Dynamisk statistisk modellering af vedligeholdelsesbehandling af børn med akut lymfoblastær leukæmi

Relaterede dokumenter
Faculty of Health Sciences. Miscellaneous: Styrkeberegninger Overlevelsesanalyse Analyse af matchede studier

Dag 6: Interaktion. Overlevelsesanalyse

Susanne Ditlevsen Institut for Matematiske Fag susanne

Introduktion til overlevelsesanalyse

Økonometri 1. Dummyvariabler 13. oktober Økonometri 1: F10 1

Eksempel Multipel regressions model Den generelle model Estimation Multipel R-i-anden F-test for effekt af prædiktorer Test for vekselvirkning

Lineære normale modeller (4) udkast

Statistiske principper

Epidemiologi og Biostatistik Opgaver i Biostatistik Uge 10: 13. april

Normalfordelingen. Det centrale er gentagne målinger/observationer (en stikprøve), der kan beskrives ved den normale fordeling: 1 2πσ

Forelæsning 11: Kapitel 11: Regressionsanalyse

1 Hb SS Hb Sβ Hb SC = , (s = )

Oversigt. 1 Gennemgående eksempel: Højde og vægt. 2 Korrelation. 3 Regressionsanalyse (kap 11) 4 Mindste kvadraters metode

Simpel Lineær Regression: Model

Økonometri 1. Dagens program. Den simple regressionsmodel 15. september 2006

Module 4: Ensidig variansanalyse

Økonometri 1. Inferens i den lineære regressionsmodel 25. september Økonometri 1: F6 1

12. september Epidemiologi og biostatistik. Forelæsning 4 Uge 3, torsdag. Niels Trolle Andersen, Afdelingen for Biostatistik. Regressionsanalyse

Økonometri 1. Dagens program. Den multiple regressionsmodel 18. september 2006

Økonometri 1. Den simple regressionsmodel 11. september Økonometri 1: F2

Epidemiologisk design I. Eksperimentelle undersøgelser. Epidemiologisk design II. Randomiserede undersøgelser. Randomisering I.

Introduktion til overlevelsesanalyse

Økonometri: Lektion 2 Multipel Lineær Regression 1/33

Lineær og logistisk regression

Epidemiologi og biostatistik. Uge 3, torsdag. Erik Parner, Institut for Biostatistik. Regressionsanalyse

Statistik ved Bachelor-uddannelsen i folkesundhedsvidenskab. Indledende om Signifikanstest Boldøvelser

Epidemiologi og biostatistik. Uge 3, torsdag. Erik Parner, Afdeling for Biostatistik. Eksempel: Systolisk blodtryk

Hvad skal vi lave? Model med hovedvirkninger Model med vekselvirkning F-test for ingen vekselvirkning. 1 Kovariansanalyse. 2 Sammenligning af modeller

1 Regressionsproblemet 2

Økonometri: Lektion 2 Multipel Lineær Regression 1/27

Mindste kvadraters tilpasning Prædiktion og residualer Estimation af betinget standardafvigelse Test for uafhængighed Konfidensinterval for hældning

Logistisk regression

Kausale modeller. Konstruktion og analyse

Hypotesetests, fejltyper og p-værdier

Anvendt Statistik Lektion 9. Variansanalyse (ANOVA)

Program: 1. Repetition: p-værdi 2. Simpel lineær regression. 1/19

Løsning til eksamensopgaven i Basal Biostatistik (J.nr.: 1050/06)

Morten Frydenberg Biostatistik version dato:

Modul 11: Simpel lineær regression

Anvendt Statistik Lektion 9. Variansanalyse (ANOVA)

Epidemiologisk design I. Eksperimentelle undersøgelser. Epidemiologisk design II. Randomiserede undersøgelser. Randomisering II

Økonometri Lektion 1 Simpel Lineær Regression 1/31

1 Ensidet variansanalyse(kvantitativt outcome) - sammenligning af flere grupper(kvalitativ

grupper(kvalitativ exposure) Variation indenfor og mellem grupper F-test for ingen effekt AnovaTabel Beregning af p-værdi i F-fordelingen

