Statistik ved Bachelor-uddannelsen i folkesundhedsvidenskab. Mantel-Haenszel analyser

Transkript

1 Statistik ved Bachelor-uddannelsen i folkesundhedsvidenskab Mantel-Haenszel analyser

2 Mantel-Haenszel analyser Sidst lærte vi om stratificerede analyser. I dag kigger vi på et specialtilfælde: både exposure og outcome er dikotome. Vi skal forstå hvad der menes med en confounder-justeret OR. og vi skal forbedre metoderne fra sidst 1. test for ingen effektmodifikation 2. bedre test for betinget uafhængighed 1

3 Generel stratificeret analyse Confounder Z kan antage k forskellige værdier Z = 1 Z = z Z = k Outcome exp Ja Nej ja a 1 b 1... Outcome exp Ja Nej ja a z b z... Outcome exp Ja Nej ja a k b k nej c 1 d 1 nej c z d z nej c k d k ÔR 1 ÔR z ÔR k 2

4 Betinget uafhængighed Betyder: OR=1 i alle del-tabeller. Dvs hvis der bare findes en tabel med OR 1, så er exposure og outcome ikke betinget uafhængige. Naiv testprocedure: 1. udfør χ 2 -test i hver tabel 2. hvis et (eller flere) test er signifikante forkastes hypotesen om betinget uafhænigighed 3

5 Multipel testning Hvad er risiko for type I fejl? Antag H 0 er sand og at vi har 2 strata P (forkast) = 1 P ({accept i stratum 1} {accept i stratum 2}) = 1 P ({accept i stratum 1}) P ({accept i stratum 2}) = = > 0.05 k strata: P (forkast) = k, k = 10 P (forkast) = 0.40 Når vi har mange strata er der stor risiko for en type 1 fejl. (se også resultater fra øvelse 2, opgave 2) Det bedre at kombinere information fra forskellige strata i et samlet test - f.eks globalt χ 2 -test 4

6 Program Odds-ratio (OR) stratificerede analyser confounding og effektmodifikation Mantel Haenszel OR estimatet Breslow-Day test for homogene OR Mantel Haenszel test for betinget uafhængighed 5

7 Effekt af DTP vaccination i Bissau-data Død DTP ja nej total ja % 95.72% nej % 95.87% total Odds Ratio: 1.04, 95%-CI (0.79, 1.37), p = 0.78 Effekten er ikke statistisk signifikant 6

8 Er BCG-vaccination en confounder? DTP BCG DØD Vi har tidligere set at BCG forbedrer overlevelsen 7

9 Sammenhæng mellem DTP og BCG BCG DTP ja nej total ja % 1.4% nej % 62.6% total χ 2 = 2043, df = 1, p < Børn med DTP har med stor sandsynlighed også fået BCG 8

10 Konklusion BCG-vaccination er en confounder OK, vi stratificerer efter BCG - no problem 9

11 Effekt af DTP for børn med BCG Død DTP ja nej total ja % 95.75% nej % 97.15% total Odds Ratio: 1.51, 95%-CI (1.01; 2.27), p =

12 Effekt af DTP for børn uden BCG Død DTP ja nej total ja % 93.55% nej % 95.11% total Odds Ratio: 1.34, 95%-CI (0.31; 5.70), p =

13 Hvad så vi? Efter stratifikation for BCG blev den skadelige DTP effekt stærkere Ukorrigeret: 1.04, 95%-CI (0.79, 1.37) Stratificeret: stratum odds-ratio med BCG ÔR 1 = 1.51( ) uden BCG ÔR 2 = 1.34( ) Næste skridt er at teste om BCG modificerer effekten af DTP Ingen effektmodifikation H 0 : OR 1 = OR 2 12

14 Generel stratificeret analyse Variabel Z kan antage k forskellige værdier Z = 1 Z = z Z = k Outcome exp Ja Nej ja a 1 b 1... Outcome exp Ja Nej ja a z b z... Outcome exp Ja Nej ja a k b k nej c 1 d 1 nej c z d z nej c k d k ÔR 1 ÔR z ÔR k 13

