Prøvevejledning. Principper for mikrobiologisk undersøgelse Generelt: Undersøgelse for specielle bakterier og svampe:...

Transkript

1 Side 1 af 158 Indledning... 7 Geografi:... 7 Telefon:... 7 Åbningstid:... 8 Vagtordning:... 8 Rekvirering af akutte mikrobiologiske:... 8 Kl Kl Telefonisk rådgivning:... 9 Patienttilsyn:... 9 Konferencer:... 9 Videnskabelige undersøgelser: Principper for mikrobiologisk undersøgelse Generelt: Undersøgelse for specielle bakterier og svampe: Bestilling af mikrobiologisk undersøgelse Utensilieoversigt: Efter prøvetagning Opbevaring: Indlevering: Akutte prøver: Mikrobiologiske prøvemodtagelser: Transport: Svartyper: Afsendelse af svar: Tolkning af svar: Følsomshedsbestemmelse in vitro: Supplerende undersøgelser: Undersøgelseskategorier Abscesmateriale, aspireret pus (10011) Adenovirus fæces, se Gastroenteritis, diagnostik Adenovirus øje (32080) Arena (Lassa, Junin) virus PCR og antistof IgM, IgG, se Lassa Virus Aspergillus galactomannan antigen (23051/NPU22155) Aspergillus antistof (NPU28756) AST (anti-streptolysin O) (NPU08093) Atypisk pneumoniantistof Bartonella henselae (cat scratch disease) og Bartonella Quintana (trench fever) antistof (NPU14445) Bartonella henselae (cat scratch disease) og Bartonella Quintana (trench fever) PCR (12138) Bilharzia antistoffer, se Bloddyrkning (NPU17191/NPU14618/EPC00150) BK polyomavirus DNA/RNA (32251/SSI00273) Bordetella pertussis IgG antistof, se Kighoste (Bordetella pertussis) antistoffer Bordetella pertussis/parapertussis DNA/RNA, se Kighoste (Bordetella pertussis) DNA Borrelia burgdorferi antistoffer (NPU16028/DNK05348) Bronkoalveolær lavage (BAL) (10011/52010/11601/32010/32032/ 22070/52050/33057/32020/23051) Brucella antistof (NPU14439) Brucella DNA/RNA (12142) Burkholderia pseudomallei DNA/RNA (12144) Børneorm (Enterobius vermicularis) (41040) Campylobacter antistof Ig (G, M, A) (NPU14452) Candida mannan (antigen og antistof undersøgelse) (NPU27498) Chikungunya virus PCR og antistof IgM & IgG (NPU27084/NPU57062) P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

2 Side 2 af 158 Chlamydophila pneumoniae antistof IgG & IgM (NPU17003) Chlamydophila pneumoniae DNA, se Pneumoniudredning (atypisk pneumoni) Chlamydophila psittaci antistof (papegøjesyge) (SSI00371) Chlamydia psittaci DNA (52010) Chlamydia trachomatis og Neisseria gonorrhoeae DNA (12250) Clostridium botulinum (10011) Clostridium difficile, se Gastroenteritis, diagnostik Clostridium tetanitoxin antistof (NPU56571) Coccidioides antistof (NPU12129) Coxiella burnetii antistof (Q-fever) (NPU54251) Coxiella burnetii PCR (Q-fever) (12274) CPO (carbapenemase-producerende bakterier), screening for (10118) Crimean Congo hemorrhagic fever virus DNA/RNA, se Krim-Congovirus PCR og antistof IgM, IgG Cryptococcus antigen (NPU17489/NPU17431) Syfilisantistoffer (CSV) fuld undersøgelse (DNK35912) CVK-spids, se I.V. kateterspids Cytomegalovirus DNA kvantitativ/viral load (NPU28653(serum/32032(andet)) Cytomegalovirus (CMV) antistoffer (NPU01846) Denguevirus antigen og antistofundersøgelse (DNK35279) Diaréudreding, se Gastroenteritis, diagnostik Dientamoeba fragilis Difteritoksin antistof (NPU56572) Duodenalsekret (10011/59110) Ebola virus PCR og antistof IgM, IgG Echinococcus (mikroskopi) (41020) Echinococcus granulosus antistof (NPU28916) Se Rigshospitalets prøvevejledning Echinococcus multilocularis antistof (NPU01927) Ehrlichia antistof (NPU28476) Encephalit udredning, se også Herpes simplex virus 1+2 og Varicella zoster virus (DNA/RNA); CSV (EPC00213) Ekspektorat, trakeal- og bronkialsekret (10011) Enterobius vermicularis, se børneorm Entamoeba histolytica antistof (NPU12120) Enterovirus IgM (NPU12723) Entero- og parechovirus RNA/DNA, fæces (32065) Enterovirus RNA (32060) Epstein-Barr virus (EBV) antistoffer (NPU14054) Epstein-Barr virus (EBV) DNA Kvant. (NPU29074/32042) Fasciola hepatica antistof (NPU27820) Filarioidea antistof (NPU02058) Flucytosin serum koncentration (NPU19770) Franciscella tularensis antistof (NPU08038) Franciscella tularensis DNA (12276) Franciscella tularensis (dyrkning) (10822) Fæces for orm, æg og cyster, se Gastroenteritis, diagnostik Gardnerella Vaginalis, se vaginalpodning for gær Gastroenteritis, diagnostik (59001) Giardia trofozoitter, se Duodenalsekret Gonokokker, se Neisseria gonorrhoeae (gonokokker)(dyrkning) og Chlamydia trachomatis og Neisseria gonorrhoeae RNA Gonokok antistof (GAT) Gul feber virus PCR (NPU27081) og antistof IgM, IgG (NPU53357) Haemophilus ducrei (12100) Haemophilus influenza type b antistof (Hib) (NPU08044) Hantavirus PCR (NPU27111) og antistof IgM, IgG (NPU29071) P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

