Indledning Principper for mikrobiologisk undersøgelse Generelt: Undersøgelse for specielle bakterier og svampe:...

Side 1 af 142 Indledning... 7 Geografi:... 7 Telefon:... 7 Telefax:... 7 Åbningstid:... 8 Vagtordning:... 8 Rekvirering af akutte mikrobiologiske prøver i tidsrummet fra klokken 22.00-08.00:... 8 Telefonisk rådgivning:... 8 Patienttilsyn:... 9 Konferencer:... 9 Videnskabelige undersøgelser:... 9 Principper for mikrobiologisk undersøgelse... 10 Generelt:... 10 Undersøgelse for specielle bakterier og svampe:... 10 Bestilling af mikrobiologisk undersøgelse... 11 Utensilier:... 11 Prøvetagningssæt:... 11 loddyrkningskolbe, Aerobe, Grå/Blå hætte... 12 Bloddyrkningskolbe, Anaerob, Orange/guld hætte... 12 Bloddyrkningskolbe, Svampe (mycosis), Grøn/Grå hætte... 12 Bloddyrkningskolbe, Børnekolbe, Lyserød/sølv hætte... 12 Bloddyrkningskolbe, Aerob kolbe/blå hætte... 12 Bloddyrkningskolbe, Aerob kolbe/grøn hætte... 13 Bloddyrkningskolbe, Anaerob kolbe/mørkerød hætte... 13 Bloddyrkningskolbe, Anaerob kolbe/orange hætte... 13 Bloddyrkningskolbe, Børnekolbe/gul hætte... 13 Bloddyrkningskolbe, Børnekolbe/gul hætte... 13 Chlamydia trachomatis/ Neisseria gonorrhoeae, Molekylærbiologisk teknik... 14 Urintransportrør... 14 EDTA-glas, 3ml... 14 Blodprøverør med gel... 15 Ekspektoratdåse m/ plasticcontainer... 15 eswab transportmedium... 15 eswab transportmedium... 15 Forsendelsesetui til 2 objektglas... 16 Forsendelseshylster, sæt... 16 Forsendelsesrør til sprøjter... 16 Fæcesrør komplet... 16 Objektglas uslebne... 17 Objektglas, facetslebne... 17 Plastflaske, 250mL... 17 Plastflaske, 1 L... 17 Spidsglas m/skruelåg, sterile... 17 Spidsglas m/skruelåg, sterile... 17 Sprøjte 3 ml Luer Lock... 18 Sugekateter Ideal, lige... 18 Sugekateter Ideal, lige... 18 Termobeholder... 18 Trakeal sugesæt med vaccumkontrol... 18 Vatpind, steril, hvid... 18 Urinprøvesæt, steril... 18 Urin-movetter (borsyreglas)... 18

Side 2 af 142 Efter prøvetagning... 19 Opbevaring:... 19 Indlevering:... 19 Akutte prøver:... 19 Mikrobiologiske prøvemodtagelser:... 19 Transport:... 20 Svartyper:... 20 Afsendelse af svar:... 20 Tolkning af svar:... 21 Følsomshedsbestemmelse in vitro:... 22 Supplerende undersøgelser:... 22 Undersøgelseskategorier... 23 Abscesmateriale, aspireret pus... 23 Adenovirus antistof, (se Luftvejspanel).... 24 Adenovirus fæces, (se diarreudredning).... 24 Adenovirus øje... 24 Antituberkuløse midler, (se Serumkoncentration af antituberkuløse midler).... 24 Arena (Lassa, Junin) virus PCR og antistof IgM, IgG... 25 Aspergillus galactomanan antigen, (se Rigshospitalets prøvevejledning)... 25 Aspergillus antistof... 25 Pus, sårsekret, sekret podning... 25 AST (anti-streptolysin O)... 27 Bartonella henselae (cat scratch disease) og Bartonella Quintana (trench fever) antistof... 28 Bartonella henselae (cat scratch disease) og Bartonella Quintana (trench fever) PCR... 28 Biopsi materiale, (se Væv, knogle og vævs-biopsier).... 28 Bloddyrkning... 29 BK polyomavirus DNA/RNA... 31 Bordetella pertussis IgG antistof, (se kighoste).... 31 Bordetella pertussis/parapertussis DNA/RNA, (se kighoste).... 31 Borrelia burgdorferi antistoffer... 31 Bronkoalveolær lavage (BAL)... 33 Brucella antistof... 35 Brucella DNA/RNA... 35 Burkholderia pseudomallei DNA/RNA... 35 Børneorm (Enterobius vermicularis)... 35 Campylobacter antistof Ig(G,M,A), (se Rigshospitalets prøvevejledning)... 36 Candida mannan (antigen og antistof undersøgelse)... 37 Chikungunya virus PCR og antistof IgM, IgG... 37 Chlamydophila pneumoniae antistof IgG & IgM... 37 Chlamydophila pneumoniae DNA, (se Mycoplasma pneumoniae DNA/Chlamydophila pneumoniae DNA).... 37 Chlamydophila psittaci antistof (papegøjesyge)... 37 Chlamydia psittaci DNA... 38 Chlamydia trachomatis og Neisseria gonorrhoeae RNA... 39 Clostridium botulinum... 41 Clostridium botulinum toksiner... 41 Clostridium difficile, (se Gastroenteritis, diagnostik)... 41 Coccidioides antistof... 41 Coxiella burnetii antistof (Q-fever)... 41 Coxiella burnetii PCR (Q-fever)... 42 Crimean Congo hemorrhagic fever virus DNA/RNA, (se Krim-Congovirus PCR og antistof IgM, IgG).... 42 Cryptococcus antigen... 42 CSV-syfilisantistoffer fuld undersøgelse... 42 Cytomegalovirus DNA kvantitativ/viral load.... 42 Cytomegalovirus (CMV) antistoffer... 43

Side 3 af 142 Denguevirus antigen og antistofundersøgelse... 45 Diaréudreding, (se Gastroenteritis, diagnostik)... 47 Diaréudredning (tarmpatogene parasitter) DNA/RNA, (se Duodenalsekret).... 47 Dientamoeba fragilis... 47 Difteritoksin antistof... 48 Duodenalsekret... 48 Ebola virus PCR og antistof IgM, IgG... 49 Echinococcus (mikroskopi)... 50 Echinococcus granulosus antistof, (se Rigshospitalets prøvevejledning)... 50 Echinococcus multilocularis antistof... 50 Ehrlichia antistof... 50 Encephalit udredning, (se Herpes simplex virus (HSV) antistof, eller Varicella zoster virus (VZV) DNA).... 50 Encephalit-udredning... 50 Ekspektorat, trakeal- og bronkialsekret... 52 Enterobius vermicularis, (se børneorm)... 54 Entamoeba histolytica antistof... 54 Enterovirus IgM... 54 Enterovirus RNA, fæces... 54 Enterovirus RNA... 54 Epstein-Barr virus (EBV) antistoffer... 55 Epstein-Barr virus (EBV) DNA Kvant.... 57 Fasciola hepatica antistof... 58 Filarioidea antistof... 58 Flucytosin serum koncentration... 58 Franciscella tularensis antistof... 59 Franciscella tularensis DNA... 59 Franciscella tularensis (dyrkning)... 59 Fæces for orm, æg og cyster, se Gastroenteritis, diagnostik... 59 Gastroenteritis, diagnostik... 59 GAT, (se Gonokok antistof (GAT)).... 63 Giardia trofozoitter, (se Duodenalsekret).... 63 Gonokokker, (se Neisseria gonorrhoeae (gonokokker)(dyrkning) og Chlamydia trachomatis og Neisseria gonorrhoeae RNA).... 63 Gonokok antistof (GAT)... 63 Gul feber virus PCR og antistof IgM, IgG... 63 Haemophilus ducrei... 63 Haemophilus influenza type b antistof (Hib)... 64 Hantavirus PCR og antistof IgM, IgG... 64 Helicobacter pylori antigen i fæces... 64 Helicobacter pylori antistoffer... 65 Hepatitis A virus (HAV)... 66 Hepatitis A virus (HAV) PCR... 67 Hepatitis B virus (HBV)... 67 Hepatitis B virus (HBV) subtype og resistensbestemmelse... 71 Hepatitis B virus (HBV), DNA (PCR) kvantitativ, (Se Analyser der udføres på Hvidovre Hospital)... 71 Hepatitis C virus (HCV)... 71 Hepatitis C virus genotypning, (Se Analyser der udføres på Hvidovre Hospital)... 72 Hepatitis C virus, RNA (RT-PCR) kvantitativ, (Se Analyser der udføres på Hvidovre Hospital)... 72 Hepatitis D virus PCR... 72 Hepatitis D virus antigen og antistof HDV... 73 Hepatitis E PCR... 73 Hepatitis E antistof IgM, IgG... 73 Hepatitis G virus (GBV-C) RNA (RT-PCR)... 73 Herpes simplex virus (HSV) antistof... 73

