Information om nyt indeks for HD Schæferhundeklubben Kevin Byskov Dansk Kvæg Team for avlsværdivurdering

Størrelse: px

Starte visningen fra side:

Download "Information om nyt indeks for HD Schæferhundeklubben 2010. Kevin Byskov Dansk Kvæg Team for avlsværdivurdering"

Bodil Iversen
8 år siden
Visninger:

1 Information om nyt indeks for HD Schæferhundeklubben 2010 Kevin Byskov Dansk Kvæg Team for avlsværdivurdering

2 Disposition Grundlæggende forskelle på ny og gammel model Teoretisk del Aktuelle data Præsentation af data Editering af data Præsentation af model & systematiske effekter hvor meget betyder disse? Ændringer mellem nyt og gammelt HD-indeks

3 BLUP Animal model - Fordele i forhold til nuværende metode 1. Det antages IKKE, at parringer foretages tilfældigt i populationen 2. Tager hensyn til alt kendt slægtskab i data 3. Simultan estimering af systematiske effekter

4 HD-resultatet påvirkes af flere faktorer Arv Fotoudstyr og bedømmer Køn Alder Tilfældig -heder Motion Fodring Fysiske Opvækst -forhold

5 Hvad skyldes forskelle mellem hunde Systematiske forskelle Tilfældige forskelle Arvelige Forskelle

6 Bridag til avlsværidtal Egen præstation Forældre (og indirekte øvrige slægtninge) Afkom

7 Derfor Gode registreringer er forudsætning for sikre avlsværdital Registrering er kun i nogen grad udtryk for avlsmæssig niveau Avlsværditallet er det bedste bud på det reelle avlsmæssige niveau

8 Aktuelle Data

9 Præsentation af data Datasæt for HD og afstamning med følgende variable: Hundens ID og registreringsnummer Race Registreringsdato for HD (Foto-dato) Fødselsdato Køn Kuld Mor ID Far ID HD-score } Alder ved HD og År

10 Fiktive fødselsdatoer Hunde med HD-test og ukendt fødselsdato får beregnet en fiktiv fødselsdato som følger: Hunden antages at være født 1½ år før ældste registrerede afkom. Hvis fiktivfødselsdato er senere end evt. bedømmelsesdato 365 dage, sættes fiktiv dato til bedømmelsesdato 365 dage. Denne procedure gennemføres for max 20 generationer. Fra hunde som fortsat har ukendt fødselsdato slettes HD-test fra beregningerne

11 Præsentation af data - Redigering af HD-datasæt for februarkørsel 2010 Andel observationer i datasæt Redigering efter redigering Schæferhund Hunde i råt datasæt Hunde med HD-test før 1986 slettes Hunde med ukendt (fiktiv) fødselsdato slettes Hunde født før 1986 med ukendt dato for HD-test slettes Hunde HD-testet inden for 1. leveår slettes

12 Model og systematiske effekter

13 Model HD ijklm = KØN i + ÅR j + ALDER k + hund l + kuld m + e ijklm Hvor; KØN = ÅR = fixed effekt med 2 klasser (tæve el. han) fixed effekt af årstallet for HD-test med 26 klasser. Én klasse for hvert årstal i perioden samt én klasse for hunde med ukendt dato for HD-test ALDER= fixed effekt med 7 klasser (1,0; 1,1; 1,2; 1,4; 1,6; 1,8; 2,0) hund = Kuld = e = den additive genetiske effekt effekten af kuldet hunden tilhører, og residualen

14 HD-resultatet påvirkes af flere faktorer Arv ÅR Fotoudstyr og bedømmer KØN Køn hund Tilfældig -heder Motion Fodring Alder Fysiske Opvækst -forhold ALDER

15 Effekt af ÅR (bedømmelses-år) 0,2 0,2 0-0,2-0,4-0,6-0,8 Ruhåret Hønsehund Golden Retriever Labrador Retriever Ruhåret Hønsehund Schæferhund Golden Retriever ukendt HD-dato Labrador Ruh.Hønsehund Retriever ukendt HD-dato Schæferhund G. Retriever ukendt HD-dato L. retriever ukendt HD-dato Schæferhund -1-1 Bedømmelsesår