Er hesten halt? Diagnosticering og kvantificering af halthed vha. accelerationsdata

Test for strukturelle ændringer i investeringsadfærden

Noter til Specialkursus i videregående statistik

CENTER FOR KLINISKE RETNINGSLINJER

Anvendt Statistik Lektion 8. Multipel Lineær Regression

Velkommen til kurset. Teoretisk Statistik. Lærer: Niels-Erik Jensen

Opgave 1 Betragt to diskrete stokastiske variable X og Y. Antag at sandsynlighedsfunktionen p X for X er givet ved

Institut for Matematiske Fag Matematisk Modellering 1 UGESEDDEL 6

Lineær regression: lidt mere tekniske betragtninger om R 2 og et godt alternativ

Modul 12: Regression og korrelation

Screenings-baseret sygeplejerske navigation til kvinder med brystkræft: En RCT pilot undersøgelse

Estimation og konfidensintervaller

men nu er Z N((µ 1 µ 0 ) n/σ, 1)!! Forkaster hvis X 191 eller X 209 eller

Statistisk modellering og regressionsanalyse

Behandlingsvejledning for terapiområdet Biologisk Behandling af Kroniske Inflammatoriske Tarmsygdomme

Arbejdsløshed, arbejdsløshedsforsikring og konjunktursvingninger?

Susanne Ditlevsen Institut for Matematiske Fag susanne

3.600 kg og den gennemsnitlige fødselsvægt kg i stikprøven.

1. Intoduktion. Undervisningsnoter til Øvelse i Paneldata

4 Oversigt over kapitel 4

Overlevelsesanalyse. Faculty of Health Sciences

Behandlingsvejledning inklusiv lægemiddelrekommandation for behandling af patienter med myelomatose

Noter til SfR checkliste 3 Kohorteundersøgelser

Statistik og Sandsynlighedsregning 2. IH kapitel 12. Overheads til forelæsninger, mandag 6. uge

Statistik ved Bachelor-uddannelsen i folkesundhedsvidenskab. Introduktion

Naturvidenskabelig Bacheloruddannelse Forår 2006 Matematisk Modellering 1 Side 1

Forsøgsplanlægning Stikprøvestørrelse

Uge 43 I Teoretisk Statistik, 21. oktober Forudsigelser

Kvantitative metoder 2

Om hypoteseprøvning (1)

Økonometri: Lektion 6 Emne: Heteroskedasticitet

Kvantitative metoder 2

Simpel Lineær Regression

Kursus Introduktion til Statistik. Forelæsning 13: Summary. Per Bruun Brockhoff

Statistik ved Bachelor-uddannelsen i folkesundhedsvidenskab. Introduktion

Multipel regression. Data fra opgave 3 side 453: Multipel regressionsmodel: Y = α + β 1 x 1 + β 2 x 2 + ǫ. hvor ǫ N(0, σ 2 ).

Introduktion til GLIMMIX

Statistik ved Bachelor-uddannelsen i folkesundhedsvidenskab. Eksamensopgave E05. Socialklasse og kronisk sygdom

Eksamen Bacheloruddannelsen i Medicin med industriel specialisering

Modersmålsbaseret undervisning-

OR stiger eksponentielt med forskellen i BMI. kompliceret model svær at forstå og analysere

PERCIST. Joan Fledelius, Nuklearmedicinsk afdeling, Hospitalsenhed vest, Herning

Epidemiologi og Biostatistik. Mogens Erlandsen, Institut for Biostatistik Uge 1, tirsdag d. 5. februar 2002

Motivation. Konfidensintervaller og vurdering af usikkerhed på estimerede størrelser

Et statistisk test er en konfrontation af virkelighenden (data) med en teori (model).

Kvantitative metoder 2

Tema. Dagens tema: Indfør centrale statistiske begreber.

