EPIDEMIOLOGI OG PATOLOGISK SIGNIFIKANS AF ENTEROAGGREGATIV E. COLI



Relaterede dokumenter
Flemming Scheutz Collaborating Centre for Reference and Research on Escherichia and Klebsiella

VEROCYTOTOKSIN-PRODUCERENDE BAKTERIOFAGER I E. COLI

Tarmsygdomme i klimastalden hvad fortæller sokkeprøverne os? DANVETs årsmøde 11. marts 2016 Fagdyrlæge Kirsten Jensen

Colon irritable efter mavetarm-infektion Tarmbakteriologisk Årsmøde, Dansk Selskab for Klinisk Mikrobiologi Slagelse Sygehus, d. 13.

Resistente bakterier

Juvenil Spondylartrit/Enthesitis-relateret artrit (GIGT) (SPA-ERA)


Clostridium difficile

Afholdt d. 17. november 2016

EPIDEMIOLOGISKE UNDERSØGELSER FOR AT UDPEGE FØDEVAREN DER FORÅRSAGER SYGDOM

Nye diagnostiske muligheder ved tarminfektioner. DVHS November 2013 Chefforsker Ken Steen Pedersen, Afd. Veterinær Forskning og Udvikling

Clostridium difficile. Klinisk Mikrobiologisk Afdeling

Diagnostiske centre i Danmark - Behovet set fra almen praksis

Basal mikrobiologi Smitteveje og smittemåder Mette Winther Klinisk Mikrobiologisk Afdeling

Flemming Scheutz. Fødevarebårne Infektioner Statens Serum Institut

SKRIFTLIG EKSAMEN I BIOSTATISTIK OG EPIDEMIOLOGI Cand.Scient.San, 2. semester 20. februar 2015 (3 timer)

MULIGHEDER UDEN ZINK, ROBUSTE GRISE, SEN FRAVÆNNING, GENETIK

Skriftlig tværfaglig mappe-eksamen. onsdag den 25. aug kl torsdag den 26. aug. kl

Patientvejledning. Low FODMAP

De 10 trin Udbrudsopklaring på SSI

Diarré hos smågrise og slagtesvin

Diagnosticering af Clostridium perfringens type C infektion i neonatale grise

Råmælk, immunisering og sundhed

MRSA. Status, smittemåder og. Robert Skov, overlæge. Statens Serum Institut

Projektbeskrivelse for undersøgelsen:

SÆSONINFLUENZAVACCINATION

LEGIONELLAPROBLEMATIKKEN OG DEN AKTUELLE SITUATION

PED situationen i Europa

ved inflammatorisk tarmsygdom

Håndtering af PED- udbrud Erfaringer fra USA. Dyrlæge Per Damkjær Bak DANVET K/S

Nethindeløsning infektion i øjet. (endoftalmitis) to alvorlige komplikationer til grå stær operation. Nyt fra forskningsfronten

DANSK RESUMÉ. Forhøjet blodtryk er i stigende grad almindeligt i afrikanske lande syd for Sahara.

Ekstrakter - rammebevillinger

Metronidazol til behandling af dientamoebiasis hos børn i Danmark - Et randomiseret, placebo-kontrolleret, dobbeltblindet klinisk studie

DYNAMIK AF PRRS-VIRUS I 3 FORVENTLIGE PRRS-VIRUS-FRIE SOBESÆTNINGER

MULIGHEDER FOR SMITTE TIL SYGEHUSPATIENTER GENNEM VASKETØJ. Brian Kristensen, overlæge Central Enhed for Infektionshygiejne Statens Serum Institut

Årsrapport: MRSA i Danmark STAFYLOKOKLABORATORIET, STATENS SERUM INSTITUT

Diagnostik af pneumonier - og hvad med den kolde

Autoimmunitet. Umahro Cadogan Sundhedsrevolutionær-uddannelsen


Clostridium difficile: Gammel kending nye behandlingsmuligheder. Jørgen Engberg, Overlæge dr.med. KMA Slagelse


