Årsrapport Laboratorieundersøgelser af materiale fra SVIN på DTU Veterinærinstituttet og Laboratorium for svinesygdomme i Kjellerup

Transkript

1 Årsrapport 2015 Laboratorieundersøgelser af materiale fra SVIN på DTU Veterinærinstituttet og Laboratorium for svinesygdomme i Kjellerup Juni 2016

2 Indholdsfortegnelse 1. Formål: Opgørelsen Data og materiale Indsendelsernes geografiske placering Undersøgelser og resultater Undersøgelser for virus Undersøgelser for bakterier og coccidier Undersøgelser for bakterier og coccidier Andre undersøgelser for virus og bakterier Histopatologiske undersøgelser... 22

3 1. Formål: Denne rapport indeholder opgørelser af laboratoriedata vedrørende svin fra DTU-veterinærinstituttet (DTU-Vet) og SEGES, Laboratorium for svinesygdomme, Videncenter for Svineproduktion, Kjellerup (VSP-Kjellerup). Det er hensigten at beskrive omfang og resultater af de laboratorieundersøgelser, som foretages på materialer fra svin på de to laboratorier i Danmark. Der foretages også en del undersøgelser på udenlandske laboratorier, specielt laboratorier i Tyskland. Omfanget af dette er desværre ukendt og data er ikke tilgængelige. Data fra DTU-Vet er for visse materialer opdelt efter hensigten (anledning til indsendelse), hvilket omfatter eksport, overvågning og diagnostik. Overvågningen inkluderer prøver foretaget i forbindelse med import, karantænestalde, KS-stationer og prøver i relation til overvågning af lovomfattede sygdomme eller vedrørende SPF-sundhedsovervågning. Prøver fra udlandet indgår ikke i materialet. For data fra VSP Kjellerup foretages der ikke registreringer af hensigten med indsendelserne, men her gælder det i overvejende grad, at de serologiske undersøgelser vedrører overvågning af visse SPF-relevante sygdomme, og de øvrige undersøgelser vedrører primært diagnostik af endemiske sygdomme. 2. Opgørelsen 2.1 Data og materiale Tabel 1 viser antal indsendelser, prøver og undersøgelse per laboratorium. Indsendelser til DTU-Vet vedrører histopatologiske, bakteriologiske, parasitologiske, serologiske og/eller virologiske undersøgelser. Indsendelser til VSP-Kjellerup vedrører obduktioner, bakteriologiske, parasitologiske og serologiske undersøgelser. For VSP-Kjellerup er det ikke muligt for nærværende at opgøre antal blodprøver, jf. fodnoter til tabel 1. Tabel 1: Antal indsendelser, prøver og analyser per laboratorium DTU-Vet VSP-Kjellerup Antal indsendelser Antal prøver Antal analyser Antal prøver per Median (5-95 percentil) 5 (1-30) indsendelse Gennemsnit (min-max) 10 (1-931) 1 inkl. blodprøver. 2 Inkl. organer til USK og prøver vedr. nysesyge; ekskl. blodprøver til serologi. 3 Kun blodprøver til serologi 2

4 Alle Indsendelser Indsendelsestyper excl. praksis Antal Praksis Andre 0 VSP/lab Slagteri FVST Andre offentlige Indsendelser Prøver Analyser Figur 1: Oprindelse af indsendelserne til DTU-Vet Langt hovedparten af indsendelser til DTU-Vet har oprindelse fra praksis (figur 1) og 96 % hidrører fra besætninger med CHR-nummer. Anledningen er for de fleste indsendelser diagnostik (figur 2). En betydelig del (14 %) af indsendelser til DTU-Vet kommer fra VSP-Kjellerup med henblik på specifikke undersøgelser, herunder histolologi, serologi, identifikation af agens ved PCR, MALDI-TOF eller typebestemmelser ved anden metode. Overvågning udgør også en betydelig andel af indsendelserne til DTU-Vet (figur 2). En stor del af disse prøver vedrører overvågning af eksotiske sygdomme mhp. dokumentation af frihed. Endvidere er der mange prøver, som vedrører SPF sundhedsovervågningen i henhold til regler fastsat af SPFsundheds-styringen ( 3

