Protokol for genetisk bestemmelse af ABO blodtyper
|
|
- Jonathan Knudsen
- 8 år siden
- Visninger:
Transkript
1 Page1 Udarbejdet i samarbejde mellem: Kåre Lehmann, Annabeth Høgh Petersen, Anne Rusborg Nygaard og Jørn M. Clausen
2 Page2 VIGTIGT: SKIFT PIPETTE SPIDSER/TIPS EFTER HVER GANG!! Så undgår du at forurene dine prøver og de forskellige reagenser :-) God fornøjelse
3 Page3 A) Oprensning af genomisk DNA (DeoxyriboNucleicAcid) 1. Høst celler fra mundhulen med en steril vatpind ved at gnide vatpinden mod indersiden af kinden. Se figur Klip træpinden over ved bomuldskanten og kom træpind med bomuld i et 2 ml rør. Skriv jeres gruppe nummer på røret. Figur 1 Udtagning af prøve og afklipning i mikrocentrifugerør. Til oprensning af genomisk DNA anvendes QIAamp DNA Investigator Kit 3. Tilsæt 400 µl Buffer ATL og 20 µl proteinase K til hvert rør med prøve. Buffer ATL nedbryder (lyserer) cellemembraner og kernemembraner, da det indeholder natriumdodecylsulfat, der er et sæbestof. Dette frigør DNAet. Proteinase K, er et proteinspaltende enzym, der fordøjer DNA-nedbrydende proteiner, således DNAet ikke bliver nedbrudt. 4. Vortex prøven i 10 sekunder. 5. Inkuber prøven ved 56 C i 60 min. Vortex prøven i 10 sekunder hvert 10. min under inkuberingen. 6. Efter endt inkubering centrifuges prøven kort. 7. Tilsæt 400 µl Buffer AL og vortex prøven i 15 sekunder og centrifuger prøven kort. Buffer AL indeholder guanidinhydrochlorid, der er et salt, der ødelægger proteinerne, og herved beskytter DNAet imod at blive nedbrudt.
4 Page4 8. Inkuber prøven ved 70 C i 10 min. Vortex prøven i 10 sekunder hvert 3. min under inkuberingen. (Imens prøven inkuberer kan man med fordel støbe gelerne under punkt B). Figur 2 Oprensningens hovedtrin. 9. Efter endt inkubering centrifuges prøven kort. 10. Tilsæt 200 µl 100 % ethanol og vortex prøven i 15 sekunder. Centrifuger kort. DNAet vil udfælde ved tilsætningen af ethanol. 11. Overfør lysatet (væsken) til en QIAamp MinElute kolonne. Centrifuger ved 8000 rpm i 1 min. Dna et fra prøven vil nu bindes til membranen, som sidder i kolonnen. Efter centrifugeringen overføres kolonnen til et nyt opsamlingsrør. Det gl. opsamlingsrør smides ud. 12. Tilsæt 500 µl Buffer AW1 til kolonnen. Centrifuger ved 8000 rpm i 1 min. (Det bundne dna vaskes rent for andre stoffer). Herefter overføres kolonnen til et rent opsamlingsrør. Det gl. opsamlingsrør smides ud. Buffer AW1 indeholder også et guadinium salt samt ethanol. 13. Tilsæt 700 µl Buffer AW2. Centrifuger ved 8000 rpm i 1 min. (Endnu en vask af det bundne dna). Herefter overføres kolonnen til et rent opsamlingsrør. Det gl. opsamlingsrør smides ud.
5 Page5 14. Tilsæt 700 µl 100 % ethanol. Centrifuger ved 8000 rpm i 1 min. (Sidste vask af det bundne dna!)herefter overføres kolonnen til et rent opsamlingsrør. Det gl. opsamlingsrør smides ud. 15. Centrifuger ved rpm i 3 min (gøres for at trække al ethanolen ud af membranen, så den lettere tørrer) 16. Overfør kolonnen til et 1,5 ml eppendorf rør og inkuber minimum 10 min. ved stuetemperatur eller 3 min. ved 56 C. (Tørring af membranen) Det gl. opsamlingsrør smides ud. 17. Tilsæt 30 µl Buffer ATE til kolonnen og inkuber i 5 min. ved stuetemperatur. Det bundne dna genopløses nu. 18. Centrifuger ved rpm i 1 min. Dna et befinder sig nu i væsken igen. 19. Gentag trin 17 og 18 for at sikre, at mest mulig dna bliver elueret. B) Gelelektroforese af oprenset genomisk DNA. Støbning af en 1 % agarose gel (nok til 3 stk.) Hvis der går mere end 1 uge mellem i skal bruge DNA-gelen og PCR-gelerne, er det bedst i støber gelerne ad 2 omgange. Hvis I gør det, husk da at korrigere mængden af agarose og buffer. 1. Rengør 3 gelkar og tilhørende kamme i 70 % ethanol. 2. Spænd gelbakkerne fast i de medfølgende klemmer, så de tætnes i begge ender. Se figur 3. Figur 3 Støbeklemme til gelbakker.
6 Page6 3. Tag en 250 ml bluecap flaske og vej 1,5 g agarose af i flasken. 4. Tilsæt 140 ml 1xTAE buffer til bluecap flasken, læg en omrører-magnet i og sæt låget løst på. 5. Sæt flasken med agarose-opløsningen på varmepladen og varm til kogepunktet under omrøring. Se figur 4. Opløsningen skal koge et par minutter før al agarosen er opløst. Hvis jeres laboratorie har en mikroovn kan denne anvendes i stedet for varmepladen. Figur 4 Varmeplade med bluecap til smeltning af agarosen. 6. Check at opløsningen er helt klar (intet uopløst agarose må være tilbage). 7. Tag omrører-magneten op. (Gøres bedst med en magnet-henter og pas på den meget varme opløsning!) 8. Tag nitrilhandsker på. 9. Tilsæt 10 ml 1xTAE+EtBr opløsning til de 140 ml opløst agarose, og bland ved at svinge flasken rundt nogle gange. EtBr (Ethidium bromid) anvendes til farvning af DNA og fluorescerer i UV lys. Husk at bruge handsker (nitrilhandsker, de er blå) ved håndteringen af EtBr, da det er mutagen! 10. Lad gelopløsningen køle af i 5 min. 11. Hæld blandingen op i gelkarrene (ca ml per gel). Undgå luftbobler. Kom kammen i toppen af gelen. Lad gelen størkne. (20-30 min). Hvis I ikke bruger al agarose-opløsning til at støbe geler med, kan resten hældes i en pose, som smides i skrald når det er størknet. Husk at skylle flasken ren med vand mens den er varm.
