Klinisk Mikrobiologisk Afdeling Årsberetning 2013

Transkript

1 Klinisk Mikrobiologisk Afdeling Årsberetning 2013

2 2 Forord 4 Medarbejdere på KMA 5 Produktion 6 Sådan finder du KMA midt i en byggeplads 9 Brug af UV-lys til at nedsætte biofilminfektioner på centrale venekatetre 10 Forenkling af prøvemodtagelse og transport med genetisk undersøgelse af fæcesprøver 12 Bioanalytiker holder foredrag på ECCMID i Berlin 13 ScandTick et samarbejde mod flåtbårne sygdomme 14 CFB-infect Cystisk Fibrose Børneinfektionsprojekt 16 Fagocytlaboratoriets beskrivelse af et forskningsprojekt fra Det erhvervsrettede uddannelseslaboratorium (UddX) 20 LUA Forum KMA og ISIM - et samarbejde om undervisning og forskning 24 Valgt til RegionH, Regionsrådet (Niels Høiby) 25 Professor i Klinisk Parasitologi (Jørgen Kurtzhals) 26 Bevilling: 2,5 mio. kr. til forskning i luftvejsinfektioner hos CF patienter (Helle Krogh Johansen) 27 Forskning i kroniske infektioner udløser pris og bevilling (Thomas Bjarnsholt) 28 EUROBIOFILMS Bedst i lysmikroskopi (Casper Hempel) 29 Publikationer Klinisk Mikrobiologisk Afdeling Årsberetning 2013 Ansvarlig for indhold: konstitueret klinikchef Liselotte Højgaard og ledende bioanalytiker Annette Dreyer Redaktion: Kommunikationsmedarbejder Mie Hørbo Layout: Eckardt ApS Print: Sangill Grafisk Udgivet maj 2014

3

4 Forord Tak til alle, der i 2013 har bidraget til den gode, faglige udvikling på Klinisk Mikrobiologisk Afdeling (KMA). Driften er blevet afviklet med høj faglig kvalitet til fordel for patienterne på Rigshospitalet, og forskningen er af høj kvalitet til gavn for morgendagens patienter nationalt og internationalt. KMA udførte analyser i 2013 og publicerede 60 videnskabelige arbejder (peer review artikler). KMA har et tæt samarbejde med Københavns Universitets Sundhedsvidenskabelige Fakultet, Institut for International Sundhed, Immunologi og Mikrobiologi, ISIM, både i relation til forskning og uddannelse af lægestuderende. Det gode samarbejde er meget værdsat. Overlæge Ph.d. Jørgen Kurtzhals blev udnævnt til professor i klinisk parasitologi 1. maj 2013 ved ISIM, KU Sund. Civilingeniør Thomas Bjarnsholt, laboratorieleder på KMA, forsvarede sin doktordisputats 31. maj 2013 på KU Sund. Disputatsen er udarbejdet i et samarbejde mellem KMA og ISIM. Thomas er pr. 1. marts 2014 udnævnt til professor ved ISIM, KU Sund. I året der er gået, blev overlæge Michael Tvede udnævnt som klinikchef pr. 1. februar 2013 og gik på pension 31. januar Professor Niels Høiby blev i november 2013 valgt til medlem af Regionsrådet i Region Hovedstaden, og KMA siger tillykke med den betydningsfulde post. I slutningen af året blev det besluttet, at rutinefunktionen på afsnit 7602 skulle lægges sammen med afsnit 9301 primo 2014 for at gøre det daglige arbejde mere hensigtsmæssigt for prøvetransport og personale på KMA. Det har været en stor logistisk udfordring, men takket være den brede opbakning fra alle ansatte på KMA, har flytning og ombygning forløbet ganske effektivt. Tak til alle på KMA for den store indsats i Tak for godt samarbejde til henvisende afdelinger på Rigshospitalet og tak for godt forskningsmæssigt samarbejde nationalt og internationalt. Annette Dreyer Ledende bioanalytiker Liselotte Højgaard, Professor, dr. med. Konstitueret klinikchef KMA fra Klinikchef Klinisk Fysiologi, Nuklearmedicin & PET 2 RIGSHOSPITALET, KLINISK MIKROBIOLOGISK AFDELING

5 Konstitueret klinikchef med stil og power Medio oktober 2013 tiltrådte Liselotte Højgaard som konstitueret klinikchef på KMA. Liselotte er klinisk fysiolog, klinikchef og professor på klinik for Fysiologi- Nuklearmedicin på Rigshospitalet, en afdeling der tegner ca. 200 ansatte. Liselotte har været, og er, en fantastisk hjælp og støtte i den periode hvor afdelingen har været uden en klinikchef, der er klinisk mikrobiolog. Der er pågået en stor udvikling i afdelingen, med organisatoriske ændringer og planlægning af opsætning af mulige analyser både inden for parasitologi og virologi. Afdelingen har fået den støtte der skulle til, for at sikre den gode udvikling på afdelingen kunne fortsætte inden for diagnostik, forskning og uddannelse. Afdelingen glæder sig over klinikchefstillingen blev opslået d. 8 marts 2014, og ser frem til ansættelse af den kommende klinikchef. På vegne af KMA, ledende bioanalytiker Annette Dreyer ÅRSBERETNING

6 Medarbejdere på KMA Afdelingsledelse Konstitueret klinikchef, professor, overlæge, dr. med. Liselotte Højgaard Ledende bioanalytiker, Annette Dreyer Overlæger Professor, overlæge, dr. med. Niels Høiby Professor, overlæge, Ph.d. Jørgen Kurtzhals Overlæge, dr. med. Helle Krogh Johansen Konstitueret overlæge, Ph.d. Claus Moser Overlæge Michael Tvede (indtil ) Læger Afdelingslæge, Ph.d. Claus Bohn Christiansen Vikarierende afdelingslæge, Ph.d. Zhijun Song 6 reservelæger i uddannelsesstillinger Forsknings- og laboratorieledere Professor, Ph.d. Thomas Bjarnsholt Peter Østrup Jensen, Ph.d. Nikolai Kirkby, Ph.d. Arsalan Kharazmi, Ph.d. Forskningsassistenter, Ph.d.-studerende og specialestuderende Bioanalytikere og hospitalsmedhjælpere Afdelingsbioanalytiker Vibeke Clausen Afdelingsbioanalytiker Maria Björnsdottir Konstitueret afdelingsbioanalytiker, Ala Nassereddin Bioanalytikerunderviser, Mette Jørgensen Bioanalytikerunderviser, Louise Thomsen 38 bioanalytikere/laboranter 2 Hospitalsmedhjælper Sekretariatet Kommunikationsmedarbejder og leder af sekretariatet Mie Hørbo 3 sekretærer Infektionshygiejnisk Enhed (selvstændig afdeling med laboratorier på KMA 7602) Overlæge Leif Percival Andersen Hygiejnesygeplejersker: Lisbeth Bergen (orlov til , vikar Suzanne Pollas) Helle Neustrup, vikar Anni Juhl-Jørgensen til 01/07/14. Sekretær Tanja Møller Andersen

7 Produktion Oversigt over afdelingens produktion gennem de sidste fem år som antal udførte analyser pr. år. Oversigten indeholder følgende områder: Bakteriologi, virologi, parasitologi og hospitalshygiejne. Analyser i alt ÅRSBERETNING

8 Sådan finder du KMA midt i en byggeplads RegionH udvider Rigshospitalet, ved at opføre en Nordfløj til behandling og forskning, et patienthotel, et parkeringshus og en sterilcentral. Den omfattende byggeproces medfører, at tilkørslen til Klinisk Mikrobiologisk Afdeling på Juliane Maries Vej 22 vil være ændret i 2014 og en del år frem. 6 RIGSHOSPITALET, KLINISK MIKROBIOLOGISK AFDELING

9 Universitetsparken JAGTVEJ Jagtvej Øster Allé Nørre Allé Henrik Harpestrengs Vej Fælledparken Frederik V s Vej Rig igshospitalet t Tagensvej Blegdamsvej Adgang fra Nørre Allé Kør ad Universitetsparken Drej til højre og følg Edel Sauntes Allé Drej til venstre ad Frederik V s Vej Drej til højre ad Henrik Harpestrengsvej Adgang fra Blegdamsvej Kør ad Frederik V s Vej Drej til venstre ad Henrik Harpestrengsvej Læs mere om Det Nye Rigshospital her: nythospital/menu/projektet/nordfloejen/ Nordfløjen.htm

10 8 RIGSHOSPITALET, KLINISK MIKROBIOLOGISK AFDELING

11 Brug af UV-lys til at nedsætte biofilminfektioner på centrale venekatetre V/ Konstitueret overlæge, Ph.d. Claus Moser Medicinske biofilminfektioner på fremmedlegemer er et velkendt problem. Særligt fremmedlegemer med kontakt til huden er udsatte, herunder urinvejskatetre, vejrtrækningstuber og centrale venekatetre. Biofilminfektioner kan ofte holdes nede med lokal antibiotika, eller ikke antibiotiske strategier som ethanoleller saltsyreskylning. Men oftest kan infektionerne ikke elimineres helt og på sigt, er man derfor tit nødt til helt at fjerne fremmedlegemet. 30 mill. kr. til konceptudvikling med UV-lys En ny strategi til at forebygge biofilminfektioner er udviklet fra lyslederteknologi og lysdioder, hvor viden om fototeknik og optik (drevet af hurtigere telekommunikation) kan bruges til udvikling af nyt medicinsk udstyr. UVlys er effektivt til at slå mikroorganismer ihjel, men har været teknisk vanskeligt at benytte. Den nyeste lyslederog polymerteknologi giver nu i samspil med udvikling af lysdioder mulighed for at lede UV-lys til netop de steder på udstyret, hvor biofilmen sidder - også inde i patientens krop. Lige inden jul 2013 har Forsknings- og Innovationsstyrelsen bevilget 30 mill. Kr. til at videreudvikle dette koncept ved en række innovative virksomheder samt én stor kateter producent, Teknologisk Institut og, Klinisk Mikrobiologisk Afdeling på Rigshosptalet.. Figur med angivelse af, hvor biofilminfektioner findes. Delt op i fremmedlegeme relaterede og i vævsrelaterede biofilminfektioner (fra Lebeaux et al. 2013). ÅRSBERETNING

12 Forenkling af prøvetagning og transport med genetisk undersøgelse af fæcesprøver V/ Cand.scient i parasitologi Anna Kildemoes og professor, overlæge, Ph.d. Jørgen Kurtzhals Klokken er kvart over tre og prøvemodtagelsen er lukket. Trafikproppen på Jagtvej vandt. Den stadig kropsvarme fæcesprøve gemt godt helt inde på maven er gået til spilde. Om igen i morgen. Kropstemperatur og kort transporttid er nemlig nødvendig for at bevare de skrøbelige tarmamøber, så de kan ses i mikroskop. Disse prøvekrav er en logistisk udfordring for både patienter og personale, som vi gerne vil gøre mere fleksible uden at give køb på kvaliteten. Verdenspremiere på parasit-panelkit til PCR-robot Detektion af parasit-dna med PCR-metoden er en oplagt og udbredt metode til at omgå behovet for intakte mobile amøber og et godt supplement til mikroskopi af tarmparasitter. Fæcesprøver er dog fulde af DNA fra mange kilder bl.a. mad, mikroflora og andre patogener, og desuden kan de indeholde stoffer, der hæmmer DNA-påvisningen. Begge dele kan give udfordringer for PCR-metodens følsomhed og specificitet. Derfor afprøver parasitlaboratoriet i samarbejde med Becton Dickinson i øjeblikket et parasit-panelkit til PCR platformen Giardia trofozoitter 10 RIGSHOSPITALET, KLINISK MIKROBIOLOGISK AFDELING

