genetisk fingerprintning af Streptococcus equi subsp. zooepidemicus isoleret fra hoppens kønsorganer ved brug Pulsed Field Gel Electrophoresis

Størrelse: px
Starte visningen fra side:

Download "genetisk fingerprintning af Streptococcus equi subsp. zooepidemicus isoleret fra hoppens kønsorganer ved brug Pulsed Field Gel Electrophoresis"

Transkript

1 ORIgINALARTIKEL genetisk fingerprintning af Streptococcus equi subsp. zooepidemicus isoleret fra hoppens kønsorganer ved brug af Pulsed Field gel Electrophoresis (PFgE) MARIA MAThILDE haugaard 1 morten rønn Petersen 2 anders miki Bojesen 3 1 dyrlæge, ræveholmsvej 43, 2690 Karlslunde 2 dyrlæge, ph.d., dact, adjunkt, veterinær reproduktion og obstetrik, institut for produktionsdyr og heste, Ku life, dyrlægevej 68, 1870 frederiksberg c 3 dyrlæge, ph.d., lektor, mikrobiologi, institut for veterinær sygdomsbiologi, Ku life, stigbøjlen 4, 1870 frederiksberg c. Introduktion Sub- og infertilitet som følge af bakteriel infektion i endometriet er et velkendt problem i arbejdet med reproduktion hos heste og medfører store tab i hesteavlen (1,2,3). Viden om patogenesen ved bakteriel endometritis er fortsat mangelfuld trods en langvarig forskningsindsats på området. En række mikroorganismer kan isoleres fra uterine svabre og biopsier, men ganske få anses for betydelige patogener. En af de vigtigste patogener er den betahæmolytiske Streptococcus equi subspecies zooepidemicus (S. zooepidemicus) (4,1). Sammen med Escherichia coli udgør disse to bakteriearter 80 % af de isolerede patogener fra endometriet (4). S. zooepidemicus er en del af den naturlige bakterieflora i de øvre luftveje og nedre reproduktionsveje hos flere dyrearter, heriblandt heste. S. zooepidemicus er ligeledes en opportunistisk patogen, der under særlige forhold forårsager infektion, blandt andet i uterus (5). Formålet med nærværende undersøgelse er at belyse den genetiske diversitet af S. zooepidemicus isoleret fra endometriet, vagina og fossa clitoridis hos en gruppe individuelle hopper ved hjælp af typningsmetoden Pulsed Field Gel Electrophoresis. Sammendrag I studiet blev fossa clitoridis, vagina og endometriet undersøgt bakteriologisk på 29 hopper med henblik på at karakterisere den genetiske diversitet af Streptococcus equi subsp. zooepidemicus. Op til tre isolater af S. zooepidemicus fra hver lokalisation blev efterfølgende karakteriseret med den molekylære typningsmetode Pulsed Field Gel Electrophoresis (PFGE). Af de i alt 88 undersøgte isolater, blev der identificeret 44 forskellige PFGE profiler, hvilket overordnet indikerede en høj genetisk diversitet blandt S. zooepidemicus, isoleret fra hoppens kønsorganer. Ved karakterisering og evaluering af isolaterne fra endometriet fandtes en høj genetisk diversitet, når isolater fra forskellige hopper sammenlignedes, hvorimod endometrieisolaterne fra samme hoppe var identiske. Isolaterne fra hhv. fossa clitoridis og vagina fandtes genetisk forskellige fra stammer isoleret fra endometriet, mens der hos 75 % af hopperne med isolater fra både klitoris og vagina kunne genfindes samme klon fra begge anatomiske lokalisationer. Til trods for den overordnede store genetiske diversitet af S. zooepidemicus fra hoppens kønsorganer ser det således ud til, at isolater, der er isoleret i forbindelse med endometritis, udgør en selvstændig gruppe, der tilsyneladende er forskellig fra S. zooepidemicus isolater fra de mere distale dele af kønsorganerne. Dette kunne indikere, at endometritisisolater besidder specifikke egenskaber, som adskiller dem fra isolater fra hhv. vagina og klitoris, og at det normalt ikke er isolater fra de nedre kønsorganer, der er årsag til endometritis. 18 Dansk Veterinærtidsskrift oktober Nummer 20 Årgang 93

2 Velkendt typningsmetode Pulsed Field Gel Electrophoresis (PFGE) er en hyppigt anvendt molekylær typningsmetode, der muliggør bestemmelse af slægtskabet mellem forskellige bakterieisolater inden for den samme art. Typningsmetoden kan således afgøre, om forskellige isolater er identiske, også kaldet klonale, eller må betragtes som to forskellige stammer inden for samme art. Måden PFGE virker på er at sammenligne DNA fragmenter, der er fremkommet efter skæring af bakteriens kromosomale DNA med restriktionsenzymer. Grundtanken bag denne sammenligning er, at hvis to isolater af en bakterie er klonale, vil DNA et klippes identiske steder, og afstanden mellem hvert klip vil være ens. Efter skæring af DNA et med restriktionsenzymet adskilles DNA fragmenterne ved at køre DNA et gennem en agarosegel, hvorved DNA fragmenter vandrer med forskellig hastighed afhængig af størrelse. Efter farvning af gelen kan de forskellige DNA fragmenter visualiseres og sammenlignes ved hjælp af computerprogrammer. PFGE adskiller sig fra klassisk gelelektroforese ved at strømmen, som ledes gennem gelen, kommer fra skiftende retninger. Når strømmens retning ændres i forudbestemte intervaller, vil mindre DNA fragmenter hurtigere være i stand til at ændre deres vandringsmønster end større fragmenter, og derved fremkommer en mere tydelig adskillelse af DNA- båndene. Det er især blandt fragmenter med mange basepar (store fragmenter), at PFGE har sin styrke sammenlignet med klassisk gelelektroforese. For at kunne udsætte det kromosomale DNA for restriktionsenzymerne, skal DNA et isoleres fra de enkelte bakterieceller. Dette opnås ved at inkorporere hvert enkelt bakterieisolat i en agaroseblok, som herefter inkuberes i væske indeholdende et enzym, der forårsager cellelysis. Efter flere omganges vask af DNA et tilsættes restriktionsenzym, og agaroseblokkene indeholdende det klippede DNA er nu klar til at blive karakteriseret ved PFGE. Materialer og metode I alt 88 isolater af S. zooepidemicus fra 29 forskellige hopper, er inkluderet i undersøgelsen. I studiet er der ikke lagt vægt på hoppernes race eller alder, sidstnævnte varierer fra 3-21 år. Størstedelen af de undersøgte hopper (18/29) havde på prøvetidspunktet kliniske symptomer på endometritis, inklusiv fri væske i uterus og/eller patologisk flåd fra vulva. Et mindre antal hopper uden indikation på sygdom i endometriet er ligeledes inkluderet i studiet. Hopper i såvel østrus som diøstrus er repræsenteret. Indsamling af isolater er foretaget i perioden april til juli Prøveudtagning Der indgik tre prøveudtagninger fra hver hoppe: En fra fossa clitoridis, en fra vagina og en fra endometriet. Inden vask af perinealområdet blev der udtaget en svaberprøve fra fossa clitoridis ved at den ventrale del af labia vulva blev separeret og klitoris eksponeret. Prøven blev udtaget uden berøring af labia vulva. Der blev anvendt en udækket svaber BBL CultureSwab (In Vitro Diagnostics ). Hvis fossa clitoridis var tør ved prøvetagningen, blev svaberen fugtet med enten sterilt saltvand eller transportmedie inden prøveudtagning. Efter udtagning af klitorisprøven blev svaberen placeret i transportmedie. De eksterne genitalier og perinealområdet blev herefter vasket i varmt vand og aftørret med papir, inden prøver fra hhv. den craniale del af vagina og endometriet blev udtaget. Svaberprøven fra vagina blev udtaget med en dækket svaber (Equi-Vet ; Kruse). Den dækkede svaber førtes til bunden af vagina, hvor selve svaberdelen blev skubbet frem, hvorved svaberen kom i kontakt med vaginalslimhinden. Svaberen blev roteret og holdt i kontakt med slimhinden i minimum 30 sekunder. Svaberen med prøvematerialet blev herefter trukket tilbage i sit hylster, inden den samlede dækkede svaber blev ført tilbage gennem vagina. På denne måde minimeredes risikoen for kontaminering. En uterusbiopsi blev udtaget fra endometriet. Til denne procedure blev anvendt udstyr og metode som beskrevet af Nielsen (2005), hvor anvendelse af sterilt stålspekulum og udtagning af > Summary In the current investigation, Streptococcus equi subsp. zooepidemicus isolates were obtained from the fossa clitoridis, vagina and the endometrium of 29 mares with the aim of characterizing the genetic diversity by Pulsed Field Gel Electrophoresis (PFGE). Up to three isolates per localization were obtained from each mare. From a total of 88 isolates, 44 different PFGE profiles were outlined and thus revealed a high overall genetic diversity. However, when comparing endometrial isolates from individual mares the genetic diversity was extremely limited meaning that only one clone was involved in the endometritis of each mare. Furthermore, when comparing all S. equi subsp. zooepidemicus isolates from endometritis with isolates from the lower reproductive tract isolates, the endometritis isolates formed a distinct group only distantly related to isolates from the fossa clitoridis and the vagina. Identical clones originating from the vagina and the fossa clitoridis in 75 % of mares suggested a high level of exchange of bacteria between these two localities. In conclusion, no specific strain of S. zooepidemicus cause bacterial endometritis in the mare. However, isolates from endometritis appeared to belong to a distinct group only distantly related to the normal flora of the lower reproductive tract. Consequently, endometrial isolates are likely to possess specific traits enabling them of causing endometritis that may not be common to S. zooepidemicus from the normal flora of lower reproductive tract. Dansk Veterinærtidsskrift oktober Nummer 20 Årgang 93 19

