WPS / R day. Rune Juhl (DTU Technical University of Denmark. 11th December DTU Compute Department of Applied Mathematics and Computer Science
|
|
- Mogens Møller
- 8 år siden
- Visninger:
Transkript
1 WPS / R day Rune Juhl DTU Technical University of Denmark DTU Compute Department of Applied Mathematics and Computer Science 11th December 2013 DTU WPS Compute / R day Department of Applied 11th December Mathematics 2013and Computer 1 / 27
2 Om mig Historie B.Sc. Medicin og Teknologi, DTU og KU Prægraduat forskningsår, KU Hjerneforskning, Rigshospitalet og Hvidovre Hospital M.Sc. Matematisk modellering og computing, DTU une Juhl (DTU Technical University of Denmark DTU WPS Compute / R day Department of Applied 11th December Mathematics 2013and Computer 2 / 27
3 Om mig Historie B.Sc. Medicin og Teknologi, DTU og KU Prægraduat forskningsår, KU Hjerneforskning, Rigshospitalet og Hvidovre Hospital M.Sc. Matematisk modellering og computing, DTU Nu PhD Matematisk statistik (SDE), DTU Compute DTU WPS Compute / R day Department of Applied 11th December Mathematics 2013and Computer 2 / 27
4 Om R Åben og gratis computersprog til statistik Ross Ihaka og Robert Gentleman, University of Auckland, New Zealand Første udgave i 1993 Stort online community Mange udvidelsesmuligheder (CRAN) Hvor findes R: DTU WPS Compute / R day Department of Applied 11th December Mathematics 2013and Computer 3 / 27
5 RStudio IDE Gratis og meget populær IDE - DTU WPS Compute / R day Department of Applied 11th December Mathematics 2013and Computer 4 / 27
6 Grundlæggende R R er et computersprog med variabler af forskellige datatyper funktioner med flere argumenter og et resultat DTU WPS Compute / R day Department of Applied 11th December Mathematics 2013and Computer 5 / 27
7 Grundlæggende R R er et computersprog med variabler af forskellige datatyper funktioner med flere argumenter og et resultat Datatyper i R er numeric integer character logical matrix list data.frame DTU WPS Compute / R day Department of Applied 11th December Mathematics 2013and Computer 5 / 27
8 Grundlæggende operationer Tildelingsoperatoren er "<-" x <- 1 x ## [1] 1 Lave en vector c(-1, 0, 1, 2) ## [1] :2 ## [1] DTU WPS Compute / R day Department of Applied 11th December Mathematics 2013and Computer 6 / 27
9 Grundlæggende operationer Hvis springet nu ikke er 1 (x <- seq(-1, 2, by = 0.5)) ## [1] Inspicering af variablen x summary(x) ## Min. 1st Qu. Median Mean 3rd Qu. Max. ## str(x) ## num [1:7] DTU WPS Compute / R day Department of Applied 11th December Mathematics 2013and Computer 7 / 27
10 Grundlæggende operationer Pas på med at sætte forskellige datatyper sammen (x <- c(1, 2, "a")) ## [1] "1" "2" "a" x er nu en charactervektor str(x) ## chr [1:3] "1" "2" "a" DTU WPS Compute / R day Department of Applied 11th December Mathematics 2013and Computer 8 / 27
11 Dataframes data.frame er en vigtig datatype i R dat <- data.frame(values = c(20.2, 19.0, 18.7, 20.1), Sex = rep(c("m", "F"), each = 2)) dat ## Values Sex ## M ## M ## F ## F str(dat) ## 'data.frame': 4 obs. of 2 variables: ## $ Values: num ## $ Sex : Factor w/ 2 levels "F","M": DTU WPS Compute / R day Department of Applied 11th December Mathematics 2013and Computer 9 / 27
12 Dataframes - udtræk variabler Variabler i en data.frame kaldes via $ dat$values ## [1] dat$sex ## [1] M M F F ## Levels: F M dat[, "Sex"] ## [1] M M F F ## Levels: F M DTU WPS Compute / R day Department of Applied 11th December Mathematics 2013and Computer 10 / 27
13 Subsetting Først dannes 10 tilfældige normalfordelte tal (x <- rnorm(10)) ## [1] ## [8] Find dem der er større end 0 (keep er logical) (keep <- x > 0) ## [1] FALSE FALSE TRUE FALSE TRUE FALSE TRUE TRUE TRUE x[keep] ## [1] x[!keep] DTU WPS Compute / R day Department of Applied 11th December Mathematics 2013and Computer 11 / 27
14 Subsetting i dataframes - udtræk rækker dat dataframen fra før. Udtræk kvinderne dat[dat$sex == "F", ] ## Values Sex ## F ## F subset(dat, Sex == "F") ## Values Sex ## F ## F Komplicerede udtræk kan laves med & og. DTU WPS Compute / R day Department of Applied 11th December Mathematics 2013and Computer 12 / 27
15 Indlæsning af data R læser nemt tekstfiler ind med read.table. data <- read.table("data.csv", header = TRUE, sep = ";") data er nu en data.frame. DTU WPS Compute / R day Department of Applied 11th December Mathematics 2013and Computer 13 / 27
16 Linære modeller Linære modeller fittes med lm. Modellen gives ved en formular: respons ~ forklarende.variabler Intercept er inkluderet som standard og kan fjernes med -1 + eller 0 + DTU WPS Compute / R day Department of Applied 11th December Mathematics 2013and Computer 14 / 27
17 Linære modeller Simpel linær model på Iris datasættet i R lm(sepal.length ~ Sepal.Width + Petal.Width, data = iris) ## ## Call: ## lm(formula = Sepal.Length ~ Sepal.Width + Petal.Width, data ## ## Coefficients: ## (Intercept) Sepal.Width Petal.Width ## Ikke anbefalet måde lm(iris$sepal.length ~ iris$sepal.width + iris$petal.width) DTU WPS Compute / R day Department of Applied 11th December Mathematics 2013and Computer 15 / 27