13 Kongres: Tropemedicin og International Sundhed mødtes i Tivoli kongrescenter 1100 deltagere var med, da de to traditionsrige kongresser slog pjalterne sammen i Tivoli Kongrescenter, til 4 intensive dage med 6 parallelle spor. kaldet BD-MAX. BD-MAX er en fleksibel kasettebaseret PCR-robot, som allerede bruges på daglig basis til detektion af toxin fra bakterien Clostridium difficile. Faktisk er der tale om en verdenspremiere, da vi er blandt de allerførste til at afprøve panelkittet, som tidligst lanceres på markedet i april De foreløbige resultater med BD-MAX Panelkittet detekterer tarmparasitterne Giardia lamblia, Cryptosporidium hominis/parvum og Entamoeba histolytica. Disse tre tarmparasitter forårsager typisk symptomer som diarré, som kan være langvarig og livstruende hos immunsvækkede personer, og de ses også hyppigt efter udlandsophold i områder med dårlige sanitære forhold. Vi afprøver kittet på fæcesprøver, som allerede er fundet positive ved mikroskopi for en række af forskellige tarmparasitter. De foreløbige resultater viser god følsomhed og specificitet for Giardia lamblia og Cryptosporidium hominis/parvum. Derimod viser Entamoeba histolytica sig lidt genstridig, og vi arbejder i øjeblikket på at forbedre sensitiviteten ved blandt andet at inkorporere et opkoncentreringstrin, inden prøven overføres til PCR robotten. Hvis vi opnår god følsomhed og specificitet for de tre protozoer vil panelkittet i fremtiden blive brugt som supplement til mikroskopi i rutinediagnostikken. Forhåbentlig vil dette betyde at behovet for friske varme fæcesprøver, leveret inden for få timer, daler til fordel for både patienter og personale. V/ Professor, overlæge, Ph.d. Jørgen Kurtzhals Tropemedicin og International sundhed har traditionelt fokuseret på infektionssygdomme, ikke mindst parasitinfektioner som malaria, bakterielle sygdomme som tuberkulose og virusinfektioner som HIV. Men verden i dag står overfor store udfordringer med ikke-smitsomme sygdomme som diabetes, hjerte-kredsløbssygdomme og cancer. Kongressen (den sep. 2013) afspejlede denne spændvidde i global sundhed. Antibiotikaresistente bakterier i Afrika Jørgen Kurtzhals, professor, overlæge, Ph.d. på Klinisk Mikrobiologisk Afdeling Rigshospitalet, fortæller: Kongressen havde en session om antibiotikaresistente bakterier i Afrika. Det var en nyskabelse i en tropemedicin kongres, og præsentationerne bevidnede, at det er på høje tid, at der bliver gjort en indsats på området. Det afrikanske marked er oversvømmet med antibiotika af dårlig kvalitet og fødevarer med antibiotikarester. Ikke mindst importerede varer, som afspejler, at Afrika stadig bruges til at skille sig af med produkter, som ikke kan sælges i andre dele af verden. Resultatet er blevet en skræmmende høj forekomst af multiresistente bakterier, som i mange tilfælde gør det næsten umuligt at behandle livstruende infektioner. Klinisk Mikrobiologisk Afdeling på Rigshospitalet havde en stor aktie i kongressen via medlemskab af den lokale organisationskomité og med chairpersons og præsentationer ved flere af sessionerne. p Læs mere om kongressen på

14 Bioanalytiker holder foredrag på ECCMID i Berlin ECCMID: European Congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases Hos alvorligt syge voksne og børn kan en influenza være dødelig, og det er vigtigt, at lægerne har en behandling der virker. Influenzavirus kan imidlertid udvikle resistens overfor tamiflu, som er et af de lægemidler, der findes til behandling af influenza. Konstitueret afdelingsbioanalytiker på Klinisk Mikrobiologisk Afdeling Alá Nassereddin, fortæller: -Jeg blev meget glad, da vores abstract blev optaget på ECCMID i Berlin. Det er første gang bioanalytikere fra vores afdeling får abstracts optaget på denne kongres, og så fik vi endda to abstracts med fra Klinisk Mikrobiologisk Afdeling. Men det var endnu større, da vi også blev inviteret til at holde foredrag. Det var noget af en mundfuld, at skulle stå overfor så mange læger og bioanalytikere og fremlægge resultater. Jeg var nervøs, men jeg gjorde det, og jeg vil til hver en tid gøre det igen, for det var en oplevelse! Alá Nassereddin har været med til at lave en undersøgelse af forekomsten af tamifluresistens hos patienter med længerevarende influenza A. Alá siger yderligere: -Det har virkelig været spændende og meningsfuldt at dykke ned i patienternes sygehistorier, indsamle og analysere data og dermed være med til at forsøge at optimere behandlingen hos alvorligt syge voksne og børn med Influenza. Jeg har desuden fået meget opbakning fra afdelingen og især min vejleder, afdelingslæge Claus Bohn Christiansen, har været en rigtig god vejleder. Det var også ham, samt den ledende bioanalytiker Annette Dreyer, der opfordrede mig til at sige ja til at præsentere vores resultater ved et foredrag på ECCMID. Og det er jeg rigtig glad for. 12 RIGSHOSPITALET, KLINISK MIKROBIOLOGISK AFDELING

15 ScandTick - et samarbejde mod flåtbårne sygdomme Seminar om flåtoverførte infektioner V/ Afdelingslæge, Ph.d. Claus Bohn Det er vigtigt, at vi deler vores forskningsresultater i ScandTick gruppen og også med øvrige interessenter, for på den måde at forbedre diagnostik og behandling af de patienter der bliver ramt af borrelia eller øst-europæisk hjernebetændelse. Torsdag d. 5. september 2013 afholdt arbejdsgruppen ScandTick seminar om flåtoverførte infektioner i Øresund-Kattegat-Skagerak regionen. Afdelingslæge på Klinisk Mikrobiologisk Afdeling Claus Bohn Christiansen var med til at arrangere programmet og fortæller: -Formålet med seminaret var at samle alle de personer der arbejder med flåtoverførte sygdomme i ScandTick regi for at udveksle idéer og planlægge det fremtidige samarbejde. Det er vigtigt, at vi deler vores forskningsresultater i ScandTick gruppen og også med øvrige interessenter, for på den måde at forbedre diagnostik og behandling af de patienter der bliver ramt af borrelia eller øst-europæisk hjernebetændelse. ÅRSBERETNING

16 CFB-infect Cystisk Fibrose Børneinfektionsprojekt Der ligger et mangeårigt forskningssamarbejde mellem Institut for System Biologi på DTU og KMA på Rigshospitalet til grund for projektet. Tilbage i 00 erne fokuserede vi på den kroniske Pseudomonas aeruginosa lungeinfektion hos cystisk fibrose (CF) patienterne. Her viste vi, at mange voksne CF patienter er inficeret med en af de to dominante kloner, som findes i CF-klinikken på Rigshospitalet, enten DK1 eller DK2. De to kloner har i mere end bakteriegenerationer tilpasset sig livet i CF lungerne. Den ene klon, DK1, har løbende tilpasset sig via genetiske forandringer så som hypermutabilitet, stor klon diversitet og sameksisterende kloner. Det er i modsætning til DK2 klonen, som har tilpasset sig ved helt fra begyndelsen af lungeinfektionen ved at akkumulere mutationer i 4 meget vigtige regulatoriske gener: muca og algt (mukoiditet), rpon (alternativ σ-faktor som er vigtig for transkriptionen) og lasr (quorum-sensing). For at undersøge hvad der sker i de første generationer før bakterier etablerer sig kronisk i lungerne hos CF patienterne, har vi i de sidste 8-10 år samlet de første og efterfølgende P. aeruginosa isolater fra øvre og nedre luftveje hos CF patienterne. Blandt de ca. 80 patienter som vi har longitudinelle isolater fra, har vi ud fra kliniske data, laboratorieoplysninger og antallet af isolater fra hver patient valgt 41 modelpatienter, hvorfra vi har hel-genomsekventeret mere end 500 isolater (Figur 1). CFB-infect gruppen består af 2 post.doc, 6 Ph.d.- studerende og 2 seniorforskere. I løbet af 2013 har vi etableret en række nationale og internationale samarbejder bl.a. med kolleger på DTU - Novo Nordisk Center for Biosustainability i Hørsholm (CfB) og på Nano-DTU, i Oxford, i Exeter, på Imperial College i London, på Stanford University, i San Diego, i Argentina, i Firenze, i Greifswald, i Madrid og i Grenoble. Hovedformålet med vores CFB-infect aktiviteter er at arbejde så translationelt som muligt. Det betyder, at de resultater vi opnår gerne skulle kunne bruges i klinikken, Figur 1. Prøve-flow fra A) patient til B) genomsekventering til C) bioinfomatiske analyser og fylogenetiske træer som illustrerer slægtskabet mellem de forskellige bakterielle kloner hos CF patienterne. 14 RIGSHOSPITALET, KLINISK MIKROBIOLOGISK AFDELING

17 V/ Overlæge, dr. med., Novo Nordisk Fonds Klinisk Forskningsstipendiat Helle Krogh Johansen, post.doc, Ph.d. Rasmus Lykke Marvig og professor, Ph.d. Søren Molin. Hovedformålet med vores CFB-infect aktiviteter er at arbejde så translationelt som muligt. Det betyder, at de resultater vi opnår gerne skulle kunne bruges i klinikken, fx til tidligere diagnostik af bakterieinfektioner samt give os større viden om persistens med særlig fokus på patho-adaptive mutationer hos bakterierne. fx til tidligere diagnostik af bakterieinfektioner samt give os større viden om persistens med særlig fokus på patho-adaptive mutationer hos bakterierne. De bioinformatiske resultater for de første 500 genomsekvenser er ved at være færdiganalyseret. Derudover har vi fokuseret på persistente versus non-persistente kloner, patho-adaptive mutationer og diversitet i de 53 forskellige klontyper som vi har fundet i vores børnepatienter (Figur 2). Desuden har vi arbejdet med mikrobiomer blandt de kronisk inficerede patienter og har fokus på resistensudvikling og kendte og ukendte mutationer i relation til de antibiotikabehandlinger, som benyttes i CF-klinikken. I det kommende år planlægger vi et stort projekt om metabolisme og Genome Scale Models (GSM) samt transkriptom undersøgelser på udvalgte isolater, hvor vi vil se nærmere på two-component switch systemer. Figur 2. Oversigt over 474 longitudinelt indsamlede og genomsekventerede P. aeruginosa isolater fra 34 cystisk fibrose patienter. Hvert symbol repræsenterer et sekventeret isolat. Akserne angiver dels årstallet hvor isolatet er dyrket dels fra hvilken CF patient isolatet stammer. Vi vil gerne takke alle bioanalytikere og sekretærer på KMA for den store hjælp og interesse, som I alle udviser for at få dette projekt til at fungere tusind tak. ÅRSBERETNING

18 Inside out. Udsigt fra den anaerobe bænk, hvor Fagocytlaboratoriet undersøger betydningen af host-depleted og host-derived elektron-acceptorer for udviklingen af infektion. 16 RIGSHOSPITALET, KLINISK MIKROBIOLOGISK AFDELING

19 Fagocytlaboratoriets beskrivelse af et forskningsprojekt fra 2013 V/ Forskningsleder Ph.d. Peter Østrup Jensen I 2013 fik Fagocytlaboratoriets antaget et studie om lattegas (N 2 O) produktion i sputum fra cystisk fibrose (CF) patienter med kronisk Pseudomonas aeruginosa lungeinfektion til publikation. Vores opdagelser I CF sputum har vi tidligere vist, at aktive neutrophilocytter accelererer iltsvindet ved at danne reaktive oxygen og nitrogen arter, samt at aerob respiration kun forbruger ilt i ringe grad. Derfor mener vi, at det intensive neutrophilocyt respons påvirker mikromiljøet i CF patienters inficerede endobronkiale mukus ved at skabe iltsvind og øge mængden af nitrat (NO 3- ) og nitrit (NO 2- ). Da der er observeret vækst af P. aeruginosa i CF sputum, forventede vi at, P. aeruginosa i CF sputum kan opnå energi til vækst, ved anerob respiration vha. dentrifikation. For at demonstrere denitrifikation brugte vi mikrosensorer til at undersøge dynamikken af N 2 O indholdet i sputum fra inficerede CF patienter. Vi fandt lokal produktion og forbrug af N 2 O i iltfrie områder af sputum. Desuden fandt vi et forbrug af NO 3 - og NO 2-, der er nødvendige som elektron acceptorer ved denitrifikation. På baggrund heraf foreslår vi, at P. aeruginosa tilpasser sig neutrophilocytternes fjernelse af ilt og forsyning af NO 3 - og NO 2-, ved at anvende denitrifikation for at opnå energi. Bakteriers evne til at tilpasse sig til iltsvind kan have konsekvens for forløbet af infektionen. Vi har allerede vist, at tilgængeligheden af ilt påvirker aktiviteten af antiobiotika, idet den baktericidale aktivitet af ciprofloxacin nedsættes ved dentrifikation under iltfrie forhold, mens den baktericidale aktivitet af colistin øges. Desuden er vi færd med at undersøge, om P. aeruginosa kan anvende denitrifikation ved fysiologiske koncentrationer af NO 3 - til at opnå vækstrater, der tilsvarer vækstrater observeret i CF sputum og lunger, og om dentrifikation kan bidrage til CF pathogeners evne til at forårsage lungeskader. Undersøgelserne foregår på KMA og er baseret på samabejde med kliniske mikrobiologer, pædiatrikere, civilingeniører, farmaceuter, mikrobiologer, marinbiologer og zoologer fra bla. Rigshospitalets Børneafdeling GGK- 5003, Københavns Universitet, Tyskland, England, USA og Japan. Microsensor måling af N 2 O og O 2 gradienter i sputum. (A) Nærbillede af microsensor i sputum prøve fra cystic fibrosis patient med kronisk P. aeruginosa lunge infektion. (B) Repræsentative microprofiler af N 2 O og O 2 i en CF sputum prøve. (C) Model af de involverede PMN- and biofilm processer i CF sputum til forklaring af microprofilerne. ÅRSBERETNING

