Fra spild til penge brug enzymer



Relaterede dokumenter
Temaøvelse i differentialligninger Biokemiske Svingninger

Reaktionskinetik - 1 Baggrund. lineære og ikke-lineære differentialligninger. Køreplan

Baggrundsmateriale til Minigame 7 side 1 A + B C + D

2. del. Reaktionskinetik

UNDERVISNINGS MINISTERIET KVALITETS- OG TILSYNSSTYRELSEN. KeiTii A. Studenterel<saTilen. Onsdag den 3.juni 2015 kl

[BESØGSSERVICE INSTITUT FOR MOLEKYLÆRBIOLOGI OG GENETIK, AU]

Test Canvas: Eksamen i BMB502 Januar 2012

BASE. Besvarelse til individuel skriftlig test

Studienummer: MeDIS Exam Husk at opgive studienummer ikke navn og cpr.nr. på alle ark, der skal medtages i bedømmelsen

Diffusionsbegrænset reaktionskinetik

[BESØGSSERVICE INSTITUT FOR MOLEKYLÆRBIOLOGI OG GENETIK, AU]

Energi, Enzymer & enzymkinetik.metabolisme

Dosering af anæstesistoffer

Angiv alle C- og H-atomer i whiskyacton Jeg skal i denne opgave alle C- og H-atomer i whiskyacton. Dette gøre jeg ved hjælp af chemsketch.

Som substrat i forsøgene anvender vi para nitrophenylfosfat, der vha. enzymet omdannes til paranitrofenol

Opholdstidsfordeling i Kemiske Reaktorer

Vejledning. Prøven Opgavesættet består af 4 opgaver med i alt 16 delopgaver. Alle hjælpemidler er tilladt.

Viden SIDE 1. Grundskole. Viden om appelsiner. Et kig indenfor

Kemi A. Studentereksamen

Reaktionskinetik

OPGAVER ØL -verdens første svar på anvendt bioteknologi

Enzymer og katalysatorer

3y Bioteknologi A. Lærere TK og JM. Eksamensspørgsmål uden bilag

Matematik A-niveau Delprøve 1

mens mange enzymkatalyserede reaktioner er to-substrat reaktioner (2):

Dynamik. 1. Kræfter i ligevægt. Overvejelser over kræfter i ligevægt er meget vigtige i den moderne fysik.

Stabilitet af kølet tankreaktor

Gymnasium. Osteproduktion. Viden

BIOTEKNOLOGI HØJT NIVEAU

SRP Mat A Kemi B Reaktionskinetik Gülcicek Sacma, 3.x 20. december 2012

Titler på eksamensspørgsmål til kemi B maj/juni 2018

Bioteknologi A. Studentereksamen. Af opgaverne 1 og 2 skal begge opgaver besvares. Af opgaverne 3 og 4 skal en og kun en af opgaverne besvares.

Skriftlig eksamen i Kemi F2 (Fysisk kemi)

Efterbehandling til Enzymer - Klip dit tis i stykker CIRKUS NATURLIGVIS

Differential- ligninger

Forsøgsundervisning i bioteknologi ved gymnasiale uddannelser

Bioteknologi A Kommentarer til opgaveformuleringer i opgavesættet 31. maj 2011

Rikke Lund, 3.f Studieretningsprojekt 21/ Reaktionskinetik

Enzymkemi H. C. Ørsted Ungdomslaboratorium Kemisk Institut Københavns Universitet august 2001

Teknisk Gymnasium Silkeborg - Arla Produktion af mejeriprodukter. Smil(e) Workshop d. 17.april i NVH

Opgave 1 Slankemidler

Lektion 8 Differentialligninger

Skriftlig eksamen i Kemi F2 (Fysisk kemi)

HVORDAN BLIVER TOBAK TIL RØG, OG HVAD INDEHOLDER RØGEN?

Anvendelse af Enzymer i Fødevarer

STUDENTEREKSAMEN MATHIT PRØVESÆT MAJ MATEMATIK A-NIVEAU. MATHIT Prøvesæt Kl STXA-MATHIT

Eksaminanderne på hf tilvalg forventes ikke at kunne udnytte grafregnerens muligheder for regression.

Abstract: Indledning til opgaven Introduktion til emnet Katalase generelt: Enzymers strukturelle opbygning...

