Curriculum Vitae Lars Andrup, civilingeniør, Ph.d. Født 6. april 1961 Resumé Uddannet cand. polyt. med speciale i mikrobiologi, molekylærbiologi, genetik og bioteknologi (1986). Ansat på Arbejdsmiljøinstituttet (Arbejdstilsynet) i forbindelse med risikovurdering af genteknologi. Ph.d.-studium om DNA-udveksling i bakterier (spredning af fx antibiotikaresistensgener og virulensfaktorer) (stipendium fra Forskerakademiet). Ansat som seniorforsker på Arbejdsmiljøinstituttet (1994) egen forskningsgruppe, internationalt samarbejde og forskningsbevillinger med fokus på mikrobiologiske risici, DNA-udvekslingssystemer, spredninger af plasmider, antibiotikaresistens og virulensfaktorer, Grampositive bakterier, miltbrand og lidt fugleinfluenza. Fra 1998: sektionsleder, afdelingsleder, forskningschef, projektkoordinationschef og nu forskningschef for ca. 45 medarbejdere. Kronologisk forløb 2013 Genansat som chef i ny åremålsstilling (betegnelsen er igen Forskningschef) i 6+3 år på Det Nationale Forskningscenter for Arbejdsmiljø 2003 Projektkoordinationschef efter omorganisering til projektorganisation (chef for ca. 40 medarbejdere organiseret i 6-10 forskningsgrupper inden for molekylærbiologi, toksikologi (særlig fokus på Nanotoksikologi), allergi, mikrobiologi og høreskader, ledelse og organisation, CSR og arbejdsmiljøbetingede ulykker og sikkerhedskultur). 2001 Forfremmet til forskningschef. 2000 Ansat som forskningsleder for Afdeling for Kemisk Arbejdsmiljø (ca. 30 medarbejdere). 1999 Gæsteforskerophold på Université Catholique de Louvain, Belgien (marts-april). Konstitueret som forskningsleder af Afdeling for Mikrobiologi, Irritation og Allergi på Arbejdsmiljøinstituttet, oktober.
1994 Ph.D.-graden tildelt 3. februar. Ansat, efter positiv lektorbedømmelse, som seniorforsker i molekylærbiologi på Arbejdsmiljøinstituttet 1. september. 1993 Afsluttet Ph.D.-studium 14. maj. Tiltrådt forskerstilling på AMI. Ph.D.- afhandling forsvaret 14. oktober. 1990 Startet Ph.D.-studium, finansieret af Forskerakademiet og AMI 1. maj. Orlov fra Arbejdsmiljøinstituttet. 1988 Ansat i Toksikologisk-biologisk Afdeling på AMI 1. april. 1987 Ansat på Arbejdsmiljøinstituttet (AMI), Produktregistret 1. januar. 1986 Forsknings- og undervisningsvikar på Laboratoriet for Mikrobiologi, DtH. 1986 Cand. polyt. fra Danmarks tekniske Højskole. Kemi -ingeniør med speciale i molekylærbiologi og mikrobiel genetik. 1980-81 Div. erhvervsarbejde i Frankrig og Danmark. 1980 Mat.-fys. student fra Vesthimmerlands Gymnasium. 1961 Født d. 6. april i Fredericia. Videnskabelig profil Den røde tråd i mit videnskabelige virke har været risici ved mikroorganismer tidligt skrev jeg et review om mulige risici forbundet med brugen af genteknologi. Efterfølgende fokuserede jeg på nogle industrielt relevante bakterier (mikrobiologiske biopesticider baseret Bacillus thuringiensis) og deres potentiale for at sprede DNA (plasmid-udvekslingssystemer). Jeg opdagede og karakteriserede (genetisk og biologisk) nye konjugationssystemer, udarbejdede og validerede en matematisk model baseret på Mikaelis-Menten kinetik til kvantitativt at beskrive DNA-udveksling i bakterier (store plasmiders conjugation). Jeg medvirkede til opdagelsen af store genetiske ligheder mellem biopesticid-bakterien, som anvendes i store mængder i