Side 4 af 142 Herpes simplex virus (HSV) DNA (typespecifik)... 74 Histoplasma antistof... 76 HIV-1 genotypisk resistensbestemmelse... 76 HIV-1 genotypisk tropisme test... 76 HIV-1 integrase resistens... 76 HIV-1 RNA (Viral load) kvantitativ (RT-PCR), (Se Analyser der udføres på Hvidovre Hospital)... 76 HIV-1 PCR (DNA) kvalitativ... 77 HIV 1 og HIV 2 (antigen- og antistofundersøgelse)... 77 HSV, (se Herpes simplex virus (HSV) antistof).... 78 Hudsvampe... 78 Human herpes virus 6A, 6B, 7 DNA... 80 Human papillomavirus DNA/RNA... 80 Influenza (A+B) virus DNA/RNA... 80 Influenza C... 80 Influenza virus antistof, (se Luftvejspanel).... 81 Influenzavirus subtypning... 81 Influenzavirus, genotypisk resistens overfor neuramidasehæmmer... 81 Itraconazol serum koncentration... 81 I.v. kateterspids... 81 Japansk encephalit virus PCR og antistof... 82 JC-virus ultrasensitiv... 82 Kighoste (Bordetella pertussis) antistoffer... 82 Kighoste (Bordetella pertussis) DNA... 83 Koncentrationsbestemmelse af antibiotika... 84 Krim-Congovirus PCR og antistof IgM, IgG... 87 Legionella DNA... 87 Legionella pneumophila antigen i urin (LUT)... 88 Legionella pneumophila antistof (LAT)... 89 Leishmania arter antistof... 89 Leptospira DNA/RNA... 90 Leptospira DNA/RNA og dyrkning... 90 Leptospira antistof (Weil)... 90 Listeria monocytogenes antistof... 90 Luftvejspanel (inf. virus, Adenovirus og RSV antistof)... 90 Luftvejsvirus DNA/RNA... 91 Malaria... 92 Maarburg Virus DNA/RNA, IgG og IgM antistof... 94 MTB kompleks mikroskopi og PCR... 95 Meningokok antistoffer (MAT)... 95 Morbillivirus IgM og IgG antistof, (Se Analyser der udføres på Hvidovre Hospital)... 95 Morbillivirus IgG antistof immunstatus, (Se Analyser der udføres på Hvidovre Hospital)... 95 Morbillivirus DNA... 96 MRSA (meticillinresistente S. aureus)... 96 MTB kompleks mikroskopi og PCR, (se Mycobacterium dyrkning og DNA/RNA (TB)).... 97 Mycobacterium tuberculosis (MTB) kompleks, rifampicin og isoniazid resistens (kan udføres på mikroskopipositive og andet ekspektorater)... 97 Multiresistente bakterier ved udlandsrejser og hospitaler (se Udlandsscreening, screening for (multi-) resistente bakterier)... 98 Mycobacterium dyrkning og DNA/RNA (TB)... 98 Mycoplasma, (se Non-gonoroisk, non-klamydiel urethrit/cervicit udredning DNA/RNA)... 98 Mycoplasma pneumoniae IgG og IgM antistof, (Se Analyser der udføres på Hvidovre Hospital)... 98 Mycoplasma pneumoniae DNA/Chlamydophila pneumoniae DNA... 98 Mykobakterier atypiske PCR (kan udføres på mikroskopipositive og ekspektorater)... 100 Mæslinger, (se Morbillivirus DNA).... 100

Side 5 af 142 Neisseria gonorrhoeae antistof, (se Gonokok antistof (GAT)).... 100 Neisseria gonorrhoeae (gonokokker)(dyrkning)... 100 Neisseria meningitidis antistof (MAT), (se Meningokok antistoffer).... 101 Non-gonorrhoisk, non-chlamydia urethrit/cervicit... 101 Non-gonoroisk, non-chlamydia uretrit PCR... 102 Non-gonoroisk, non-klamydiel urethrit/cervicit udredning DNA/RNA... 103 Norovirus, (se Gastroenteritis, diagnostik)... 103 Orm, æg og cyster, (se Gastroenteritis, diagnostik)... 103 Orm (identifikation)... 103 Parainfluenza virus antistof... 104 Parechovirus, (se Enterovirus IgM).... 104 Parotitisvirus IgG antisstof (immunstatus), (Se Analyser der udføres på Hvidovre Hospital)... 104 Parotitisvirus IgM og IgG antistof, (Se Analyser der udføres på Hvidovre Hospital)... 104 Parotitisvirus DNA/RNA... 104 Parvovirus B-19 IgM og IgG antistof... 104 Parvovirus DNA/RNA, (se Rigshospitalets prøvevejledning)... 106 Plasmodium (mikroskopi) (malaria), (se Malaria).... 106 Plasmodium arter (malaria) antistof IgM, IgG... 106 Pneumocystis jiroveci (tidl. carinii) DNA... 107 Pneumokok antistof (23 valent)... 107 Pneumonok antistof (7/13 valent)... 107 Pneumoniudredning (atypisk pneumoni)... 108 Podning fra cervix... 109 Poliovirus neutraliserende antistof... 110 Polyomavirus Ki, Wu... 110 Posaconazol serumkoncentration... 111 Poxvirus DNA/RNA... 111 PUT, (se Streptococcus pneumoniae (pneumokok) antigen i urin (PUT)).... 111 Q-feber, (se Coxiella burnetii antistof)... 111 Rabiesvirus antistof... 111 Rickettsia arter DNA... 111 Rift Valley virus DNA/RNA, IgG og IgM antistof... 112 RSV, (se Luftvejspanel).... 112 Rotavirus, (se Gastroenteritis, diagnostik)... 112 Rubellavirus IgM og IgG antistof... 112 Rubellavirus RNA/DNA... 113 Salmonella antistof(enteritidis og typhimurium)... 113 Sandfly Toscana virus PCR og antistof IgM, IgG... 114 Schistosoma (bilharziose) antistof, (se Rigshospitalets prøvevejledning)... 114 Schistosomiasis (Bilharziose), mikroskopi... 114 Screening for Multiresistente bakterier, Udlandsscreening (Se Udlandsscreening, screening for (multi-) resistente bakterier)... 115 Sektionsmateriale... 115 Serumkoncentration af antituberkuløse midler... 116 Serumkoncentration af svampemidler, (se Flucytosin serum koncentration, Posaconazol serumkoncentration, Voriconazol serumkoncentration eller Itraconazol serum koncentration).... 116 Staphylococcus areus (MRSA) (dyrkning), (se MRSA (meticillin-resistente S. aureus)).... 116 Spinalvæske og hjerneventrikelvæske... 116 Streptococcus pneumoniae antistof (23 valent), (se Pneumokok antistof (23 valent)).... 118 Streptococcus pneumoniae antistof (7/13 valent), (se Pneumonok antistof (7/13 valent)).... 118 Streptococcus pneumoniae (pneumokok) antigen i urin (PUT)... 119 Strongyloides antistof... 120 Strongyloides dyrkning, (se Rigshospitalets prøvevejledning)... 120 Syfilisantistoffer i spinalvæske, (se CSV-syfilisantistoffer)... 120

