Basal statistik for lægevidenskabelige forskere, forår 2014 Udleveret 4. marts, afleveres senest ved øvelserne i uge 13 (25.

Transkript

1 Hjemmeopgave Basal statistik for lægevidenskabelige forskere, forår 2014 Udleveret 4. marts, afleveres senest ved øvelserne i uge 13 ( marts) Garvey et al. interesserer sig for sammenhængen mellem anæstesi og allergiske reaktioner (se f.eks. nedenstående reference, der dog ikke lige vedrører denne problemstilling). På hjemmesiden ligger oplysninger om 179 anæstesier (en pr. patient), der alle gav anledning til mistanke om en allergisk reaktion. Forslag til variabelnavne er angivet i 1. linie, og betydningen af disse er: id Personidentifikation gender Patientens køn, F (kvinde), M (mand) age Patientens alder reacclass Sværhedsgraden af den allergiske reaktion, 1: "Mild", 2: "More serious, 3: "Anafylactic shock" tryptase Den registrerede værdi af serum tryptase Opgaven er at se på patienternes reaktion, dels som den kvantitative måling af tryptase og dels som den kategoriske variabel, der beskriver reaktionens sværhedsgrad i 3 kategorier. Vi skal se på forskelle mellem mænd og kvinder samt en evt. aldersafhængighed. OBS: Meget vigtigt!! I skal benytte hver jeres datasæt, idet hver enkelt kursist skal slette en af observationerne. Det fremgår af en liste på hjemmesiden hvilken det drejer sig om for hver enkelt. Dette er desværre nødvendigt pga. tidligere problemer med afskrift. 1

2 I bedes benytte sidste side fra denne opgavetekst i udfyldt stand som forside på jeres opgavebesvarelse. Siden findes også på nettet. 1. Tryptase vs. alder (og køn): (a) Lav en figur til illustration af tryptases afhængighed af alder. Kommenter på denne figur med henblik på at foretage en simpel lineær regression. (b) Udfør en lineær regression af tryptase (evt. transformeret), med alder som kovariat, og foretag passende modelkontrol. Hvis denne viser tydelige tegn på problemer, må du lave en passende transformation af tryptase og udføre analysen igen. (c) Giv et estimat for den forventede forskel på tryptase for to individer med 10 års forskel i alder. Husk konfidensinterval! (d) Fandt du en signifikant effekt af alder i denne model? (e) Udbyg figuren fra spørgsmål 1a ved at benytte forskellige symboler for mænd og kvinder. (f) Udbyg ligeledes analysen fra spørgsmål 1b til at undersøge, om effekten af alder er forskellig for mænd og kvinder. (g) Er der overhovedet nogen forskel på kønnene forsåvidt angår tryptase? Kvantificer med konfidensinterval. 2. Nu skal vi se på graden af reaktionen, reacclass (eller, hvis I argumenterer for det, en binær version af denne): (a) Det formodes, at tryptase-værdien er forhøjet for personer med anafylaktisk chok. Kan dette bekræftes baseret på de indsamlede data? Det forventes her, at man udover en P-værdi også anfører et konfidensinterval for en passende valgt størrelse. Husk at tegne, inden I regner. (b) Undersøg ved hjælp af en to gange to tabel, om anafylaktisk chok er mere udbredt blandt mænd end blandt kvinder. Kvantificer både differensen mellem sandsynlighederne samt relativ risiko og odds ratio. Formuler også konklusionen i ord. (c) Er der nogen sammenhæng mellem alderen og graden af den allergiske reaktion? I behøver ikke lave test osv. for dette spørgsmål, men blot kommentere ud fra passende summariske størrelser. 2

3 3. Tilbage til tryptases afhængighed af alder: (a) Foretag en analyse, der tillader estimation af den forventede forskel på tryptase for to individer med samme sværhedsgrad af den allergiske reaktion, men med 10 års forskel i alder. Husk konfidensinterval! (b) Fik du lavet modelkontrol for modellen ovenfor? (c) Forklar forskellen på resultaterne opnået under punkt 1c og 3a. 4. Giv en kort sammenfattende vurdering af, hvad du har fundet ud af. Reference: Garvey, L.H. et al. (2010): Effect of General Anesthesia and Orthopedic Surgery on Serum Tryptase Anesthesiology 2010; 112:

4 Regler for hjemmeopgave i basal statistik 1. Opgaven er individuel. Gruppebesvarelser modtages ikke. Det er naturligvis tilladt at snakke sammen om opgaven, men den endelige udformning skal være selvstændig. 2. Opgaver skal afleveres på papir, enten til øvelserne, på mit kontor ( ), eller sendes som almindeligt brev. Elektroniske besvarelser modtages ikke!! Det er simpelthen for arbejdskrævende med al den printning og sortering, beklager. Opgavebesvarelsen skal benytte en korrekt udfyldt forside (som også kan udprintes fra hjemmesiden). 3. Opgaven er obligatorisk. Godkendelse af opgavebesvarelsen er en forudsætning for udstedelse af kursusbevis. 4. Opgavebesvarelser med væsentlige fejl vil ikke blive godkendt. Det er altså ikke tilstrækkeligt at besvare halvdelen af opgaven korrekt. I tilfælde af betydelige fejl i opgaven vil I få en chance til at lave de relevante dele om. 5. Der er intet krav om brug af specifikt statistikprogrammel, men der kræves dokumentation for udførte analyser i form af computer output. 6. Ukommenteret computer output er ikke godt nok. I skal også med egne ord formulere hvad man kan aflæse på outputtet. 7. Skriftlig standardbesvarelse lægges først på hjemmesiden efter at alle opgavebesvarelser er i hus og godkendt. (Ellers kan man jo bare skrive af!) Gode råd Start tidligt. Det tager ofte længere tid end man tror, og det kan være en fordel at benytte lejligheden til at stille spørgsmål ved de mellemliggende øvelsesgange. Man kan med fordel med det samme påbegynde et Word dokument med opgavebesvarelse og løbende kopiere relevant output ind her og kommentere. Det er også væsentligt lettere at rette opgaven, hvis output står på de relevante steder og ikke i appendix.

5 Hjemmeopgave, forår 2014 Basal statistik for sundhedsvidenskabelige forskere Navn Hold Jeg har slettet observationen med løbenummer (id): Jeg har undervejs i opgaveløsningen diskuteret problemerne med følgende personer: Jeg erklærer, at jeg egenhændigt har udført analyserne og formuleret besvarelsen. Dato Underskrift