3 Side 3 af 158 Helicobacter pylori antigen i fæces (13260) Helicobacter pylori antistoffer Helicobacter pylori, dyrkning fra ventrikelbiopsi, se Væv, knogle og vævs-biopsier Hepatitis A virus (HAV) (NPU17657) Hepatitis A virus (HAV) PCR (32150) Hepatitis B virus (HBV) (NPU16105) Hepatitis B virus (HBV), DNA (PCR) kvantitativ (NPU16258) Se Hvidovre Hospitals prøvevejledning Hepatitis B virus (HBV), subtype og resistensbestemmelse Hepatitis C virus (HCV) (NPU12728) Hepatitis C virus genotypning (NPU57507) Se Hvidovre Hospitals prøvevejledning Hepatitis C virus, RNA (RT-PCR) kvantitativ (NPU16355) Hepatitis D virus PCR (NPU20186) Hepatitis D virus antistof HDV (NPU02345) Hepatitis E (HEV) RNA PCR (NPU28021/32175) Hepatitis E antistof IgM, IgG (NPU54238) Herpes simplex virus (HSV) antistof (NPU18834) Herpes simplex virus (HSV) DNA (typespecifik) (32010) Histoplasma antistof (NPU12128) HIV 1 og HIV 2 (antigen- og antistofundersøgelse) (NPU19649) HIV-1 genotypisk resistensbestemmelse (NPU29263) HIV-1 genotypisk tropisme test (SSI00681) HIV-1 integrase resistens (NPU29920) HIV-1 RNA (Viral load) kvantitativ (RT-PCR) (NPU16132) Se Hvidovre Hospitals prøvevejledning HIV-1 PCR (DNA) kvalitativ (NPU16131) HSV, se Herpes simplex virus (HSV) antistof Hudsvampe (dermatofytter) DNA/RNA (22050) Hudsvampe (dermatofyter) mikroskopi og dyrkning (21030) Human herpes virus 6A, 6B, 7 DNA (SV100279) Human papillomavirus DNA/RNA (SSI00265) Influenza C Influenzavirus subtypning Influenzavirus, genotypisk resistens overfor neuramidasehæmmer Itraconazol serum koncentration (NPU27331) I.V. kateterspids (10011) Japansk encephalit virus PCR og antistof (NPU27117/NPU53365) JC-polyomavirus (NPU27704) Kighoste (Bordetella pertussis) antistoffer (NPU13609) Kighoste (Bordetella pertussis) DNA (NPU13609/12145) Koncentrationsbestemmelse af antibiotika (NPU19779/NPU19867/NPU19919/NPU19929) Krim-Congovirus PCR (NPU27090) og antistof IgM, IgG (NPU53360) Lassa Virus PCR og antistof IgM, IgG (NPU54040/NPU54039) Legionella DNA (52010) Legionella pneumophila (LUT) og pneumokok antigener (PUT) (53300) Legionella pneumophila antistof (LAT) (NPU14591) Leishmania arter antistof (NPU58288) Leptospira DNA/RNA (SSI00065/12102) Leptospira antistof (Weil) (NPU12657) Luftvejsvirus udvidet DNA/RNA (33057) Malaria (NPU21598) Marburg Virus DNA/RNA (NPU27102) IgG og IgM antistof (NPU53363) Meningitis PCR (Pneumo- og meningokokker DNA/RNA) (12106) P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

4 Side 4 af 158 Meningokok antistoffer (MAT) (NPU02891) Morbillivirus IgM og IgG antistof (NPU14920) Se Hvidovre Hospitals prøvevejledning Morbillivirus DNA (NPU18830/NPU18832/32015) MRSA (meticillinresistente S. aureus) (12128/10122) Mycobacterium (TB) (mikroskopi, PCR og dyrkning) (11601) Multiresistente bakterier ved udlandsrejser og hospitaler se Udlandsscreening, screening for (multi-) resistente bakterier Mycoplasma pneumoniae IgG og IgM antistof (NPU02853) Se Hvidovre Hospitals prøvevejledning Mycoplasma pneu. DNA/Chlamydophila pneumoniae DNA (52010) Mykobakterier atypiske PCR (kan udføres på mikroskopipositive og ekspektorater) Mycoplasma genitalium DNA/RNA (12510) Mycoplasma hominis DNA (12505/NPU29537) Mæslinger, se Morbillivirus DNA Neisseria gonorrhoeae (gonokokker)(dyrkning) (10200) Neisseria meningitidis antistof (MAT), se Meningokok antistoffer Non-gonorrhoisk, non-chlamydia urethrit/cervicit Norovirus, se Gastroenteritis, diagnostik Orm, æg og cyster, se Gastroenteritis, diagnostik Orm (identifikation) (41007) Parechovirus, se Enterovirus IgM Parotitisvirus IgG antisstof (immunstatus) (NPU03952) Se Hvidovre Hospitals prøvevejledning Parotitisvirus IgM og IgG antistof (NPU17128) Se Hvidovre Hospitals prøvevejledning Parotitisvirus DNA/RNA (NPU28710/NPU28711/32118) Parvovirus B-19 IgM og IgG antistof (NPU58175) Parvovirus DNA/RNA (NPU58172(CSV)/NPU58171(EDTA)/32120(Andet)) Se Rigshospitalets prøvevejledning Plasmodium (mikroskopi) (malaria), se Malaria Plasmodium arter (malaria) antistof IgM, IgG (NPU14921) Pneumocystis jiroveci (tidl. carinii) DNA (22070) Pneumokok antistof (23 valent) (NPU12001) Pneumonok antistof (7/13 valent) (NPU54234) Pneumoniudredning (atypisk pneumoni) (52010) Podning fra cervix (10011/10200/12250) Poliovirus neutraliserende antistof (NPU17414) Polyomavirus Ki (32252) & Wu (32253) Posaconazol serumkoncentration (NPU27459) Poxvirus DNA/RNA (32300) Pus, sårsekret, sekret podning (10011) PUT, se Legionella pneumophila (LUT) og pneumokok antigener (PUT) Q-feber, se Coxiella burnetii antistof (Q-fever) Rabiesvirus antistof (NPU56028) Rickettsia arter DNA (12300) Rickettsia antistof (SSI00354) Rift Valley virus DNA/RNA, IgG og IgM antistof (NPU27099/ NPU 53362) RSV, se Influenza (A&B) og RS virus DNA/RNA Rotavirus, se Gastroenteritis, diagnostik Rubellavirus IgM og IgG antistof (NPU14062) Rubellavirus RNA/DNA (NPU28708/NPU28709/32125) Salmonella antistof (enteritidis og typhimurium) (SSI00361) Sandfly fever virus DNA/RNA (32025) Sandfly fever virus antistof IgM, IgG (SSI00242) P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

5 Side 5 af 158 Schistosoma (bilharziose) antistof (NPU17104) Schistosomiasis (Bilharziose), mikroskopi (41010) Screening for Multiresistente bakterier, Udlandsscreening, se Udlandsscreening, screening for (multi-) resistente bakterier Sektionsmateriale (10011) Serumkoncentration af antituberkuløse midler Serumkoncentration af svampemidler, se Flucytosin serum koncentration, Posaconazol serumkoncentration, Voriconazol serumkoncentration eller Itraconazol serum koncentration) Staphylococcus aureus (MRSA) (dyrkning), se MRSA (meticillinresistente S. aureus) Spinalvæske og hjerneventrikelvæske Dyrkning og Resistens (10011) Streptococcus pneumoniae antistof (23 valent), se Pneumokok antistof (23 valent) Streptococcus pneumoniae antistof (7/13 valent), se Pneumonok antistof (7/13 valent) Streptococcus pneumoniae (pneumokok) antigen i urin (PUT) (53300) Strongyloides antistof (NPU27819) Strongyloides dyrkning (40100) Se Rigshospitalets prøvevejledning Syfilisantistoffer i spinalvæske, se Syfilisantistoffer intratekal syntese Syfilisantistoffer intratekal syntese (DNK35912) Svælgpodning for ß-hæmolytiske streptokokker (10011) Svælgpodning, andet (10011) Taenia solium antistof (cysticercosis) (NPU27903) Tarmpatogene bakterier, inklusive Clostridium difficile, se Gastroenteritis, diagnostik TB, PCR for, se Mycobacterium (TB) (mikroskopi og dyrkning) TBE antistof, se Tick borne encephalitis (TBE) IgG og IgM) TBE DNA/RNA, se Tick borne encephalitis (TBE) DNA/RNA Tetanustoksin antistof, se Clostridium tetanitoxin antistof Tick borne encephalitis (TBE) IgG og IgM (NPU17637) Tick born encephalitis (TBE) DNA/RNA (NPU27614/NPU27695) Toscana virus DNA/RNA, IgG og IgM antistof, se Sandfly fever virus antistof IgM, IgG Toxocara antistof (SSI00377) Toxoplasma gondii IgG og IgM antistof (NPU12259) Toxoplasma gondii (nyfødte) (42045) Toxoplasma gondii DNA/RNA (NPU12967/42020) Treponema pallidum antistoffer, intratekaltest, se Syfilisantistoffer intrathekal syntese Treponema pallidum antistoffer i spinalvæske, se syfilisantistoffer (CSV) Treponema pallidum antistoffer (syfilis screening) (NPU14097) Treponema pallidum DNA/RNA (12280) Trichinella spiralis antistof (SSI00382) Trichomonas vaginalis, se Vaginalpodning for gær Trofozoitter af Giardia intestinalis i duodenalsekret (59110) Tropheryma whipplei DNA/RNA (12108) Trypanosoma antistof (NPU17484) Udlandsscreening, screening for (multi-) resistente bakterier (10050) Ureaplasma urealyticum og Ureaplasma parvum (DNA) (12159) Urin (10011) Urogenitiale mycoplasmer, se Mycoplasma genitalium DNA/RNA Vaginalpodning for gær (20010) Varicella zoster virus (VZV) antistoffer (NPU12275) Varicella zoster virus (VZV) DNA (32020) Venezuelansk equine encephalitis virus IgG og IgM antistof (NPU53361) VRE (vancomycin-resistente enterokokker), screening for (10117) Voriconazol serumkoncentration (NPU27136) VZV, se Varicella zoster virus (VZV) DNA VZV-antistof, se Varicella zoster virus (VZV) antistoffer P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

