KU Almen Kemi Forelæsning 01 Total Forelæsninger 14

KU Almen Kemi Forelæsning 01 Total Forelæsninger 14 Aldehyder og ketoner Struktur og egenskaber Navngivning Reaktioner med nucleofiler - med Grignardfobindelser (carbonnucleofiler) - med alkoholer (dannelse af acetaler) - med aminer (dannelse af iminer) Oxidation Aldehyder vs. ketoner Reduktion Katalytisk reduktion Reduktion med metalhydrider Reduktiv aminering Keto-enol tautomeri Racemisering af α-carbon manan.dk 1

KU Almen Kemi Forelæsning 01 Total Forelæsninger 14 δ- δ+ sp 2 methanal (formaldehyd) ethanal (acetaldehyd) propanal 3-hydroxypropanal 3-pentanon 2-pentanon 3-oxobutansyre cyclohexancarbaldehyd benzaldehyd cyclohexanon manan.dk 2

KU Almen Kemi Forelæsning 01 Total Forelæsninger 14 Fremstilling af Grignardreagens Etherens betydning - stabiliserer manan.dk 3

KU Almen Kemi Forelæsning 01 Total Forelæsninger 14 Grignardreaktion med methanal (formaldehyd) Grignardreagens formaldehyd alkoholation af primær alkohol primær alkohol manan.dk 4

KU Almen Kemi Forelæsning 01 Total Forelæsninger 14 Grignardreaktion med aldehyder Grignardreagens aldehyd alkoholation af sekundær alkohol sekundær alkohol manan.dk 5

KU Almen Kemi Forelæsning 01 Total Forelæsninger 14 Grignardreaktion med ketoner Grignardreagens keton alkoholation af tertiær alkohol tertiær alkohol manan.dk 6

KU Almen Kemi Forelæsning 01 Total Forelæsninger 14 Grignardreaktioner - oversigt Methanal Aldehyd Keton Carbondioxid Epoxid manan.dk 7

KU Almen Kemi Forelæsning 01 Total Forelæsninger 14 Syrekatalyseret dannelse af acetal halvacetal acetal manan.dk 8

KU Almen Kemi Forelæsning 01 Total Forelæsninger 14 Syrekatalyseret dannelse af iminer manan.dk 9

KU Almen Kemi Forelæsning 01 Total Forelæsninger 14 Oxidation Aldehyd Aldehyd Tollen's reagens Ketoner er vanskelige at oxidere manan.dk 10

KU Almen Kemi Forelæsning 01 Total Forelæsninger 14 Reduktion manan.dk 11

KU Almen Kemi Forelæsning 01 Total Forelæsninger 14 Syrekatalyseret keto-enol ligevægt manan.dk 12

KU Almen Kemi Forelæsning 01 Total Forelæsninger 14 Racemisering af α-carbon R-form achiral S-form manan.dk 13

KU Almen Kemi Forelæsning 02 Total Forelæsninger 14 Alkaner og cycloalkaner Egenskaber Forekomst Anvendelse IUPAC-navngivning Isomeri Strukturisomeri for alkaner cis/trans-isomeri for cycloalkaner Konformation af alkaner Newman projektioner Konformation af cycloalkaner Stol- og bådkonformationer manan.dk 1

KU Almen Kemi Forelæsning 02 Total Forelæsninger 14 Formler IUPAC-navn CH 3 CH 2 CH 3 propan CH 3 CH 2 CH 2 CH 3 butan CH 3 CH 2 CH 2 CH 2 CH 3 pentan CH 3 CH 2 CH 2 CH 2 CH 2 CH 3 hexan CH 3 CH 2 CH(CH 3 )CH 2 CH 2 CH 3 3-methylhexan 2,4-dimethylhexan manan.dk 2

KU Almen Kemi Forelæsning 02 Total Forelæsninger 14 Formel IUPAC-navn cyclobutan methylcyclopentan 1-ethyl-2,3-dimethylcyclohexan Substituenter i alfabetisk rækkefølge manan.dk 3

KU Almen Kemi Forelæsning 02 Total Forelæsninger 14 IUPAC eksempler 2,3-dimethylhexanol lokanter multiplikativt præfiks substituent præfiks stamme suffix 6-hydroxy-4,5-dimethylhexansyre manan.dk 4

KU Almen Kemi Forelæsning 02 Total Forelæsninger 14 manan.dk 5

KU Almen Kemi Forelæsning 02 Total Forelæsninger 14 Strukturisomeri kædeisomeri stillingsisomeri funktionsisomeri manan.dk 6