5 Indsendelses-hensigt Diagnostik Avl Eksport Overvågning Mistanke Antal indsendelser Figur 2: Antal indsendelser til DTU-Vet fordelt på foranledninger Figur 3-5 viser fordelingen af indsendelser, prøver og analyser pr. uge (blå kurver) og måneder (grå søjler) til DTU-Vet i Det øgede antal prøver i januar er relateret til den årlige SPF-screening for serotyperne 1, 5, 7 og 10 af Actinobacillus pleuropneumoniae. Det øgede antal prøver og analyser i efteråret er dels relateret til nogle eksporter og dels til en årstidsvariation for indsendelser af sokkeprøver til undersøgelser ved PCR for diarrefremkaldende bakterier. Antal indsendelser / uge Jan Feb Mar Apr Maj Jun Jul Aug Sep Okt Nov Dec Antal indsendelser / måned Figur 3. Antal indsendelser til DTU-Vet fordelt på uge og måned 4

6 Antal prøver / uge Antal prøver / måned Jan Feb Mar Apr Maj Jun Jul Aug Sep Okt Nov Dec 0 Figur 4. Antal prøver modtaget på DTU-Vet fordelt på uge og måned Antal anlyser / uge Jan Feb Mar Apr Maj Jun Jul Aug Sep Okt Nov Dec Antal analyser / måned Figur 5. Antal analyser på DTU-Vet fordelt på uge og måned 5

7 Tabel 2: Antal indsendelser og prøver til DTU-Vet opdelt efter besætningstype og størrelse. Avl og Karantæne Andre Produktion Besætningsopformering KS-station station 2 /ukendt størrelse Antal indsendelser Ukendt dyr dyr dyr >1000 dyr Antal prøver Ukendt dyr dyr dyr >1000 dyr : Besætningsstørrelse målt på antal søer 2: CHR-numre der er registreret som Karantænestation i CHR registeret, uden dyr registreret som produktions- eller avlsbesætning. 3: Hovedsagligt prøver indsendt fra samlesteder, slagterier eller via VSP-Kellerup mhp. serologisk overvågning af PED, CSF, PRRS og Aujeszky (1039 indsendelser, prøver). Desuden er et mindre antal indsendelser fra besætninger hvor CHR-nr mangler, eller aldersgruppe ikke fremgår af CHR. Tabel 2 viser, at det er de største produktionsbesætninger, som sender flest prøver til DTU-Vet. Avlsbesætninger, KS- og karantænestationer udgør nogenlunde lige store andele af prøvemængden. 6

8 Tabel 3: Antal prøver af forskellige materialer indsendt til DTU-Vet og VSP- Kjellerup Næsesvaber DTU- Vet Blod Fæces Kadaver Organer Spyt Bakterie -kultur USK organer Ikke VSP ,213 oplyst DTU-Vet har desuden modtaget 313 udstrygnings-præparater samt diverse materialer i mindre antal (svaberprøver, kropsvæsker og biopsier). 1: Inkl organer fra VSP Kjellerup. Desuden 250 organer indsendt fra Kjellerup til analyse for CSF og ASF (overvågning). 2: Omfatter alle aldersgruppe, inkl. USK grise. 3: Omfatter 1102 hele grise til USK. Størstedelen af prøvemateriale fra svin til DTU-Vet er blodprøver til serologiske undersøgelser, hvor antallet i 2015 var forøget med 28 % sammenlignet med 2014, jf. tabel 3. Antal fæcesprøver var stort set uændret. På VSP-Kjellerup blev der modtaget næsesvaberprøver, som primært angik overvågning for nysesyge i SPF-avlsbesætninger. Omfanget af kadavere var 11 % højere i 2015 i forhold til 2014, hvor der blev modtaget kadavere (inkl. USK grise) på VSP-Kjellerup. Antal fæcesprøver faldt med 42 % (2.515 i 2014), hvorimod antal organer var uændret. Antallet af USK organer var højere i 2014 ( mod i 2015), hvilket skyldtes et stort projekt i Antallet af blodprøver til VSP-Kjellerup vedrørende SPF sundhedsovervågningen er ikke oplyst, men antallet af analyser på disse blodprøver fremgår af tabel 18, og det var stort set uændret. 2.2 Indsendelsernes geografiske placering Der var i CHR aktive svinebesætninger registret i 2015, hvor en aktiv besætning er defineret som en besætning, der havde mindst 1 dyr 1.oktober 2015, og/eller sendte prøver til mindst et af de to laboratorier i løbet af Mange af disse besætninger er små og kan eventuelt være tomme en del af perioden, og omfatter desuden også slagterier, samlesteder mv. Ud af de aktive besætninger har sendt prøver til DTU-Vet i løbet af 2015 og 2,472 besætninger har indsendt til VSP-Kjellerup. I alt har besætninger sendt prøver til mindst et af laboratorierne i

