Nyhedsbrev Nr. 2 2015 Juni 2015 Redaktion: Marianne Nielsine Skov marianne.skov@rsyd.dk, Michael Kemp: michael.kemp@rsyd.dk, Janne Kudsk Klitgaard: jkklitgaard@health.sdu.dk, Lone R. Ejrnæs (Redaktør): lone.ejrnaes@rsyd.dk Nyhedsbrev nr. 2 fra forskningsenheden for Klinisk Mikrobiologi Kvartalets forsker Overlæge Ulrik Stenz Justesen har været ansat på KMA, OUH i sammenlagt 8 1/2 år og har hele tiden ydet en markant forskningsindsats. Alene i første halvdel af i år har Ulrik udgivet 8 videnskabelige artikler. Ulriks forskningsområder er først og fremmest inden for antibakteriel resistens og anaerobe bakterier. Ulrik har desuden været en ivrig igangsætter, som har startet mange yngre forskere i nogle af deres første projekter. Ulrik har formået at opbygge et solidt forskningsnetværk: Lokalt: Institut for Biokemi og Molekylær Biologi, Syddansk Universitet (SDU). Nationalt: Statens Serum Institut (SSI), The Microbial Genomics and Antimicrobial Resistance Group, National Food Institute, Technical University of Denmark (DTU). Internationalt: EUCAST Laboratory for Antimicrobial Susceptibility Testing, Centrallasarettet, Växjö, Sverige, Institute of Clinical Microbiology, University of Szeged, Szeged, Ungarn, Department of Medical Microbiology, University Medical Centre Groningen, Groningen, Holland, Department of Medical Microbiology, Marmara University, Istanbul, Tyrkiet, R.M. Alden Research Laboratory, LA, USA. Efter redaktionens beslutning om at portrættere Ulrik har vi erfaret at han desværre forlader OUH for at blive overlæge på Rigshospitalet. Vi ønsker både Ulrik og Rigshospitalet til lykke og håber at vi fortsat kan have fornøjelse af Ulrik og hans forskning gennem samarbejdsprojekter.
Personale Kort præsentation af nye medarbejdere og andre, der får tilknytning til forskningsenheden. 2)Præsentation af en af enhedens forskere ( kvartalets forsker ): En kort omtale af en af forskningsenhedens medarbejdere. Velkommen til: Efter sommerferien (1. september) starter fire stud.med er som forskningsårsstuderende (prægraduat), Kia Cirkeline Møller Hansen (Cirke), Simon Andreas Ferløv Schwensen, Daniel Skovgaards og Melissa Niyonkuru. Cirke skal undersøge forekomsten af antibiotika-resistens i tarmfloraen, hos patienter der har været i behandling med bredspektrede antibiotika. Det er patienter fra infektionsmedicinsk afdeling Q, onkologisk afdeling R og hæmatologisk afdeling X, der indgår i studiet. Der anvendes fæcesprøver, hvorfra der skal isoleres bakterier tilhørende Bacteroides fragilis gruppen. På isolaterne udføres identifikation og resistensbestemmelse. Simon skal undersøge udviklingen i forekomsten af antibiotikaresistens hos den normale tarmflora over 40 år. Undersøgelsen fortages på historiske isolater tilhørende Bacteroides fragilis gruppen indsamlet over 40 år. Herudover skal Simon opsætte en PCR til konfirmation af en MALDI-TOF metode til at finde resistensgener i de samme isolater. Daniel er allerede startet på undersøgelser af forekomsten af protozoer hos børn og har præsenteret en poster sidste efterår. I forskningsåret fortsættes disse undersøgelser med brug af vores nyudviklede PCR assays.