3 ORIgINALARTIKEL Kolonier af Strep. equi subsp. zooepidemicus. biopsien uden samtidig rektalpalpation markant minimerer risiko for kontaminering af prøven. Mikrobiologi Alt prøvemateriale blev udstrøget på blodagerplader (5 % kalveblod) inden for 8 timer efter indsamling. Vækst blev evalueret efter 24 timers inkubation ved 37 C. Fra vaginal- og endometrieprøver blev udelukkende vækst i renkultur anset som positiv vækst, og i dette studie blev renkultur defineret ved at 90 % af kolonierne på pladen var af samme art. Klitorisprøverne viste hyppigst vækst i blandingskultur, hvilket var forventet på grund af eksponering overfor hoppens ydre omgivelser, fæces mv. Kolonier med hæmolyse og morfologi som S. zooepidemicus blev isoleret og karakteriseret yderligere. Fra alle plader, uanset prøvelokalisation, med positiv vækst af S. zooepidemicus, isoleredes om muligt tre individuelle kolonier, som blev subkultiveret på en ny blodagarplade for at etablere monokultur af hvert enkelt isolat. Alle isolater blev identificeret som S. zooepidemicus ud fra kolonimorfologi, mikroskopi, negativ kaliumhydroxidtest samt evnen til at fermentere lactose, sorbitol og ribose, men ikke trehalose. Ethvert isolat af S. zooepidemicus blev herefter inkuberet i BHI bouillon i 24 timer ved 37 C, før de opbevares nedfrosset ved -80 C. Fryseblandingen består af 300 µl 50 % glycerol og 700 µl BHI-overnatskultur. Molekylær typning Alle isolater er karakteriseret ved PFGE som beskrevet i tidligere afsnit. Hvert isolat indstøbes i agaroseblokke (Certified Megabase Agarose, Biorad Laboratories), og blokkene inkuberes natten over med lysisbuffer og mutanolysin (Sigma-Aldrich ) ved 37 C for at opnå lysis af bakteriecellerne. Efter vask af blokkene i TE-buffer, tilsættes ES-buffer Figur 1. Dendrogram indeholdende 88 S. zooepidemicus isolater isoleret fra kønsorganerne hos 29 individuelle hopper samt visning af tilhørende geler. Isolaterne falder i to hovedgrupper bestående af hhv. isolater fra uterus og isolater fra de nedre kønsveje. Isolater anses for klonale, når antallet af bånd samt disses størrelse er ens eller kun afviger med et enkelt bånd. Når antallet af bånd eller disses størrelse afviger med 2-3 bånd mellem isolater anses disse for tæt relaterede kloner. Når dette antal af afvigende bånd stiger til 4-6 bånd, er isolaterne sandsynligvis relaterede, mens afvigelser på 7 eller flere bånd betyder, at isolaterne ikke er relaterede til hinanden (14). 20 Dansk Veterinærtidsskrift oktober Nummer 20 Årgang 93

4 Klitoris Vagina Uterus Klitoris Vagina Uterus Simpsons index (D) 0,045 0,065 0,058 Tabel 1. Værdi af Simpsons indeks for hver af de tre anatomiske isolationssteder. 0 = ultimativ høj diversitet. 1 = komplet klonalitet. Den anvendte formel er: D = n(n-1) / N (N-1). S. zooepidemicus (6/9) 67 % (4/8) 50 % (0/11) 0 % Tabel 2. Andelen af hopper hvorfra der kunne isoleres mere end én klon fra de respektive anatomiske lokalisationer, når mere end ét isolat blev karakteriseret per hoppe pr. isolationssted. og proteinase K (Roche Diagnostics), og anvendelse af Gelcompar er der i alt er bakterien isoleret fra såvel vagina blokkene inkuberes natten over ved fundet 44 forskellige PFGE-profiler. Den som uterus. Hos alle tre hopper fin- 56 C. Tilsætning af proteinase K sikrer visuelle vurdering har i enkelte tilfæl- des vaginalstammerne at være gene- nedbrydning af protein og derved pro- de vægtet mere end sammenligningen tisk forskellige fra stammer isoleret fra teinkontaminering i prøven. Blokkene i Gelcompar, idet de 88 isolater er kørt endometriet. vaskes i TE-buffer og skæres herefter i på fem forskellige geler. En svaghed Hos fire hopper (010B, 018B, 019B, stykker på 1-3 mm. Disse stykker læg- ved PFGE er, at det kan være vanskeligt 019H) blev S. zooepidemicus isolater fra ges i bufferblanding i to gange en halv at sammenligne mellem geler, idet der klitoris og vagina, men ikke uterus ka- time, før de tilsættes restriktionsenzym- ikke anvendes markør i alle baner, og rakteriseret, hvor det ved tre ud af fire blandingen. Det anvendte restriktionsen- normalisering mellem forskellige geler var muligt at isolere den samme klon fra zym er SmaI (New England Biolabs). derfor kan være umulig. begge anatomiske lokalisationer. Stykkerne i enzymblandingen inkube- Når de tre isolationssteder analyse- Der ses en stigende grad af genetisk res natten over ved 25 C, hvorefter de res hver for sig findes en høj genetisk diversitet, jo længere caudalt i kønsor- vaskes i TE-buffer og loades i agarose- diversitet mellem hopperne. Dette kan ganerne prøven udtages. Alle undersøg- gel (Seakem GTG Agarose, Lonza). Kørs- matematisk vises ved at udregne Simp- te hopper havde kun en klon repræsen- len foregår over 20 timer ved 5,6 volt sons indeks (D) for hvert isolationssted teret i endometriet, mens 50 % (4/8) af pr. cm. Anvendt buffer under kørslen er (tabel 1). Resultatet af dette indeks lig- hopperne, hvorfra der kunne isoleres en 0,5 x TB opløsning. ger mellem 0 og 1, hvor 0 er lig med mere end et isolat af S. zooepidemicus Resultater er analyseret ved hjælp af ultimativ høj genetisk diversitet, mens fra vagina, havde mere end en klon re- programmet Gelcompar (Applied Maths, 1 er lig med komplet klonalitet. Af ta- præsenteret. Klitorisisolaterne viste, at Belgien). Gelen er normaliseret ved an- bel 1 ses, at alle tre beregnede indeks 67 % (6/9) havde mere end en klon re- vendelse af markøren Midrange II PFG ligger relativt tæt på 0, hvilket betyder, præsenteret (tabel 2). Markers (New England Biolabs). Alle bånd er manuelt udvalgte. Bestemmel- at den genetiske diversitet er høj imellem hopper, når isolater sammenlignes Diskussion se af klonalitetsgraden er kalkuleret ved inden for klitoris-, indenfor vagina- og Det kan på baggrund af resultaterne i hjælp af Pearson-koefficienten, og til inden for uterusisolater (tabel 1). nærværende studie konkluderes, at di- klusteranalyse er anvendt Unweighted 12 hopper blev diagnosticeret med versiteten blandt de karakteriserede S. Pair group Method using Aritmetic ave- infektiøs endometritis forårsaget af S. zooepidemicus er høj, når der sammen- rages (UPGMA). zooepidemicus. Heraf blev der isoleret lignes mellem hopper. Der findes altså Resultater og karakteriseret mere end et isolat fra 92 % (11/12 hopper). Ved sammenlig- forskellige kloner hos forskellige hopper. Dette stemmer overens med resul- I alt 88 isolater af S. zooepidemicus fra ning af uterusisolaterne mellem forskel- tater i andre studier (6,7,8), og kan for- 29 forskellige hopper blev karakterise- lige hopper ses der også en høj gene- klares ved,at den undersøgte bakterie rede i dette studie. 31 isolater blev iso- tisk diversitet, men når uterusisolater- er vidt udbredt i hestenes nærmiljø og lerede fra endometriet, mens hhv. 26 ne sammenlignes inden for den enkelte er naturligt forekommende i de øvre isolater stammede fra vagina og 31 iso- hoppe findes stammerne at være klo- luftveje og nedre reproduktionsorganer later fra fossa clitoridis. Blot et isolat nale hos samtlige hopper (11/11 = 100 (5,9). Bakterien har en evne til konstant (1/89) kunne ikke karakteriseres med %). (Figur 1). Det er for en enkelt hoppe at tilpasse sig og kan forårsage infek- den anvendte PFGE-procedure, og det i studiet (022H) lykkedes at isolere S. tion adskillige steder i en organisme, konkluderes, at den anvendte procedu- zooepidemicus fra alle tre anatomiske samt inficere flere forskellige værtsar- re har en høj typbarhed til genotypning lokalisationer. Her findes isolaterne fra ter, heriblandt heste og mennesker, hvil- af S. zooepidemicus isoleret fra hoppens hhv. klitoris og vagina at være klona- ket ydermere gør det vanskeligt at pro- kønsorganer. le, mens disse er genetisk forskellige ducere brugbare vacciner (5,10). Når samtlige isolater sammenlignes fra den klon, der isoleres fra endome- Resultaterne i nærværende studie in- ses en høj overordnet genetisk diversitet (Figur 1). Ved visuel vurdering og triet (Figur 1). Hos tre hopper (035B, 030B, 001G) dikerer ligeledes, at uterusisolater fra samme hoppe er klonale, hvilket stem- > Dansk Veterinærtidsskrift oktober Nummer 20 Årgang 93 21

