Workshop 5. Bring forskningen ind i undervisningen. Overvågning af marine invasive arter med edna metode

Transkript

1 Workshop 5. Bring forskningen ind i undervisningen Overvågning af marine invasive arter med edna metode

2 Peter Rask Møller group - Aquatic Biodiversity and Evolution Peter Rask Møller Henrik Carl Steen Knudsen Jørgen Nielsen Werner Schwarzhans Eva Sigsgaard Felipe Torquato Research Project examples National Fish Atlas. National collaborative research grant with DTU, funded by Aage V. Jensens Fonde. edna MONIS 2-4, Steps toward nation-wide monitoring of nonindigenous species in Danish marine waters National collaborative research contract with NIVA, DTU and AmphiConsult for SVANA. Taxonomy Evolution, Systematics & taxonomy of marine fishes Pop gen Connectivity, diversity and genetic flow between offshore natural coral reefs and oil platforms. International collaboration with Qatar University and Mærsk Oil, funded by QNRF.

3 Research - Fishing for/with edna : Philip F. Thomsen Aarhus University DNA&LIV Real Science DNAmark Collaborators:

4 to i Collections Curator of fishes /herp

5 5 edna approaches Artsspecifikke assays qpcr En art ad gangen kopier/liter Metabarcoding Next Gen sequencing Mange arter på en gang Reads

6 Easy to combine with other methods New Fishing methods Tegning Rasmus Ebert GPS

7 Fishing with edna Standardized Non-invasive Independent of weather conditions? Independent of bottom conditions? Lager catch-window Easy to combine with other methods Cryptic species Qualitative and Quantitative? 100% species ID? Population level? Trophic relation Monopol breaker? to i

8 Lager catch-window? DNA - henfaldstider Thomsen et al. 2012b Sigsgaard et al

9 Easy to combine with other methods Thomsen et al. 2016

10 Qualitative and Quantitative? West Greenland Thomsen et al. 2016

11 Trawl vs edna Thomsen et al. 2016

12 Whale shark and tuna in Qatar Iran Saudi Qatar Mærsk Oil

13 Population level? Sigsgaard et al. 2016

14 Trophic - relations Sigsgaard et al. 2016

15 Monitoring of non-indigenous species (NIS) in selected Danish harbours. MONIS 4

16 Sted og dato Slide 16 Eksempler på gymnasie-elevers indsats

17 Sted og dato Slide 17 Kvalitets-kontrol af gymnasie-elever Pos. Kon 1 Neg.Kon 0 edna 1 Pålidelige Resultater Pos. Kon. 1 Neg.Kon 0 edna 0 Procentvis pålidelige resultater Pos. Kon 1 Neg.Kon 1 edna 0 Pos. Kon 1 Neg.Kon 1 edna 1 Pos. Kon 0 Neg.Kon 0 edna 0 Upålidelige Resultater Pos. Kon 0 Neg.Kon 1 edna 0 Pos. Kon 0 Neg.Kon 0 edna 1 Pos. Kon 0 Neg.Kon 1 edna 1 Procentvis upålidelige resultater Antal Art prøver Loegfroe ,0% ,0% StorVandsalamander ,8% ,2% Strandtudse ,8% ,2% GroenbrogetTudse ,0% ,0% Loevfroe ,5% ,5% Springfroe ,1% ,9% Klokkefroe ,6% ,4% Skrubtudse ,3% ,7% Bjergsalamander ,5% ,5% Latterfroe ,5% ,5% SpidssnudetFroe ,3% ,7% KortbenetGroenFroe ,9% ,1% ButsnudetFroe ,3% ,7% LilleVandsalamander ,8% ,2% Karusse ,2% ,8% Skalle ,9% ,1% Soelvkarusse ,5% ,5% Antal prøver 717 Treshold 0.1 Procentvis pålidelige resultater 65,3%

18 Appendix B 19. edna detected from Mnemiopsis leidyi ( amerikanskribbegoble ), Assay Id No: season spring autumn Hirtshals Frederikshavn 57 Aalborgportland AalborgHavn edna evalution La titud e 56 No Ct below LOD above LOD and below LOQ 1 above LOQ 3 above LOQ Aarhus Grenaa Helsingoer Esbjerg KalundborgStatiolHavn Fredericia Odense Koebenhavn Koege 55 conventional monitoring Unknown, no previous record Recorded in the past Recorded during MONIS4 Roedby Gedser

19 19 REAL SCIENCE fokus på padder I projektet REAL SCIENCE undersøger gymnasieklasser fra hele landet i forårsmånederne en lokal sø for biotiske og abiotiske faktorer og indsamler samtidig en vandprøve. Klasserne benytter realtime-pcr-analyse til at undersøge forekomsten af miljø-dna - DNA-spor efter de padder og fisk, der lever i søen. PCR-analysen foretages ved hjælp af artsspecifikke sporingssystemer udviklet i et samarbejde mellem museets forskere og særligt interesserede elever Med projekterne ønsker museet at inddrage gymnasierne i så mange aspekter af forskningsprocessen, som vi kan. Derfor kan gymnasielærere og -elever deltage i praktiske aktiviteter og bidrage til forskningen gennem feltarbejde, laboratorieundersøgelser, 2/1/2019 databehandling, metodeudvikling og formidling.