Hjemmeopgave, efterår 2009

Transkript

1 Hjemmeopgave, efterår 2009 Basal statistik for sundhedsvidenskabelige forskere Udleveret 29. september, afleveres senest ved øvelserne i uge 44 ( oktober) I alt 112 piger har fået målt bone mineral density (bmd) i 11- års alderen. Pigerne er herefter randomiseret til enten at få et calciumtilskud eller en placebopille. Efter ca. 2 år er de fleste genundersøgt, og bmd er målt igen. Data kan hentes på nettet fra siden ved at klikke på "data til hjemmeopgave" og gemme data på egen computer. Data indeholder 112 linier (foruden en overskriftslinie), med angivelse af observationsnummer (Nr), behandlingsgruppe (treat, angivet som enten C for calciumtilskud eller P for placebo), bone mineral density ved hhv. 1. og 2. måling (bmd1 hhv. bmd5) samt det eksakte antal dage, der er imellem de to målinger (dage). OBS: Meget vigtigt!! I skal benytte hver jeres datasæt, idet hver enkelt kursist skal slette en af observationerne. Det fremgår af en liste på hjemmesiden hvilken det drejer sig om for hver enkelt. Dette er desværre nødvendigt pga. tidligere problemer med afskrift. I bedes benytte sidste side fra denne opgavetekst i udfyldt stand som forside på jeres opgavebesvarelse. Siden findes også på nettet. 1

2 Summary statistics for bone mineral density (for alle 112 piger) er angivet i tabellen på næste side, blot for at I kan checke at data er kommet rigtigt ind. Målingerne af bone mineral density (bmd) har enheden g cm bmd1 bmd treat N Mean Std N Mean Std C P Det er i orden ved løsningen af opgaven at anvende normalfordelingsbaserede metoder (uden at transformere), men derfor er det alligevel godt at kommentere på denne antagelse, uden at gå i alt for meget detalje. I de 6 første spørgsmål skal der ikke tages hensyn til, at det eksakte antal dage mellem målingerne varierer noget. 1. Husk at slette den observation, der fremgår af listerne på nettet! 2. Ser det ud som om randomiseringen har været korrekt udført? 3. Et antal piger har kun fået målt bmd en enkelt gang. Beskriv bortfaldet (gerne grafisk) og kommenter dets mulige betydning for konklusionerne. 2

3 4. Udregn ændringen i bone mineral density for hver enkelt pige som bmd5-bmd1, og undersøg v.hj. a. et Bland-Altman plot (differenser mod gennemsnit) om differensen er et rimeligt mål for ændringen i bone mineral density i de to grupper. 5. Er der evidens for en reel forøgelse af bone mineral density i placebogruppen? Test den relevante hypotese og kvantificer ændringen (estimat med konfidensinterval). 6. Sammenlign ændringen i bone mineral density for de 2 grupper. Kvantificer forskellen på disse ændringer (husk konfidensinterval). Der skal nu tages hensyn til, at der ikke er helt lige lang tid mellem de to målinger for alle piger. 7. Er der systematisk forskel på de to grupper mht tiden mellem de to målinger? 8. Undersøg for hver gruppe for sig, om ændringen i bone mineral density afhænger af den forløbne tid mellem målingerne. Giv i denne forbindelse et estimat for den årlige forøgelse af bone mineral density i hver af grupperne (husk konfidensinterval). 9. Hvordan opsummerer man bedst effekten af calcium, når man samtidig skal tage hensyn til antallet af dage mellem målingerne? Husk igen konfidensinterval! Reference: Vonesh, F & Chinchilli, V.M. (1997): Linear and nonlinear models for the analysis of repeated measurements. Chapman & Hall. 3

4 Regler for hjemmeopgave i basal statistik 1. Opgaven er individuel. Gruppebesvarelser modtages ikke. Det er naturligvis tilladt at snakke sammen om opgaven, men den endelige udformning skal være selvstændig. 2. Opgaven er obligatorisk. Godkendelse af opgavebesvarelsen er en forudsætning for udstedelse af kursusbevis. 3. Opgavebesvarelser med væsentlige fejl vil ikke blive godkendt. I et sådant tilfælde vil I dog få en chance til at lave de relevante dele om, inden for en kort tidsfrist. 4. Der er intet krav om brug af specifikt statistikprogrammel, men der kræves dokumentation for udførte analyser i form af computer output, i passende omfang. 5. Ukommenteret computer output er ikke tilstrækkeligt. I skal også med egne ord formulere hvad man kan aflæse på outputtet eller udlede af figurerne. 6. Skriftlig standardbesvarelse frigøres først på hjemmesiden efter at alle opgavebesvarelser (incl. revisioner) er i hus og endeligt vurderet. Gode råd Start tidligt. Det tager ofte længere tid end man tror, og det kan være en fordel at benytte lejligheden til at stille spørgsmål ved de mellemliggende øvelsesgange. Check at alle delspørgsmål bliver besvaret.

5 Hjemmeopgave, efterår 2009 Basal statistik for sundhedsvidenskabelige forskere Navn Hold Jeg har undervejs i opgaveløsningen diskuteret problemerne med følgende personer: Jeg erklærer, at jeg egenhændigt har udført analyserne og formuleret besvarelsen. Dato Underskrift