5 ORIgINALARTIKEL (5) Timoney, J. F. (2004). The pathogenic quine streptococci. Vet. Res. 35: (6) Bindslev, M.M., Villumsen, M. H., Petersen, M.R., Nielsen, J.M., Bøgh, I.B., Bojesen, A.M. (2008): Genetic diversity of S. equi subsp. zooepidemicus and E. coli isolated from the reproductive tract of the mare [Conference proceeding]. ICAR, June, Budapest, Hungary. (7) Luque, I., Fernandez-Garayzabal, J. F., Blume, V., Maldonado, A., Astorga, R., Tarradas, C. (2006). Molecular typing and antimicrobial susceptibility of clinical isolates of Streptococcus equi ssp. Zooepidemicus from equine bacterial endometritis. J. Vet. Med. 53: (8) Kuroiwa, Y., Anzai, T., Higuchi, T., Sawada, T.(2006). A PCR-RFLP analyses of the SZP gene in Streptococcus Zooepidemer overens med resultater fundet af Kuroiwa et al. (2006), men er modstridende med resultater fundet af Bindslev et al. (2008) og Luque et al. (2006). I nærværende studie adskiller uterusisolaterne sig genetisk fra stammer, som er isolerede andre steder i kønsorganerne. Dette indikerer, at det er afgørende for kvaliteten af en endometriebiopsi eller svaber, at prøven udtages sterilt uden kontaminering fra de distale dele af kønsorganerne, idet der herved højst sandsynligt isoleres en anden klon end den som forårsager infektion i endometriet. Hvor betydningsfuldt dette er rent behandlingsmæssigt, må afgøres ved resistensundersøgelse af de enkelte kloner. Dette fund stiller spørgsmålstegn ved den udbredte opfattelse af, at infektion i uterus skyldes en ascenderende infektion. Der kan spekuleres i, hvorvidt en infektion i uterus kan opstå på anden vis end ved en ascenderende infektion fx ved en hæmatogen spredning fra andre lokalisationer, som eksempelvis luftvejene. Kuroiwa et al. (2006) finder at 41 % af analyserede SzP-genotyper af S. zooepidemicus isoleret fra endometriet kan genfindes i luftvejene hos heste (8). Fortsat forskning i patogenesen for bakteriel endometritis er derfor nødvendig for at afklare dette forhold. Hopper med endometritis udviser ikke symptomer på septikæmi, hvilket indikerer, at det højst sandsynligt er tilstedeværelsen af bestemte virulensfaktorer, som gør de enkelte kloner i stand til at inficere såvel endometriet som luftvejene hos heste. Det skal ligeledes bemærkes, at det ikke kan udelukkes, at identiske kloner findes i vagina og på klitoris hos hopper med endometritis, trods resultaterne i dette studie, men at de blot ikke har været blandt de tre kolonier, som er tilfældigt udvalgte fra hver plade med positiv vækst af S. zooepidemicus. På baggrund af disse observationer vil en fortsat genotypisk og molekylærbiologisk karakterisering af uterusisolater og deres virulensfaktorer være indiceret. Af figur 1 ses det, at 24/31 uterusisolater danner en klynge, hvilket indikerer, at de i denne gruppe er indbyrdes tættere genetisk relaterede, end de er til de resterende isolater præsenteret i figuren. Dette til trods for, at isolaterne er isoleret fra individuelle hopper uden epidemiologisk relation. Disse observationer kunne indikere, at uteruskloner er i besiddelse af bestemte egenskaber, der gør dem i stand til at etablere en infektion i endometriet, men at det ikke er en specifik klon, som alene er ansvarlig for infektioner i uterus blandt forskellige hopper. Fx finder Kuroiwa et al. (2006) 16 forskellige SzP-profiler ved PCR-RFLP analyse af 55 isolater af S. zooepidemicus, isoleret fra cervix hos hopper med metritis. Dette indikerer, at SzP-proteinets»udseende«ikke er afgørende for patogenesen, men SzP-proteinet anses fortsat som en afgørende virulensfaktor (8,11). Andre studier finder ligeledes ingen sammenhæng mellem SzP-proteinets sammensætning og bestemte lidelser hos heste (12). Relationen mellem genotype og bakteriens evne til at etablere infektion i endometriet er endnu uafklaret, og videre forskning på området er nødvendig for at afgøre, om der er en sammenhæng. Dette studie indikerer, at de distale afsnit af kønsorganerne hos hopper huser S. zooepidemicus med en højere genetisk diversitet end i uterus, hvilket stemmer overens med resultater fundet af Bindslev et al. (2008). At diversiteten på klitoris er størst, kan forklares med dennes umiddelbare eksponering for hoppens fæces og omgivelser. Vulva og den vaginovestibulære sphincter beskytter vagina mod kontaminering (9), mens den anatomiske barriere mellem vagina og uterus er cervix. Da identiske kloner kan genfindes på klitoris og i vagina, men ikke i uterus, indikerer resultaterne, at cervix er den vigtigste anatomiske barriere for beskyttelse mod ascenderende infektion. Dette er i modstrid med konklusioner af Hinrichs et al. (1988), der konkluderer, at den vaginovestibulære sphincter er af størst betydning, idet de ikke er i stand til at isolere opportunistiske patogener fra vagina og uterus hos raske hopper. Forskellen mellem nærværende studie og resultaterne fundet af Hinrichs et al. Referencer (1) Albihn, A., Baverud, V., Magnusson, U. (2003). Uterine microbiology and antimicrobial susceptibility in isolated bacteria from mares with fertility problems. Acta Veterinaria Scandinavica. 44(3/4): (2) Dimock, W. V. & Edwards, P. R. (1928). Pathology and bacteriology of the reproductive organs of mares in relation to sterility. Research Bulletin of the Kentucky Agricultural Experimental Station. 286: (3) Bain, A. M. (1966). The role of infection in infertility in the thoroughbred mare. The veterinary record. 78(5): (4) Nielsen, J.M. (2005). Endometritis in the mare: a diagnostic study comparing cultures from swab and biopsy. Theriogenology. 64(3): micus isolates from mares with metritis in Japan. Journal Equine science. 17(4): (9) Hinrichs, K., Cummings, M. R., Sertich, P. L., Kenney, R. M. (1988). Clinical significance of aerobic bacterial flora of the uterus, vagina, vestibule and clitoral fossa of clinically normal mares. Journal of the American veterinary medical association. 193(1): (10) Waller, A. S. (2010). Protecting against Streptococcus zooepidemicus opportunism: The challenge of vaccine design. Guest editorial. The veterinary journal 184: (11) Wittenbrink, M. M., Hoelzle, K., Hoelzle, L. E. (2008). What s new in bacteriology of the mare's genital tract. Pferdeheilkunde (January/February): Dansk Veterinærtidsskrift oktober Nummer 20 Årgang 93

6 IN memoriam (1988) kan muligvis forklares ved, at studiet af Hinrichs et al. (1988) udelukkende er baseret på raske hopper uden kliniske symptomer eller anamnese om reproduktionsproblemer, mens nærværende studie hovedsagelig er baseret på hopper med symptomer på endometritis og/eller lav drægtighedsprocent. Disse iagttagelser henleder opmærksomheden på, at etablering af infektion i uterus sandsynligvis er et samspil mellem bakterielle faktorer og hoppens anatomiske og immunologiske status. Konklusion Blandt isolater af S. zooepidemicus, isoleret fra hoppens kønsorganer, findes en høj genetisk diversitet, når disse sammenlignes mellem forskellige hopper. Derimod findes uterusisolater at være klonale inden for hver enkelt hoppe. Dette afkræfter hypotesen om, at én bestemt klon af S. zooepidemicus er ansvarlig for infektion i endometriet, men det tyder på, at de kloner, som forårsager infektion, har bestemte egenskaber, der adskiller dem fra isolater fra hhv. vagina og klitoris. Flere studier, som omhandler diversitet, identifikation af virulensfaktorer samt faktorer som påvirker hoppens modtagelighed for infektion, er nødvendige før patogenesen for endometritis, forårsaget af S. zooepidemicus, kan endelig forklares. (12) Walker, R. L. & Runyan, C. A. (2003). Idenfification of variations in SzP proteins of Streptococcus equi subspecies zooepidemicus and the relationship between protein variants and clinical signs of infection in horses. AJVR, vol 64, No. 8, August (13) Blobel, H., Wleklinski, C. G., Blobel, K. (1980). Detection of beta-haemolytic streptococci in cervix and clitoris swab samples from mares. Tierärzliche Umschau. 35(12): , 830. (14) Tenover, F. C, Arbeit, R. D., Goering, R. V. (1995). Interpreting chromosomal DNA restriction patterns produced by Pulsed-Field gel electrophoresis: Criteria for bacterial strain typing. J. Clin. Microbiol. 33(9): Dansk Veterinærtidsskrift oktober Nummer 20 Årgang 93 23