MÅLRETTET BEHANDLING AF LUNGEKRÆFT PATIENTINFORMATION OM NYESTE BEHANDLINGSMULIGHEDER

Clostridium difficile - CD

Udtagning af prøver og forsendelse ved pyodermi, enteritis, urinvejsinfektioner og sepsis

Oliver Hendricks Overlæge, ph.-d. Klinisk lektor Syddansk Universitet

Infektionshygiejne og UVI

Optimer din behandlingsstrategi ved smågrisediarre. Ken Steen Pedersen, Fagdyrlæge, Europæisk specialist i svinesundhed og -sygdomme, Ph.

Fjerkræsygdomme på Københavns Universitet

Information til patienten. Infektioner. - hos nyfødte og for tidligt fødte børn. Børneafdeling C1 Hospitalsenheden Vest

MRSA-enhedens opgaver. Hygiejnesygeplejerske Bodil Forman MRSA-enheden

Anette Spohr Dyrlæge, ph.d

Sygdom og metaboliske forstyrrelser hos farende søer

Antibiotika resistens Antibiotika forbrug Afbrydelse af smitteveje. På vej med handleplanen, SHS Steen Lomborg, ledenede ovl, Mikrobiologi, SHS

GODE RÅD OG NYTTIG INFORMATION TIL DIG SOM HAR KRONISK TARMBETÆNDELSE OG SKAL BEHANDLES MED BIOLOGISKE LÆGEMIDLER

Mikrobiologi Hånden på hjertet

TOKSISKE EFFEKTER MED FOKUS PÅ HJERTEKARSYGDOM

Behandlingsvejledning for terapiområdet Biologisk Behandling af Kroniske Inflammatoriske Tarmsygdomme

Bærerskab, patienten som smittekilde!

Udvikling af ADHD symptomer hos førskolebørn i Odense Børnekohorte. SAFARI Jette Asmussen Børne og Ungdoms psykiatri Odense

Behandling af Crohn s sygdom med lægemidlet Methotrexat

MEDICINSK MIKROBIOLOGI OG INFEKTIONSPATOLOGI Biologisk del

Fri for laktose - Ernæringstrends Onsdag 4. marts 2015, kl Levnedsmiddelselskabet

Fag Mål Indhold på Uddannelsesinstitution Indhold i klinik Anbefalet litteratur. søgedatabaser.

Tryk på koens immunforsvar omkring kælvning. Hans Jørgen Andersen LVK

Title Mevalonat Kinase Defekt (MKD) (eller HYper IgD syndrome)

VÆRDIEN AF DIAGNOSTIK. Svend Haugegaard Laboratorium for Svinesygdomme

Appendix. TS-kursus i gastropatologi Lene Riis Patologiafdelingen, Herlev Hospital

Spirokætose og Svinedysenteri Betydningen af infektion. Svinefagdyrlæge Kirsten Jensen, Novartis

FORBRUGET AF TETRACYKLIN KAN REDUCERES I NOGLE BESÆTNINGER UDEN TEGN PÅ PRODUKTIONSTAB

PoC behovet i udviklingslandene - erfaringer fra malaria forskningen

MPH Introduktionsmodul: Epidemiologi og Biostatistik

Undersøgelse af patogen-forekomst i regnvand. Karsten Arnbjerg-Nielsen

Får vi protein nok? Præsenteret af PhD studerende Lene Holm Jakobsen

18. maj 2011 PRODUKTRESUMÉ. for. Canaural, øredråber, suspension 0. D.SP.NR VETERINÆRLÆGEMIDLETS NAVN Canaural

HYGIEJNE GAMMEL VIN PÅ NYE FLASKER

E. coli fravænningsdiarré

Forskningsopgave. Mycoplasma genitalium ved akut urethritis hos mænd i almen praksis. Trine Overgaard og Lisa Videbæk Gow