20 Det erhvervsrettede uddannelseslaboratorium (UddX) Undervisning, uddannelse samt nye metoder og arbejdsgange Klinisk Mikrobiologisk Afdeling (KMA) deltager gennem projektet det erhvervsrettede uddannelseslaboratorium aktivt i uddannelsesudvikling og strategisk ledelse med de 4 andre laboratoriemedicinske specialer - Klinisk Biokemisk Afdeling, Klinisk Immunologisk Afdeling, Klinisk Fysiologi & Nuklearmedicin og Patologi Afdelingen - under Diagnostisk center, Rigshospitalet, samt tværfagligt med Professionshøjskolen Metropol. KMA er med til at udvikle og styrke samarbejdet i forbindelse med uddannelse/kompetenceudvikling i egen afdelingen samt på tværs af de laboratoriemedicinske specialer både i forbindelse med bioanalytikerstuderende og fast personale. Hvad er det erhvervsrettede uddannelseslaboratorium Det erhvervsrettede uddannelseslaboratorium - UddX er et forandringsprojekt, der har til formål at udvikle innovative løsninger, der knytter sig til de erhvervsrettede uddannelser bl.a. professionsuddannelser, indenfor læring, undervisning, organisation og ledelse. Initiativet til forandringsprojektet er taget af Teknisk Erhvervsskole Center og Professionshøjskolen Metropol og er støttet af Region Hovedstaden og Den Europæiske Socialfond. Projektet startede i januar 2012 og løber frem til udgangen af Rigshospitalet samarbejder med Professionshøjskolen Metropol, begge indenfor bioanalytikeruddannelsen. Projektets metoder består af uddannelseseksperimenter indenfor 5 overordnede programmer, hvoraf Rigshospitalet deltager i følgende 2 programmer samt et eksperiment udenfor program; kk Program 2: Nye samspilsformer mellem uddannelse og erhverv. Praksislæring på nye måder kk kk Program 3: Den eksperimenterende organisation. Nye ledelsesformer og samarbejdsrelationer Eksperimentpuljen: Makkerpar. Transfer mellem studerende og færdiguddannet bioanalytiker. Ideen er at arbejde med en eksperimenterende tankegang via hypoteser. KMA s rolle i det det erhvervsrettede uddannelseslaboratorium Annette Dreyer, ledende bioanalytiker, Mette Jørgensen, bioanalytikerunderviser og Louise Thomsen, bioanalytikerunderviser er alle med i Rigshospitalets interne styregruppe for uddannelseslaboratoriet. KMA er aktive i eksperimenterne strategisk ledelse, videnswop og makkerpar. Christine Dao Pedersen, bioanalytiker er repræsenteret som ambassadør for uddannelseslaboratoriet. Fremtidsperspektiv KMA håber på, at den eksperimenterende tankegang vil kunne leve videre og udbredes i afdelingen efter projektets afslutning, således at de indsatser der har været i fokus i det erhvervsrettede uddannelseslaboratorium vil styrke de eksisterende samarbejdsflader på Rigshospitalet og med Professionshøjskolen Metropol, samt at KMA s studerende og faste personale vil underbygge et uddannelsesmiljø, der generer ny viden til fremtidens diagnostik og behandling. R Læs mere om Det erhvervsrettede uddannelseslaboratorium på: Kort beskrivelse af projektet: uploads/2013/03/det-erhvervsrettedeuddannelseslaboratorium-folder.pdf 18 RIGSHOSPITALET, KLINISK MIKROBIOLOGISK AFDELING

21 V/ Bioanalytikerunderviser Louise Thomsen Eksperimenthjulet illustrerer de fire faser i uddannelseseksperimentets flow og er et centralt værktøj for den eksperimenterende metode i Uddannelseslaboratoriet. Metodetilgangen er at arbejde ud fra en forandringsteori til uddannelsessektoren som eksperimenterende tilgang fra tænkning til konkrete metoder. VIDEN/HANDLING/PRAKSIS DER VIRKER Planlæg transformation (Formulering og målsætning) Hvilke hypoteser testes? Hvad skal eksperimentet forbedre/forandre? VIDEN/HANDLING/PRAKSIS DER UDVIKLES Revidering eller implementering Hvad skal udbredes? Hvad skal stoppes? Hvad skal korrigeres? Hvad skal fastholdes? Hvad kan implementeres? Udfør eksperiment Hvad sker der? Hvordan sker det? VIDEN/HANDLING/PRAKSIS DER UDFORDRES Evaluer (analyser) eksperiment Hvad blev bedre (effekter)? Hvordan blev det bedre? Hvad blev anderledes? Hvordan blev det anderledes? Hvilke barrierer opstod? VIDEN/HANDLING/PRAKSIS AFPRØVES

22 LUA Forum 2013 netværk for bioanalytikere på mikrobiologiske afdelinger i Danmark PCR metoder, kommunikation i hverdagen og kickstart af nationalt mikrobiologisk vidensnetværk for bioanalytikere. Sådan lød de centrale emner til dette års LUA Forum, der blev afholdt 7. og 8. november 2013 med Rigshospitalets Klinisk Mikrobiologisk Afdeling (KMA) som vært og arrangør. LUA-Forum er et årligt tilbagevendende møde for ledende bioanalytikere, bioanalytikerundervisere og afdelingsbioanalytikere på landets klinisk mikrobiologiske afdelinger. Vi sætter kommunikation og netv ærk på dagsorden Ledende bioanalytiker Annette Dreyer, KMA Rigshospitalet fortæller; -LUA Forum er noget jeg ser meget frem til, da vi her får mulighed for at netværke og dele viden med de andre KMA er i landet. Der er meget at hente, da vi langt hen ad vejen står med de samme faglige og organisatoriske udfordringer. Men ét årligt møde er ikke meget til alle de løbende udfordringer som f.eks. indkøb af nyt apparatur, 20 RIGSHOSPITALET, KLINISK MIKROBIOLOGISK AFDELING

23 Som bioanalytikere kan vi helt sikkert bruge hinanden meget mere og dele ny viden og erfaringer. Derfor greb vi chancen og satte kommunikation og netværk på dagsorden til LUA-forum nye molekylærbiologiske metoder og organisationsudvikling. Som bioanalytikere kan vi helt sikkert bruge hinanden meget mere og dele ny viden og erfaringer. Derfor greb vi chancen og satte kommunikation og netværk på dagsorden til LUA-forum Nyhedsbrev som begynderplatform for mere netværk Kommunikationsmedarbejder, KMA Rigshospiatalet, Mie Hørbo fortæller; -På LUA Forum var der god opbakning til ideen om at skabe mere netværk mellem bioanalytikerne på de mikrobiologiske afdelinger. I første omgang vil vi i 2014 søsætte et elektronisk nyhedsbrev, hvor det er bioanalytikerne selv, der byder ind med relevante nyheder fra egen afdeling med undertegnede som redaktør. Det er et forsøg, og vi er spændte på om en øget indsigt i hvad der rører sig på de andre KMA er, kan skabe grobund for mere samarbejde på tværs af landet. Hvis der opstår behov for andre platforme, f.eks. et webforum, en vidensdatabase eller mere fagspecifikke netværksgrupper, evt. også med andre faggrupper på KMA erne, så tager vi den derfra og handler på de reelt erfarede behov. I første omgang skyder vi ressourcerne efter et nyhedsbrev for bioanalytikere på de 12 mikrobiologiske afdelinger. Øvrige LUA emner: Dengue diagnostik, PCR, ledelse og motivation LUA Forum 2013 bød også på spændende faglige oplæg om Dengue Diagnostik samt PCR til parasit diagnostik og opsætning af multiplex-pcr til undersøgelse af fæcesprøver for patogene tarmbakterier. På den mere humanistiske bane var der oplæg fra KMA s bioanalytikerundervisere Mette Jørgensen og Louise Thomsen, om kommunikation og motivation i undervisningen. Institutchef på Professionshøjskolen Metropol i København, Tue Sanderhage, bød ind med et oplæg om ledelsestendenser i et uddannelsesperspektiv. ÅRSBERETNING

24 KMA og ISIM - et samarbejde om undervisning og forskning V/ Professor, overlæge, Ph.d. Jørgen Kurtzhals og Bioanalytiker Christine Huong Dao Pedersen KMA har igennem en lang årrække haft et tæt parløb med Institut for International Sundhed, Immunologi og Mikrobiologi (ISIM, på Københavns Universitet. Dette samarbejde drejer sig om både forskning og undervisning. KMA har to professorer og en række andre forskningsmedarbejdere involveret i biofilmforskning sammen med ISIM, og de involverede forskningsgrupper hører internationalt til i den absolutte elite. Ligeledes har KMA en professor og et malariaforskningsteam, som indgår i ISIMs Center for Medicinsk Parasitologi (CMP, CMP er internationalt anerkendt for sin malariaforskning og er desuden dybt engageret i opbygning af universiteter i Afrika. På undervisningsområdet er KMAs professorer ansvarlige for den obligatoriske undervisning i klinisk mikrobiologi på lægestudiet på Københavns Universitet, og en række af afdelingens øvrige læger tager del i forelæsninger og øvelseskurser. Dertil kommer en række vejlederopgaver på bachelor-, kandidat- og PhD-niveau. Sidst men ikke mindst spiller KMAs bioanalytikere en vigtig rolle for øvelseskursus i klinisk mikrobiologi, idet de i semestermånederne løbende forbereder bakteriekulturer, reagenser og sørger for gode rammer til de lægestuderende. En af de bioanalytikere er Christine Huong Dao Pedersen, der fortæller: Nødvendigt at være et skridt foran Vi starter allerede forberedelserne til de medicinstuderendes øvelseskurser en uge før kursus start, så vi er sikre på, at vores kollektion af bakteriekulturer er vokset godt frem og uden forurening. Under forberedelserne tænker vi hele tiden et skridt foran og laver ekstra bakteriekulturer/dyrkningsmedier i tilfælde af bakteriekulturer, som ikke vokser frem, som forventet. Herudover skal der også tænkes på de øvelser, de studerende skal lave dagen efter, da de bakteriekulturer ligeledes skal forberedes og indkuberes i varmeskab natten over. Udfordrende arbejde Arbejdet på Panum er utroligt udfordrende, da der er ca. 90 medicinstuderende, som er afhængig af, at det forberedende arbejde man har lavet, er 100% i orden. Er det forberedende arbejde ikke i orden, vil de studerende få svært ved at udføre deres øvelser. Det giver en stor tilfredshed, når et semester er veloverstået og alt gik som det skulle. 22 RIGSHOSPITALET, KLINISK MIKROBIOLOGISK AFDELING

25 ÅRSBERETNING

26 Professor, overlæge, dr. med. Niels Høiby RegionH, Regionsrådet Prof. overlæge dr. med Niels Høiby blev valgt til medlem af RegionH - Regionsråd ved valget d. 19 november 2013, og tiltrådte pr. 1 januar KMA siger hjertelig tillykke og tak fordi Niels vil stille op for almenvellet. Liselotte Højgaard Annette Dreyer 24 RIGSHOSPITALET, KLINISK MIKROBIOLOGISK AFDELING