6 Side 6 af 158 Væsker, led-, pleura-, perikardie-, p-dialysevæske, ascites m.m. (10011) Væv, knogle og vævs-biopsier (10011) West Nile virus DNA/RNA, IgG og IgM antistof (NPU27108/NPU53369) Yellow fever, se Gul feber virus PCR og antistof IgM, IgG Yersinia enterocolitica 0:3 antistof (NPU13815) Se Hvidovre Hospitals prøvevejledning) Yersinia pestis DNA (12112) Zikavirus antistof (IgG, IgM) (NPU53851) Zika Virus (RNA) (NPU54041) Zoonotisk fugle- og svineinfluenza (32113) Øjenpodning (10011) Øjenpodning for Chlamydia og Gonokokker (12250) Ørepodning (10011) Bilag P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

7 Side 7 af 158 Indledning Geografi: Telefon: Region Hovedstaden Klinisk Mikrobiologisk Afdeling (KMA) Herlev Hospital, Opgang 59 etage 05 Herlev Ringvej 75, 2730 Herlev Gennemvalgsnummer til fastnettelefoner lokalnummer. Sekretariat... lokal Vagthavende læge... lokal Afdelingsledelsen Ledende overlæge, dr.med. Jens Otto Jarløv... lokal Konst. Ledende overbioanalytiker Anne Kailow. lokal Afdelingsledelsessekretær Elsebeth Theil... lokal Øvrige speciallæger Overlæge Barbara Juliane Holzknecht... lokal Overlæge, ph.d. Bente Olesen... lokal Overlæge, ph.d. Dennis Schrøder Hansen... lokal Overlæge, dr.med. Jette Bangsborg... lokal Overlæge Lene Nielsen... lokal Afdelingslæge Inger Brock... lokal Afdelingslæge Valeria Antsupova... lokal Bioanalytikerundervisere/afdelingsbioanalytikere Casper Dam-Nielsen... lokal Hanne Wiese Hallberg... lokal Irene Møller Jensen... lokal Betina Jensen... lokal Lilyan Almousawi... lokal Tina Profft Larsen... lokal Nina Clarén... lokal Lars Karsten... lokal Hygiejnesygeplejersker Sanne Dragsted... lokal Dorte Buhl... lokal Dorthe Mogensen... lokal Marianne Midttun... lokal Janne Pedersen... lokal Tina Marloth (Nordsjællands hospital)... tlf Helene Bjergegaard Gyrup (Nordsjællands hospital). tlf P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

8 Side 8 af 158 Ledende sekretær Elsebeth Theil... lokal Åbningstid: Vagtordning: KMA har åbent alle ugens dage inkl. søn- og helligdage mellem kl kl Sekretariatets telefon er åben mandag til fredag mellem kl på tlf Opkald til vagthavende mikrobiolog udenfor sekretariatets åbningstider på tlf eller via omstillingen på Herlev Hospital på tlf indtil kl I tidsrummet kl kan vagthavende mikrobiolog på Rigshospitalet kontaktes via omstillingen på tlf Rekvirering af akutte mikrobiologiske: Kl Akutte prøver skal altid meldes til vagthavende mikrobiolog på Herlev ved læge til læge kontakt på tlf eller via omstillingen tlf Den kliniske afdeling bestiller selv transport, akut piccoline (Herlev) eller taxa ved andre hospitaler end Herlev hospital. Som hovedregel betragtes nedennævnte prøver som akutte prøver: Spinalvæsker: Makroskopisk purulent eller relativt forhøjet leukocyt tal og/ eller lav SPV/ blodglucoseratio. Klinisk oplagt meningitis (laboratorietal afventes ikke) Malariastryg (patient med febrile episoder og ophold i malariaområder indenfor de seneste 3 måneder. Disse skal tages akut, og prøvetagning skal ikke vente på bioanalytiker rutinerunde. Væv ved klinisk mistanke om nekrotiserende infektion. Evt. andre prøver, der har en umiddelbar diagnostisk eller terapeutisk konsekvens efter aftale med vagthavende mikrobiolog tlf eller via omstillingen tf Prøver til hurtigtest for MRSA og/eller VRE også som en del af udlandsscreening skal meldes til vagthavende mikrobiolog på tlf , hvis de ønskes undersøgt i weekenden, på P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

9 Side 9 af 158 helligdage eller efter kl. 16 i hverdage. MRSA og VRE udføres på prøver, der ankommer inden kl. 20 alle hverdage og inden kl i weekenden og på helligdage. Ankommer de senere, laves de hurtigst muligt dagen efter. Prøver til undersøgelse for toxin-producerende Clostridium difficile udføres, hvis de ankommer inden kl alle dage. Kl I tidsrummet kl kan vagthavende mikrobiolog på Rigshospitalet kontaktes via omstillingen på tlf Akutte mikrobiologiske prøver, der skal bestilles i tidsrummet fra klokken , skal bestilles på nødblanket og udelukkende efter telefonisk aftale med vagthavende mikrobiolog på Klinisk mikrobiologisk afdeling, på Rigshospitalet. Den vagthavende mikrobiolog træffes via omstillingen på tlf Husk at notere kontaktperson i egen afdeling samt telefonnummer på nødblanketten så Klinisk Mikrobiologisk afdeling kan ringe et svar tilbage. Noter også prøveforsendelsen på ordinationsark som dokumentation. Husk ligeledes at markere prøven med tydelig patientidentifikation. Prøverne sendes med taxa på rekvirentens regning og afleveres i Rigshospitalets information, Blegdamsvej 9, 2100 København Ø, såfremt andet ikke er aftalt med den vagthavende mikrobiolog. Prøver kan ikke sendes uden personlig kontakt og ved forventning om prøvefremsendelse kontaktes den vagthavende mikrobiolog generelt først, når prøveudtagelse er udført. Telefonisk rådgivning: KMA s læger står til rådighed for såvel sygehusvæsen som primær sundhedstjeneste med rådgivning om diagnostik, behandling og profylakse af infektionssygdomme. Hygiejnesygeplejersker og læger yder endvidere infektions hygiejnisk rådgivning. Patienttilsyn: KMA s læger udfører akutte tilsyn på Gentofte, Herlev samt Nordsjællands hospitaler. Tilsyn aftales telefonisk med vagthavende mikrobiolog. Hvis ønske om tilsyn meddeles KMA inden kl , vil dette så vidt muligt blive udført samme dag. Problemstillingen bør fremgå af journalen. Konferencer: Mange kliniske afdelinger har ugentlige konferencer med KMA s læger. Behov for konferencer på andre afdelinger kan aftales med P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