Introduktion. Endometritis er en hyppig årsag til infertilitet

Introduktion. Endometritis er en hyppig årsag til infertilitet ORIGINALARTIKEL Sammendrag Bakteriel endometritis er en af de hyppigste årsager til infertilitet hos hoppen og ofte betinget af de opportunistiske patogener, Streptococcus equi subspecies zooepidemicus

Læs mere

Real-Time PCRs anvendelse til diagnostik af endometritis hos hopper

Real-Time PCRs anvendelse til diagnostik af endometritis hos hopper ORIGINALARTIKEL Real-Time PCRs anvendelse til diagnostik af endometritis hos hopper Påvisning af Streptococcus equi subspecies zooepidemicus og Streptococcus equi subspecies equi i endometrieprøver fra

Læs mere

Biocide resistance in Salmonella Typhimurium

Biocide resistance in Salmonella Typhimurium FACULTY OF HEALTH AND MEDICAL SCIENCES UNIVERSITY OF COPENHAGEN PhD thesis Mette Rørbæk Gantzhorn Biocide resistance in Salmonella Typhimurium Academic advisor: Line Elnif Thomsen This thesis has been

Læs mere

PCR (Polymerase Chain Reaction): Opkopiering af DNA

PCR (Polymerase Chain Reaction): Opkopiering af DNA PCR (Polymerase Chain Reaction): Opkopiering af DNA PCR til at opkopiere bestemte DNA-sekvenser i en prøve er nu en af genteknologiens absolut vigtigste værktøjer. Peter Rugbjerg, Biotech Academy PCR (Polymerase

Læs mere

Sammendrag Den mest effektive måde til at nedbringe forekomst af Salmonella på mørbrad er at undgå kontamination på slagtegangen.

Sammendrag Den mest effektive måde til at nedbringe forekomst af Salmonella på mørbrad er at undgå kontamination på slagtegangen. Rapport Optimering af hygiejne ved håndtering af mørbrad 23. december 2015 Proj.nr.:2003021-15 Version 1 VHR/HCH Fedtendeskubber indflydelse på kimtal på mørbrad og i bækkengang Vinnie H. Rasmussen & Hardy

Læs mere

En forsker har lavet et cdna insert vha PCR og har anvendt det følgende primer sæt, som producerer hele den åbne læseramme af cdna et:

En forsker har lavet et cdna insert vha PCR og har anvendt det følgende primer sæt, som producerer hele den åbne læseramme af cdna et: F2011-Opgave 1. En forsker har lavet et cdna insert vha PCR og har anvendt det følgende primer sæt, som producerer hele den åbne læseramme af cdna et: Forward primer: 5 CC ATG GGT ATG AAG CTT TGC AGC CTT

Læs mere

Regnskovens hemmeligheder

Regnskovens hemmeligheder Center for Undervisningsmidler, afdeling København Regnskovens hemmeligheder Øvelsesvejledning Formål Et gen for et kræfthelbredende protein er blevet fundet i nogle mystiske blade i regnskoven. Forskere

Læs mere

Respirationsvejslidelser - kalve. Kvægkursus Kjellerup 22-23. Oktober 2015 Lars Erik Larsen Veterinærinstituttet DTU

Respirationsvejslidelser - kalve. Kvægkursus Kjellerup 22-23. Oktober 2015 Lars Erik Larsen Veterinærinstituttet DTU Respirationsvejslidelser - kalve Kvægkursus Kjellerup 22-23. Oktober 2015 Lars Erik Larsen Veterinærinstituttet DTU 2 Respirationsvejslidelser er multifaktorielle! Kenneth Krogh design 3 Luftvejs smitstoffernes

Læs mere

Børbetændelse hos køer

Børbetændelse hos køer Børbetændelse hos køer Jørgen Agerholm Professor i Veterinær Reproduktion og Obstetrik LVK Årsmøde 2014 Hvorfor får en ko børbetændelse?? Dias 2 Hvorfor får en ko børbetændelse???? Koens immunitet Forurening

Læs mere

3 PRRS-STABILE SOHOLD LEVEREDE HVER 10 HOLD PRRS-FRI SMÅGRISE

3 PRRS-STABILE SOHOLD LEVEREDE HVER 10 HOLD PRRS-FRI SMÅGRISE 3 PRRS-STABILE SOHOLD LEVEREDE HVER 10 HOLD PRRS-FRI SMÅGRISE ERFARING NR. 1404 Tre besætninger producerede hver 10 hold PRRS-fri smågrise, selvom soholdet var PRRS-positivt. Dette var muligt på trods

Læs mere

Diagnosticering af Clostridium perfringens type C infektion i neonatale grise

Diagnosticering af Clostridium perfringens type C infektion i neonatale grise Diagnosticering af Clostridium perfringens type C infektion i neonatale grise med real-time PCR og ELISA DVHS 3. maj 2013 Speciale af cand.med.vet. Camilla Bjørn Olesen 1 De næste 25 min Baggrund Formål

Læs mere

Test dit eget DNA med PCR

Test dit eget DNA med PCR Test dit eget DNA med PCR Navn: Forsøgsvejledning Side 1 af 8 Formål med forsøget Formålet med dette forsøg er at undersøge jeres arvemateriale (DNA) for et transposon kaldet Alu. Et transposon er en DNA

Læs mere

SUNDHEDSOVERVÅGNING AF KLIMAGRISE OG SLAGTESVIN

SUNDHEDSOVERVÅGNING AF KLIMAGRISE OG SLAGTESVIN SUNDHEDSOVERVÅGNING AF KLIMAGRISE OG SLAGTESVIN NOTAT NR. 1811 Løbende overvågning af smitstoffer kan være et nyttigt supplement og værktøj til den veterinære rådgivning i svinebesætninger. Det viser en

Læs mere

BEGRÆNSET GENETISK VARIATION I PRRS OVER TID HOS GRISE I VÆKST

BEGRÆNSET GENETISK VARIATION I PRRS OVER TID HOS GRISE I VÆKST BEGRÆNSET GENETISK VARIATION I PRRS OVER TID HOS GRISE I VÆKST MEDDELELSE NR. 1022 Der var meget lidt genetisk variation blandt de PRRS-virus, som kunne isoleres i 3 danske besætninger i løbet af 6-11

Læs mere

Test dit eget DNA med PCR

Test dit eget DNA med PCR Test dit eget DNA med PCR Navn: Forsøgsvejledning Side 1 af 8 Formål med forsøget Formålet med dette forsøg er at undersøge jeres arvemateriale (DNA) for et transposon kaldet Alu. Et transposon er en DNA-sekvens,

Læs mere

Clostridium difficile. Klinisk Mikrobiologisk Afdeling

Clostridium difficile. Klinisk Mikrobiologisk Afdeling Clostridium difficile Klinisk Mikrobiologisk Afdeling Clostridium difficile - CD Tarmbakterie Sporedannende Reservoir Tarmflora Omgivelser Kontaktsmitte Fæko-orale rute Forekomst CD forekommer i normal

Læs mere

Evaluering af Soltimer

Evaluering af Soltimer DANMARKS METEOROLOGISKE INSTITUT TEKNISK RAPPORT 01-16 Evaluering af Soltimer Maja Kjørup Nielsen Juni 2001 København 2001 ISSN 0906-897X (Online 1399-1388) Indholdsfortegnelse Indledning... 1 Beregning

Læs mere

Analyse af proteiner Øvelsesvejledning

Analyse af proteiner Øvelsesvejledning Center for Undervisningsmidler, afdeling København Analyse af proteiner Øvelsesvejledning Formål At separere og analysere proteiner i almindelige fødevarer ved brug af gelelektroforese. Teori Alle dele

Læs mere

Test dit eget DNA med PCR

Test dit eget DNA med PCR Test dit eget DNA med PCR Navn: Forsøgsvejledning Formål med forsøget Formålet med dette forsøg er at undersøge jeres arvemateriale (DNA) for et transposon kaldet Alu. Et transposon er en DNA sekvens,