KU Almen Kemi Forelæsning 02 Total Forelæsninger 14 cis-trans isomeri i cycloalkaner cis trans cis-1,2-dimethylcyclohexan trans-1,2-dimethylcyclohexan manan.dk 7

KU Almen Kemi Forelæsning 02 Total Forelæsninger 14 Konformation af alkaner Staggered laveste energi mest favorabel Eclipsed højeste energi mindst favorabel Newman projektioner manan.dk 8

KU Almen Kemi Forelæsning 02 Total Forelæsninger 14 Axiale og ækvatoriale positioner Cyclopentan axial Cyclohexan ækvatorial manan.dk 9

KU Almen Kemi Forelæsning 02 Total Forelæsninger 14 Cyclohexans konformationer Stolkonformation (mest stabil) (mindst stabil) Bådkonformation manan.dk 10

KU Almen Kemi Forelæsning 03 Total Forelæsninger 14 Alkener, alkyner og aromater Bindingsgeometri cis-trans og E-Z isomeri Navngivning Biologisk vigtige alkener Reaktioner Addition Stabiliteten af carbocationer Markovnikov's regel Oxidation Reduktion Dannelse af chirale centre manan.dk 1

KU Almen Kemi Forelæsning 03 Total Forelæsninger 14 Hybridisering og bindingsgeometri Ethene Ethyne sp 2 -hybridiseret sp-hybridiseret Dobbeltbinding: 1 σ-binding 1 π-binding Trippelbinding: 1 σ-binding 2 π-bindinger manan.dk 2

KU Almen Kemi Forelæsning 03 Total Forelæsninger 14 cis-trans versus E-Z navngivning. 1 cis og Z trans og E buten manan.dk 3

KU Almen Kemi Forelæsning 03 Total Forelæsninger 14 cis-trans versus E-Z navngivning. 2 cis og E trans og Z 2-chlorbuten manan.dk 4

KU Almen Kemi Forelæsning 03 Total Forelæsninger 14 Navngivning trans-3-methyl-2-penten (E)-3-methyl-2-penten (E)-3-methylpent-2-en 3-methyl-cyclohexen 1 2 3 4 2-methyl-butadien (isopren) Der frigives 330 M ton isopren pr. år fra planter trans,cis-3-methyl-2,4-heptadien (2E,4Z)-3-methyl-2,4-heptadien (2E,4Z)-3-methylhepta-2,4-dien 2-hexyn manan.dk 5

KU Almen Kemi Forelæsning 03 Total Forelæsninger 14 Navngivning methylbenzen toluen 1,3-dimethylbenzen meta-dimethylbenzen m-dimethylbenzen 1,4-dimethylbenzen para-dimethylbenzen p-dimethylbenzen 1,2-dimethylbenzen ortho-dimethylbenzen o-dimethylbenzen 1-butyl-3-methylbenzen manan.dk 6

KU Almen Kemi Forelæsning 03 Total Forelæsninger 14 isopren (330 M ton/år fra planter) zingiberen (ingefær) vitamin A manan.dk 7

KU Almen Kemi Forelæsning 03 Total Forelæsninger 14 Addition af hydrogenchlorid: Reaktionsmekanisme: Elektrofil addition manan.dk 8

KU Almen Kemi Forelæsning 03 Total Forelæsninger 14 Addition af vand: Elektrofil addition manan.dk 9

KU Almen Kemi Forelæsning 03 Total Forelæsninger 14 Addition af brom (eller chlor): Elektrofil addition manan.dk 10

KU Almen Kemi Forelæsning 03 Total Forelæsninger 14 Oxidation med osmium tetraoxid: manan.dk 11

KU Almen Kemi Forelæsning 03 Total Forelæsninger 14 Reduktion af alkener Aromater reagerer kun ved meget høje tryk og temperaturer manan.dk 12

KU Almen Kemi Forelæsning 04 Total Forelæsninger 14 Alkoholer, thioler, ethere og epoxider: Struktur Navngivning Fysiske egenskaber polaritet hydrogenbindinger Reaktioner Syre-base egenskaber Substitution og elimination af alkoholer Oxidation af alkoholer og thioler Hydrolyse af epoxider til dioler manan.dk 1

KU Almen Kemi Forelæsning 04 Total Forelæsninger 14 Alkoholer danner hydrogenbindinger manan.dk 2