27 Professor, overlæge og Ph.d. Jørgen Kurtzhals Professor i Klinisk Parasitologi Overlæge og Ph.d. Jørgen Kurtzhals blev udnævnt til professor i klinisk parasitologi. ÅRSBERETNING

28 Overlæge, dr. med. Helle Krogh Johansen Bevilling: 2,5 mio. kr. til forskning i luftvejsinfektioner hos cystisk fibrose patienter 1. februar 2013 tog overlæge dr. med. Helle Krogh Johansen den bevilling i brug, som blev givet i Bevillingen var et femårigt klinisk forskerstipendium fra Novo Nordisk Fonden på 2,5 mio kr. til projektet Etablering og persistens af luftvejsinfektioner hos cystisk fibrose patienter. Projektet foregår på klinisk mikrobiologisk afdeling og på CF-klinikken på Rigshospitalet og på Novo Nordisk Fondens Center for Biosustainability i Hørsholm. 26 RIGSHOSPITALET, KLINISK MIKROBIOLOGISK AFDELING

29 Professor, Ph.d. Thomas Bjarnsholt Forskning i kroniske infektioner udløser pris og bevilling i 2013 Civilingeniør, og nu også professor, Thomas Bjarnsholt fra Klinisk Mikrobiologisk Afdeling modtog i 2013 Young Investigator Award for sin forskning i klinisk mikrobiologi og infektionssygdomme. Professor, Ph.d. Thomas Bjarnsholt forsvarer sin medicinske doktordisputats The role of bacterial biofilms in chronic infections (2013). Prisen uddeles af The European Society of Clinical Microbiology and infectious diseases (ESCMID). Thomas Bjarnsholt har modtaget prisen for sit enestående arbejde med kroniske infektioner, hvor han og hans kolleger har demonstreret innovative resultater i bekæmpelsen af resistente bakterier. Thomas Bjarnholt modtog desuden en bevilling på 10 mio. kr. fra Lundbeckfonden til videre forskning i behandling af kroniske infektioner var også året hvor Thomas Bjarnsholt forsvarede sin medicinske doktordisputats The role of bacterial biofilms in chronic infections. Thomas blev 1. marts 2014 udnævnt til professor ved ISIM, KU, Sund. ÅRSBERETNING

30 EUROBIOFILMS 2013 I september 2013 blev den 3. europæiske mikrobiologiske kongres om biofilm afholdt i Ghent, Belgien. Professor Niels Høiby (tv) og professor Thomas Bjarnsholt (th) fra Klinisk Mikrobiologisk Afdeling var medarrangører af kongressen. Bedst i lysmikroskopi Core faciliteten for integrated microscopy på Panum, arrangerede en konkurrence i 2013 hvor post.doc Casper Hempel, Klinisk Mikrobiologisk Afdeling, vandt i kategorien lysmikroskopi. Billede viser sukkerstoffer i hjernens blodkar, taget med elektronmikroskopi. Den lille bjælke nederst til højre har en længde af 0,0001 (en titusindedel) millimeter 28 RIGSHOSPITALET, KLINISK MIKROBIOLOGISK AFDELING

31 Publikationer Rådgivning og information Klinisk Mikrobiologisk Afdeling deltager dagligt i 2-5 konferencer på kliniske afdelinger (22/uge) samt fører tilsyn af patienter og har telefonkontakt til klinikerne. Afdelingen rådgiver også i klinisk mikrobiologiske spørgsmål til Grønland og Færøernes sundhedsvæsener. Udvikling og forskning Ph.d. afhandlinger i 2013: Hengzhuang Wang: Pharmacodynamics and Pharmacokinetics of antibiotics on Pseudomonas aeruginosa biofilms. Klinisk Mikrobiologisk Afd., Rigshospitalet, 10. april Lone Rasmussen: Helicobacter pylori. Susceptibility testing and screening for antibacterial and antiadhesive effects in extracts from tea mushroom and fish. Klinisk Mikrobiologisk Afd., Rigshospitalet, 13. december Doktordisputatser i 2013: Thomas Bjarnsholt: The role of bacterial biofilms in chronic infections Københavns Universitet den 31. maj A Artikler trykt i 2013: 1 Adjei GO, Goka BQ, Kitcher E, Rodrigues OP, Badoe E & Kurtzhals JAL: Reversible audiometric threshold changes in children with uncomplicated malaria. Journal of Tropical Medicine. E-pub , Amnitzbøl SE & Høiby N: Fireårsreglen har spillet fallit. Jyllands-Posten (debatindlæg), Arendrup MC, Dzajic E, Jensen RH, Johansen HK, Kjældgaard P, Knudsen JD, Kristensen L, Leitz C, Lemming LE, Nielsen L, Olesen B, Rosenvinge FS, Røder BL, Schønheyder HC: Epidemiological changes with potential implication for antifungal prescription recommendations for fungaemia: data from a nationwide fungaemia surveillance programme. Clin. Microbiol. Infect. 19:E343-53; Aanaes K, Buchwald C, Hjuler T, Skov M, Alanin M, Johansen HK: The effect of sinus surgery with intensive follow-up on pathogenic sinus bacteria in patients with cystic fibrosis. Am. J. Rhinol. Allergy 27:1-4; Aanæs K, Johansen HK, Poulsen SS, Pressler T, Buchwald C von, Høiby N: Secretory IgA as a diagnostic tool for early Pseudomonas aeruginosa colonization. J. Cystic Fibrosis 12:81-87; Aanæs K, Johansen HK, Skov M, Buchwald FF, Hjuler T, Pressler T, Høiby N, Nielsen KG, Buchwald C von: Clinical effects of sinus surgery and adjuvant therapy in cystic fibrosis patients can chronic lung infection be postponed? Rhinology 51: ; Bjarnsholt T: The role of bacterial biofilms in chronic infections (Doctoral thesis). APMIS Suppl.136:1-58; Bjarnsholt T, Alhede M, Alhede M, Eickardt-Sørensen SR, Moser C, Kühl M, Jensen PØ, Høiby N: The in vivo biofilm. Trends in Microbiology 21:466-74; Bjarnsholt T, Ciofu O, Molin S, Givskov M, Høiby N: Applying insights from biofilm biology to drug development can a new approach be developed? Nature Reviews Drug Discovery. 12: ; Buhl M, Thybo S, Kurtzhals JAL, Møller NE, Vestergaard LS, Gade K, Andersen PH & Christiansen AH: Beskyttelse af den gravide rejsende. EPI-nyt 2013; uge 26A. 11 Buhl M, Thybo S, Kurtzhals JAL, Møller NE, Vestergaard LS, Gade K, Andersen PH & Christiansen AH: Opdatering af SSIs forslag til vaccination ved udlandsrejse. EPI-nyt 2013; uge 26A. 12 Buhl M, Thybo S, Kurtzhals JAL, Møller NE, Vestergaard LS, Gade K, Andersen PH & Christiansen AH: Vaccinationsforslag ved udlandsrejse. EPI-nyt 2013; uge 26B. 13 Cavanagh P, Granslo HN, Freidheim EA, Christophersen L, Jensen PØ, Thomsen K, van Gennip M, Klingenberg C, Flaegstad T, Moser C: Efficacy of a synthetic antimicrobial peptidomimetic versus vancomycin in a Staphylococcus epidermidis device-related murine peritonitis model. JAC 68: ; Chiang W-C, Nilsson M, Jensen PØ, Høiby N, Nielsen TE, Givskov M, Tolker-Nielsen T: Extracellular DNA shields against aminoglycosides in Pseudomonas aeruginosa biofilms. Antimicrob. Agents Chemother. 57: ; Chiduo M, Theilgaard ZP, Bakari V, Mtatifikolo F, Bygbjerg I, Flanholc L, Gerstoft J, Christiansen CB, Lemnge M, Katzenstein TL: Prevalence of sexually transmitted infections among women attending antenatal clinics in Tanga, north eastern Tanzania. Int. J. STD AIDS 23:325-9; Christensen L, Breiting V, Bjarnsholt T, Eickhardt S, Høgdall E, Janssen M, Pallua N, Zaat SA: Bacterial Infection as a Likely Cause of Adverse Reactions to Polyacrylamide Hydrogel Fillers in Cosmetic Surgery. Clin. Infect. Dis. 56: ; Christensen LD, van Gennip M, Rybtke MT, Wu H, Chiang W-C, Alhede M, Høiby N, Nielsen TE, Givskov M, Tolker- Nielsen T: Clearance of Pseudomonas aeruginosa foreign body biofilm infections through reduction of the c-di-gmp level in bacteria. Infect. Immun. 81: ; Ciofu O, Hansen CR, Høiby N: Respiratory bacterial infections in cystic fibrosis. Curr. Opin. Pulm. Med. 19:251-8: Ciofu O, Johansen HK, Aasnæs K, Wassermann T, Alhede M, Buchwald C von, Høiby N: ÅRSBERETNING