18 Visualisering af data R er har mange muligheder for at plotte data. Grundlæggende funktioner plot hist pairs plot(iris$sepal.length, iris$sepal.width) DTU WPS Compute / R day Department of Applied 11th December Mathematics 2013and Computer 16 / 27
19 Visualisering af data plot(iris$sepal.length, iris$sepal.width) iris$sepal.width iris$sepal.length DTU WPS Compute / R day Department of Applied 11th December Mathematics 2013and Computer 17 / 27
20 Øvelse Installer R Installer RStudio Importer data Iris summary plot lm DTU WPS Compute / R day Department of Applied 11th December Mathematics 2013and Computer 18 / 27
21 R s pakkesystem R udvides dagligt af mange folk fra hele verden. Standard repository er CRAN (Comprehensive R Archive Network) 5006 tilgængelige pakker (november 2013) une Juhl (DTU Technical University of Denmark DTU WPS Compute / R day Department of Applied 11th December Mathematics 2013and Computer 19 / 27
22 R s pakkesystem R udvides dagligt af mange folk fra hele verden. Standard repository er CRAN (Comprehensive R Archive Network) Installering og brug af pakker 5006 tilgængelige pakker (november 2013) install.packages("ggplot2") library(ggplot2) DTU WPS Compute / R day Department of Applied 11th December Mathematics 2013and Computer 19 / 27
23 Overblik over pakkerne CRAN Task Views DTU WPS Compute / R day Department of Applied 11th December Mathematics 2013and Computer 20 / 27
24 Alternative plottemuligheder Mulige pakker til at plotte data med ggplot2 lattice GGobi Rgl (3D) Anbefaler ggplot2 skrevet af Hadley Wickham, Rice University DTU WPS Compute / R day Department of Applied 11th December Mathematics 2013and Computer 21 / 27
25 ggplot2 DTU WPS Compute / R day Department of Applied 11th December Mathematics 2013and Computer 22 / 27
26 ggplot2 eksempel ggplot(data = iris, aes(x = Sepal.Length, y = Sepal.Width, shape = Species)), colour = Petal.Length) geom_point() + ggtitle("questionable Plot\nFlowers") DTU WPS Compute / R day Department of Applied 11th December Mathematics 2013and Computer 23 / 27
27 ggplot2 eksempel 4.5 Questionable Plot Flowers 4.0 Sepal.Width Species setosa versicolor virginica Petal.Length Sepal.Length DTU WPS Compute / R day Department of Applied 11th December Mathematics 2013and Computer 24 / 27
28 GLM i R ## Dobson (1990) Page 93: Randomized Controlled Trial : counts <- c(18, 17, 15, 20, 10, 20, 25, 13, 12) outcome <- gl(3, 1, 9) treatment <- gl(3, 3) head(d.ad <- data.frame(treatment, outcome, counts)) ## treatment outcome counts ## ## ## ## ## ## DTU WPS Compute / R day Department of Applied 11th December Mathematics 2013and Computer 25 / 27
29 GLM i R (glm.d93 <- glm(counts ~ outcome + treatment, family = poisson( ## ## Call: glm(formula = counts ~ outcome + treatment, family = ## ## Coefficients: ## (Intercept) outcome2 outcome3 treatment2 treatme ## 3.04e e e e e ## ## Degrees of Freedom: 8 Total (i.e. Null); 4 Residual ## Null Deviance: 10.6 ## Residual Deviance: 5.13 AIC: 56.8 DTU WPS Compute / R day Department of Applied 11th December Mathematics 2013and Computer 26 / 27
30 GLM i R summary(glm.d93) ## glm(formula = counts ~ outcome + treatment, family = poisson ## ## Call: ## ## Deviance Residuals: ## ## ## 9 ## ## ## Coefficients: ## Estimate Std. Error z value Pr(> z ) ## (Intercept) 3.04e e <2e-16 *** ## outcome2-4.54e e * ## outcome3-2.93e e DTU WPS Compute / R day Department of Applied 11th December Mathematics 2013and Computer 27 / 27
Klasseøvelser dag 2 Opgave 1
Klasseøvelser dag 2 Opgave 1 1.1. Vi sætter først working directory og data indlæses: library( foreign ) d
Læs mereOversigt. 1 Gennemgående eksempel: Højde og vægt. 2 Korrelation. 3 Regressionsanalyse (kap 11) 4 Mindste kvadraters metode
Kursus 02402 Introduktion til Statistik Forelæsning 11: Kapitel 11: Regressionsanalyse Oversigt 1 Gennemgående eksempel: Højde og vægt 2 Korrelation 3 Per Bruun Brockhoff DTU Compute, Statistik og Dataanalyse
Læs mereR syntaks. Installation af R
R syntaks Denne note er en introduktion 1 til syntaksen i R. Den kode, vi skal bruge til modellerne, står i bogen eller kommer til at være på hjemmesiden i den takt, vi gennemgår teorien. Så det, vi skal
Læs mereForelæsning 11: Kapitel 11: Regressionsanalyse
Kursus 02402 Introduktion til Statistik Forelæsning 11: Kapitel 11: Regressionsanalyse Per Bruun Brockhoff DTU Compute, Statistik og Dataanalyse Bygning 324, Rum 220 Danmarks Tekniske Universitet 2800
Læs mereStatistikforedrag i Hjørring
i Hjørring Ph.d.-studerende Institut for Matematiske Fag Aalborg Universitet 7. maj 2008 1/36 Oversigt Hvad kan man blive? Fra talmateriale til analyse Sæsonvariation Retsgenetik 2/36 Statistikerens opgave
Læs mereNormalfordelingen. Statistik og Sandsynlighedsregning 2
Normalfordelingen Statistik og Sandsynlighedsregning 2 Repetition og eksamen Erfaringsmæssigt er normalfordelingen velegnet til at beskrive variationen i mange variable, blandt andet tilfældige fejl på
Læs mereLogistisk regression
Logistisk regression Susanne Rosthøj Biostatistisk Afdeling Institut for Folkesundhedsvidenskab Københavns Universitet sr@biostat.ku.dk Kursushjemmeside: www.biostat.ku.dk/~sr/forskningsaar/regression2012/
Læs mereLogistisk regression
