STORKNOLDET KNOLDBÆGERSVAMP

Transkript

1 14. JANUAR 2014 STORKNOLDET KNOLDBÆGERSVAMP (SCLEROTINIA SCLEROTIORUM) KAN PCR-TEST FORUDSIGE ANGREB? BENT J. NIELSEN & ANNEMARIE FEJER JUSTESEN, AGROØKOLOGI UNI VERSITET

2 Storknoldet knoldbægersvamp (Sclerotinia sclerotiorum) Forårsager ofte lille skade men lejlighedsvis store udbyttetab sklerotier i marken (sædskiftet) foto C. Lerenius

3 Storknoldet knoldbægersvamp (Sclerotinia sclerotiorum) Forårsager ofte lille skade men lejlighedsvis store udbyttetab sklerotier i marken (sædskiftet) England ( ): gens 19% marker med angreb gens. 2% angrebne planter 1-2% udbyttetab

4 Storknoldet knoldbægersvamp (Sclerotinia sclerotiorum) Forårsager ofte lille skade men lejlighedsvis store udbyttetab sklerotier i marken (sædskiftet) England ( ): gens 19% marker med angreb gens. 2% angrebne planter 1-2% udbyttetab Danmark (37 forsøgsmarker ) gens. 2,4 % angrebne planter

5 % planter med knoldbægrsavmp Angreb af knoldbægersvamp i 37 marker ,0 10,0 8,0 6,0 4,0 2,0 0, Marker Vinterrapsmarker hvor der har været anlagt forsøg 5

6 % planter med knoldbægrsavmp Angreb af knoldbægersvamp i 37 marker ,0 10,0 8,0 6,0 Hvordan finder vi markerne med sprøjtebehov? 4,0 2,0 0, Marker Vinterrapsmarker hvor der har været anlagt forsøg 6

7 Forudsigelse af angreb Aktuelt sprøjtebehov baseret på upræcis risikovurdering Behov for at kunne præcisere faktiske forekomst af angreb i marken

8 Forudsigelse af angreb Aktuelt sprøjtebehov baseret på upræcis risikovurdering Behov for at kunne præcisere faktiske forekomst af angreb i marken Muligheder med ny PCR-baseret teknik?

9 Bestemmelse af svampe art mængde DNA ekstraktion PCR DNA detektion 9

10 Muligheder for at forudsige angreb (Gladders, 2008) 10

11 Varsling for bekæmpelse Risiko for angreb afhænger af sporeproduktion under blomstring vejrforhold så kronblade kan klæbe til blade (længere periode med høj RH og temp > 7 o ) 11

12 Varsling for bekæmpelse Risiko for angreb afhænger af sporeproduktion under blomstring vejrforhold så kronblade kan klæbe til blade (længere periode med høj RH og temp > 7 o ) Sprøjtning før end infektion finder sted Lige før eller ved fuld blomst 3 ugers beskyttelse 12

13 Risikovurdering Agronomiske forhold Tidligere angreb på ejendommen Sædskifte 13

14 Risikovurdering Sklerotie depoter spiring af apothecier DK , (Gladders, 2008) 14

15 Risikovurdering Varslingsmodel ScleroPro (Gladders, 2008) 15

16 Risikovurdering Kronbladtest (Gladders, 2008) 16

17 Kronbladtest Detektion af ascosporer i kronblade Indsamling af kronblade Dyrkning på agar (gamle metode) Detektion med PCR (bestemmelse af S. sclerotinium DNA)

18 Danske undersøgelser med kronbladtest Projekt 2009 mellem AU og VFL Kan tidlig bestemmelse ved hjælp af PCR teknik forudsige angreb og bekæmpelsesbehov? Markforsøg blev anlagt, men der kom ikke angreb PCR metode implementeret som kan teste for tilstedeværelse af S. sclerotiorum DNA