KU Almen Kemi Forelæsning 04 Total Forelæsninger 14 2-hydroxypropansyre (mælkesyre) trans-2-methylcyclohexanol 1,2-pentandiol (diol, glycol) 2-methyl-2-propanol (tertiær alkohol) pentanol (primær alkohol) 2-pentanol (sekundær alkohol) manan.dk 3 Navngivning af alkoholer

KU Almen Kemi Forelæsning 04 Total Forelæsninger 14 Oxidation af primære alkoholer (alkohol) (aldehyd) (carboxylsyre) Stærke oxidationsmidler som f.eks. H 2 Cr 2 O 7 giver carboxylsyre PCC giver aldehyd: pyridiniumchlorochromate (PCC) manan.dk 4

KU Almen Kemi Forelæsning 04 Total Forelæsninger 14 Oxidation af sekundære alkoholer (alkohol) (keton) manan.dk 5

KU Almen Kemi Forelæsning 04 Total Forelæsninger 14 Navngivning af ethere ethoxyethane (diethylether) 3-methoxypentane methoxycyclohexane tetrahydrofuran tetrahydropyran 1,4-dioxan ethenoxide (et epoxide) manan.dk 6

KU Almen Kemi Forelæsning 05 Total Forelæsninger 14 Aminer og aminosyrer Navngivning Alifatiske aminer Cykliske aminer Klassificering Egenskaber Syre/base-egenskaber Hydrogenbindinger Aminosyrer Sidekædegrupper Syre/base-egenskaber manan.dk 1

KU Almen Kemi Forelæsning 05 Total Forelæsninger 14 Klassificering og navngivning primær amin sekundær amin tertiær amin methanamin methylamin N-methylethanamin methylethylamin N,N-dimethylethanamin dimethylethylamin manan.dk 2

KU Almen Kemi Forelæsning 05 Total Forelæsninger 14 Cycliske aminer benzenamin anilin N-methylbenzenamin N-methylanilin pyrolidin pyrol indol imidazol piperidin pyridin manan.dk 3

KU Almen Kemi Forelæsning 05 Total Forelæsninger 14 Anilins resonansformer manan.dk 4

KU Almen Kemi Forelæsning 05 Total Forelæsninger 14 Nitroanilins resonansformer manan.dk 5

KU Almen Kemi Forelæsning 05 Total Forelæsninger 14 Aminer danner hydrogenbindinger manan.dk 6

KU Almen Kemi Forelæsning 05 Total Forelæsninger 14 α-aminosyre sidekæde Til venstre: L-form (S)-2-aminopropansyre L-alanin Naturligt forekommende Til højre: D-form (R)-2-aminopropansyre D-alanin manan.dk 7

KU Almen Kemi Forelæsning 05 Total Forelæsninger 14 Zwitterion: Molekyle med positiv og negativ ladning syre Zwitterion base manan.dk 8

KU Almen Kemi Forelæsning 05 Total Forelæsninger 14 Aminosyrernes sidekæder manan.dk 9

KU Almen Kemi Forelæsning 05 Total Forelæsninger 14 ph Glycin n base manan.dk 10

KU Almen Kemi Forelæsning 05 Total Forelæsninger 14 ph Histidin n base manan.dk 11

KU Almen Kemi Forelæsning 06 Total Forelæsninger 14 Atomers elektronstruktur Atomets opbygning Hydrogenatomets energitilstande Atomare spektre er diskrete Elektronenergier er kvantiserede - kvantetallet n Atomer med flere elektroner De fire kvantetal n, l, m l og m s Atomorbitaler Pauli's udelukkelsesprincip Elektronernes energiniveauer Elektronkonfiguration Det periodiske system - ædelgaskonfiguration og oktetregel Atomare ioners elektronkonfiguration manan.dk 1

KU Almen Kemi Forelæsning 06 Total Forelæsninger 14 Hydrogenatomets energiniveauer og spektrum E n= n=6 n=5 n=4 n=3 Paschen serien n=2 Balmer serien n=1 Lyman serien manan.dk 2

KU Almen Kemi Forelæsning 06 Total Forelæsninger 14 Elektrontilstande for atomer m l m s manan.dk 3

KU Almen Kemi Forelæsning 06 Total Forelæsninger 14 Laveste niveauer fyldes først manan.dk 4

KU Almen Kemi Forelæsning 06 Total Forelæsninger 14 Det periodiske system manan.dk 5

KU Almen Kemi Forelæsning 06 Total Forelæsninger 14 Atomnumre og det periodiske system manan.dk 6

KU Almen Kemi Forelæsning 06 Total Forelæsninger 14 Vi deler det periodiske system manan.dk 7