Screeningsundersøgelse af den danske slagtekyllingebestand for IB stamme D388

Bedre diagnostik flere tilfældighedsfund Dilemmaer ved genom-undersøgelser i diagnostik

Influenza i mink. Lars Erik Larsen Dyrlæge, Professor i virologi. Virologigruppen Afdeling for Diagnostik og Beredskab DTU Veterinærinstituttet

Biologien bag epidemien

Gravide og råmælksoste. Susan Rønholt Hansen / Claus Heggum

Bruk av PET/CT i diagnostisk pakkeforløp. Overlæge Karin Hjorthaug Nuklearmedicinsk afd & PET center Århus Universitetshospital

Behandling med Adacolumn ved inflammatorisk tarmsygdom

Patientvejledning. Lungebetændelse/pneumoni

Ny diagnose Modic? Hvad er Modic forandringer? Viden om Modic forandringer. Modic forandringer på MR-skanning. Modic forandringer på MR-skanning

Kursus i Epidemiologi og Biostatistik. Epidemiologiske mål. Studiedesign. Svend Juul

JULI 2015 MERS (MIDDLE EAST RESPIRATORY SYNDROME) Information til rejsende

19-21 MAY 2010 Highlights

Susanne Mansdal Teamleder Mikrobiologisk laboratorium

Dyrkning og Resistens

LA-MRSA = Husdyr associeret MRSA

DIAGNOSTISKE TEST, infektioner og krybdyr.

Biomarkører. Anja Hviid Simonsen Post Doc Nationalt Videnscenter for Demens

Børbetændelse hos køer

Evidensbaseret praksis Introduktion

Studiedesigns: Alternative designs

STOP SMITSOM YVERBETÆNDELSE

Steen Hoffmann, SSI Jordemoderforeningen, den 8. januar 2015

Transkript:

EPIDEMIOLOGI OG PATOLOGISK SIGNIFIKANS AF ENTEROAGGREGATIV E. COLI Betina Hebbelstrup Jensen Statens Serum Institut, Afdeling for Mikrobiologi og Infektions kontrol Vejledere: Karen Angeliki Krogfelt Andreas Munk Petersen Katharina E. P. Olsen

ENTEROAGGREGATIV E. COLI - EAEC EAEC observeres første gang i 1987 i et studie af Professor Nataro et. al. Isolatet stammede fra en peruviansk dreng med diarre Bakterien blev kendetegnet ved det typiske brick-layer mønster. Mønsteret opstår ved dyrkning af enteroaggregative E.coli på HEp-2 celler. Denne mønstergenkendelse er fortsat gold standard til diagnostik af bakterien.

EAEC EAEC dyrket på HEp-2 celler med brick-layer mønster. Kilde: Enteroaggregative Escherichia coli. Okeke, I N; Nataro, J P (2001) The Lancet infectious diseases vol. 1 (5) p. 304-13

PATOGENICITET Det aggregative mønster (AA) er associeret med en 60 mda plasmid. Plasmidet bærer adskillelige virulensfaktorer og fimbriae. EAEC stammer bærende aggr genet anses for at være typiske EAEC. AggR genet øger transskriptionen af fimbriaerne og andre EAEC virulens gener. Der er fundet dosisrespons ved kvantitativ PCR ved anvendelse af aggr primer.

PATOGENICITET Dispersin er et hydrofobt overflade protein som ændrer de elektrokemiske egenskaber på overfladen af bakterien. Det negativt ladede LPS lag på EAEC og de positive ladede fimbriae tendere til agglutination. Dispersin facilitere fimbriaernes evne til at skyde ud fra bakterien og får denne til at adhærere til andre bakterier og tarmepitelet. Dispersin er immunogent selvom forhøjede antistofniveauer ikke beskyttede amerikanske studerende på rejse i Mexico.