Artikel 2: Kulhydratkemi

KemiF2 laboratorieøvelser 2008 Øvelse 3 v.1.4 HOMOGEN KATALYSE. Indledning

Kemi A. Studentereksamen. Onsdag den 4. juni indd 1 26/02/

Kulhydrater - pest eller guld

Varmeligningen og cosinuspolynomier.

Hvad er en funktion? Funktioner og graftegning. Funktioners egenskaber. Funktioners egenskaber. f(b) y = f(x) f(a) f(a)

Madkemi Kulhydrater: er en gruppe af organiske stoffer der består af kul, hydrogen og oxygen (de sidste to i forholdet 2:1, ligesom H 2

Kemi F2- Laboratorieøvelse nr. 9 Ulla Christensen, Biofysisk Kemi ENZYMKINETIK

1. Beregn begyndelseskoncentrationerne af og i alle forsøgene.

Matematik B-niveau STX 7. december 2012 Delprøve 1

Matematik A. Højere teknisk eksamen. Forberedelsesmateriale. htx112-mat/a

Oplægget henvender sig primært til specielt interesserede 3g elever med matematik A og kemi A.

1. Reaktionshastighed: Med udgangspunkt i forsøget: Reaktionen mellem thiosulfat og syre skal du komme ind på begrebet reaktionshastighed.

Kvantitativ bestemmelse af reducerende sukker (glukose)

Exoterme og endoterme reaktioner (termometri)

Det teknisk-naturvidenskabelige basisår Matematik 1A, Efterår 2005, Hold 3 Prøveopgave C

Opgaver til Maple kursus 2012

Undervisningsbeskrivelse

Eksempler på opgaver i Kemi A

Undervisningsbeskrivelse

Undervisningsbeskrivelse

Matematik A. Studentereksamen. Fredag den 9. december 2011 kl stx113-mat/a

ØVELSE 3 ENZYMMÅLINGER OG ENZYMKINETISKE UNDERSØGELSER

1: Kemisk kinetik 1. Du skal gøre rede for kemiske reaktioners hastighed, herunder begrebet reaktionsorden.

Undervisningsbeskrivelse

Forsøgene udføres ved betingelserne: ph 7.6, 0.1 M phosphatpuffer, ved stuetemperatur.

Projekt: Logistisk vækst med/uden høst

KemiF2 Enzymkinetik. Ved en overfladisk beskrivelse af denne type enzymkatalyseret reaktion, angives reaktionen som (4):

Enzymer og katalysatorer

Noter til kemi A-niveau

Undervisningsbeskrivelse

Projekt 4.9 Bernouillis differentialligning

Skriftlig eksamen i Kemi F2 (Fysisk kemi)

[FUNKTIONER] Hvornår kan vi kalde en sammenhæng en funktion, og hvilke egenskaber har disse i givet fald. Vers. 2.0

Amalie Avnborg 2.y SRO 18/3-12

Asymptoter. for standardforsøgene i matematik i gymnasiet Karsten Juul

EKSAMENSSPØRGSMÅL 2x Ke/s 2015 med Jørgen Mogensen

Undervisningsbeskrivelse

Emneopgave: Lineær- og kvadratisk programmering:

Klavs Thormod og Tina Haahr Andersen

Løsninger til eksamensopgaver på A-niveau 2019 ny ordning

Epidemi. Matematik. Indermohan Singh Walia, Egedal Gymnasium & HF

Undervisningsbeskrivelse

Introduktion til Laplace transformen (Noter skrevet af Nikolaj Hess-Nielsen sidst revideret marts 2013)

Koblede differentialligninger.

Reaktionshastighedens temperaturafhængighed og Arrheniusligningen Mihaelis-Menten-kinetik Overblik Opgaver... 36

Hjernens glukoseomsætning

Peter Harremoës Matematik A med hjælpemidler 15. december 2016 = 25 = x = = 10 2 =

Hvis man ønsker mere udfordring, kan man springe de første 7 opgaver over. Skitser det omdrejningslegeme, der fremkommer, når grafen for f ( x)

Undervisningsbeskrivelse

katalysatorer f i g u r 1. Livets undfangelse på et celluært plan.