Logistisk regression Susanne Rosthøj Biostatistisk Afdeling Institut for Folkesundhedsvidenskab Københavns Universitet sr@biostat.ku.dk 21. marts 2013 Dagens program Chi-i-anden (χ 2 )-testet Sandsynligheder,
Læs mereOversigt. 1 Motiverende eksempel: Højde-vægt. 2 Lineær regressionsmodel. 3 Mindste kvadraters metode (least squares)
Kursus 02402/02323 Introducerende Statistik Forelæsning 8: Simpel lineær regression Oversigt Motiverende eksempel: Højde-vægt 2 Lineær regressionsmodel 3 Mindste kvadraters metode (least squares) Klaus
Læs mereTransparency International Danmark på Roskilde Festival 2018: Har indsatsen nyttet noget?
Transparency International Danmark på Roskilde Festival 2018: Har indsatsen nyttet noget? Udarbejdet af frivillige Frederik Carl Windfeld og Kim Alexander Byrial Juárez Jensen samt sekretariatet i Transparency
Læs mereKursus 02323: Introducerende Statistik. Forelæsning 8: Simpel lineær regression. Peder Bacher
Kursus 02323: Introducerende Statistik Forelæsning 8: Simpel lineær regression Peder Bacher DTU Compute, Dynamiske Systemer Bygning 303B, Rum 009 Danmarks Tekniske Universitet 2800 Lyngby Danmark e-mail:
Læs mereVariansanalyse i SAS. Institut for Matematiske Fag December 2007
Københavns Universitet Statistik for Biokemikere Det naturvidenskabelige fakultet Institut for Matematiske Fag December 2007 Variansanalyse i SAS 2 Tosidet variansanalyse Residualplot Tosidet variansanalyse
Læs mereReeksamen i Statistik for Biokemikere 6. april 2009
Københavns Universitet Det Naturvidenskabelige Fakultet Reeksamen i Statistik for Biokemikere 6. april 2009 Alle hjælpemidler er tilladt, og besvarelsen må gerne skrives med blyant. Opgavesættet er på
Læs mereØkonometri Lektion 1 Simpel Lineær Regression 1/31
Økonometri Lektion 1 Simpel Lineær Regression 1/31 Simpel Lineær Regression Mål: Forklare variablen y vha. variablen x. Fx forklare Salg (y) vha. Reklamebudget (x). Statistisk model: Vi antager at sammenhængen
Læs mereLineær regression i SAS. Lineær regression i SAS p.1/20
Lineær regression i SAS Lineær regression i SAS p.1/20 Lineær regression i SAS Simpel lineær regression Grafisk modelkontrol Multipel lineær regression SAS-procedurer: PROC REG PROC GPLOT Lineær regression
Læs mereNaturvidenskabelig Bacheloruddannelse Forår 2006 Matematisk Modellering 1 Side 1
Matematisk Modellering 1 Side 1 I nærværende opgavesæt er der 16 spørgsmål fordelt på 4 opgaver. Ved bedømmelsen af besvarelsen vægtes alle spørgsmål lige. Endvidere lægges der vægt på, at det af besvarelsen
Læs mereKursus 02402/02323 Introducerende Statistik
Kursus 02402/02323 Introducerende Statistik Forelæsning 8: Simpel lineær regression Peder Bacher DTU Compute, Dynamiske Systemer Bygning 303B, Rum 009 Danmarks Tekniske Universitet 2800 Lyngby Danmark
Læs mereProgram. Logistisk regression. Eksempel: pesticider og møl. Odds og odds-ratios (igen)
Faculty of Life Sciences Program Logistisk regression Claus Ekstrøm E-mail: ekstrom@life.ku.dk Odds og odds-ratios igen Logistisk regression Estimation og inferens Modelkontrol Slide 2 Statistisk Dataanalyse
Læs mereØkonometri: Lektion 5. Multipel Lineær Regression: Interaktion, log-transformerede data, kategoriske forklarende variable, modelkontrol
Økonometri: Lektion 5 Multipel Lineær Regression: Interaktion, log-transformerede data, kategoriske forklarende variable, modelkontrol 1 / 35 Veksekvirkning: Motivation Vi har set på modeller som Price
Læs mereEksamen Bacheloruddannelsen i Medicin med industriel specialisering
Eksamen 2016 Titel på kursus: Uddannelse: Semester: Forsøgsdesign og metoder Bacheloruddannelsen i Medicin med industriel specialisering 6. semester Eksamensdato: 17-02-2015 Tid: kl. 09.00-11.00 Bedømmelsesform
Læs mereStatistik og Sandsynlighedsregning 2. IH kapitel 12. Overheads til forelæsninger, mandag 6. uge
Statistik og Sandsynlighedsregning 2 IH kapitel 12 Overheads til forelæsninger, mandag 6. uge 1 Fordelingen af én (1): Regressionsanalyse udfaldsvariabel responsvariabel afhængig variabel Y variabel 2
Læs mereenote 5: Simpel lineær regressions analyse Kursus 02402/02323 Introducerende Statistik Oversigt
enote 5: Simpel lineær regressions analse Kursus 02402/02323 Introducerende Statistik Forelæsning 8: Simpel lineær regression To variable: og Beregn mindstekvadraters estimat af ret linje Inferens med
Læs mereEn meget kort introduktion til R på polit
En meget kort introduktion til R på polit Sebastian Barfort sebastian.barfort@econ.ku.dk Indhold 1 Introduktion 1 2 R som lommeregner 2 3 Tabeller, grafer og estimation 6 4 Økonomiske figurer 11 1 Introduktion
Læs mereLineær regression. Simpel regression. Model. ofte bruges følgende notation:
Lineær regression Simpel regression Model Y i X i i ofte bruges følgende notation: Y i 0 1 X 1i i n i 1 i 0 Findes der en linie, der passer bedst? Metode - Generel! least squares (mindste kvadrater) til
Læs mereØvelser i epidemiologi og biostatistik, 6. april 2010 Baseline-informationer fra Ebeltoft datasættet Eksempel på besvarelse
Øvelser i epidemiologi og biostatistik, 6. april 2010 Baseline-informationer fra Ebeltoft datasættet Eksempel på besvarelse 1. Hvor stor en andel af deltagerne var mænd? Var der samme andel i de tre randomiseringsgrupper?.