Melissa skal arbejde med molekylærbiologisk detektion og identifikation af malariaparasitter. Farvel til: Kandidatspeciale studerende forår 2015: Marie Olssøn Østby-Deglum og Håll Karin Charlotte Anderman. Nyt om projekter Spændende nyt, sjove/vigtige observationer, oplæg til diskussioner, spørgsmål, o.l. Undersøgelse af atypiske Staphylococcus aureus-isolater - et samarbejde med KMA, Hvidovre Vi har fundet 7 Methicillin sensitive Staphylococcus aureus (MSSA)-isolater på KMA, Odense, som har MLST-typen ST2250 og spatypen t11475. Disse isolater pådrog sig i første omgang vores opmærksomhed, da de var negative i KMAs in-house nuc PCR, som er en species-specifik PCR for S. aureus. Vi fik hjælp af KMA, Hvidovre til at MLST- og spa-type disse isolater. Efterfølgende har KMA, Hvidovre fundet yderligere 7 Methicillin resistente S. aureus (MRSA) isolater med samme MLST- og spa-type. Disse isolater er meget sjældne, og de ligger genetisk langt væk fra alle S.aureus i deres database. Alle isolaterne er helgenomsekventeret, men der er nogle huller i sekvensen, så afdelingen har bevilliget penge til at få sekventeret et isolat på PacBio i håb om at få lukket sekvensen. Derefter skal isolaterne beskrives nærmere fylogenetisk med henblik på at undersøge om det er en ny species eller subspecies. Silje Vermedal Høgh, Marianne N. Skov & Michael Kemp, KMA OUH samt Henrik Westh, Kit Boye & Peder Worning, KMA Hvidovre Formidling Antagne videnskabelige publikationer, herunder mødeabstracts Husk at sende publikationer, herunder abstracts fra kongres- og mødepræsentationer, til Lone, så de kan blive registreret i PURE. Postere: Artikler: Rasmussen BS, Christensen N, Sørensen J, Rosenvinge FS, Kolmos HJ, Skov MN. Outbreak of Pseudomonas aeruginosa bacteraemia in a haematology department. Dan Med J. 2015 Apr;62(4):A5040. Pinholt M, Larner-Svensson H, Littauer P, Moser CE, Pedersen M, Lemming LE, Ejlertsen T, Søndergaard TS, Holzknecht BJ, Justesen US, Dzajic E, Olsen SS, Nielsen JB, Worning P, Hammerum AM, Westh H, Jakobsen L. Multiple hospital outbreaks of vana Enterococcus faecium in Denmark, 2012-13, investigated by WGS, MLST and PFGE. J Antimicrob Chemother. 2015 Jun 1. [Epub ahead of print] Ank N, Sydenham TV, Iversen LH, Justesen US, Wang M. Characterisation of a multidrug-resistant Bacteroides fragilis isolate recovered from blood of a patient in Denmark using whole-genome sequencing. Int J Antimicrob Agents. 2015 Jul;46(1):117-20. Epub 2015 Apr 17. Sydenham TV, Hasman H, Justesen US. Draft Genome Sequences of Sanguibacteroides justesenii, gen. nov., sp. nov., Strains OUH 308042T (= ATCC BAA-2681T) and OUH 334697 (= ATCC BAA-2682), Isolated from Blood Cultures from Two Different Patients. Genome Announc. 2015 Mar 26;3(2).