KU Almen Kemi Forelæsning 06 Total Forelæsninger 14 Orbitaler og det periodiske system manan.dk 8

KU Almen Kemi Forelæsning 06 Total Forelæsninger 14 Chlor 17 Cl: [Ne] 3s2 3p 5 manan.dk 9

KU Almen Kemi Forelæsning 06 Total Forelæsninger 14 Kalium K: [Ar] 4s1 19 manan.dk 10

KU Almen Kemi Forelæsning 06 Total Forelæsninger 14 Jern 26 Fe: [Ar] 4s2 3d 6 manan.dk 11

KU Almen Kemi Forelæsning 06 Total Forelæsninger 14 Bly 84 Pb: [Xe] 6s2 4f 14 5d 10 6p 2 manan.dk 12

KU Almen Kemi Forelæsning 06 Total Forelæsninger 14 Neon 10 Ne: 1s2 2s 2 2p 6 F - O 2- N 3- Na + Mg 2+ manan.dk 13

KU Almen Kemi Forelæsning 06 Total Forelæsninger 14 Elektronegativitet manan.dk 14

KU Almen Kemi Forelæsning 06 Total Forelæsninger 14 Atomorbitaler s p d manan.dk 15

KU Almen Kemi Forelæsning 07 Total Forelæsninger 14 Kemisk binding Hydrogenmolekylet og kovalent binding Lewis-strukturer Oktetreglen Lone-pair elektroner Resonansstrukturer Formel ladning Atom- og bindingsorbitaler Hybridorbitaler Sigma- og pi-bindinger Rumlig struktur manan.dk 1

KU Almen Kemi Forelæsning 07 Total Forelæsninger 14 Potentialfunktion for hydrogenmolekylet manan.dk 2

KU Almen Kemi Forelæsning 07 Total Forelæsninger 14 Valenselektroner og det periodiske system manan.dk 3

KU Almen Kemi Forelæsning 07 Total Forelæsninger 14 Tegning af Lewisstrukturer: 1) Tæl antallet af valenselektroner. 2) Tegn en struktur med enkeltbindinger. 3) Bestem hvor mange elektroner der er til rest. 4) Bestem hvor mange elektroner der skal til for at opfylde oktetreglen ved at fylde op med lonepair. 5) Hvis der er fyldt for mange elektroner på fjernes lonepair og der introduceres dobbelt eller trippelbindinger til antallet passer med punkt 3). manan.dk 4

KU Almen Kemi Forelæsning 07 Total Forelæsninger 14 VSEPR-modellen og rumlig struktur manan.dk 5

KU Almen Kemi Forelæsning 07 Total Forelæsninger 14 Hybridisering sp 3 p x s sp 3 sp 3 sp 3 sp 2 p z sp 2 p y sp 2 p z p z sp sp p x manan.dk 6

KU Almen Kemi Forelæsning 07 Total Forelæsninger 14 Ethen: sp 2 -hybridiseret Ethyn: sp-hybridiseret H H H C C H H C C H p-orbital p-orbital p-orbital p-orbital danner π-binding p-orbital p-orbital danner to π-bindinger manan.dk 7

KU Almen Kemi Forelæsning 08 Total Forelæsninger 14 Carboxylsyrer Struktur Navngivning Egenskaber Hydrogenbindinger - dimerdannelse - høje kogepunkter Hydrofil og hydrofob Syre- og baseegenskaber - Syrestyrkekonstant - Induktiv effekt - Resonanseffekter Reaktioner Reduktion Esterdannelse Omdannelse til syrechlorider Decarboxylering manan.dk 1

KU Almen Kemi Forelæsning 08 Total Forelæsninger 14 methansyre (myresyre) cyclohexancarboxylsyre ethansyre (eddikesyre) benzoesyre propansyre 2-hydroxybenzoesyre (salicylsyre) 3-butensyre ethandisyre (oxalsyre) 1,2-benzendicarboxylsyre (pthalsyre) propandisyre (malonsyre) 3-oxobutansyre butandisyre (ravsyre) (E)-butendisyre (fumarsyre) 2-hydroxypropansyre (mælkesyre) manan.dk 2

KU Almen Kemi Forelæsning 08 Total Forelæsninger 14 Kogepunkter - Evne til at danne hydrogenbindinger Eddikesyre 118 C donor + acceptor + dipol propanol 97 C donor + acceptor propanal 48 C acceptor + dipol butan 0 C Kun derspersionskræfter manan.dk 3