Læs mereStatistik og Sandsynlighedsregning 2. Repetition og eksamen. Overheads til forelæsninger, mandag 7. uge
Statistik og Sandsynlighedsregning 2 Repetition og eksamen Overheads til forelæsninger, mandag 7. uge 1 Normalfordelingen Erfaringsmæssigt er normalfordelingen velegnet til at beskrive variationen i mange
Læs mereβ = SDD xt SSD t σ 2 s 2 02 = SSD 02 f 02 i=1
Lineær regression Lad x 1,..., x n være udfald af stokastiske variable X 1,..., X n og betragt modellen M 2 : X i N(α + βt i, σ 2 ) hvor t i, i = 1,..., n, er kendte tal. Konkret analyseres (en del af)
Læs mereOpgave 1: Graft vs. Host disease
Opgave 1: Graft vs. Host disease Denne opgave er baseret på opgave 12.3 fra DG Altman, p. 361. Data omhandler knoglemarvstransplantation af 37 leukæmipatienter, og outcome er forekomst af graft versus
Læs mereInstitut for Matematiske Fag Matematisk Modellering 1 UGESEDDEL 6
Institut for Matematiske Fag Matematisk Modellering 1 Aarhus Universitet Eva B. Vedel Jensen 25. februar 2008 UGESEDDEL 6 Forelæsningerne torsdag den 21. februar og tirsdag den 26. februar. Jeg har gennemgået
Læs mereInstitut for Matematiske Fag Sandsynlighedsregning og Statistik 2. R opgaver
Institut for Matematiske Fag Sandsynlighedsregning og Statistik 2 Københavns Universitet Susanne Ditlevsen og Helle Sørensen R opgaver Det er en god ide at vænne sig til at skrive kommandoerne i en editor
Læs mereOpgavebesvarelse, korrelerede målinger
Opgavebesvarelse, korrelerede målinger I 18 familier bestående af far, mor og 3 børn (i veldefinerede aldersintervaller, med child1 som det ældste barn og child3 som det yngste) har man registreret antallet
Læs mereModel. k = 3 grupper: hvor ǫ ij uafhængige og normalfordelte med middelværdi nul og varians σi 2, i = 1,2,3.
Model Program (8.15-10): 1. ensidet variansanalyse. 2. forsøgsplanlægning: blocking. Bruger nu to indices: i = 1,...,k for gruppenr. og j = 1,...,n i for observation indenfor gruppe. k = 3 grupper: µ 1
Læs merek UAFHÆNGIGE grupper Oversigt 1 Intro eksempel 2 Model og hypotese 3 Beregning - variationsopspaltning og ANOVA tabellen 4 Hypotesetest (F-test)
Kursus 02323: Introduktion til Statistik Forelæsning 11: Envejs variansanalse, ANOVA Peder Bacher DTU Compute, Dnamiske Sstemer Bgning 303B, Rum 009 Danmarks Tekniske Universitet 2800 Lngb Danmark e-mail:
Læs mereForelæsning 11: Envejs variansanalyse, ANOVA
Kursus 02323: Introduktion til Statistik Forelæsning 11: Envejs variansanalyse, ANOVA Peder Bacher DTU Compute, Dynamiske Systemer Bygning 303B, Rum 009 Danmarks Tekniske Universitet 2800 Lyngby Danmark
Læs mereX M Y. What is mediation? Mediation analysis an introduction. Definition
What is mediation? an introduction Ulla Hvidtfeldt Section of Social Medicine - Investigate underlying mechanisms of an association Opening the black box - Strengthen/support the main effect hypothesis
Læs merek normalfordelte observationsrækker (ensidet variansanalyse)
k normalfordelte observationsrækker (ensidet variansanalyse) Lad x ij, i = 1,...,k, j = 1,..., n i, være udfald af stokastiske variable X ij og betragt modellen M 1 : X ij N(µ i, σ 2 ). Estimaterne er
Læs meremen nu er Z N((µ 1 µ 0 ) n/σ, 1)!! Forkaster hvis X 191 eller X 209 eller
Type I og type II fejl Type I fejl: forkast når hypotese sand. α = signifikansniveau= P(type I fejl) Program (8.15-10): Hvis vi forkaster når Z < 2.58 eller Z > 2.58 er α = P(Z < 2.58) + P(Z > 2.58) =
Læs mereReeksamen i Statistik for biokemikere. Blok
Københavns Universitet Det Naturvidenskabelige Fakultet Reeksamen i Statistik for biokemikere. Blok 2 2007-2008. 3 timers skriftlig prøve. Alle hjælpemidler - også blyant - er tilladt. Opgavesættet er
Læs mereNormalfordelingen. Statistik og Sandsynlighedsregning 2
Statistik og Sandsynlighedsregning 2 Repetition og eksamen T-test Normalfordelingen Erfaringsmæssigt er normalfordelingen velegnet til at beskrive variationen i mange variable, blandt andet tilfældige
Læs mereI dag. Kursus Hvad er PCR? Eksempel, Data 1. Statistik. PCR: Principal component regression. Anna Helga Jónsdóttir. 25.