! Variansen på OLS estimatoren. ! Multikollinaritet. ! Variansen i misspecificerede modeller. ! Estimat af variansen på fejlleddet

Kvadratisk regression

MPH specialmodul Epidemiologi og Biostatistik

Center for Statistik. Multipel regression med laggede responser som forklarende variable

Basal statistik Esben Budtz-Jørgensen 4. november Forsøgsplanlægning Stikprøvestørrelse

Vi sætter. (Signal støj- forhold) Poul Thyregod, 25. april Specialkursus vid.stat. foraar Lad Y i angiver observationer fra i te udtagne balle.

Statistik ved Bachelor-uddannelsen i folkesundhedsvidenskab. Estimation

Økonometri 1 Forår 2006 Ugeseddel 11

OR stiger eksponentielt med forskellen i BMI komplicet model svær at forstå og analysere simpel model

Transkript:

Dynamisk statistisk modellering af vedligeholdelsesbehandling af børn med akut lymfoblastær leukæmi Susanne Rosthøj 2. oktober 2009

Akut Lymfoblastær Leukæmi (ALL) Årlig forekomst på ca 35 tilfælde i Danmark. Behandles med intensivt og langvarigt forløb med kemoterapi. Recidivfri overlevelse er ca 80%. Der findes foreløbigt ingen generelle retningslinier for den optimale behandlingsstrategi. NOPHO ALL-92: Nordisk randomiseret studie 538 patienter diagnosticeret 01.01.1992-31.12.1996. Follow-up frem til 23.01.2008.

Behandlingen 2-2.5 års varighed afhængig af risikoklassificering: Konsolidering Induktion Vedligeholdelse (9-27 months) Mål: Antal hvide blodlegemer (WBC) imellem 1.5-3.5 10 9 /L. Medicin: Methotrexate (MTX) ugentligt. 6-Mercaptopurine (6MP) dagligt. Ugentlig kontrol: WBC og trombocyttal (TC).

The protocol Kontrol gruppen Øg 3.5 WBC ( 10 9 /L) 1.5 1.0 Pause Reducer (50%) 100 Thrombocyttal ( 10 9 /L)

The protocol Kontrol gruppen Farmakologi gruppen Øg 3.5 WBC ( 10 9 /L) Øg hvis lave medicinkoncentrationer 1.5 1.0 Pause Reducer (50%) 100 Thrombocyttal ( 10 9 /L)

Recidivfri overlevelse: Udfaldet af NOPHO studiet 0.0 0.2 0.4 0.6 0.8 1.0 Girls control group Girls pharmacology group Boys control group Boys phamacology group 0 2 4 6 8 10 12 Years since diagnosis År siden diagnose

Formål Problem: Den biologiske forståelse af vedligeholdelsesbehandlingen er utilstrækkelig. Behov for nye behandlingsstrategier. Formål: 1. At udvikle biologisk fortolkelige modeller for de parametre, som vedligeholdelsesbehandlingen bygger på (medicinkoncentrationer + WBC). 2. At undersøge om nyligt udviklede statistiske metoder indenfor kausal inferens og dynamiske behandlingsstrategier er nyttige i forbindelse med formulering af fremtidige protokoller.

Medicinkoncentrationerne Formulering af modeller for hvorledes medicinkoncentrationerne afhænger af de givne doser ved brug af: Lineære og ikke-linære hierarkiske modeller som tager højde for - inter-individual variation (tilfældige effekter) - heteroscedasticitet - seriel korrelation. Derved har vi opnået biologisk fortolkelige modeller.

Erythrocyt-MTX koncentrationerne Steady state MTX: Ikke-lineær relation mellem MTX-dosis og koncentration. E-MTX 0 1 2 3 4 5 Girls Boys 0 5 10 15 20 25 MTX dosis

Erythrocyt 6TGN koncentrationerne Steady state 6TGN: Lineær relation mellem 6MP-dosis og concentration. Men hældningen afhænger af TPMT-aktiviteten. 0 2 4 6 8 Hældning for 6MP-dosis 10 15 20 25 TPMT aktivitet

Medicin koncentrationer som en parameter for dosisjusteringer Patient specifikke karakteristika bestemmer hvorvidt høje medicinkoncentrationer kan opnås. Betydelig inter-individuel variation. Konclusion: Medicinkoncentrationerne er næppe nyttige som et redskab for dosisjusteringer for alle patienter.