10 Side 10 af 158 KMA s afdelingsledelse. Ved specielle patientproblemer bør KMA orienteres om morgenen inden konferencen, således at relevant materiale kan findes frem. Videnskabelige undersøgelser: KMA samarbejder gerne med sine brugere om videnskabelige projekter inden for infektionshygiejne samt diagnostik og behandling af infektionssygdomme. KMA vil gerne orienteres om projekter, der har et mikrobiologisk aspekt, også selv om et umiddelbart samarbejde ikke skønnes nødvendigt. Ved brug af mikrobiologiske svar i artikler og kasuistikker vil KMA gerne orienteres før publikation. P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

11 Side 11 af 158 Principper for mikrobiologisk undersøgelse Generelt: Resultatet af en mikrobiologisk undersøgelse er helt afhængigt af kvaliteten af det modtagne prøvemateriale og af de ledsagende kliniske oplysninger. Er prøvematerialet ikke repræsentativt, er det til blandet normalflora, eller mangler relevante oplysninger om den kliniske problemstilling, bliver den mikrobiologiske besvarelse mangelfuld eller helt misvisende. I visse tilfælde vil prøven blive afvist, hvis der ikke er relevant indikation eller de kliniske oplysninger mangler. Ofte er en fuldstændig kortlægning af alle tilstedeværende bakterier og svampe ikke praktisk mulig. Dyrkning og identifikation af disse kan være forbundet med ugers eller måneders arbejde. Prøverne behandles derfor efter standardiserede procedurer, som erfaringsmæssigt giver de klinisk mest relevante oplysninger. Visse prøvekategorier dyrkes ikke rutinemæssigt anaerobt, idet dyrkningsresultaterne sjældent giver klinisk relevante oplysninger. Dette gælder dyrkning fra fx svælg, ekspektorat, urin, fæces og vagina. Undertiden vil det være indiceret at afvige fra de standardiserede procedurer. Dette forudsætter imidlertid, at KMA informeres via sufficiente oplysninger på rekvisitionen, evt. suppleret med telefonisk kontakt, inden prøven afsendes. Ved dyrkning fra områder, som normalt forventes at være sterile (blod, spinalvæske, visse punkturvæsker og biopsimateriale), vil alle potentielt patogene bakterier og svampe blive identificeret og resistensbestemt. En undtagelse er dog dykninger fra intraabdominale abscesser, perforeret tarm eller appendix indeholdende talrige bakteriearter, som i så fald vil blive svaret ud summarisk. I tilfælde af særlig "kostbart" prøvemateriale vil det være en god idé at kontakte KMA inden afsendelsen. Undersøgelse for specielle bakterier og svampe: Ved mistanke om specifik ætiologi til en infektion bør dette oplyses, idet bakterier og svampe som fx Actinomyces, Nocardia, difteri-bakterier og Brucella kræver specielle dyrkningsforhold for at kunne påvises. P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

12 Bestilling af mikrobiologisk undersøgelse Side 12 af 158 Mikrobiologiske prøver skal følges af en elektronisk rekvisition. For hospitaler bestilles undersøgelsen i Sundhedsplatformen og for praksissektoren i Webreq. I rekvisitionsbilledet ses tre kolonner, Undersøgelse, Materiale og Lokalisation. Rækkefølgen af disse kolonner bestemmes med sorteringsknappen nederst til venstre under førstesøjle. Generelt bestilles PCR og serologiske undersøgelser efter agensnavn/ undersøgelse, derefter eventuelt Materiale (fx Enterovirus RNA/DNA fæces; Hepatitits A virus antistof (immunstatus) - Serum eller koagelblod). Bakteriologiske prøver, dyrkningsprøver, bestilles generelt altid som Dyrkning og resistens og herefter altid Materiale og eventuelt lokalisation (fx Dyrkning og resistens Sårpodning Lokalisation angivet i fri tekst; Dyrkning og resistens Urin). Enkelte specielle bakteriologiske undersøgelser bestilles efter agens-navn/ undersøgelse, det gælder fx Helicobacter pylori (dyrkning), Dyrkning (gærsvampe) Slimhinde-podning Vagina. Mycobacterium dyrkning og DNA/RNA (TB) materiale. Det selvklæbende nummer på prøvetagningsblanketten (PTB) anvendes som eneste mærkning af prøven. Prøvetagningsblanketten (PTB en) skal ikke medsendes. Utensilieoversigt: Praksissektor Frigjorte kuverter, rekvisitioner (grønne) og utensilier bestilles ved at tilbagesende den bestillingsseddel, der vedlægges hver leverance af utensilier. Hospitalssektor Utensilier bestilles i Refleks og leveres fra: Regionallageret Fabriksparken Glostrup P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

13 Side 13 af 158 Utensilier Bloddyrkningskolbe, Aerobe, Grå/Blå hætte SAP kortbeskrivelse: BACTEC Plus Aerobic/F Medium SAP nr enhed = 50 stk. Anvendelse Bloddyrkningskolbe Gælder kun Herlev og Gentofte Hospitaler Opbevaring ved stuetemperatur beskyttet mod lys Bloddyrkningskolbe, Anaerob, Orange/guld hætte SAP kortbeskrivelse: BACTEC Plus Anaerobic/F Medium SAP nr enhed = 50 stk. Bloddyrkningskolbe, Svampe (mycosis), Grøn/Grå hætte SAP kortbeskrivelse: BACTEC MYCOSIS IC/F SAP nr enhed = 50 stk. Bloddyrkningskolbe, Børnekolbe, Lyserød/sølv hætte SAP kortbeskrivelse: BACTEC PEDS/PLUS SAP nr enhed = 50 stk. P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

14 Side 14 af 158 Utensilier Bloddyrkningskolbe, Aerob kolbe/blå hætte SAP kortbeskrivelse: BACT/ALERT SA SAP nr enhed = 25 eller 100 stk. Bloddyrkningskolbe, Aerob kolbe/grøn hætte Anvendelse Bloddyrkningskolber Gælder kun Nordsjællands Hospital Psykiatrisk center - Nordsjælland Opbevaring ved stuetemperatur beskyttet mod lys SAP kortbeskrivelse: BACT/ALERT FA PLUS SAP nr enhed = 25 eller 100 stk. Bloddyrkningskolbe, Anaerob kolbe/ mørkerød hætte SAP kortbeskrivelse: BACT/ALERT SN SAP nr enhed = 25 eller 100 stk. Bloddyrkningskolbe, Anaerob kolbe/orange hætte SAP kortbeskrivelse: BACT/ALERT FN PLUS SAP nr enhed = 25 eller 100 stk. Bloddyrkningskolbe, Børnekolbe/gul hætte SAP kortbeskrivelse: BACT/ALERT PF PLUS SAP nr enhed = 100 stk. P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