I dag Kursus 02593 Statistik Anna Helga Jónsdóttir ahj@imm.dtu.dk 25. november 2008 PCR: Principal component regression Motiverende eksempel Hvad er PCR? Hvordan går man? Splus Anna Helga Jónsdóttir (ahj@imm.dtu.dk)
Læs mereBesvarelse af vitcap -opgaven
Besvarelse af -opgaven Spørgsmål 1 Indlæs data Dette gøres fra Analyst med File/Open, som sædvanlig. Spørgsmål 2 Beskriv fordelingen af vital capacity og i de 3 grupper ved hjælp af summary statistics.
Læs mereAppendiks Økonometrisk teori... II
Appendiks Økonometrisk teori... II De klassiske SLR-antagelser... II Hypotesetest... VII Regressioner... VIII Inflation:... VIII Test for SLR antagelser... IX Reset-test... IX Plots... X Breusch-Pagan
Læs mereRegressionsanalyse i SAS
Københavns Universitet Statistik for Biokemikere Det naturvidenskabelige fakultet Inge Henningsen Afdeling for Anvendt Matematik og Statistik December 2006 Regressionsanalyse uden gentagelser Regressionsanalyse
Læs mere(studienummer) (underskrift) (bord nr)
Danmarks Tekniske Universitet Side 1 af 20 sider. Skriftlig prøve: 15. december 2008 Kursus navn og nr: Introduktion til Statistik, 02402 Tilladte hjælpemidler: Alle Dette sæt er besvaret af (studienummer)
Læs mereKommentarer til øvelser i basalkursus, 2. uge
Kommentarer til øvelser i basalkursus, 2. uge Opgave 2. Vi betragter målinger af hjertevægt (i g) og total kropsvægt (målt i kg) for 10 normale mænd og 11 mænd med hjertesvigt. Målingerne er taget ved
Læs mereIntroduktion til R. Erik Gahner Larsen
Introduktion til R Erik Gahner Larsen Oktober 27, 2017 Indhold Kapitel 1: Introduktion...................................... 1 1.1 Hvorfor R? Fordele og ulemper ved R........................ 2 1.2 Installation
Læs mereIntroduktion til R. Erik Gahner Larsen
Introduktion til R Erik Gahner Larsen Februar 26, 2017 Indhold Kapitel 1: Introduktion.................................. 1 1.1 Hvorfor R? Fordele og ulemper ved R.................... 2 1.2 Installation
Læs mereMultipel Lineær Regression
Multipel Lineær Regression Trin i opbygningen af en statistisk model Repetition af MLR fra sidst Modelkontrol Prædiktion Kategoriske forklarende variable og MLR Opbygning af statistisk model Specificer
Læs mereOpgavebesvarelse, brain weight
Opgavebesvarelse, brain weight (Matthews & Farewell: Using and Understanding Medical Statistics, 2nd. ed.) For 20 nyfødte mus er der i tabellen nedenfor anført oplysning om kuldstørrelsen (fra 3 til 12
Læs mereMuligheder: NB: test for µ 1 = µ 2 i model med blocking ækvivalent med parret t-test! Ide: anskue β j som stikprøve fra normalfordeling.
Eksempel: dæktyper og brændstofforbrug (opgave 25 side 319) Program: cars 1 2 3 4 5... radial 4.2 4.7 6.6 7.0 6.7... belt 4.1 4.9 6.2 6.9 6.8... Muligheder: 1. vi starter med at gennemgå opgave 7 side
Læs mereBasal Statistik - SPSS
Faculty of Health Sciences Basal Statistik - SPSS Kovariansanalyse. Lene Theil Skovgaard 3. oktober 2017 1 / 12 APPENDIX med instruktioner til SPSS-analyse svarende til nogle af slides Bland-Altman plot,
Læs mereBasal Statistik - SPSS
Faculty of Health Sciences Basal Statistik - SPSS Kovariansanalyse. Lene Theil Skovgaard 1. oktober 2018 1 / 12 APPENDIX med instruktioner til SPSS-analyse svarende til nogle af slides Bland-Altman plot,
Læs mere(studienummer) (underskrift) (bord nr)
Danmarks Tekniske Universitet Side 1 af 21 sider. Skriftlig prøve: 27. maj 2010 Kursus navn og nr: Introduktion til Statistik, 02402 Tilladte hjælpemidler: Alle Dette sæt er besvaret af (studienummer)
Læs mereLøsning eksamen d. 15. december 2008
Informatik - DTU 02402 Introduktion til Statistik 2010-2-01 LFF/lff Løsning eksamen d. 15. december 2008 Referencer til Probability and Statistics for Engineers er angivet i rækkefølgen [8th edition, 7th
Læs mereFor at få 8 linjer ud, skal dette specifiseres i kommandoen ved at sætte antal lig 8 n=8:
Klasseøvelser dag 1 Opgave 1 1.1. Vi gemmer først dbase filen "perulung.dbf" i den relevante mappe og derefter sættes working directory til denne mappe ved at vælge menuen Session -> Set Working Directory
Læs mereOpgaver til ZAR II. Afdeling for Anvendt Matematik og Statistik Michael Sørensen Oktober Opgave 1
Københavns Universitet Afdeling for Anvendt Matematik og Statistik Statistik for biokemikere Inge Henningsen Michael Sørensen Oktober 2003 Opgaver til ZAR II Opgave 1 Et datasæt består af 20 observationer.
