Nyhedsbrev Nr December 2015

Transkript

1 Nyhedsbrev Nr December 2015 Redaktion: Marianne Nielsine Skov [email protected], Michael Kemp: [email protected], Janne Kudsk Klitgaard: [email protected], Lone R. Ejrnæs (Redaktør): [email protected] Nyhedsbrev nr. 3 fra forskningsenheden for Klinisk Mikrobiologi Kvartalets forsker Seniorforsker, Thomas Emil Andersen er molekylærbiolog og startede for godt 10 år siden på KMA som ph.d.-studerende. Efter et post.doc-forløb er han nu ansat som seniorforsker. Gennem et netværk på OUH/SDU og i virksomheder har Thomas igangsat forskellige tværfaglige projekter, herunder et større Innovationsfondsprojekt hvor tre hospitalsafdelinger og to virksomheder udvikler nye antimikrobielle katetre. Herudover forsøger Thomas gruppe at finde svar på grundvidenskabelige spørgsmål, bl.a. hvorfor urinvejsinfektion ofte vender tilbage, hvordan S. aureus spreder sig i kroppen og hvorfor shigatoxin-producerende E. coli giver så svære komplikationer hos visse patienter. Forskningen i Thomas' gruppe er finansieret af offentlige og private fonde, herunder Innovationsfonden, Lundbeck samt OUH og Region Syddanmarks forskningsfonde.

2 Personale Kort præsentation af nye medarbejdere og andre, der får tilknytning til forskningsenheden. Velkommen til: Farvel til: Overlæge Ulrik Stenz Justesen, der har fået en overlægestilling på Rigshospitalet. Ulrik har orlov fra sin stilling på OUH, så vi har lov at håbe på en tilbagevenden. Nyt om projekter Spændende nyt, sjove/vigtige observationer, oplæg til diskussioner, spørgsmål, o.l. Dagbog fra en flåt konference: 14th International Conference on Lyme Borreliosis and other Tick-Borne Diseases. Af Nanna Skaarup Andersen Det er første gang jeg skal på en dedikeret flåtkonference uden for Scandinavien. Jeg glæder mig. Mange af de andre konferencer jeg har deltaget i har måske haft en enkelt session med vektorbårne infektioner. Alle de store inden for feltet i Europa og USA kommer. Mon man må tage en selfie sammen med selveste Allan Steere, Ed Shapiro eller måske Franc Strle? Dag 1: Vi er 3 fra OUH på konference. Fredrikke Knudtzen, Sigurdur Skarphedinsson fra afd Q og så mig. Vi er repræsentanter for Klinisk Center for Vektorbårne Infektioner der blev etableret sidste år på OUH hvor meningen er at vi særligt skal blive klogere på neuroborreliose, men også andre flåtoverførte infektioner hos patienterne, da de ofte har et mere langstrakt sygdomsforløb, end man tidligere har troet. Desuden deltager Ram Dessau fra KMA Slagelse som også er arrangør og taler samt Klaus Hansen Neurolog fra Rigshospitalet er taler. Så er der et lille Dansk medicotek firma der kigger på T-celle respons hos neuroborrelia pt. der også er med 3 repræsentanter. Vi er så heldige at de har været længe om at komme med programmet så vi blev nødt til at bestille fly til dagen før konferencen. Det viste sig at konferencen først startede kl så vi have en hel dag i Wien, inden det faglige gik løs. Vi fik set Hundertwasser House, Belvedere hvor de tilfældigvis udstillede Klimt, Domkirche St. Stephan og gået godt 20 km hvilket var tiltrængt da vi mest spiste kage drak kaffe den dag. Opening lecture var af Allen C. Steere, Boston, MA, USA med titlen Lyme arthritis: forty years after its discovery. Herefter var der en piano recital; Pawel Markowicz, Vienna, AT. Det skulle jo være klassisk når nu vi var i Wien. Dag 2: Den første dag det rigtig går løs. Konferencen er på et fint Østrigsk Hotel med krystallysekroner i loftet og en teatersal hvor sessionerne foregår. Dagen stod primært på biologi og epidimeologi af Borrelia inkl. Borrelia af Relapsing fever gruppen. Der er oplæg om morgenen og eftermiddag og Poster-Walks mellem Både Fredrikke og jeg er på denne dag. Fredrikke præsentere foreløbige resultater af gennemgangen af 20 års neuroborreliose pt. i DK: 20 Years of Neuroborreliosis in a High Endemic Area in Denmark. Jeg præsenterer et projekt om Anaplasma i får: Seroprevalence of Anaplasma phagocytophilum in Danish Sheep. Det gik rigtig fint bortset fra at man stort set ikke kunne høre hvad der blev sagt selvom man kun stod 2 m væk. Om aftenen fandt vi den bedste Thailandske resturent og en hyggelig vin bar hvor vi brugte nogle timer på at diskuterer faglige emner omkring fremtidige forskningsprojekter - selvfølgeligt. Det blev lidt sent