15 Side 15 af 158 Utensilier Chlamydia trachomatis/ Neisseria gonorrhoeae/ Mycoplasma genitalium Molekylærbiologisk teknik Anvendelse Prøvetagningssæt, kvinder (Cervix, urethra), mænd (urethra) og øjne SAP kortbeskrivelse APTIMA Unisex speciment collection SAP nr pakke m/ 1 transportør og 2 podepinde 1 enhed = 50 eller 7200 sæt Chlamydia trachomatis/ Neisseria gonorrhoeae/ Mycoplasma genitalium Molekylærbiologisk teknik SAP kortbeskrivelse APTIMA Multitest kit SAP nr (PRD-03546) 1 pakke med 1 transportør og 1 podepind 1 enhed = 1 æske med 50 stk. eller 1 karton med 1000 stk. Chlamydia trachomatis/ Neisseria gonorrhoeae/ Mycoplasma genitalium Molekylærbiologisk teknik Urinopsamlingsrør Prøvetagningssæt, vaginalpodning Urin SAP kort beskrivelse: APTIMA Urine Speciment collection kit SAP nr enhed = 50 eller 1000 sæt P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

16 Side 16 af 158 Utensilier EDTA-glas, 3ml (Lilla låg med sort ring) Anvendelse Supplerende blodprøve til malaria SAP kortbeskrivelse: Vacutainer K3 EDTA, GLAS, 3 ml 13x75 mm SAP nr enhed = 100 stk. Blodprøverør med gel (Gult låg) Blodprøve glas SAP kortbeskrivelse: Serum med gel 5/3,5 ml, snaplåg, SAND4G SAP nr enhed = 50 eller stk. Ekspektorat dåse m/ plasticcontainer Ekspektorat SAP nr enhed = 5 stk. eswab m/alm. podepind hvidt skruelåg SAP nr enhed = 1 el. 50 stk. eswab m/tynd podepind blåt skruelåg SAP nr enhed = 1 el. 50 stk. Dyrkning og resistens samt virus PCR-analyser Bruges fortrinsvis til kighoste, men kan også bruges til andre podninger, hvor de anatomiske forhold taler for det. P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

17 Side 17 af 158 Utensilier Forsendelsesetui til 2 objektglas SAP nr enhed = 50 stk. Forsendelseshylster til svampeprøve (Mikroskopi & Dyrkning) Anvendelse Børneorm analaftryk Malariaudstryg (Objektglas kan ses hvide i stedet for lyserøde) Svampeprøve (Mikroskopi & Dyrkning) SAP fritekst: Dermapak 2000 Black 25 stk. Varenr: DMK201 Kat: Pris: 200 kr. Leverandør: Pris: 200 kr Forsendelseshylster til svampeprøve (DNA/RNA) Svampeprøve (PCR) Mikrorør 2 ml, m/skruelåg spids bund SAP nr enhed = 100 stk. Forsendelsesrør til sprøjter Rør 50ml V-bund m/skruelåg SAP nr enhed = 20 stk. Fæcesrør SAP nr enhed = 300 stk. Forsendelsescontainer til fæcesrør SAP nr enhed = 1, 30 el. 300 stk. P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

18 Side 18 af 158 Utensilier Objektglas uslebne med mat skrivefelt Anvendelse Malariapræparat m.m. SAP nr enhed = 1 æske á 50 stk. Objektglas, facetslebne med 2 afskårne hjørner SAP nr enhed = 1 æske á 50 stk. Plastflaske, 250 ml. Skruelåg til 250 ml. flaske SAP nr Og enhed = 1 stk. Plastflaske, 1 L Skruelåg til 1 L flaske Udstrygning af malariapræparat Bronkoalveolær lavage (BAL) Urin til undersøgelse for æg af Schistosoma SAP nr Og enhed = 10 stk. Spidsglas m/skruelåg, sterile Centrifuge Tube w/cap 11 ml Conical St Flydende prøvematerialer fx urin, spinalvæske, sekret og andre væsker. SAP nr kasse = 480 stk. Gælder Herlev og Gentofte Hospitaler Spidsglas m/skruelåg, sterile Centrifugerør spids bund *S SAP nr. IV kasse = 75 eller 450 stk. Gælder Nordsjællands Hospitaler, Psykiatrisk center Nordsjælland P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

19 Side 19 af 158 Utensilier Anvendelse Sprøjte 3 ml. Luer Lock Sprøjte u. kanyle, 3 komp. LL 2-3ml SAP nr enhed = 5 stk. Sugekateter Ideal, lige CH 06/35 cm. SAP nr enhed = 100 stk. Sugekateter Ideal, lige CH 08/33 cm. SAP nr enhed = 100 stk. Termobeholder Udlånes af KMA efter telefonisk aftale, tlf Trakeal sugesæt med vaccumkontrol Nasofaryngealsug for respirationsvejsvirus (børn) Transport duodenalsekret til undersøgelse for trofozoitter SAP nr enhed = 1 stk. eller 50 stk. Vatpind, steril, hvid SAP nr enhed = 50 pakker á 2 stk. Urinprøvesæt, steril SAP nr. IV enhed = 1 stk. eller 50 stk. Prøvetagning af urin til dyrkning Urinrør til D+R, praksis (borsyreglas) Prøvetagning af urin til dyrkning KUN praksissektor Rekvireres på Klinisk Mikrobiologisk Afdeling P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

20 Side 20 af 158 Utensilier Urinrør til D+R, hospital (uden borsyre) Anvendelse Prøvetagning af urin til dyrkning, alternativ til spidsglas SAP nr enhed = 1 stk. eller 100 stk. Urinrør D+R (adapter) SAP nr enhed = 1 stk. eller 100 stk. Forsendelseshylster KUN praksissektor Rekvireres på Klinisk Mikrobiologisk Afdeling Prøvetagning af urin til dyrkning Urin suges ved hjælp af adapter og vacum op i glasset. Forsendelse af eswab, aptimautensilier, urin D+R og glas til blod P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