KU Almen Kemi Forelæsning 08 Total Forelæsninger 14 Den induktive effekt - nogle pk A -værdier eddikesyre 4.76 chloreddikesyre 2.86 trichloreddikesyre 0.70 propansyre 4.87 2-hydroxypropansyre (mælkesyre) 3.86 2-oxopropansyre (pyrodruesyre) 2.39 manan.dk 4

KU Almen Kemi Forelæsning 08 Total Forelæsninger 14 Resonanseffekter benzoesyre pk A = 4.19 3-hydroxybenzoesyre pk A = 4.06 2-hydroxybenzoesyre (salicylsyre) pk A = 2.97 manan.dk 5

KU Almen Kemi Forelæsning 08 Total Forelæsninger 14 Salicylationens resonansformer - fordeling af negativ ladning stabiliserer anionen manan.dk 6

KU Almen Kemi Forelæsning 08 Total Forelæsninger 14 Reduktionsmidlernes selektivitet LiAlH 4 NaBH 4 Pd, H 2 Carboxylsyre alkohol - - Aldehyd/keton alkohol alkohol alkohol Alken - - alkan Eksempel: manan.dk 7

KU Almen Kemi Forelæsning 08 Total Forelæsninger 14 Fisheresterificering manan.dk 8

KU Almen Kemi Forelæsning 08 Total Forelæsninger 14 Decarboxylering af β-ketosyre β-ketosyre [Enol + CO 2 ] Keton + CO 2 manan.dk 9

KU Almen Kemi Forelæsning 08 Total Forelæsninger 14 Derivater af carboxylsyrer syrechlorid anhydrid ester lacton amid lactam imid manan.dk 10

KU Almen Kemi Forelæsning 09 Total Forelæsninger 14 Chiralitet Stereoisomeri Chirale og achirale forbindelser IUPAC-navngivning R,S-systemet Prelog, Ingold & Cahn Flere chirale centre Antal stereoisomere Enantiomere og diastereomere Kemiske egenskaber Optisk aktivitet Meso-forbindelser manan.dk 1

KU Almen Kemi Forelæsning 09 Total Forelæsninger 14 Isomeri Strukturisomeri Stereoisomeri cis-trans isomeri Spejlbilledeisomere manan.dk 2

KU Almen Kemi Forelæsning 09 Total Forelæsninger 14 Spejlbilledeisomeri manan.dk 3

KU Almen Kemi Forelæsning 09 Total Forelæsninger 14 Chirale og achirale molekyler * * * manan.dk 4

KU Almen Kemi Forelæsning 09 Total Forelæsninger 14 Prelog-Ingold-Cahn 1 6 7 8 9 16 17 35 54 1. -H -CH 3 -NH 2 -OH -F -SH -Cl -Br -I stigende prioritet 1 6 7 8 17 2. -CH 2 -H -CH 2 -CH 3 -CH 2 -NH 2 -CH 2 -OH -CH 2 -Cl 3. stigende prioritet manan.dk 5

KU Almen Kemi Forelæsning 09 Total Forelæsninger 14 Bilen drejer til venstre - s-form Bilen drejer til højre - R-form 17 Cl 35 Br 35 Br 17 Cl 9 F 9 F manan.dk 6

KU Almen Kemi Forelæsning 09 Total Forelæsninger 14 Eksempler på R,S-navngivning (R)-butan-2-ol (R)-3-methylcyclopenten (R)-3-methylhex-5-ynnitril (S)-3-chlor-1,1-dimethylcyclopentan (S)-3-methylpenten (3S,4R,5R)-3,4,5-trimethyloctan manan.dk 7

KU Almen Kemi Forelæsning 09 Total Forelæsninger 14 Enantiomere og diastereomere par Enantiomere (spejlbilleder) Enantiomere (spejlbilleder) Diastereomere par (ikke spejlbilleder) manan.dk 8

KU Almen Kemi Forelæsning 09 Total Forelæsninger 14 Mesoformer har spejlplan(er) Mesoform Enantiomere R,S R,R S,S Identiske manan.dk 9

KU Almen Kemi Forelæsning 09 Total Forelæsninger 14 1,3-dimethylcyclopentan Mesoform Enantiomere R,S S,S R,R cis trans trans manan.dk 10

KU Almen Kemi Forelæsning 10 Total Forelæsninger 14 Enolationen Struktur og resonans Syre- og baseegenskaber Enolationen som nucleofil Aldolkondensation Mekanisme Dehydrering af β-hydroxyketoner Krydsede reaktioner Intramolekylære reaktioner Claisenkondensation Mekanisme Decarboxylering af β-ketoester Dieckmankondensation Eksempler fra biokemien manan.dk 1