Statistiske metoder for dynamiske behandlingsstrategier Optimale dynamiske behandlingsstrategier: Murphy (2003), Journal of the Royal Statistical Society, series B. Statisk-optimale behandlingsstrategier: Van der Laan, Petersen and Joffe (2005), International Journal of Biostatistics.

Matematisk notation Baseline kovariater Z 0. K + 1 måletidspunkter, j = 1,..., K + 1. Tilstandsvariabel S j = (WBC j, TC j, ). Dosis D j. Observationsrækkefølge: (S 1, D 1, S 2, D 2,, S k, D k, S K+1 ) Observeret historie til tidpunkt j: H j = (S 1, D 1, S 2, D 2,, S j 1, D j 1, S j )

Potential outcomes Potential outcomes: Observeret Potentiel D 1 d 1 S 2 = S 2 (D 1 ) S 2 (d 1 ) Potentielle tilstandsproces: ( S1, S 2 ( d 1 ), S 3 ( d 1, d 2 ),, S K+1 ( d 1,, d k ) ).

Optimale dynamiske behandlingsstrategier Respons Y K+1. Her: Andelen af vedligeholdelsesbehandlingen for hvilken WBC er i target range. S 1 D 1 S 2 D 2 S K D K Y K+1

Optimale dynamiske behandlingsstrategier Respons Y K+1. Her: Andelen af vedligeholdelsesbehandlingen for hvilken WBC er i target range. Find doser d j = d j (H j ) som giver anledning til maksimal forventet respons E(Y K+1 ). S 1 D 1 S 2 D 2 S K D K Y K+1

Optimale dynamiske behandlingsstrategier Respons Y K+1. Her: Andelen af vedligeholdelsesbehandlingen for hvilken WBC er i target range. Find doser d j = d j (H j ) som giver anledning til maksimal forventet respons E(Y K+1 ). S 1 D 1 S 2 D 2 S K D K Y K+1

Optimale dynamiske behandlingsstrategier Respons Y K+1. Her: Andelen af vedligeholdelsesbehandlingen for hvilken WBC er i target range. Find doser d j = d j (H j ) som giver anledning til maksimal forventet respons E(Y K+1 ). S 1 D 1 S 2 D 2 S K D K Y K+1 Murphy formulerer modeller for den optimale dosis, e.g. log d j (H j ) = α + βd j 1 + γwbc j + δ Z 0, j = 1,, K.

Estimation af optimale dynamiske behandlingsstrategier Eksempel: Antikoagulationsbehandling. Estimation: - Svært! - Alternative estimationsprocedurer kunne ikke afhjælpe problemet. - Umuligt at implementere i praksis. Videre udvikling af de eksisterende metoder eller alternative tilgange er nødvendige.

Statisk-optimale behandlingsstrategier Et tidspunkt frem i tid: Find d j = d j (H j ) således at E(S j+1 ) opnår ønsket værdi / range. S 1 D 1 S 2 D 2 S 3 D 3 S 4 D 4

Statisk-optimale behandlingsstrategier Et tidspunkt frem i tid: Find d j = d j (H j ) således at E(S j+1 ) opnår ønsket værdi / range. S 1 D 1 S 2 D 2 S 3 D 3 S 4 D 4

Statisk-optimale behandlingsstrategier Et tidspunkt frem i tid: Find d j = d j (H j ) således at E(S j+1 ) opnår ønsket værdi / range. S 1 D 1 S 2 D 2 S 3 D 3 S 4 D 4

Statisk-optimale behandlingsstrategier Et tidspunkt frem i tid: Find d j = d j (H j ) således at E(S j+1 ) opnår ønsket værdi / range. S 1 D 1 S 2 D 2 S 3 D 3 S 4 D 4