21 Side 21 af 158 Efter prøvetagning Opbevaring: Indlevering: Prøverne opbevares som angivet under de enkelte prøvekategorier. Prøver til undersøgelse afleveres i de mikrobiologiske prøvemodtagelser, hvor der er opbevaringsskab (stuetemperatur) og køleskab (4-8 C) med adgang fra gangen til højre for elevatoren. Prøver fra hospitaler skal fremsendes i gule poser eller i de dertil indrettede grå kasser. Når prøverne ankommer til KMA sættes de på hylder i køleskabet. Bloddyrkningskolber sættes i opbevaringsskabet (stuetemperatur), hvor eventuelle rekvisitionerne også placeres. Akutte prøver: Akutte prøver kræver forudgående aftale med vagthavende mikrobiolog. Rekvirerende læge konfererer med vagthavende mikrobiolog om prøvebehandling, transportmåde, afleveringssted og tidspunkt. NB! Når akutte prøver fremsendes med taxa, anbringes prøve og Rekvisition, i en lukket kuvert. Mikrobiologiske prøvemodtagelser: Herlev Hospital: Kl : KMA, opgang 59, etage 05 (gul trappe). Gentofte Hospital: Klinisk biokemisk afdeling, (Centrallaboratorium) opgang 20. Nordsjællands Hospital Hillerød, Klinisk biokemisk afdeling Dyrehavevej 29, 3400 Hillerød Nordsjællands Hospital Frederikssund, Klinisk biokemisk afdeling Frederikssundsvej 30, 3600 Frederikssund Sundhedshuset i Helsingør Murergade 5, 3000 Helsingør Center for Handicappede, Vangedehuse/Lille Mosegaard: Prøverne indleveres i Prøvemodtagelsen, Gentofte Hospital. Steno Diabetes Center samt diverse plejehjem: Prøverne indleveres i Prøvemodtagelsen på KMA, Herlev Hospital. P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

22 Side 22 af 158 Prøver fra praksis Planlægningsområde midt: Prøver i frigjorte kuverter afleveres på postbutik/ posthus. De kan også indleveres direkte i den mikrobiologiske prøvemodtagelse på Herlev Hospital. Efter aftale, kan patienten aflevere urin og fæcesprøver direkte i KMA s prøvemodtagelse. Prøver fra praksis Planlægningsområde nord: Prøver bliver afhentet hos de praktiserende læger og transporteres med intern hospitalstransport. Transport: Prøver transporteres fra hospitalerne i kasser ved henholdsvis 4 C og stuetemperatur som anført under de enkelte prøvekategorier. Tidspunkter for kørsel fra KBA-Hillerød og KBA-Frederikssund Duodenalsekret til undersøgelse for trofozoitter sendes i særlig termobeholder, der udlånes af KMA. Oversigt over transport af prøver fra hospitalsafdelinger til KMA, se bilag 1 Svartyper: Telefonisk svar: Svar afgives telefonisk ved positivt fund i bloddyrkning, spinalvæske, effusionsvæsker og malariaudstryg. Foreløbigt svar: For mange prøvekategoriers vedkommende afgives efter ca. et døgn foreløbigt svar elektronisk via WWBakt. Endeligt svar: Fremkommer, når identifikation og følsomhedsbestemmelse er afsluttet, sædvanligvis efter 3-5 dage, se under den enkelte prøvekategori. Supplerende svar: I visse tilfælde vil det være nødvendigt at bruge længere tid til identifikation eller til supplerende typebestemmelser af de fundne bakterier. Endvidere kan udvidet resistensbestemmelse komme på tale. I disse tilfælde vil der blive sendt et supplerende svar til erstatning for det tidligere udsendte slutsvar. Afsendelse af svar: Svar sendes dagligt og udbringes til afdelingerne elektronisk. Svar til praksissektoren sendes dagligt elektronisk eller med postvæsenet. Tolkning af svar: P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

23 Side 23 af 158 Den mikrobiologiske undersøgelse omfatter almindeligvis: Mikroskopi Bedømmelse af mængden af de dyrkede organismer Identifikation af disse, hvor det er klinisk relevant Følsomhed for antibiotika (resistensmønster) Mikroskopi kan give oplysning om prøvematerialets egnethed. Visse bakterier og svampe kan med stor sikkerhed identificeres alene på udseendet ved direkte mikroskopi evt. suppleret med en hurtigtest, således at afdelingen kan få et foreløbigt telefonisk svar. Da det ikke er muligt at foretage direkte mikroskopi af materialet fra en podepind, vil det altid være bedre at fremsende selve prøvematerialet som anført under de enkelte prøvekategorier. Mængden kan betegnes med et antal bakterier pr. ml, således som det rutinemæssigt sker ved kvantitativ dyrkning af urin og i visse tilfælde ved duodenal- eller tarmsekret. I de fleste tilfælde anvendes en grov kvantitativ bedømmelse af bakteriemængden efter følgende retningslinjer: Talrige: En del: Få: svarer til >10 5 bakterier pr. ml svarer til bakterier pr. ml svarer til <10 3 bakterier pr. ml De anførte kvantitative forhold kan kun tillægges betydning, såfremt der ikke er sket en opformering af bakterierne efter prøvetagningen. Dette forudsætter korrekt opbevaring og transport. Ved dyrkning fra i.v. kateterspids vil der blive angivet et absolut antal kolonier på basis af en semikvantitativ teknik. Positive blod- og fæcesdyrkninger kvantiteres ikke. Identifikation og resistensbestemmelse Potentielt patogene bakterier og renkulturer identificeres til speciesniveau og der laves relevant resistensbestemmelse. Ved fund, der skønnes at være forurening eller ikke-klinisk relevante, foretages kun identifikation til genus niveau, og besvarelsen sker uden resistensbestemmelse. Angivelse af følsomhed for en funden bakterie er ikke nødvendigvis ensbetydende med, at antibiotikabehandling tilrådes, eller er effektiv. P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

24 Følsomshedsbestemmelse in vitro: Side 24 af 158 S I R (Sensitiv) betyder, at behandling er mulig med normal dosering. (Intermediær) betyder, at behandling er mulig, hvis dosis kan øges udover normal dosering (relevant for penicilliner og cefalosporiner) eller hvis fysiologisk koncentrering kan forventes i fokus (fx urinvejene). (Resistent) betyder, at behandling ikke er mulig. Supplerende undersøgelser: Prøvematerialet opbevares i 7 døgn, bortset fra positive bloddyrkninger og prøver fra normalt sterile områder som opbevares i 14 dage. Det vil således være muligt ved henvendelse til KMA at få foretaget supplerende identifikation og følsomhedsbestemmelse. P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

25 Undersøgelseskategorier Side 25 af 158 Abscesmateriale, aspireret pus (10011) Princip: Indikation: Prøvemateriale: Mikroskopi, dyrkning, identifikation og følsomhedsbestemmelse af bakterier og svampe. Dybe abscesser på hals, i organer, peritoneum og pelvis (fossa Douglasi). Denne information bedes noteret i de kliniske oplysninger, også hvis det drejer sig om ultravejledt punktur. Abscesmateriale udhentet ved aspiration eller ultralydsvejledt punktur. SP/Webreq: Undersøgelse: dyrkning og resistens Prøvekategori: Pus og sekreter Materiale: Pus Lokalisation: Anatomisk lokalisation angivet i fri tekst Tidspunkt for prøvetagning: Utensilier: Før antibiotisk behandling startes. Sterilt spidsglas med skruelåg. Prøvetagning: Prøven udtages ved perkutan punktur efter desinfektion. Desinfektion udføres med 2 x jodsprit 2,5 % SAD liniment, eller hos patienter med jodallergi 2 x klorhexidinsprit 0,5 % i alkohol 70 %. Desinfektionsmidlerne skal tørre mellem påføringerne og inden punkturen. Efter desinfektion af indstiksstedet må dette ikke berøres, med mindre man har sterile handsker på. For at undgå jodforbrænding, aftørres jodet med sprit efter prøvetagningen. Prøvemængde: Se under prøvetagning, spidsglasset må kun fyldes halvt. Opbevaring: Forsendelse: Prøvemateriale i spidsglas opbevares i køleskab (4-8 C). Spidsglas sendes i kølekasse. Svarafgivelse: Såfremt der ved mikroskopi påvises bakterier og svampe, vil dette fremgå af det foreløbige elektroniske svar eller eventuelt blive meddelt telefonisk til en autoriseret patientansvarlig medarbejder. Foreløbigt dyrkningssvar afgives 1 døgn efter modtagelse af prøven. Slutsvar afgives efter 2-5 døgn. Bemærkninger: Drænprøver giver sjældent brugbare oplysninger, derfor analyseres disse prøver ikke. P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