Læs mereIntroduktion til biostatistik
Introduktion til biostatistik Kursusplan Anders Bo Bojesen anders.bo.bojesen@rsyd.dk 15. juni 2016 Kurset er en indføring i praktisk anvendelse af klassiske biostatistiske metoder til analyse af kategoriske,
Læs mereIndhold. 2 Tosidet variansanalyse Additive virkninger Vekselvirkning... 9
Indhold 1 Ensidet variansanalyse 2 1.1 Estimation af middelværdier............................... 3 1.2 Estimation af standardafvigelse............................. 3 1.3 F-test for ens middelværdier...............................
Læs mereLog-lineære modeller. Analyse af symmetriske sammenhænge mellem kategoriske variable. Ordinal information ignoreres.
Log-lineære modeller Analyse af symmetriske sammenhænge mellem kategoriske variable. Ordinal information ignoreres. Kontingenstabel Contingency: mulighed/tilfælde Kontingenstabel: antal observationer (frekvenser)
Læs mereSide 1 af 19 sider. Danmarks Tekniske Universitet. Skriftlig prøve: 15. december 2007 Kursus navn og nr: Introduktion til Statistik, 02402
Danmarks Tekniske Universitet Side 1 af 19 sider. Skriftlig prøve: 15. december 2007 Kursus navn og nr: Introduktion til Statistik, 02402 Tilladte hjælpemidler: Alle Dette sæt er besvaret af (studienummer)
Læs mereVariansanalyse i SAS 1. Institut for Matematiske Fag December 2007
Københavns Universitet Statistik for Biokemikere Det naturvidenskabelige fakultet Institut for Matematiske Fag December 2007 Variansanalyse i SAS 1 Ensidet variansanalyse Bartlett s test Tukey s test PROC
Læs mereMultipel regression 22. Maj, 2012
Data: Det færøske kviksølv-studie Simpel linær regression Confounding Multipel lineær regression Fortolkning af parametre Vekselvirkning Kollinearitet Modelkontrol Multipel regression 22. Maj, 2012 Esben
Læs mereModule 1: Introduktion til R, simpel regression
Department of Statistics ST502: Statistisk modellering Pia Veldt Larsen Module 1: Introduktion til R, simpel regression 1.1 Lineære modeller................................... 1 1.2 Simpel lineær regression..............................
Læs mereØkonometri B i R. Sebastian Barfort.
Økonometri B i R Sebastian Barfort sebastian.barfort@econ.ku.dk Hvis man gerne vil igang med R, men har svært ved den stejle læringskurve, kan nedenstående måske fungere som en slags guide. For at have
Læs mere(studienummer) (underskrift) (bord nr)
Danmarks Tekniske Universitet Side 1 af 20 sider. Skriftlig prøve: 26. maj 2011 Kursus navn og nr: Introduktion til Statistik, 02402 Tilladte hjælpemidler: Alle Dette sæt er besvaret af (studienummer)
Læs mereLøsning til øvelsesopgaver dag 4 spg 5-9
Løsning til øvelsesopgaver dag 4 spg 5-9 5: Den multiple model Vi tilføjer nu yderligere to variable til vores model : Køn og kolesterol SBP = a + b*age + c*chol + d*mand hvor mand er 1 for mænd, 0 for
Læs mereMultipel regression. M variable En afhængig (Y) M-1 m uafhængige / forklarende / prædikterende (X 1 til X m ) Model
Multipel regression M variable En afhængig (Y) M-1 m uafhængige / forklarende / prædikterende (X 1 til X m ) Model Y j 1 X 1j 2 X 2j... m X mj j eller m Y j 0 i 1 i X ij j BEMÆRK! j svarer til individ
Læs mereOversigt. Kursus 02402 Introduktion til Statistik. Forelæsning 1: Intro og beskrivende statistik. Per Bruun Brockhoff. Praktisk Information
Kursus 02402 Forelæsning 1: Intro og beskrivende statistik Oversigt 1 Per Bruun Brockhoff DTU Compute, Statistik og Dataanalyse Bygning 324, Rum 220 Danmarks Tekniske Universitet 2800 Lyngby Danmark e-mail:
Læs mereForelæsning 1: Intro og beskrivende statistik
Kursus 02402 Introduktion til Statistik Forelæsning 1: Intro og beskrivende statistik Per Bruun Brockhoff DTU Compute, Statistik og Dataanalyse Bygning 324, Rum 220 Danmarks Tekniske Universitet 2800 Lyngby
Læs mereReminder: Hypotesetest for én parameter. Økonometri: Lektion 4. F -test Justeret R 2 Aymptotiske resultater. En god model
Reminder: Hypotesetest for én parameter Antag vi har model Økonometri: Lektion 4 F -test Justeret R 2 Aymptotiske resultater y = β 0 + β 1 x 2 + β 2 x 2 + + β k x k + u. Vi ønsker at teste hypotesen H
Læs merePROC TRANSPOSE. SAS-tabellen - hensigtsmæssig lagring af data. Copyright 2011 SAS Institute Inc. All rights reserved.
