EN VEJLEDNING FRA UCL BIBLIOTEKET PubMed - tips til søgning December 2017
Indholdsfortegnelse 1 Basens indhold... 1 2 Adgang til basen... 1 3 Søgemetoder... 2 3.1 Fritekstsøgning... 2 3.1.1 Muligheder for afgrænsning... 5 3.1.2 Adgang til den fulde tekst eller ej... 10 3.1.3 Opsamling af poster i Clipboard og arkivering af poster... 12 3.2 Søgning med basens emneord / MeSH -søgning... 13 4 Søgehistorie... 16 5 Kombination af søgninger... 17 1 Basens indhold PubMed er en stor sundhedsfaglig database med henvisninger til videnskabelige artikler. Den indeholder omtale af over 27 mill. artikler. Der er artikler tilbage fra slutningen af 1940 erne og frem til i dag, og basen opdateres dagligt. Der indlægges også ældre titler. Langt de fleste artikler er på engelsk, men vær opmærksom på, at der kan være enkelte artikler på andre sprog f.eks. kinesisk eller spansk. Søgesproget er engelsk. Ved en del af artiklerne er det muligt at klikke sig videre til den fulde tekst. 2 Adgang til basen Der er adgang til basen fra UCL-bibliotekets hjemmeside bib.ucl.dk. Det gælder både, hvis du befinder dig på UCL-nettet, og hvis du ønsker fjernadgang. Du finder adgangen på bibliotekets hjemmeside under Fagguide, hvor du vælger den uddannelse, du er tilknyttet. Uanset hvor du befinder dig, anbefales det, at du starter med at åbne dit personlige My NCBI. Se evt. vejledning til oprettelse heraf samme sted som du finder adgangen til PubMed og denne vejledning. 1
3 Søgemetoder Du kan søge på forskellige måder. I denne vejledning omtales dels fritekstsøgning, dels søgning med MeSH-ord (Medical Subject Headings). Uanset din søgemetode så vær opmærksom på at gemme din søgehistorie se evt. side 16-17. Bemærk! Hvis du er vant til at bruge trunkeringstegn (f.eks. i bibliotek.dk), så vær opmærksom på, at brugen af dette i PubMed sætter koblingen til MeSH-ordene ud af kraft. Anbefalingen er derfor at du ikke bruger trunkering PubMed. Eksempel i vejledningen Eksemplet er baseret på litteratursøgning ift. hvordan man kan søge efter materiale om sygeplejerske patient- forholdet, i forbindelse med rehabilitering af patienter med et slagtilfælde. 3.1 Fritekstsøgning Du kan søge direkte på de ord, du arbejder med i forhold til dit emne. Herved får du også de allernyeste artikler med artikler, der endnu ikke har fået tilknyttet databasens egne emneord, MeSH-ordene. Vær opmærksom på, at der alene søges i omtalen af artiklen, ikke i selve artiklens fulde tekst. Her vises et eksempel på en søgning, hvor der er brugt boolske operatorer (AND, OR, NOT). Nært beslægtede emner/synonymer er sat i parentes med OR imellem: 2
Det giver omkring 2500 hits. Du kan se de nyeste på skærmen: For at se hvordan PubMed har oversat dine søgeord, kan du i kolonnen til højre (længere nede) under Search details klikke på See more 3
Herved får du følgende billede, hvor du blandt andet under Translations kan se, om PubMed har suppleret med søgning på basens egne emneord, MeSH-ord, der som nævnt bliver tilknyttet artiklerne efter nogen tid. I mange søgninger kan disse oplysninger hjælpe dig med at finde relevante søgeord. 4
3.1.1 Muligheder for afgrænsning På udgivelsesdato Hvis du kun ønsker artikler fra de sidste 5 år, klikker du på 5 years i kolonnen tv. under Publication dates. Du kan også vælge andre tidsrum ved at klikke på Custom range. Vær opmærksom på, at der skal være et flueben ud for det, du har valgt, før begrænsningen er aktiv ift. din søgning. På sprog For at kunne afgrænse på sprog, skal du først trykke på Show additional filters og dernæst sætte et flueben ud for Languages og til sidst trykke Show. Nu kan du umiddelbart vælge engelsk som sprog, men hvis du ønsker at kunne vælge andre sprog end engelsk, skal du trykke på Customize og derefter vælge de sprog, du ønsker. Når du så har trykket på Show er afgrænsningen aktiv. 5
I dette eksempel afgrænses til artikler på dansk, engelsk, norsk og svensk. Vær opmærksom på, at du hvis du benytter andre filtre (f.eks. Type of Articles, Subsets m.fl.) - kan miste de allernyeste artikler, der endnu ikke har fået tildelt basens egne emneord, MeSH-ord, eller disse supplerende oplysninger. Vær også opmærksom på, at alle afgrænsninger fastholdes, indtil du selv sletter dem eller forlader PubMed. Du kan slette dem alle ved at klikke på Clear all eller slette de enkelte afgrænsninger ved at klikke på clear til højre for overskrifterne. 6
Du kan få et overblik over de aktuelle begrænsninger ved at kigge på teksten efter Filters activated Ved brug af de valgte begrænsninger er søgesættet nu på 756 hits. 7
