Biofysik forelæsning 8 Kapitel 1 (8)

Relaterede dokumenter
Forklaring. Størrelsesforhold i biologien DIFFUSION. Biofysik forelæsning 8 Kapitel 1 (8) Mindste organisme: 0.3 :m = m (mycoplasma)

Forklaring. Størrelsesforhold i biologien DIFFUSION. Veterinær biofysik kapitel 8 Forelæsning 1. Mindste organisme: 0.3 :m = m (mycoplasma)

Elektrokemisk potential, membranpotential og. Donnanligevægt

Liste A 1 Na + -glucosetransportør 2 Glucosetransportør 3 Na + /H + exchanger 4 Na +,K + ATPase 5 Acetylcholinreceptoren i den neuromuskulære junction

Biofysik ( ) Eksamen 6. juni timers skriftlig prøve. Alle hjælpemidler er tilladt

Skriftlig eksamen i Kemi F2 (Fysisk kemi)

Anvendt BioKemi: MM4. Anvendt BioKemi: Struktur. 1) MM4- Opsummering. Små molekyler: fedtsyre. Store molekyler: fedt, lipids, lipoproteiner

Skriftlig eksamen i Kemi F2 (Fysisk kemi)

Skriftlig eksamen i Kemi F2 (Fysisk kemi)

Anvendt BioKemi: Struktur. Anvendt BioKemi: MM3. 1) MM3- Opsummering. Forholdet mellem Gibbs fri energi og equilibrium (ligevægt) konstant K

Teoretiske Øvelser Mandag den 28. september 2009

m: masse i masseprocent : indhold i volumenprocent : indhold

Teknikken er egentlig meget simpel og ganske godt illustreret på animationen shell 4-5.

Kinetisk Molekylteori

Danmarks Tekniske Universitet

Termodynamik. Esben Mølgaard. 5. april N! (N t)!t! Når to systemer sættes sammen bliver fordelingsfunktionen for det samlede system

Diffusionsbegrænset reaktionskinetik

Lysspredning for gymnasiet

Termodynamikkens første hovedsætning

Undervisningsplan FORÅR februar Introduktion til faget Hana Malá februar Hjernens opbygning og funktion Hana Malá

Første og anden hovedsætning kombineret

Almen cellebiologi Membrantransport

Tilstandssummen. Ifølge udtryk (4.28) kan MB-fordelingen skrives , (5.1) og da = N, (5.2) . (5.3) Indføres tilstandssummen 1 , (5.

Nanotermodynamik formelsamling

Elektromagnetisme 7 Side 1 af 12 Elektrisk strøm. Elektrisk strøm

Test Canvas: Eksamen i BMB502 Januar 2012

Brugsvejledning for dialyseslange

Densitet (også kendt som massefylde og vægtfylde) hvor

Aalborg Universitet. Skriftlig eksamen i Grundlæggende Mekanik og Termodynamik. Tirsdag d. 11. august 2015 kl

VERTIKAL TRANSPORT MODUL OG NEDBRYDNING I JAGG 2.0 ET BIDRAG TIL FORSTÅELSE AF DEN KONCEPTUELLE MODEL. Jacqueline Anne Falkenberg NIRAS A/S

10. Mandag Nervesystemet del 1

Aalborg Universitet. Skriftlig eksamen i Grundlæggende Mekanik og Termodynamik. Fredag d. 2. juni 2017 kl

Aalborg Universitet. Skriftlig eksamen i Grundlæggende Mekanik og Termodynamik. Torsdag d. 8. august 2013 kl

Spontan biologisk mønsterdannelse på basis af reaktions-diffusions mekanismer: Turing strukturer

Folkeskolens afgangsprøve Maj-juni 2006 Fysik / kemi - Facitliste

Fremstilling af værktøjskomponenter Sænkgnist. AMU nr

Kolde atomare gasser Skræddersyet kvantemekanik. Georg M. Bruun Fysiklærerdag 2011

Aalborg Universitet. Skriftlig eksamen i Grundlæggende Mekanik og Termodynamik. Torsdag d. 9. juni 2011 kl

DOCUMENTA BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA

Statistisk mekanik 2 Side 1 af 10 Entropi, Helmholtz- og Gibbs-funktionen og enthalpi. Entropi

HVOR FORSVINDER RØGEN HEN?

HVOR FORSVINDER RØGEN HEN?

Elektromagnetisme 7 Side 1 af 12 Elektrisk strøm. Elektrisk strøm

Elektromagnetisme 13 Side 1 af 8 Maxwells ligninger. Forskydningsstrømme I S 1

Kære selvstuderende i: Fysik A. Herunder ser du det materiale, der udgør dit eksaminationsgrundlag.

Skriftlig eksamen i Statistisk Mekanik den fra 9.00 til Alle hjælpemidler er tilladte. Undtaget er dog net-opkoblede computere.

Elektromagnetisme 13 Side 1 af 8 Maxwells ligninger. Forskydningsstrømme I S 1

Skriftlig eksamen i Kemi F2 (Fysisk kemi)

Den klassiske oscillatormodel

Naturvidenskab og mysticisme er det ikke modsætninger?