32 P. aeruginosa in the paranasal sinuses and transplanted lungs have similar adaptive mutations as isolates from the chronically infected CF lungs. J. Cystic Fibrosis 12: ; Claussen A, Jakobsen TH, Bjarnsholt T, Givskov M, Welch M, Ferkinghoff-Borg J, Sams T: Kinetic Model for Signal Binding to the Quorum Sensing Regulator LasR. Int. J. Mol. Sci. 14: ; Dahl A, Rasmussen RV, Bundgaard H, Hassager C, Bruun LE, Lauridsen TK, Moser C, Søgaard P, Arpi M, Bruun NE: Enterococcus faecalis infective endocarditis: a pilot study of the relationship between duration of gentamicin treatment and outcome. Circulation. 127:1810-7; Dalbøge C, Pressler T, Høiby N, Nielsen KG, Johansen, HK: A cohort study of the Copenhagen CF centre eradication strategy against Staphylococcus aureus in patients with CF. J. Cystic Fibrosis 12:42-48; DellaValle B, Staalsoe T, Kurtzhals JAL, Hempel C: Effects of hydrogen sulfide gas on Plasmodium falciparum growth and the development of cerebral malaria. PLoS One 8: e59271, Duus LM, Høiby N, Wang M, Schiøtz O, Nørskov-Lauritsen N: Bacteria of the genus Dyella can chronically colonize the airways of patients with cystic fibrosis and elicit a pronounced antibody rtesponse. Internat. J. Med. Microbiol. 303: ; Eickhardt S, Braendstrup P, Clasen-Linde E, Jensen KE, Alhede M, Bjarnsholt T, Høiby N, Vindeløv L, Moser C: A non-fatal case of invasive zygomycete (Lichtheimia corymbifera) infection in an allogeneic haematopoietic cell transplant recipient. APMIS 121:456-9; Goetz LL, Cardenas DD, Kennely M, Bonne Lee BS, Linsenmeyer T, Moser C, Pannek J, Wyndaele JJ, Biering- Sørensen F: International Spinal Cord Injury Tract Infection Basic Data Set. Spinal Cord 51:700-4; Gutu A, Sgambati N, Strasbourger P, Brannon M, Jacobs M, Haugen E, Kaul R, Johansen HK, Høiby N, Moskowitz S: Polymyxin resistance of Pseudomonas phoq mutants is dependent on additional two-component regulatory systems. Antimicrob Ag Chemother. 57: ; Hansson HH, Kurtzhals JA, Goka BQ, Rodriques OP, Nkrumah FN, Theander TG, Bygbjerg IC, Alifrangis M: Human genetic polymorphisms in the Knops blood group are not associated with a protective advantage against Plasmodium falciparum malaria in Southern Ghana. Malaria J. 12:400; Hartmeyer GN, Høgh S, Chen M, Holt H, Skov MN, Kemp M: Need for species-specific detection for the diagnosis of amoebiasis in a non-endemic setting. Scandinavian Journal of Infectious Diseases. 45:868-71; Holler JG, Röser D, Nielsen HV, Eickhardt S, Chen M, Lester A, Bang D, Frandsen C, David KP: A case of human Babesiosis in Denmark. Travel Med. Infect. Dis. 11:324-8; Høiby N: Alle angreb tilbagevises. Berlinske Tidende (debatindlæg), Høiby N: Diskrimination af læger. Jyllands-Posten (debatindlæg), Høiby N: Prioritering eller rationering i hovedstadsregionen. Jyllands-Posten (debatindlæg), Høiby N: Sundhedsministerens kvalifikationer igen. Jyllands-Posten (debatindlæg), Høiby N, Elborn S, Heijerman H, Dubois C, Worlitzsch D: Orbituary for professor dr. Gerd Döring. J. Cystic Fibrosis 12: ; Høiby N, Geertsen M, Abildgaard M: Verdens bedste sundhedsvæsen 40 år efter. Berlingske Tidende (debatindlæg), Iversen K, Høst N, Bruun NE, Elming H, Pump B, Christensen JJ, Gill S, Rosenvinge F, Wiggers H, Fuursted K, Holst-Hansen C, Korup E, Schønheyder HC, Hassager C, Høfsten D, Larsen JH, Moser C, Ihlemann N, Bundgaard H: Partial oral treatment of endocarditis. Am. Heart J. 165:116-22; Jacobsen TH, Bjarnsholt T, Jensen Ø, Givskov M, Høiby N: Targeting quorum sensing in Pseudomonas aeruginosa biofilms: current and emerging inhibitors. Future Microbiology 8: ; Jakobsen TH, Hansen MA, Jensen PØ, Hansen L, Riber L, Cockburn A, Kolpen M, Hansen CR, Eickhardt S, Hansen M, Kerpedjiev P, Alhede M, Qvortrup K, Burmølle M, Moser C, Kühl M, Ciofu O, Givskov M, Sørensen SJ, Høiby N, Bjarnsholt T: Complete Genome Sequence of the Cystic Fibrosis Pathogen Achromobacter xylosoxidans NH Complies with Important Pathogenic Phenotypes. PLOS One 8 (7):1-17; 2013, published , e Jia W, Xiao X, Zhijun Song Z, Hong Wu H: Basis of Medical Microecology. In: Xuedong Zhou & Wenyuan Shi (ed): Oral Microecology (in Chinese), p 1-12, Chapter One. People s Health Publishing House, Beijing 2013 July. ISBN Jørgensen KM, Wassermann T, Jensen PØ, Wang H, Molin S, Høiby N, Ciofu O: Sub-lethal cicprofloxacin treatment leads to rapid development of high-level ciprofloxacin resistance during long-term experimental evolution of Pseudomonas aeruginosa. Antimicrob. Agents Chemother.57: ; Karlsson M, Hempel C, Sjövall F, Hansson MJ, Kurtzhals JAL, Elmér E: Brain mitochondrial function in a murine model of cerebral malaria and the therapeutic effects of rhepo. Int. J. Biochem. Cell Biol. 45: ; Kruse AY, Chuong T, Phuong CN, Duc DT, Stensballe LG, Prag J, Kurtzhals JAL, Greisen G, Pedersen FK: Neonatal Blood Stream Infections in a Pediatric Hospital in Vietnam: A cohort study. Journal of Tropical Pediatrics 59: ; Larsen T, Ciofu O, Moesby L, Kirkevang L, Poulsen AH: Anvendelse af antibiotika i Tandlægepraksis. Tandlægebladet. 117: ; Nonnemann B, Tvede M, Bjarnsholt T: Identification of pathogenic microorganisms directly from positive blood vials by matrix-assisted laser desorption/ ionization time of flight mass spectrometry. APMIS 121:871-7; Rammer P, Calum H, Moser C, Björnsdottir MK, Smedegaard H, Høiby N, Bjarnsholt T: Dietzia papillomatosis bacteriemia. J. Clin. Microbiol. 51:1977-8; Rostved AA, Sassi M, Kurtzhals JAL, Sørensen SS, Rasmussen A, Ross C, Gogineni E, Huber C, Kutty G, Kovacs JA, Helweg-Larsen J: Outbreak of Pneumocystis pneumonia in renal and liver transplant patients caused by genotypically distinct strains of Pneumocystis jirovecii. Transplantation 96: ; RIGSHOSPITALET, KLINISK MIKROBIOLOGISK AFDELING

33 48 Salomonsen CM, Boye M, Høiby N, Jensen TH, Hammer AS: Comparison of histopathological lesions in acute hemorrhagic penumonia in mink associated with Pseudomonas aeruginosa or Escherichia coli. Canadian Journal of Veterinary Research, 77: ; Salomonsen CM, Chriél M, Jensen TH, Rangstrup- Christensen L, Høiby N, Hammer AS: Effect of infectious dose and season on development of hemorrhagic pneumonia in mink caused by Pseudomonas aeruginosa. Can. J. Veterinary Research, 77: ; Salomonsen CM, Themudo GE, Jelsbak L, Molin S, Høiby N, Hammer AS: Typing of Pseudomonas aeruginosa from hemorrhagic pneumonia in mink. Veterinary Microbiology 163: ; Song Z, Borgwardt L, Høiby N, Wu H, Sandberg Sørensen T, Borgwardt A: Prosthesis infections after orthopedic joint replacement. The possible role of bacterial biofilms. Orthopedic Reviews 5:65-71; Søe NH, Jensen NV, Nürnberg BM, Jensen AL, Koch J, Stehen Poulsen SS, Pier GB, Johansen HK: A novel knee prosthesis model of implant-related osteomyelitis in rats. Acta Orthop. 84:92-7; Tan SY, Chua SL, Liu Y, Høiby N, Andersen LP, Givskov M, Song Z, Yang L: Comparative genomic analysis of rapid evolution of an extreme-drug-resistant Acinetobacter baumannii clone. Genome Biol. Evol. 5:807-18; Trøstrup H, Bjarnsholt T, Kirketerp-Møller K, Høiby N, Moser C: What is new in the understanding of non healing wounds. Epidemiology, pathophysiology, and therapies. Ulcers2013, 1-8, 2013 (doi: /2013/ ) 55 Trøstrup H, Thomsen K, Christophersen LJ, Hougen JP, Bjarnsholt T, Jensen PØ, Kirkby N, Calum H, Høiby N, Moser C: Pseudomonas aeruginosa biofilm aggravates skin inflammatory response in BALB/c mice in a novel chronic wound model. Wound Rep. Reg. 21: ; Wang H, Ciofu O, Yang L, Wu H, Song Z, Oliver A, Høiby N: High beta-lactamase levels change the pharmacodynamics of beta-lactam antibiotics in Pseudomonas aeruginosa biofilms. Antimicrob. Agents and Chemother. 57: ; Wang H, Ridderberg C, Hansen CR, Høiby N, Jensen- Fangel S, Olesen HV, Skov M, Lemming LE, Pressler T, Johansen HK, Nørskov-Lauritsen N: Early treatment with inhaled antibiotics postpones next recurrence of Achromobacter in cystic fibrosis. J. Cystic Fibrosis 12: ; Wolff T, Eickhardt S, Björnsdottir M, Moser C, Bjarnsholt T, Høiby N, Thomsen T: Direct sequencing and RipSeq interpretation as a tool for identification of polymicrobial bacteremia. J. Clin. Microbiology 51: ; Xie Y, Xiao X, Jia W, Song Z, Wu H: The succession of oral microflora. In: Xuedong Zhou & Wenyuan Shi (ed): Oral Microecology (in Chinese), p 22-26, Chapter Three: People s Health Publishing House, Beijing 2013 July. ISBN Zhang LB, Gao QG, Chen WY, Qin HY, Wang HZ, Chen YC, Yang L, Zhang G: Regulation of pqs quorum sensing via catabolite repression control in Pseudomonas aeruginosa. Microbiology 159:1931-6; B Artikler i trykken 2013: 1 Alhede M, Bjarnsholt T, Givskov M, Alhede M: Pseudomonas aeruginosa Biofilms. Mechnisms of Immun Evasion. Accepted Alhede M, Er Ö, Eickhardt-Sørensen s, Kragh K, Alhede M, Christensen LD, Poulsen SS, Christensen LH, Høiby N, Tvede M, Bjarnsholt T: Bacterial biofilm formation and treatment in soft tissue fillers. Pathogens and Disease. Accepted Bjarnsholt T, Kirketerp-Møller K, Høiby N, Moser C: What is new in the understanding of non-healing wounds. Special issue Chronic Ulcers: Updating Epidemiology, Physiopathology, and Therapies Ulcers. Accepted Brochmann RP, Toft A, Ciofu O, Hempel C, Bjarnsholt T, Høiby N, Jensen PØ: Bactericidal effect of colistin on planktonic Pseudomonas aeruginosa is independent of hydroxolyl radical formation. Intern. J. Antimicrob. Agents. Accepted Burmølle M, Ren D, Bjarnsholt T, Sørensen SJ: Interactions in multispecies biofilms: do they actually matter? Trends in Microbiology. Accepted Calum H, Høiby N, Moser C: Burn Mouse Models. Chapter 57 in: Methods in Pseudomonas aeruginosa. Eds: Alain Filloux, A., Ramos, J.L., Springer Verlag. Accepted Ciofu O, Hansen CR, Høiby N: Respiratory bacterial infections in cystic fibrosis. Current Opinion in Pulmonary Medicine. In press Dalbøge CS, Nielsen XC, Alffenaar JWC, Dalhoff K, Dunø M, Buchard A, Uges DRA, Jensen AG, Pressler T, Johansen HK, Høiby N: Pharmacokinetic variability of clarithromycin and differences in CYP3A4 activity in patients with cystic fibrosis. J. Cyst. Fibros. In press Friman VP, Ghoul M, Molin S, Johansen HK, Buckling A: Pseudomonas aeruginosa adaptation to lungs of cystic fibrosis patients leads to lowered resistance to phage and protist enemies. PLOS ONE. PONE-D R1. In press Gottrup F, Apelqvist J, Bjansholt T, Cooper R, Moore Z, Peters EJG, Probst S: EWMA Document: Antimicrobials and Non-healing Wounds Evidence, controversies and suggestions. (Consensus report). Journal of Wound Care. Accepted Hansen CR, Pressler T, Johansen HK, Skov M: Achromobacter xylosoxidans in cystic fibrosis: indirect patient-to-patient contact can lead to cross-infection. J. Cyst. Fibros. In press Hansen F, Johansen HK, Østergaard C, Arpi M, Hansen DS, Littauer P, Holm A, Heltberg O, Schumacher H, Fuursted K, Lykke MAD, Tønning B, Hammerum AM, Justesen US: Characterisation of carbapenem non-susceptible Pseudomonas aeruginosa in Denmark; a nationwide, prospective study. Microbial Drug Resistance. In press Hempel C, Kohnke H, Maretty L, Jensen PØ, Staalsø T, Kurtzhals JAL: Plasmodium falciparum avoids change in erythrocytic surface expression of phagocytosis markers during inhibition of nitric oxide synthase activity. PLoS ONE. Submitted Høiby N: Lægers ytringsfrihed er stadig under pres. Ugeskr. Læger (kronik). Accepted ÅRSBERETNING