Du har nu flere muligheder, f.eks. kan du: 1. tilføje flere ord I søgeboksen 2. kigge på de nyeste artikler, der endnu ikke er indekseret færdige (mangler MeSH-ord mv.), og derefter supplere med en søgning på basens emneord, MeSH-ord. NB: Søger du på MeSH-ord får du en mere præcis søgning. Du kan dog tabe nogle helt nye artikler, da disse endnu ikke har fået tilføjet disse emneord. Derfor kan det være en god idé at kigge på de nyeste poster, der ikke er indekseret færdige. (MeSH-søgning er omtalt side 13) 3. benytte flere af de filtre, der er vist i kolonnen tv. Hvis du vælger mulighed 2: De nyeste artikler vil blive vist først, hvis du sørger for, at der øverst på skærmen står: Sort by: Most Recent Prøv så at vælge at læse beskrivelsen af artikler i formatet: Abstract. Tryk først på den lille pil til højre for Summary. Dernæst dobbelt-klikker du på Abstract. Nu vil du får vist abstractet til de enkelte artikler. 8
Hvis der står MeSH terms i en boks under artiklens abstract, er der blevet tilføjet MeSH-ord til beskrivelsen af artiklen. Hvis du nu klikker inde i boksen, vil du kunne se de MeSH-ord, der er tilføjet til beskrivelsen af artiklen. Meget ofte vil der gå et halvt år eller mere, før der bliver tilføjet MeSH-ord, hvilket betyder, at du ikke kan søge de allernyeste artikler frem ved hjælp af MeSH-ord. Hvordan du søger ved hjælp af MeSH-ord, kan du se nedenfor. Men først skal du vide, hvordan du kan undersøge, om der mulighed for at læse en eller flere artikler online nu og her (fuldtekstadgang) 9
3.1.2 Adgang til den fulde tekst eller ej Når du som ovenfor har indstillet PubMed til at vise dig abstractet vedr. artiklerne, vil du straks kunne undersøge, om der er online-adgang. Klik på et af ikonerne nedenunder abstractet, og hvis der er online-adgang kan du klikke på et link Klik videre her: 10
Nogle gange er der ikke online-adgang, men så kan du bestille en kopi af artiklen ved at klikke her: Nu kommer der en blanket frem, som du udfylder med dit ønskede afhentningssted samt cpr. og din pinkode på UCL Biblioteket. Til sidst klikker du blot Send Bestilling 11
3.1.3 Opsamling af poster i Clipboard og arkivering af poster Når du finder artikler, du vil vende tilbage til, kan du som lægge dem i Clipboard, et midlertidigt opsamlingssted. Afmærk til venstre for posten, klik Send to, vælg "Clipboard og klik på Add to Clipboard : Hvis du har oprettet en My NCBI (se særskilt vejledning) kan du også gemme posterne i en Collection, hvor du selv bestemmer, hvor længe de skal opbevares. Du kan se, når du har indhold i dit Clipboard, og du kan gå til Clipboard ved at klikke på items : Fra Clipboard kan du igen vælge at bestille, gemme i fil, E-maile, gemme i Collection el.lign. 12
3.2 Søgning med basens emneord / MeSH -søgning Som supplement til fritekstsøgning ovenfor, vises herunder, hvordan du kan udføre en mere præcis søgning ved at benytte PubMeds emneord, MeSH (Medical Subject Headings). En sådan søgning medtager som nævnt ikke de allernyeste artikler, der endnu ikke har fået tildelt disse emneord. Du vælger MeSH -basen: og skriver cerebrovascular accident i søgefeltet og trykker Search. Derved foretages en søgning efter emneord ikke efter artikler, da vi er i emneordsbasen / MeSH-basen. Så bliver du henvist til det kontrollerede emneord: Stroke. Her kan du læse definitionen på ordet, og du kan se synonymerne til Stroke 13
Tryk på Add to search builder. Herved rykker MeSH-ordet ind i boksen PubMed Search builder og du kan nu sætte en søgning i gang ved at trykke på: Search PubMed Men du kan også gentage en søgning på et andet MeSH-ord, f.eks. Rehabilitation 14
Mærk ordet af og så klik så igen på Add to search builder og vær opmærksom på, at der skal stå AND i boksen til højre: Nu kan der søges på to MeSH-ord på én gang. Klik så på Search PubMed Når man tilføjer: (nurse OR nurses OR nursing care) til søgningen, er resultatet omkring 240 hits. Vær opmærksom på, at de filtre, der blev lagt ind i forbindelse med fritekstsøgningen, er fastholdt: 15
4 Søgehistorie Uanset hvordan du vælger at søge, er det hensigtsmæssigt at gemme din søgehistorie: Vælg Advanced : og du kan se din søgehistorie under History : 16
Hvis du altid starter med at logge personligt ind (Sign in to NCBI), kan du genfinde dine søgninger fra de sidste 6 måneder. Hvis du ikke logger ind, gemmes dine søgninger i 8 timer på den PC el.lign., du har brugt. Selv om du er logget in, kan du med fordel printe søgehistorien ud eller gemme den elektronisk, f.eks. ved at tage en skærmkopi (alt + PrtScrn på en PC, cmd + shift + 3 (eller 4) på en MAC) og lægge den over i et word-dokument. Det giver det mest præcise billede af, hvordan du har bygget din søgning op. 5 Kombination af søgninger I stedet for at kombinere dine søge- eller emneord med det samme, kan du søge på dem hver for sig og efterfølgende kombinere: Gå til Advanced Klik på Add ud for den søgning, du vil bruge og vælg AND, hvis du vil søge med og. Herved tilføjes søgningen til Builder. Klik derefter på Add ud for den søgning, du vil kombinere med og vælg igen AND. Herved er begge søgningerne tilføjet Builder og du kan klikke på Search. revideret 5.12.2017 / ANDY. 17