsdag den 11. november 2014 Varighed: 90 minutter Opgaverne besvares direkte på svararket! Uden hjælpemidler! Husk at overføre alle svar til svararket! Kun svararket
Læs mereCisgen byg med bedre fosfatudnyttelse
Cisgen byg med bedre fosfatudnyttelse Seniorforsker Inger Bæksted Holme Aarhus Universitet, Science and Technology, Institut for Molekylærbiologi og Genetik, Afgrødegenetik og Bioteknologi Hypotese Det
Læs mereFra mutationer til sygdom
Forskningsnyheder om Huntingtons Sygdom På hverdagssprog Skrevet af forskere. Til det globale HS-fællesskab Nyt antistof afslører farlige dele af huntingtinproteinet Et nyt antistof gør forskere i stand
Læs mereBioteknologi A. Studentereksamen. Af opgaverne 1 og 2 skal begge opgaver besvares. Af opgaverne 3 og 4 skal en og kun en af opgaverne besvares.
Bioteknologi A Studentereksamen Af opgaverne 1 og 2 skal begge opgaver besvares. Af opgaverne 3 og 4 skal en og kun en af opgaverne besvares. frs122-btk/a-22082012 nsdag den 22. august 2012 kl. 09.00-14.00
Læs mereElevvejledning pglo transformation
Introduktion til transformation Elevvejledning pglo transformation I denne øvelse skal du lære fremgangsmåden ved genetisk transformation. Husk på, at et gen er et stykke DNA, der indeholder informationer
Læs mereBioteknologi A Kommentarer til opgaveformuleringer i opgavesættet 31. maj 2011
Bioteknologi A Kommentarer til opgaveformuleringer i opgavesættet 31. maj 2011 Spørgsmålene i opgavesættene stilles som udgangspunkt i den betydning der fremgår af listen over typeord, som findes på ministeriets
Læs mereBiotechnology Explorer
Biotechnology Explorer Oprensning af genomisk DNA fra plantemateriale Manual Katalog nr. 166-5005EDU explorer.bio-rad.com Oversat og bearbejdet af Birgit Sandermann Justesen, Nærum Gymnasium, februar 2009
Læs mereFotosyntetisk produktion af hydrogen med genmodificerede mikroorganismer
Fotosyntetisk produktion af hydrogen med genmodificerede mikroorganismer Forskerspirer 2009 Hovedområde: NAT Niels Christian Sanden ncsanden@hotmail.com Forskerkontakt: Poul Erik Jensen Værtsinstitution:
Læs mereSvarark for (navn) Skole: Opgave 22 besvares DIREKTE her i opgaven.
Opgave 22 besvares DIREKTE her i opgaven. 22. Den røde farve i kød skyldes myoglobin som er et globulært protein. Myoglobin indeholder ligesom hæmoglobin en organisk gruppe (hæm) med en tilknyttet jern(ii)-ion
Læs mereKlip-og-kopier DNA: reparér mutationer med 'genom-redigering' DNA, RNA og protein
Forskningsnyheder om Huntingtons Sygdom På hverdagssprog Skrevet af forskere. Til det globale HS-fællesskab Klip-og-kopier DNA: reparér mutationer med 'genom-redigering' Forskere kan lave præcise ændringer
Læs mereSide 1 of 11. Kursus navn: Kursus nr Introduktion til Bioinformatik
Side 1 of 11 Danmarks Tekniske Universitet Skriftlig prøve, den 22/1-2015 Kursus navn: Kursus nr. 27633 Introduktion til Bioinformatik Tilladte hjælpemidler: Alle "Vægtning" Angivet ved de individuelle
Læs mereBIOLOGI A-NIVEAU NY ORDNING. Tirsdag den 20. maj 2008. Kl. 09.00 14.00 STX081-BIA STUDENTEREKSAMEN MAJ 2008
STUDENTEREKSAMEN MAJ 2008 BIOLOGI A-NIVEAU Tirsdag den 20. maj 2008 NY ORDNING Kl. 09.00 14.00 Af opgaverne 1, 2, 3 og 4 skal tre og kun tre af opgaverne besvares STX081-BIA Undervisningsministeriet Side
Læs mereFORSØG ØL verdens første svar på anvendt
FORSØG ØL verdens første svar på anvendt bioteknologi Biotech Academy BioCentrum-DTU Søltofts Plads DTU - Bygning 221 2800 Kgs. Lyngby www.biotechacademy.dk bioteket@biocentrum.dtu.dk INDHOLDSFORTEGNELSE
Læs mereOpsætning af metode til påvisning af mutation W515L/K i MPL genet ved kroniske myeloproliferative sygdomme.
Modul 14. Studienr.: 32109532. Hold: SB509. University College Lillebælt. Antal anslag: 54.221 Opsætning af metode til påvisning af mutation W515L/K i MPL genet ved kroniske myeloproliferative sygdomme.
Læs mereInstitut for Molekylær Biologi
Indholdsfortegnelse INDHOLDSFORTEGNELSE HOLDFORDELING...4 HOLD A...4 HOLD B...5 HOLD C...6 OVERSIGT OVER ØVELSESKURSET...7 LABORATORIEREGLER....8 HYGIEJNE....8 ARBEJDSPLADS...8 SIKKERHEDSREGLER...9 RAPPORTKRAV...11
Læs mere(19) DANMARK. 2six,l (12) PATENTSKRIFT. Patent- og Varemærkestyrelsen (11) DK 175072 B1
(19) DANMARK (11) DK 175072 B1 2six,l (12) PATENTSKRIFT Patent- og Varemærkestyrelsen (51) Int.C1 7.: C 12 N 15/38 A 61 K 39/245 C 12 N 15/63 G 01 N 33/569 (21) Patentansøgning nr: PA 1987 02888 (22).
Læs mere1 Idékatalog til øvelser: Bioanalytikeruddannelsen UCSJ, Parkvej 190, 4700 Næstved
1 Idékatalog til øvelser: Bioanalytikeruddannelsen UCSJ, Parkvej 190, 2 Idékatalog til øvelser: Bioanalytikeruddannelsen UCSJ, Parkvej 190, Indhold Realtime PCR på β-actin... 3 CSI og retsgenetik... 3
Læs mereCellekernen (Nucleus) Sebastian Frische Anatomisk Institut
Cellekernen (Nucleus) Sebastian Frische Anatomisk Institut Cellekernen Cellekernens overordnede struktur kernemembranen/nucleolemma kromatin nucleolus Cellecyklus faser i cellecyklus faser i mitosen Størrelse:
Læs mere