NAV avlsværdital for Holdbarhed Jørn Pedersen og Anders Fogh

Transkript

1 NAV avlsværdital for Holdbarhed Jørn Pedersen og Anders Fogh Projektgruppen Jørn Pedersen Jan-Åke Eriksson, Minna Toivonen, Jukka Pösö Ulrik S. Nielsen og Gert P. Aamand

2 Oversigt NAV-holdbarhedsprojektet Hvilke data indgår og hvordan Model, heritabiliteter, genetiske korrelationer Resultater, ændringer Base Udvikling over tid (trends) Korrelationer mellem det gamle og nye indeks Relation til andre egenskaber Værdi i NTM 2

3 Tidligere anvendte holdbarhedsmodeller DNK, FIN: Funktionel holdbarhed = ydelseskorrigeret Overlevelsesmodel ( Survival KIT ) SWE: Produktiv holdbarhed = ikke korrigeret for ydelse Lineær model med 3 egenskaber: Overlevelse til 2. laktation enten-eller egenskab Overlevelse til 3. laktation enten-eller egenskab Overlevelse til 4. laktation enten-eller egenskab 3

4 4 Projektgruppens opgaver Formål: Udvikling af NAV avlsværdital for holdbarhed 3 race grupper: RDC, HOL(+DRH), JER Ens model for alle 3 lande Ens genetiske parametre for alle 3 lande Produktiv holdbarhed dvs. ukorrigeret for ydelse

5 Opgaver i projektet Definition af egenskaben (projektgruppen) Model Beregning af genetiske parametre Heritabiliteter genetiske og miljømæssige korrelationer Analyser Rekursiv - proces 5

6 Holdbarhedsegenskaber DAGE11: Dage fra 1. kælving til slutningen af 1. laktation (informationsegenskab) DAGE12: Dage fra 1. kælving til slutningen af 2. laktation (informationsegenskab) DAGE13: Dage fra 1. kælving til slutningen af 3. laktation (avlsværdi) DAGE14: Dage fra 1. kælving til slutningen af 4. laktation (informationsegenskab) DAGE15: Dage fra 1. kælving til slutningen af 5. laktation (informationsegenskab) Maximalt 365 dage per laktation er inkluderet 365 dage per laktation, hvis koen overlever til næste laktation (dvs. ingen straf for god frugtbarhed) DAGE13 er den avlsværdi, som bliver omregnet til et indeks og bliver publiceret 6

7 Edit of data Oplysninger om kælvninger og afgange kombineres Kun 1. til 5. laktation anvendes Køer, der indgår, har kælvet efter for DNK og SWE - og efter for FIN Alle køer skal starte med en 1. kælvning Alle kælvninger/laktationer, som indgår skal være fra samme besætning Efter besætningsskift anses observationerne for at være manglende (det der er i orden slettes ikke) Alder ved 1. kælvning skal ligge mellem 450 og 1280 dage Køer med ukendt fødselsdato indgår ikke 7

8 Opportunity perioder Eksempel: Hvis en ko afgår efter 20 dage i en laktation indgår oplysningen IKKE før den har haft mulighed for at leve 365 dage Opportunity perioder DAGE11: Oplysning anvendes først 365 dage efter 1. kælvning DAGE12: Oplysning anvendes først 365 dage efter 2. kælvning DAGE13: Oplysning anvendes først 365 dage efter 3. kælvning DAGE14: Oplysning anvendes først 365 dage efter 4. kælvning DAGE15: Oplysning anvendes først 365 dage efter 5. kælvning Vigtig oplysning: Dato for dataudtræk Dato for besætningsophør (dato for sidst kendte 1. kælvning) 8

9 Gennemsnit for HOL, RDM og JER med1. kælvning DAGE11 DAGE12 DAGE13 DAGE14 DAGE15 HOL RDM JER Minimum Maksimum

10 Animal Model Multi-trait med 5 egenskaber Effekter i modellen Alder ved 1. kælvning Kælvningssæson (år x måned - 1. kælvning) Besætning x 5 års periode (år for 1. kælvning) Heterosiseffekter (mange hos RDM/RDC) Genetiske grupper modelleret som fantom forældre (race x tid) Besætning x 1. kælvningsår (tilfældig) Ko (tilfældig genetisk effekt) 10

11 Genetiske parametre Heritabiliteter DAGE11 DAGE12 DAGE13 DAGE14 DAGE15 HOL RDM JER

12 Holstein genetiske korrelationer RDM og JER: Næsten samme resultater DAGE11 DAGE12 DAGE13 DAGE14 DAGE15 DAGE DAGE DAGE DAGE DAGE15 12

13 Oversigt hvor er vi nået til NAV-holdbarhedsprojektet Hvilke data indgår og hvordan Model, heritabiliteter, genetiske korrelationer Resultater, ændringer Base: Generel ændring tidsuafhængig Trends: Generel ændring tidsafhængig Korrelationer: Individuelle ændringer Relation til andre egenskaber Værdi i NTM 13

14 Base ændringer Tidligere: Tyre født August 2010: Køer født Skyldes IKKE den nye model Base ændring Virkning I NTM HOL RDM JER

15 Holstein udvikling i holdbarhedsindeks 15

16 RDM udvikling i holdbarhedsindeks

17 Jersey udvikling i holdbarhedsindeks 17

18 Korrelationer mellem det gamle og det nye holdbarhedsindeks pr. år Tyre født HOL RDC JER DNK FIN SWE

19 19

20 Korrelationer pr. årgang: Individuelle ændringer Hvorfor så lave korrelationer? FIN, DNK: Ikke ydelseskorrigeret holdbarhed Lineær model versus overlevelse tidlig afgang lidt tæller mere SWE: Dage baseret versus enten-eller Dage baseret mod laktationsbaseret (den gamle svenske model havde stor sammenhæng med frugtbarhed) Lidt lavere korrelationer i DNK - end i FIN og SWE Mange faktorer ikke en enkelt afgørende faktor 20

21 RDC: Korrelationer med andre indekser Gns. pr. år i perioden Ydelse Frugtbarhed Yver Sundh. Andre sygd. Krop Lemmer Malke org. DNK Gl Nyt FIN Gl Nyt SWE Gl Nyt

22 Korrelationer mellem ny holdbarhed og andre egenskaber Tyre født Ydelse Frugtbarhed Yversundhed Andre sygdomme Krop Lemmer Malkeorganer HOL RDM JER

23 Standardisering af variation Tyre født Dage indeholdt i 1 indeksenhed RDC HOL JER DAGE DAGE DAGE DAGE DAGE

24 Værdi af holdbarhedindeks i NTM Basal økonomisk værdi er ikke påvirket (kr./dag) Hvordan kan en ændret metode ændrer værdi/vægt: Ændret definition af egenskaben: Principielt uændret Ændret indhold af en indeksenhed (standardisering af variationen) Specielt for holdbarhed: Overførslen af værdi til Yversundhed, Andre sygdomme, Frugtbarhed, Malkeorganer og Lemmer&klove Beslutning: Uændret vægtning (0.11, 0.08, 0.12 for HOL+DRH, RDM og JER) 24

25 Afslutning: NAV-holdbarhed Ny fælles model er udviklet Baseændring skyldes IKKE den nye model Store ændringer i genetisk fremgang Lidt store individuelle ændringer Fremtidsplaner Evt. overlevelsesmodel 25

26 Anerkendelse Det Europæiske Fællesskab og Fødevareministeriet ved Direktoratet for FødevareErhverv har deltaget i finansieringen af denne aktivitet.