Typer af sortbensyge / blødrådbakterier (Erwinia-komplekset) i Danmark Steen Lykke Nielsen & Tina Tønnersen, AU, DJF Lars Bødker, Videncenter for Landbrug 1
Erwinia-komplekset Tidligere navn Nye navn Erwinia carotovora subsp. carotovora Erwinia carotovora subsp. atroseptica Erwinia chrysanthemi Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum Pectobacterium atrosepticum Dickeya dianthicola 2
Ændring af forekomsten af bakterierne i Europa Pectobacterium carotovorum og P. atrosepticum har indtil for nyligt været de dominerende bakterier i Nordeuropa. Dickeya dianthicola har været knyttet til varmere klimater. Dickeya dianthicola har spredt sig nordpå. Dickeya dianthicola udgør nu den primære smitte i Holland og Frankrig og forekommer hyppigt i Finland. 3
Resultater fra landsforsøgene 2005 (Lars Møller) Prøver i alt 59 prøver Bakterieart Antal positive prøver P. carotovorum 47 P. atrosepticum 35 D. dianthicola (E. chrysanthemi) 2 4
Resultater fra landsforsøgene 2005 (Lars Møller) Prøver i alt 59 prøver Bakterieart Antal positive prøver P. carotovorum 47 P. atrosepticum 35 D. dianthicola (E. chrysanthemi) 2 Prøver med 2 bakterier 29 Prøver med 3 bakterier 1 5
Formål med undersøgelse i Danmark - at undersøge, hvilke arter af Erwinia-komplekset optræder i Danmark. - og om Dickeya dianthicola er blevet mere almindeligt forekommende i Danmark. 6
Værter Pectobacterium carotovorum : Kartofler Pectobacterium atrosepticum: Kartofler Dickeya dianthicola: Kartofler, majs og Dahlia i Nordeuropa, foruden tropiske og subtropiske planter 7
Sygdomme Pectobacterium carotovorum : Primært blødråd Pectobacterium atrosepticum: Sortbensyge Dickeya dianthicola: Primært stængelbakteriose, men også blødråd og sortbensyge, 8
Blødråd P. carotovorum Angreb kan ses i marken på vandlidende arealer. Normalt udvikles sygdommen først på lageret. Knoldene smittes gennem sår og lenticeller. 9
Sortbensyge P. atrosepticum Bakterierne angriber moderknolden og transporteres op i stænglerne. Sortbensyge kan kun udvikle sig fra moderknolden. 10
Stængelbakteriose Dickeya dianthicola Angrebet starter på stænglen mellem moderknold og top. Udvikler sig ved højere temperatur end sortbensyge. 11
Formål med undersøgelse i Danmark - at undersøge, hvilke arter af Erwinia-komplekset optræder i Danmark. - og om Dickeya dianthicola er blevet mere almindeligt forekommende i Danmark. 12
Metode Der blev indsamlet stængler fra kartoffelplanter med symptomer på sortbensyge og stængelbakteriose fra læggekartoffelmarker. Totalt DNA blev ekstraheret fra prøverne. Der blev kørt konventionel PCR for de 3 bakteriearter. 13
Resultater År 2009 2010 Prøver i alt 42 marker 30 marker Bakterieart Antal positive prøver Antal positive prøver P. carotovorum 16 13 P. atrosepticum 12 14 D. dianthicola 22 30 14
Resultater År 2009 2010 Prøver i alt 42 marker 30 marker Prøver med 2 bakterier 9 15 Prøver med 3 bakterier 3 6 15
Konklusion D. dianthicola er almindeligt forekommende i danske læggekartoffelmarker. Resultaterne bekræfter udviklingen registreret i andre europæiske lande. Resultaterne underbygger desuden den kendte viden, at to eller alle tre bakteriearter ikke sjældent optræder i samme plante. 16
Ny aggressiv type af Dickeya spp. Siden 2000 har en ny aggressiv type af Dickeya spp. bredt sig i Europa (Polen, Holland, Finland). Den nye type kaldes Dickeya spp. biovar 3 eller Dickeya solani. Den nye type er i færd med at erstatte (udkonkurrere) Dickeya dianthicola. 17
Dickeya solanis aggressivitet D. dianthicola D. solani Symptom Stængelnekrose Sortben Smittepotentiale Kun svækket og Kan inficere sundt væv såret væv Smitte direkte fra jord Nej Ja. Koloniserer sunde stoloner og knolde og sprede sig systemisk Spredning fra angreben stængel til andet væv Bakteriekoncentration nødvendig for symptomudvikling Nej Høj Ja. Til rødder, stoloner og knolde Lav 18
Undersøgelse af forekomst af Dickeya solani i Danmark Undersøgelsen pågår. Dickeya dianthicola-isolaterne fra 2009 og 2010 testes for, om de hører til D. solani -typen. Der anvendes rep-pcr, men metoden fungerer endnu ikke optimalt. 19
Rep PCR Mw Dickeya dianthicola Dickeya dianthicola Dickeya solani Dickeya solani Dickeya dianthicola Dickeya dianthicola Mw P.a. + P.c. + D.s. P.a. + P.c. + D.s. P.a. + P.c. + D.d. P.a. + P.c. + D.d. Negativ kontrol Sund plante Mw 20
Taksigelse Kartoffelafgiftsfonden har støttet projektaktiviteterne med bevillinger i 2009 og 2010. Konsulenter og kontrollører takkes for at have indsamlet og indsendt stængelprøver. 21
Forskningsaktiviteter 2011 om Dickeya Kartoffelafgiftsfonden har bevilget midler i 2011 til to projekter: Kvalitetsskadegørere i læggekartofler. Trin 1. Test for sortbensyge, stængelbakteriose og blødråd. Formål: At udvikle DNA-baserede tests for latente infektioner af P. carotovorum, P. atrosepticum og D. dianthicola Dansk deltagelse i et internationalt EUPHRESCO-projekt med titlen: Risks of the new Dickeya species in agriculture and their potential management. Den danske del vil omfatte epidemiologi under danske forhold. 22