Transkript:

Fra spild til penge brug enzymer Køreplan 01005 Matematik 1 - FORÅR 2010 Denne projektplan er udarbejdet af Per Karlsson og Kim Knudsen, DTU Matematik, i samarbejde med Jørgen Risum, DTU Food. 1 Introduktion Ved fremstilling af ost fremkommer en stor mængde valle, som indeholder protein og laktose. Umiddelbart udgør valle et affaldsproblem. Godt nok er valle let nedbrydelig i et biologisk rensningsanlæg, men etablering og drift af et sådant anlæg er meget bekostelig. En bedre mulighed for bortskaffelse baseres på oparbejdning af valle til produkter med en større værdi. Valleproteiner har egenskaber, der gør dem anvendelige som hjælpestoffer i levnedsmiddelindustrien. De kan opkoncentreres fra valle ved ultrafiltrering. Resten fra processen er en opløsning af laktose (og mineraler). Laktose har ikke nogen særlig værdi, da såvel sødeevne som opløselighed er meget begrænset. Disakkaridet laktose kan hydrolyseres til monosakkariderne glukose og galaktose. Begge er meget sødere end laktose og samtidig meget mere opløselige. Den øgede sødhed kan udnyttes direkte, ved at inddampe væsken til en sirup, der anvendes i levnedsmidler. Alternativt kan galaktose omdannes til tagatose, der er et interessant produkt. Tagatose er nemlig en sukkerart med meget stor sødeevne, som vanskeligt optages fra tarmen, og som ikke klumper. Derfor er produktet interessant som et lavkalorie sødemiddel. Læs evt. mere om industriel produktion og udnyttelse af tagatose på diverse hjemmesider. 1

Figur 1: Processkitse projektopgaven drejer sig om, hvad der foregår i reaktor 1. Processen kan kort beskrives ved følgende delprocesser: Ostning : Ostemælk Ost + Valle Ultrafiltrering : Valle Retentat (med protein) + Permeat (med laktose) Tørring : Retentat Valleproteinkoncentrat Hydrolyse med β-galactosidase : Laktose Glukose + Galaktose Isomerisering ved ph 12,5 (+ Ca(OH) 2 + CaCl 2 ) : Bundfald med tagatose + glukoseopløsning Opløsning af bundfald ved ph 6,5 : tagatoseopløsning Den samlede proces er illustreret i Figur 1. Resultatet er altså salgbare produkter og et mere begrænset affaldsproblem hovedsageligt bestående af saltopløsninger. Basis for processen er, at laktose hydrolyseres til glukose og galaktose. Det er denne del af processen, som vi vil undersøge i dette projekt. 2

2 Enzymkinetik Til hydrolysen bruges enzymet β-galactosidase (EC. 3.1.2.23), der katalyserer processen : Laktose + H 2 O Glukose + Galaktose Ligevægten af reaktionen er meget stærkt forskudt til højre, idet K = [galaktose] [glukose] [laktose] [H 2 O] (1) er endog meget stor. Reaktionshastigheden kan beskrives ved det klassiske Michaelis-Menten udtryk hvor v(t) = c c(t) (t) = v max, (2) c(t) + K m Symbol Størrelse Enhed v(t) Reaktionshastighed M/min v max Maksimal reaktionshastighed M/min c(t) Substratkoncentration M og K m er en konstant, som beskriver affinitet mellem substrat og enzym. I resten af projektopgaven antager vi, at K m = 6 mm. Den maksimale reaktionshastighed, v max, afhænger bl.a. af mængden og styrken af det tilsatte enzym, reaktionstiden og -temperaturen. Vi vil dog i første omgang antage, at v max er konstant. Reaktionshastigheden ses at være afhængig af substratkoncentrationen, c = c(t). Opgave 1. Opstil et udtryk, der beskriver v når c K m og når c K m. Opgave 2. Tegn grafen (brug Maple) for v som funktion af c (fx. med v max = 100 µm/min). Startkoncentration af produktet c 0 er kendt, og sammen med ligningen (2) fastlægger c 0 koncentrationen for senere tidspunkter. Opgave 3. Argumenter for, at ligningen (2) med en begyndelsesbetingelse c(0) = c 0 > 0 har en entydigt bestemt løsning. Vis, at c(t) > 0 for t > 0. Opgave 4. Argumenter udfra differentialligningen (2) for, at c(t) har en omvendt funktion t(c). Udled en differentialligning for t(c) og angiv en begyndelsesbetingelse. Opgave 5. Opstil et udtryk for funktionen t(c), der fastlægger, hvor lang tid det tager at nå en given substratkoncentration. Opgave 6. Opstil et udtryk for substratkoncentrationen c(t) til et givet tidspunkt t. Man kan her benytte resultatet fra Opgave 5, eller man kan bruge Maples dsolve. Opgave 7. Plot de to udtryk for c 0 = 0,15 M, K m = 6 mm og v max = 100 µm/min. 3