Læs mere

RAPPORT Karakteristik af tangtag nedbrydelighed og kemisk sammensætning

RAPPORT Karakteristik af tangtag nedbrydelighed og kemisk sammensætning RAPPORT Karakteristik af tangtag nedbrydelighed og kemisk sammensætning Forfattere: Lektor Erik Kristensen og Professor Marianne Holmer, Biologisk Institut, Syddansk Universitet, Campusvej 55, 523 Odense

Læs mere

SMITTESPORING MED MIKROBIOLOGISKE METODER nye muligheder med fuldgenom-sekvensering

SMITTESPORING MED MIKROBIOLOGISKE METODER nye muligheder med fuldgenom-sekvensering SMITTESPORING MED MIKROBIOLOGISKE METODER nye muligheder med fuldgenom-sekvensering Eva Møller Nielsen cand.brom., PhD Sektionsleder, Fødevarebårne Infektioner Afdeling for Mikrobiologi og Infektionskontrol

Læs mere

Basal mikrobiologi Smitteveje og smittemåder Mette Winther Klinisk Mikrobiologisk Afdeling

Basal mikrobiologi Smitteveje og smittemåder Mette Winther Klinisk Mikrobiologisk Afdeling Basal mikrobiologi Smitteveje og smittemåder 07.05.2018 Mette Winther Klinisk Mikrobiologisk Afdeling MIKROBIOLOGI - Virus - Bakterier - Svampe - Parasitter - Prioner Virus generelle egenskaber Mindre

Læs mere

Projektbeskrivelse. Er som ordet siger en beskrivelse af ens forskningsprojekt Kan anvendes inden man går i gang med et projekt

Projektbeskrivelse. Er som ordet siger en beskrivelse af ens forskningsprojekt Kan anvendes inden man går i gang med et projekt Er som ordet siger en beskrivelse af ens forskningsprojekt Kan anvendes inden man går i gang med et projekt Til at få ens projekt godkendt (projekter under studiet, bachelor, speciale, ph.d.) Til at søge

Læs mere

ORDINÆR EKSAMEN I EPIDEMIOLOGISKE METODER IT & Sundhed, 2. semester

ORDINÆR EKSAMEN I EPIDEMIOLOGISKE METODER IT & Sundhed, 2. semester D E T S U N D H E D S V I D E N S K A B E L I G E F A K U L T E T K Ø B E N H A V N S U N I V E R S I T E T B l e g d a m s v e j 3 B 2 2 0 0 K ø b e n h a v n N ORDINÆR EKSAMEN I EPIDEMIOLOGISKE METODER

Læs mere

Partiel genetisk karakterisering af PRRSV påvist i indsendelse fra Hatting Juli/august 2019 foreløbige resultater

Partiel genetisk karakterisering af PRRSV påvist i indsendelse fra Hatting Juli/august 2019 foreløbige resultater Partiel genetisk karakterisering af PRRSV påvist i indsendelse fra Hatting Juli/august 2019 foreløbige resultater Revideret: 18.08. 2019 Lars Erik Larsen, KU/DTU (lael@sund.ku.dk) Bidrag fra: Lise Kvisgaard,

Læs mere

Alfa-1-antitrysin mangel hos børn. Elisabeth Stenbøg, Afd.læge, PhD Børneafd. A, AUH

Alfa-1-antitrysin mangel hos børn. Elisabeth Stenbøg, Afd.læge, PhD Børneafd. A, AUH Alfa-1-antitrysin mangel hos børn Elisabeth Stenbøg, Afd.læge, PhD Børneafd. A, AUH Hvad er det? Alfa-1-antitrypsin Proteinstof Produceres i leveren Fungerer i lungerne Regulerer neutrofil elastase balancen

Læs mere

Test dit eget DNA med PCR

Test dit eget DNA med PCR Test dit eget DNA med PCR Forsøgsvejledning Navn: Side 1 af 7 Formål med forsøget Formålet med dette forsøg er at undersøge jeres arvemateriale (DNA) for et transposon kaldet Alu. Et transposon er en DNA

Læs mere

Projektet formål var at tilvejebringe velbegrundede forslag til ændringer ved plucksudtagning, som kan reducere spredning af Salmonella.

Projektet formål var at tilvejebringe velbegrundede forslag til ændringer ved plucksudtagning, som kan reducere spredning af Salmonella. Rapport Reduktion af salmonellaspredning ved plucksudtagning Slut-rapport Jannie Bøegh-Petersen & Flemming Hansen 21. dec 2015 2003019-15 JBOE/FH Sammendrag Baggrund Mundhule og svælg er sammen med blindtarm

Læs mere

Skriftlig re eksamen august 2017 Digital stedprøve

Skriftlig re eksamen august 2017 Digital stedprøve Skriftlig re eksamen august 2017 Digital stedprøve Titel på kursus: Uddannelse: Reproduktionsorganernes endokrinologi Medicin og medicin med industriel specialisering Semester: 4. semester Eksamensdato:

Læs mere

Elevvejledning pglo transformation

Elevvejledning pglo transformation Introduktion til transformation Elevvejledning pglo transformation I denne øvelse skal du lære fremgangsmåden ved genetisk transformation. Husk på, at et gen er et stykke DNA, der indeholder informationer

Læs mere

Clostridium difficile - CD

Clostridium difficile - CD Clostridium difficile - CD Tarmbakterie Sporedannende Reservoir Tarmflora Omgivelser Kontaktsmitte Fæko-orale rute Forekomst CD forekommer i normal tarmflora hos Børn < 2 år 50 % Raske voksne 3 % Hos indlagte

Læs mere

Biotechnology Explorer. Protein Fingerprinting

Biotechnology Explorer. Protein Fingerprinting Biotechnology Explorer Protein Fingerprinting Instruktionsmanual Katalognummer 166-0100EDU explorer.bio-rad.com Delene i dette kit er sendt i seperate æsker. Opbevar proteinstandarderne i fryseren, ved

Læs mere

RAPPORT Karakteristik af tangtag nedbrydelighed og kemisk sammensætning

RAPPORT Karakteristik af tangtag nedbrydelighed og kemisk sammensætning RAPPORT Karakteristik af tangtag nedbrydelighed og kemisk sammensætning Forfattere: Lektor Erik Kristensen og Professor Marianne Holmer, Biologisk Institut, Syddansk Universitet, Campusvej 55, 523 Odense

Læs mere

Afholdt d. 23. maj 2019

Afholdt d. 23. maj 2019 DANMAP monitorering af antibiotikaforbrug og resistens - Og hvorfor det er så vigtigt at få infektionshygiejnen med Veterinary & food populations Design, adjustment & optimisation Laboratory analysis Data

Læs mere

Test dit eget DNA med PCR

Test dit eget DNA med PCR Test dit eget DNA med PCR Navn: Forsøgsvejledning Side 1 af 8 Formål med forsøget Formålet med dette forsøg er at undersøge jeres arvemateriale (DNA) for et transposon kaldet Alu. Et transposon er en DNA-sekvens,

Læs mere

MODERNE METAGENOMANALYSER MIKROBIEL NEDBRYDNING AF MILJØFREMMEDE STOFFER I JORD OG GRUNDVAND

MODERNE METAGENOMANALYSER MIKROBIEL NEDBRYDNING AF MILJØFREMMEDE STOFFER I JORD OG GRUNDVAND AARHUS UNIVERSITY DEPARTMENT OF ENVIRONMENTAL SCIENCE ENVIRONMENTAL MICROBIAL GENOMICS GROUP MODERNE METAGENOMANALYSER MIKROBIEL NEDBRYDNING AF MILJØFREMMEDE STOFFER I JORD OG GRUNDVAND Aarhus Universitet,

Læs mere

Reexam questions in Statistics and Evidence-based medicine, august sem. Medis/Medicin, Modul 2.4.

Reexam questions in Statistics and Evidence-based medicine, august sem. Medis/Medicin, Modul 2.4. Reexam questions in Statistics and Evidence-based medicine, august 2013 2. sem. Medis/Medicin, Modul 2.4. Statistics : ESSAY-TYPE QUESTION 1. Intelligence tests are constructed such that the average score

Læs mere

- men er det farligt for mennesker?