Side 6 af 142 Syfilisantistoffer intrathekal syntese... 120 Svælgpodning for ß-hæmolytiske streptokokker... 120 Svælgpodning, andet... 121 Taenia solium antistof (cysticercosis)... 122 Tarmpatogene bakterier, inklusive Clostridium difficile, (se Gastroenteritis, diagnostik)... 122 TBE antistof, (se Tick born encephalitis (TBE) IgG og IgM).... 122 TBE DNA/RNA, (se Tick born encephalitis (TBE) DNA/RNA).... 122 Tetanustoksin antistof... 123 Tick born encephalitis (TBE) IgG og IgM... 123 Tick born encephalitis (TBE) DNA/RNA... 123 Toscana virus DNA/RNA, IgG og IgM antistof.... 123 Toxocara antistof... 123 Toxoplasma gondii IgG og IgM antistof... 124 Toxoplasma gondii (nyfødte)... 125 Toxoplasma gondii DNA/RNA... 125 Treponema pallidum antistoffer, intrathekaltest, (se Syfilisantistoffer intrathekal syntese).... 125 Treponema pallidum antistoffer i spinalvæske, (se CSV-syfilisantistoffer).... 125 Treponema pallidum antistoffer (syfilis screening)... 125 Treponema pallidum DNA/RNA... 127 Trichinella spiralis antistof... 127 Trofozoitter af Giardia intestinalis i duodenalsekret... 127 Tropheryma whipplei DNA/RNA... 128 Trypanosoma antistof... 128 Udlandsscreening, screening for (multi-) resistente bakterier... 129 Ureaplasma ureayticum, (se Non-gonoroisk, non-klamydiel urethrit/cervicit udredning DNA/RNA).... 130 Urin... 131 Urogenitiale mycoplasmer, (se Non-gonoroisk, non-klamydiel urethrit-/cervicit udredning DNA/RNA).... 133 Vaginalpodning for gær... 133 Varicella zoster virus (VZV) antistoffer... 134 Varicella zoster virus (VZV) DNA... 134 Venezuelansk equine encephalitis virus DNA/RNA, IgG og IgM antistof... 135 VZV, (se Varicella zoster virus (VZV) DNA)... 136 VZV antistof, (se Varicella zoster virus (VZV) antistoffer).... 136 Voriconazol serumkoncentration... 136 Væsker, led-, pleura-, perikardie-, p-dialysevæske, ascites m.m... 136 Væv, knogle og vævs-biopsier... 138 Weil Felix Proteus antistof ved rickettsiose... 139 West Nile virus DNA/RNA, IgG og IgM antistof... 139 Yellow fever, (se Gul feber virus PCR og antistof IgM, IgG).... 140 Yersinia enterocolitica 0:3 antistof, (Se Analyser der udføres på Hvidovre Hospital)... 140 Yersinia pestis DNA... 140 Zoonotisk fugle- og svineinfluenza... 140 Øjenpodning... 140 Ørepodning... 142

Side 7 af 142 Indledning Geografi: Telefon: Region Hovedstaden Klinisk Mikrobiologisk Afdeling (KMA) Herlev Hospital, Opgang 59 etage 05 Herlev Ringvej 75, 2730 Herlev 38 68 38 68. Telefax: Gennemvalgsnummer til fastnettelefoner 386 + lokalnummer. Sekretariat... lokal 8 38 50 Vagthavende læge... lokal 8 24 52 Afdelingsledelsen: Ledende overlæge, dr. med. Jens Otto Jarløv... lokal 8 38 56 Ledende bioanalytiker Susanne Pedersen... lokal 8 38 54 Afdelingsledelsessekretær Elsebeth T. Gylling... lokal 8 38 55 Øvrige speciallæger: Overlæge, ph.d. Bente Olesen... lokal 8 52 82 Overlæge, ph.d. Dennis Schrøder Hansen... lokal 8 52 83 Overlæge, dr. med. Jette Bangsborg... lokal 8 38 74 Overlæge Lene Nielsen... lokal 8 38 75 Overlæge Magnus Arpi... lokal 8 38 83 Afdelingslæge Inger Brock... lokal 8 47 15 Afdelingslæge, ph.d. Michael Pedersen... lokal 8 52 56 Afdelingslæge Barbara Juliane Holzknecht... lokal 8 52 86 Bioanalytikerundervisere/afdelingsbioanalytikere: Casper Dam-Nielsen... lokal 8 52 55 Hanne Wiese Hallberg... lokal 8 38 85 Irene Møller Jensen... lokal 8 37 01 Anne Kailow... lokal 8 94 46 Lilyan Almousawi... lokal 8 52 54 Tina Proft Larsen... lokal 8 22 82 Nina Clarén... lokal 8 64 09 Hygiejnesygeplejersker: Sanne Dragsted... lokal 8 38 57 Dorte Buhl... lokal 8 43 38 Dorthe Mogensen... lokal 8 22 15 Marianne Midttun... lokal 8 38 59 Ledende lægesekretær Elsebeth Gylling... lokal 8 38 55 38 68 37 72

Side 8 af 142 Åbningstid: KMA har åbent alle ugens dage inkl. søn- og helligdage mellem kl. 08.00 - kl. 22.00. Sekretariatets telefon er åben mandag til lørdag mellem kl. 9-15 på tlf. 38 68 38 50. Vagtordning: Opkald til vagthavende mikrobiolog udenfor sekretariatets åbningstider sker via omstillingen på Herlev Hospital på tlf. 38 68 38 68 indtil kl. 22.00. I tidsrummet kl. 22.00-08.00 kan vagthavende mikrobiolog på Rigshospitalet kontaktes via omstillingen på tlf. 35 45 35 45. Rekvirering af akutte mikrobiologiske prøver i tidsrummet fra klokken 22.00-08.00: Akutte mikrobiologiske prøver, der skal bestilles i tidsrummet fra klokken 22.00-08.00, skal bestilles på nødblanket og udelukkende efter telefonisk aftale med vagthavende mikrobiolog på Klinisk mikrobiologisk afdeling, på Rigshospitalet. Den vagthavende mikrobiolog træffes via omstillingen på tlf. 35 45 35 45. Husk at notere kontaktperson i egen afdeling samt telefonnummer på nødblanketten så Klinisk Mikrobiologisk afdeling kan ringe et svar tilbage. Noter også prøveforsendelsen på ordinationsark som dokumentation. Husk ligeledes at markere prøven med tydelig patientidentifikation. Prøverne sendes med taxa på rekvirentens regning og afleveres i Rigshospitalets information, Blegdamsvej 9, 2100 København Ø, såfremt andet ikke er aftalt med den vagthavende mikrobiolog. Prøver kan ikke sendes uden personlig kontakt og ved forventning om prøvefremsendelse kontaktes den vagthavende mikrobiolog generelt først, når prøveudtagelse er udført. Prøver, som analyseres på Rigshospitalet kan ikke ses via WWBakt, idet Rigshospitalet har et andet mikrobiologi system. Efter endt prøvebehandling vil det endelige svar findes i den landsdækkende database MiBa, som tilgås via WWBakt i OPUS arbejdsplads. Telefonisk rådgivning: KMA s læger står til rådighed for såvel sygehusvæsen som primær sundhedstjeneste med rådgivning om diagnostik, behandling og profylakse af infektionssygdomme. Hygiejnesygeplejersker og læger yder endvidere infektionshygiejnisk rådgivning.

Side 9 af 142 Patienttilsyn: KMA s læger udfører akutte tilsyn på Gentofte, Herlev samt Nordsjællands hospitaler. Tilsyn aftales telefonisk med vagthavende mikrobiolog. Hvis ønske om tilsyn meddeles KMA inden kl. 12.00, vil dette så vidt muligt blive udført samme dag. Problemstillingen bør fremgå af journalen. Konferencer: Mange kliniske afdelinger har ugentlige konferencer med KMA s læger. Behov for konferencer på andre afdelinger kan aftales med KMA s afdelingsledelse. Ved specielle patientproblemer bør KMA orienteres om morgenen inden konferencen, således at relevant materiale kan findes frem. Videnskabelige undersøgelser: KMA samarbejder gerne med sine brugere om videnskabelige projekter inden for infektionshygiejne samt diagnostik og behandling af infektionssygdomme. KMA vil gerne orienteres om projekter, der har et mikrobiologisk aspekt, også selv om et umiddelbart samarbejde ikke skønnes nødvendigt. Ved brug af mikrobiologiske svar i artikler og kasuistikker vil KMA gerne orienteres før publikation.

