1. Proteomforskning indenfor cancerområdet i Winsløwparken v. professor Henrik Ditzel og Rikke Raaen Lund

Transkript

1 Afdeling: Udarbejdet Tina Thorsell Mikkelsen og Niels Hæmatologisk Afd. X af: Abildgaard Journal nr.: tina.thorsell.mikkelsen@ouh.regionsyddanmark.dk Dato: 28. april 2011 Telefon: Referat Møde: Forskningsmøde med deltagelse af professor Henrik Ditzel, post.doc. Rikke Lund og professor Lars Melholt Rasmussen Tidspunkt: Onsdag d Sted: Konferencelokalet Afd. X 1. Proteomforskning indenfor cancerområdet i Winsløwparken v. professor Henrik Ditzel og Rikke Raaen Lund Henrik Ditzel indleder med en gennemgang af discovery-baseret proteomforskning. Fokus for dette område er at finde nye og bedre markører for specifikke sygdomme og til forudsigelse af effekt på specifikke behandlinger. Til forskningsområdet hører også eksplorativ functional proteomics. Proteomics: Har som mål at beskrive ændringer og mønstre i cellers proteinekspression. Funktionel proteomic - posttranslationelle modifikationer - fosfyleringer - glykosyleringer Ditzel s gruppe er især aktiv indenfor mammacancer, men også indenfor andre cancere, herunder coloncancer. Der forskes aktuelt i, om man kan identificere proteomics-profiler, som kan forudsige resistens overfor de enkelte behandlinger. Side 1/ 7

2 En af de store udfordringer er at få analyseret data, idet mængden af data er meget stor. Hele området bio-informatik er voksende og fordrer specialkompetencer Rikke Raaen Lund gennemgår de foreløbige erfaringer indenfor coloncancer. Det understreges, at der er stor interesse i et forskningssamarbejde med Hæmatologisk Afdeling. 2. Studie af proteomics i forbindelse med behandling med Interferon Alfa ved kronisk myeloide sygdomme v. ph.d. Thomas Stauffer Larsen Kort gennemgang af kroniske myeloproliferative neoplasier (ET, PV, PMF, CML). De fire sygdomme udgør tilsammen den største gruppe klonale stamcelle sygdomme. Kendetegnende specielt for ET, PV og PMF er, at disse tre sygdomme har en del fælles karakteristika. Gennembrud i 2005 i forhold til diagnosticeringen af denne gruppe sygdomme, da JAK2 mutationen blev kendt. Thomas er desuden godt på vej med nyt studie; DALIAH, Dansk studie af Lav-dosis Interferon Alpha vs. Hydroxyurea i behandlingen af Ph-Negative kroniske myeloide neoplasier. Et nationalt randomiseret, prospektivt kvalitetssikringsstudie med særlig fokus på effekt, toxicitet og livskvalitet. Primære formål 1. At sammenligne behandlingseffekt, klinisk, molekylært og histopatologisk hos danske patienter med Ph-negative kroniske myeloide neoplasier (CMPN); essential trombocytose (ET), polycytæmia vera (PV) og primær myelofibrose (PMF) i behandling med lav-dosis Interferon Alpha (Pegasys IFN-alpha2a, PegIntron IFN-alpha2b, Multiferon - Humant Leukocyt IFN og Hydrea (hydroxyurea). 2. At undersøge toksiciteten af Pegasys IFN-alpha2a og PegIntron IFN-alpha2b, dels de to præparater imellem, men også overfor Hydrea - (hydroxyurea). Side 2/ 7

3 3. At undersøge livskvaliteten (EORTC QLQ C30 og MPN-SAF) hos danske patienter i behandling med Pegasys IFN- alpha2a, PegIntron IFN-alpha2b, Multiferon - Humant Leukocyt IFN og Hydrea - hydroxyurea. 4. At undersøge forekomsten af neutraliserende interferon antistoffer hos patienter i behandling med Pegasys IFN-alpha2a, PegIntron IFN-alpha2b, og undersøge om der ved behandlingsintolerans og/eller dårligt respons kan (gen)-opnås et klinisk og molekylært respons ved behandlingsskift til Multiferon - Humant Leukocyt IFN. Sekundære formål 1. Gennem indsamling af blod og knoglemarv til biobank at kunne gennemføre senere molekylærbiologiske, immunologiske, serologiske og immunhistokemiske studier. Perspektiver i forhold til mulige proteomstudier Eksplorativt værktøj til at afdække forskelle i proteomprofilen mellem ET, PV og PMF eller JAK2 V617F +/- på diagnosetidspunktet. Forskelle i proteomprofilen mellem IFN responders og non-responders prædiktion af behandlingsrespons. (Målinger til tiden 0, 6, 12, 24 mdr.?) 3. Center of Clinical Proteomics, præsentation ved professor Lars Melholt Rasmussen For nogle år tilbage opstod ønsket om at samle den fraktionerede kliniske proteomforskning i ét samlet center i Odense. Fordelene ved dette er bl.a.: - Styrkelse af klinisk proteomforskning i Odense - Synergi mellem forskningsprojekter - Samling af tung teknologi og ekspertise - Samlet center står stærkere ved store ansøgninger Første fase Etablering af koordinerende center (se diagram for beskrivelse af organisation). Etablering af klinisk proteom-forskergruppe på BMB, SDU Professor, post.doc./kemiker, laborant, instrumenter. Side 3/ 7

4 Etablering af high-throughput protein-/biomarkør-laboratorie på OUH (KBF). Lektor (1/2), bioinformatiker (post.doc), MS-instrument til multiplexede proteinmålinger. Afdeling for Klinisk Biokemi og Farmakologi (KBF s) rolle Etablering af nyt forskningslaboratorium (biomarkørlaboratoriet). Highthroughput kvantitering af peptider. multiplexing på LC-MS/MS. immunoassays Plan Ombygning (færdig primo juni 2011). Ansættelse af ½ lektor + post.doc. fra juli Start af proteinkvantiteringer (efterår 2011): fibulin-1, apolipoproteiner, thyreoglobulin, titin, m.fl. Hvad er fordelene ved massespektrometriske metoder? Fordele og ulemper ved kvantitering af peptider / proteiner ved massespektrometri versus immunoassays kan kort resumeres som følger: MASSESPEKTROMETRI (LC-MS) Målekomponent bedre defineret Resultater fra discovery proteom-exp kan bruges Måler peptid fragmenter Ingen behov for antistoffer Behov for rene peptider til std. Kan multiplexes Ikke interferens fra bindingsprot. etc. Bedre mulighed for måling af posttrans. modif. Præcision? Side 4/ 7

5 Sensitivitet? Lidt langsommere end batch-immunoassays Metoder i kraftig udvikling IMMUNOASSAYS Afhængig af antistof og std. Epitop ofte ikke veldefineret Interferens risiko Ofte god sensitivitet Hurtig Side 5/ 7

6 BOARD International advisory board CENTER leder Martin R. Larsen Academic secretary BMB Clinical PROTEOMICS Prof. Martin Røssel Larsen OUH CLINICAL proteomics Prof. Lars Melholt Rasmussen Method development Disease understanding Biomarker discovery Biomarker Validation of large data sets with SRM, ELISA or Western Blotting Transfer new screening methods and assays into the clinic

7 Side 7/ 7