- men er det farligt for mennesker? Center for Hormonforstyrrende Center Hormonforstyrrende Stoffer Stoffer cehos.dk Hormonforstyrrende effekter - men er det farligt for mennesker? Anna-Maria Andersson biolog, centerleder og forsker ved

Læs mere

Patientinddragelse i forskning. Lars Henrik Jensen Overlæge, ph.d., lektor

Patientinddragelse i forskning. Lars Henrik Jensen Overlæge, ph.d., lektor Patientinddragelse i forskning Lars Henrik Jensen Overlæge, ph.d., lektor BMC Health Services Research 2014, 14:89 142 studies that described a spectrum of engagement Engagement was feasible in most settings

Læs mere

Screeningsundersøgelse af den danske slagtekyllingebestand for IB stamme D388

Screeningsundersøgelse af den danske slagtekyllingebestand for IB stamme D388 Screeningsundersøgelse af den danske slagtekyllingebestand for IB stamme D388 En screeningsundersøgelse af danske slagtekyllingebesætninger i månederne januar til april 2007 har vist, at IB stammen D388

Læs mere

DYNAMIK AF PRRS-VIRUS I 3 FORVENTLIGE PRRS-VIRUS-FRIE SOBESÆTNINGER

DYNAMIK AF PRRS-VIRUS I 3 FORVENTLIGE PRRS-VIRUS-FRIE SOBESÆTNINGER DYNAMIK AF PRRS-VIRUS I 3 FORVENTLIGE PRRS-VIRUS-FRIE SOBESÆTNINGER NOTAT NR. 17XX PRRS-virus blev påvist i alle tre sobesætninger på trods af diverse tiltag for at kontrollere PRRS. Ved nærmere undersøgelse

Læs mere

1 Idékatalog til øvelser: Bioanalytikeruddannelsen UCSJ, Parkvej 190, 4700 Næstved

1 Idékatalog til øvelser: Bioanalytikeruddannelsen UCSJ, Parkvej 190, 4700 Næstved 1 Idékatalog til øvelser: Bioanalytikeruddannelsen UCSJ, Parkvej 190, 2 Idékatalog til øvelser: Bioanalytikeruddannelsen UCSJ, Parkvej 190, Indhold Realtime PCR på β-actin... 3 CSI og retsgenetik... 3

Læs mere

Velkommen. Test dit eget DNA med PCR. Undervisningsdag på DTU Systembiologi. Undervisere:

Velkommen. Test dit eget DNA med PCR. Undervisningsdag på DTU Systembiologi. Undervisere: Velkommen Test dit eget DNA med PCR Undervisningsdag på DTU Systembiologi Undervisere: Hvem er I? 2 DTU Systembiologi, Danmarks Tekniske Universitet Hvilke baser indgår i DNA? A. Adenin, Guanin, Cytosin,

Læs mere

Kan mikrobiologiske plantebeskyttelsesmidler give mave-problemer?

Kan mikrobiologiske plantebeskyttelsesmidler give mave-problemer? Kan mikrobiologiske plantebeskyttelsesmidler give mave-problemer? Det er et åbent spørgsmål, om nogle af de mikrobiologiske bekæmpelsesmidler kan give sygdomme. Det er derfor nødvendigt at have eksperimentelle

Læs mere

Forsøgsprotokol til larveforsøg: Tilsætning af 3 dage gamle larver til gødning inficeret med patogene bakterier

Forsøgsprotokol til larveforsøg: Tilsætning af 3 dage gamle larver til gødning inficeret med patogene bakterier Forsøgsprotokol til larveforsøg: Tilsætning af 3 dage gamle larver til gødning inficeret med patogene bakterier Formål: at undersøge udviklingen i mængden af tilsatte patogene bakterier til hønsegødning.

Læs mere

Special Pathology Department of Veterinary Disease Biology University of Copenhagen

Special Pathology Department of Veterinary Disease Biology University of Copenhagen Department of Veterinary Disease Biology Foreløbige resultater af ErhvervsPhD Nye rådgivningsværktøjer til håndtering af cystitis og urolitiasis hos mink optimering af forebyggelse og behandling Special

Læs mere

Cross-Sectorial Collaboration between the Primary Sector, the Secondary Sector and the Research Communities

Cross-Sectorial Collaboration between the Primary Sector, the Secondary Sector and the Research Communities Cross-Sectorial Collaboration between the Primary Sector, the Secondary Sector and the Research Communities B I R G I T T E M A D S E N, P S Y C H O L O G I S T Agenda Early Discovery How? Skills, framework,

Læs mere

Probiotika og foders indflydelse på sundheden hos økologisk regnbueørred OPTIFISH

Probiotika og foders indflydelse på sundheden hos økologisk regnbueørred OPTIFISH Probiotika og foders indflydelse på sundheden hos økologisk regnbueørred OPTIFISH www.fiskehuset.com Lone Madsen DTU Veterinærinstituttet OPTIFISH problemstilling Regnbueørred = dominerende opdrætsfisk

Læs mere

You decide if the examination will be held in Danish or in English. Censor is Dr. Peter Westermann, BioCentrum, Technical University of Denmark.

You decide if the examination will be held in Danish or in English. Censor is Dr. Peter Westermann, BioCentrum, Technical University of Denmark. Advanced Bacteriology 2007 Questions for final exam The final exam will take place Thursday November 1 2007 in Øvelsessal II, Sølvgade 83H (Øvelsessal II is found behind Øvelsessal III where teaching took

Læs mere

Afholdt d. 18. maj 2017

Afholdt d. 18. maj 2017 Diagnostiske muligheder: SSI perspektiv Anette M. Hammerum, Seniorforsker Referencelaboratoriet for Antibiotikaresistens Afdeling for Bakterier, Parasitter og Svampe Statens Serum Institut eller Brug af

Læs mere

Probiotika i akvakultur en strategi til forebyggelse af fiskesygdom

Probiotika i akvakultur en strategi til forebyggelse af fiskesygdom Bettina Spanggaard & Lone Gram Danmarks Fiskeriundersøgelser, Afdeling for Fiskeindustriel Forskning Probiotika i akvakultur en strategi til forebyggelse af fiskesygdom Sygdom hos fisk i opdræt behandles

Læs mere

Rapport. God slagtehygiejne ved høj hastighed. Bestemmelse af nølefase for udvalgte salmonella isolater. Hardy Christensen og Vinnie H.

Rapport. God slagtehygiejne ved høj hastighed. Bestemmelse af nølefase for udvalgte salmonella isolater. Hardy Christensen og Vinnie H. Rapport God slagtehygiejne ved høj hastighed 13. november 2013 Proj.nr. 2001472 Version 1 VHR/JUSS Bestemmelse af nølefase for udvalgte salmonella isolater Hardy Christensen og Vinnie H. Rasmussen Sammendrag

Læs mere

Påvisning af PCV2 Notat nr 1807

Påvisning af PCV2 Notat nr 1807 Downloaded from orbit.dtu.dk on: Jan 20, 2019 Påvisning af PCV2 Notat nr 1807 Neumann, Katrine; Buse, Katja Strøm; Hjulsager, Charlotte Kristiane; Nielsen, Gitte Blach; Nielsen, Søren Saxmose; Larsen,

Læs mere

Metodeafprøvning. Bestemmelse af coliforme bakterier og E. coli i spildevand. Naturstyrelsens Referencelaboratorium. Miljøanalyser

Metodeafprøvning. Bestemmelse af coliforme bakterier og E. coli i spildevand. Naturstyrelsens Referencelaboratorium. Miljøanalyser Metodeafprøvning Bestemmelse af coliforme bakterier og E. coli i spildevand Naturstyrelsens Referencelaboratorium for Mikrobiologiske Miljøanalyser Titel: Metodeafprøvning, bestemmelse af coliforme bakterier

Læs mere

Røntgenundersøgelser af columna lumbalis indblændning ved analog vs. digital teknik

Røntgenundersøgelser af columna lumbalis indblændning ved analog vs. digital teknik Røntgenundersøgelser af columna lumbalis indblændning ved analog vs. digital teknik Lars Göran Zetterberg MSC, radiograf, adjunkt Radiografuddannelsen, University College Nordjylland, Aalborg, Danmark

Læs mere

MISLYKKET FORSØG PÅ AT SANERE EN BESÆTNING MED SMÅGRISE OG SLAGTESVIN FOR PRRSV VED BRUG AF VACCINE

MISLYKKET FORSØG PÅ AT SANERE EN BESÆTNING MED SMÅGRISE OG SLAGTESVIN FOR PRRSV VED BRUG AF VACCINE MISLYKKET FORSØG PÅ AT SANERE EN BESÆTNING MED SMÅGRISE OG SLAGTESVIN FOR PRRSV VED BRUG AF VACCINE MEDDELELSE NR. 1017 Det lykkedes ikke at sanere en PRRSV-positiv besætning for PRRSV ved hjælp af en

Læs mere

DNA SOM STREGKODER FOR KOMPLEKSE MIKROBE MILJØER

DNA SOM STREGKODER FOR KOMPLEKSE MIKROBE MILJØER DNA SOM STREGKODER FOR KOMPLEKSE MIKROBE MILJØER Lars Hestbjerg Hansen, Sektionsleder EMBI @ENVS, @Århus Universitet Plantekongress Herning Jan 2019 1 I dag: Hvorfor er mikroorganismer vigtige i forhold

Læs mere

Vi går derfor ud fra, at I ved, at DNA molekyler er meget lange molekyler

Vi går derfor ud fra, at I ved, at DNA molekyler er meget lange molekyler DNA-profil analyse Indledning DNA-profil analyser eller i daglig tale DNA-fingeraftryk er en metode, der bruges, når man skal finde ud af, hvem der er far et barn, hvis der altså er flere muligheder. Det

Læs mere

Velkommen. Test dit eget DNA med PCR. Undervisningsdag på DTU Systembiologi. Undervisere: Sebastian, Louise og Ana