9 Figur 6. Placering af aktive svinebesætninger i Danmark i Blå besætninger (n=2156)indsendte prøver til DTU-Vet; røde besætninger(n=355) kun til VSP- Kjellerup, grønne besætninger(n=2093) indsendte til begge laboratorier og grå besætninger indsendte ikke prøver til nogen af dem. Figur 6 viser placering af aktive svinebesætninger i Danmark og hvilke der har indsendt prøver til DTU-Vet, VSP-Kjellerup eller begge laboratorier. En del af de prøver, som tilgår DTU-Vet er prøver fra VSP-Kjellerup til supplerende undersøgelser (typebestemmelser, PCR, histologi, IHC, FISH, serologi). Figuren viser, at prøverne bliver sendt fra hele landet, men at mange (3609) aktive svinebesætninger, som ikke har sendt prøver til nogen af de to laboratorier i Derudover er der nogle steder, især Nordsjælland, hvor relativt få besætninger som har indsendt prøver. 8

10 Figur 7. Analyse af svinebesætningers placering i forhold til indsendelse af prøver til DTU-Vet og VSP-Kjellerup. Svinebesætninger som indsendte prøver til laboratorierne (blå) og aktive svinebesætninger i hele landet (grå) i Grønne områder: Clustre af besætninger med signifikant lavere indsendelses rate; Blå områder: Clustre med signifikant højere indsendelsesrate (p<0.001) Figur 7 viser en analyse af svinebesætningers placering i forhold til indsendelse af prøver til de to laboratorier. Analysen udpeger områder, hvorfra signifikant færre eller flere besætninger indsendte prøver end fra andre områder i forhold til antal svinebesætninger i området. Det fremgår, at svinebesætninger på Sjælland (grønne områder) sender betydeligt færre prøver end andre besætninger i Danmark. Sandsynligheden for at en svinebesætning i Nordsjælland sender prøver til laboratorierne er 6 gange mindre (RR=0,13) i forhold til besætninger andre steder i landet. Tilsvarende er den relative risiko, RR=0,87 for at en besætning på Midtsjælland indsender prøver. Omvendt var der en større andel af besætningerne i Sydøstjylland (RR=1,33) og i Vendsyssel (RR=1,38), der indsendte prøver i

11 2.3 Undersøgelser og resultater Undersøgelser for virus Resultater for analyser for tilstedeværelse af virus er vist i Tabel 4. De forskellige undersøgelser for virus har forskellige anledninger. For de eksotiske virus kan der være tale om mistanker, men for svinepest drejer det sig især om 250 early warning sager, der er særligt udvalgt materiale fra obduktioner på VSP Kjellerup, samt nogle mistanker/kontroller for CSV/ASF. Undersøgelser for de endemiske virus har baggrund i afklaring af sygdomsårsager til problemer i besætningerne. Alle 511 influenzavirus positive prøver blev testet for H1N1pdm09 subtypen, som blev påvist i 75 indsendelser. Dette er en del af overvågningen af influenzavirus i svin, som financieres af FVST. Tabel 4: Antal undersøgelser for virus 1 Virus Antal indsendelser Antal analyser I alt Positive I alt Positive Afrikansk Svinepest, CSV Klassisk svinepest, ASF SVD Influenza PPV PRRS PCV PCV2 (IF på fosterhjerter) PED PRCV Rota TGE Omfatter analyser på svin registreret på CHR-nr. samt nedskudte vildsvin og hængebugsvin. 1: Udført på DTU-Vet ved PCR bortset fra - undersøgelse for rotavirus, som er udført på VSP-Kjellerup. - undersøgelse for PCV-2 på fostre (fra VSP), som er undersøgt ved immunofluorocens. 2: Omfatter også analyser foretaget i forbindelse med luftvejspakken, som fremgår separat af tabel