16 Importerede hunde 3. Den udenlandske skala for HD, ser ud til at være forskudt i forhold til den danske udenlandske hunde fejlestimeres, hvis der ikke korrigeres herfor Kontrol af denne korrektion ved at beregne avlsværdital for disse hunde hhv. med og uden egen HD-information Labrador Schæfer antal gns. indeks antal gns. indeks Egen HD + afkom 100,2 94, Kun afkom 99,3 94,8

17 Effekt af ALDER 0,1 0-0,1-0,2-0,3 Ruhåret hønsehund Golden Retriever Labrador Retriever Schæferhund -0,4-0,5 1 1,1 1,2 1,3 1,4 1,5 1,6 1,7 1,8 1,9 2 Alder i år

18 Effekt af tæve - effekt af han Effekt af køn 0,1 0,09 0,08 0,07 0,06 0,05 0,04 0,03 0,02 0,01 0 Ruhåret hønsehund Golden Retriever Labrador Retriever Schæferhund

19 Kuldeffekt For Alder, År og Køn er der altid mindst 20 observationer pr. klasse. Kuldeffekten estimeres lidt anderledes end de øvrige effekter på grund af få observationer. Jo færre observationer til at estimere effekten for et kuld, jo tætter trækkes estimatet ind mod gennemsnit

20 Eksempel systematiske effekter To Schæferhunde Hund1 Hund2 Køn Tæve Han Alder ved bedømmelse 2 år 3 mdr 1 år 0 mdr Bedømmelsesår Bedømmelse B A Forskel i HD-point 0,084 0,379-0,143

21 Eksempel systematiske effekter To Schæferhunde Hund1 Hund2 (Standard) Egen bedømmelse 2 1 Køn -0,084 - Alder ved bedømmelse -0,379 - Bedømmelsesår -(-0,143) - Korrigeret bedømmelse 1,680 1,000

22 Ændringer i hundenes indekser ved overgang til nyt HD-indeks

23 Nye avlsværdital Hvor store ændringer ses i forhold til gamle avlsværdital Sammenhæng mellem nyt og gammelt avlsværdital Eksempler på hunde med stor ændringer Hvorfor har de fået det aktuelle indeks? Tilsendte spørgsmål

24 Generelle ændringer Indekserne offentliggøres på en rullende base. Basen for det nye indeks består af hunde, som på beregningstidspunktet er 1-11 år gamle og har egen HD-test. OBS kun hunde med kendt fødselsdato. For det gamle indeks var det ikke klart, hvilke hunde, som udgjorde basen. Basedefinitionen har betydet at alle schæferhunde som gennemsnit er faldet ca. 10 indeksenheder.

25 HD indeks Generelle ændringer 120,000 Schæferhund 115, , , ,000 95,000 Gl. indeks Nyt indeks 90,000 85,000 80,000 Fødselsår

26 Korrelation mellem nyt og gl. indeks 1,00 0,90 0,80 0,70 0,60 0,50 0,40 0,30 0,20 0,10 0,00 Fødselsår

27 Nyt HD-indeks Sammenhæng mellem nyt og gl. indeks ukendt fødselsdato født født Gl. HD-indeks

28 Korrelation mellem nyt og gl. indeks Korrelationer mellem nyt og gammelt indeks ligger i det forventede leje ved overgang til Animal-model (AM). (erfaring fra kvæg) AM tager bedre højde for slægtskab mellem dyrene end den gamle model og foretager simultan korrektion for miljøeffekter Fixed effekter i ny model beskriver noget af variationen i datasættet. Forskelle i basedefinition vil ikke ændre rangeringen af hundene indbyrdes. Det vil dog betyde at nogle kombinationer af han og tæve ikke længere kan anvendes, hvis der er et krav om minimum 100 til afkom.