Henriksen DP, Pottegård A, Laursen CB, Jensen TG, Hallas J, Pedersen C, Lassen AT. Risk factors for hospitalization due to community-acquired sepsis - a population-based case-control study. PLoS One. 2015 Apr 21;10(4): Rasmussen BS, Christensen N, Sørensen J, Rosenvinge FS, Kolmos HJ, Skov MN Outbreak of Pseudomonas aeruginosa bacteraemia in a haematology department.dan Med J. 2015 Apr;62(4):A5040. Anden formidling Kommende møder og konferencer med deadlines for tilmelding Økonomi Opnået støtte: Lektor Janne Kudsk Klitgaard har modtaget 29.000 kroner fra Dansk Proces Teknologi til et pilotprojekt i samarbejde med Aminnord ApS hvor potentialet af et antimikrobielt stof fra en plante skal analyseres. Professor Michael Kemp og Thomas Vognbjerg Sydenham har modtaget 15.000 kr. fra Overlægerådets legatudvalg til projektet: Anvendelse af Next Generation Sequencing til diagnostik af infektioner i centralnervesystemet Ulrik Stenz Justesen har fået 166.039,- kr. til Simon Andreas Ferløv Schwensens prægraduate forskningsprojekt: Udviklingen i forekomsten af antibiotikaresistens hos den normale tarmflora over 40 år, fra Det Frie Forskningsråd - Sundhed og Sygdom Til lykke til alle beløbsmodtagere. Kommende deadlines for fonde og legater Projektstøtte ansøgninger termin Navn beløb Link uddybning juli 01 FONDEN AF 17-12-1981 gældend e takster http://www.fondenaf17121981.d k/index.php?option=com_conten t&view=article&id=51&itemid= 55 1-2 ledige skolar- og 1 junior stipendium september 01 http://www.gangstedfonden. dk/ ca 200.000 http://www.gangstedfonden.dk/ Hempel Fonden yder støtte til kulturelle, sociale, humanitære, videnskabelige, kunstneriske og andre almennyttige formål. oktober 01 Lægevidenskabens fremme http://www.apmollerfonde.dk/an soegning/laegefonden.aspx oktober 01 A.P Møller 50.000-100.000 kr. http://www.apmollerfonde.dk/ansoegning/laegefonden.aspx 4 x årligt Spar Nord Fonden 40.000? https://www.sparnordfonden.dk/ ansoeg-spar-nord-fonden.aspx Tømmerhandler Bangs Fond Vilhelm 2 mill årligt samlet http://tvbf.dk/ Lundbeckfondens Visiting Professorships til sundhedsvidenskab 750.000 http://www.lundbeckfonden.com /Visiting-Professorships.63.aspx Danske sundhedsvidenskabelige forskningsmiljøer kan i søge om støtte til at tiltrække udenlandske gæsteforskere på professorniveau til Danmark i op til ½ år. Dansk Selskab for Rejsemedicins Legater 4.000 http://www.danskrejsemedicin.dk/default.aspx?pa ge=legater Kongresrejser Dansk Selskab for 10.000 http://www.danskrejsemedicin.dk/default.aspx?pa Videnskabelige projekter om rådgivning til rejsende
Rejsemedicins Legater ge=legater Knud og Edith Eriksens Mindefond op til 1 mill http://keemindefond.businesscat alyst.com/bevillinger-2014.html Knud og Edith Eriksens Mindefond uddeler årligt ca. 1 million kroner i en eller flere portioner til en læge eller videnskabsmand, der arbejder med forskning til bekæmpelse af sygdomme eller til én eller flere sygdomsramte personer. Knud Højgaards Fond khf.dk Knud Højgaards Fond støtter studierejser og konferencedeltagelse i udlandet for ph.d.-studerende og post docs Bodil Pedersen Fonden Aase og Ejner Danielsens fond Direktør Ob Henriksens fond Lægevidenskabelige selskaber, udenlandske foredragsholdere http://bodilpedersenfonden.dk/a nsoegninger.html http://www.danielsensfond.dk/fonden_st%c3%b8tter/l%c3%a6gevidenskabelig_forskni ng.aspx http://www.dihfond.dk/side4.ht ml http://www.selskaberne.dk/portal/page/portal/lvs/forside/medlemsselskaber/tilskud%20 til%20udenlandsk%20foredragsholder brd. Hartmanns Fond http://www.hartmannfonden.dk/ kontaktformular Apparatur Alfred benzons Workshops 50.000 http://www.benzonfoundation.dk/?q=node/8 Alfred benzons Symposier http://www.benzonfoundation.dk/?q=node/6 Lundbeckfonden Rejsestipendier 50.000 http://www.lundbeckfonden.com /Rejsestipendier.34.aspx Kongresdeltagelse udland Region Syddanmark MTVpuljen http://www.regionsyddanmark.d k/wm356231 Socialt Andet Evt/andet