DNBC application form

Størrelse: px

Starte visningen fra side:

Download "DNBC application form"

Erik Hedegaard
5 år siden
Visninger:

ref. 2009-16 Project title: Gen-miljø interaktion hos 7-9-årige børn med depression Populationsbaseret kohorteundersøgelse af prævalens, vulnerabilitetsgener, risikofaktorer og beskyttende faktorer.

1 ref Project title: Gen-miljø interaktion hos 7-9-årige børn med depression Populationsbaseret kohorteundersøgelse af prævalens, vulnerabilitetsgener, risikofaktorer og beskyttende faktorer. Applicant: Other partners taking part in the project Names and work addresses: Niels Bilenberg (hovedvejleder), Professor, Ph.d., overlæge Forskningsenheden, Børne- og Ungdomspsykiatrisk Afdeling Odense, Psykiatrien i Region Syddanmark, Klinisk Institut, Syddansk Universitet Dannebrogsgade 3, 5000 Odense C. Phone, fax, , , niels.bilenberg@ouh.regionsyddanmark.dk Rikke Wesselhöft, ph.d. studerende, cand. med., ekstern lektor, Forskningsenheden, Børne- og Ungdomspsykiatrisk Afdeling Odense, Psykiatrien i Region Syddanmark, Klinisk Institut, Syddansk Universitet, Dannebrogsgade 3, 5000 Odense C. Per Kragh-Sørensen, Professor, Dr.med., ekstern lektor, Forskningsenheden, Børne- og Ungdomspsykiatrisk Afdeling Odense, Psykiatrien i Region Syddanmark, Klinisk Institut, Syddansk Universitet, Dannebrogsgade 3, 5000 Odense C. Ole Mors, Professor, Ph.d., overlæge, Center for psykiatrisk forskning, Århus Universitetshospital, 8240 Risskov. Torben Kruse, Professor, lic. scient., Klinisk Biokemi og Klinisk Genetik, Klinisk Institut, OUH, Sdr. Boulevard 29, 5000 Odense C. Thorkild IA Sørensen, Professor, Institut for Sygdomsforebyggelse, Københavns Universitet, København Project description (max 200 words) The description should contain 1) purpose, 2) method, material, data, 3) time schedule, 4) publishing and 5) up to 5 key words Formål Estimering af prævalens af Major Depressive Disorder (MDD) hos børn Identificering af miljørelaterede risikofaktorer og beskyttende faktorer Identificering af genetiske markører for depression og angstforstyrrelse Analyse af gen-miljø interaktion Etablering af kohorte til followup Materiale, metode og data Med udgangspunkt i DNBC 7-års interview, der indeholder det psykiatriske screeningsinterview Strength and Difficulties Questionnaire (SDQ) identificeres børn i høj risiko for emotionel forstyrrelse blandt årgangene 2001 og 2002 (se selektionskriterier). Forældrene til disse (20 %) og random sample (2½ %) kontaktes, mhp online diagstisk interview The Development and Well-being Questionnaire (DAWBA), for at kunne identificere: Casegruppe med MDD

2 Casegruppe med subklinisk MDD Kontrolgruppe med angstforstyrrelse Kontrolgruppe af random sample Vha DNA fra DNBC biobank analyseres de fire grupper for genetiske markører. Resultaterne sammenholdes med DNBC data, der belyser ekspositioner præ-, peri- og postnatalt. Betydningen af samspillet mellem barnets gener og barnets miljø for depressionsudvikling vil herefter kunne belyses. Tidsplan : Data indhentning : Data bearbejdning : Genetiske analyser og risikoanalyser : Sammenfatning og publikation Publicering Resultater forventes publiceret i peer-reviewed internationale tidsskrifter. Keywords Depression, risiko- og beskyttende faktorer, genetiske markører, GWAS, gen-miljø interaktion Please indicate articles planned and their approx title(s): Based on the data applied for, I plan to publish: Article 1, titel: Prevalence of depression in 7-9-year-old children Article 2, titel: Environmental risk and resilience factors in childhood depression Article 3, title: Genetic markers for depression and anxiety disorders in 7-9-year-old children Article 3, title: Gene by environment interaction in 7-9-year-old children Project protocol enclosed: yes (Bilag A) Yderligere vedlagt: Litteraturliste (Bilag B) Ph.d. bedømmelse (Bilag C)

3 Interview Data Are you applying for interview data? yes Int 1 Int 2 Int 3 Int 4 7-year follow-up Selection criteria: 7-års interviews: Alle 7-års interviews for årgangene 2001 og 2002 anvendes, forventet N ~ Ud fra besvarelserne af de børnepsykiatriske screeningsspørgsmål (SDQ, spørgsmål 70-75) udarbejdes danske rmative data. Besvarelser for årgangene 2001 og 2002, der ligger over cut-off værdier svarende til +1 SD (16 %) i total score og/eller emotionel subscore, udtages til diagsticeringsinterview DAWBA. Forventet N ~ 4.800, svarende til 20 %, idet der vil være overlap imellem de to kategorier. Ligeledes vil random sample N = 600, svarende til 2½ %, udtages til DAWBA. Interviews 1-4: For de 5.400, der udtages til diagsticeringsinterview, vil alle interviews 1-4 blive anvendt. Specification of data required: (list of variables to be agreed with the DNBC data manager) Følgende oplysninger vil fortrinsvis blive anvendt: SDQ besvarelse Social status, arbejdssituation Familieforhold Graviditet og fødsel Tid til barnet, mor/barn relation Pasningsforhold Prænatale og perinatale ekspositioner Medicin og sygdomme, barn Særlige belastninger Mors psykiske tilstand No. of individuals concerned: 7-års interview: Årgangene 2001 og 2002, cirka Interviews 1-4: besvarelser