26 Side 26 af 158 Adenovirus fæces, se Gastroenteritis, diagnostik Adenovirus øje (32080) Princip: Indikation: Prøvemateriale: Påvisning af adenovirus DNA med PCR-teknik. Mistanke om akut infektion med adenovirus ved conjunktivitis/keratitis. Pus eller podning fra conjuktiva SP/Webreq: Tidspunkt for prøvetagning: Undersøgelse: adenovirus DNA Materiale: podning Lokalisation: øje Så tidligt som muligt i sygdomsforløbet. Utensilier: eswab podepind i tilhørende transportmedie. Pus eller væske i sterilt spidsglas. Prøvetagning: Det nedre øjenlåg trækkes ned, og der podes fra konjuntivalslimhinden. Prøvemængde: Hvad der er muligt. Opbevaring: Forsendelse: Prøvemateriale opbevares i køleskab (4-8 C). Sendes i kølekasse. Svarafgivelse: 1-2 hverdage efter modtagelsen. Positivt svar angives som Adenovirus DNA påvist Arena (Lassa, Junin) virus PCR og antistof IgM, IgG, se Lassa Virus Aspergillus galactomannan antigen (23051/NPU22155) Galactomannan antigen Princip: Indikation: Påvisning af cellevægsbestanddel (galaktomannan) hos Aspergillus arter vha. ELISA teknik Mistanke om invasiv aspergillose (IA) eller overvågning af patienter i risiko for at udvikle IA (oftest svært immunsupprimerede patienter), mistanke om kronisk pulmonal aspergillose (CPA) hos patienter med kronisk lungesygdom. P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

27 Side 27 af 158 Prøvemateriale: Spinalvæske, Bronkoalveolær lavage (BAL), mini BAL eller serum Prøvebestilling: Sundhedsplatformen Utensilier: serum Prøvetagning: Opbevaring: Forsendelse: Sterilt spidsglas med skruelåg til BAL, mini BAL og SPV, tørglas til Se Bronkoalveolær lavage (BAL), venepunktur I køleskab I kølekasse Svarafgivelse: Op til 3 hverdage efter prøvens modtagelse i KMA Tolkning: Resultatet angives som en ratio (et index) mellem resultatet for patientprøven i forhold til den interne standard. Index < 0.5: negativ Index : svagt positiv Index 1: positiv Positivt resultat tyder på igangværende Aspergillus infektion. Negativt resultat kan ikke udelukke infektion, hvis prøvematerialet er serum. Derimod har et negativt resultat i BAL en høj prædiktiv værdi mhp at udelukke IA og CPA. Bemærkninger: Visse sjældent forekommende svampe (Cryptococcus neoformans, Geotrichum capitatum, Penicillium spp., Alternaria spp., Histoplasma spp., og Paecilomyces) kan give positivt resultat hvis de findes i BAL væsken. Tidligere rapporter om falsk positiv reaktion hos patienter i behandling med piperacillin/tazobactam har ikke mere betydning for mærkevaren, men viden om nyere generiske præparater er sparsom. Derfor kan det anbefales at tage serumprøver til undersøgelse for galaktomannan inden indgift af piperacillin/tazobactam og andre betalaktam antibiotika. Aspergillus antistof (NPU28756) Se Rigshospitalets prøvevejledning SP/Webreq: Kan kun bestilles på hospital. Undersøgelse: aspergillus antistof Materiale: serum eller koagelblod P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

28 AST (anti-streptolysin O) (NPU08093) Side 28 af 158 Princip: Indikation: Prøvemateriale: Påvisning af antistoffer mod streptolysin O fra Streptococcus pyogenes (hæmolytiske streptokokker gruppe A). Undersøgelsen kan ikke anvendes til diagnostik af akut streptokokinfektion. Anvendes kun ved klinisk mistanke om akut glomerulonefrit og febris rheumatica. Serum eller koagelblod. SP/Webreq: Kan kun bestilles på hospital Undersøgelse: AST (anti-streptolysin O) Materiale: serum eller koagelblod Tidspunkt for prøvetagning: Utensilier: Så tidligt som muligt i sygdomsforløbet og mindst 1 gang senere, fx efter 2-4 uger. Prøven bør så vidt muligt ikke tages umiddelbart efter indtagelse af et fedtrigt måltid. Tørglas. Prøvetagning: Venepunktur. Prøvemængde: 4-5 ml blod (2 ml serum). I særlige tilfælde, fx hos børn, kan undersøgelsen som regel gennemføres på ned til 0,5 ml blod eller 0,2 ml serum. Opbevaring: Forsendelse: I køleskab (4-8 C). Evt. i kølekasse. Ved forsendelse med postvæsenet anvendes forsendelseshylster (se side:). Svarafgivelse: Der må påregnes en svartid på 1-3 hverdage efter prøvens modtagelse i KMA. Tolkning: Ved febris rheumatica og akut glomerulonefrit er AST oftest kraftigt forhøjet (titer >1000). Bemærkninger: AST hører ikke hjemme i undersøgelsesrepertoiret ved kronisk artrit eller degenerative ledsygdomme. AST bør således ikke rekvireres samtidig med undersøgelse for rheumafaktorer. AST er uden diagnostisk værdi ved streptokokbetingede svælginfektioner, inkl. scarlatina. P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

29 Atypisk pneumoniantistof Side 29 af 158 Det anbefales ikke at bestille denne undersøgelse. Det er sjældent relevant at bestille antistoffer overfor de enkelte mikroorganismer (Mycoplasma pneumoniae, Legionella species, Chlamydophila pneumoniae, Chlamydophila psittaci), der kan forårsage atypisk pneumoni. I den akutte sygdomsfase anbefales luftvejssekret til PCR for pneumoniudredning (atypisk pneumoni), se dette. Skulle der ønskes antistofundersøgelse anbefales at bestille for de enkelte agens enkeltvis. Hvis vi modtager en blodprøve til undersøgelse for atypisk pneumoni antistof, vil den blive undersøgt for legionella antistof, som er det mest relevante. Bartonella henselae (cat scratch disease) og Bartonella Quintana (trench fever) antistof (NPU14445) SP/Webreq: Kan kun bestilles på hospital. Under undersøgelse: vælg Bartonelle antistof. Bartonella henselae (cat scratch disease) og Bartonella Quintana (trench fever) PCR (12138) SP/Webreq: Kan kun bestilles på hospital. Undersøgelse: Bartonelle DNA/RNA. Materiale: Væv Bilharzia antistoffer, se Schistosoma (bilharziose) antistof Bilharzia Mikroskopi, se Schistosomiasis (Bilharziose), mikroskopi Biopsi materiale, se Væv, knogle og vævs-biopsier Bloddyrkning (NPU17191/NPU14618/EPC00150) Princip: Blod taget ved venepunktur eller fra kateter i bloddyrkningskolber med efterfølgende dyrkning, identifikation og resistensbestemmelse af isolerede bakterier og svampe. P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