7 Page7 12. De geler, som ikke skal bruges samme dag, kan gemmes i en plasticpose i køleskabet i op til 1 uge. Gelelektroforese 1. Brug Nitrilhandsker ved håndteringen af gelen. 2. Løsn støbeforms-klemmen, tag kammen op af gelen og kom gelkaret over i et elektroforesekar. Brøndene fra kammen skal vende mod den negative pol i elektroforesekaret, og bunden af gelen skal vende mod den positive pol i elektroforesekaret. DNAet er negativladet og vil derfor vandre mod den positive pol. 3. Hæld 1xTAE Buffer i elektroforesekarret, så brøndene og gelen er dækket med bufferen. 4. Bland 2 µl DNA loading buffer med 10 µl oprenset DNA prøve. 5. Tilsæt 3 µl 1 kb DNA markør til den første brønd. 6. Tilsæt 10 µl af blandingen fra pkt.4 til den næste brønd osv. Der er plads til i 14 prøver/gel. 7. Når DNA markøren og alle prøverne er tilsat gelen sættes gelelektroforese-låget på. 8. Tilslut strømforsyningen til gelelektroforesekaret. VIGTIGT: Husk at sætte rødt stik i rødt hul og sort stik i sort hul i strømforsyningen. 9. Strømforsyningen indstilles på 90 V i 45 min. 10. Tryk start (RUN). 11. Læg gelen på en UV-bakken (se figur 5)og tag et billede (anvend den medfølgende Geldoc)
8 Page8 Figur 5 UV-tray til Gel Doc'en med gel på. Gel Doc en tilsluttes den medfølgende labtop med USB kablet. Tænd for Gel Doc en strømforsyning og start softwaren på labtoppen Image Lab.
9 Page9 C) Polymerase Chain Reaction (PCR) med AB0 gene specifikke primere 1. Start med at tænde PCR maskinen og anvend følgende program. PCR-maskinen er allerede programmeret med dette program. Det hedder BIOTEK-1 og kan findes under de gemte protokoller. Vælg dette program og tryk RUN når alle PCR rør med prøver er sat i maskinen. Temperatur Tid Cyklusser 95⁰C 11 min 1 95⁰C 30 sec 60⁰C 30 sec 35 72⁰C 1 min 72⁰C 5 min 1 10⁰C Pause For høj koncentration af template-dna i en PCR-reaktion kan give uspecifik binding af primerne. Man kan koncentrationsbestemme DNA spektrofotometrisk, men ældre udstyr kræver tit et alt for stort volumen end hvad vi har elueret. På baggrund af tidligere erfaring med forsøget anbefaler vi derfor: At fortynde de 60 µl eluat 250x. (dvs 4µl µl DNA-vand) Gør 2 PCR rør pr. prøve klar. Skriv på låget så du kan kende forskel på dine prøver. Grp. 1 navngiver sine rør: 1a og 1b Grp. 2 navngiver sine rør: 2a og 2b Osv. Tallet indikeret gruppens nummer, og bogstavet indikerer, hvilket primer mix der er anvendt (se nedenfor). 1. Sæt PCR rørerne på is. 2. Tilsæt 20 µl genomisk DNA (fortyndet 250x) til hvert rør. 3. Tilsæt 5 µl Exon6 primer mix (10 µm) til rør a
10 Page10 4. Tilsæt 5 µl Exon7 primer mix (10 µm) til rør b MEGET VIGTIGT: Skift pipette spids HVER GANG, så primer og prøver ikke forurenes eller bliver blandet med hinanden!!! 5. Bland følgende PCR reaktionsmix på is og i den givne rækkefølge (Hvis der blandes til flere prøver, multiplicer da volumenet med antallet af prøver+2, for at sikre der er nok) Pr. reaktion 12,4 µl DNA H2O 5 µl DreamTaq Buffer (10x) 2 µl dntp mix (25 mm) 4 µl MgCl2 (25 mm) 1,6 µl Dream Taq Polymerase 6. Tilsæt 25 µl PCR reaktionsmix til hvert rør. 7. Når ALLES prøver er klar: Tag din isbakke med prøver hen til PCR maskinen. 8. Sæt hurtigt dine prøver i og luk PCR maskinen. Det er vigtigt at prøverne ikke står og venter i PCR-maskinen, fordi alles prøver ikke er klar! 9. Tjek at PCR programmet kører ved at tiden på 11 min tæller op. PCR programmet varer ca. 2 timer. D) Gelelektroforese af PCR produkter. Hvis man støbte 3 geler i begyndelsen af forsøget, tages de sidste 2 nu frem fra køleskabet. Husk at anvende nitril-handsker ved håndtering af gelerne. 1. Kom gelkaret over i et elektroforesekarret. Brøndene fra kammen skal vende mod den negative pol i elektroforesekaret, og bunden af gelen skal vende mod den positive pol i elektroforesekaret. DNAet er negativladet og vil derfor vandre mod den positive pol. 12. Hæld 1xTAE Buffer i elektroforesekaret, så brøndene og gelen er dækket med bufferen. 13. Bland 2 µl DNA loading buffer med 5 µl PCR prøve. 14. Tilsæt 3 µl 1 kb DNA markør til den første brønd.
