Årsrapport 2014 vedrørende laboratorieundersøgelser af materiale fra kvæg på DTU Veterinærinstituttet Juli 2015
Indholdsfortegnelse 1. Indledning... 1 2. Data... 1 2.1 Materialer... 1 2.2 Geografisk fordeling af besætninger, som har indsendt materiale til DTU-Vet... 6 3. Resultater... 8 3.1 Bakteriologiske undersøgelser... 8 3.2 Parasitologiske undersøgelser... 9 3.3 Virologiske undersøgelser... 9 3.4 Histopatologiske undersøgelser... 10 3.5 Serologiske undersøgelser... 10
1. Indledning Denne rapport indeholder opgørelser af laboratorieundersøgelser for diverse sygdomme på materialer fra kvæg indsendt til DTU-veterinærinstituttet (DTU-Vet) i 2014. Indsendelserne vedrører dels kommercielle diagnostiske undersøgelser for almindeligt forekommende sygdomme og dels indsendelser som led i passiv og aktiv overvågning af nogle lovomfattede sygdomme. Det har ikke været muligt at inkludere overvågningsundersøgelser udført på private laboratorier eller på udenlandske laboratorier. Rapporten fokuserer på oprindelse og omfang af materialer, undersøgelsernes art og antal samt resultater af undersøgelserne, som primært præsenteres som tabeller og figurer. 2. Data 2.1 Materialer Tabel 1 viser antal indsendelser, prøver og undersøgelser. Indsendelser til DTU-Vet vedrører, bakteriologiske, parasitologiske, virologiske, histo-patologiske, og serologiske undersøgelser. Tabel 1. indsendelser, prøver og undersøgelser indsendelser 2 619 prøver 10 385 undersøgelser 22 504 prøver per indsendelse 1 3 (1-85) 1 1 Median (5-95 percentiler) 1
prøver indsendelser Figur 1: indsendelser i løbet af 2014 Figur 2: prøver i løbet af 2014 2
undersøgelser Figur 3: undersøgelser i løbet af 2014 Figurer 4 og 5: Type og oprindelse af indsendelserne 3
Figur 6: indsendelser til DTU Vet fordelt på forskellige anledninger Tabel 2: prøver fordelt på forskellige materialer indsendt til DTU-Vet prøver Blod Fæces Organer Mælk Næsesvaber Kadaver Aborterede fostre 9189 556 227 111 16 5 120 Figur 7: Andel af forskellige materialer indsendt til DTU-Vet 92% 8% 4% 3% 1% Blod Fæces Organer Mælk NæseSvaber Kadaver 4
Størstedelen af prøvemateriale til DTU-Vet er blodprøver til serologiske undersøgelser, efterfulgt af fæces til undersøgelse for bakterier og parasitter (Tabel 2) Figur 8: af indsendelser fra forskellige besætningstyper 5
2.2 Geografisk fordeling af besætninger, som har indsendt materiale til DTU-Vet Figur 9. Placering af aktive kvægbesætninger i Danmark i 2014. Røde besætninger indsendte prøver til DTU-Vet og grå besætninger indsendte ikke prøver til DTU-Vet. 6
Figure 10. Analyse af kvægbesætningers placering i forhold til indsendelse af prøver til DTU-Vet. kvægbesætninger som indsendte prøver til DTU-Vet (Røde) og aktive kvægbesætninger i hele landet (grå) i 2014. Fra Sydjylland (markeret med rød cirkel) var der indsendelser fra signifikant flere besætninger i forhold til total antal besætninger i området end fra resten af landet og fra Midt- og Nordjylland (markeret med lyseblå cirkler) var der indsendelser fra signifikant færre besætninger end fra resten af landet. 7
