Nyhedsbrev Nr. 1 2015 April 2015 Redaktion: Marianne Nielsine Skov marianne.skov@rsyd.dk, Michael Kemp: michael.kemp@rsyd.dk, Janne Kudsk Klitgaard: jkklitgaard@health.adu.dk, Lone R. Ejrnæs (Redaktør): lone.ejrnaes@rsyd.dk Velkommen til første udgave af Nyhedsbrev for Klinisk Mikrobiologi Kære læser Dette er en forsmag på Nyhedsbrevet for Forskningsenheden for Klinisk Mikrobiologi. Nyhedsbrevet skal fungere som kommunikationsredskab for alle, der deltager i forskning på forskningsenheden. Ud over konkrete oplysninger af generel interesse for forskningen håber vi at nyhedsbrevet kan bidrage til at vi lærer mere om hinandens forskning og derved får mulighed for i højere grad at udnytte mulige synergier. Vi planlægger fire udgivelser årligt, i slutningen af hvert kvartal. I starten af den måned, hvor nyhedsbrevet udkommer, vil der blive indkaldt bidrag med deadline midt samme måned. Indlæg til nyhedsbrevet sendes til redaktøren (Lone). Planlægningsgruppen for nyhedsbrevet har tænkt sig at følgende emner skal dækkes, men det vil naturligvis kunne justeres hen ad vejen efterhånden som behovet for ændringer viser sig. Vi håber, at Nyhedsbrevet kan være til gavn og glæde for alle, der interesserer sig for klinisk mikrobiologisk forskning og ser frem til mange gode indlæg. Lone (redaktør), Marianne, Janne, Michael
Personale Kort præsentation af nye medarbejdere og andre, der får tilknytning til forskningsenheden. 2)Præsentation af en af enhedens forskere ( kvartalets forsker ): En kort omtale af en af forskningsenhedens medarbejdere. Velkommen til Stud.med. Marie Olssøn Østby-Delgum og stud. med. Charlotte Anderman. Marie og Charlotte skal skrive kandidatspeciale om klinisk mikrobiologisk anvendelse af genomsekventering af bakterier. Vejledere: Marianne Skov og Michael Kemp. Stud. scient. Guillem Montamat. Guillem er bachelorstuderende fra Barcelona Universitet og tilbringer foråret i enheden (feb.-jun.). Guillem arbejder i sit projekt med tarmpatogene E. coli og belyser bl.a. toxinproduktion under physiologiske vækstbetingelser og vejledes af Rune Pedersen og Thomas Emil Andersen. Stud. med. Eline Skilhagen Thormodsen og stud. med. Håkon Viker Nordland som skriver kandidat speciale om phytokemi til behandling af bakterielle infektioner. Vejleder: Janne Kudsk Klitgaard. Nyt om projekter Spændende nyt, sjove/vigtige observationer, oplæg til diskussioner, spørgsmål, o.l. Stud. scient Kirstine Lindhardt Madsen og Nadia Davidsen deltog i Novo Nordisk Scholarship symposium 10. marts 2015 hvor de præsenterede deres populærvidenskabelige artikler Biofilm-bakterieslim på rejse i kroppen og Menningitis: Infektion af babyhjerner kan skyldes søde bakterieproteiner. Artiklerne er skrevet på baggrund af Kirstine og Nadias specialeprojekter, som delvis er udført på KMA. Kirstines artikel er efterfølgende blevet udvalgt til offentliggørelse på Videnskab.dk hvor man vil kunne læse den i nær fremtid. Kopier af de to spændende artikler bliver lagt ud på enhedens hjemmeside. Formidling Antagne videnskabelige publikationer, herunder mødeabstracts Husk at sende publikationer, herunder abstracts fra kongres- og mødepræsentationer, til Lone, så de kan blive registreret i PURE. Postere: Giardiasis and cryptosporidiosis in children, Southern Denmark. D.M. Skovgaards, G.N Hartmeyer, M.N. Skov, R. Dessau & M. Kemp. Dansk Selskab for Parasitologi og Dansk Selskab for Tropemedicin og International Sundhed årsmøde, Frederiksberg, 20.03.2015. Whole Genome DNA Sequencing of bacteria and free online analyzing tools in local infection control M. Kemp, E. Knudsen, B. Gahrn-Hansen, H.J. Kolmos, A. Holm, M. Detlefsen & M. N. Skov. ECCMID 2015, København, 25.04 28.04 2015. Whole genome sequencing and use of free internet software in the investigation of an outbreak with methicillin resistant Staphylococcus aureus in a neonatal ward. M.L. Slott Jensen, M.N. Skov, M. Detlefsen. A. Holm & M.Kemp. ECCMID 2015, København, 25.04 28.04 2015. A unique case of metronidazole resistant Bacteroides fragilis and B. thetaiotaomicron from one patient; first report of nimj metronidazole resistance gene in B. Thetaiotaomicron. T.V. Sydenham, O. Källman, C.G. Giske, M. Kemp & U.S: Justesen. ECCMID 2015, København, 25.04 28.04 2015. Time for a change in strategy of diagnostic parasitology. G.N. Hartmeyer, S.V. Hoegh, M.N. Skov, E. Knudsen & M. Kemp. ECCMID 2015, København, 25.04 28.04 2015.