Scanningelektron mikroskopisk billede af EAEC. Kilde: Sheikh, J., Czeczulin, J.R., Harrington, S., Hicks, S., Henderson, I.R., Le Bouguénec, C., et al. (2002). A novel dispersin protein in enteroaggregative Escherichia coli. J Clin Invest 110, 1329-1337.

PATOGENICITET Fire typer af fimbriae er fundet AAF/I - AAF/IV. Disse fimbriae binder til komponenter i den extracellulære matrix herunder laminin, kollagen type IV og fibronectin. Fimbriae er essentielle for bakteriens evne til adhærence og dannelse af biofilm Kilde: http://mgm.ufl.edu/faculty/facultyhome-pages/giron-jorge-a/

PATOGENICITET Fæcesprøver med påvist EAEC har forhøjet leukocytter, lactoferrin, IL-1β, IL-8. Patienter med SNPs i IL-8 genet har udvist større tendens til diarre ved EAEC infektion, desuden mere udtalt fækal leukocytose. Det inflammatoriske respons i tarmen er set at være afhængig af blandt andet bakteriens fimbriae. Manifestation af diarre grundet EAEC er antaget at være afhængig af værtsfaktorer

PATOGENICITET Transmission med EAEC følges af: 1) Initial adhærence til tarmmucosa 2) Dannelse af biofilm 3) Frigivelse af toxiner forårsager et inflammatorisk respons i tarmen.

DIAGNOSTIK EAEC stammerne udviser betydelig heterogenicitet. PCR med anvendelse af forskellige kombinationer af primers anvendt til diagnostik af EAEC. Endnu findes ingen global konsensus om hvilken kombination af primers, der er HEp-2 celleassay overlegen. Der er ingen konsensus om hvilke stammer er der true pathogenic

DIAGNOSTIK Liste over PCR primers anvendt til diagnose af EAEC aggr transcription activators for AAF/I and AAF/II, agga fimbrial subunit encoding AAF/I, asta - Aggregative heat-stabile toxin 1 EAST1, aap - anti-aggregation protein dispersin, afad invasin, aaf encoding subunit of AAF/II, aata ABC transporter aaic type VI secretion system aspu dispersin surface coat protein, Cdt cytodetaching toxin, fyua genes involved in iron sequestration, hda adhesion, hly haemolysin, hra1 + 2 heat resistant agglutinin, ipah invasin, irp2 yersina biosynthesis gene, Pet plasmid encoding toxin, pic protein involved in colonization, ShET /set - Shigella enterotoxin1, tia gene product protein important for invasion,

DIAGNOSTIK PCR diagnostik af EAEC Kontrol stammer I II III I O42 II JM221 III C1010 aata aggr aaic

DIAGNOSTIK AggR anses for at være the major regulon AaiC genet er et kromosomalt gen, en del af en type VI transportersystem, involveret i dannelsen af biofilm aata faciliterer transporten af dispersin på bakteriens overflade og er en del af et ABC transportersystem. Disse 3 gensekvenser anses for at være så konserverede at en diagnostisk for EAEC

EPIDEMIOLOGI I 1995 foretager Nataro et al. et voluntørstudie, hvor deltagerne indtager 4 forskellige EAEC stammer. Kun den ene stamme forårsager diarre hos 3 ud af 4 deltagere. Stammen kaldes 042 og er siden studiet anset for prototype stammen. Stammen er sidenhen fundet at være i stand til dannelse af ekstensiv biofilm.

EPIDEMIOLOGI Initialt ansås EAEC for at være opportunistisk patogen. EAEC blev associeret med diarre hos HIV patienter, patienter med nedsat immunforsvar og småbørn fra udviklingslandene. Senere studier associerede EAEC med rejsediarre. Aktuelt ses studier, hvor EAEC sammenkædes med samfundserhvervede diarreepisoder i den vestlige verden.