12 Tabel 5: Serologiske undersøgelser for endemiske virus på DTU-Vet Formål og sygdom/virus Indsendelser Analyser I alt Positive I alt Positive Overvågning Svineinfluenza PCV PPV PRRS ved EU-IPT PRRS ved US-IPT PRRS ved EU-ELISA PRRS ved US-ELISA PRCV Diagnostik Svineinfluenza PCV PPV PRRS ved EU-IPT PRRS ved US-IPT PRRS ved EU-ELISA PRRS ved US-ELISA PRCV Eksport Svineinfluenza virus PCV PPV PRRS ved EU-IPT PRRS ved US-IPT PRRS ved EU-ELISA PRRS ved US-ELISA PRCV I alt Svineinfluenza PCV PPV PRRS ved EU-IPT PRRS ved US-IPT PRRS ved EU-ELISA PRRS ved US-ELISA PRCV

13 Vedrørende tabel 5: Resultater for serologiske undersøgelser for endemiske virus er vist i Tabel 5. Disse analyser udføres oftest som del af en overvågning, herunder SPF-sundhedskontrol og ved eksport. Ved sundhedskontrol indsendes ofte mange prøver til undersøgelse for PRRS fra hver besætning, og der indsendes ofte mange gange fra hver besætning, især fra avlsbesætninger hvor der sendes omkring indsendelser per besætning per år. Derudover indsendes prøver i forbindelse med almindelig diagnostik, dvs. ved mistanke om udbrud af endemiske virus. Når formålet er diagnostisk er der oftest kun en enkelt eller nogle få indsendelser fra hver besætning per år. Det bør dog bemærkes, at formålet med undersøgelsen kan være registreret forkert i nogle sager. Vedrørende tabel 6: En stor del af undersøgelserne for antistoffer overfor aujeszky, svinepest og PED virus er overvågning til dokumentation for frihed. Mange undersøgelser vedrører eksport, dog i mindre omfang PED. Undersøgelser med anledningen diagnostik er overvejende mistanker opstået på forskellig vis. 12

14 Tabel 6: Serologiske undersøgelser for eksotiske virus (antistoffer) på DTU- Vet Antal Formål og virus indsendelser Antal analyser I alt positive I alt positive Overvågning Afrikansk svinepest (ASF) Klassisk svinepest virus (CSF) Aujeszky-virus (MA) Porcin epidemisk diarre virus (PED) Transmissible gastroenteritis virus (TGE) Swine vesicular disease virus (SVD) Vomiting and wasting disease (HEV) Diagnostik/mistanker Afrikansk svinepest (ASF) Klassisk svinepest virus (CSF) Aujeszky-virus (MA) Porcin epidemisk diarre virus (PED) Transmissible gastroenteritis virus (TGE) Swine vesicular disease virus (SVD) Eksport Afrikansk svinepest (ASF) Klassisk svinepest virus (CSF) Aujeszky-virus (MA) Porcin epidemisk diarre virus (PED) Transmissible gastroenteritis virus (TGE) Swine vesicular disease virus (SVD) Ialt Afrikansk svinepest (ASF) Klassisk svinepest virus (CSF) Aujeszky-virus (MA) Porcin epidemisk diarre virus (PED) Transmissible gastroenteritis virus (TGE) Swine vesicular disease virus (SVD) Vomiting and wasting disease (HEV) : To reagenter ved Elisa-test blev fundet positive ved NT test. Disse blev afklaret ved opfølgende undersøgelser. 2: En reagent ved ELISA test afklaret ved negativ NT test 3: Fire sager (4 prøver) var falsk positive ved ELISA, hvilket blev afklaret ved NT-test. 1 sag blev afklaret ved klinisk inspektion (FVST) i besætningen. Tre sager (8 prøver) afklaret med opfølgende undersøgelser. 13