29 Hunde med store ændringer Gl. HD-indeks 131 Nyt HD-indeks 84 Afkom A: 4 B: 1 C:1 D: 0 E: 0 Afkoms afkom A: 12 B: 19 C: 7 D: 9 E: 6

30 Hunde med store ændringer Gl. HD-indeks 136 Nyt HD-indeks 90 Afkom A: 8 B: 2 C:0 D: 1 E: 0 Afkoms afkom A: 3 B: 1 C: 2 D: 3 E: 3

31 Hunde med store ændringer Gl. HD-indeks 132 Nyt HD-indeks 91 Afkom A: 36 B: 25 C:3 D: 0 E: 2 Afkoms afkom A: 154 B: 107 C: 43 D: 32 E: 14

32 Hunde med store ændringer Gl. HD-indeks 85 Nyt HD-indeks 104 Afkom A: 7 B: 25 C:6 D: 2 E: 2 Afkoms afkom A: 11 B: 7 C: 1 D: 4 E: 1

33 Spørgsmål Jeg har i hundeweb fundet 2 tyske kuldbrødre (SZ Dux de Intercanina / SZ Dax de Intercanina) som for mig ser "ens" ud: de er født samme dag de har samme forældre (med samme reg.nr.) de er begge registreret med HD-status (A) - selvom Dax har HD-status (B) de har henholdsvis 1 og 2 kuld i DK de har begge ingen hvalpe over 1 år (med HDbedømmelse). men de har alligevel forskellige HD-indeks (111 / 106)?

34 Svar Alle de givne oplysninger er korrekte, men der er én forskel på de 2 hunde: Dax har ukendt HD-foto dato Dux er HD-fotograferet Dux kan korrigeres for alder og bedømmelsesår mens Dax korrigeres for at have et udenlandsk HD-resultat.

35 Spørgsmål Jeg har i hundeweb fundet 2 tyske kuldbrødre (SZ Vanos van Noort / SZ Vegas van Noort) som for mig ser "ens" ud: de er født samme dag de har samme forældre (med samme reg.nr.) de har begge HD-status (A) de har begge 4 kuld i DK de har begge ingen hvalpe over 1 år (med HDbedømmelse). men de har alligevel forskellige HD-indeks (104 / 97)?

36 Svar Hundene står ikke til at have samme mor i afstamningsfilen og opfattes derfor kun som halvbrødre Vanos mor er LOF /45533 Vegas mor er SZ Vi er bekendte med at der kan være problemer med entydig identifikation.

37 Spørgsmål Min tæve, er født med et index på 100, fordi det er gennemsnittet af forældrenes index? Ja Hvad bliver hendes index når hun opnår HDstatus A, B, C, D, eller E? Det kommer an på hvor mange informationer der er bagud Hvis der er HD-test kun på mor + far + bedsteforældre vil egeninformation vægte ca. 40 % af samlet vægte ved h 2 = 0,25 A = ca. 110 B = ca. 100 E = ca. 70

38 Spørgsmål Hvilken effekt har hendes HD-status på forældrenes, og bedsteforældrenes HD-index? Forældre: A = ca. 4 C = ca. -4 E = ca. -12 Bedsteforældre:A = ca. 1,7 C = ca. -1,7 E = ca. -5,1 Halvsøster uden egeninformation: A = ca. 2 C = ca. -2 E = ca. -6 Halvsøster med egeninformation: A = ca. 1,5 C = ca. -1,5 E = ca. -4,5

39 Spørgsmål Hvilken indflydelse har hendes fars HD-status, når han er Tysker og bedømt i Tyskland? Han får beregnet en fiktiv fødselsdato og indgår i beregningerne som en hver anden far, og han vil blive korrigeret i forhold til den gruppe han er i Hvad effekt vil denne nye HD-indexberegning få, på schæferhundehundeavlen i Danmark Som følge af en bedre metode, der udnytter informationerne i data bedre, vil det blive nemmere at udvælge de bedste hunde for HD

40 Opsumering Ændringer skyldes primært: Forskelle i data indregnet i indekset Mere slægtskab Systematiske effekter i modellen

41 Husk! HD-indekset er et redskab som I har mulighed for at anvende. En hund er mere end et sæt hofter!

Relaterede dokumenter

Indeks for HD BLUP - AM

Indeks for HD BLUP - AM Indeks for HD Per Madsen Seniorforsker Aarhus Universitet Det Jordbrugsvidenskabelige Fakultet Institut for Genetikk og Bioteknologi Forskningscenteret Foulum, Danmark Hofteledsdysplasi (HD) er en lidelse,