Artikler: Lund LC, Sydenham TV, Høgh SV, Skov M, Kemp M, Justesen US. Draft Genome Sequence of "Terrisporobacter othiniensis" Isolated from a Blood Culture from a Human Patient. Genome Announc. 2015 Mar 5;3(2). pii: e00042-15. doi: 10.1128/genomeA.00042-15. PubMed PMID: 25744994; PubMed Central PMCID: PMC4358381. Hammerum AM, Hansen F, Skov MN, Stegger M, Andersen PS, Holm A, Jakobsen L, Justesen US. Investigation of a possible outbreak of carbapenem-resistant Acinetobacter baumannii in Odense, Denmark using PFGE, MLST and whole-genome-based SNPs. J Antimicrob Chemother. 2015 Mar 19. pii: dkv072. [Epub ahead of print] PubMed PMID: 25795772. Marbjerg LH, Gaini S, Justesen US. First Report of Sphingomonas koreensis as a Human Pathogen in a Patient with Meningitis. J Clin Microbiol. 2015 Mar;53(3):1028-30. doi: 10.1128/JCM.03069-14. Epub 2014 Dec 24. PubMed PMID: 25540396. Sydenham TV, Sóki J, Hasman H, Wang M, Justesen US; ESGAI (ESCMID Study Group on Anaerobic Infections). Identification of antimicrobial resistance genes in multidrug-resistant clinical Bacteroides fragilis isolates by whole genome shotgun sequencing. Anaerobe. 2015 Feb;31:59-64. doi: 10.1016/j.anaerobe.2014.10.009. Epub 2014 Nov 11. PubMed PMID: 25464141. Nagy E, Justesen US, Eitel Z, Urbán E; ESCMID Study Group on Anaerobic Infection. Development of EUCAST disk diffusion method for susceptibility testing of the Bacteroides fragilis group isolates. Anaerobe. 2015 Feb;31:65-71. doi: 10.1016/j.anaerobe.2014.10.008. Epub 2014 Nov 11. PubMed PMID: 25464140. Klein K, Palarasah P, Kolmos HJ, Møller-Jensen J, Andersen TE; Quantification of filamentation by uropathogenic Escherichia coli during experimental bladder cell infection by using semi-automated image analysis. J. Microbiol. Methods. 2015 (109) 110-116. Anden formidling Kommende møder og konferencer med deadlines for tilmelding http://www.trippus.se/web/presentation/web.aspx?evid=/e5h44xn6obfmotixoqs5g==&ecid=wzeuuynrqe1e6e0k33zsya==&ln=eng&view=ca tegory&template=desktop Abstract: submission 1. june 2015. Økonomi Opnået støtte: Hans Jørn Kolmos og Thomas Emil Andersen har fra OUH s forskningsråd modtaget 334.225,- kr. som dækker en del af egenfinansieringen af det netop opstartede Innovationfondsprojekt New material prevents device thrombosis. Rasmus Grønnemose har modtaget to års Ph.d.-løn (2x500.000 kr), ét år fra OUH s ph.d.-pulje og ét års fakultetstipendium, til projektet Thrombosis and infection caused by blood-contacting medical devices: Elucidation of
pathogenesis and improvement of devices. Sidste år finansieres af Innovationsfondsprojektet New material prevents device thrombosis. Rasmus starter på Ph.d.-studiet 1. april 2015. Gitte N. Hartmeyer har fået 50.000 kr. fra Beckett Fonden til Ph.d. projektet om parasitoser. Daniel M. Skovgaards (stud.med. der starter projekt hos Gitte til efteråret) har fået 20.000 kr. af Beckett-Fonden til projektet "Giardiasis og cryptosporidiose hos børn under 16 år". Til lykke til alle beløbsmodtagere. Kommende deadlines for fonde og legater Projektstøtte ansøgninger termin Navn beløb Link uddybning maj 01 Eva og Henry Frænkels Mindefond 100.000 kræft-,hjerte- og kredsløbssygdomme.støtten kan gives til indkøb af apparatur, udgivelse af videnskabelige skrifter eller til legater til videnskabsmænd og læger til forskning