3 Dag 3: Puha Det var svært at stå op da væggeuret ringede kl. 7.30, men heldigvis lokkede hotellets morgenmadsbuffet og ikke mindst kaffen. Formiddagen stod igen på lektioner denne gang Borrelia fra et klinisk aspekter af Lyme borreliose her primært artrit som er det største problem i USA og så neuroborreliose som er det største problem i Europa om eftermiddagen handlede det om laboratorie diagnostik og behandling. I pausen mellem Sessionerne havde vi lavet en aftale med Afdelingen for Virologi på Wiens medicinske Universitet hos Prof. Franz X. Heinz og Prof. Karian Stiasny som er dem der laver neutralisationstest (NT-test) for TBE-virus komplekset i mine rådyrprøver. Det blev til en rigtig god snak om udbredelse af TBE, nye spots for TBE og hvordan vi finder dem, krydsreaktion i NT-testning, mulige nye samarbejdsområder og lignende. Vi måtte desværre ikke se faciliteterne, da de fungerer som reference center for flavivirus og derfor er der risiko for Bio-terror. Vi nåede tilbage tidsnok til at deltage i sidste session. Derefter tog vi tilbage på hotellet og nåede lige at slappe af en halv time inden vi skulle til Social dinner. Vi var heldige at få bord med nogle af vores norske venner og det blev til en meget festlig aften hvor der blev skålet hyppigt. Vi sluttede af med at tage nordmændene og de danske medicotek folk med på vores lokale vin bar som holdt ekstra åbent for vores skyld. Det var så hyggeligt (på nederste billede ses Snurre Stuen, verdensberømt Anaplasma forsker). Dag 4: Endnu mere Puha.. Det var endnu sværere at stå op denne morgen og nu skulle vi oven i købet have pakket alle vores ting, for turen gik hjem samme eftermiddag. Kaffen redede mig igen. Morgenens session var heldigvis ekstra spændende for mig, da vi nu var vi nået til TBE-virus. Bl.a. talte Gerhard Dobler, München, DE, om TBE-virus i flåter. Efter sessionen fik jeg en snak med ham omkring mit projekt og vi aftalte at starte et samarbejde bl.a. omkring selve protokollen for PCR på flåterne, positive kontoller og at jeg skal til München hvis vi finder TBE for at forsøge at isolere og sekventerer virus såfremt vi finder den i de flåter jeg har indsamlet denne sommer. Kl. 13 skulle jeg præsenterer min sidste poster: Nationwide seroprevalence study of Tick-borne encephalitis virus in Danish roe deer (C. capreolus). Der var færre mennesker der skulle præsenterer den dag så man kunne høre hvad der blev sagt. Alle de store kanoner indenfor TBE deltog i Poster-Walken så det var super fedt, at kunne fortælle hvad vi ellers arbejdede på i DK. Kl hentede en taxa os og vi blev kørt til lufthavnen i en fart. Vi nåede lige at tjekke ind, og så ellers ind på flyet. Alt i alt var den en forrygende tur, jeg glæder mig allerede til næste gang. Formidling Antagne videnskabelige publikationer, herunder mødeabstracts Husk at sende publikationer, herunder abstracts fra kongres- og mødepræsentationer, til Lone, så de kan blive registreret i PURE. Postere: Andersen, N. S., Skarphédinson, S., Jensen, P. M., Kolmos, H. J. & Riis Olesen, C. Nationwide seroprevalence study of Tick-borne encephalitis virus in Danish roe deer (C. capreolus). Præsenteret på 14th International Conference on Lyme Borreliosis and other Tick-Borne Diseases - ICLB2015 i Wien fra. D til Andersen, N. S., Hansen, S. G., Moestrup Jensen, P., Thamsborg, S. M. & Skarphédinson, S. Seroprevalence of Anaplasma phagocytophilum in Danish Sheep. Præsenteret på 14th International Conference on Lyme Borreliosis and other Tick-Borne Diseases - ICLB2015 i Wien fra. D til