15 Hypotesen om ingen effektmodifikation Under hypotesen er OR homogene over strata H 0 : OR 1 = OR 2 =... = OR k Hypotesen testes ved det såkaldte Breslow-Day test. Her sammenlignes celle-antal i hver af de k del-tabeller med forventede celle-antal under hypotesen. De forventede celletal under hypotesen? De forventede celletal beregnes ved at kræve at OR er den samme i alle del-tabeller. Hvilken fælles værdi? Mantel-Haenszel løste problemet i

16 Mantel-Haenszel estimat af fælles odds-ratio Mantel-Haenszel estimatet er et vægtet gennemsnit over odds-ratio værdierne i de forskellige strata: ÔR mh = w 1 ÔR 1 + w 2 ÔR w k ÔR k hvor w 1 + w w k = 1 Mantel-Hanszel vægte er proportinale med b zc z n z 15

17 Mantel-Haenszel estimat i Bissau data Mantel-Hanszel vægte er proportinale med b zc z n z med BCG-vaccination: = 20.5 uden BCG-vaccination: = 1.3 vægte: w med = 0.93 og w uden = 0.06 Samlet estimat er derfor: ÔR mh = =

18 Breslow-Day test for ingen effektmodifikation Er Odds-ratio værdierne de samme i de forskellige strata? Observerede celletal (a z, b z, c z, d z ) sammenlignes med forventede celletal under hypotesen [E(a z ), E(b z ), E(c z ), E(d z )] De forventede celletal beregnes ved at kræve at 1. samme række- og søjlesummer som observeret 2. odds ratio skal være lig med ÔR mh i alle strata Beregn et χ 2 -test, der sammenligner de observerede og de forventede værdier χ 2 = k [ [a z E(a z )] 2 E(a z ) z=1 + [b z E(b z )] 2 E(b z ) + [c z E(c z )] 2 E(c z ) + [d z E(d z )] 2 E(d z ) ] Under H 0 : χ 2 -fordelt med k 1 frihedsgrader 17

19 Bissau data - Breslow-Day test Breslow-Day test strata odds-ratio med BCG 1.51 ( ) uden BCG 1.34 ( ) Mantel-Haenszel 1.50 ( ) χ 2 = 0.025, df = 2 1 = 1, p = 0.87 Tendens til effektmodifikation er insignifikant. Effekten af DTP afhænger ikke af BCG. 18

20 Ingen effektmodifikation Confounder Z kan antage k forskellige værdier Z = 1 Z = z Z = k Outcome exp Ja Nej ja a 1 b 1 nej c 1 d 1... Outcome exp Ja Nej ja a z b z nej c z d z... Outcome exp Ja Nej ja a k b k nej c k d k OR 1 = a OR z = a OR k = a Der er den samme odds-ratio i hver tabel (her kaldet a) 19

21 Næste skridt - test for betinget uafhængighed Confounder Z kan antage k forskellige værdier Z = 1 Z = z Z = k Outcome exp Ja Nej ja a 1 b 1 nej c 1 d 1... Outcome exp Ja Nej ja a z b z nej c z d z... Outcome exp Ja Nej ja a k b k nej c k d k OR 1 = a OR z = a OR k = a Der er den samme odds-ratio i hver tabel (her kaldet a) Næste skridt er at teste om den fælles odds ratio er 1 (H 0 : a = 1) Svarer til at exposure og outcome er betinget uafhængige givet Z 20

22 Test for betinget uafhængighed Hvis effektmodifikationen ikke er signifikant er næste skridt at teste om outcome er betinget uafhængig af exposure givet confounder Dvs om den fælles OR er 1. Vi har Mantel-Haenszel: ÔR mh = 1.50 ( ) Et formeldt test kan opnåes ved: Under hypotesen følger Wald-teststørrelsen: z = en standardiseret normalfordeling. log ÔR mh s.e[log ÔR mh] Vi får z = log ÔR mh s.e[log ÔR mh] = = 2.05, p = Konklusion: Efter korrektion for BCG er der afhængighed mellem DTP og dødelighed. 21