3. Resultater 3.1 Bakteriologiske undersøgelser Tabel 3: indsendelser til nogle specifikke bakteriologiske undersøgelser Patogen indsendelser positive Salmonella 99 14 Mycoplasma bovis 17 3 Campylobacter fetus 78 0 Tabel 4: indsendelser med forskellige fund af patogene bakterier i materiale fra 121 aborterede fostre Pathogen positive prøver Bacillus licheniformis 4 Brucella spp. 0 Listeria monocytogenes 3 Non-hæmolytiske E. coli 12 Staphylococcus spp. 2 Streptococcus uberis 3 Andet inkl. negative 97 Tabel 5: fæcesprøver med E. coli, F5+ (k99+) og F5- (k99-). Non-hæmolytiske E. coli positive prøver F5+ 7 F5-76 Total 83 Tabel 6: Typebestemmelse af Salmonella fund Type 4,12:i:- 5 Salmonella dublin 5 Salmonella typhimurium 3 Salmonella havana 1 Andre typer 10 8
Protozoer Trematoder Nematoder 3.2 Parasitologiske undersøgelser Tabel 7: prøver med fund af forskellige parasitter Parasit Capillariaæg (hårorm) 1 Dictyocaulus larver (lungeorm) 2 Nematodirus battus æg (tarmorm) 1 Nematodirusæg (tarmorm) 9 Strongylideæg 48 Strongyloidesæg (trådorm) 9 Toxocara æg (spolorm) 1 Trichuris æg 10 Fasciola hepatica (den store leverikte) 2 Fasciola æg (leverikte) 13 Babesia divergens 2 Cryptosporidium 43 Oocyster Eimeria 93 Isospora 2 3.3 Virologiske undersøgelser Tabel 8: indsendelser til undersøgelse for virus Patogen Bovin virusdiarré virus (BVDV) Undersøgelse ved cellekulturteknik indsendelser positive 258 0 Bovin virusdiarre virus (BVDV) RT-PCR 65 14 Infektiøs bovin rhinotracheitis virus (IBR) RT-PCR 5 0 Bovin respiratorisk syncytial virus (BRSV) 25 8 Bovin coronavirus 79 4 Rotavirus 62 36 Bluetongue virus RT-PCR 51 0 Mund- og klovesyge virus (MKSV) RT- PCR 8 0 Schmallenberg virus (SBV) RT-PCR 15 0 9
IBR Q-Fever BVDV BLV Brucella BTV 3.4 Histopatologiske undersøgelser Tabel 9: prøver til histopatologiske undersøgelser Analyse Histologisk undersøgelse, Undersøgelse ved in situ hybridisering (FISH) 1 En prøve var fostervæske og derfor ikke inkluderet her prøver Abort kvæg 120 1 Andet materiale 22 Q-feber 9 Andre agens 4 3.5 Serologiske undersøgelser Tabel 10: serologiske undersøgelser Analyse Bluetongue virus (Antistof-test ved ELISA) undersø -gelser positive % Pos Testkit 270 22 1 8,1 In-house 628 3 1 0,5 Brucella (abortus/suis/meliten sis) Bovin Leukose virus Antistof-test ved agglutination SAT 1311 2 2 0,2 RBT 9 0 0 Antistof-test ved CF 137 0 0 Antistof-test ved indirekte ELISA Antistof-test ved ELISA 1373 0 0 70 0 0 Antistof-test ved ELISA 2459 59 2,4 Undersøgelse ved antigen-elisa 360 5 1,4 Coxiella burnetii - Antistof-test ved ELISA på blod 177 5 2,8 på mælk 26 13 50 Antistof-test ved ELISA 2109 0 0 Neutralisationstest 2 0 0 10
SBV Salmonella Mycobac. M. bovis Leptospira L. hardjo / interrogans Antist of-test ved MAT Diagnost. (titer: <50) Eksport (titer: <100) 103 0 0 89 0 0 L. canicola 145 0 0 L. grippotyphosa 145 0 0 L. hebdomadis Antistof-test ved MAT 133 0 0 L.icterohaemorrhagica 147 0 0 L. pomona 145 0 0 Mycoplasma bovis, bestemmelse af antistoffer ved indirekte ELISA 1097 377 34,4 Mycobacterium paratuberculosis (Para-tb) - Antistof-test ved absorberet ELISA 1001 32 3,2 Salmonella Antistof-test ved ELISA 157 19 14,7 Salmonella Dublin Antistof-test ved ELISA 2962 243 8,3 antistof-elisa 383 32 8,4 Schmallenberg virus (VN), 5 prøver eller derover 464 0 0 1 Vaccinerede dyr eller mistanker afkræftet ved PCR 2 Positive reagenter fundet negative for brucellose ved opfølgende undersøgelser 11