insektbekæmpelse og Bacillus anthracis, som forårsager miltbrand (dette arbejde medførte, at jeg i en kort periode i forlængelse af katastrofen med World Trade Center blev anvendt som miltbrandekspert i Danmark). Sideløbende har jeg også interesseret mig for de små plasmider i Bacillus cereus-gruppen. Dette arbejde kulminerede med et review i 2003. Jeg har medvirket til afklaringen af den genetiske basis for virulensfaktorer, som var involveret i fatale levnedsmiddelforgiftninger i Belgien, og jeg har bidraget til opdagelsen af nye bakteriophager (bakterie vira) i Bacillus cereus. Mit arbejde har ført til et omfattende nationalt og internationalt netværk, og jeg har besøgt en række universiteter inklusiv Standford University, Pasteur Instituttet, Louvain-la-Neuve og Oslo Universitet. Jeg har selv udført meget arbejde i laboratoriet, jeg har været på arbejdspladser og lavet personbårne og
stationære målinger og har haft mange speciale- og Ph.D.-studerende. Ligeledes har jeg igennem mange år været censor i Danmark og været opponent på Ph.D.- og doktorafhandlinger i Danmark, Belgien og Norge. Jeg er stadig løbende censor for speciale- og bachelorprojekter på DTU og Seruminstituttet. Publikationer etc. Internationale videnskabelige peer-review artikler Barfod KK, Smidt L, Krogfelt KA, Larsen ST, and Andrup L. 2010. Low translocation of Bacillus thuringiensis israelensis to inner organs in mice after pulmonary exposure to commercial biopesticide. Biocontrol Science and Technology 20(9):1001-1011. Apetroaie-Constantin C, Shaheen R, Andrup L, Smidt L, Rita H, Salkinoja- Salonen M. 2008. Environment driven cereulide production by emetic strains of Bacillus cereus. Int J Food Microbiol. 127(1-2):60-7. Andrup L, Barfod KK, Jensen GB and Smidt L. 2008. Detection of large plasmids from the Bacillus cereus group. Plasmid 59(2):139-43. Wilcks A, Smidt L, Bahl MI, Hansen BM, Andrup L, Hendriksen NB, Licht TR. 2008. Germination and conjugation of Bacillus thuringiensis subsp. israelensis in the intestine of gnotobiotic rats. J Appl Microbiol. 104(5):1252-9. Van der Auwera, GA., Andrup, L., and Mahillon, J. 2005. Conjugative plasmid paw63 brings new insights into the genesis of the Bacillus anthracis virulence plasmid pxo2 and of the Bacillus thuringiensis plasmid pbt9727. BMC Genomics 6:103. Hoton F.M., L. Andrup, I. Swiecicka and J. Mahillon. 2005. The cereulide genetic determinants of emetic Bacillus cereus are plasmid-borne. Microbiology 151:2121-2124. Jensen G.B., N. Fisker, T. Sparsø, L. Andrup. 2005. Discrimination within the Bacillus cereus group using gyrb sequencing and PCR-RFLP. International Journal of Food Microbiology 104(1):113-20. Andrup L, G.B. Jensen, A. Wilcks, L. Smidt, L. Hoflack, and J. Mahillon. 2003. The patchwork nature of rolling-circle plasmids: comparison of six plasmids from two distinct Bacillus thuringiensis serotypes. Plasmid 49(3):205-32. Jensen, G.B., P. Larsen, B. L. Jacobsen, B. Madsen, L. Smidt, and L. Andrup. 2002. Bacillus thuringiensis in fecal samples from greenhouse workers after exposure to B. thuringiensis-based pesticides. Appl. Environ. Microbiol. 68:4900-4905. Zhiming, Y., J. Eilenberg, L. Andrup, and B.M. Hansen. 2002. Detection of enterotoxin genes in mosquito-larvicidal Bacillus species. Curr. Microbiol. 45:221-5.