Velkommen. Test dit eget DNA med PCR. Undervisningsdag på DTU Systembiologi. Undervisere: Sebastian, Louise og Ana Velkommen Test dit eget DNA med PCR Undervisningsdag på DTU Systembiologi Undervisere: Sebastian, Louise og Ana Hvem er I? 2 DTU Systembiologi, Danmarks Tekniske Universitet Dagens program 9:00 10:00 Introduktion

Læs mere

NYT OM MRSA. Poul Bækbo og Karl Pedersen Kongres for Svineproducenter 2016

NYT OM MRSA. Poul Bækbo og Karl Pedersen Kongres for Svineproducenter 2016 NYT OM MRSA Poul Bækbo og Karl Pedersen Kongres for Svineproducenter 2016 FRYGTEN FOR ANTIBIOTIKARESISTENS MRSA driver processen 2.. MRSA Methicillin Resistent Staphylococcus Aureus (husdyrtypen = 398)

Læs mere

Oliver Hendricks Overlæge, ph.-d. Klinisk lektor Syddansk Universitet

Oliver Hendricks Overlæge, ph.-d. Klinisk lektor Syddansk Universitet Oliver Hendricks Overlæge, ph.-d. Klinisk lektor Syddansk Universitet Compounds which are chemically foreign or hostile to a biological system Eukaryotic drugs Other chemical compounds Drugs Eukaryotedirected

Læs mere

Basic statistics for experimental medical researchers

Basic statistics for experimental medical researchers Basic statistics for experimental medical researchers Sample size calculations September 15th 2016 Christian Pipper Department of public health (IFSV) Faculty of Health and Medicinal Science (SUND) E-mail:

Læs mere

Ikke-parametriske tests

Ikke-parametriske tests Ikke-parametriske tests 2 Dagens menu t testen Hvordan var det nu lige det var? Wilcoxson Mann Whitney U Kruskall Wallis Friedman Kendalls og Spearmans correlation 3 t-testen Patient Drug Placebo difference

Læs mere

Validering af molekylærbiologiske analyser. Marianne Antonius Jakobsen Afsnitsleder for molekylærbiologisk lab. Klinisk Immunologisk afdeling, OUH.

Validering af molekylærbiologiske analyser. Marianne Antonius Jakobsen Afsnitsleder for molekylærbiologisk lab. Klinisk Immunologisk afdeling, OUH. Validering af molekylærbiologiske analyser Marianne Antonius Jakobsen Afsnitsleder for molekylærbiologisk lab. Klinisk Immunologisk afdeling, OUH. Hvordan laver man en god validering? Standarden: Mere

Læs mere

Resistensovervågning i Danmark: DANMAP

Resistensovervågning i Danmark: DANMAP Resistensovervågning i Danmark: DANMAP Af læge Thomas Lund Sørensen, Statens Seruminstitut I juni 1995 bevilgede Sundhedsministeriet og det daværende Landbrugs- og Fiskeriministerium midler til at øge

Læs mere

LA-MRSA = Husdyr associeret MRSA

LA-MRSA = Husdyr associeret MRSA Udvalget for Fødevarer, Landbrug og Fiskeri 2010-11 FLF alm. del Bilag 171 Offentligt LA-MRSA = Husdyr associeret MRSA Robert Skov, overlæge Bakteriologisk Overvågning og Infektionshygiejne Statens Serum

Læs mere

Biofilmdannelse i ledningsnet populationssammensætning i vand- og biofilmprøver

Biofilmdannelse i ledningsnet populationssammensætning i vand- og biofilmprøver Biofilmdannelse i ledningsnet populationssammensætning i vand- og biofilmprøver Hans-Jørgen Albrechtsen, Adam C. Martiny*, Erik Arvin & Søren Molin* Institut for Miljø og Ressourcer, *BioCentrum, DTU,

Læs mere

LABORATORIEBASERET OVERVÅGNING AF SALMONELLA. Mia Torpdahl Fødevarebårne Infektioner Mikrobiologi & Infektionskontrol

LABORATORIEBASERET OVERVÅGNING AF SALMONELLA. Mia Torpdahl Fødevarebårne Infektioner Mikrobiologi & Infektionskontrol LABORATORIEBASERET OVERVÅGNING AF SALMONELLA Mia Torpdahl Fødevarebårne Infektioner Mikrobiologi & Infektionskontrol SALMONELLA OVERVÅGNINGEN Registrering: Laboratoriet: Registrering af patienter i TarmBakteriologisk

Læs mere

Spirokætose og Svinedysenteri Betydningen af infektion. Svinefagdyrlæge Kirsten Jensen, Novartis

Spirokætose og Svinedysenteri Betydningen af infektion. Svinefagdyrlæge Kirsten Jensen, Novartis Spirokætose og Svinedysenteri Betydningen af infektion Svinefagdyrlæge Kirsten Jensen, Novartis Spirokæter hvad er det for nogen? Familie af spiral formede bakterier Kan give sygdomme som Borreliose Syfilis

Læs mere

Mælkesyrebakterier og holdbarhed

Mælkesyrebakterier og holdbarhed Mælkesyrebakterier og holdbarhed Navn: Forsøgsvejledning Mælkesyrebakterier og holdbarhed Formål med forsøget Formålet med denne øvelse er at undersøge mælkesyrebakteriers og probiotikas evne til at øge

Læs mere

Effektmålsmodifikation

Effektmålsmodifikation Effektmålsmodifikation Mads Kamper-Jørgensen, lektor, maka@sund.ku.dk Afdeling for Social Medicin, Institut for Folkesundhedsvidenskab It og sundhed l 21. april 2015 l Dias nummer 1 Sidste gang Vi snakkede

Læs mere

Referencelaboratoriet for måling af emissioner til luften

Referencelaboratoriet for måling af emissioner til luften Referencelaboratoriet for måling af emissioner til luften Rapport nr.: 77 Titel Hvordan skal forekomsten af outliers på lugtmålinger vurderes? Undertitel - Forfatter(e) Arne Oxbøl Arbejdet udført, år 2015

Læs mere

Anlægsbærerundersøgelse ved autosomal recessive sygdomme

Anlægsbærerundersøgelse ved autosomal recessive sygdomme Holdningspapir Dansk Selskab for Medicinsk Genetik Anlægsbærerundersøgelse ved autosomal recessive sygdomme Holdningspapiret er udarbejdet i 2015 af en arbejdsgruppe nedsat af Dansk Selskab for medicinsk

Læs mere

Udtagning af prøver og forsendelse ved pyodermi, enteritis, urinvejsinfektioner og sepsis

Udtagning af prøver og forsendelse ved pyodermi, enteritis, urinvejsinfektioner og sepsis Udtagning af prøver og forsendelse ved pyodermi, enteritis, urinvejsinfektioner og sepsis 1. Prøvetagning ved pyodermi... 2 1.1. Hvornår...2 1.2. Hvilke læsioner udtages prøver fra...2 1.3. Hvordan udtages

Læs mere

Memo risiko analyse på deduster

Memo risiko analyse på deduster Memo risiko analyse på deduster To: All From: DEr CC: Date: January 6, 2015 Re: Risiko analyse på deduster. Indholdsfortegnelse: Indholdsfortegnelse:... 1 Formål:... 2 Risiko analyse:... 2 Risiko resultater

Læs mere

18. maj 2011 PRODUKTRESUMÉ. for. Canaural, øredråber, suspension 0. D.SP.NR. 3209. 1. VETERINÆRLÆGEMIDLETS NAVN Canaural

18. maj 2011 PRODUKTRESUMÉ. for. Canaural, øredråber, suspension 0. D.SP.NR. 3209. 1. VETERINÆRLÆGEMIDLETS NAVN Canaural 18. maj 2011 PRODUKTRESUMÉ for Canaural, øredråber, suspension 0. D.SP.NR. 3209 1. VETERINÆRLÆGEMIDLETS NAVN Canaural 2. KVALITATIV OG KVANTITATIV SAMMENSÆTNING 1 g suspension indeholder: Aktive stoffer:

Læs mere

Værd at vide om. Mykoplasma. (Almindelig lungesyge) Literbuen 9 2740 Skovlunde Telefon: 44 54 69 00 Telefax: 44 53 19 55 www.intervet.

Værd at vide om. Mykoplasma. (Almindelig lungesyge) Literbuen 9 2740 Skovlunde Telefon: 44 54 69 00 Telefax: 44 53 19 55 www.intervet. Værd at vide om Breathe better. Grow better. Mykoplasma (Almindelig lungesyge) Introduktion Mykoplasmalungesyge, også kaldet almindelig lungesyge, er en lungebetændelse der optræder hos slagtesvin. Infektionen

Læs mere

RINGANALYSE FINDER GOD ANALYSESIKKERHED FOR JODTAL

RINGANALYSE FINDER GOD ANALYSESIKKERHED FOR JODTAL RINGANALYSE FINDER GOD ANALYSESIKKERHED FOR JODTAL ERFARING NR. 1322 En ringanalyse med 6 laboratorier har vist god analysesikkerhed for fedtsyreprofiler og jodtal i foder og rygspæk. Den analysemæssige

Læs mere

BD CLED Agar / MacConkey II Agar (Biplate)

BD CLED Agar / MacConkey II Agar (Biplate) BRUGSANVISNING PLADEMEDIER KLAR TIL BRUG PA-257562.01 Rev.: Jan. 2016 BD CLED Agar / MacConkey II Agar (Biplate) TILSIGTET BRUG BD CLED Agar / MacConkey II Agar (Biplate) anvendes til mikrobiologisk urinanalyse.