34 15 Jensen PO, Briales A, Brochmann R, Wang H, Kragh K, Kolpen M, Hempel C, Bjarnsholt T, Høiby N, Ciofu O: Formation of hydroxyl radicals contributes to the bactericidal activity of ciprofloxacin on Pseudomonas aeruginosa biofilm. Pathogens and Disease. Accepted Jiricny N, Molin S, Foster K, Diggle SP, Scanlan PD, Ghoul M, Johansen HK, Santorelli L, Popat R, West SA, Griffin AS: Loss of social behaviours in populations of Pseudomonas aeruginosa infecting lungs of patients with cystic fibrosis. PLOS ONE. In press Kolpen M, Bjarnsholt T, Moser C, Hansen C, Rickelt L, Kuhl M, Hempel C, Pressler T, Høiby N, Jensen PØ: Nitric Oxide Production by Polymorphonuclear Leukocytes in Infected Cystic Fibrosis Sputum. Clinical & Experimental Immunology. Submitted Kolpen M, Kühl M, Bjarnsholt T, Moser C, Hansen CR, Liengaard L, Kharazmi A, Pressler T, Høiby N, Jensen PØ: Nitrous Oxide Production in Sputum from Cystic Fibrosis Patients with Chronic Pseudomonas aeruginosa Lung Infection. PLoS ONE. Apccepted Madvig RL, Jochumsen N, Johansen HK, Høiby N, Molin S, Sommer M, Jelsbak L, Folkeson A: Draft genome sequences of Pseudomonas aeruginosa B3 strains sampled from cystic fibrosis patients undergoing antibiotic chemotherapy. Genome Announc. Accepted Marvig RL, Johansen HK, Molin S, Jelsbak L: Genome sequencing of a transmissible lineage of Pseudomonas aeruginosa reveals pathoadaptive mutations and distinct evolutionary paths of hypermutators. PLOS Genetics. PGENETICS-D R1. In press Rammer P, Calum H, Moser C, Björnsdóttir M, Smedegaard H, Høiby N, Bjarnsholt T: Dietzia papillomatosis bacteremia. J. Clin. Microbiol. Accepted Sjölander I, Hansen F, Elmanama A, Khayyat R, Abu-Zant A, Hussein A, Taha AA, Hammerum AM, Ciofu O: Detection of NDM-2-producing Acinetobacter baumannii and VIM-producing Pseudomonas aeruginosa in Palestine. Journal of Global Antimicrobial Resistance 59. Accepted Tan SY-Y, Chua SL, Liu Y, Høiby N, Andersen LP, Givskov M, Yang L, Song Z: Comparative genomic analysis of rapid evolution of an extreme-drug-resisatnt (EDR) Acinetobacter baumanii clone. Genome Biology and Evolution. Accepted Thomsen K, Trøstrup H, Moser C: Animal models to evaluate bacterial biofilm development. In Microbial Biofilms Methods and Protocols. Humana Press. Accepted Van de Weert - van Leeuwen PB, Vrankrijker AMM, Frentz J, Ciofu O, Wojtaszewski JFP, Arets HGM, Hulzebos HJ, Van der Ent CK, Beekman JM, Johansen HK: Effect of long-term voluntary exercise wheel running on susceptibility to bacterial pulmonary infections in a mouse model. PLOS ONE. In press Wessman M, Bjarnsholt T, Eickhardt-Sørensen S, Johansen HK, Homøe P: Mucosal biofilm detection in chronic otitis media. A study of middle ear biopsies from Greenlandic patients. European Archives of Oto-Rhino-Laryngology and Head & Neck. Accepted Wu H, Høiby N, Yang L, Givskov M, Song Z: Effects of Panax ginseng on microbial infections. Journal of Traditional Chinese Medicine. Accepted C+D Kongresabstracts, foredrag, posters, korrespondancer o.l.: 1 Alhede M: Biofilm Formation and Treatment in Tissue Filler Infections. Eurobiofilms 2013, Gent, Belgium, Sept. 9-12, Alhede M: Diagnosis of Biofilm Infections 30th Annual Meeting of Nordic Society of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, Aarhus, Denmark, September 5-8, Alhede M: Testing of antibacterial Wound Dressings. Annual meeting of European Wound Management Association, Copenhagen, Denmark, May 15-17, Alhede M, Er Ö, Eickhardt S, Kragh K, Alhede M, Christensen L, Poulsen S, Christensen L, Høiby N, Givskov M, Tvede M, Bjarnsholt T: Bacterial biofilm formation and treatment in soft tissue fillers. Eurobiofilms 2013, Gent, Belgium, Sept. 9-12, Aanaes K, Johansen HK, Skov M, Buchvald FF, Hjuler T, Pressler T, Høiby N, Nielsen KG, von Buchwald C: Sinus surgery and postoperative treatment can reduce pathogens in the lungs of patients with cystic fibrosis; a one year prospective follow-up study. ARS, Vancouver, Canada, September 28, Chaudry MS: Clinical significance of Epstein Barr virus DNA viral load in acute EBV infection. KLM møde, Malmø, Sverige, 3. juni Chen M, Johannesson G, Kjældgaard K, Gomme G, Kurtzhals JAL: Development of multiplex real-time PCR for the detection of Plasmodium species in the BD MAX system. The 8th European Congress on Tropical Medicine and International Health, September, 2013, Copenhagen, Denmark. 8 Christiansen CB: Præsentation af ScandTick. SNÄFF-møde Söderköping, Sverige, 15. maj Christiansen CB: TBE and borrelia in Denmark. NorTick, Oslo, Norge, 6. Februar Christophersen LJ, Trøstrup H, Damlund DSM, Bjarnsholt T, Thomsen K, Jensen PØ, Hougen HP, Høiby N, Moser C: Bead-size directed distribution of Pseudomonas aeruginosa results in distinct inflammatory response in a mouse model of chronic lung infection. World Immune Regulation Meeting (WIRM). Davos, Schweiz, March 13-16, Ciofu O: External evaluation of animal experiments and tolerance to antibiotics. Animal model preconference workshop. Eurobiofilms 2013, Gent, Belgium, Sept. 9-12, Ciofu O: Treatment of P. aeruginosa infection in CF patients: basis of current recommendations and future perspectives. Eurobiofilms 2013, Gent, Belgium, Sept. 9-12, Dalbøge CS, Nielsen XC, Dalhoff K, Alffenaar J-W, Dunø M, Buchard A, Uges DRA, Jensen AG, Jürgens G, Pressler T, Høiby N, Johansen HK: Pharmacokinetic variability of clarithromycin and ciprofloxacin in patients with cystic fibrosis. 36 th European Cystic Fibrosis Conference, June 12-15, Lisbon, Portugal, Dellavalle B, Hempel C, Johansen FF, Kurtzhals J: GLP-1 analogue, liraglutide reduces lesion size, and attenuates inflammation and cell death associated with 32 RIGSHOSPITALET, KLINISK MIKROBIOLOGISK AFDELING

35 acute traumatic brain injury in murine lesion model. Society of Neuroscience Conference, San Diego November 9-13, Eickhardt S, Kragh K, Høiby N, Bjarnsholt T, Alhede M: Fluorescent microscopy of clinical biofilms infections a cautionary tale of false positives. Eurobiofilms 2013, Gent, Belgium, Sept. 9-12, Hempel C, Sporring J, Hyttel P, Kurtzhals JAL: Extensive damage to the endothelial glycocalyx in terminal murine cerebral malaria. European Congress of Tropical Medicine and International Health, Copenhagen September 10-13, Høiby N: Homage to Vera Vavrova. Faculty of Medicine, Charles University, Prague, Czech Republic, Høiby N: Microbiology of Cystic Fibrosis. Seminar on the 80th years birthday of prof. Vera Vavrova, Faculty of Medicine, Charles University, Prague, Czech Republic, Høiby N: Antibiotic therapy, resistance problems and susceptibility testing. Nordic conference of fast identification and antibiotic susceptibility testing results in clinical decision making. Copenhagen, Høiby N: New antibiotics: what is in the pipeline? Nordic conference of fast identification and antibiotic susceptibility testing results in clinical decision making. Copenhagen, Høiby N: Bill Costesrton s Biofilm Legacy. The Costerton Biofilm Center, opening ceremony, Panum Institute, Copenhagen, Høiby N: Mine erfaringer som kongresarrangør. Møde om nye kongresser, Rigshospitalet, Copenhagen, Høiby N: Animal models of biofilm infections overview and introduction. Educational workshop 12, 23th ECCMID, Berlin, Germany, Høiby N: The move to totally automated ID/AST. Integrated symposium Lab organisation and automation: redifining the service you provide. 23th ECCMID, Berlin, Germany, Høiby N: Use of polymyxins in patients with cystic fibrosis. Session 4: What is the role of inhaled polymyxins for treatment of respiratory tract infections? 1st International Conference on Polymyxins. Monash University, Prato, Italy, Høiby N: Bacterial biofilms and resistance. Session 7: Mechanisms of activity, resistance and nephrotoxicity: How understanding may be used advantagesly. 1st International Conference on Polymyxins. Monash University, Prato, Italy, Høiby N: Pseudomonas aeruginosa infection in the United Airways of cystic fibrosis patients. Key-note lecture, First Hannover Symposium on Pediatric Research, Hannover Medical School, Hannover, Germany, May 25, Høiby N: Upper airway as trigger of lung infection. Session PARI pulsating aerosol for upper airways in CF potentials and perspectives. 36th European Cystic Fibrosis Conference, Lisbon, Portugal, Høiby N: Eradication of Pseudomonas aeruginosa infections in the united airways of cystic fibrosis patients. 10th Australian Cystic Fibrosis Conference. Auckland, New Zealand, Høiby N: S. aureus vs. P. aeruginosa in CF. 10th Australasian Cystic Fibrosis Conference. Auckland, New Zealand, Høiby N: Pseudomonas aeruginosa infections in the united airways of cystic fibrosis. 10th Australian Cystic Fibrosis Conference. Auckland, New Zealand, Høiby N: Biofilm infections, history, current problems and future challenges. Key note lecture, Nobel conference on Biofilm formation, its clinical impact and potential treatment. Karolinska Institute, Stockholm, Sweden, Høiby N: The clinical problem persistent infections by biofilmforming bacteria. Niels Høiby s 25-aniversary as professor symposium, Panum Institute, Copenhagen, Denmark, Høiby N: Consensus guidelines on diagnosis and treatment of biofilm infections. Eurobiofilms 2013, Gent, Belgium, Sept. 9-12, Høiby N: Interference with biofilms and quorum aensing as targets to reduce chronic inflammation. Le STUDIUM Conference: Chronic inflammatory lung diseases: The next-generation therapeutic targets to consider. Tours, France, 20/ Høiby N: Early detection of bacteria and the strategy to prevent and treat infections in CF. South Eastern European CF conference, Beograd, Serbia, Høiby N: Tribute to Gerd Döring. IX Italian Convention of investigators in cystic fibrosis. Verona, Nov. 29, My lecture was read by another scientist, since I had to cancel due to acute health problems of my wife. 38 Høiby N: Gåsehud er en infektionssygdom. Rigshospitalets Julearrangement, Johansen HK: Bacterial reservoirs in the airways of CF patients. CFsemiar, The CF-Clinic University Hospital Verona, Italy, November 28, Johansen HK: Evolutionary pathways in two dominant clinical Pseudomonas aeruginosa clones. 36 th European Cystic Fibrosis Conference, Lisbon, Portugal, June 12-15, Johansen HK: Identification and management of bacterial reservoirs in the airways of CF patients. The 2013 Italian Cystic Fibrosis meeting, Verona, Italy, November 27, Johansen HK: Sinus disease and its relevanve to lower airway infection. British Thoracic Society Winter Meeting, London, UK, December 4, Johansen HK, Markussen T, Damkier S, Marvig RL, Pressler T, Høiby N, Jelsbak L, Molin S: Evolutionary pathways in two dominant clinical Pseudomnas aeruginosa clones. 14th International Conference on Pseudomonas. Lausanne, Switzerland, September 7-11, ÅRSBERETNING

