Årsrapport vedrørende laboratorieundersøgelser af materiale fra kvæg på DTU Veterinærinstituttet

Transkript

1 Årsrapport 2014 vedrørende laboratorieundersøgelser af materiale fra kvæg på DTU Veterinærinstituttet Juli 2015

2 Indholdsfortegnelse 1. Indledning Data Materialer Geografisk fordeling af besætninger, som har indsendt materiale til DTU-Vet Resultater Bakteriologiske undersøgelser Parasitologiske undersøgelser Virologiske undersøgelser Histopatologiske undersøgelser Serologiske undersøgelser... 10

3 1. Indledning Denne rapport indeholder opgørelser af laboratorieundersøgelser for diverse sygdomme på materialer fra kvæg indsendt til DTU-veterinærinstituttet (DTU-Vet) i Indsendelserne vedrører dels kommercielle diagnostiske undersøgelser for almindeligt forekommende sygdomme og dels indsendelser som led i passiv og aktiv overvågning af nogle lovomfattede sygdomme. Det har ikke været muligt at inkludere overvågningsundersøgelser udført på private laboratorier eller på udenlandske laboratorier. Rapporten fokuserer på oprindelse og omfang af materialer, undersøgelsernes art og antal samt resultater af undersøgelserne, som primært præsenteres som tabeller og figurer. 2. Data 2.1 Materialer Tabel 1 viser antal indsendelser, prøver og undersøgelser. Indsendelser til DTU-Vet vedrører, bakteriologiske, parasitologiske, virologiske, histo-patologiske, og serologiske undersøgelser. Tabel 1. indsendelser, prøver og undersøgelser indsendelser prøver undersøgelser prøver per indsendelse 1 3 (1-85) 1 1 Median (5-95 percentiler) 1

4 prøver indsendelser Figur 1: indsendelser i løbet af 2014 Figur 2: prøver i løbet af

5 undersøgelser Figur 3: undersøgelser i løbet af 2014 Figurer 4 og 5: Type og oprindelse af indsendelserne 3

6 Figur 6: indsendelser til DTU Vet fordelt på forskellige anledninger Tabel 2: prøver fordelt på forskellige materialer indsendt til DTU-Vet prøver Blod Fæces Organer Mælk Næsesvaber Kadaver Aborterede fostre Figur 7: Andel af forskellige materialer indsendt til DTU-Vet 92% 8% 4% 3% 1% Blod Fæces Organer Mælk NæseSvaber Kadaver 4

7 Størstedelen af prøvemateriale til DTU-Vet er blodprøver til serologiske undersøgelser, efterfulgt af fæces til undersøgelse for bakterier og parasitter (Tabel 2) Figur 8: af indsendelser fra forskellige besætningstyper 5

8 2.2 Geografisk fordeling af besætninger, som har indsendt materiale til DTU-Vet Figur 9. Placering af aktive kvægbesætninger i Danmark i Røde besætninger indsendte prøver til DTU-Vet og grå besætninger indsendte ikke prøver til DTU-Vet. 6

9 Figure 10. Analyse af kvægbesætningers placering i forhold til indsendelse af prøver til DTU-Vet. kvægbesætninger som indsendte prøver til DTU-Vet (Røde) og aktive kvægbesætninger i hele landet (grå) i Fra Sydjylland (markeret med rød cirkel) var der indsendelser fra signifikant flere besætninger i forhold til total antal besætninger i området end fra resten af landet og fra Midt- og Nordjylland (markeret med lyseblå cirkler) var der indsendelser fra signifikant færre besætninger end fra resten af landet. 7