15 2.3.2 Undersøgelser for bakterier og coccidier Fund af forskellige patogene bakterier på VSP Kjellerup, som anført i tabel 7, afviger kun ubetydeligt i forhold til de fund, der blev observeret i Tabel 7: Antal indsendelser til VSP-Kjellerup, hvor de forskellige bakterier blev påvist Bakterie Antal positive Bakterier isoleret fra luftvejene indsendelser Actinobacillus pleuropneumoniae Bordetella bronchiseptica 37 Haemophilus parasuis 48 Pasteurella multocida 32 Tarmbakterier Brachyspira hyodysenteriae 7 Clostridium perfringens type A type C type E Lawsonia intracellularis 147 Hæmolytiske, spontan aggl. 64 Serotype serotype O Hæmolytiske E. coli 2 serotype O serotype O serotype O serotype O157 2 serotype O64 3 Salmonella 3 68 Andre bakterier Erysipelothrix rhusiopathiae. 5 Leptospira spp. 1 Staphylococcus hyicus 8 Streptococcus dysgalactiae dysgalactiae 0 equisimilis 26 type 2 38 Streptococcus suis type 7 24 type 8 8 anden type 60 1: Detaljer om typebestemmelser i tabel 11. 2: E. coli som er fundet hæmolytiske og/eller identificeret som en af de angivne serotyper. Fundet i 328 indsendelser, hovedsagelig fæcesprøver, tarme og/eller grise med diarre. 3: Salmonella isoleret fra indsendelser vedrørende klinisk sygdom; serotyper se Tabel 9. 4: Tilhører ikke de sædvanlige kendte patogene serotyper. 14

16 Tabel 8: Antal indsendelser til VSP-Kjellerup hvor Salmonella blev påvist i relation til afklaring af klinisk sygdom Serotype Salmonella enterica Antal Typhimurium 22 4,12:i:- (monofasisk Typhimurium) 16 4,5,12:i:- 17 Beslægtet med 4,12:i eller 4,5,12:i 2 Livingstone 2 Infantis 3 Derby 5 Rissen 2 Salmonella Typhimurium er langt den hyppigste Salmonella serotype hos svin i forbindelse med klinisk sygdom (Tabel 8). Antallet af S. Typhimurium og monofasiske S. Typhimurium steg fra samlet 32 i 2014 til samlet 57 i De monofasiske udgjorde i % af S. Typhimurium gruppen mod 31 % i 2014, hvilket er en bemærkelsesværdig stigning. Antallet af andre serotyper (typisk foderbårne) var uændret (hhv. 14 og 12). Tabel 9: Antal indsendelser til VSP-Kjellerup hvor coccidier 1 blev undersøgt Grad af oocystudskillelse Antal indsendelser Antal prøver/pools ialt positive ialt positive Lavgradig 33 Middelsvær Massiv 9 1: 187 indsendelser med i alt 318 prøver/pools undersøgt Tabel 9 viser indsendelser til undersøgelse for coccidier. Parasitologiske i øvrigt undersøges formentlig hovedsagligt i dyrlægepraksis. Omfanget af parasitologiske undersøgelser inkl. coccidiose i dyrlægepraksis er imidlertid ukendt. 15

17 2.3.3 Undersøgelser for bakterier og coccidier Tabel 10: Antal undersøgelser for specifikke bakterier 1 udført på DTU Vet. Bakterie Antal indsendelser Antal analyser I alt positive I alt positive Leptospira spp., IF Pasteurella multocida, v. MALDI-TOF Pasteurella multicida toxin Lawsonia intracellularis IF PCR Brachyspira hyodysenteriae, FISH Mycoplasma hypopneumonia, PCR Mycoplasma hyorhinis, FISH Clamydiaceae., FISH Haemophilus parasuis, PCR Erysiopelothrix rhusiopathiae, FISH Streptococcus suis, BU-MALDI-TOF Staph. hyicus, BU-MALDI-TOF Omfatter undersøgelser ved specifikke metoder, ikke almindelig bakteriologisk dyrkning. 2 Undersøgelse af næsesvaberprøver i forbindelse med eksport. 3 Andre Brachyspira spp. er udeladt fordi analyserne kun er gennemført systematisk for B. hyodysenteriae på det indsendte materiale. 4 Omfatter ikke PCR undersøgelser for M. hyopneumoniae ved luftvejspakke, se tabel 15. Mange af indsendelserne anført i tabel 10 kom fra VSP-Kjellerup og en delmængde indgår derfor også i tabel 7. Ud af de 268 sager undersøgt for L. intracellularis var der f.eks. 80 sager indsendt fra Kjellerup, de øvrige 188 sager vedrørte indsendelser direkte fra praksis. Antallet af undersøgelser for L. intracellularis på DTU-Vet faldt med 36 % i forhold til 2014, hvilket til dels kan skyldes, at VSP-Kjellerup etablerede PCR for L. intracellularis i september 2015 og udførte 125 PCR analyser indtil årsskiftet. En del af de bakteriefund på DTU-Vet, der fremgår af tabel 10, er identifikationer ved MALDI-TOF af isolater fremsendt fra VSP-Kjellerup. Det gælder f.eks. P. multocida, streptokokker og stafylokokker. 16