36 44 Johansen HK, Marvig RL, Madsen LM, Pressler T, Molin S: The persistome: genome-wide investigations of airway populations of Pseudomonas aeruginosa in cystic fibrosis (CF) patients. The 27 th annual North American Cystic Fibrosis Conference, Salt Lake City, Utah, October 17-19, Pediatr. Pulmonol Suppl. 36, p. 357, Johansen HK, Aanaes K, Pressler T, Skov M, Nielsen K, Buchwald C von, Høiby N, Molin S: Early genetic adaptation associated with Pseudomonas aeruginosa airways infection. 23th. ECCMID, Berlin, Germany, Kolpen M, Bjarnsholt T, Kühl M, Hansen CR, Dalbøge CS, Høiby N, Jensen PØ: Denitrification by cystic fibrosis pathogens. 36th. European Cystic Fibrosis Conference, Lisbon, Portugal, 12-15/ Kolpen M, Bjarnsholt T, Hansen CR, Dalbøge CS, Kühl M, Høiby N, Jensen PØ: Denitrification by cystic fibrosis pathogens. Eurobiofilms 2013, Gent, Belgium, Sept. 9-12, Kolpen M, Bjarnsholt T, Hansen CR, Dalbøge CS, Kühl M, Høiby N, Jensen PØ: Denitrification by cystic fibrosis pathogens. 27th Ann. North American Cystic Fibrosis Conf., Salt Lake City, Utah, Oct ; Pediatric Pulmonol. Suppl. 36:316 (abstract 307); Kragh KN, Alhede M, Jensen PØ, Moser C, Jacobsen CS, Poulsen SS, Eickhardt-Sørensen SR, Hougen H-P, Givskov M, Kühl M, Høiby N, Bjarnsholt T: Polymorphonuclear leukocytes restrict the growth of Pseudomonas aerugoinosa in lungs of Cystic Fibrosis patients. Eurobiofilms 2013, Gent, Belgium, September 9-12, Kruse A, Huu CT, Cam PN, Duc TD, Stensballe LG, Prag J, Kurtzhals JA, Greisen G, Pedersen FK: Blood stream infections among neonates admitted to a Vietnamese paediatric hospital. European Congress of Tropical Medicine and International Health, Copenhagen, September 10-13, Kurtzhals JAL: Malaria: diagnostic and therapeutic challenges. Professortiltrædelsesforelæsning, Københavns Universitet, 22. november Kurtzhals JAL: The nature of parasitism. Key note presentation. Spring symposium of the Danish Society for Parasitology and the Danish Society for Tropical Medicine and International Health, Copenhagen, March, Kurtzhals JAL: Update på malaria. Dansk Selskab for Rejsemedicin. Årsmøde, Odense, januar Kurtzhals JAL, Maretty L: Alternative iron supplementation regimens. Key note presentation. European Congress of Tropical Medicine and International Health, Copenhagen, September 10-13, Madsen LM, Marvig RL, Pressler T, Molin S, Johansen HK: The persistome: genome-wide investigations of airway populations of Pseudomonas aeruginosa in cystic fibrosis (CF) patients. 14th International Conference on Pseudomonas. Lausanne, Switzerland, September 7-11, Markussen T, Marvig RL, Gómez-Lozano-M, Burleigh AE, Johansen HK, Molin S, Jelsbak L: Evolutionary pathways of Pseudomonas aeruginosa during long-term infection of CF airways. 14th International Conference on Pseudomonas. Lausanne, Switzerland, September 7-11, Marvig RL, Johansen HK, Molin S, Jelsbak L: Genome analysis of a transmissible lineage of Pseudomonas aeruginosa reveals pathoadaptive mutations and distinct evolutionary paths of hypermutators. 14th International Conference on Pseudomonas. Lausanne, Switzerland, September 7-11, Moser C: Animal Models of Biofilm Infections. 23th ECCMID, Berlin, Germany, April 27-30, Moser C: Animal Models of Biofilm Infections. Eurobiofilms 2013, Gent, Belgium, September 9-12, Moser C: Culture dependent versus non-culture dependent techniques in foreign body infections. 30th annual meeting NSCMID, Aarhus, Denmark, September 5-8, Moser C: Diagnosis and treatment of Biofilm Infections. Meet-The- Expert session. 23th ECCMID, Berlin, Germany, April 27-30, Moser C: Risk assessment for invasive fungal infections. Symposium på RH New issues in Candida infections, København, Danmark, 23. januar Moser C: Use of rdna PCR and sequencing and the Ibis T5000 technology in the clinical microbiological laboratory. Danmarks Mikrobiologiske Selskabs Årsmøde, København, 18. november Nassereddin A, Pedersen TT, Sengeløv H, Poulsen A, Kirkby N, Christiansen CB: Extended viral shedding in hospitalised patients with influenza A and influenza B. 23th. ECCMID, Berlin, Germany, April 27-30, Nassereddin A, Kirkby N, Christiansen CB: Evaluation of Biofire filmarray respiratory virus panel and Clart pneumovir microarray genomica. European Society Clinical Virology meeting, Lyon, Frankrig, september Poss P, Kvich LA, Bjørnsdottir MK, Rammer P, Sørensen SER, Moser C, Bjarnsholt T, Høiby N: 16s sequencing a rapid and more sensitive method to detect and identify bacteria in priority samples. 23th. ECCMID, Berlin, Germany, Qvist T, Pressler T, Katzenstein TL, Skov M, Høiby N, Collins M: Antibody activity against Mycobacterium avium in serum from cystic fibrosis patients is associated with clinical MAC disease. 27th Ann. North American Cystic Fibrosis Conf., Salt Lake City, Utah, Oct ; Pediatric Pulmonol. Suppl. 36:328 (abstract 339); Rubin M: Dengue fever in Danish travellers - NS1-antigen and biochemical markers for rapid diagnosis. KLM møde, Malmø, Sverige 3. juni Rubin M, Thybo S, Nielsen AY, Christiansen CB: Increasing number of imported dengue fever cases in Denmark: A clinical evaluation of a new rapid dengue antigen test. 8th European Congress on Tropical Medicine and International Health, København, september Song Z: P. aeruginosa biofilm forsøg-1. KMA, Slagelse Sygehus, 25. april Song Z: P. aeruginosa biofilm forsøg-2. KMA, Slagelse Sygehus, 16. maj Song Z: Antibiotisk følsomhedmåling. SCELSE, NTU, Singapore, February 21, Stavnsbjerg C, Nielsen AK, Høiby N, Alhede M: 34 RIGSHOSPITALET, KLINISK MIKROBIOLOGISK AFDELING

37 An easy, cheap and reproducible biofilm setup for fast screening of different biofilm phenotypes. Eurobiofilms 2013, Gent, Belgium, September 9-12, Søe NH, Vedel Jensen N, Poulsen SS, Espersen F, Pier GB, Johansen HK: Vancomycin is superior to active/passive immunization against Staphylococcus aureus periprosthetic osteomyelitis in rats. Danish Orthopaedic Society, Copenhagen, Denmark, October 23-25, Thomsen K, Christophersen L, Bjarnsholt T, Jensen PØ, Moser C, Høiby N: Anti-Pseudomonas aeruginosa IgY antibodies promote specific bacterial aggregation and ingternalization in polymorphonuclear neutrophils. 36th. European Cystic Fibrosis Conference, Lisbon, Portugal, 12-15/ Wang H, Green K, Pressler T, Høiby N: Pharmacokinetics of two methods of intervenous administration of colistin in adult patients with cystic fibrosis and evaluation of dose regimens in biofilm infections of Pseudomonas aeruginosa. 1st International Conference on Polymyxins. Monash University, Prato, Italy, 2-4/ Wang M, Ridderberg W, Hansen CR, Høiby N, Jensen- Fangel S, Olesen HV, Skov M, Lemming LE, Pressler T, Johansen HK, Nørskov-Lauritsen N: Early treatment with inhaled antibiotics postpones recurrence of Achromobacter species in cystic fibrosis. 36th. European Cystic Fibrosis Conference, Lisbon, Portugal, June 12-15, Wang H, Song Z, Ciofu O, Onsøyen E, Rye P, Høiby N: Biofilm disruption and synergistic antimicrobial effects of a novel alginate oligomer on Pseudomonas aeruginosa in vitro and in vivo. 36th. European Cystic Fibrosis Conference, Lisbon, Portugal, June 12-15, Wang H, Song Z, Ciofu O, Onsøyen E, Rye P, Høiby N: Biofilm disruption and synergistic antimicrobial effects of a novel alginate oligomer on Pseudomonas aeruginosa in vitro and in vivo. Eurobiofilms 2013, Gent, Belgium, Sept. 9-12, Wang H, Song Z, Ciofu O, Onsøyen E, Rye P, Høiby N: Biofilm disruption and synergistic antimicrobial effects of a novel alginate oligomer on Pseudomonas aeruginosa in vitro and in vivo. 53 rd ICAAC 2013, Denver, USA, September, Wang H, Song Z, Ciofu O, Onsøyen E, Rye P, Høiby N: Biofilm disruption and synergisstic antimicrobial effects of a novel alginate oligomer on Pseudomonas aeruginosa in vitro and in vivo. 27th Ann. North American Cystic Fibrosis Conf., Salt Lake City, Utah, Oct ; Pediatric Pulmonol. Suppl. 36:294 (abstract 246); Wang H, Song Z, Ciofu O, Onsøyen E, Rye P, Høiby N: Potentiation effects of a novel alginate oligomer with colistin methanesulfonate on Pseudomonas aeruginosa biofilm in a murine lung infection model. 23th. ECCMID, Berlin, Germany, Wang H, Song Z, Ciofu O, Onsøyen E, Rye P, Høiby N: Potentiation effects of a novel alginate oligomer with colistin methanesulfonate on Pseudomonas aeruginosa biofilm in a murine lung infection model. 1st International Conference on Polymyxins. Monash University, Prato, Italy, 2-4/ E Diverse: Bjarnsholt T: Vejleder for bachelor stud. Sanne Wolf. Vejleder for bachelor stud. Cecilie Christiansen. Vejleder for forskningsår stud. Odin Joensen. Vejleder for master stud. Camilla Stavnsbjerg. Vejleder for master stud. Minna Kaarina Tiirikainen. Vejleder for master stud. Marie Helene Bitsch Thaysen. Vejleder for Ph.d. stud. Steffen Robert Eickhardt-Sørensen: The prevalence of implant-associated biofilm infections in patients who have died of other causes, SUND, KU. Vejleder for Ph.d. stud. Kasper Nørskov Kragh: 3D spatial structure in multicellular systems: self-assembly, implications and optimization, SUND, KU. Vejleder for Ph.d. stud. Stephanie Crone Geisler: Paradigm lost Chronic infections take the place of acute infections., SUND, KU. Vejleder for Ph.d. stud. Majken Sønderholm: Paradigm lost Chronic infections take the place of acute infections. Medvejleder for Ph.d. stud. Tim Holm Jakobsen: Udvikling af quorum sensing inhibitorer, SUND, KU. Medvejleder for Ph.d. stud. Signe Maria Nielsen: Achromobacter biofilms in cystic fibrosis. Opponent for Anubrata Ghosal Ph.d. forsvar d. 18/ Series Editor for Springer Series on Biofilms Reviewer for Microbiology. Reviewer for Wound repair and regeneration. Reviewer for Biofouling. Reviewer for Journal of antimicrobial chemotherapy. Reviewer for Biofilms. Reviewer for Journal of cystic fibrosis. Reviewer for Journal of medical microbiology. Reviewer for PlosOne. Medlem af ISIM KU institutråd. Sekretær og stifter af biofilm arbejdsgruppen under DSKM. Sekretær og bestyrelsemedlem i Dansk Mikrobiologisk Selskab. Sekretær for 2nd Eurobiofilm Conference 2011 Copenhagen. Formand og bestyrelsesmedlem i ESGB-ESCMID. Medlem af DSKM. Guest Editor in chief for Thematic issue of EuroBiofilm 2013 udgivet af FEMSIM Editor of Microorganisms. Editor ass. of FEMS Pathogenesis. External doctoral evaluator - University of Milan (Italy) Member of the editorial board for Wound Healing Society s yearbook series, Advances in Wound Care. Christiansen CB: Vejleder for stud.med. Mavish Safdar Chaudrys kandidatopgave med titlen Klinisk signifikans af Epstein Barr Virus DNA viral load ved akut EBV infektion. Mødedeltager ved International Scientific Working Group on TBE Wien, Østrig 31. januar-1.februar Mødedeltager ved ScandTick Styregruppemøde ScandTick i Oslo, Norge, 5. februar Mødedeltager ved NorTick møde i Oslo, Norge, februar Mødedeltager ved ECCMID, Berlin, Tyskland, april Mødedeltager ved Styregruppemøde ScandTick i Söderköping, Sverige, 12. maj Mødedeltager ved SNÄFF-møde i Söderköping, Sverige, maj Mødedeltager ved København Lund Malmø (KLM) møde Lund Universitet, Department of laboratory medicine, Malmø, Sverige, 3. juni Mødedeltager ved European Congress of Virology møde i Lyon, Frankrig, september Mødearrangør og mødeleder ved ScandTick Åbent symposium om flåtoverførte sygdomme, Aud. 93, Rigshospitalet, København, 5. september Arrangeret fokuseret ophold for reservelæge: Maria Rubin. Fem dages ophold på KMA. Maria arbejde med denguevirus og diagnostiske metoder april ÅRSBERETNING