Noter til kemi A-niveau

Danmarks Tekniske Universitet

Anvendt BioKemi: MM2. Anvendt BioKemi: Struktur. 1) MM2- Opsummering. Aminosyrer og proteiner som buffere

Proximal reabsorption

Skriftlig eksamen i Almen Kemi I

Eksamen i fysik 2016

Statistisk mekanik 2 Side 1 af 10 Entropi, Helmholtz- og Gibbs-funktionen og enthalpi. Entropi

Homeostase. Homeostase, organismens evne til at opretholde et konstant indre miljø, er et centralt begreb i fysiologien.

Undervisningsbeskrivelse

Danmarks Tekniske Universitet

U = φ. R = ρ l A. Figur 1 Sammenhængen mellem potential, φ og spændingsfald, U: U = φ = φ 1 φ 2.

Program. Flersidet variansanalyse og hierarkiske modeller. Eksempel: iltoptag for krabber. Eksempel: iltoptag for krabber.

Menneskets væskefaser

ELLÆRENS KERNE- BEGREBER (DC) Hvad er elektrisk: Ladning Strømstyrke Spændingsforskel Resistans Energi og effekt

DesignMat Lineære differentialligninger I

Almen cellebiologi Membrantransport

Teoretiske Øvelser Mandag den 13. september 2010

Kvantecomputing. Maj, Klaus Mølmer

Undervisningsbeskrivelse

Statistisk mekanik 10 Side 1 af 7 Sortlegemestråling og paramagnetisme. Sortlegemestråling

Bestemmelse af smeltevarme for et N-partikelsystem

Fysikken bag hverdagens materialer.

Atomare kvantegasser. Michael Budde. Institut for Fysik og Astronomi og QUANTOP: Danmarks Grundforskningsfonds Center for Kvanteoptik

Energi, Enzymer & enzymkinetik.metabolisme

Måling af ledningsevne: Hvordan og hvad skal man være opmærksom på?

Undervisningsbeskrivelse

Atomer er betegnelsen for de kemisk mindste dele af grundstofferne.

Til denne udfordring kan du eksperimentere med forsøg 4.2 i kemilokalet. Forsøg 4.2 handler om kuliltens påvirkning af kroppens blod.

Dansk Fysikolympiade 2015 Udtagelsesprøve søndag den 19. april Teoretisk prøve. Prøvetid: 3 timer

Ordliste. Teknisk håndbog om magnetfelter og elektriske felter

Aalborg Universitet. Skriftlig eksamen i Grundlæggende Mekanik og Termodynamik. Torsdag d. 23. august 2012 kl

13 cm. Tværsnit af kernens ben: 30 mm 30 mm

Grundstoffer og det periodiske system

Moderne Fysik 1 Side 1 af 7 Speciel Relativitetsteori

Rektangulær potentialbarriere

MODUL 5 ELLÆRE: INTRONOTE. 1 Basisbegreber

Indeks. Eksperimenter og opskrifter. Eksperimenter og opskrifter

Aalborg Universitet. Skriftlig eksamen i Grundlæggende Mekanik og Termodynamik. Tirsdag d. 27. maj 2014 kl

Lys på (kvante-)spring: fra paradox til præcision

Spørgsmål 1 Kemisk ligevægt

Årsplan Skoleåret 2012/13 Fysik/Kemi

Undervisningsbeskrivelse for STX 2m Kemi B

May the force be with you

Transkript:

Størrelsesforhold i biologien Forklaring Mindste organisme:.3 :m = 3-7 m (mycoplasma) Største organisme: 3 m (blåhval) Største Organismer : Mindste = Enkelte celler:.3 :m - 3 :m Største Celler : Mindste = Kapillærdiameter: 6 :m 8 (alle dyr) Alveolediameter: 5-3 :m (alle dyr) IFFUSION et fænomen, at partikler i opløsning (i middel ) bevæger sig bort fra områder med høj koncentration over til områder med lav koncentration Systemet søger mod tilstande med størst mulig sandsynlighed Koncentrationsforskelle udjævnes Mekanisme Varmebevægelse & Statistik Membraner Problem: Hvordan kommer stoffer igennem en membran? Brownsk bevægelse Pollenkorn flytter sig tilfældigt (Robert Brown 827) Membranproteiner Årsag: Sammenstød med væskemolekyler i varmebevægelse Opløsningsmidlets molekylære varmebevægelse er årsag til diffusion Transportkanal