KU Almen Kemi Forelæsning 10 Total Forelæsninger 14 Enolationens dannelse Carbanion Resonans stabiliserer carbanionen/enolationen Enolation manan.dk 2

KU Almen Kemi Forelæsning 10 Total Forelæsninger 14 Syrestyrker pk a Carboxylsyre 4.75 Alkohol 16 Aldehyd/keton 20 Alkan 51 manan.dk 3

KU Almen Kemi Forelæsning 10 Total Forelæsninger 14 Flere mulige enolationer manan.dk 4

KU Almen Kemi Forelæsning 10 Total Forelæsninger 14 Enolationen som nucleofil manan.dk 5

KU Almen Kemi Forelæsning 10 Total Forelæsninger 14 Aldolkondensation manan.dk 6

KU Almen Kemi Forelæsning 10 Total Forelæsninger 14 Aldolkondensation - mekanisme manan.dk 7

KU Almen Kemi Forelæsning 10 Total Forelæsninger 14 Krydsede aldolkondensationer manan.dk 8

KU Almen Kemi Forelæsning 10 Total Forelæsninger 14 Dehydrering af β-hydroxyaldehyd/keton - basekatalyseret manan.dk 9

KU Almen Kemi Forelæsning 10 Total Forelæsninger 14 Claisenkondensation - mekanisme pk a =10.7 pk a =16.1 manan.dk 10

KU Almen Kemi Forelæsning 10 Total Forelæsninger 14 Claisen - hydrolyse - decarboxylering manan.dk 11

KU Almen Kemi Forelæsning 10 Total Forelæsninger 14 Reaktioner i biokemien Claisen (coenzym A) Aldol Reduktion (R)-3,5-dihydroxy-3-methylpentanoat (R)-mevalonat manan.dk 12

KU Almen Kemi Forelæsning 10 Total Forelæsninger 14 Coenzym A manan.dk 13

KU Almen Kemi Forelæsning 10 Total Forelæsninger 14 Nicotinamid adenin dinucleotid NAD + NADH manan.dk 14

KU Almen Kemi Forelæsning 11 Total Forelæsninger 14 Haloalkaner - oversigt: Struktur Navngivning Anvendelser Nukleofil alifatisk substitution S N 1 og S N 2 mekanismerne Substitutionsreaktioner β-elimination E1 og E2 mekanismerne Fås substitution eller elimination? manan.dk 1

KU Almen Kemi Forelæsning 11 Total Forelæsninger 14 Navngivning af haloalkaner -kun prefix chlorpropan 2-brompropan trichlormethan (chloroform) 1,3-dichlor-2-methylbuthan 6 5 4 3 2 1 bromcyclohexan trans-1,2-dichlorcyclohexan chlorcyclopropan 2-chlor-3-(1-chlorethyl)-5-fluorhexan manan.dk 2

KU Almen Kemi Forelæsning 11 Total Forelæsninger 14 S N 2-mekanismen Nukleofil Leaving group manan.dk 3

KU Almen Kemi Forelæsning 11 Total Forelæsninger 14 S N 1-mekanismen 1. trin: langsom 2. trin: hurtig manan.dk 4

KU Almen Kemi Forelæsning 11 Total Forelæsninger 14 Nukleofil Alifatisk nukleofil substitution Produkt Hydroxid Alkohol Alkoholat Ether Hydrogensulfid Thiol Thiolat Thioether Amoniak Primær amin Primær amin Sekundær amin Carboxylat Ester manan.dk 5

KU Almen Kemi Forelæsning 11 Total Forelæsninger 14 E2-mekanismen manan.dk 6

KU Almen Kemi Forelæsning 11 Total Forelæsninger 14 E1-mekanismen Trin 1: Trin 2: manan.dk 7

Kulhydrater Struktur Egenskaber Fisherprojektioner Aminosukkerstoffer Stereokemi D,L-nomenklatur Navngivning Pyranose- og Furanoseformer Halvacetaldannelse Haworthprojektioner α- og β-former Reaktioner Glycosiddannelse Reduktion og oxidation Disaccharider Polysaccharider

Aldoser - hydroxyaldehyder Aldotriose D-glyceraldehyd Aldotetrose D-erythrose Aldopentose D-ribose Aldohexose D-allose file:///kl5/smk/tex/mbm/forel/strukttur-aldoser.png