EPIDEMIOLOGI Pilotstudier pegede på association mellem EAEC og colon irritable. Nyere studier med større patient population har afvist denne sammenhæng. Et enkelt studie har fundet EAEC i større antal hos patienter med Colitis Ulcerosa sammenlignet med patienter med Morbus Crohn. Aktuelt sammenkædes diarre og EAEC med alle patienter uanset immunstatus eller anden co-morbiditet

EPIDEMIOLOGI I case-kontrol studier ses højt antal af raske smittebærer. Det høje antal af raske smittebærer antages at skyldes erhvervet immunitet grundet manglende hygiejne i udviklingslandene. Dog ses også et betydeligt antal af raske smittebærer i case-kontrol studier foretaget i den vestlige verden. Disponerende værtsfaktorer for sygdomsmanifestation er uafklaret.

EPIDEMIOLOGI I foråret 2011 sås udbrud med VTEC I Tyskland. VTEC udbrud stammen O:104:H:4 forårsagede 54 dødsfald og talrige tilfælde af hæmolytisk uræmisk syndrom HUS. The EAEC stammen havde optaget en profag kodende for verocytotoxinet vtx2. EAEC stammer bærer sædvanligvis ikke verocytotoxinet og er ikke associeret med HUS og kun sjældent med blodig diarre.

SYMPTOMER Manifestation of kliniske symptomer efter infektion med EAEC Vandig diarre Mucoid diarre Subfebrilia > 38 C Kvalme Anoreksi Borborygmi Tenesmi Vægttab Persisterende diarre

PROJEKT BESKRIVELSE Ph.d studiet vil omfatte 3 delprojekter Børnekohorte Case-kontrol studie Komparativt studie

BØRNEKOHORTEN Kohorte studie med 200 børn i alderen 0-6 år i 36 daginstitutioner i Københavns omegn i en 1-årig periode. Fæcesprøver fra børnene sendes ind hver anden måned Spørgeskema udfyldes af forældre i tilslutning til prøveindsendelse. Registrering af mulige risiko faktorer for transmission af EAEC.

BØRNEKOHORTEN Fæcesprøverne testes for patogene bakterier, virus samt parasitter Prævalens af EAEC i danske daginstitutioner Langtidsudskillelse af EAEC hos børn vil blive undersøgt

CASE-KONTROL STUDIE Børnekohorten udgør den raske kontrol gruppe Case gruppen udgøres af børn med EAEC positive fæcesprøver samt diarre 200 interviews med forældrene til de EAEC positive børn Forskelle i eksponering, antropometriske mål, brug af antibiotika.

CASE-CONTROL STUDY Sammenligning af EAEC stammer ved PCR mellem case og kontrol grupper. EAEC som årsag til diarre hos små børn vil blive undersøgt Nedsat trivsel og vægttab på grund af EAEC infektion hos danske børn vil blive undersøgt.

VOKSEN EAEC PROJEKT 200 interviews med voksne med diarre og EAEC sammenlignes med 200 voksne med co-infection. Risiko for EAEC infektion belyses rejse, fødevarer indtag, risikoerhverv ect. Gastrointestiale symptomer fra patienter med EAEC sammenlignes med patienter inficeret med etablerede tarmpatogene mikroorganismer. Sammenligning af EAEC stammer hos patienter med persisterende diarre og patienter med akut diarre ved anvendelse af PCR

STUDIE MÅL Undersøge forekomsten af EAEC i Danmark Er EAEC en hidtil ikke diagnosticeret årsag til diarre? Hvilke EAEC stammer er særligt patogene i den danske befolkning Er EAEC en mulig årsag til persisterende diarre hos små børn?

ACKNOWLEDGEMENT Vejledere Karen Krogfelt Andreas Munk Petersen Katharina E. P. Olsen Samarbejdspartnere Dennis Röser, Henrik Vedel, Bente Utoft, Alice Friis-Møller, Søren Persson, Jørgen Engberg, Susanne Schjørring, Steen Ethelberg, Lee O Brian, Steffen Jørgensen, Rie Jønnson, Susanne Jespersen, Ovidiu Maldovan, Hengameh Mirsapasi.