Side 10 af 142 Principper for mikrobiologisk undersøgelse Generelt: Resultatet af en mikrobiologisk undersøgelse er helt afhængig af kvaliteten af det modtagne prøvemateriale og af de ledsagende kliniske oplysninger. Er prøvematerialet ikke repræsentativt, er det til blandet normalflora, eller mangler relevante oplysninger om den kliniske problemstilling, bliver den mikrobiologiske besvarelse mangelfuld eller helt misvisende. I visse tilfælde vil prøven blive afvist, hvis der ikke er relevant indikation eller de kliniske oplysninger mangler. Ofte er en fuldstændig kortlægning af alle tilstedeværende bakterier og svampe ikke praktisk mulig. Dyrkning og identifikation af disse kan være forbundet med ugers eller måneders arbejde. Prøverne behandles derfor efter standardiserede procedurer, som erfaringsmæssigt giver de klinisk mest relevante oplysninger. Visse prøvekategorier dyrkes ikke rutinemæssigt anaerobt, idet dyrkningsresultaterne sjældent giver klinisk relevante oplysninger. Dette gælder dyrkning fra fx svælg, ekspektorat, urin, fæces og vagina. Undertiden vil det være indiceret at afvige fra de standardiserede procedurer. Dette forudsætter imidlertid, at KMA informeres via sufficiente oplysninger på rekvisitionen, evt. suppleret med telefonisk kontakt, inden prøven afsendes. Ved dyrkning fra områder, som normalt forventes at være sterile (blod, spinalvæske, visse punkturvæsker og biopsimateriale), vil alle potentielt patogene bakterier og svampe blive identificeret og resistensbestemt. En undtagelse er dog dyrkninger fra intraabdominale abscesser, perforeret tarm eller appendix indeholdende talrige bakteriearter, som i så fald vil blive svaret ud summarisk. I tilfælde af særlig "kostbart" prøvemateriale vil det være en god idé at kontakte KMA inden afsendelsen. Undersøgelse for specielle bakterier og svampe: Ved mistanke om specifik ætiologi til en infektion bør dette oplyses, idet bakterier og svampe som fx Actinomyces, Nocardia, difteribakterier og Brucella kræver specielle dyrkningsforhold for at kunne påvises.

Bestilling af mikrobiologisk undersøgelse Side 11 af 142 Mikrobiologiske prøver skal følges af en elektronisk rekvisition. For hospitaler bestilles undersøgelsen i Opus og for praksissektoren i Webreq. I rekvisitionsbilledet ses tre kolonner, Undersøgelse, Materiale og Lokalisation. Rækkefølgen af disse kolonner bestemmes med sorteringsknappen nederst til venstre under førstesøjle. Generelt bestilles PCR og serologiske undersøgelser efter agensnavn/ undersøgelse, derefter eventuelt Materiale (fx Enterovirus RNA/DNA fæces; Hepatitits A virus antistof (immunstatus) - Serum eller koagelblod). Bakteriologiske prøver, dyrkningsprøver, bestilles generelt altid som Dyrkning og resistens og herefter altid Materiale og eventuelt lokalisation (fx Dyrkning og resistens Sårpodning Lokalisation angivet i fri tekst; Dyrkning og resistens Urin). Enkelte specielle bakteriologiske undersøgelser bestilles efter agens-navn/ undersøgelse, det gælder fx Helicobacter pylori (dyrkning), Dyrkning (gærsvampe) Slimhinde-poding Vagina. Mykobacterium dyrkning og DNA/RNA (TB) materiale. Det selvklæbende nummer på prøvetagningsblanketten anvendes som eneste mærkning af prøven. Prøvetagningsblanketten skal ikke medsendes. Utensilier: Praksissektor Frigjorte kuverter, rekvisitioner (grønne) og utensilier bestilles ved at tilbagesende den bestillingsseddel, der vedlægges hver leverance af utensilier. Prøvetagningssæt: Hospitalssektor Utensilier bestilles i Refleks og leveres fra: Regionallageret Fabriksparken 22 2600 Glostrup Utensilier Anvendelse

Side 12 af 142 Utensilier loddyrkningskolbe, Aerobe, Grå/Blå hætte Reflex kortbeskrivelse: BACTEC Plus Aerobic/F Medium Anvendelse Bloddyrkningskolbe Gælder kun Herlev og Gentofte Hospitaler Opbevaring ved stuetemperatur beskyttet mod lys Reflex nr. 442023 1 enhed = 50 stk. Bloddyrkningskolbe, Anaerob, Orange/guld hætte Reflex kortbeskrivelse: BACTEC Plus Anaerobic/F Medium Reflex nr. 442022 1 enhed = 50 stk. Bloddyrkningskolbe, Svampe (mycosis), Grøn/Grå hætte Reflex kortbeskrivelse: BACTEC MYCOSIS IC/F Reflex nr. 442206 1 enhed = 50 stk. Bloddyrkningskolbe, Børnekolbe, Lyserød/sølv hætte Reflex kortbeskrivelse: BACTEC PEDS/PLUS Reflex nr. 442194 1 enhed = 50 stk. Bloddyrkningskolbe, Aerob kolbe/blå hætte Reflex kortbeskrivelse: BACT/ALERT SA Reflex nr. 259789 1 enhed = 25 eller 100 stk Bloddyrkningskolber Gælder kun Nordsjællands Hospital Psykiatrisk center - Nordsjælland Opbevaring ved stuetemperatur beskyttet mod lys

Side 13 af 142 Utensilier Anvendelse Bloddyrkningskolbe, Aerob kolbe/grøn hætte Reflex kortbeskrivelse: BACT/ALERT FA PLUS Reflex nr. 410851 1 enhed = 25 eller 100 stk. Bloddyrkningskolbe, Anaerob kolbe/mørkerød hætte Reflex kortbeskrivelse: BACT/ALERT SN Reflex nr. 259790 1 enhed = 25 eller 100 stk. Bloddyrkningskolbe, Anaerob kolbe/orange hætte Reflex kortbeskrivelse: BACT/ALERT FN PLUS Reflex nr. 410852 1 enhed = 25 eller 100 stk. Bloddyrkningskolbe, Børnekolbe/gul hætte Reflex kortbeskrivelse: BACT/ALERT PF Reflex nr. 259794 1 enhed = 100 stk. Bloddyrkningskolbe, Børnekolbe/gul hætte Reflex kortbeskrivelse: BACT/ALERT PF PLUS Reflex nr. 410853 1 enhed = 100 stk.

Side 14 af 142 Utensilier Chlamydia trachomatis/ Neisseria gonorrhoeae, Molekylærbiologisk teknik Anvendelse Prøvetagningssæt, kvinder (Cervix, urethra), mænd (urethra) og øjne Reflex kortbeskrivelse APTIMA Unisex speciment collection Reflex nr. 301041 1 pakke m/ 1 transportrør og 2 podepinde 1 enhed = 50 eller 7200 sæt Urintransportrør Urin Reflex kort beskrivelse: AP- TIMA Urine Speciment collection kit Reflex nr. 301040 1 enhed = 50 eller 1000 sæt EDTA-glas, 3ml (Lilla låg med sort ring) Supplerende blodprøve til malaria Reflex kortbeskrivelse: Vacutainer K3 EDTA, GLAS, 3 ml 13x75 mm Reflex nr. 454021 1 enhed = 100 stk.