38 Ciofu O: Vejleder for bachelorprojekt: Kristian Skov Kjær Thioridazine s effekt på MRSA og Mycobacterium tuberculosis. Vejleder for bachelorprojekt: Andres Toft Is the Bactericidal Activity of Colistin on Pseudomonas aeruginosa mediated by formation of Hydroxyl Radicals? Vejleder for masterprojekt: Nanna Rørbo Cystic fibrosis P. aeruginosa biofilms and bacteriophage treatment. ( ). Vejleder for ph.d projektet: Adaptive mechanisms of P. aeruginosa during the chronic airways infection in patients with cystic fibrosis Karin M. Jørgensen, Division of Bacteriology, ISIM ( ). Censor for Masterprojekt: Characterization of intestinal isolates of cephalosporin-resistant Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae from community persons in Ghana af Nana A.K. Blankson, juni Censor for Masterprojekt: Characterization of enteroaggregative Escherichia coli from Danish patients suffering from travelers diarrhea af Katja Kuhr, juli Censor for Masterprojekt: Enteroaggrgative Escherichia coli in children af Katrine Kamph Slott Maarlev, juli Høiby N: Formand for Pasteurselskabet. Chairman for ESCMID Biofilm Study Group. Chairman for ESCMID Study Group for Biofilm guidelines for diagnosis and treatment of Biofilm infections. Member of Editorial board of Journal of Cystic Fibrosis. Member of Editorial Boaard of Future Microbiology. Member of Editorial Board of International Journal of Antimicrobial Agents. Member of Editorial Board of Lancet Respiratory Medicine. Member of Editorial Board of Pathogens and Diseases. Medlem af Bestyrelsen af Cystisk Fibrose Foreningen. Member of Scientific Advisory Board, 30th Ann. Meeting of Nordic Sopciety for Clinical Microbiology and Infectious Diseases, Århus, Denmark, Sept. 5-8, Chairman for Symposium IV: Biofilms, quorum sensing, foreign body infections. 30th NSCMID Meeting, Århus, Denmark, Sept. 5-8, Member of Scientific Advisory board, Eurobiofilms 2013, Gent, Belgium, September 9-12, Scientific Organizer & Chairman: Nordic conference of fast identification and antibiotic susceptibility testing results in clinical decision making, Copenhagen, March 1, Scientific organizer & Chairman: Pari-pulsating aerosols for upper airways in CF potential and perspectives. 36th. European Cystic Fibrosis Conference, Lisbon, Portugal, June 12-15, Chairman for Workshop 17 Novel antimicrobial therapies. 36th. European Cystic Fibrosis Conference, Lisbon, Portugal, June 12-15, Chairman for Symposium 26 Burkholderia cepacia complex: Still a problem? 36th. European Cystic Fibrosis Conference, Lisbon, Portugal, June 12-15, Jensen PØ: Vejleder for cand. scient. Mette Kolpen i Ph.d.- projektet: Significance of the polymorphonuclear leukocytes in CF patients with chronic Pseudomonas aeruginosa lung infection ved Klin. Mikrobiol. Afd., RH, januar december Vejleder for stud. scient. Sanne Wolff i Bachelor-projektet: Nitric oxide reductase hos Pseudomonas aeruginosa fremmer anaerob biofilm dannelse og beskytter mod nitric oxide ved Klin. Mikrobiol. Afd., RH, januar - juni Vejleder for stud. scient. Cecilie Christiansen i Bachelor- projektet: Nitrogenmonoxid redultase (NOR) i Pseudomonas aeruginosa er nødvendig for anaerob vækst og nedsætter fagocytters indhold af nitrogenmonoxid ved Klin. Mikrobiol. Afd., RH, januar - juni Reviewer for Expert Review of Anti-infective Therapy. Reviewer for Annals of Medical and Health Sciences Research. Reviewer for BMC Clinical Pathology. Johansen HK: Medvejleder for DTU- bacheloropgave (20 ECTS point) for ingeniør stud. Line Præst Lauridsen Development of microbiological tools to investigate Staphylococcus aures biofilm formation in vitro and in a rat knee-prosthesis model. Hovedvejleder for Ph.d.-studerende Rasmus Hare Jensen, Mykologisk afsnit, SSI. Resistance in human pathogenic yeasts and filamentous fungi: prevalence, underlying molecular mechanisms and link to the use of azoles in humans and the environment. Medvejleder for Ph.d.-studerende Lea Mette Madsen, DTU, Systembiologi. P. aeruginosa adaptation and evolution. Medvejleder for Ph.d.-studerende Linda Jensen, DTU, Systembiologi. P. aeruginosa adaptation and evolution. Samarbejdspartner med post. doc., Ph.d. Fatima Yousef Coronado, DTU, Systembiologi. Samarbejdspartner med post. doc., Ph.d. Sandra Breum Andersen, DTU, Systembiologi. Medvejleder for forskningsassistent Anna Lewinska, DTU, Systembiologi. P. aeruginosa adaptation and evolution. Medvejleder for Ph.d.-studerende Mikkel Lindegaard, DTU, Systembiologi. P. aeruginosa adaptation and evolution. Medvejleder for læge Ph.d.-studerende Mikkel Alanin. Samspillet mellem infektioner i lunger og bihuler hos patienter med primær cilie dyskinesi (PCD) og patienter med cystisk fibrose (CF). Medvejleder for Ph.d.-studerende Fatima AlZahara a Alatraktchi, DTU, Systembiologi/Nano-Tech. Electrochemical micro- and nano- for detection of bacterial infections. Samarbejdspartner med forskningsassistent Rasmus Lykke Marvig, Rigshospitalet KMA. Medlem af styregruppen i RegionH s Task-force til halvering af nosokomielle infektioner. Desuden medlem af Antibiotika og resistensgruppen. Medlem af Censor-korpset ved Danmarks Tekninske Universitet (beskikket som censor ved ingeniøruddannelserne - korpset for kemi). Opponent ved Ph.d.-forsvaret ved læge Pauline van de Weet - van Leeuwen, 17. september Exercise and immune function in cystic fibrosis, Utrecht Universitet, Holland. Kurtzhals J: Hovedvejleder for Ph.d. studerende, cand. scient. Brian Della Valle, Københavns Universitet og cand. med. Filip Castberg, Københavns Universitet. Projektvejleder for Ph.d. studerende MD Efunshile M. Akinwale, Leipzig Universitet, M Phil Seth Amponsah, og M Phil William Vanderpuije, University of Ghana. Hovedvejleder for bachelor studerende (molekylær biomedicin) Ida Marie Boisen, Københavns Universitet. Formand for bedømmelesesudvalget vedr. Ph.d. afhandling af Sanne Schou Berger, Micha Jepsen, Daniel Minja og Sisse Bolm Ditlev. Vice president i World Federation of Parasitologists Medlem af Center for Medicinsk Parasitologi scientific board (CMP). Leder af CMP s forskningsgruppe på Rigshospitalet. Affilieret bestyrelsesmedlem i Dansk Selskab for Smådyrsparasitologi. Implementing committee leder af Kwame Nkrumah University of Science and Technology Platform of Human Health som led i Danske Universiteters Building Stronger Universities initiativ DSKM udpeget medlem af arbejdsgruppen til udarbejdelse af rejsemedicinske retningslinier i Danmark. Fagredaktør (parasitologi), EQA News. 36 RIGSHOSPITALET, KLINISK MIKROBIOLOGISK AFDELING

39 Editorial committee member af Tropical Parasitology. DSKM udpeget referent for parasitologiske afsnit, Medicin.dk. Forfatter af tropemedicinske afsnit i Medicinhåndbogen. Medlem af local organising committee for 8th European Congress on Tropical Medicine and International Health, København, September Medlem af Vifor Pharma International, advisory board vedrørende jernbehandling ved malaria. Suppleant i studienævnet i medicin, Det Sundhedsfaglige Fakultet, Københavns Universitet. Moser C: Arrangeret New issues in Candida infections. 23. januar Arrangeret sammen med Kristian Schønning. Sponsoreret af MSD. Hovedvejleder for Ph.d studerende Kim Thomsen. Hovedvejleder for Ph.d studerende Hannah Trøstrup. Medvejleder for Ph.d Maria van Gennip. Medvejleder for Ph.d studerende Steffen Eickhardt. Medvejleder for Ph.d studerende Majken Sønderholm. Medvejleder for Ph.d studerende Siri Tribler Ekstern lektor på ISIM, Københavns Universitet. F Undervisning Bjarnsholt T: Underviser og udvikler af: Online biofilm course, Københavns Universitet efterår Underviser på ESCMID biofilm kurset DTU: Undervist ved Educational workshop at EWMA, Copenhagen, Denmark Undervist ved Keynote lecture at EWMA, Copenhagen, Denmark Undervist ved Keynote lecture at 3 rd EuroBiofilm Conference Gent, Belgium Undervist ved Educational workshop at European Congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases 2013, Berlin, Germany. Undervist ved Honorary Lecture for ESCMID Young investigator Award at European Congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases 2013, Berlin, Germany. Undervist ved Wound Infection Summit, Kings College, London UK Undervist ved DTU 21 januar Undervist ved Panum 3. januar og 19. December 2013 Immunology og general mikrobiologi. Undervist ved Medicin øvelseskursus uge og 43-44, Undervist ved KU-Nat master course Advanced Microbiology 13. september Undervist ved DTU Signalbehandling 18 februar Christiansen CB: Undervist sammen med Maria Rubin i Diagnostik af denguevirus. Hvidovre Infektionsmedicinsk afd., Hvidovre Hospital, 17. April Ciofu O: Undervisning (øvelseskursus og forelæsninger) i bakteriologi forår og efterår 2013 og formulering og rettelse af eksamensopgaver til sommer og vintereksamener for medicinstuderende. Undervisning på Biofilm online kursus. Høiby N: Undervist medicinstuderende på Panum, forelæsninger, øvelseskursus, eksamensopgaver, bachelor- og kandidat-opgaver, vejledning af PhD studerende og specialestuderende m.v. Formand for bedømmelseskommiteen af Maiken Cavling Arendrup s doktordisputats: Candida and candidaemia: susceeptibility and epidemiology University of Copenhagen, defended Member of the International Advisory Board of the Pediatric Research Center, Hannover Medical School, Hannover, Germany, Jensen PØ: Undervist på Online biofilm course, Københavns Universitet efterår Undervist på: Workshop - Animal models of biofilms. EUROBIOFILMS Gent. Belgium. September 9-12, Johansen HK: Undervisning af medicinske studenter, Det Sundhedsvidenskabelige Fakultet, ISIM, Københavns Universitet, ekstern lektor. Kurtzhals J: Forelæsninger og øvelseskurser i bakteriologi og parasitologi på medicinstudiets 6., 8. og 12. semester, KU. Underviser på Summer School in International Health, Københavns Universitet August Underviser på Forsvarets Lægekorps uddannelse i tropemedicin. Moser C: Undervisning: Risk assessment and new molecular diagnostics for invasive fungal infections. KMA, Herlev Hospital, 29. januar Undervisning: 16S PCR. Afsnit 4131, Rigshospitalet, 15. januar Undervisning: Biofilm and Animal Models. National graduate course in Infection, inflammation and immunity. Ph.D course Molecular and clinical aspects of infection, inflammation and immunity. Tromsø, juni Undervisning: Chronic and Acute Infections. National graduate course in Infection, inflammation and immunity. Ph.D course Molecular and clinical aspects of infection, inflammation and immunity. Tromsø, juni Undervisning: Biofilm Techniques. Danmarks Tekniske Universitet, august Undervisning: Gilenya Immunologi og Infektionsrisiko. Uddannelsesdag for Sygeplejersker. Arrangeret af Novartis. København, 29. november Forelæsninger og Studenteraktivende Undervisning for tandlægestuderende, Københavns Tandlægehøjskole. G Videreuddannelse & rejser Johansen HK: Deltaget i European CF Conference, Lissabon, Portugal, June 12-15, Deltaget i NACFC, Salt Lake City, Utah, U.S.A., October 17-19, Deltaget i ECCMID, Berlin, Germany, April 27-30, Deltaget i International Conference on Pseudomonas, Lausanne September 7-11, Kurtzhals J: Arrangør og inviteret taler ved 8th European Congress on Tropical Medicine and International Health, København, september To rejser til Ghana mhp universitetssamarbejde (BSU) og projektarbejde (malaria vaccineprojekt i Hohoe, Ghana). Moser C: Deltaget i 2nd ESCMID conference on invasive fungal infections. Rom januar Deltaget i World Immune Regulation Meeting (WIRM). Davos, Schweiz, marts Deltaget i ECCMID, Berlin, Germany, April 27-30, Deltaget i American Society for Microbiology, General Meeting. Denver, USA Maj Deltaget i European Cystic Fibrosis Society Conference. Lisabon, Portugal juni Deltaget i Eurobiofilms 2013, Gent, Belgien, September 9-12, ÅRSBERETNING

40 Klinisk Mikrobiologisk Afdeling Afsnit 9301 Juliane Maries Vej København Ø Afsnit 7602 Ole Maaløesvej København N. Telefon: