Litteratursøgning i PubMed

Transkript

1 Litteratursøgning i PubMed 1

2 En introduktion til PubMed PubMed er National Library of Medicine s webadgang til Medline, produceret i samarbejde med tidsskriftudgiverne. Tidsskriftudgiverne leverer data elektronisk til databasen allerede før papirudgaven af tidsskriftet foreligger. Opdateres dagligt [PubMed as supplied by publisher] Gennemgår emneindekseringsproces [PubMed - in process] Overgår til selve Medline [PubMed - indexed for MEDLINE] Forsynes med links til related articles. De opstilles ikke kronologisk, men i relevans-orden ( ranking ) efter hvor meget de har til fælles med den udvalgte artikel. Evt. links til tidsskriftets egen hjemmeside, som evt. kan give fuldtekstadgang Evt. links til bøger. Søgning Man kan anvende fritekst (PubMed vil forsøge at oversætte fritekst til MeSH-terminologi) frasesøgning (fast ordforbindelse ofte i ) trunkering søgning på ordstammer med brug af * MeSH-headings og subheadings (kontrollerede emneord) Avanceret søgning ved brug af de Booleske operatorer (AND, OR, NOT) forfattersøgning 2 - eller kombinationer heraf. Man kan præcisere søgningen ved brug af følgende funktioner Filtre/Limits Advanced search

3 Simpel søgning (fritekstsøgning) 1. Gå til søgefeltet 2. Skriv vitamin c common cold 3. Klik på Search. 3 PubMed forsøger at oversætte fritekstord til MeSH. I Search details vises, hvordan systemet har foretaget søgningen. Frasesøgning I PubMed er det muligt at søge på fraser (sammenhørende ord) ved at bruge citationstegn, eks. vitamin C NB: brug af citationstegn sætter automatisk oversættelse til MeSH-termer ud af funktion! Hvis man søger på vitamin C findes kun de referencer, hvor vitamin C optræder som sammenhørende ord. Der oversættes ikke til ascorbic acid, og man mister derfor en række relevante referencer.

4 Søgning ved hjælp af thesaurus Man kan bruge MeSH (Medical Subject Headings) NLM s kontrollerede emneordsliste til at finde egnede søgetermer. Ved at bruge MeSH-termer slipper man for at søge på synonymer til emneord og man har mulighed for at lave mere specifikke søgninger. Til MeSH-termerne er knyttet et antal subheadings for at angive særlige aspekter ved MeSH-termen. F.eks. adverse effects, diagnosis eller surgery etc. 1. Vælg MeSH i drop-down menuen ud for søgefeltet 2. Skriv common cold i søgefeltet 3. Klik på common cold i listen med foreslåede MeSH-termer 4. Markér prevention and control i listen over subheadings, for at begrænse søgningen til artikler, der handler om forebyggelse og kontrol af forkølelse 5. Klik på Add to search builder og derefter Search PubMed 4 Gentag proceduren med en søgning på Vitamin C.

5 Advanced Search Builder History Klik på Advanced og brug søgningerne i søgehistorien, History, til at kombinere søgesættene. Kombiner søgningen på Common cold/prevention and control med søgningen på Ascorbic Acid med AND ved at kombinere søgesætnumrene i det viste eksempel #4 AND #8 5

6 Advanced Search Builder Fra Advanced Search Builder har du mulighed for at vælge specifikke søgefelter. Brug fx funktionen til at finde Cochrane Reviews.: Vælg Journal fra listen og skriv Cochrane. Vælg Cochrane database of systematic reviews (online) og kombiner med din søgning 6 Eller hvis du vil søge på en forfatter:

7 Limitfunktionen Filters Bruges til at begrænse søgningen med foruddefinerede filtre, f.eks. bestemte sprog, årstal eller dokumenttyper. Nogle filtre vises som standard. Andre kan vælges i Show additional filters. Klik på ønskede filter for at begrænse søgningen. 7 Husk at slå limitfunktionen fra inden du starter en ny søgning.

8 Find relaterede artikler eller hurtig genfinding af kendt artikel 1. Under PubMed Tools vælges Single Citation Matcher 2. Indtast så mange oplysninger du kan om den pågældende artikel. Eksempelvis Journal, Date, First page 8 3. Klik på Go

9 Når referencen er fundet vises den i Abstract format, hvor de fem mest relaterede artikler er vist til højre i skærmbilledet. Klik på See All for at se alle lignende artikler. For at få en adgang til en PDF af artiklen klikkes i forlags-ikonet i højre side (hvis der er et ellers kan tidsskriftet søges i DEff alternativt bestilles artiklen i Fagbiblioteket) 9

10 Gem en søgning i My NCBI For at gemme en søgning skal man først have registreret en My NCBI account. Klik på MyNCBI i øverste højre hjørne. Vælg Register for an account og følg vejledningen på skærmen for at oprette en account. 10

11 Gå til History under Advanced Placér musen på den søgning du ønsker at gemme Klik på venstre musetast Klik på Save in My NCBI 11 Du har nu mulighed for at vælge om du selv vil opdatere din søgning eller om du vil have en e-alert når der er kommet nye poster til.

12 Clipboard Du kan udvælge enkelte artikler og føje dem til dit Clipboard 12

13 Når du åbner dit Clipboard kan du igen sende udvalgte artikler videre fx til Collections (hvis du har oprettet en profil i My NCBI) eller sende dem i en fx til bibliotekaren (husk at skrive dit navn, afdeling og sygehus i feltet Additional text) 13 Bemærk at alle artikler får tildelt en PubMedID, der giver mulighed for hurtig genfinding af den enkelte artikel:

14 Øvelser 1. Brug MeSH Database til at udforske dit eget felt. 2. Brug MeSH Database til at finde artikler om transcutaneous nerve stimulation. 3. Find artikler om livskvalitet hos patienter med fibromyalgi. Begræns din søgning til engelsksprogede artikler de seneste 10 år 4. Find denne artikel: Leuk Res 2013, Feb; 37(2): Chronic inflammation as a promotor of mutagenesis in essential thrombocythemia, polycythemia vera and myelofibrosis. A human inflammation model for cancer development? 14 Hasselbalch HC 5. Vis artiklen i abstract-format. Er der fuldtekstadgang til artiklen? 6. Hvis du har tid: Opret en konto i My NCBI Gem evt. en af dine søgninger i My NCBI - Vælg at du vil modtage med nye referencer fra din søgning hver uge