23 Mantel-Haenszel test for betinget uafhængighed 1. Opstil 2X2-tabel for sammenhæng mellem exposure og outcome 2. Beregn de forventede celletal - hvis exposure ikke har effekt, men under hensyntagen til at Z kan have en effekt. 3. Beregn forskel mellem observeret og forventet 4. Vurder signifikansen i χ 2 1-fordeling Proceduren er altså den samme som i χ 2 -testet for uafhængighed det eneste der anderledes er beregningen af de forventede celletal. 22

24 Forventede celletal under betinget uafhængighed Død DTP ja nej total ja F 11 F nej F 21 F total Forventede celletal hvis DTP ikke har effekt, men under hensyntagen til at BCG kan have en effekt: Ud af de 2172 DTP-børn har 2141 fået BCG og 31 har ikke fået BCG: F 11 = 2141 P (død BCG) + 31 P (død uden BCG) = = 82.8 (se næste slide) Hvis jeg glemmer at korrigere for BCG: F 11 = 2172 P (død) = = 91.0 Det forventede antal døde i DTP-gruppen bliver lavere når jeg tager højde for at en stor andel har fået den gode BCG-vaccine. 23

25 Dødssandsynligheder i de to BCG-grupper Udfra data hvad er da vores bedste bud på dødssandsynlighederne? død BCG ja nej total ja nej total p 1 =124/3300=3.76% p 2 = 97/1973=4.92% 24

26 χ 2 -test uden og med korrektion for BCG Observeret død DTP ja nej total ja nej total Forventet uden BCG Forventet med BCG død død DTP ja nej total DTP ja nej total ja ja nej nej total total p = 0.78 p =

27 Er DTP og Død uafhængige givet BCG? To tests af hypotesen om ingen sammenhæng: 1. Wald-test z = log ÔR mh s.e[log ÔR mh ] = = 2.05, p = Mantel-Haenszel test χ 2 = 3.87, df = 1, p = DTP har en signifikant effekt efter korrektion for BCG. 26

28 Fortolkning: Unadjusted vs Mantel-Haenszel Resultater om effekten af DTP: 1. Unadjusted: ÔR = %-CI: , p > Mantel-Haenszel: ÔR = %-CI: , p = 0.04 Fortolkning: 1. Unadjusted OR sammenligner tilfældige DTP-vaccinerede med tilfældige ikke DTP-vaccinerede - her så vi kun en meget lille overdødelighed blandt DTP-vaccinerede (fordi disse børn oftere har den gavnlige BCG-vaccination) 2. Mantel-Haenszel OR sammenligner DTP vaccinerede med ikke DTP-vaccinerede der har samme BCG-status - her så vi en signifikant overdødelighed i DTP-gruppen 27

29 Stratificerede analyser: arbejdsgang 1. Beregn OR for sammenhængen mellem eksponering og outcome for hver værdi af stratificeringsvariabelen (confounderen) 2. Test for ingen effektmodifikation (Breslow-Day test). Forkast: Effekt af eksponering på outcome afhænger af stratificeringsvariabel. Analysen stopper. Angiv OR i hvert stratum Ikke forkast: fortsæt til næste trin 3. Beregn fælles OR (Mantel-Haenszel) 4. Test for betinget uafhængighed - er den fælles OR signifikant forskellig fra 1 (f.eks Mantel Haenszel s test) 28

30 Bogen: rygning og hjertesydom rygning tidl. syg. hjertesygd. 29

31 Eksemplet - Breslow-Day test Breslow-Day test strata odds-ratio ingen tidligere sygdom ( ) tidligere sygdom ( ) χ 2 = 7.33, df = 1, p = Signifikant evidens for effektmodifikation. Effekten af rygning afhænger af tidligere hjertesygdom. Det giver nu ikke mening at angive en fælles OR. 30

32 Mantel-Haenszel: Begrænsninger? Hvad nu hvis jeg har en kontinuert confounder? Mantel-Haenszel kan ikke være med - brug logistisk regression som også kan klare en kontinuert exposure variabel Logistisk regression er emnet resten af kurset 31