Side 15 af 142 Utensilier Blodprøverør med gel (Rødt låg med gul ring) Anvendelse Blodprøve glas Reflex kortbeskrivelse: Blodprøverør Serum med gel 5/4 ml, snaplåg 13x75 mm Reflex nr. 454067 1 enhed = 50 eller 1.200 stk Ekspektoratdåse m/ plasticcontainer Ekspektorat Reflex nr. 40078 1 enhed = 5 stk. eswab transportmedium m/ tynd podepind blåt skruelåg Reflex kortbeskrivelse: ESWAB + flocked swab (pernasal) 482 ce Bruges fortinsvis til kighoste, men kan også bruges til andre podninger, hvor de anatomiske forhold taler for det. Reflex nr. 72796 1 enhed = 10 stk. eswab transportmedium m/ tyk podepind pink skruelåg Dyrkning og resistens samt virus PCR analyser Reflex kortbeskrivelse: ESWAB + flocked swab (reg.) 480ce Reflex nr. 72795 1 enhed = 10 stk.

Side 16 af 142 Utensilier Forsendelsesetui til 2 objektglas Anvendelse Børneorm analaftryk Malariaudstryg Reflex nr. 86.972 1 enhed = 50 stk Forsendelseshylster, sæt Svampeprøve Kun praksissektor 1 sæt= Dermapak papkuvert i plastpose og Eppendorf centrifugerør, mikrorør 1,5 ml Superspin klar Rekvireres på Klinisk Mikrobiologisk Afdeling tlf. 3868 3868 Forsendelsesrør til sprøjter Rør 50ml V-bund m/skruelåg Reflex nr. 227261 1 enhed = 20 stk. Fæcesrør komplet inkl. transportrør Reflex nr. 40080 1 enhed = 25 stk.

Side 17 af 142 Utensilier Objektglas uslebne med mat skrivefelt Anvendelse Malariapræparat m.m. Reflex nr. 1510.0020 1 enhed = 1 æske á 50 stk Objektglas, facetslebne med 2 afskårne hjørner Reflex nr. 1510.1050 1 enhed = 1 æske á 50 stk. Plastflaske, 250mL Skruelåg til 250 ml flaske Udstrygning af malariapræparat Bronkoalveolær lavage (BAL) Reflex nr. 0655.0250 Og 0655.6002 1 enhed = 1 stk. Plastflaske, 1 L Skruelåg til 1 L flaske Urin til undersøgelse for æg af Schistosoma Reflex nr. 0655.1000 Og 0655.6005 1 enhed = 10 stk. Spidsglas m/skruelåg, sterile Centrifuge Tube w/cap 11 ml Conical St Flydende prøvematerialer fx urin, spinalvæske, sekret og andre væsker Reflex nr. 10707431 1 kasse = 480 stk. Gælder Herlev og Gentofte Hospitaler Spidsglas m/skruelåg, sterile Centrifugerør spids bund *S Reflex nr. EK-1030-450 1 kasse = 75 eller 450 stk. Gælder Nordsjællands Hospitaler, Psykiatrisk center Nordsjælland

Side 18 af 142 Utensilier Anvendelse Sprøjte 3 ml Luer Lock Sprøjte u. kanyle, 3 komp. LL 2-3ml Reflex nr. 309658 1 enhed = 5 stk. Sugekateter Ideal, lige CH 06/35 cm. Reflex nr. 12038181 1 enhed = 100 stk. Sugekateter Ideal, lige CH 08/33 cm. Reflex nr. 5072181 1 enhed = 100 stk. Termobeholder Udlånes af KMA efter telefonisk aftale, tlf. 3868 3868 Trakeal sugesæt med vaccumkontrol Nasofaryngealsug for respirationsvejsvirus (børn) Transport duodenalsekret til undersøgelse for trofozoitter Reflex nr. 24004181 1 enhed = 1 stk. eller 50 stk. Vatpind, steril, hvid Reflex nr. 4622150 1 enhed = 50 pakker á 2 stk. Urinprøvesæt, steril Reflex nr. EK-1010-RGH 1 enhed = 1 stk. eller 60 stk. Prøvetagning af urin til dyrkning Urin-movetter (borsyreglas) Forsendelse af urin til dyrkning KUN praksissektor Rekvireres på Klinisk Mikrobiologisk Afdeling tlf. 3868 3868

Side 19 af 142 Efter prøvetagning Opbevaring: Indlevering: Prøverne opbevares som angivet under de enkelte prøvekategorier. Prøver til undersøgelse afleveres i de mikrobiologiske prøvemodtagelser, hvor der er opbevaringsskab (stuetemperatur) og køleskab (4-8 C) med adgang fra gangen til højre for elevatoren. Prøver fra hospitaler skal fremsendes i gule poser eller i de dertil indrettede grå kasser. Når prøverne ankommer til KMA sættes de på hylder i køleskabet. Bloddyrkningskolber sættes i opbevaringsskabet (stuetemperatur), hvor eventuelle rekvisitionerne også placeres. Akutte prøver: Akutte prøver kræver forudgående aftale med vagthavende mikrobiolog. Rekvirerende læge konfererer med vagthavende mikrobiolog om prøvebehandling, transportmåde, afleveringssted og tidspunkt. NB! Når akutte prøver fremsendes med taxa, anbringes prøve og Rekvisition, i en lukket kuvert. Mikrobiologiske prøvemodtagelser: Herlev Hospital: Kl. 08.00-22.00: KMA, opgang 59, etage 05 (gul trappe). Gentofte Hospital: Klinisk biokemisk afdeling, (Centrallaboratorium) opgang 20. Nordsjællands Hospital Hillerød, Klinisk biokemisk afdeling Dyrehavevej 29, 3400 Hillerød Nordsjællands Hospital Frederikssund, Klinisk biokemisk afdeling Frederikssundsvej 30, 3600 Frederikssund Sundhedshuset i Helsingør Murergade 5, 3000 Helsingør Center for Handicappede, Vangedehuse/Lille Mosegaard: Prøverne indleveres i Prøvemodtagelsen, Gentofte Hospital. Steno Diabetes Center samt diverse plejehjem: Prøverne indleveres i Prøvemodtagelsen på KMA, Herlev Hospital. Prøver fra praksis Planlægningsområde midt:

Side 20 af 142 Prøver sendes med posten i frigjorte kuverter. De kan også indleveres direkte i den mikrobiologiske prøvemodtagelse på Herlev Hospital. Efter aftale, kan patienten aflevere urin og fæcesprøver direkte i KMAs prøvemodtagelse. Prøver fra praksis Planlægningsområde nord: Prøver bliver afhentet hos de praktiserende læger og transporteres med intern hospitalstransport. Transport: Svartyper: Prøver transporteres fra hospitalerne i kasser ved henholdsvis 4 C og stuetemperatur som anført under de enkelte prøvekategorier. Duodenalsekret til undersøgelse for trofozoitter sendes i særlig termobeholder, der udlånes af KMA. Telefonisk svar: Svar afgives telefonisk ved positivt fund i bloddyrkning, spinalvæske, effusionsvæsker og malariaudstrygninger samt prøver mærket akut eller telefonsvar fra rekvirerende afdeling. Såfremt der ønskes telefonsvar ved andre prøver må dette anføres tydeligt på rekvisitionssedlen i den dertil beregnede rubrik: Hastesvar. Foreløbigt svar: For mange prøvekategoriers vedkommende afgives efter ca. et døgn foreløbigt svar elektronisk via WWBakt. Endeligt svar: Fremkommer, når identifikation og følsomhedsbestemmelse er afsluttet, sædvanligvis efter 3-5 dage, se under den enkelte prøvekategori. Svarene indklæbes i journalen taglagt på de røde støttekort til mikrobiologiske svar. Supplerende svar: I visse tilfælde vil det være nødvendigt at bruge længere tid til identifikation eller til supplerende typebestemmelser af de fundne bakterier. Endvidere kan udvidet resistensbestemmelse komme på tale. I disse tilfælde vil der blive sendt et supplerende svar til erstatning for det tidligere udsendte slutsvar. Afsendelse af svar: Svar sendes dagligt og udbringes til afdelingerne elektronisk. Svar til praksissektoren sendes dagligt elektronisk eller med postvæsenet.