Statisk-optimale behandlingsstrategier Et tidspunkt frem i tid: Find d j = d j (H j ) således at E(S j+1 ) opnår ønsket værdi / range. S 1 D 1 S 2 D 2 S 3 D 3 S 4 D 4

Statisk-optimale behandlingsstrategier Et tidspunkt frem i tid: Find d j = d j (H j ) således at E(S j+1 ) opnår ønsket værdi / range. To tidspunkter frem i tid: Find (d j, d j+1 ) = (d j, d j+1 )(H j ) således at E(S j+2 ( d j, d j+1 ) opnår ønsket værdi / range. S 1 D 1 S 2 D 2 S 3 D 3 S 4 D 4

Statisk-optimale behandlingsstrategier Et tidspunkt frem i tid: Find d j = d j (H j ) således at E(S j+1 ) opnår ønsket værdi / range. To tidspunkter frem i tid: Find (d j, d j+1 ) = (d j, d j+1 )(H j ) således at E(S j+2 ( d j, d j+1 ) opnår ønsket værdi / range. S 1 D 1 S 2 D 2 S 3 D 3 S 4 D 4

Statisk-optimale behandlingsstrategier Et tidspunkt frem i tid: Find d j = d j (H j ) således at E(S j+1 ) opnår ønsket værdi / range. To tidspunkter frem i tid: Find (d j, d j+1 ) = (d j, d j+1 )(H j ) således at E(S j+2 ( d j, d j+1 ) opnår ønsket værdi / range. S 1 D 1 S 2 D 2 S 3 D 3 S 4 D 4

Statisk-optimale behandlingsstrategier Et tidspunkt frem i tid: Find d j = d j (H j ) således at E(S j+1 ) opnår ønsket værdi / range. To tidspunkter frem i tid: Find (d j, d j+1 ) = (d j, d j+1 )(H j ) således at E(S j+2 ( d j, d j+1 ) opnår ønsket værdi / range. S 1 D 1 S 2 D 2 S 3 D 3 S 4 D 4

Statisk-optimale behandlingsstrategier Et tidspunkt frem i tid: Find d j = d j (H j ) således at E(S j+1 ) opnår ønsket værdi / range. To tidspunkter frem i tid: Find (d j, d j+1 ) = (d j, d j+1 )(H j ) således at E(S j+2 ( d j, d j+1 ) opnår ønsket værdi / range. S 1 D 1 S 2 D 2 S 3 D 3 S 4 D 4 For ethvert tidspunkt er sekvensen af doser ikke-dynamisk. Det er dog muligt at definere en statisk-optimal dynamisk behandlingsstrategi.

Marginale Strukturelle Modeller Et trin frem i tiden kan vi - givet historien - formulere E(S j+1 (d j )) = α + β 1 S j + β 2 D j 1 + γd j + δ Z 0. NB: Dette er ikke en traditionel regressionsmodel! Confounding: D 1 WBC 2 WBC 1 Data for WBC 1 = 4.0: D j Ssh. Vægt 0.5 1/4 4 1.0 1/2 2 1.0 1/2 2 1.5 1/4 4

Marginale Strukturelle Modeller Et trin frem i tiden kan vi - givet historien - formulere E(S j+1 (d j )) = α + β 1 S j + β 2 D j 1 + γd j + δ Z 0. NB: Dette er ikke en traditionel regressionsmodel! Confounding: D 1 WBC 2 WBC 1 Data for WBC 1 = 4.0: D j Ssh. Vægt 0.5 1/4 4 1.0 1/2 2 1.0 1/2 2 1.5 1/4 4

Model for potentiel WBC (j = 1) Først: Model for doserne. Potential outcome: log(wbc j+1 (d j )) Dosis d j = ændring af dosis. Diskret version: d j 0 50%, 50 90%, 90 110%, 110 150%, > 150%

Model for potentiel WBC (j = 1) Først: Model for doserne. Potential outcome: log(wbc j+1 (d j )) Dosis d j = ændring af dosis. Diskret version: d j 0 50%, 50 90%, 90 110%, 110 150%, > 150% Modellen E ( ) log(wbc j+1 (d j )) V j, Z 0 1 log(wbcj ) (d j 0 50%) + D j 1 (d j 50 90%) + D j 1 (d j 90 110%) (d j 110 150%) + X j + Z 0 (d j > 150%)