Opgave 8. Hvad sker der med koncentrationen, når t? Er det konsistent med udsagnet om konstanten K i (1)? Der er nu opstillet to udtryk for den integrerede Michaelis-Menten-ligning. I litteraturen finder man ofte sammenhængen mellem koncentration og tid udtrykt ved c 0 c t Opgave 9. Passer de to fundne udtryk med dette? = v max K m 1 t ln c 0 c. (3) 3 Inhibering Enzymer katalyserer omdannelse af stoffer, og produkterne minder ofte om substratet. Derfor kan man forestille sig, at der opstår en konkurrence mellem substrat og produkt om det sted på enzymet, hvor molekylerne bindes. Når dette er tilfældet, siges reaktionen at blive inhiberet. Da der er tale om konkurrence, og da det er produktet, der inhiberer, betegnes det som kompetetiv produktinhibering. Fænomenet er selvfølgelig uheldigt, når det er produktet, der er det interessante, som i spaltningen af laktose. Her gælder det, at galaktose optræder som kompetetiv inhibitor, medens glukose tilsyneladende ikke har nogen inhiberende virkning. Hastighedsudtrykket for en kompetetiv produktinhiberet reaktion har formen v(t) = c c(t) (t) = v max ( c(t) + K m 1 + c ), (4) 0 c(t) K I hvor K I er en konstant, der beskriver inhiberingen. I resten af projektet sættes K I = 30 mm. Som for processen beskrevet ved (2) vil en startkoncentration c(0) = c 0 fastlægge den fremtidige koncentration c(t). Endvidere har c(t) en omvendt funktion t(c), der angiver den tid, det tager at nå koncentrationen c. Opgave 10. Analyser differentialligningen (4) ved at besvare Opgave 2-8 med ligning (2) erstattet af ligning (4). Regn med c0 = 0, 15M. Sammenlign resultaterne for den inhgiberede proces med resultaterne for den ikke-inhiberede proces. Det integrerede udtryk fra litteraturen er : c 0 c t = 1 v ( max Km Opgave 11. Passer dette udtryk med de fundne integrerede udtryk? K I ( ) KI + c ) 0 1 K m K I K m t ln c 0 c. (5) Med de nu udviklede udtryk kan vi komme med en foreløbig løsning af opgaven: For at kunne foretage en dimensionering foretages forsøg i større skala for at finde frem til, hvor lang tid det vil tage at nå en omsætningsgrad på 90% (dvs. c/c 0 = 0,1) af laktosen, når c 0 = 0,15 M. Der tilsættes en mængde enzym svarende til v max = 300 µm/min. 4