PROC TRANSPOSE SAS-tabellen - hensigtsmæssig lagring af data Copyright 2011 SAS Institute Inc. All rights reserved. Transponerede tabeller Brede eller smalle? Hvad: Brede tabeller har mange kolonner med
Læs mereAfdeling for Anvendt Matematik og Statistik Januar Regressionsanalyse i SAS 2. Regressionsanalyse med GLM Sammenligning af regressionslinier
Københavns Universitet Statistik for Biokemikere Det naturvidenskabelige fakultet Inge Henningsen Afdeling for Anvendt Matematik og Statistik Januar 2007 2 Regressionsanalyse med GLM Sammenligning af regressionslinier
Læs mereProgram. t-test Hypoteser, teststørrelser og p-værdier. Hormonkonc.: statistisk model og konfidensinterval. Hormonkoncentration: data
Faculty of Life Sciences Program t-test Hypoteser, teststørrelser og p-værdier Claus Ekstrøm E-mail: ekstrom@life.ku.dk Resumé og hængepartier fra sidst. Eksempel: effekt af foder på hormonkoncentration
Læs mereBesvarelse af opgave om Vital Capacity
Besvarelse af opgave om Vital Capacity I filen cadmium.txt ligger observationer fra et eksempel omhandlende lungefunktionen hos arbejdere i cadmium industrien (hentet fra P. Armitage & G. Berry: Statistical
Læs merek UAFHÆNGIGE grupper F-test Oversigt 1 Intro eksempel 2 Model og hypotese 3 Beregning - variationsopspaltning og ANOVA tabellen
Introduktion til Statistik Forelæsning 10: Envejs variansanalyse, ANOVA Peder Bacher DTU Compute, Dynamiske Systemer Bygning 303B, Rum 017 Danmarks Tekniske Universitet 2800 Lyngby Danmark e-mail: pbac@dtu.dk
Læs mereMPH specialmodul i epidemiologi og biostatistik. SAS. Introduktion til SAS. Eksempel: Blodtryk og fedme
MPH specialmodul i epidemiologi og biostatistik. SAS Introduktion til SAS. Display manager (programmering) Vinduer: program editor (med syntaks-check) log output reproducerbart (program teksten kan gemmes
Læs mereKA 4.2 Kvantitative Forskningsmetoder Forår 2010
KA 4.2 Kvantitative Forskningsmetoder Forår 2010 Besvar alle spørgsmål. Brug ikke mere end én side af tekst på de åbne spørgsmål som er markeret * Answer all questions. Do not write more than one page
Læs mereSPSS appendix SPSS APPENDIX. Box plots. Indlæsning. Faculty of Health Sciences. Basal Statistik: Sammenligning af grupper, Variansanalyse
Faculty of Health Sciences SPSS APPENDIX SPSS appendix Basal Statistik: Sammenligning af grupper, Variansanalyse Lene Theil Skovgaard 12. september 2017 med instruktioner til SPSS-analyse svarende til
Læs mereFaculty of Health Sciences. SPSS appendix. Basal Statistik: Sammenligning af grupper, Variansanalyse. Lene Theil Skovgaard. 22.
Faculty of Health Sciences SPSS appendix Basal Statistik: Sammenligning af grupper, Variansanalyse Lene Theil Skovgaard 22. januar 2018 1 / 20 SPSS APPENDIX med instruktioner til SPSS-analyse svarende
Læs mereSPSS appendix SPSS APPENDIX. Box plots. Indlæsning. Faculty of Health Sciences. Basal Statistik: Sammenligning af grupper, Variansanalyse
Faculty of Health Sciences SPSS APPENDIX SPSS appendix Basal Statistik: Sammenligning af grupper, Variansanalyse Lene Theil Skovgaard 11. februar 2019 med instruktioner til SPSS-analyse svarende til nogle
Læs mereAnders Milhøj. Nyheder i SAS Analytics 14.2
Anders Milhøj Nyheder i SAS Analytics 14.2 Department of Economics, University of Copenhagen Øster Farimagsgade 5, DK-1353 København K Anders.Milhoj@econ.ku.dk Side 1 af 15 SAS's nyere analytiske releases
Læs mereTo samhørende variable
To samhørende variable Statistik er tal brugt som argumenter. - Leonard Louis Levinsen Antagatviharn observationspar x 1, y 1,, x n,y n. Betragt de to tilsvarende variable x og y. Hvordan måles sammenhængen
Læs mereIntroduktion til R. Faculty of Health Sciences
Faculty of Health Sciences Introduktion til R Susanne Rosthøj Biostatistisk Afdeling Institut for Folkesundhedsvidenskab Københavns Universitet sr@biostat.ku.dk Kursushjemmeside: www.biostat.ku.dk/~sr/forskningsaar/survival2011
Læs mere3. SPSS Output. Descriptives. [DataSet1] C:\Users\Thomas\Desktop\Eservice_i_produktgruppen_Bekldning.sav
3. SPSS Output DESCRIPTIVES VARIABLES=DEM DEM5 DEM10 DEM11 /STATISTICS=MEAN STDDEV MIN MAX. Descriptives [DataSet1] C:\Users\Thomas\Desktop\Eservice_i_produktgruppen_Bekldning.sav Descriptive Statistics
Læs mereEksamen i Statistik for Biokemikere, Blok januar 2009