Data Data er meget ubalancerede og antallet af dage varierer mellem varierer. Den fulde effekt af en dosisændring forventes først at indtræde efter ca 10-18 dage. Vi kan ikke ignorere antallet af dage mellem prøvetagninger! Definerer to balancerede del-datasæt: 1) 1 uge (6-8 dage) mellem prøverne (n = 3797, 316 patienter). 2) 2 uger (13-15 dage) mellem prøverne (n = 1717, 337 patienter).

Estimater 1 uge 2 uger Term Est. SE p Est SE p Intercept 0.0212 0.0136 0.12-0.0066 0.0185 0.72 log(wbc j ) 1 - - 1 - - D j 1 (d j 0 50%) 0.2456 0.1509 0.10 0.5615 0.2288 0.01 D j 1 (d j 50 90%) 0.1589 0.0591 <.01 0.1825 0.1318 0.17 D j 1 (d j 90 110%) 0 - - 0 - - D j 1 (d j 110 150%) -0.1429 0.0692 0.04-0.2395 0.0992 0.02 D j 1 (d j > 150%) -0.1841 0.2035 0.37-0.5546 0.3529 0.12 D j 1-0.3434 0.0556 <.01-0.3155 0.0961 <.01 gns. positiv 6-m-dosis 0.2095 0.0606 <.01 0.2542 0.1121 0.02

Estimeret forventet potentiel WBC Et eksempel WBC j =3.8 10 9 /L, D j 1 = 400 (mg/m 2 ) 2, gennemsnitlig positiv 6-m-dosis =300 (mg/m 2 ) 2. 1 uge 2 uger Dosisændring WBC (SE) WBC (SE) [0.0, 0.5) 3.97 (0.06) 4.50 (0.17) [0.5, 0.9] 3.83 (0.01) 3.86 (0.01) (0.9, 1.1) 3.60 (0.00) 3.59 (0.00) [1.1, 1.5] 3.40 (0.01) 3.26 (0.01) 1.5+ 3.35 (0.07) 2.88 (0.17)

Behandlingsstrategier Vi har nu 3 forskellige behandlingsstrategier: 1) Protokollerne 2) Strategien implementeret af lægerne 3) Strategien baseret på modellen ( statisk-optimal ) Optimal strategi baseret på modellen med 2 uger mellem prøvetagning: Hvis WBC er udenfor range: Ændr dosen så lidt som muligt for at opnå en forventet potentiel WBC i range om 2 uger. Hold pause hvis TC < 100 10 9 /L.

Den statisk-optimale mod den implementerede strategi Conditional probability 0 20 40 60 80 100 1 = Large reduction 2 = Moderate reduction 3 = No change 4 = Moderate increase 5 = Large increase 1 2 3 4 5 Estimated choice

Den statisk-optimale strategi Strategien ser ud til at være mest nyttig til at afgøre hvornår dosis skal ændres, men ikke hvor meget. Hvordan skal vi vurdere performance?

Den statisk-optimale strategi Strategien ser ud til at være mest nyttig til at afgøre hvornår dosis skal ændres, men ikke hvor meget. Hvordan skal vi vurdere performance? En simpel sammenligning: Nuværende WBC i range: 65% Næste WBC i range: 64% For 54% disse observationer blev den statisk-optimale beslutning valgt. For 71% af disse var WBC 2 uger frem i range.

Konklusion Dynamiske behandlingsstrategier benyttes i behandlingen af mange slags sygdomme. Jeg har vist at - det er svært / umuligt at bestemme den optimale strategi. - at problemet er for komplekst til at bestemme en rimelig statisk-optimal strategi. Vi har brug for alternative metoder / videreudvikling af de eksisterende for at kunne opnå modeller, som kan benyttes ved formuleringen af nye protokoller. Videre arbejde: - problemer med vægtene - tidsaspektet