Side 21 af 142 Tolkning af svar: Den mikrobiologiske undersøgelse omfatter almindeligvis: Mikroskopi Bedømmelse af mængden af de dyrkede organismer Identifikation af disse, hvor det er klinisk relevant Følsomhed for antibiotika (resistensmønster) Mikroskopi kan give oplysning om prøvematerialets egnethed. Visse bakterier og svampe kan med stor sikkerhed identificeres alene på udseendet ved direkte mikroskopi evt. suppleret med en hurtigtest, således at afdelingen kan få et foreløbigt telefonisk svar. Da det ikke er muligt at foretage direkte mikroskopi af materialet fra en podepind, vil det altid være bedre at fremsende selve prøvematerialet som anført under de enkelte prøvekategorier. Mængden kan betegnes med et antal bakterier pr. ml, således som det rutinemæssigt sker ved kvantitativ dyrkning af urin og i visse tilfælde ved duodenal- eller tarmsekret. I de fleste tilfælde anvendes en grov kvantitativ bedømmelse af bakteriemængden efter følgende retningslinjer: Talrige: En del: Få: svarer til >10 5 bakterier pr. ml svarer til 10 3-10 5 bakterier pr. ml svarer til <10 3 bakterier pr. ml De anførte kvantitative forhold kan kun tillægges betydning, såfremt der ikke er sket en opformering af bakterierne efter prøvetagningen. Dette forudsætter korrekt opbevaring og transport. Ved dyrkning fra i.v.kateterspids vil der blive angivet et absolut antal kolonier på basis af en semikvantitativ teknik. Positive blod- og fæcesdyrkninger kvantiteres ikke. Identifikation og resistensbestemmelse Potentielt patogene bakterier og renkulturer identificeres til speciesniveau og der laves relevant resistensbestemmelse. Ved fund, der skønnes at være forurening eller ikke-klinisk relevante, foretages kun identifikation til genus niveau, og besvarelsen sker uden resistensbestemmelse. Angivelse af følsomhed for en funden bakterie er ikke nødvendigvis ensbetydende med, at antibiotikabehandling tilrådes, eller er effektiv.

Følsomshedsbestemmelse in vitro: Side 22 af 142 S I R (Sensitiv) betyder, at behandling er mulig med normal dosering. (Intermediær) betyder, at behandling er mulig, hvis dosis kan øges udover normal dosering (relevant for penicilliner og cefalosporiner) eller hvis fysiologisk koncentrering kan forventes i fokus (fx urinvejene). (Resistent) betyder, at behandling ikke er mulig. Supplerende undersøgelser: Prøvematerialet opbevares i 7 døgn, bortset fra positive bloddyrkninger og prøver fra normalt sterile områder som opbevares i 14 dage. Det vil således være muligt ved henvendelse til KMA at få foretaget supplerende identifikation og følsomhedsbestemmelse.

Undersøgelseskategorier Prøvevejledning Side 23 af 142 Abscesmateriale, aspireret pus Princip: Indikation: Prøvemateriale: Mikroskopi, dyrkning, identifikation og følsomhedsbestemmelse af bakterier og svampe. Dybe abscesser på hals, i organer, peritoneum og pelvis (fossa Douglasi). Denne information bedes noteret i de kliniske oplysninger, også hvis det drejer sig om ultravejledt punktur. Abscesmateriale udhentet ved aspiration eller ultralydsvejledt punktur. Opus/Webreq: Undersøgelse: dyrkning og resistens Materiale: Absces aspirat. Lokalisation: angives i fri tekst Tidspunkt for prøvetagning: Utensilier: Før antibiotisk behandling startes. Sterilt spidsglas med skruelåg. Prøvetagning: Prøven udtages ved perkutan punktur efter desinfektion. Desinfektion udføres med 2 x jodsprit 2,5 % SAD liniment, eller hos patienter med jodallergi 2 x klorhexidinsprit 0,5 % i alkohol 70 %. Desinfektionsmidlerne skal tørre mellem påføringerne og inden punkturen. Efter desinfektion af indstiksstedet må dette ikke berøres, med mindre man har sterile handsker på. For at undgå jodforbrænding, aftørres jodet med sprit efter prøvetagningen. Prøvemængde: Se under prøvetagning, spidsglasset må kun fyldes halvt. Opbevaring: Forsendelse: Prøvemateriale i spidsglas opbevares i køleskab (4-8 C). Spidsglas sendes i kølekasse. Svarafgivelse: Såfremt der ved mikroskopi påvises bakterier og svampe, vil dette fremgå af det foreløbige elektroniske svar eller eventuelt blive meddelt telefonisk til en autoriseret patientansvarlig medarbejder. Foreløbigt dyrkningssvar afgives 1 døgn efter modtagelse af prøven. Slutsvar afgives efter 2-5 døgn. Bemærkninger: Drænprøver giver sjældent brugbare oplysninger og bør undgås, hvis der kan skaffes materiale fra den inficerede kavitet.

Adenovirus antistof, (se Luftvejspanel). Side 24 af 142 Adenovirus fæces, (se diarreudredning). Adenovirus øje Princip: Indikation: Prøvemateriale: Påvisning af adenovirus DNA med PCR teknik. Mistanke om akut infektion med adenovirus ved conjunktivitis/keratitis. Pus eller podning fra conjuktiva Opus/Webreq: Undersøgelse: adenovirus DNA Materiale: slimhindepodning Lokalisation: øje Tidspunkt for prøvetagning: Så tidligt som muligt i sygdomsforløbet. Utensilier: eswab podepind i tilhørende transportmedie. Pus eller væske i sterilt spidglas. Prøvetagning: Det nedre øjenlåg trækkes ned, og der podes fra konjuntivalslimhinden. Prøvemængde: Hvad der er muligt. Opbevaring: Forsendelse: Prøvemateriale opbevares i køleskab (4-8 C). Sendes i kølekasse. Svarafgivelse: 1-2 hverdage efter modtagelsen. Positivt svar angives som Adenovirus DNA påvist Antituberkuløse midler, (se Serumkoncentration af antituberkuløse midler).

Side 25 af 142 Arena (Lassa, Junin) virus PCR og antistof IgM, IgG Der skelnes mellem mistanke om akut infektion og serologi til afklaring af overstået infektion Opus/Webreq: Kan kun bestilles på hospital. Undersøgelse: Arena virus. Materiale: akut infektion: blod tilsat SSIs blå inaktiverinsmedie, kontakt vagthavende SSI tlf 3268 3460 eller 4033 6379. Serologi: serum koagel blod eller blod i EDTA glas Aspergillus galactomanan antigen, (se Rigshospitalets prøvevejledning) Opus/Webreq: Kan kun bestilles på hospital. Undersøgelse: Aspergilus galactomanan antigen, Materiale: BAL, minibal, Serum eller Koagelblod eller Spinalvæske. Aspergillus antistof Opus/Webreq: Kan kun bestilles på hospital. Undersøgelse: aspergillus antistof Materiale: serum eller koagelblod Pus, sårsekret, sekret podning Princip: Indikation: Dyrkning, identifikation og følsomhedsbestemmelse af potentielt patogene bakterier og svampe. Akut inflammerende traumatiske sår. Cellulit, fasciit. Inflammeret bidsår (hund, kat, hest, menneske) og brandsår.