18 Tabel 11: Typebestemmelser på DTU-Vet af bakterie-isolater modtaget fra VSP-Kjellerup Bakterie Antal typebestemmelser Antal positive analyser Actinobacillus pleuropneumpniae 237 indsendelser, 237 isolater Type Type 5-3 Type 6-65 Type 7-4 Type 8-4 Type 12-8 Clostridium perfringens 112 indsendelser, 112 isolater 112 Type A Type C Staphylococcus hyicus, 2 indsendelser, 19 prøver Toksin type A 10 Toksin type B, C, D 0 Toksin ikke påvist 9 E. coli 73 indsendelser, 87 isolater F F5, F6, eller F41 47(for hver type) 0 F LT STA 89 6 STB VT2e F18 + VT2e + negativ for resten (også inkluderet under F18 og VT2e) typebestemmelse ikke mulig for 1 isolat, hverken serologisk eller ved PCR. Et isolat blev identificeret som Haemophilus parasuis. Fordelingen af serotyper for A. pleuropneumoniae er meget lig den, som har været gældende gennem mange år. For C. perfringens er type C fortsat meget sjælden. Antallet af toksinundersøgelser af S. hyicus med henblik på fremstilling af autovaccine er meget begrænset, og fremstilling af autovaccine mod sodeksem anvendes ikke i samme omfang som for år siden. Antal isolater til undersøgelse for E. coli virulensfaktorer steg fra 64 i 2014 til 89 i 2015, heraf var der 29 isolater med ødemsyge typen (F8, VT2e). 17

19 Tabel 12: Undersøgelser for Brucella spp. på DTU-Vet Bakterie og metode Antal sager Antal analyser I alt Positive I alt Positive Dyrkning fra organpools /testikler Brucella Antistof i blod SAT Antistof i blod Rose-Bengal Antistof i blod komplement-fixation : de 4 positive prøver blev gentestet (ved ELISA-c test) i henhold til bekendtgørelse nr. 502 af : To prøver var negative ved ELISA-c test og to prøver var positive ved ELISA-c test. Videre undersøgelse af organpool fra de to dyr var negative ved dyrkning for Brucella. Serologiske undersøgelser for antistoffer overfor bakterier udført på DTU-Vet fremgår af tabel 13. De serologiske undersøgelser for A. pleuropneumoniae (Ap) omfatter blandt andet de årlige/halvårlige screeninger for Ap serotype 1, 5, 7 og 10 i avls- og opformeringsbesætninger (rød SPF). Derudover indsendes der et lignende antal prøver til undersøgelse for Ap serotype 2 og 6 samt til mix- ELISA for Ap serotype 2, 6 og 12. Disse indsendelser kan både være i forbindelse med overvågning af SPF-status i produktionsbesætninger (blå SPF) og i forbindelse med diagnostisk afklaring af et sygdomsproblem. Serologiske undersøgelser for C. abortus foretages primært i relation til eksporter, fordi der er visse lande, som stiller krav om dette. Det skal fremhæves, at den pågældende test ikke er egnet til afklaring af reproduktionsproblemer, og at det i stedet anbefales at indsende fostre eller andet materiale til VSP-Kjellerup, som videresender relevante prøver til DTU- Vet mhp. undersøgelse for Chlamydia spp. eller andet ved FISH. Vedrørende L. bratislava ses der godt og vel en fordobling i antallet af indsendelser/analyser i forhold til Andelen af positive prøver er på uændret niveau (2/3 af prøverne er positive). Årsagen til det øgede antal prøver kan være en skærpelse i krav til dispensation for anvendelse af en ikke-registreret vaccine. 18