Københavns Universitet Det Naturvidenskabelige Fakultet Eksamen i Statistik for Biokemikere, Blok 2 2008 09 19. januar 2009 Alle hjælpemidler er tilladt, og besvarelsen må gerne skrives med blyant. Opgavesættet
Læs mere(studienummer) (underskrift) (bord nr)
Danmarks Tekniske Universitet Side 1 af 20 sider. Skriftlig prøve: 15. december 2012 Kursus navn og nr: Introduktion til Statistik, 02402 Tilladte hjælpemidler: Alle Dette sæt er besvaret af (studienummer)
Læs mereBasal Statistik - SPSS
Faculty of Health Sciences Basal Statistik - SPSS Begreber. Parrede sammenligninger. Lene Theil Skovgaard 5. september 2017 1 / 16 APPENDIX med instruktioner til SPSS-analyse svarende til nogle af slides
Læs mereOversigt. 1 Intro: Regneeksempel og TV-data fra B&O. 2 Model og hypotese. 3 Beregning - variationsopspaltning og ANOVA tabellen
Kursus 02402/02323 Introducerende Statistik Forelæsning 10: Envejs variansanalyse, ANOVA Oversigt 1 Intro: Regneeksempel og TV-data fra B&O 2 Model og hypotese Per Bruun Brockhoff DTU Compute, Statistik
Læs mereAppendices. Appendix 2: Questionnaire in StudSurvey. Appendix 3: Text presenting the electronic questionnaire. Appendix 4: Outputs from regressions
Appendices Appendix 1: Print screen of WEB-DIRECT Appendix 2: Questionnaire in StudSurvey Appendix 3: Text presenting the electronic questionnaire Appendix 4: Outputs from regressions StudSurvey http://studsurvey.asb.dk/nsurveyadmin/surveycontentbuilder.aspx?surv...
Læs mere1 Regressionsproblemet 2
Indhold 1 Regressionsproblemet 2 2 Simpel lineær regression 3 2.1 Mindste kvadraters tilpasning.............................. 3 2.2 Prædiktion og residualer................................. 5 2.3 Estimation
Læs mereReeksamen Bacheloruddannelsen i Medicin med industriel specialisering. Eksamensdato: Tid: kl
Reeksamen 2018 Titel på kursus: Uddannelse: Semester: Forsøgsdesign og metoder Bacheloruddannelsen i Medicin med industriel specialisering 6. semester Eksamensdato: 13-08-2018 Tid: kl. 09.00-11.00 Bedømmelsesform
Læs mereTænk på a og b som to n 1 matricer. a 1 a 2 a n. For hvert i = 1,..., n har vi y i = x i β + u i.
Repetition af vektor-regning Økonometri: Lektion 3 Matrix-formulering Fordelingsantagelse Hypotesetest Antag vi har to n-dimensionelle (søjle)vektorer a 1 b 1 a 2 a =. og b = b 2. a n b n Tænk på a og
Læs mereEngineering of Chemical Register Machines
Prague International Workshop on Membrane Computing 2008 R. Fassler, T. Hinze, T. Lenser and P. Dittrich {raf,hinze,thlenser,dittrich}@minet.uni-jena.de 2. June 2008 Outline 1 Motivation Goal Realization
Læs merePhd-kursus i Basal Statistik, Opgaver til 1. uge Opgave 1: Sundby
Phd-kursus i Basal Statistik, Opgaver til 1. uge Opgave 1: Sundby Vi betragter et lille uddrag af det såkaldte Sundby95-materiale, der er en stor undersøgelse af københavnernes sundhed. Det totale datasæt
Læs mereForelæsning 11: Tovejs variansanalyse, ANOVA
Introduktion til Statistik Forelæsning 11: Tovejs variansanalyse, ANOVA Peder Bacher DTU Compute, Dynamiske Systemer Bygning 303B, Rum 009 Danmarks Tekniske Universitet 2800 Lyngby Danmark e-mail: pbac@dtu.dk
Læs mereGenerelle lineære modeller
Generelle lineære modeller Regressionsmodeller med én uafhængig intervalskala variabel: Y en eller flere uafhængige variable: X 1,..,X k Den betingede fordeling af Y givet X 1,..,X k antages at være normal
Læs mereMotivation. En tegning
Motivatio Scatter-plot at det mådelige salg mod det måedlige reklamebudget. R: plot(salg ~ budget, data = salg) Økoometri Lektio Simpel Lieær Regressio salg 400 450 500 550 20 25 30 35 40 45 50 budget
Læs mereØkonometri: Lektion 6 Emne: Heteroskedasticitet
Økonometri: Lektion 6 Emne: Heteroskedasticitet 1 / 32 Konsekvenser af Heteroskedasticitet Antag her (og i resten) at MLR.1 til MLR.4 er opfyldt. Antag MLR.5 ikke er opfyldt, dvs. vi har heteroskedastiske
Læs mereEn Introduktion til SAS. Kapitel 5.
En Introduktion til SAS. Kapitel 5. Inge Henningsen Afdeling for Statistik og Operationsanalyse Københavns Universitet Marts 2005 6. udgave Kapitel 5 T-test og PROC UNIVARIATE 5.1 Indledning Dette kapitel
Læs mereMindste kvadraters tilpasning Prædiktion og residualer Estimation af betinget standardafvigelse Test for uafhængighed Konfidensinterval for hældning
1 Regressionsproblemet 2 Simpel lineær regression Mindste kvadraters tilpasning Prædiktion og residualer Estimation af betinget standardafvigelse Test for uafhængighed Konfidensinterval for hældning 3
Læs mere