Ketoser - hydroxyketoner Ketotriose dihydroxyacetone Ketotetrose D-erythrulose Ketopentose D-ribulose Ketohexose D-psicose file:///kl5/smk/tex/mbm/forel/strukttur-ketoser.png

Fisherprojektioner file:///kl5/smk/tex/mbm/forel/fisher-definition.png

DL-Navngivning file:///kl5/smk/tex/mbm/forel/dl-navngivning.png OH-gruppe på næstsidste C sidder til højre D = Dexter = til højre D-glyceraldehyd OH-gruppe på næstsidste C sidder til venstre L = Laevus = til venstre L-glyceraldehyd

Eksempel: Glucose file:///kl5/smk/tex/mbm/forel/dl-eksempel.png Denne konfiguration af de øverste 3 chirale angiver glucose D-glucose Næstsidste carbon har OH-gruppen højre d.v.s. D-form L-glucose er spejlbilledet af D-glucose Enantiomere former

Fra Fisher- til Haworthprojektion: D-allose Fischer D-form D-form α Haworth β

Navne for α-d-aldohexoser file:///kl5/smk/tex/mbm/forel/hexose-navne.png 000 allose 001 altrose 010 glucose 011 mannose 100 gulose 101 indose 110 galactose 111 talose all altruits gladly make gum in gallon tanks

Mutarotation file:///kl5/smk/tex/mbm/forel/mutarotation.png β H + H + α α-d-glucopyranose β-d-glucopyranose 36% 0.003% 64%

Foretrukne konformationer af glucose α-d-glucopyranose β-d-glucopyranose file:///kl5/smk/tex/mbm/forel/glucose-konformation.png axial ækvatorial

Dannelse af glycosider og N-glycosider α-glycosid β-glycosid α-n-glycosid β-n-glycosid

ATP - adenosintriphosphat Phosphoresterbinding Adenosin β-n-glycosid binding Triphosphat D-Ribose

Nucleotider - byggesten i RNA og DNA Base ribose 2-deoxyribose

Glycosidbindinger mellem monosaccharider α-d-glucose α-d-glucose β-d-galactose α-d-glucose 1 4 α-1,4-glycosidbinding Maltose 1 4 β-1,4-glycosidbinding Lactose

Reduktion af kulhydrater til alditoler D-erythrose Erythriol D-ribulose

Oxidation af sukkerstoffer til aldonsyrer Aldonsyrer

KU Almen Kemi Forelæsning 13 Total Forelæsninger 14 Biologiske makromolekyler og nanostrukturer Polysaccharider Stivelse og glycogen Cellulose RNA og DNA Nucleotider Primær struktur og sekvens DNA dobbelthelix Proteiner Primær struktur og sekvens Sekundær struktur Tertiær struktur Protein-DNA komplekser manan.dk 1

KU Almen Kemi Forelæsning 13 Total Forelæsninger 14 Amylopectin og glycogen Glucoseenhed α-1,6-glycosidbindinger α-1,4-glycosidbindinger manan.dk 2

KU Almen Kemi Forelæsning 13 Total Forelæsninger 14 Cellulose Glucoseenhed β-1,4-glycosidbindinger manan.dk 3

KU Almen Kemi Forelæsning 13 Total Forelæsninger 14 Chitin - Byggematerialet i leddyrs exoskelet N-acety-D-glucosaminenhed β-1,4-glycosidbindinger manan.dk 4

KU Almen Kemi Forelæsning 13 Total Forelæsninger 14 Nucleotider - byggesten i RNA og DNA Base ribose 2-deoxyribose manan.dk 5

KU Almen Kemi Forelæsning 13 Total Forelæsninger 14 DNA's primære struktur 5' 4' 3' 1' 2' 3'-phosphoesterbinding 5'-phosphoesterbinding manan.dk 6

KU Almen Kemi Forelæsning 13 Total Forelæsninger 14 manan.dk 7

KU Almen Kemi Forelæsning 13 Total Forelæsninger 14 manan.dk 8

KU Almen Kemi Forelæsning 13 Total Forelæsninger 14 Guanin (G) Cytosin (C) Hydrogenbindinger manan.dk 9

KU Almen Kemi Forelæsning 13 Total Forelæsninger 14 manan.dk 10

KU Almen Kemi Forelæsning 13 Total Forelæsninger 14 manan.dk 11

KU Almen Kemi Forelæsning 13 Total Forelæsninger 14 Proteiners primære struktur Hydrogenbindingsdonor Hydrogenbidingsacceptor N-terminal Sidekæde C-terminal Peptidbinding (amid) manan.dk 12