4 Knudtzen, F. C., Andersen, N. S., Jensen, T. G., Skarphédinson, S. 20 Years of Neuroborreliosis in a High Endemic Area in Denmark. Præsenteret på 14th International Conference on Lyme Borreliosis and other Tick-Borne Diseases - ICLB2015 i Wien fra. D til Foredrag: Michael Kemp har holdt foredragene: 1) Kemp, M. Experimental use of whole genome sequencing for characterization of bacteria in a hospital setting. Inviteret foredrag på Illumina informatics summit, Center for Genomic Regulation, Barcelona, Spanien sept ) M. Kemp, A. Kvistholm Jensen, B. Gahrn-Hansen, A. Holm, E. Knudsen, E. Møller Nielsen, H.J. Kolmos, M.N. Skov: Rapid identification of the source of hospital-acquired listeriosis by whole-genome sequencing. Poster / foredrag præsenteret på 32nd Annual meeting of NSCMID - Infection and Antibiotics, 3-6 September 2015, Umeå, Sverige Artikler: Holt HM, Danielsen TK, Justesen US. Routine disc diffusion antimicrobial susceptibility testing of Clostridium difficile and association with PCR ribotype 027. Eur J Clin Microbiol Infect Dis Aug 30. [Epub ahead of print] Krogh TJ, Agergaard CN, Møller-Jensen J, Justesen US. Draft genome sequence of Parabacteroides goldsteinii with putative novel metallo-β-lactamases isolated from a blood culture from a human patient. Genome Announc. 2015;3:e Stærk K, Khandige S, Kolmos HJ, Møller-Jensen J, Andersen TE. Uropathogenic Escherichia coli express type 1 fimbriae only in surface adherent populations under physiological growth conditions J Infect Dis Aug 19. pii: jiv422. [Epub ahead of print] Stenger M, Hendel K, Bollen P, Licht PB, Kolmos HJ, Klitgaard JK.Assessments of Thioridazine as a Helper Compound to Dicloxacillin against Methicillin-Resistant Staphylococcus aureus: In Vivo Trials in a Mouse Peritonitis Model. PLoS One Aug 12;10(8):e doi: /journal.pone ecollection Gradel KO, Nielsen SL, Pedersen C, Knudsen JD, Østergaard C, Arpi M, Jensen TG, Kolmos HJ, Søgaard M, Lassen AT, Schønheyder HC; Danish Collaborative Bacteraemia Network (DACOBAN); Danish Observational Registry of Infectious Syndromes (DORIS). Low Completeness of Bacteraemia Registration in the Danish National Patient Registry. PLoS One Jun 29;10(6):e Kordjian HH, Schultz JDJH, Rosenvinge FS, Møller J, Micha Pedersen R. First clinical description of Eggerthia catenaformis bacteremia in a patient with dental abscess. Anaerobe. 2015;35(Pt B): Citterio L, Franzyk H, Palarasah Y, Andersen TE, Mateiu RV, Gram L. Improved in vitro evaluation of novel antimicrobials: potential synergy between human plasma and antibacterial peptidomimetics, AMPs and antibiotics against human pathogenic bacteria. Research in Microbiology Henriksen DP, Laursen CB, Jensen TG, Hallas J, Pedersen C, Lassen AT. Incidence Rate of Community-Acquired Sepsis Among Hospitalized Acute Medical Patients-A Population-Based Survey. Critical Care Medicine. 2015;43(1):13-21 Franck KT, Nielsen RT, Holzknecht BJ, Ersbøll AK, Fischer TK, Böttiger B. Norovirus Genotypes in Hospital Settings - Differences between Nosocomial and Community-Acquired Infections. Journal of Infectious Diseases sep 15;212(6):881-8 Asmussen Andreasen R, Andersen NS, Just SA, Jensen Hansen IM. Prognostic factors associated with mortality in patients with septic arthritis: A descriptive cohort study. Scandinavian Journal of Rheumatology maj. Emamifar A, Asmussen Andreasen R, Andersen NS, Jensen Hansen IM. Septic arthritis and subsequent fatal septic shock caused by Vibrio vulnificus infection. BMJ case reports nov 24. Holzknecht BJ, Franck KT, Nielsen RT, Böttiger B, Fischer TK, Fonager J. Sequence Analysis of the Capsid Gene during a Genotype II.4 Dominated Norovirus Season in One University Hospital: Identification of Possible Transmission Routes. PloS one. 2015;10