10 3. Resultater 3.1 Bakteriologiske undersøgelser Tabel 3: indsendelser til nogle specifikke bakteriologiske undersøgelser Patogen indsendelser positive Salmonella Mycoplasma bovis 17 3 Campylobacter fetus 78 0 Tabel 4: indsendelser med forskellige fund af patogene bakterier i materiale fra 121 aborterede fostre Pathogen positive prøver Bacillus licheniformis 4 Brucella spp. 0 Listeria monocytogenes 3 Non-hæmolytiske E. coli 12 Staphylococcus spp. 2 Streptococcus uberis 3 Andet inkl. negative 97 Tabel 5: fæcesprøver med E. coli, F5+ (k99+) og F5- (k99-). Non-hæmolytiske E. coli positive prøver F5+ 7 F5-76 Total 83 Tabel 6: Typebestemmelse af Salmonella fund Type 4,12:i:- 5 Salmonella dublin 5 Salmonella typhimurium 3 Salmonella havana 1 Andre typer 10 8

11 Protozoer Trematoder Nematoder 3.2 Parasitologiske undersøgelser Tabel 7: prøver med fund af forskellige parasitter Parasit Capillariaæg (hårorm) 1 Dictyocaulus larver (lungeorm) 2 Nematodirus battus æg (tarmorm) 1 Nematodirusæg (tarmorm) 9 Strongylideæg 48 Strongyloidesæg (trådorm) 9 Toxocara æg (spolorm) 1 Trichuris æg 10 Fasciola hepatica (den store leverikte) 2 Fasciola æg (leverikte) 13 Babesia divergens 2 Cryptosporidium 43 Oocyster Eimeria 93 Isospora Virologiske undersøgelser Tabel 8: indsendelser til undersøgelse for virus Patogen Bovin virusdiarré virus (BVDV) Undersøgelse ved cellekulturteknik indsendelser positive Bovin virusdiarre virus (BVDV) RT-PCR Infektiøs bovin rhinotracheitis virus (IBR) RT-PCR 5 0 Bovin respiratorisk syncytial virus (BRSV) 25 8 Bovin coronavirus 79 4 Rotavirus Bluetongue virus RT-PCR 51 0 Mund- og klovesyge virus (MKSV) RT- PCR 8 0 Schmallenberg virus (SBV) RT-PCR

12 IBR Q-Fever BVDV BLV Brucella BTV 3.4 Histopatologiske undersøgelser Tabel 9: prøver til histopatologiske undersøgelser Analyse Histologisk undersøgelse, Undersøgelse ved in situ hybridisering (FISH) 1 En prøve var fostervæske og derfor ikke inkluderet her prøver Abort kvæg Andet materiale 22 Q-feber 9 Andre agens Serologiske undersøgelser Tabel 10: serologiske undersøgelser Analyse Bluetongue virus (Antistof-test ved ELISA) undersø -gelser positive % Pos Testkit ,1 In-house ,5 Brucella (abortus/suis/meliten sis) Bovin Leukose virus Antistof-test ved agglutination SAT ,2 RBT Antistof-test ved CF Antistof-test ved indirekte ELISA Antistof-test ved ELISA Antistof-test ved ELISA ,4 Undersøgelse ved antigen-elisa ,4 Coxiella burnetii - Antistof-test ved ELISA på blod ,8 på mælk Antistof-test ved ELISA Neutralisationstest

13 SBV Salmonella Mycobac. M. bovis Leptospira L. hardjo / interrogans Antist of-test ved MAT Diagnost. (titer: <50) Eksport (titer: <100) L. canicola L. grippotyphosa L. hebdomadis Antistof-test ved MAT L.icterohaemorrhagica L. pomona Mycoplasma bovis, bestemmelse af antistoffer ved indirekte ELISA ,4 Mycobacterium paratuberculosis (Para-tb) - Antistof-test ved absorberet ELISA ,2 Salmonella Antistof-test ved ELISA ,7 Salmonella Dublin Antistof-test ved ELISA ,3 antistof-elisa ,4 Schmallenberg virus (VN), 5 prøver eller derover Vaccinerede dyr eller mistanker afkræftet ved PCR 2 Positive reagenter fundet negative for brucellose ved opfølgende undersøgelser 11