KU Almen Kemi Forelæsning 13 Total Forelæsninger 14 Aminosyrernes sidekæder manan.dk 13

KU Almen Kemi Forelæsning 13 Total Forelæsninger 14 Sekundær struktur - β-sheet manan.dk 14

KU Almen Kemi Forelæsning 13 Total Forelæsninger 14 β-sheet repræsenteret grafisk manan.dk 15

KU Almen Kemi Forelæsning 13 Total Forelæsninger 14 α-helix manan.dk 16

KU Almen Kemi Forelæsning 13 Total Forelæsninger 14 manan.dk 17

KU Almen Kemi Forelæsning 13 Total Forelæsninger 14 manan.dk 18

KU Almen Kemi Forelæsning 13 Total Forelæsninger 14 manan.dk 19

KU Almen Kemi Forelæsning 14 Total Forelæsninger 14 Derivater af carboxylsyrer Struktur og navngivning Syrechlorider Anhydrider Estere og lactoner Amider, lactamer og imider Reaktioner Nucleofil acylisk substitution - Reaktion med vand - hydrolyse - Reaktion med alkoholer - Reaktion med ammoniak og aminer Grignardreagens + ester Reduktion Triglycerider og fedtsyrer Forsæbning Peptider Edmandegradering manan.dk 1

KU Almen Kemi Forelæsning 14 Total Forelæsninger 14 Derivater af carboxylsyrer syrechlorid anhydrid ester lacton amid lactam imid manan.dk 2

KU Almen Kemi Forelæsning 14 Total Forelæsninger 14 Navngivning af syrederivater 1 ethanoylchlorid (acetylchlorid) ethansyreanhydrid (eddikesyreanhydrid) ethylethanoat (ethylacetat) hexano-4-lacton manan.dk 3

KU Almen Kemi Forelæsning 14 Total Forelæsninger 14 Navngivning af syrederivater 2 N- methylbromethanamid hexano-5- lactam maleinsyr maleinimi e (usystematiske navne) d manan.dk 4

KU Almen Kemi Forelæsning 14 Total Forelæsninger 14 Nucleofil acylisk substitution nucleofil leaving group manan.dk 5

KU Almen Kemi Forelæsning 14 Total Forelæsninger 14 Hydrolysereaktioner Syrechlorid Anhydrid Ester Amid manan.dk 6

KU Almen Kemi Forelæsning 14 Total Forelæsninger 14 Hydrolyse af syrechlorid nucleofil leaving group manan.dk 7

KU Almen Kemi Forelæsning 14 Total Forelæsninger 14 Basekatalyseret hydrolyse af ester (Forsæbning) manan.dk 8

KU Almen Kemi Forelæsning 14 Total Forelæsninger 14 Reaktioner med ammoniak og aminer manan.dk 9

KU Almen Kemi Forelæsning 14 Total Forelæsninger 14 Reaktiviteten af carboxylsyrederivater Reaktivitet af syrederivat Nucleofilens styrke manan.dk 10

KU Almen Kemi Forelæsning 14 Total Forelæsninger 14 Derivater af phosphorsyre phosphorsyre diphosphorsyre pyrophosphorsyre triphosphorsyre phosphat diphosphat pyrophosphat triphosphat methylphosphat dimethylphosphat Esterbinding Anhydridbinding manan.dk 11

KU Almen Kemi Forelæsning 14 Total Forelæsninger 14 ATP - Adenosintriphosphat Anhydridbinding Esterbinding manan.dk 12

KU Almen Kemi Forelæsning 14 Total Forelæsninger 14 Triglycerider er estere af glycerol og fedtsyrer Glycerol Fedtsyrer Triglycerid manan.dk 13

KU Almen Kemi Forelæsning 14 Total Forelæsninger 14 Phosphoglycerid manan.dk 14

KU Almen Kemi Forelæsning 14 Total Forelæsninger 14 Tetrapeptid - dannet af 4 aminosyrerester Peptidbindinger Phenylalanin Alanin C-terminal N-terminal Asparaginsyre/ aspartat Threonin manan.dk 15

KU Almen Kemi Forelæsning 14 Total Forelæsninger 14 Amid/peptidbindingens resonansformer manan.dk 16

KU Almen Kemi Forelæsning 14 Total Forelæsninger 14 Edmandegradering af peptider phenylisothiocyanat phenylthiohydantoinaminosyre manan.dk 17