Side 26 af 142 Postoperativ sårinfektion. Kroniske sår (diabetiske, decubitus, ulcus cruris) med inflammation af subkutant væv, fascie, muskel eller knogle. Prøvemateriale: Tidspunkt for prøvetagning: Utensilier: Pus, sårsekret eller vævsvæske. ESwab anvendes kun, hvor det ikke er muligt at fremsende aspireret materiale eller biopsier. Før antibiotisk behandling startes. Spidsglas med skruelåg, sterilt. Sprøjte Luer Lock til aspiration af inficeret materiale. Forsendelsesrør til sprøjte. ESwab. Prøvetagning: Ved større pusmængder aspireres materialet i sprøjte og overføres til sterilt spidsglas. Ved mindre mængder kan materialet forblive i den sprøjte, der anvendtes til aspiration. Sprøjten lukkes med steril lukkeprop og fremsendes i forsendelsesrør. Ved bløddelsinfektion uden pussekretion (cellulit og lign.) kan prøvemateriale opnås på følgende måde: Der udføres huddesinfektion med 2 x jodsprit 2,5 % SAD liniment, eller hos patienter med jodallergi 2 x klorhexidinsprit 0,5 % i alkohol 70 %. Desinfektionsmidlerne skal tørre mellem påføringerne og inden punkturen. Efter desinfektion af indstiksstedet må dette ikke berøres, med mindre man har sterile handsker på. For at undgå jodforbrænding, aftørres jodet med sprit efter prøvetagningen. En sprøjte med kanyle indføres i det inficerede område og 1 ml sterilt saltvand injiceres, hvorefter der aspireres så meget som muligt. Den aspirerede væske sendes i sprøjten som beskrevet ovenfor. Prøvemængde: Så meget materiale som muligt, glasset må dog kun fyldes halvt. Opbevaring: Forsendelse: I køleskab (4-8 o C). Så vidt muligt i kølekasse. Podninger i eswab kan sendes med postvæsenet efter emballering i forsendelsesrør. Svarafgivelse: Foreløbigt svar afgives 1 døgn efter modtagelse af prøven. Slutsvar afgives efter 2-5 døgn. Prøver i relation til dyrebid: Op til 7 døgn. Tolkning: Før antibiotisk behandling startes er det nødvendigt at sammenholde klinikken med de bakterier og svampe, som er dyrket fra den pågældende region. Ved dyrebid bør dyrearten angives præcist på rekvisitionssedlen,

Side 27 af 142 idet bidsår fra forskellige dyr er associeret med specielle bakteriearter. Bemærkninger: Ved kroniske sår (decubitus, ulcus cruris) vil overfladepodninger sjældent give relevante mikrobiologiske oplysninger, hvorfor det foreslås at tage stansebiopsier fra sårranden efter rensning af såret. Biopsier fremsendes i spidsglas med et par dråber sterilt vand. AST (anti-streptolysin O) Princip: Indikation: Prøvemateriale: Påvisning af antistoffer mod streptolysin O fra Streptococcus pyogenes (hæmolytiske streptokokker gruppe A). Undersøgelsen kan ikke anvendes til diagnostik af akut streptokokinfektion. Anvendes kun ved klinisk mistanke om akut glomerulonefrit og febris rheumatica. Serum eller koagelblod. Opus/Webreq: Kan kun bestilles på hospital Undersøgelse: AST (anti-streptolysin O) Materiale: serum eller koagelblod Tidspunkt for prøvetagning: Utensilier: Så tidligt som muligt i sygdomsforløbet og mindst 1 gang senere, fx efter 2-4 uger. Prøven bør så vidt muligt ikke tages umiddelbart efter indtagelse af et fedtrigt måltid. Tørglas. Prøvetagning: Venepunktur. Prøvemængde: 4-5 ml blod (2 ml serum). I særlige tilfælde, fx hos børn, kan undersøgelsen som regel gennemføres på ned til 0,5 ml blod eller 0,2 ml serum. Opbevaring: Forsendelse: I køleskab (4-8 C). Evt. i kølekasse. Ved forsendelse med postvæsenet anvendes forsendelseshylster (se side:).

Side 28 af 142 Svarafgivelse: Der må påregnes en svartid på 1-3 hverdage efter prøvens modtagelse i KMA. Tolkning: Ved febris rheumatica og akut glomerulonefrit er AST oftest kraftigt forhøjet (titer >1000). Bemærkninger: AST hører ikke hjemme i undersøgelsesrepertoiret ved kronisk artrit eller degenerative ledsygdomme. AST bør således ikke rekvireres samtidig med undersøgelse for rheumafaktorer. AST er uden diagnostisk værdi ved streptokokbetingede svælginfektioner, inkl. scarlatina. Bartonella henselae (cat scratch disease) og Bartonella Quintana (trench fever) antistof Opus/Webreq: Kan kun bestilles på hospital. Under undersøgelse: vælg Bartonelle antistof. Bartonella henselae (cat scratch disease) og Bartonella Quintana (trench fever) PCR Opus/Webreq: Kan kun bestilles på hospital. Undersøgelse: Bartonelle DNA/RNA. Materiale: Biopsimateriale: Billharzia antistoffer, (se Schistosomiasis (Bilharziose), antistof). Billharzia Mikroskopi, (se Schistosoma (bilharziose) mikroskopi). Biopsi materiale, (se Væv, knogle og vævs-biopsier).

Side 29 af 142 Bloddyrkning Princip: Indikation: Prøvemateriale: Blod taget ved venepunktur eller fra kateter i bloddyrkningskolber med efterfølgende dyrkning, identifikation og resistensbestemmelse af isolerede bakterier og svampe. Feber eller hypotermi. Cirkulatorisk kollaps med eller uden temperaturforhøjelse. Ældre patienter med sløret sensorium, takypnø, påvirket almentilstand med eller uden feber. Lokaliserede infektion, hvor bloddyrkning kan give en ætiologisk diagnose (f.eks. pneumoni, meningit, pyelonefrit, absces, akut osteomyelit, epiglottit og inficerede i.v.katetre). Veneblod (eventuelt arterieblod), optimalt tages i alt 40 ml. Opus/Webreg: Hillerød/ Frederikssund Undersøgelse: Dyrkning og resistens Materiale: (antal bloddyrkningskolber vælges nederst til højre): Blod fra arterie (bloddyrkningskolbe). Blod fra kateter (bloddyrkningskolbe) lokalisation vælges. Blod fra navlesnor (bloddyrkningskolbe). Blod fra vene (bloddyrkningskolbe). Herlev/ Gentofte Tidspunkt for prøvetagning: Utensilier: Undersøgelse: Dyrkning og resistens Materiale: (antal bloddyrkningskolber vælges nederst til højre): Enten som pakke a 4 kolber (vene/arterie/kateter) eller som enkelt kolber som nedenfor. Blod fra arterie (bloddyrkningskolbe). Blod fra kateter (bloddyrkningskolbe) lokalisation vælges. Blod fra navlesnor (bloddyrkningskolbe). Blod fra perifer vene (bloddyrkningskolbe). Så tidligt i infektionsforløbet som muligt og inden start af antibiotikabehandling. Hvis patienten alligevel får antibiotika, skal bloddyrkningen helst tages lige før antibiotikaindgift, hvor koncentrationen i blodet er lavest. Bloddyrkningskolber: BACTEC aerob, BACTEC anaerob og evt. BACTEC mycosis (svampe). Til mindre børn bruges BACTEC børnekolbe.

Side 30 af 142 BACTEC kan anvendes både til lukket blodtagningssystem og til prøvetagning med sprøjte. Opbevares ved stuetemperatur beskyttet mod lys. Udløbsdato er påtrykt kolberne. Brug aldrig et uklart substrat, da udfældninger kan skyldes kontaminering. Prøvetagning: Omhyggelig aseptisk teknik er helt afgørende. Der udføres huddesinfektion med 2 x klorhexidinsprit 0,5 % i alkohol 70 %. Desinfektionsmidlerne skal tørre mellem påføringerne og inden punkturen. Efter desinfektion af indstiksstedet må dette ikke berøres, med mindre man har sterile handsker på. 40-50 ml blod fordeles på 2 aerobe og 2 anaerobe, og evt. 1 mycosis (svampekolbe) bloddyrkningskolber. Desinficer bloddyrkningskolbernes membran med swabs eller hospitalssprit. Membranerne på kolberne skal desinficeres med 70 % sprit 2 gange, inden blodet injiceres. Hele blodportionen kan tages samtidig, bortset fra de tilfælde hvor der er mistanke om endokardit, og man ønsker at dokumentere en kontinuerlig bakteriæmi. I disse tilfælde tages flere tidsmæssigt uafhængige bloddyrkningssæt fra forskellige indstikssteder. Dyrkning af arterieblod giver ikke bedre resultater end veneblod. Dyrkning af knoglemarv kan overvejes i tilfælde, hvor brucellose eller tularæmi mistænkes, og bloddyrkning har været negativ. Hver kolbe fyldes med 8-10 ml blod, dette tager ved frit indløb ca. ½ minut. Det er vigtigt, at kolben ikke overfyldes. Hos nyfødte og små børn anvendes børnekolbe, som efter skøn trækkes tilbage efter indløb af 1-2 ml. Dette tager ved frit indløb 5-10 sekunder. Bloddyrkning taget gennem intravaskulært kateter må generelt frarådes. Såfremt der ikke er andre muligheder, gøres følgende: Kateteret tømmes for indhold ved hjælp af en 10 ml sprøjte, inden blodet udtages til dyrkning. Der skal udfyldes én rekvisition pr. kolbe. Husk at afkrydse den relevante rubrik for blodtagningen. Prøvemængde: 8-10 ml i hver bloddyrkningskolbe, 1-2 ml i børnekolbe. Rekvisition: Opbevaring: Forsendelse: Ved mistanke om infektion med langsomt voksende bakterier som fx Brucella, Bartonella, Fransicella, Actinomyces samt i visse tilfælde af endokardit, er længere inkubationstid nødvendig. Det er derfor vigtigt, at rekvisitionen udfyldes omhyggeligt med kliniske oplysninger, mulig eksposition og rejseanamnese. Efter prøvetagning skal kolberne opbevares ved stuetemperatur på de respektive hospitalers mikrobiologiske prøvemodtagelser indtil afsendelsen til KMA. Prøverne bringes til KMA alle ugens dage. Akut forsendelse tjener intet formål.