5 Franck KT, Lisby M, Fonager J, Schultz AC, Böttiger B, Villif A et al. Sources of Calicivirus Contamination in Foodborne Outbreaks in Denmark, The Role of the Asymptomatic Food Handler. Journal of Infectious Diseases. 2015;211(4): Nielsen SL, Lassen AT, Kolmos HJ, Jensen TG, Gradel KO, Pedersen C. The daily risk of bacteremia during hospitalization and associated 30-day mortality evaluated in relation to the traditional classification of bacteremia. American Journal of Infection Control nov 11 Agergaard CN, Hoegh SV, Holt HM, Justesen US. Two Serious Cases of Infection with Clostridium celatum after 40 Years in Hiding?. Journal of Clinical Microbiology nov 11 Anden formidling Kommende møder og konferencer med deadlines for tilmelding 6th Northern European Conference on Travel Medicine, London, 1-4 June 201. Mere info: Deadline for Abstracts 29 Januar, NSCMID, 33rd Annual Meeting of the Nordic Society of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, September 2016, Rovaniemi Finland. Call for abstracts 1 February 2016, Registration opens 1 February 2016 Deadline for abstracts 2 Maj 2016 Økonomi Opnået støtte: Hans Jørn Kolmos har fra Forskningsrådet ved Odense Universitetshospital fået støtte til projektet Shiga toxin-producing Eschericia coli: Bacterial adhesion, cellular destruction and complement-activation an in vitro study. med i alt kr Michael Kemp har fra fonden af fået støtte til projektet Enterokokker og infektiøs hjerteklapbetændelse med kr Til lykke til beløbsmodtagerne. Kommende deadlines for fonde og legater Projektstøtte ansøgninger termin Navn beløb Link uddybning Januar 5 frie forskningsmidler på OUH 5 mio Januar 15 Helsefonden s.asp?id=119 Januar 26 Odense Universitetshospitals ph.d.- pulje mio. Marts 15 April 22 Rejselegat Henrik & Emilie Ovesen foundation Det Frie Forskningsråd Se opslag på opslagstavlen på lægegangen. ansogere/aktuelle-opslag-fra-det-frie-forskningsrad/det-frie-forskningsrads-opslag-e2015- og-f20160f7ccd53d39e4d20a97787ea

6 April 23 Det Frie Forskningsråd Scolarstipendier ansogere/aktuelle-opslag-fra-det-frie-forskningsrad/det-frie-forskningsrads-opslag-e2015- og-f20160f7ccd53d39e4d20a97787ea Maj 14 Odense Universitetshospitals prægraduatpulje kr 4 x årligt Spar Nord Fonden ? RegionSyddanmark Internationaliseringspuljen Tømmerhandler Bangs Fond Vilhelm 2 mill årligt samlet Lundbeckfondens Visiting Professorships til sundhedsvidenskab /Visiting-Professorships.63.aspx Danske sundhedsvidenskabelige forskningsmiljøer kan i søge om støtte til at tiltrække udenlandske gæsteforskere på professorniveau til Danmark i op til ½ år. Dansk Selskab for Rejsemedicins Legater ge=legater Kongresrejser Dansk Selskab for Rejsemedicins Legater ge=legater Videnskabelige projekter om rådgivning til rejsende Knud og Edith Eriksens Mindefond op til 1 mill alyst.com/bevillinger-2014.html Knud og Edith Eriksens Mindefond uddeler årligt ca. 1 million kroner i en eller flere portioner til en læge eller videnskabsmand, der arbejder med forskning til bekæmpelse af sygdomme eller til én eller flere sygdomsramte personer. Knud Højgaards Fond khf.dk Knud Højgaards Fond støtter studierejser og konferencedeltagelse i udlandet for ph.d.-studerende og post docs Løbende Bodil Pedersen Fonden Aase og Ejner Danielsens fond Direktør Ob Henriksens fond Lægevidenskabelige selskaber, udenlandske foredragsholdere nsoegninger.html ng.aspx ml til%20udenlandsk%20foredragsholder brd. Hartmanns Fond kontaktformular Apparatur Alfred benzons Workshops Løbende Alfred benzons Symposier Lundbeckfonden Rejsestipendier /Rejsestipendier.34.aspx Kongresdeltagelse udland Løbende Region Syddanmark MTVpuljen k/wm356231