Opgave 12. Beregn hvor lang reaktionstiden bliver for en inhiberet proces. Opgave 13. Den fundne reaktionstid virker for lang, idet man ikke vil acceptere en reaktionstid på mere end fire timer. Hvor stor skal v max være, hvis man vil sikre sig, at processen er forløbet indenfor 4 timer? 4 Reaktionsbetingelser Hastigheden af kemiske reaktioner er temperaturafhængig, hvilket også gælder for enzymkatalyserede reaktioner. Desuden er enzymer (som proteiner) følsomme overfor høje temperaturer, idet de vil denaturere (miste aktivitet) ved påvirkning af høje temperaturer (som æggehvide, der koagulerer ved kogning af æg). Størrelsen v max vil nu afhænge af reaktionstiden og -temperaturen. Enzymerne tilsættes i form af et flydende præparat med en specificeret styrke, som afhænger af reaktionstemperaturen og aftager med reaktionstiden. Sammenhængen mellem v max (t, T ) og enzymstyrken E(t, T ) er givet ved V r v max (t, T ) = E(t, T )V e, hvor V e, V r angiver henholdvis volumenet af det tilsatte enzym og volumenet af reaktionsblandingen. T angiver den absolutte temperatur målt i Kelvin (K). Vi vil i det følgende regne med V r = 1000L. Vi indfører begyndelsesstyrken E 0 (T ) = E(0, T ). For β-galactosidasepræparatet gælder for celsiustemperaturer i intervallet [0 C,50 C], at ( E 0 (T ) = exp 23, 4 T ) 1 mm T min, T 1 = 4, 60 10 3 K, (6) hvor T 1 er en empirisk konstant. Den tidsmæssige denaturering af enzymet kan beskrives ved udtrykket E(t, T ) = k(t )E(t, T ), (7) t hvor k(t ) er en hastighedskonstant, der er temperaturafhængig, idet ( k(t ) = exp 85 T ) 2 min 1, T 2 = 28 10 3 K. (8) T Også T 2 er en empirisk konstant. Indsættes den tids- og temperaturfhængige v max (t, T ) i ligningen (4) fås v = c c (t) = v max (t, T ) ( c + K m 1 + c ). (9) 0 c K I Opgave 14. Opstil et udtryk for c(t, T ) og t(c, T ) for den samlede inhiberede proces givet ved (9). 5

Opgave 15. Fastlæg Celsius-temperaturen på 35 C og lad c 0 = 0, 15M. Der tilsættes en mængde enzym svarende til V e = 0, 1L. Beregn koncentrationen c som funktion af reaktionstiden, og tegn funktionens graf. Forklar hvad der sker, når t. Opgave 16. Fastlæg igen c 0 = 0, 15M. Undersøg, hvor lang reaktionstiden skal være for at opnå en omsætningsgrad på 90% ved en Celsiustemperatur på henholdsvis 30, 35 og 40 C når V e = 0, 1L. Beregn, hvor meget enzym, der skal tilsættes, for at nå en omsætningsgrad på 90% i løbet af fire timer. 5 Optimering Valget af reaktionsparametre for omdannelse af laktose til galaktose og glukose er ikke frit, idet der er begrænsninger i reaktionstiden ved forskellige temperaturer, se Tabel 1. Årsagen til begrænsningen i reaktionstiden er risikoen for vækst af uønskede mikroorganismer. Den længere reaktionstid ved 50 C skyldes, at meget få generende mikroorganismer vokser ved så høj en temperatur. Celsiustemperatur, C Maksimal reaktionstid i timer 5 24 10 10 20 45 4 50 8 Tabel 1: Den maksimal reaktionstid ved forskellige temperaturer De afsluttende opgaver går nu ud på, at fastlægge nogle sæt af reaktionsbetingelser, som minimerer omkostningerne. Reaktionsbetingelser betyder her mængden af tilsat enzym, reaktionstiden og temperaturen. Omkostningen O for at få processen gennemført antages i første omgang kun at afhænge af den tilsatte enzymmængde. Eksplicit antages O(V e ) = 350 kr/liter V e. Vi vil gerne optimere omkostningerne under følgende betingelser: Celsiustemperaturen skal ligge i intervallet [5 C, 50 C]. Reaktionstiden må ikke overstige betingelserne givet i Tabel 1. Begyndelseskoncentrationen er c 0 = 0.15M. Omsætningsgraden skal være 90% (c/c 0 = 0, 1). Disse krav medfører, at V e kan skrives som en funktion af reaktionstiden og -temperaturen, dvs. V e (t, T ), hvor (t, T ) ligger indenfor et område i planen, som opfylder betingelserne i Tabel 1. Opgave 17. Find minimum og minimumspunkt for funktionen O under de givne betingelser. 6

De samlede omkostninger til at gennemføre processen afhænger natuligvis også af omkostninger, der er ved at drive anlægget (herunder anlæggets pris, vedligehold, temperaturstyring i processen mm.). Vi antager, at denne yderligere omkostning for den enkelte proces er proportional med den tid, det tager at gennemføre processen. Den samlede omkostning er altså nu O(V e ) = 350 kr/liter V e + β t. Opgave 18. Sæt β = 1 kr/minut. Find minimum og minimumspunkt for O under de samme betingelser som før. 7