Jensen, G. B., P. Larsen, B. L. Jacobsen, B. Madsen, A. Wilcks, L. Smidt, and L. Andrup. 2002. Isolation and characterization of Bacillus cereus-like bacteria from faecal samples from greenhouse workers who are using Bacillus thuringiensis-based insecticides. Int. Arch. Occup. Environ. Health 75:191-196. Zhiming, Y., C. Quanxin, L. Andrup, J. Eilenberg, and P. Yi. 2001. Detection of enterotoxin genes in Bacillus thuringiensis by PCR. Acta Micobiol. Sin. 41 (2): 148-154. Andrup, L and K. Andersen. 1999. A comparison of the kinetics of plasmid transfer in the conjugation systems encoded by the F plasmid from Escherichia coli and plasmid pcf10 from Enterococcus faecalis. Microbiology 145: 2001-2009. Wilcks, A., L. Smidt, O. A. Økstad, A-.B. Kolstø, J. Mahillon and L. Andrup. 1999. Replication mechanism and sequence analysis of the replicon of paw63, a conjugative plasmid from Bacillus thuringiensis. J. Bacteriol. 181: 3193-3200. Hoflack, L., A. Wilcks, L. Andrup, and J. Mahillon. 1999. Functional insight into pgi2, a cryptic rolling-circle replicating plasmid from Bacillus thuringiensis. Microbiology 145: 1519-1530. Andrup L. 1998. Conjugation in Gram-positive bacteria and kinetics of plasmid transfer. APMIS 84:47-55. Wilcks, A., N. Jayaswal, D. Lereclus, and L. Andrup. 1998. Plasmid paw63; a second self-transmissible plasmid in Bacillus thuringiensis subspecies kurstaki HD-73. Microbiology 144:1263-1270. Andrup, L., L. Smidt, K. Andersen, and L. Boe. 1998. Kinetics of conjugative transfer: a study of the plasmid pxo16 from Bacillus thuringiensis subsp. israelensis. Plasmid 40:30-43. Jensen, G. B. and L. Andrup. 1997. DNA as shareware (minireview). Biologist 44:273-275. Jensen, G. B., L. Andrup., A. Wilcks, L. Smidt., and O. M. Poulsen. 1996. The aggregation-mediated conjugation system of Bacillus thuringiensis subsp. israelensis: host range and kinetics of transfer. Curr. Microbiol. 33:228-236. Andrup, L., G.B. Jensen, A. Wilcks, and L. Smidt. 1996. Mobilization of "nonmobilizable" plasmids by the aggregation-mediated aggregation system of Bacillus thuringiensis. Plasmid 36:75-85. Andrup, L., H. H. Bendixen, and G. B. Jensen. 1995. Mobilization of Bacillus thuringiensis plasmid ptx14-3. Plasmid 33:159-167. Jensen, G. B., A. Wilcks, S. S. Petersen, J. Damgaard, J. A. Baum and L. Andrup. 1995. The genetic basis of the aggregation system in Bacillus thuringiensis subsp. israelensis is located on the large conjugative plasmid pxo16. J.Bacteriol. 177:2914-2917. Andrup, L. 1994. Isolation and characterization of mutants of Bacillus
thuringiensis var. israelensis. J.Appl.Bacteriol. 77:733-744 (letter to the Editor). Andrup, L., J. Damgaard, K. Wassermann, L. Boe, S. M. Madsen, and F. G. Hansen. 1994. Complete nucleotide sequence of the Bacillus thuringiensis subsp. israelensis plasmid ptx14 3 and its correlation with biological properties. Plasmid 31:72-88. Andrup, L. 1993. Horisontal DNA-udveksling i Bacillus thuringiensis. DNAudveksling i Gram-positive bakterier - en undersøgelse og vurdering af arbejdsmiljørisici. Ph.D.-afhandling; Arbejdsmiljøinstituttet/Laboratoriet for Mikrobiologi, Danmarks tekniske Højskole. Andrup, L., J. Damgaard, and K. Wassermann. 1993. Mobilization of small plasmids in Bacillus thuringiensis subsp. israelensis is accompanied by specific aggregation. J.Bacteriol. 175(20):6530-6536. Madsen, S. M., L. Andrup, and L. Boe. 1993. Fine mapping and DNA sequence of replication functions of Bacillus thurigiensis plasmid ptx14 3. Plasmid 30:119-130. Andrup, L., J. Damgaard, B. Laursen, and K. Wassermann. 1992. Using the relationship between nucleotide sequence and codon usage for the detection of frame shift sequencing errors in bacterial genes. Biotechnol.Techn. 6, 461 462. Boe, L., T. T. Nielsen, S. M. Madsen, L. Andrup, and G. Bolander. 1991. Cloning and characterization of two plasmids from Bacillus thuringiensis in Bacillus subtilis. Plasmid 25:190 197. Andrup, L., G. Bolander, L. Boe, S. M. Madsen, T. T. Nielsen, and K. Wassermann. 1991. Identification of a gene (mob14 3) encoding a mobilization protein from the Bacillus thuringiensis subsp. israelensis plasmid ptx14 3. Nucleic Acids Res. 19(10):2780. Andrup, L., B. H. Nielsen, and S. Kølvraa. 1990. Biosafety considerations in industries using recombinant DNA based production methods. Scand.J.Work.Environ.Health 16:85 95. Andrup, L., T. Atlung, N. Ogasawara, H. Yoshikawa, and F. G. Hansen. 1988. Interaction of the Bacillus subtilis DnaA like protein with the Escherichia coli DnaA protein. J.Bacteriol. 170(3):1333 13-38. Formidling/populærvidenskab 26 populærvidenskabelige artikler i forskellige danske fagblade, 2 bogkapitler og en række avisartikler og debatindlæg.