Side 31 af 142 Svarafgivelse: Bloddyrkningskolberne aflæses automatisk i 5 døgn. Ved positivt fund afgives hurtigst muligt telefonisk svar til en autoriseret patientansvarlig medarbejder. Foreløbigt negativt svar afgives et døgn efter modtagelse af prøven, og slutsvar afgives efter 5 døgn. Tolkning: Bloddyrkninger kan forurenes fra patientens hud, ved prøvetagningsproceduren samt under arbejdet i laboratoriet. Et positivt dyrkningsresultat vil altid blive telefoneret til afdelingen af vagthavende mikrobiolog, således at der er mulighed for at diskutere relevansen af det pågældende fund og evt. behandling. Bemærkninger: Ved påvist bakteriæmi må infektionsfokus så vidt muligt identificeres med eventuel dyrkning fra dette. Temperaturforhøjelse alene er ikke nødvendigvis indikation for bloddyrkning. Bloddyrkning er dog indiceret hos nyindlagte patienter med temperatur >38,5 C og hos patienter med temperaturstigning i det postoperative forløb. BK polyomavirus DNA/RNA Opus/Webreq: Kan kun bestilles på hospital. Undersøgelse: BK polyomavirus DNA/RNA. Materiale: Blod(EDTA-glas) eller urin. Bordetella pertussis IgG antistof, (se kighoste). Bordetella pertussis/parapertussis DNA/RNA, (se kighoste). Borrelia burgdorferi antistoffer Princip: Indikation: Påvisning af IgM og IgG antistoffer mod B. burgdorferi i blod og spinalvæske ved hjælp af kemiluminiscens assay (CLIA) teknik (i spinalvæske dog hhv. -capture og -capture ELISA). Antistoffer i blod undersøges ved mistanke om B. burgdorferi infektion i 2. stadium (multiple erythema migrans, Borrelia lymfocytom, neuroborreliose, Borrelia myocarditis eller Borrelia artritis) eller 3. stadium (acrodermatitis chronica atrophicans, kronisk neuroborreliose, kronisk arthritis). Antistoffer i blod samt spinalvæske undersøges ved mistanke om neuroborreliose (intratekal test).

Side 32 af 142 Det frarådes at foretage serologisk diagnostik ved typisk erythema migrans i 1. stadium, da undersøgelsen kun er positiv i ca. halvdelen af tilfældene. Prøvemateriale: Blod uden tilsætning. Til intratekal antistofsyntese (neuroborreliose) indsendes både blod og spinalvæske, udtaget på samme tidspunkt. Sendes samlet på samme rekvisition. Opus/Webreq: Undersøgelse: Borrelia antistof, Materiale: serum eller koagelblod. Eller Undersøgelse: Borrelia antistof(intratekal test), (kan kun bestilles på hospital) Materiale: pakke: Koblet spinalvæske og serum Tidspunkt for prøvetagning: Utensilier: Prøvetagning: Når indikationen er stillet, evt. opfulgt af nye prøver med 2-4 ugers mellemrum til diagnostisk afklaring er nået. Tørglas, til spinalvæske sterilt spidsglas. Venepunktur. Lumbalpunktur. Prøvemængde: 4-5 ml blod (2 ml serum). Minimum 0,6 ml blod (0,3 ml serum). Mindst 2,5 ml spinalvæske. Opbevaring: Forsendelse: I køleskab (4-8 C). Evt. i kølekasse. Ved forsendelse med postvæsenet anvendes forsendelseshylster. Svarafgivelse: 1-3 hverdage efter prøvens modtagelse i KMA. Intratekal test udføres 3 gange ugentlig. Svar angives for antistofundersøgelse af blod som negativ eller positiv for Borrelia antistoffer. Undertiden vil resultatet være en grænseværdi, som kan følges op med en ny prøve efter ca. 2 uger. Svar på undersøgelse for intratekal antistofsyntese angives som en spinalvæske/serum indeks for hhv. IgM og IgG antistoffer mod Borrelia. Positivt referenceindeks er 0,3 100. Tolkning: IgM undersøgelsen kan være negativ indtil 2-3 mdr. efter begyndelsen af 2. stadium. Udvikling af IgG antistoffer kan forsinkes af antibiotisk behandling. Efter behandling aftager niveauet af IgM antistoffer, som dog kan påvises i op til et år.

Side 33 af 142 Interval for positiv intratekaltest er index på >0,3. Positiv intratekaltest er diagnostisk for neuroborreliose, uanset om index for IgM eller IgG er forhøjet. Ved neuroborreliose er intratekaltesten positiv i løbet af 2-6 uger, dvs. undersøgelsen kan være negativ i første sygdomsuge. Intratekal IgG syntese kan fortsætte i årevis efter endt behandling. Intratekal IgM syntese ophører oftest efter ca. 6 mdr. For at stille diagnosen Borrelia artrit, som herhjemme er sjælden, kræves positiv IgG. Bemærkninger: Facialisparese hos børn skyldes borreliainfektion i 30-40 % af tilfældene. De anvendte testmetoder måler antistoffer mod de tre B. burgdorferi undertyper som forårsager borreliose i Europa. Falsk positivt IgM resultat i blod kan ses ved mononucleose og autoimmunsygdomme. Påvisning af IgG antistoffer er ikke nødvendigvis et udtryk for sygdomsaktivitet, men kan være et udtryk for overstået sygdom. Syfilis kan give positive fund. Neuroborreliose er anmeldelsespligtig. Bronkoalveolær lavage (BAL) Princip: Sekret ophentet ved skylning af et lungeafsnit i forbindelse med fiberbronkoskopi. Standardundersøgelsen omfatter: Undersøgelse af BAL vælges som en pakke med mulighed for tilvalg af undersøgelser i en supplerende BAL pakke. I standardpakken kan vælges: Indikation: 1. Mikroskopi, dyrkning og resistens som omfatter undersøgelse for Nocardia og Actinomyces. 2. Atypisk pneumoni (Legionella, Mycoplasma og Chlamydophila pneumoniae) 3. Mycobacterium (TB) DNA og dyrkning I den supplerende BAL pakke kan tilvælges: 1. Cytomegalovirus (CMV) DNA 2. Herpes simplex virus (HSV) DNA 3. Pneumocystis jiroveci (tidl. P. carinii) DNA 4. Influenzavirus (A+B) virus + Respiratorisk Syncytialvirus (RSV) RNA 5. Varicella zoster virus (VZV) DNA 6. Aspergillus galaktomannan antigen Patienter med klinisk/røntgenologisk pneumoni, som ikke ekspektorerer, eller hvor en sandsynlig diagnose ikke er opnået med undersøgelse af ekspektorat, trakeal- eller bronkialsug.