4 Biological Specimens Are you applying for biological specimens? yes: DNA fra børnene Only a minimum quantity of blood necessary for the analyses in question will be handed out. Please te that DNA is t yet available from all participants. DNA must be extracted at Statens Serum Institut. from 1st sample quantity from 2nd sample quantity from 3rd sample quantity Til geme-wide undersøgelsen skal anvendes mindst 300ng gemisk DNA per person til Illumina 660K chippen. Vi vil helst ikke bruge amplificeret DNA til denne opgave, fordi det forringer mulighederne for at analysere for copy-number-variations. Vi er i gang med at etablere et samarbejde med Thorkild IA Sørensen for at kunne genbruge kontroldata fra deres 3000 personer- kontrol population i fedme-undersøgelsen. Til vores kandidatgen studie kan amplificeret DNA anvendes til SNP analyser på Sequem, ca. 10 ng per 36 markører. Antallet af disse markører er ikke fastlagt endnu, men 300 er sandsynlig, dvs mindst 100ng. Please describe how your study design is adapted to make the best possible use of the biological specimens. Account for the feasibility of the analyses (requirements for transportation, treatment and storages must be taken into consideration). Number of persons, selection criteria, time period: Med et forventet frafald på 20 % opnås besvarelser af DAWBA. Ud fra disse etableres: Case gruppe med MDD (Forventet N ~ 200, svarende til 1 % af , korrigeret for frafald og screening) Casegruppe med subklinisk MDD (Børn med den højeste depressions symptomscore, der lige netop ikke opfylder MDD kriterierne, N ~ 200) Kontrolgruppe med angstforstyrrelse (Børn der opfylder kriterierne for angstforstyrrelse og ikke MDD eller subklinisk MDD, N ~ 200) Kontrol gruppe af random sample (N = 600) Ovennævnte fire grupper udgør en kohorte til fremtidig followup. Biobanken ansøges om DNA fra disse ca individer. I de 40 % af tilfældene, hvor der ikke foreligger navlesrsblod, vil SSI blive ansøgt om hælblod fra PKU-test. Periode: DNA analyserne vil finde sted i 2010, For what kind of analyses? (state purpose and method): 1) Geme-wide-associations studie på Illumina 660K chip 2) Kandidat-gener udvalgt fra ovennævnte GWAS, fra GWAS resultater fra voksne med depression hvor vi selv deltager samt kandidatgener udvalgt i det serotonerge system samt neuroplasiticitet getypet på en Sequem.

5 Where are the laboratory analyses carried out?: References from the laboratory may be enclosed. Getypering udføres i et samarbejde mellem Torben Kruse og Ole Mors laboratorier. Begge steder har stor erfaring med analyse af gemiske data. Det er muligt, at den chipbaserede undersøgelse udliciteres til et firma, fx AROS applied biotechlogy, ( Supplementary Data Collection Sample analyses results Will you be collecting supplementary data/biological samples from cohort members, or will new analyses data be generated? In you application to the Danish Data Protection Agency (DDPA) remember to state that you will return supplementary data to the DNBC No Yes Supplementary data and results from biological analyses, including geme-wide scans must after approval from the DDPA - be returned to the DNBC database and be made available for other scientists. If you are contacting DNBC participants by mail, this contact must be initiated by the DNBC secretariat. Which kind of data/biological samples? interview/questionnaire (to be enclosed) DAWBA sektionerne A, B, C, D, E, F, G, H, J, K, L, M, N (Bilag D) linkage with other registries (please specify) Det Centrale Psykiatriske Forsknings register Landspatientregisteret (LPR) CPR register biological specimens (please specify) How many individuals will be concerned? Data: Cirka During which time period will collection take place? September 2009 august 2011.

6 Other Approvals Is your project/data collection approved by: Danish Biomedical Research Ethics Committee yes (copy of approval to be enclosed) The Danish Data Protection Agency yes (copy of approval to be enclosed) Der vil snarest blive ansøgt om godkendelse ved Videnskabsetisk Komité og Datatilsynet. Finances The invoice for the data file should be sent to: Is the project fully financed? Niels Bilenberg, Professor, Ph.d., overlæge Forskningsenheden ved Børne- og Ungdomspsykiatrisk afdeling, Odense, Psykiatrien i Region Syddanmark, Dannebrogsgade 3, 5000 Odense C. No Yes, amount Name of the funding person/organisations: Det sundhedsvidenskabelige Fakultet, Syddansk Universitet: Et års fakultetsstipendium Psykiatriens Forskningsfond, Region Syddanmark: Et års løn Forskningsenheden, Børne- og Ungdomspsykiatrisk Afdeling Odense, Psykiatrien i Region Syddanmark: Et års løn Ebba og Verner Andersens Fond: To måneders løn Date and signature Date and signature: Save the application form to your harddisk and mail to IKM@ssi.dk together with your protocol and other relevant documentation.

Relaterede dokumenter

Application form for access to data and biological samples Ref. no

Application form for access to data and biological samples Ref. 2016-02 Project title: Applicant: Other partners taking part in the project Names and work addresses: "Skilsmisse og selvvurderet mentalt