11 Page Tilsæt 6 µl prøve (produktet fra pkt.13) til den næste brønd osv. 16. Når DNA markøren og alle prøverne er tilsat gelen sættes gelelektroforese-låget på. 17. Tilslut strømforsyningen til gelelektroforesekarret. VIGTIGT: Husk at sætte rødt stik i rødt hul og sort stik i sort hul i strømforsyningen. 18. Strømforsyningen indstilles på 90 V i 45 min. 19. Tryk start (RUN). 20. Læg gelen på en UV-bakken og tag et billede. Samme procedure som Produktet af exon 6 forventes at være ca. 460 bp mens exon 7 er 650 bp. 21. Det tilbageværende PCR produkt fra alle prøver, som gav bånd, skal nu markeres som angivet nedenfor og sendes tilbage til Aalborg Universitet for efterfølgende sekventering. 22. Rørene markeres således: Gruppe x, exon 6 Gruppe x, exon Sæt alle prøverne i den medfølgende blå frost-box og opbevar denne i fryseren indtil dagen for tilbagesendelse (alternativt dagen før afsendelse). 24. Når prøverne kommer tilbage til AAU vil de gennemgå en PCR-cleanup (proces, hvor taq-pol, dntp s og primer-rester fjernes), hvorefter de sendes til sekventering. (Normalt hos Eurofins i Tyskland.) Begge exons vil af prismæssige hensyn kun blive sekventeret med forward-primeren. 25. Resultaterne bliver returneret til skolen så snart de modtages retur fra sekventeringsfirmaet. For at tolke sekvens-resultaterne, er man nødt til at læse vejledningen grundigt igennem samt at downloade programmet Chromas Lite, som gratis kan downloades fra internettet. Dette gøre i samarbejde med læreren. Rigtig god fornøjelse!
Protokol for genetisk bestemmelse af ABO blodtyper
Page1 Udarbejdet i samarbejde mellem: Kåre Lehmann, Annabeth Høgh Petersen, Anne Rusborg Nygaard og Jørn M. Clausen Page2 VIGTIGT: SKIFT PIPETTE SPIDSER/TIPS EFTER HVER GANG!! Så undgår du at forurene
Læs mereTrin 1: Oprensning af genomisk DNA (DeoxyriboNucleicAcid)
Trin 1: Oprensning af genomisk DNA (DeoxyriboNucleicAcid) (Denne del tager ca. 3 timer, max 14 prøver) ELEVVEJLEDNING forsøgskasse nr. 1 AAU Oprensning af DNA-prøven foregår gennem fem trin, se figur 1:
Læs mereTest dit eget DNA med PCR
Test dit eget DNA med PCR Navn: Forsøgsvejledning Formål med forsøget Formålet med dette forsøg er at undersøge jeres arvemateriale (DNA) for et transposon kaldet Alu. Et transposon er en DNA sekvens,
Læs mereTest dit eget DNA med PCR
Test dit eget DNA med PCR Forsøgsvejledning Navn: Side 1 af 7 Formål med forsøget Formålet med dette forsøg er at undersøge jeres arvemateriale (DNA) for et transposon kaldet Alu. Et transposon er en DNA
Læs mereTest dit eget DNA med PCR
Test dit eget DNA med PCR Navn: Forsøgsvejledning Side 1 af 8 Formål med forsøget Formålet med dette forsøg er at undersøge jeres arvemateriale (DNA) for et transposon kaldet Alu. Et transposon er en DNA
Læs mereTest dit eget DNA med PCR
Test dit eget DNA med PCR Navn: Forsøgsvejledning Side 1 af 8 Formål med forsøget Formålet med dette forsøg er at undersøge jeres arvemateriale (DNA) for et transposon kaldet Alu. Et transposon er en DNA-sekvens,
Læs mereTest dit eget DNA med PCR
Test dit eget DNA med PCR Navn: Forsøgsvejledning Side 1 af 8 Formål med forsøget Formålet med dette forsøg er at undersøge jeres arvemateriale (DNA) for et transposon kaldet Alu. Et transposon er en DNA-sekvens,
Læs mereGAPDH PCR modul Manual
GAPDH PCR modul Manual Katalog nr. 166-5010EDU explorer.bio-rad.com Kopiering kun tilladt til undervisningsbrug Bemærk: Kittet indeholder temperaturfølsomme dele. Åbn derfor straks kassen og læg de pågældende
Læs mereDNA origami øvelse 2013. DNA origami øvelse
DNA origami øvelse Introduktion I denne øvelse bruger vi DNA origami teknikken til at samle en tavle af DNA med dimensioner på 70 nm x 100 nm. Tavlen dannes af et langt enkeltstrenget DNA molekyle, der
Læs mereAnalyse af proteiner Øvelsesvejledning
Center for Undervisningsmidler, afdeling København Analyse af proteiner Øvelsesvejledning Formål At separere og analysere proteiner i almindelige fødevarer ved brug af gelelektroforese. Teori Alle dele
Læs merePCR (Polymerase Chain Reaction): Opkopiering af DNA
PCR (Polymerase Chain Reaction): Opkopiering af DNA PCR til at opkopiere bestemte DNA-sekvenser i en prøve er nu en af genteknologiens absolut vigtigste værktøjer. Peter Rugbjerg, Biotech Academy PCR (Polymerase
Læs mereVelkommen. Test dit eget DNA med PCR. Undervisningsdag på DTU Systembiologi. Undervisere:
Velkommen Test dit eget DNA med PCR Undervisningsdag på DTU Systembiologi Undervisere: Hvem er I? 2 DTU Systembiologi, Danmarks Tekniske Universitet Hvilke baser indgår i DNA? A. Adenin, Guanin, Cytosin,
Læs mereDNA origami øvelse DNA origami øvelse
DNA origami øvelse Introduktion I denne øvelse bruger vi DNA origami teknikken til at samle en tavle af DNA med dimensioner på 70 nm x 100 nm. Tavlen dannes af et langt enkeltstrenget DNA molekyle, der
Læs mereTrin 1: Oprensning af genomisk DNA (DeoxyriboNucleicAcid)
Trin 1: Oprensning af genomisk DNA (DeoxyriboNucleicAcid) LÆRERVEJLEDNING forsøgskasse nr. 1 AAU (rev.17.02.16) (Denne del tager ca. 3 timer, max 14 prøver) Oprensningen forudsætter elevernes fortrolighed
Læs mereDNA origami øvelse. Introduktion. DNA origami øvelse 3 timer 2018
DNA origami øvelse Introduktion I denne øvelse bruger vi DNA origami teknikken til at samle en tavle af DNA med dimensioner på 70 nm x 100 nm. Tavlen dannes af et langt enkeltstrenget DNA molekyle, der
Læs mereDNA origami øvelse DNA origami øvelse
DNA origami øvelse Introduktion I denne øvelse bruger vi DNA origami teknikken til at samle en tavle af DNA med dimensioner på 70 nm x 100 nm. Tavlen dannes af et langt enkeltstrenget DNA molekyle, der
Læs mereBiotechnology Explorer
Biotechnology Explorer Oprensning af genomisk DNA fra plantemateriale Manual Katalog nr. 166-5005EDU explorer.bio-rad.com Oversat og bearbejdet af Birgit Sandermann Justesen, Nærum Gymnasium, februar 2009
Læs mereRegnskovens hemmeligheder
Center for Undervisningsmidler, afdeling København Regnskovens hemmeligheder Øvelsesvejledning Formål Et gen for et kræfthelbredende protein er blevet fundet i nogle mystiske blade i regnskoven. Forskere
Læs mereVelkommen. Test dit eget DNA med PCR. Undervisningsdag på DTU Systembiologi. Undervisere: Sebastian, Louise og Ana
Velkommen Test dit eget DNA med PCR Undervisningsdag på DTU Systembiologi Undervisere: Sebastian, Louise og Ana Hvem er I? 2 DTU Systembiologi, Danmarks Tekniske Universitet Dagens program 9:00 10:00 Introduktion
Læs mereKRIMINALDETEKTIVEN GERNINGSSTEDETS GÅDE PCR
KRIMINALDETEKTIVEN GERNINGSSTEDETS GÅDE Elevvejledning PCR PCR trin for trin PCR involverer en række gentagne cykler, der hver består af følgende tre trin: Denaturering, primer påsætning og forlængelse
Læs mereLaboratorieprotokol for manuel isolering af DNA fra 0,5 ml prøve
Laboratorieprotokol for manuel isolering af DNA fra 0,5 ml prøve Til isolering af genomisk DNA fra indsamlingssætserierne Oragene - og ORAcollect. Du kan finde flere sprog og protokoller på vores webside
Læs mereFORSØG ØL verdens første svar på anvendt
FORSØG ØL verdens første svar på anvendt bioteknologi Biotech Academy BioCentrum-DTU Søltofts Plads DTU - Bygning 221 2800 Kgs. Lyngby www.biotechacademy.dk bioteket@biocentrum.dtu.dk INDHOLDSFORTEGNELSE
Læs mereAppendix 1: Udregning af mængde cellesuspention til udsåning. Faktor mellem total antal celler og antal celler der ønskes udsås:
Appendix Appendix 1: Udregning af mængde cellesuspention til udsåning Fortyndingsfaktor: Efter trypsinering og centrifugering af celler fra cellestokken, opblandes cellerne i 1 ml medie. For at lave en
Læs mereFormål At analysere for myosin i muskelvæv fra fisk ved brug af western blotting
Center for Undervisningsmidler, afdeling København Western blotting Øvelsesvejledning Formål At analysere for myosin i muskelvæv fra fisk ved brug af western blotting Teori Proteomik er studiet af celleproteiners
Læs mereTissue_LC_200_V7_DSP og Tissue_HC_200_V7_DSP
August 2015 QIAsymphony SPprotokolark Tissue_LC_200_V7_DSP og Tissue_HC_200_V7_DSP Dette dokument er Tissue_LC_200_V7_DSP og Tissue_HC_200_V7_DSP QIAsymphony SPprotokolark, R2, til kitversion 1. QIAsymphony
Læs merePå jagt efter min far. Edvotec S-49.
På jagt efter min far. Edvotec S-49. Skolekom eller Frederiksen er leverandører Dansk oversættelse Lektor Åse Uttenthal, Vordingborg Gymnasium og HF. Figurer fra Edvotecs vejledning. Oktober 2017, version
Læs mereBiotechnology Explorer
Biotechnology Explorer Genes in a Bottle Kit DNA Extraction Module Lav et halssmykke med dit eget DNA Katalognr.: 166-2000EDU Dertil kan man købe ekstradele, hvis der skal laves halskæder til eleverne.
Læs mereEkstraktion af proteiner fra kød, æg og mælkeprodukter
Ekstraktion af proteiner fra kød, æg og mælkeprodukter Udarbejdet af Lektor Lars Haastrup Pedersen, forskningsadjunkt Claus Gyrup Nielsen, Phd. Anders Bundgaard Sørensen, Phd. Malene Bredal Brohus samt
Læs mereGerningsstedets gåde Den usynlige sandhed - DNA PCR Basics Kit. Katalog nr. 166-2600EDU
1 Gerningsstedets gåde Den usynlige sandhed - DNA PCR Basics Kit Katalog nr. 166-2600EDU Bemærk: Kittet indeholder temperaturfølsomme dele. Åbn derfor straks pakken og læg de dele, der er mærket med -20
Læs mereForsøgsprotokol til larveforsøg: Tilsætning af 3 dage gamle larver til gødning inficeret med patogene bakterier
Forsøgsprotokol til larveforsøg: Tilsætning af 3 dage gamle larver til gødning inficeret med patogene bakterier Formål: at undersøge udviklingen i mængden af tilsatte patogene bakterier til hønsegødning.
Læs mereIsolering af DNA fra løg
Isolering af DNA fra løg Formål: At afprøve en metode til isolering af DNA fra et levende væv. At anvende enzymer.. Indledning: Isolering af DNA fra celler er første trin i mange molekylærbiologiske undersøgelser.
Læs mereBiotechnology Explorer. Protein Fingerprinting
Biotechnology Explorer Protein Fingerprinting Instruktionsmanual Katalognummer 166-0100EDU explorer.bio-rad.com Delene i dette kit er sendt i seperate æsker. Opbevar proteinstandarderne i fryseren, ved
Læs mereEn forsker har lavet et cdna insert vha PCR og har anvendt det følgende primer sæt, som producerer hele den åbne læseramme af cdna et:
F2011-Opgave 1. En forsker har lavet et cdna insert vha PCR og har anvendt det følgende primer sæt, som producerer hele den åbne læseramme af cdna et: Forward primer: 5 CC ATG GGT ATG AAG CTT TGC AGC CTT
Læs mereBanan DNA 1/6. Formål: Formålet med øvelsen er at give eleverne mulighed for at se DNA strenge med det blotte øje.
Banan DNA Formål: Formålet med øvelsen er at give eleverne mulighed for at se DNA strenge med det blotte øje. Baggrundsviden: Om vi er mennesker, dyr eller planter, så har alle organismer DNA i deres celler.
Læs mereBiotechnology Explorer
Biotechnology Explorer Green Fluorescent Protein (GFP) Oprensnignskit Katalognummer 166-0005-EDU www.bio-rad.com For teknisk service bedes du ringe til dit lokale Bio-Rad kontor Office or in the U.S. Call
Læs mereElektroforese. Navne: Rami Kassim Kaddoura Roman Averin Safa Sarac Magnus Høegh Jensen Frederik Gaarde Lindskov
Elektroforese Navne: Rami Kassim Kaddoura Roman Averin Safa Sarac Magnus Høegh Jensen Frederik Gaarde Lindskov Klasse: 1.4 Fag: Biologi Vejleder: Brian Christensen Skole: Roskilde tekniske gymnasium, Htx
Læs mereTag dine gener om halsen. Isoler dit eget DNA, og lav et halssmykke ud af det.
Samarbejde mellem gymnasier og Aarhus Universitet Bioteknologiske eksperimenter Tag dine gener om halsen. Isoler dit eget DNA, og lav et halssmykke ud af det. Denne øvelse er baseret på øvelseskittet:
Læs mereAndrostenon-indol-skatol-protokol.
Androstenon-indol-skatol-protokol. Indholdsfortegnelse: 1. Formål side 2 2. Teori side 2 2. Prøvebehandling side 2 3. Materialer side 2 3.1 Apparatur side 2 3.2 Kemikalier side 3 3.3 Reagenser side 3 4.
Læs mereMælkesyrebakterier og holdbarhed
Mælkesyrebakterier og holdbarhed Navn: Forsøgsvejledning Mælkesyrebakterier og holdbarhed Formål med forsøget Formålet med denne øvelse er at undersøge mælkesyrebakteriers og probiotikas evne til at øge
Læs mereVi går derfor ud fra, at I ved, at DNA molekyler er meget lange molekyler
DNA-profil analyse Indledning DNA-profil analyser eller i daglig tale DNA-fingeraftryk er en metode, der bruges, når man skal finde ud af, hvem der er far et barn, hvis der altså er flere muligheder. Det
Læs mereELISA Immuno Explorer TM Kit
- 1 - ELISA Immuno Explorer TM Kit Katalog nummer 166-2400EDU Til læreren Dette kit er lavet for at lette og illustrere immunologiundervisningen og kan give en øget forståelse af antigen-antistof interaktionen,
Læs mereGreen Fluorescent Protein (GFP) Oprensning af GFP
1 Green Fluorescent Protein (GFP) Oprensning af GFP Katalognummer 166-0005EDU www.biorad.com Oversat og bearbejdet af Birgit Sandermann Justesen, Nærum Gymnasium Revideret februar 2010. Kontakt: Birgitjustesen@gmail.com
Læs mereBiotechnology Explorer. Regnskovens hemmelighed
Biotechnology Explorer Regnskovens hemmelighed Katalognummer 166-0006-EDU explorer.bio-rad.com For teknisk service bedes du ringe til dit lokale Bio-Rad kontor Office or in the U.S. Call 1-800-4BIORAD
Læs mereBiotechnology Explorer. Kromosom 16 PV92 PCR Kit
1 Biotechnology Explorer Kromosom 16 PV92 PCR Kit Katalog nr.166-2500edu explorer.bio-rad.com Bemærk: Kittet indeholder temperaturfølsomme dele. Åbn derfor straks kassen og læg de pågældende dele til opbevaring
Læs mereElevvejledning pglo transformation
Introduktion til transformation Elevvejledning pglo transformation I denne øvelse skal du lære fremgangsmåden ved genetisk transformation. Husk på, at et gen er et stykke DNA, der indeholder informationer
Læs mereBiotechnology Explorer ELISA Immuno Explorer Kit. Instruktionsmanual
Biotechnology Explorer ELISA Immuno Explorer Kit Instruktionsmanual Katalognummer 166-2400EDU explorer.bio-rad.com Delene i dette kit er sendt i separate æsker. Opbevar posen med reagenser i køleskab indefor
Læs mereE 10: Fremstilling af PEC-solceller
E 10: Fremstilling af PEC-solceller Formål Formålet med forsøget er at fremstille PEC (Photo Electro Chemical) solceller ud fra vinduesruder, plantesaft, hvid maling og grafit fra en blyant. Apparatur
Læs mereØvelse med tarmkræftceller i kultur.
Øvelse med tarmkræftceller i kultur. Baggrund Hver 3. dansker bliver ramt af kræft, inden de er blevet 75 år. Tyktarmskræft er den 3. hyppigste kræftform hos både mænd og kvinder, hvor henholdsvis 7.3
Læs mereDNA-smykke Simpel ekstraktion af DNA fra kindceller fra mennesket, som er velegnet til at bruge i et halssmykke
145678 John Schollar and Dean Madden National Centre for Biotechnology Education, University of Reading Science and Technology Centre, Earley Gate, Reading RG6 6BZ UK E: J.W.Schollar@reading.ac.uk Simpel
Læs mereFind enzymer til miljøvenligt vaskepulver
Find enzymer til miljøvenligt vaskepulver Enzymer, der er aktive under kolde forhold, har adskillige bioteknologiske anvendelsesmuligheder. Nye smarte og bæredygtige produkter kan nemlig blive udviklet
Læs mereAnimo 1. GENEREL BESKRIVELSE
Animo Denne instruktion er for brugere af Animo vandopvarmningsbeholder, type WKT-Dn. Læs denne instruktion omhyggeligt, da det bevirker bedst og mest sikker brug af maskinen. 1. GENEREL BESKRIVELSE Vandopbevaringsbeholderen
Læs mereProduktion af biodiesel fra rapsolie ved en enzymatisk reaktion
Produktion af biodiesel fra rapsolie ved en enzymatisk reaktion produceres fra rapsolie som består af 95% triglycerider (TG), samt diglycerider (DG), monoglycerider (MG) og frie fedtsyrer (FA). Under reaktionen
Læs mereMælkesyrebakterier og holdbarhed
Mælkesyrebakterier og holdbarhed Formål Formålet med denne øvelse er at undersøge mælkesyrebakteriers og probiotikas evne til at øge holdbarheden af kød ved at: 1. Undersøge forskellen på bakterieantal
Læs mereRegnskovens hemmelighed
1 Regnskovens hemmelighed Katalognummer 1660006-EDU www.bio-rad.com Oversat og bearbejdet af Birgit Sandermann Justesen, Nærum Gymnasium Revideret februar 2010. Kontakt: Birgitjustesen@gmail.com Brugen
Læs mereProteinelektroforese af GFP Suppleringskit til pglo
Proteinelektroforese af GFP Suppleringskit til pglo Katalognummer nr. 166 0013EDU www.bio rad.com Oversat og bearbejdet af Birgit Sandermann Justesen, Nærum Gymnasium, Nærum Hovedgade 30, 2850 Nærum Birgitjustesen@gmail.com
Læs mereBW T A Q A Life. Kompakt blødgøringsanlæg til private husstande
Installations- Quickguide for og VVS ere Betjeningsvejledning for hurtig og enkel installation DK DK BW T A Q A Life Kompakt blødgøringsanlæg til private husstande 1 Test drikkevandets hårdhed Udfør en
Læs mereBiotechnology Explorer GMO analyse Kit
1 Biotechnology Explorer GMO analyse Kit Katalog nr.166-2500edu www.biorad.com Oversat og bearbejdet af Birgit Sandermann Justesen december 2005 - revideret februar 2010 Bemærk: Kittet indeholder temperaturfølsomme
Læs mere1 ISMASKINE OXIRIA Sikkerhed og generel beskrivelse VIGTIGE SIKKERHEDSFORANSTALTNINGER Ved brug af elektriske apparater, må der altid tages sikkerhedsforanstaltninger: 1. Læs denne vejledning omhyggeligt,
Læs mereSTUDERENDES ØVELSESARK TIL EKSPERIMENT A: NATURLIGE NANOMATERIALER
STUDERENDES ØVELSESARK TIL EKSPERIMENT A: NATURLIGE NANOMATERIALER Navn: Dato:.. MÅL: - Lær om eksistensen af naturlige nanomaterialer - Lysets interaktion med kolloider - Gelatine og mælk som eksempler
Læs mereMaterialeliste: Ready-to-loadTM DNA prøver til elektroforese. Medfølgende reagenser og tilbehør. Egne materialer
Elevvejledning 1 Materialeliste: Ready-to-loadTM DNA prøver til elektroforese A B C D E F Plasmid DNA (uskåret) Plasmid skåret med Bgl I Plasmid skåret med Eco RI Lambda DNA (uskåret) Lambda DNA skåret
Læs merePlasmidoprensning med kogemetode Oprensning af plasmid DNA med kogemetode for brug til transformation og restriktionsanalyse
www.volvoxdk.dk C. Girnth-Diamba og B. Fahnøe, 2010 Claudia Girnth-Diamba og Bjørn Fahnøe Solrød Gymnasium, Solrød Center 2 DK 2680 Solrød Strand, Denmark E: sgcg@solgym.dk og sgbf@solgym.dk Plasmidoprensning
Læs mereLigerings- og transformationsmodul inklusiv plasmidoprensning og restriktionsanalyse
Biotechnology Explorer Ligerings- og transformationsmodul inklusiv plasmidoprensning og restriktionsanalyse Katalog nr. 166-5015EDU explorer.bio-rad.com Kopiering kun tilladt til undervisningsbrug Bemærk:
Læs merePuffere. Øvelsens pædagogiske rammer. Sammenhæng. Formål. Arbejdsform: Evaluering
1 Puffere Øvelsens pædagogiske rammer Sammenhæng Denne øvelse er tilpasset kemiundervisningen på modul 3 ved bioanalytikeruddannelsen. Kemiundervisningen i dette modul indeholder blandt andet syrebaseteori
Læs mereC V C. Vejledning i brug af Biofortuna SSPGo TM HLA No Template Control Kit BF-40-02. Revision 2. Juli 2014
DOT131v1 Instructions for Use Biofortuna SSPGo TM HLA No Template Control Kit BF-40-02 Side 1 af 7 Vejledning i brug af Biofortuna SSPGo TM HLA No Template Control Kit BF-40-02 Revision 2 Juli 2014 DOT131v1
Læs mereUndersøgelser af fiskeproteiner. protein-fingerprinting og immunoblotting 1. Proteomik kit I Proteinelektroforese
Undersøgelser af fiskeproteiner. protein-fingerprinting og immunoblotting 1 Proteomik kit I Proteinelektroforese Oversat og bearbejdet af Birgit Sandermann Justesen, Nærum Gymnasium og Niels Troest, Bjerringbro
Læs mereDet Teknisk-Naturvidenskabelige Fakultet
Analyse af geners ekspressionsprofil i arkiveret lymfoidt materiale: Undersøgelse af metode til kvalitetsbaseret udvælgelse af tumorvæv, der er fikseret i formalin og indstøbt i paraffin Afgangsprojekt
Læs mereIsmaskine BRUGSANVISNING. Model nr V, 50/60Hz Kapacitet: 0,5 liter
Ismaskine Model nr. 1664 220-240V, 50/60Hz Kapacitet: 0,5 liter BRUGSANVISNING 1 Vigtige sikkerhedsforanstaltninger. Ved brug af elektriske apparater er det vigtigt at overholde grundlæggende sikkerhedsforanstaltninger,
Læs mereKemiøvelse 2 1. Puffere
Kemiøvelse 2 1 Puffere Øvelsens pædagogiske rammer Sammenhæng Denne øvelse er tilpasset kemiundervisningen på modul 3 ved bioanalytikeruddannelsen. Kemiundervisningen i dette modul indeholder blandt andet
Læs mereSpm. 1.: Hvis den totale koncentration af monomer betegnes med CT hvad er så sammenhængen mellem CT, [D] og [M]?
