Danish National Biobank (nationalbiobank.dk)

Transkript

1 Danish National Biobank (nationalbiobank.dk) Mads Melbye Statens Serum Institut

2 Vi vil skabe et unikt miljø hvor laboratoriet er hele befolkningen

3 og hvor materialet er Danmarks helt unikke registre og biologiske samlinger

4 Muligheder for registerforskning i Danmark

5 De danske registre er unikke følge hvert individ fra vugge til grav sygdommes vandring gennem generationer (gen/miljø) millioner af personer stor sikkerhed i resultaterne en investering i milliardklassen CPR-nummer Fødselsforløb Sygdomme Medicinforbrug Vaccinationer Børneinstitutionsforhold Familie, bopæl, fødested Uddannelse, erhverv, indkomst Biologiske prøver

6

7 Den Nationale Biobank National Biobank Nationalt biobankregister Koordinerende center

8 Den Nationale Biobank Samlet antal prøver pt. Fjernlager 1-3 millioner prøver Artillerivej 4,3 millioner prøver 1,8 millioner PKU kort BSMB prøver 21% af grønlandske befolk + Prospektive prøver ( /dag) Persondata DNA i intelligente frysere Serum/plasma Spinalvæsker Levende celler i nitrogen Etc. Forsker

9 Bi obank Data PK Sampl ei D CPR Sam pletype Sam pledat e St or agetem per at u r e BiobankSour ce Pr oject Nam e Bi obank Data PK Sampl ei D CPR Sam pletype Sam pledat e St or agetem per at u r e BiobankSour ce Pr oject Nam e PK Bi obank Dat a Sampl ei D CPR Sam pletype Sam pledat e St or agetem per at u r e BiobankSour c e Pr oject Nam e PK Bi obank Data Sampl ei D CPR Sam pletype Sam pledat e St or agetem per at u r e BiobankSour ce Pr oject Nam e PK Bi obank Data Sampl ei D CPR Sam pletype Sam pledat e St or agetem per at u r e BiobankSour ce Pr oject Nam e Nationalt biobankregister Biobanks Cancer Society: Diet, Cancer, and Health DNA biobank at Rigshospitalet (all referred patients) Patobanken (all pathological specimens) Civil Registration System National registers Danish National Patient Registry Danish Family Relations Database National biobank At SSI Clinical cancer biobanks Danish Medical Birth Registry National Pathology Registry Biobank Data Biobank Registry Internet PK SampleID CPR SampleType SampleDate StorageTemperature BiobankSource ProjectName PC PC

10 Web-baseret søgning

11

12 Hvad skal stedet tilbyde Know-how i modtagelse, opbevaring og udlevering af biologiske prøver til forskerne Eksperter i håndtering af store databaser Rådgivning til andre biobanker Vil have on-line adgang til nationale registre Stort biostatistisk miljø Her placeres bioinformatikere og eksperter i analysering af SNP og sekventeringsdata Kobles biologisk info. med registerdata Specialistkundskaber vedrørende udtrækning af information fra biologisk prøv.

13 Biobanken i aktivt forskningsmiljø Omkring biobanken opbygges laboratorier der udnytter materialet DNA oprensning og amplifikation Sekventeringsmuligheder (454 teknologi) Med tiden: overveje overflytning af de biokemiske forskningsaktiviteter (Tandem mass spec., Luminex, etc.) Etc. Etc.

14 Tidsplan Bygning stå færdig udgangen af 2011 Biobanken funktionsdygtig forår 2012 Biobank-registeret færdigudviklet udgangen af 2011

15 Byggeri Haft en af Europas største eksperter til at lede opgaven Planlagt ned i mindste detalje. 16 firmaer i prækvalifikationsfasen. 5 firmaer i udbudsfasen. Bud åbnes medio oktober kvm. moderne biobank med lagringsfaciliteter og udviklingslaboratorier, samt 750 kvm kælder til lager og energigenudvindingsfaciliteter

16 Finansiering Novo Nordisk Fonden Infrastrukturmidlerne Fysisk biobank, nationalt biobankregister, løbende drift i 10 år.

17 SSI s bidrag SSI finansierer samling af det stærke epidemiologiske miljø, biostatistisk ekspertise og bioinformatik indbygget i biobankkomplekset Konkret vil SSI finansiere 800 kvm kontorbyggeri på øverste etage af Den Nationale Biobank Opførelse af foredragssal, og andre mødefaciliteter samt repræsentativ fælles indgang til komplekset (210 kvm. i stuen bygning 206) Hele komplekset vil fremtræde som nationalt forskningscenter i udnyttelse af store biologiske materialer og registre

18 National Biobank.DK

19 Den Nationale Biobank

20 Den Nationale Biobank

21 Lagrings modeller Manuell, - 80, Automatisered, - 80 Automatisered, Automatisered, - 20 DNA/PKU, Manuell-PKU, mill/150 m 2 4 mill/150 m 2 4 mill/130 m 2 6 mill/200 m 2 2 mill/77 m 2 LIN, - 196, 6 mill/130 m 2

22 Automatiseret minus 80 graders frysere til spinalvædsker, DNA, etc.

23 rør 4,5 MKr.

24 Arbejdslager RUM 7 Plukkestation og automatisert 80 lager RUM 8 Manuelt 80 lager Arkivlager RUM 9 Manuelt 196 lager Plukkestation (-20) -80 lager (1 million rør a 0.5 ml) - 80 lager (1 million rør a 0.5 ml) Flytende Nitrogen ( -196) Flytende Nitrogen ( -196) Transportbelte (-20) -80 Skapfryser -80 Skapfryser Flytende Nitrogen ( -196) Manuel forflytning fra arkivlager til arbejdslager

25 Modellen Den eksperterne peger på som den rigtige Topmoderne og topfunktionel i sin planlægning Optimale pladsforhold til håndtering af de omfattende mængder af biologisk materiale Nødvendige laboratorieplads til udviklingsprojekter i udtrækning af information fra biologisk materiale Har den nødvendige plads til energigenudvindingsteknikken Eksperter i håndtering og analyse af store informationsmængder herunder registerkobling placeret i samme miljø Undervisningsfaciliteter, herunder foredragssal, indbygget i konceptet Åbner banken for omverdenen og de unge forskere

26 Prof. Kristian Hveem Etableret en af de største og mest moderne biobanker i Europa (HUNT Biobank) Intensivt kendskab til sundhedsvæsenet og dets opbygning i Norden Visionær, teknisk kunden, god kommunikator, og omfattende internationalt netværk indenfor biobanker HUNT biobank

27