ved videnskabelige institutioner her i landet eller i udlandet, f.eks. gennem udvekslingsophold for danske eller udenlandske videnskabsmænd. maj 01 Beckett Fonden 100.000 http://www.beckettfonden.dk/?page=2 Kun mave-tarm sygdomme indtil maj ansøgning 2015 juli 01 FONDEN AF 17-12-1981 gældend e takster http://www.fondenaf17121981.d k/index.php?option=com_conten t&view=article&id=51&itemid= 55 1-2 ledige skolar- og 1 junior stipendium september 01 http://www.gangstedfonden. dk/ ca 200.000 http://www.gangstedfonden.dk/ Hempel Fonden yder støtte til kulturelle, sociale, humanitære, videnskabelige, kunstneriske og andre almennyttige formål. oktober 01 Lægevidenskabens fremme http://www.apmollerfonde.dk/an soegning/laegefonden.aspx marts 13 Desirée og Niels Ydes Fond april 15 DFF FSS scholarstipendiater april 15 innovationsfonden 5-30 mill http://innovationsfonden.dk/da/soegemulighed/sundhed-og-klinisk-forskning april 15 Region syddanmarks forskningspulje - tværgående forskningsmiljøer 1,5 mill http://www.regionsyddanmark.d k/wm334219 maj 15 Kong Christian d. 10 fond 25.000 http://kongehuset.dk/menu/fonde--legater/kong-christian-den-tiendes-fond 4 x årligt Spar Nord Fonden 40.000? https://www.sparnordfonden.dk/ ansoeg-spar-nord-fonden.aspx Tømmerhandler Bangs Fond Vilhelm 2 mill årligt samlet http://tvbf.dk/ Lundbeckfondens Visiting Professorships til sundhedsvidenskab 750.000 http://www.lundbeckfonden.com /Visiting-Professorships.63.aspx Danske sundhedsvidenskabelige forskningsmiljøer kan i søge om støtte til at tiltrække udenlandske gæsteforskere på professorniveau til Danmark i op til ½ år. Dansk Selskab for Rejsemedicins Legater 4.000 http://www.danskrejsemedicin.dk/default.aspx?pa ge=legater Kongresrejser Dansk Selskab for 10.000 http://www.danskrejsemedicin.dk/default.aspx?pa Videnskabelige projekter om rådgivning til rejsende
Rejsemedicins Legater ge=legater Knud og Edith Eriksens Mindefond op til 1 mill http://keemindefond.businesscat alyst.com/bevillinger-2014.html Knud og Edith Eriksens Mindefond uddeler årligt ca. 1 million kroner i en eller flere portioner til en læge eller videnskabsmand, der arbejder med forskning til bekæmpelse af sygdomme eller til én eller flere sygdomsramte personer. Knud Højgaards Fond khf.dk Knud Højgaards Fond støtter studierejser og konferencedeltagelse i udlandet for ph.d.-studerende og post docs Løbende Bodil Pedersen Fonden Aase og Ejner Danielsens fond Direktør Ob Henriksens fond Lægevidenskabelige selskaber, udenlandske foredragsholdere http://bodilpedersenfonden.dk/a nsoegninger.html http://www.danielsensfond.dk/fonden_st%c3%b8tter/l%c3%a6gevidenskabelig_forskni ng.aspx http://www.dihfond.dk/side4.ht ml http://www.selskaberne.dk/portal/page/portal/lvs/forside/medlemsselskaber/tilskud%20 til%20udenlandsk%20foredragsholder brd. Hartmanns Fond http://www.hartmannfonden.dk/ kontaktformular Apparatur Alfred benzons Workshops 50.000 http://www.benzonfoundation.dk/?q=node/8 Løbende Alfred benzons Symposier http://www.benzonfoundation.dk/?q=node/6 Lundbeckfonden Rejsestipendier 50.000 http://www.lundbeckfonden.com /Rejsestipendier.34.aspx Kongresdeltagelse udland Socialt Andet Evt/andet 1. Husk forskningsmøde d. 8. juni kl. 13-15 2. KMA, OUH er blevet bedt om at arrangere den videnskabelige del af DSKMs årsmøde 2016. Det bliver spændende.