DNA-smeltetemperaturbestemmelse KemiF2-2008 DNA-smeltetemperaturbestemmelse Introduktion Oligonucleotider er ofte benyttet til at holde nanopartikler sammen med hinanden. Den ene enkeltstreng er kovalent
Læs mereKapitel 1 Genteknologi (1/6)
Kapitel 1 Genteknologi (1/6) Transformation FOTO: SØREN LUNDBERG FORMÅL At isolere plasmider fra plasmidbærende bakterier og overføre dem til andre bakterier. TEORI Transformation er den teknik, hvor generne
Læs mereKonkurrence mellem to bakteriearter
1 Biologi-forsøg: Populationsbiologi/evolution Konkurrence mellem to bakteriearter Forsøget undersøger, hvordan en ydre miljøfaktor (temperatur) påvirker konkurrencen mellem to forskellige arter. I dette
Læs mere[BESØGSSERVICE INSTITUT FOR MOLEKYLÆRBIOLOGI OG GENETIK, AU]
Enzymkinetik INTRODUKTION Enzymer er biologiske katalysatorer i alle levende organismer som er essentielle for liv. Selektivt og effektivt katalyserer enzymerne kemiske reaktioner som ellers ikke ville
Læs mereVejledning i prøveudtagning Drænvandsundersøgelsen
Vejledning i prøveudtagning Drænvandsundersøgelsen 2013/14 Side 2 Præsentation af udstyr Side 3 Prøvetagning fra drænudløb Side 4 Prøvetagning fra drænbrønd Side 6 Prøvetagning fra vandløb eller afvandingskanal/-grøft
Læs merecobas KRAS Mutation Test KRAS
cobas KRAS Mutation Test TIL IN VITRO-DIAGNOSTIK. cobas DNA Sample Preparation Kit DNA SP 24 Tests P/N: 05985536190 cobas KRAS Mutation Test KRAS 24 Tests P/N: 05852170190 BEMÆRK: Købet af dette produkt
Læs mereTissue_LC_200_V7_DSP og Tissue_HC_200_V7_DSP (brugervalideret til QIAsymphony DSP DNA Mini-kit)
August 2015 QIAsymphony SP-protokolark Tissue_LC_200_V7_DSP og Tissue_HC_200_V7_DSP (brugervalideret til QIAsymphony DSP DNA Mini-kit) Dette dokument er Tissue_LC_200_V7_DSP og Tissue_HC_200_V7_DSP (brugervalideret
Læs mereFremstilling af ferrofluids
Fremstilling af ferrofluids Eksperiment 1: Fremstilling af ferrofluids - Elevvejledning Formål I dette eksperiment skal du fremstille nanopartikler af magnetit og bruge dem til at lave en magnetisk væske,
Læs mereVINTERTILBUD TILBUDDENE GÆLDER HELT FREM TIL 15.02.16
VINTERTILBUD TILBUDDENE GÆLDER HELT FREM TIL 15.02.16 LABORATORIEUDSTYR Binder BD inkubatorer Elektronisk controller APT.line Temperatur område stuetemp. +5⁰C op til 100⁰C Indvendig glasdør Binder BD 53
Læs mereOPTIMERING AF PCR MHP. DETEKTION AF SNP ER I CERS6.
OPTIMERING AF PCR MHP. DETEKTION AF SNP ER I CERS6. Bachelorprojekt Udarbejdet af Sandra Reinholt Nielsen 14.08.1981 Projektperiode: 6. April 9.juni 2009 Vejledere: Søren Jensen, Lektor, Professionshøjskolen
Læs mereSTUDERENDES ØVELSESARK TIL EKSPERIMENT B: FLYDENDE KRYSTALLER
Navn: Dato:.. STUDERENDES ØVELSESARK TIL EKSPERIMENT B: FLYDENDE KRYSTALLER MÅL: - Forstå selv-samlingskonceptet. - Forstå måden et materiale opfører sig på, på makroskala, er afhængig af dets struktur
Læs mereFaktor V Leiden mutation
Faktor V Leiden mutation Formål: finde ud af om individ har mutation i faktor V Leiden gen (missense: arginin glutamin) Materiale: oprens DNA fra leukocytter Metode: PCR med specifikke primere, oprens,
Læs mereBiologisk rensning Fjern opløst organisk stof fra vand
Spildevandscenter Avedøre Biologisk rensning Fjern opløst organisk stof fra vand Øvelse I Formål: På renseanlægget renses et mekanisk, biologisk og kemisk. I den biologiske rensning på renseanlægget benyttes
Læs mereOpskrift på Smart gele (6-10 klumper)
MODUL 7: INTRODUKTION TIL INNOVATION SMART GELE OPSKRIFT Opskrift på Smart gele (6-0 klumper) Du skal bruge: liter vand 80 g polyvinylalkohol (PVA) 5-30 ml 4 % borax vægt gryde Termometer Sølvfolie Bægerglas
Læs mereDette er en kladde til et genoptryk af Eksperimentel Genteknologi fra 1991. Ideer, rettelser og forslag modtages gerne. Kh Claudia.