20 Tabel 13: Serologiske undersøgelser for bakterier-antistoffer ved DTU Vet Bakterie Antal Antal analyser indsendelser 1 I alt Positive I alt Positive Mycoplasma hyopneumoniae serotype serotype serotype serotype serotype Actinobacillus pleuropneumoniae serotype serotype serotype serotype serotype serotype serotype type 2, 6, 12 (mix-elisa) H. parasuis Lawsonia intracellularis Chlamydia abortus, eksport andet australis bataviae bratislava canicola grippotyphosa hardjo ballum Leptospira hebdomadis tarassovi icterohaemorrhagiae poi pomona, pomona, eksport saxkoebing sejroe Antal indsendelser svarer til antal undersøgte besætninger 19

21 Tabel 14: Serologiske undersøgelser på VSP-Kjellerup Bakterie Antal journaler Antal analyser I alt positive I alt Positive Ap Ap Ap M. hyopneumoniae PRRS Den overvejende del (72 %) af de serologiske analyser på VSP-Kjellerup er den månedlige screening af avls- og opformeringsbesætninger i SPF-systemet (rød SPF), men der sendes også prøver fra SPF-produktionsbesætninger (blå SPF), dels til årlig screening for anførte agens og dels i forbindelse med afklaring af en mistanke til ny introduktion af smitte i en besætning. 20

22 2.3.4 Andre undersøgelser for virus og bakterier Tabel 15: Antal undersøgelser og resultater af PCR- diarrepakker på sokkeprøver og fæcesprøver ved DTU-Vet Patogen Antal indsendelser Antal analyser I alt Positive I alt Positive PCR på fæcesprøver/tarmindhold E. coli fimbrietype F4 (K88) E. coli fimbrietype F18 (F107) Lawsonia intracellularis Brachyspira pilosicoli PCR på sokkeprøver E. coli fimbrietype F4 (K88) E. coli fimbrietype F18 (F107) Lawsonia intracellularis Brachyspira pilosicoli Antallet af undersøgelser ved PCR-diarrepakker har været på samme niveau i 2014 og Der er imidlertid sket en relativ stigning i antal sokkeprøver og et tilsvarende fald i antal fæcesprøver. Fordelen ved sokkeprøverne er dels en let og simpel metode til indsamling af en poolet fæcesprøve fra flere stier, men der er også en fordel ved en mere præcis kvantificering af indholdet af de fire bakterier. Ved fæcesprøverne inddeles de positive i tre niveauer af hver enkelt bakterie (lavgradig, moderat og massivt indhold). Ved sokkeprøverne angives der et antal DNA-kopier (=bakterier) pr. gram fæces. Endvidere angives der en værdi for, hvornår summen af bakterier i prøven vil være indikativ for bakteriel betinget diarre og dermed for relevans af behandling med antibiotika. 21

23 Tabel 16: Antal undersøgelser og resultater af PCR-luftvejspakke, DTU-Vet. Patogen (i lungestykker) Antal indsendelser Antal analyser I alt positive I alt Positive Influenza virus Mycoplasma hyopneumoniae PCV Histopatologiske undersøgelser De fleste histopatologiske og immunhistokemiske undersøgelser vedrørende svin foretages på materiale indsendt fra VSP-Kjellerup. Det er bemærkelsesværdigt, at der ved anvendelse af FISH har været ganske mange fund af klamydier i aborterede fostre, fortrinsvis Chlamydophila pecorum. Alle klamydia positive fostre havde føtopatier i form af pneumoni og/eller placentitis. Tabel 17: Histopatologiske og in situ agens-undersøgelser på DTU-Vet Antal indsendelser Antal prøver Anledning og undersøgelser I alt Positive I alt klamydier (FISH) Aborter PCV2 (hjerter, IF) Leptospirose (nyre, IF) Mistanke om PCMV 1 forårsaget rhinitis og respirationsvejssygdom Mistanke om mulberry heart disease (MHD) Nyre/lever, USK 2 7 Ikke relevant 60 1: Porcint cytomegalovirus (påvisning af intranukleære inklusionslegemer i epitelceller). 2: Undersøgt for forekomst af mykotoxin-associerede læsioner. 22