Læs mere

Klinisk mikrobiologi

Klinisk mikrobiologi Klinisk mikrobiologi Kompetencemål for 1. år af hoveduddannelsesstilling 1, 2, 3, 4 og 5 Mål Konkretisering af mål Evalueringsstrategi Indsatsområder: Medicinsk ekspert: Prøvetagning, laboratoriediagnostik

Læs mere

Biokonservering af koldrøget laks

Biokonservering af koldrøget laks Af Lilian Nilsson og Lone Gram Afdeling for Fiskeindustriel Forskning, Danmarks Fiskeriundersøgelser Biokonservering af koldrøget laks - hvordan man forhindrer vækst af Listeria i fiskeprodukter er en

Læs mere

UNDERSØGELSE AF BESØGSTIDER

UNDERSØGELSE AF BESØGSTIDER UNDERSØGELSE AF BESØGSTIDER Hej Sundhedsvæsen, der er et partnerskab mellem Dansk Selskab for Patientsikkerhed og TrygFonden, vil med denne undersøgelse belyse nogle af på strukturelle barrierer, som begrænser

Læs mere

THERMABLATE BEHANDLINGSPROTOKOL TJEKLISTE FOR PATIENTUDVÆLGELSE

THERMABLATE BEHANDLINGSPROTOKOL TJEKLISTE FOR PATIENTUDVÆLGELSE TJEKLISTE FOR PATIENTUDVÆLGELSE INDIKATIONER FOR ANVENDELSE Thermablate EAS-systemet er en termal ballonablationsanordning beregnet til ablation af endometriemembranen i livmoderen hos kvinder, der lider

Læs mere

Mælkesyrebakterier og holdbarhed

Mælkesyrebakterier og holdbarhed Mælkesyrebakterier og holdbarhed Formål Formålet med denne øvelse er at undersøge mælkesyrebakteriers og probiotikas evne til at øge holdbarheden af kød ved at: 1. Undersøge forskellen på bakterieantal

Læs mere

Analyse og sammenligning af Hellmann og Pluvio nedbørsmålere

Analyse og sammenligning af Hellmann og Pluvio nedbørsmålere Klima- og Energiministeriet Analyse og sammenligning af Hellmann og Pluvio nedbørsmålere Data fra perioden 15. december 2009-15. oktober 2010 Peter Riddersholm Wang www.dmi.dk/dmi/tr10-16 København 2010

Læs mere

Epidemiologi og Biostatistik Opgaver i Biostatistik Uge 10: 13. april

Epidemiologi og Biostatistik Opgaver i Biostatistik Uge 10: 13. april Århus 8. april 2011 Morten Frydenberg Epidemiologi og Biostatistik Opgaver i Biostatistik Uge 10: 13. april Opgave 1 ( gruppe 1: sp 1-4, gruppe 5: sp 5-9 og gruppe 6: 10-14) I denne opgaveser vi på et

Læs mere

Øvelse med tarmkræftceller i kultur.

Øvelse med tarmkræftceller i kultur. Øvelse med tarmkræftceller i kultur. Baggrund Hver 3. dansker bliver ramt af kræft, inden de er blevet 75 år. Tyktarmskræft er den 3. hyppigste kræftform hos både mænd og kvinder, hvor henholdsvis 7.3

Læs mere

ELEVERS INTERESSE OG SELVTILLID I NATURFAGENE -OG I FREMTIDEN

ELEVERS INTERESSE OG SELVTILLID I NATURFAGENE -OG I FREMTIDEN ELEVERS INTERESSE OG SELVTILLID I NATURFAGENE -OG I FREMTIDEN 1. Oplæg på baggrund af artiklen: Nordic Students self-beliefs in science Publiceret som kapitel 4 i Northern Lights on TIMSS and PISA 2018

Læs mere

Naturstyrelsens Referencelaboratorium for Kemiske og Mikrobiologiske Miljømålinger NOTAT

Naturstyrelsens Referencelaboratorium for Kemiske og Mikrobiologiske Miljømålinger NOTAT Naturstyrelsens Referencelaboratorium for Kemiske og Mikrobiologiske Miljømålinger NOTAT Til: Følgegruppen for Naturstyrelsens Referencelaboratorium cc: Fra: Maj-Britt Fruekilde Dato: 26. november 2014

Læs mere

National Rådgivningstjeneste for MRSA fra dyr. Statens Serum Institut

National Rådgivningstjeneste for MRSA fra dyr. Statens Serum Institut National Rådgivningstjeneste for MRSA fra dyr Statens Serum Institut MRSA Methicillin Resistent Staphylococcus aureus STAFYLOKOKKER Mennesker bærer ofte S. aureus på huden og specielt i næsen - 20 % er

Læs mere

Personlig medicin: Styr på teknologien og de kloge hoveder

Personlig medicin: Styr på teknologien og de kloge hoveder Personlig medicin: Styr på teknologien og de kloge hoveder Onsdag den 26. oktober kl. 13:00 17:30 i Aulaen på Aarhus Universitet Hvordan sikrer vi os de kloge hoveder, vi skal bruge? Anders Børglum Professor

Læs mere

Dendrokronologisk Laboratorium

Dendrokronologisk Laboratorium Dendrokronologisk Laboratorium NNU rapport 5, 1997 STRANDGADE 3A, KØBENHAVN Nationalmuseets Marinarkæologiske Undersøgelser. Indsendt af Christian Lemée. Undersøgt af Aoife Daly og Niels Bonde. NNU j.nr.

Læs mere

Hyppigheds- og associationsmål. Kim Overvad Afdeling for Epidemiologi Institut for Folkesundhed Aarhus Universitet Februar 2011

Hyppigheds- og associationsmål. Kim Overvad Afdeling for Epidemiologi Institut for Folkesundhed Aarhus Universitet Februar 2011 Hyppigheds- og associationsmål Kim Overvad Afdeling for Epidemiologi Institut for Folkesundhed Aarhus Universitet Februar 2011 Læringsmål Incidens Incidens rate Incidens proportion Prævalens proportion

Læs mere

Dandy Walker Like Malformation

Dandy Walker Like Malformation Dandy Walker Like Malformation Speciale af Hedvig Christiansson and Evelina Kling Vegeby Præsenteret af Helle Friis Proschowsky Dyrlæge, Phd., Specialkonsulent hos DKK DWLM projektet 1. Hvad er DWLM 2.

Læs mere

PRØVEPROJEKTER - SLUTRAPPORT

PRØVEPROJEKTER - SLUTRAPPORT PRØVEPROJEKTER - SLUTRAPPORT E. coli ESBL i dansk slagtefjerkræ og kyllingekød Projekt J. nr.: 2010-20-64-00284 BAGGRUND Som det fremgår af DANMAP rapporterne fra 2010 og 2011, er der tidligere påvist

Læs mere

Hvordan bruges klovregistreringer - hornrelaterede lidelser?

Hvordan bruges klovregistreringer - hornrelaterede lidelser? Hvordan bruges klovregistreringer - hornrelaterede lidelser? Hvordan klovregistreringer bruges for Digital Dermatitis vises på side 4. For at køre et scenarie, hvori en reduktion af hornrelaterede lidelser

Læs mere

Reducer smittespredningen ved robotmalkning

Reducer smittespredningen ved robotmalkning Institut for Veterinær- og Husdyrvidenskab (IVH). Reducer smittespredningen ved robotmalkning Ilka Klaas Lektor Institut for Veterinær- og Husdyrvidenskab (IVH) Reducer smittespredning ved robotmalkning

Læs mere

Benchmarking på anbringelsesområdet i Aabenraa Kommune

Benchmarking på anbringelsesområdet i Aabenraa Kommune Benchmarking på anbringelsesområdet i Aabenraa Kommune Aabenraa Kommune har henvendt sig til for at få belyst, hvilke forhold der er afgørende for udgiftsbehovet til anbringelser, og for at få sat disse

Læs mere

Afholdt d. 17. november 2016

Afholdt d. 17. november 2016 MIKROBIOMET HVAD VED VI OM DET OG HVORDAN UNDERSØGER VI DET? Paal Skytt Andersen 1. Modtagelighed for sygdom 2. Metoder til at vise association 3. Tarmflora 4. Metoder til at karakterisere mikrobiomet

Læs mere

DGF møde, 28.11.2013 i Odense DS 1537 Jordankre Prøvning. Disposition

DGF møde, 28.11.2013 i Odense DS 1537 Jordankre Prøvning. Disposition DGF møde, 28.11.2013 i Odense DS 1537 Jordankre Prøvning Disposition Udførelse af jordankre: DS/EN 1537:2013 (indført 29/7 2013... ikke længere ny) Scope Bond type and compression type anchors Formål med

Læs mere