Transformation af E.coli K 12 Version 3. marts 2009 (C) Claudia Girnth-Diamba og Bjørn Fahnøe Dette er en kladde til et genoptryk af Eksperimentel Genteknologi fra 1991. Ideer, rettelser og forslag modtages
Læs mereBestemmelse af celletal
Bioteknologi 2, Tema 3 Forsøg 4 Bestemmelse af celletal Mange klassiske mikrobiologiske metoder har til formål at undersøge hvor mange mikroorganismer man har i sin prøve. Det undersøger man gennem forskellige
Læs mereBrugsanvisning for SURVEYOR Scan NRAS Kit Exons 2, 3 & 4 CE IVD
1 Producent Brugsanvisning for SURVEYOR Scan NRAS Kit Exons 2, 3 & 4 CE IVD for DHPLC systemer Læs venligst denne brugsanvisning grundigt igennem, før dette produkt anvendes. Gem denne brugsanvisning til
Læs merecobas EGFR Mutation Test
cobas EGFR Mutation Test TIL IN VITRO-DIAGNOSTIK. cobas DNA Sample Preparation Kit DNA SP 24 Tests P/N: 05985536190 cobas EGFR Mutation Test EGFR 24 Tests P/N: 06471463190 BEMÆRK: Købet af dette produkt
Læs mereSpm. 1.: Hvis den totale koncentration af monomer betegnes med CT hvad er så sammenhængen mellem CT, [D] og [M]?
DNA-smeltetemperaturbestemmelse KemiF2-2008 DNA-smeltetemperaturbestemmelse Introduktion Oligonucleotider er ofte benyttet til at holde nanopartikler sammen med hinanden. Den ene enkeltstreng er kovalent
Læs mereHåndbog til QIAamp DSP DNA FFPE Tissue-kit
Februar 2017 Håndbog til QIAamp DSP DNA FFPE Tissue-kit Version 1 50 Til in vitro-diagnostisk brug 60404 QIAGEN GmbH, QIAGEN Strasse 1, 40724 Hilden, TYSKLAND R3 1062689DA Sample to Insight Håndbog til
Læs mereQIAsymphony SP protokolark
QIAsymphony SP protokolark Tissue_LC_200_V7_DSP og Tissue_HC_200_V7_DSP Generel information Til in vitro-diagnostisk brug. Disse protokoller er til oprensning af totalt DNA fra væv og formalinfikseret,
Læs mereQIAsymphony SP-protokolark
Februar 2017 QIAsymphony SP-protokolark circdna_2000_dsp_v1 og circdna_4000_dsp_v1 Dette dokument er QIAsymphony circdna_2000_dsp_v1 og circdna_4000_dsp_v1 protokolark, version 1, R1 Sample to Insight
Læs mereELISA Kvantitativ bestemmelse af human IgA i brystmælk Elevvejledning.
ELISA Kvantitativ bestemmelse af human IgA i brystmælk Elevvejledning. Professionshøjskolen University College Nordjyland Laborantafdelingen 2012 Side 1 Indledning En kvinde føder og bliver mor til sit
Læs mereMasseeksperiment Jagten på de gode bakterier Protokol: Trin for trin-guide til selve eksperimentet
Masseeksperiment 2018 Jagten på de gode bakterier Protokol: Trin for trin-guide til selve eksperimentet Protokol Trin for trin guide til selve eksperimentet Masseeksperimentet kan gennemføres i uge 38,
Læs mereEr der flere farver i sort?
Er der flere farver i sort? Hvad er kromatografi? Kromatografi benyttes inden for mange forskellige felter og forskningsområder og er en anvendelig og meget benyttet analytisk teknik. Kromatografi bruges
Læs mereVIGTIGE SIKKERHEDSFORANSTALTNINGER
ISMASKINE PRO 3000 Sikkerhed og generel beskrivelse VIGTIGE SIKKERHEDSFORANSTALTNINGER Ved brug af elektriske apparater, må der altid tages sikkerhedsforanstaltninger: 1. Læs denne vejledning omhyggeligt,
Læs mereOprensning af fructofuranosidase fra gær. Matematik. Kemi. LMFK-bladet, nr. 3, maj
Oprensning af fructofuranosidase fra gær Formål Øvelsens formål er at demonstrere, hvordan et enzym kan ekstraheres fra gær og groft oprenses via gelfiltrering. Desuden bestemmes enzymets aktivitet og
Læs mereSOP for håndtering af standardsæt blod Regionernes Bio- og GenomBank
SOP for håndtering af standardsæt blod Regionernes Bio- og GenomBank Introduktion Følgende standard operating procedure (SOP) beskriver arbejdsgangen i forbindelse med indsamling og håndteringen af blod
Læs mereOpgave 1: Lav 100% din havregrød
Opgave 1: Lav 100% din havregrød Du skal nu prøve at lave 100% din havregrød. Skal der rosiner, vaniljesukker, kardemomme eller måske æbletern i din havregrød? Vælg de krydderier, tørrede eller friske
Læs mereBrugsanvisning for SURVEYOR Scan KRAS Kit Exon 2 CE IVD
1 Producent Brugsanvisning for SURVEYOR Scan KRAS Kit Exon 2 CE IVD for DHPLC systemer Læs venligst denne brugsanvisning grundigt igennem, før dette produkt anvendes. Gem denne brugsanvisning til senere
Læs mereAnvendelse af propolis
Egenskaber ved propolis Propolis er meget lidt opløselig i vand, men bedre i alkohol. Ethanol er den mest almindelige alkohol, men også glycerol anvendes til opløsning af propolis. Propolis smelter ved
Læs mereINGENIØRENS ARBEJDSMETODE: ØV DIG I METODEN
MODUL 7: INTRODUKTION TIL INNOVATION INGENIØRENS ARBEJDSMETODE ELEVVEJLEDNING INGENIØRENS ARBEJDSMETODE: ØV DIG I METODEN I denne aktivitet skal I øve jer i at bruge ingeniørens arbejdsmetode. Øvelsen
Læs mere