iffusion og brownsk bevægelse iffusion som random walk Eksperimentelle fakta: Et simuleringsprogram: Store partikler: Langsom diffusion Små partiker: Hurtig diffusion Forklaring: bevarelse af bevægelsesmængde E kin = ½mv 2 T Lav temperatur: Langsom diffusion Høj temperatur: Hurtig diffusion Forklaring: E kin T η falder med stigende temperatur Vælg en fri middelvejlængde L Vælg antallet af partikler n Gentag dette om og om igen: For hver partikel gøres dette: Vælg et tilf. tal r mellem og 2L Vælg et tilf. tal Θ mellem og 36 Flyt partiklen stykket r i retningen Θ Høj viskositet: Lav viskositet: Langsom diffusion Hurtig diffusion Forklaring: Friktionen η iffusion som random walk iffusionskoefficient Random walk med N skridt af længde L: R 2 N = 2 L N Antallet af stød = N = k t Antallet af stød pr. sekund R ( t) = ( k L ) t 2 iffusionskoefficienten: = k L L kaldes den fri middelvejlængde N skridt af længde L: R = N L N dim.: 2 dim.: 3 dim.: R = x = 2t 2 R = x + y = 4t R = x + y + z = 6t iffusionskoefficienten 2

iffusionskoefficienter i vand iffusion over membraner Stof Tobaksmosaik virus Human serum albumin Inulin Sucrose Glycin Oxygen - m2 s-.3.6.5 5.2. 8. Molekylvægt g mol - 4 69 55 342 75 32 Begreber Flux Kemisk potentiale Elektrokemisk potentiale Elektrokemisk ligevægt Membranpermeabilitet Modeller for membranpermeabilitet iffusion af ioner Influx og efflux Større molekylvægt Mindre diffusionskoefficient Flux Ficks. lov dn J = dt A C C2 J = x Fluxen J har enheden: Partikelfluxen J = Antal m -3 (Antal) stk. m s m s (Antal) m 3 eller eller (Antal) mol (Antal) kg m s m s eller Antal m-2 s- stk mol kg m 3 stk mol kg m 3 - m s Partikelfluxen J og koncentrationen C har sammenhørende enheder 3

iffusion: Mekanistisk beskrivelse Molekylerne flytter sig på grund af en fiktiv diffusionskraft F d : Sml. J = B C F d Bevægeligheden (mobiliteten) Fg = f v Gnidningsfaktoren B = f Teorell kb T Husk: = Einstein f Kraften pr. mol Teorell + Einstein: * J = C Fd C Fd kt = RT B iffusion: Makroskopisk set * Einstein: J = C Fd RT Fick: J = * C Fd = RT = * Fd RT C * d Fd = RT (ln C ) * d Fd = ( RT ln C ) F µ * d et kemiske potentiale µ = µ + RT lnc d µ J = C RT Elektrodiffusion (migration) Hvis partiklernes energi også afhænger af en elektrisk spænding ψ erstattes det kemiske potentiale med det elektrokemiske potentiale µ : (Elektro)kemisk potentiale og arbejde Kemiske potentiale µ µ = µ + RT lnc Elektrokemiske potentiale µ µ = µ + RT lnc + zfψ Antal ladninger på partiklen en elektriske spænding (potential) Potentialerne udtrykker Gibbs fri energi for mol partikler som befinder sig hvor koncentrationen er C (og spændingen er ψ) µ = µ + RT lnc + zfψ Faradays konstant= Antal Coulomb i mol elementarladninger F = 965 C mol - W 2= µ 2 µ et tilførte arbejde for at flytte mol 4

(Elektro)kemisk potentiale og arbejde: Eksempel En alge-celle har membranpotentialet -38 mv og ionkonc. som vist i skemaet (der er også andre ioner). Temperaturen er 2 C: Ion c o (mol m -3 ) c i (mol m -3 ) Na +, 4 K +, 9 Cl -,3 65 Hvor stort arbejde ville det kræve at føre mol Na-ioner ud af cellen? Stoftransport gennem membraner I Membranegenskaber (i relation til bestemte molekyler) Impermeabel Frit permeabel Semipermeabel Selektivt permeabel Beskrives ved membranens Permeabilitetskoefficient P Jnetto = P C - [ P ] = m s To modeller for membranpermeabiltet: Opløselighed i membranfasen Porer i membranen Membrandiffusion: Homogene membraner I Membrandiffusion: Homogene membraner II Antagelser: Fri diffusion i membranen (Ficks lov) Stationær konc. profil i membranen Lineær konc. profil i membranen Kun -dimensional diffusion Molekylerne er β gange mere opløselige i membranen end i vand I membranen: Ficks. lov C 2 C βc2 βc = = x x 2 J = m J = m β ( C2 C) J = P C = Ficks. lov J m Permeabilitetskoefficient β m 5

Membrandiffusion: Porøse membraner Gå ud fra fri -dimensional diffusion (Fick) Modeller for membranpermeabilitet J = C J = Porefyldt membran: C J = φ J = P C A A porer total φ = φ Poreandelen Permeabilitetskoefficient iffusionskoefficient i membranen iffusionskoefficient i væsken J = P C β m φ Altid Massiv+homogen membran Porøs membran Hvad er elektrokemisk ligevægt? Elektrokemisk ligevægt for et stof over en membran betyder at systemets energi-bidrag fra dette stof er mindst mulig. Kan vises, at det sker når: Stoffets elektrokemiske potentiale er lige stort på begge sider af membranen Ved elektrokemisk ligevægt (over en membran) har et molekyle af stoffet lige stor energi på begge sider af membranen 6