19 Sammenhæng kronblade - stængelangreb Svenske undersøgelser ( , 20 marker): (Wallenhammar et al. 2008)

20 Index for stængelangreb Sammenhæng kronblade - stængelangreb Engelske undersøgelser ( , 15 marker): Index knoldbægersvamp. Ubehandlet (Gladders, 2008) % angrebne kronblade Index knoldbægersvamp. Sprøjtet

21 Kronbladtest, konklusion.. Indsamling og test af enkeltblade Tidskrævende test (ca uge for svar) For sent svar i fht. optimale sprøjtetidspunkt Behov for Automatiseret hurtigtest Belyse sammenhæng mellem vejrforhold, klæbende kronblade og endelige angreb

22 Risikovurdering Detektion af sporer i sporefælde (Gladders, 2008) 22

23 Detektion i sporefælder Detektion af ascosporer over afgrøden Bestemmelse af sporer på tape i sporefælde Direkte mikroskopi (gamle metode) Detektion med PCR

24 Undersøgelser med sporefælder Svenske undersøgelser: Forsøg (Wallenhammar, 2010) Ascosporer kunne ses i sporefælde før end de kunne detekteres i kronblade Engelse undersøgelser: Lovende resultater med kvantificering af luftbårne smitte

25 Undersøgelser med sporefælder Sclerotinia DNA i sporefælder i vinterraps, ADAS, Rosemaund, UK 2006 (Yong et al. 2007) 25

26 Andre erfaringer med PCR detektion i sporefælder: Ramularia beticola i roer Første mark symptomer R. beticola DNA i sporefælde på to lokaliteter (KN og DC) (Wieczorek et al. 2013)

27 Sporefælder, konklusion Erfaring fra andre skadegørere med PCR detektion af sporer på tape i sporefælder Behov for udvikling af operationel PCR metode Burkhard sporefælde o Drivers på batteri o Sporer på tape o Skiftes daglig/ugentligt o DNA fra tape

28 Sporefælder, konklusion Erfaring fra andre skadegørere med PCR detektion af sporer på tape i sporefælder Behov for udvikling af operationel PCR metode Burkhard Cyclone sampler o Solceller o Sporer opsamles i rør o Skiftes daglig/ugentligt o DNA direkte fra rørerne (laboratorium)

29 Sporefælder, konklusion Erfaring fra andre skadegørere med PCR detektion af sporer på tape i sporefælder Behov for udvikling af operationel PCR metode Burkhard Cyclone sampler o Solceller o Sporer opsamles i rør o Skiftes daglig/ugentligt o DNA direkte fra rørerne o Direkte test i fælden i marken?

30 Sporefælder, konklusion Erfaring fra andre skadegørere med PCR detektion af sporer på tape i sporefælder Behov for udvikling af operationel PCR metode i raps Model for sammenhæng mellem vejrforhold (RH), sporeforekomst og bekæmpelsesbehov

31 Sporefælder, konklusion Erfaring fra andre skadegørere med PCR detektion af sporer på tape i sporefælder Behov for udvikling af operationel PCR metode i raps Model for sammenhæng mellem vejrforhold (RH), sporeforekomst og bekæmpelsesbehov Omfang og placering af sporefælder

32 Inokulum baseret varslingsmodel Nedbør/temperatur/RH Kronbladtest DNA detektion Output Varslingsmodel Automatiseret sporefælde 32

33 Inokulum baseret varslingsmodel På kort sigt. Metodeudviklking (teknik, metoder mv) o Knoldbægersvamp o Phoma (rodhalsråd) Forskningsværktøj Mere viden om sporespredning bedre modeller Vejledningsværktøj Opstilling på demogårde Marker/områder med kendt risiko 33

34 Inokulum baseret varslingsmodel På længere sigt. Automatisk, hurtigtest i mark med direkte svar Vejledningsværktøj Opstilling på demogårde Marker med kendt risiko Mange marker? 34

35 Inokulum baseret varslingsmodel På længere sigt. Automatisk, hurtigtest i mark med direkte svar Vejledningsværktøj Opstilling på demogårde Marker med kendt risiko Mange marker? Indsamling ved droner? 35

36 Tak for opmærksomheden 36