Editor Editor af: The molecular biology of Bacillus cereus, Bacillus anthracis, and Bacillus thuringiensis. First International workshop on. Udgivet af Arbejdsmiljøinstituttet. ISBN 87-7534-573-0. Referee Censorarbejde (reviewer) for ni internationale tidsskrifter (Plasmid, Journal of Occupational Medicine, Research in Microbiology, Nucleic Acids Research, Environmental Microbiology, Journal of Applied Microbiology, Vadose Zone Journal, Antonie van Leeuwenhoek Journal of Microbiology, The Journal of Microbiology). Foredrag og posters på konferencer Ca 35 præsentationer på internationale konferencer. Kurser Udover min kandidat- og Ph.D.-grad, har jeg gennemført medicinsk mikrobiologi på lægestudiet, samt en række kurser i engelsk, epidemiologi, toksikologi, formidling, ledelse, personaleledelse, coaching og arbejdsmiljø. Undervisning m.m. Medarrangør og underviser på 4 kurser i Bioteknologi under Procesteknisk Selskab; Ingeniørforeningen. 1987-90 Kursusarrangør af Occupational Health Issues in Genetic Engineering and Its Use in Industry; Arbejdsmiljøinstituttet 1988. Afholdt en række forsknings-seminarer på Københavns Universitet, Danmarks tekniske Universitet, Novo Nordisk A/S, Panuminstituttet, Veterinær- og Fødevaredirektoratet og Arbejdsmiljøinstituttet samt i Mikrobiologisk Selskab. 1989-2002. Specialevejleder for 24 DTU/DIA-studerende og 2 Humanbiologistuderende i perioden 1990-2003. Ph.D.-vejleder for Gert B. Jensen fra september 1994. Ph.D.-vejleder for Andrea Wilcks fra oktober 1995. Kursusleder og underviser på Kursus i Mikrobiologi & Molekylærbiologi på Arbejdsmiljøinstituttet 1995-96. Undervisning på kursus: Risk management, Nordic Institute for Advanced Training i 1995 og 1997. Medarrangør af First International Workshop on The Molecular Biology of Bacillus cereus, B. anthracis, and B. thuringiensis, 1997, Oslo, Norge.
Opponent for Ph.D.-projekt i Gent, Belgien, 1998. Undervisning på Panum-instituttet, 1999. Seminar på Louvain-la-Neuve Universitet i Belgien, 1999. Seminar på DMU (Ph.D.-workshop), 1999. Vært for studerende fra Louvain-la-Neuve Universitet i Belgien, 1999. Vært for prof. Jacques Mahillon fra Louvain-la-Neuve Universitet i Belgien, 1999. Vært for gæsteforsker Yuan Zhiming fra Wuhan Institute of Virology, P.R. China, 2000. Interviewet og citeret i New Scientist vdr. risici ved DNA-udveksling og biopesticider, 2001. Konsulent vedrørende miltbrand-risici i Danmark, 2001. Tilbagevendende censor på BioCentrum DTU og Seuminstituttet, 2002-. Opponent for Ph.D.-projekt i Louvain-La-Neuve, Belgien, 2004. Opponent for doktor afhandling ved Oslo Universitet, Norge, 2005. Ph.D.-vejleder for Kenneth K Barfod fra oktober 2006. Opponent for Ph.D.-projekt DTU, 2008.