Basal statistik for sundhedsvidenskabelige forskere, efterår 2014 Udleveret 30. september, afleveres senest ved øvelserne i uge 44 (

Transkript

1 Hjemmeopgave Basal statistik for sundhedsvidenskabelige forskere, efterår 2014 Udleveret 30. september, afleveres senest ved øvelserne i uge 44 ( oktober) En stor undersøgelse søger at afdække forhold vedrørende komplikationer i forbindelse med anæstesi. På hjemmesiden ligger data fra 691 kvindelige patienter, der har gennemgået en af tre mulige operationstyper. Forslag til variabelnavne er angivet i 1. linie, og betydningen af disse er: id: Patientens løbenummer optype: Operationsgruppe: A : Abdominal, G : Gynækologisk, O : Ortopædisk alder: Patientens alder i år antid: Længden af anæstesien, i minutter kompl: Fik patienten en komplikation? 1: ja eller 0: nej OBS: Meget vigtigt!! I skal benytte hver jeres datasæt, idet hver enkelt kursist skal slette en af observationerne fra den gynækologiske gruppe. Det fremgår af en liste på hjemmesiden hvilken det drejer sig om for hver enkelt. Dette er desværre nødvendigt pga. tidligere problemer med afskrift. I bedes benytte sidste side fra denne opgavetekst i udfyldt stand som forside på jeres opgavebesvarelse. Siden findes også på nettet. 1

2 Opgaven er at se på forskelle i alder og anæstesivarighed for de tre operationstyper (i det følgende benævnt hhv. A-, G- og O-gruppen), samt at komme et stykke af vejen i at se, om disse forskelle kan forklare noget om komplikationsrisikoen. 1. Beskriv fordelingen af anæstesivarigheden for gynækologiske patienter: (a) Brug passende valgte summary statistics og forklar kort deres betydning. Husk også en grafisk illustration. (b) Udregn et normalområde (referenceområde), baseret på en normalfordelingsantagelse, på passende valgt skala. (c) Sammenlign med et normalområde, udregnet direkte ved fraktiler (se hint på hjemmesiden), og kommenter evt. forskelle. 2. Lav en passende illustration til sammenligning af anæstesivarigheden for de tre operationstyper, og foretag et test for identitet af de tre middelværdier: (a) Er der evidens for forskel på middelværdierne i de tre grupper? (b) Angiv estimatet (med 95% konfidensinterval) for forskellen i middelværdi for A-gruppen i forhold til G-gruppen. Kan forskellen muligvis være helt op til en time? 3. Udfør et T-test til sammenligning af anæstesivarigheden for A-gruppen vs. G-gruppen. (a) Kvantificer forskellen med et konfidensinterval og sammenlign dette med det fra spørgsmål 2b. (b) Hvordan ville forskellen på grupperne skulle rapporteres, hvis man benyttede en logaritmetransformation af anæstesivarighederne? Estimat med konfidensgrænser ønskes angivet, tilbagetransformeret til original skala og fortolket i ord. 4. Lav en lille tabel med gennemsnit (eller median) af alder og anæstesivarighed i de tre grupper. Ser det ud som om alderen har betydning for anæstesivarigheden? 5. Tegn anæstesivarigheden op mod alderen, med symboler svarende til operationstype og indlæg regressionslinier for hver operationstype for sig. I må selv bestemme, om der skal transformeres eller ej, men det tilrådes at lade være for ikke at komplicere fortolkningerne for meget. 2

3 (a) Kvantificer den forventede ekstra anæstesivarighed for hvert tiår, for hver af de tre grupper for sig. (b) Er der evidens for forskelle i alderseffekten i de tre grupper? (Dette spørgsmål kræver analyse i en model for alle tre operationstyper samlet). (c) Samme spørgsmål som 5b, hvis vi udelader O-gruppen? 6. Brug regressionsmodellen fra modellen i spørgsmål 5c til at estimere forskellen i anæstesivarighed for 50-årige abdominalpatienter sammenlignet med 50-årige gynækologiske patienter, og sammenlign med de tilsvarende estimater fra spørgsmål 2b og 3a. Vi skal nu se på komplikationsfrekvenserne i de tre operationsgrupper: 7. Angiv estimater med tilhørende konfidensgrænser for sammenligning af A-gruppen med G-gruppen, dels i form af differensen på komplikationssandsynlighederne og dels i form af odds ratio og relativ risiko for komplikation. Prøv så vidt muligt at formulere konklusionen i ord. (a) Kan vi konkludere, at de to operationstyper disponerer forskelligt for postoperative komplikationer? (b) Kan der f.eks. være tale om dobbelt så stor risiko for den ene operationstype? 8. Som spørgsmål 7, blot for O-gruppen vs. G-gruppen. 9. Udbyg tabellen fra spørgsmål 4 med komplikationsfrekvensen i de tre grupper. Ser det ud som alder og anæstesivarighed kan forklare noget af forskellene i komplikationsfrekvensen i de tre grupper. 10. Lav nogle figurer til at belyse, om alder og/eller anæstesivarighed har nogen betydning for forekomst af komplikationer i A-gruppen. Hvis man ville undersøge sandsynligheden for komplikation som funktion af såvel anæstesivarighed og alder, hvilken type analyse kunne man da med rimelighed anvende? I har ikke lært denne type analyse endnu og skal ikke udføre den, men evt. give den et navn ud fra oversigtsskemaet. ( 3

4 Regler for hjemmeopgave i basal statistik 1. Opgaven er individuel. Gruppebesvarelser modtages ikke. Det er naturligvis tilladt at snakke sammen om opgaven, men den endelige udformning skal være selvstændig. 2. Opgaver skal afleveres på papir, enten til øvelserne, på mit kontor ( ), eller sendes som almindeligt brev. Elektroniske besvarelser modtages ikke!! Det er simpelthen for arbejdskrævende med al den printning og sortering, beklager. Opgavebesvarelsen skal benytte en korrekt udfyldt forside (vedhæftet her, men kan også udprintes fra hjemmesiden). 3. Opgaven er obligatorisk. Godkendelse af opgavebesvarelsen er en forudsætning for udstedelse af kursusbevis. 4. Opgavebesvarelser med væsentlige fejl vil ikke blive godkendt. Det er altså ikke tilstrækkeligt at besvare halvdelen af opgaven korrekt. I tilfælde af betydelige fejl i opgaven vil I få en chance til at lave de relevante dele om. 5. Der er intet krav om brug af specifikt statistikprogrammel, men der kræves dokumentation for udførte analyser i form af udvalgte dele af computer outputtet. 6. Ukommenteret computer output er ikke godt nok. I skal også med egne ord formulere hvad man kan aflæse på outputtet. 7. Skriftlig standardbesvarelse lægges først på hjemmesiden efter at alle opgavebesvarelser er i hus og godkendt. (Ellers kan man jo bare skrive af!) Gode råd Start tidligt. Det tager ofte længere tid end man tror, og det kan være en fordel at benytte lejligheden til at stille spørgsmål ved de mellemliggende øvelsesgange. Man kan med fordel med det samme påbegynde et Word dokument med opgavebesvarelse og løbende kopiere relevant output ind her og kommentere. Det er også væsentligt lettere at rette opgaven, hvis output står på de relevante steder og ikke i appendix.

5 Hjemmeopgave, efterår 2014 Basal statistik for sundhedsvidenskabelige forskere Navn Hold Jeg har slettet observationen med løbenummer (id): Jeg har undervejs i opgaveløsningen diskuteret problemerne med følgende personer: Jeg erklærer, at jeg egenhændigt har udført analyserne og formuleret besvarelsen. Dato Underskrift