30 Side 30 af 158 Indikation: Prøvemateriale: Feber eller hypotermi. Cirkulatorisk kollaps med eller uden temperaturforhøjelse. Ældre patienter med sløret sensorium, takypnø, påvirket almentilstand med eller uden feber. Lokaliserede infektion, hvor bloddyrkning kan give en ætiologisk diagnose (f.eks. pneumoni, meningit, pyelonefrit, absces, akut osteomyelit, epiglottit og inficerede i.v. katetre). Veneblod (eventuelt arterieblod). Optimalt tages i alt 40 ml, svarende til to sæt bestående af én aerob- og én anaerob bloddyrkningskolbe. For børn se skema nedenfor. Mængden af blod er den mest betydningsfulde faktor for følsomheden af undersøgelsen; op til ca. 40 ml blod per dyrkning ses en øget følsomhed af undersøgelsen. Man bør dog ikke udtage mere end maksimalt 1 % af spædbørns og små børns totale blodvolumen til undersøgelse (se anbefalinger i tabel nedenfor). Vægt (Kg) Totale blodvolumen (ml) Fordelt på følgende bloddyrkningskolbe(r) Pædiatrisk Pædiatrisk Aerob kolbe (AE) Aerob + Anaerob (AN) Aerob + Anaerob (AN) Aerob + Anaerob (AN) sæt (AE + AN) sæt (AE + AN) Som voksne SP: Søgeord; bloddyrk. Vælge herefter bloddyrkning (bacterium + fungus); B, (NPU17191) hvis der ønskes gærkolbe vælges tillige bloddyrkning gær (Candida; B) (NPU14618) eller børnekolbe EPC00150 Vælg anatomisk lokalisation, her hvor bloddyrkningen er taget fra Udfyldt alle relevante felter og signer. Gå til opgavelisten og print PTB P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

31 Side 31 af 158 Bloddyrkninger tages af Klinisk biokemisk afd. og de tager prøverne med og sender disse til klinisk mikrobiologisk afd. Hvis afdelingen selv tager bloddyrkningen, skal I huske at bruge PDA-en. Tidspunkt for prøvetagning: Utensilier: Så tidligt i infektionsforløbet som muligt og inden start af antibiotikabehandling. Hvis patienten alligevel får antibiotika, skal bloddyrkningen helst tages lige før antibiotikaindgift, hvor koncentrationen i blodet er lavest. Bloddyrkningskolber: BACTEC aerob, BACTEC anaerob og evt. BACTEC mycosis (svampe). Til mindre børn bruges BACTEC børnekolbe. BACTEC kan anvendes både til lukket blodtagningssystem og til prøvetagning med sprøjte. Opbevares ved stuetemperatur beskyttet mod lys. Udløbsdato er påtrykt kolberne. Brug aldrig et uklart substrat, da udfældninger kan skyldes kontaminering. Prøvetagning: Omhyggelig aseptisk teknik er helt afgørende. Der udføres huddesinfektion med 2 x klorhexidinsprit 0,5 % i alkohol 70 %. Desinfektionsmidlerne skal tørre mellem påføringerne og inden punkturen. Efter desinfektion af indstiksstedet må dette ikke berøres, med mindre man har sterile handsker på ml blod fordeles på 2 aerobe og 2 anaerobe, og evt. 1 mycosis (svampekolbe) bloddyrkningskolber. Desinficer bloddyrkningskolbernes membran med swabs eller hospitalssprit. Membranerne på kolberne skal desinficeres med 70 % sprit 2 gange, inden blodet injiceres. Hele blodportionen kan tages samtidig, bortset fra de tilfælde hvor der er mistanke om endokardit, og man ønsker at dokumentere en kontinuerlig bakteriæmi. I disse tilfælde tages flere tidsmæssigt uafhængige bloddyrkningssæt fra forskellige indstikssteder. Dyrkning af arterieblod giver ikke bedre resultater end veneblod. Dyrkning af knoglemarv kan overvejes i tilfælde, hvor brucellose eller tularæmi mistænkes, og bloddyrkning har været negativ. Hver kolbe fyldes med 8-10 ml blod, dette tager ved frit indløb ca. ½ minut. Det er vigtigt, at kolben ikke overfyldes. Hos nyfødte og små børn anvendes børnekolbe, som efter skøn trækkes tilbage efter indløb af 1-2 ml. Dette tager ved frit indløb 5-10 sekunder. Bloddyrkning taget gennem intravaskulært kateter må generelt frarådes. Såfremt der ikke er andre muligheder, gøres følgende: Kateteret tømmes for indhold ved hjælp af en 10 ml sprøjte, inden blodet udtages til dyrkning. Der skal udfyldes én rekvisition pr. kolbe. Husk at afkrydse den relevante rubrik for blodtagningen. Prøvemængde: 8-10 ml i hver bloddyrkningskolbe, 1-2 ml i børnekolbe. P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

32 Side 32 af 158 Rekvisition: Opbevaring: Forsendelse: Ved mistanke om infektion med langsomt voksende bakterier som fx Brucella, Bartonella, Fransicella, Actinomyces samt i visse tilfælde af endokardit, er længere inkubationstid nødvendig. Det er derfor vigtigt, at rekvisitionen udfyldes omhyggeligt med kliniske oplysninger, mulig eksposition og rejseanamnese. Efter prøvetagning skal kolberne opbevares ved stuetemperatur på de respektive hospitalers mikrobiologiske prøvemodtagelser indtil afsendelsen til KMA. Prøverne bringes til KMA alle ugens dage. Akut forsendelse tjener intet formål. Svarafgivelse: Bloddyrkningskolberne aflæses automatisk i 5 døgn. Ved positivt fund afgives hurtigst muligt telefonisk svar til en autoriseret patientansvarlig medarbejder. Foreløbigt negativt svar afgives et døgn efter modtagelse af prøven, og slutsvar afgives efter 5 døgn. Tolkning: Bloddyrkninger kan forurenes fra patientens hud, ved prøvetagningsproceduren samt under arbejdet i laboratoriet. Et positivt dyrkningsresultat vil altid blive telefoneret til afdelingen af vagthavende mikrobiolog, således at der er mulighed for at diskutere relevansen af det pågældende fund og evt. behandling. Bemærkninger: Ved påvist bakteriæmi må infektionsfokus så vidt muligt identificeres med eventuel dyrkning fra dette. Temperaturforhøjelse alene er ikke nødvendigvis indikation for bloddyrkning. Bloddyrkning er dog indiceret hos ny indlagte patienter med temperatur >38,5 C og hos patienter med temperaturstigning i det postoperative forløb. BK polyomavirus DNA/RNA (32251/SSI00273) SP/Webreq: Kan kun bestilles på hospital. Undersøgelse: BK polyomavirus DNA/RNA. Materiale: Urin eller Blod (EDTA-glas). P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

33 Side 33 af 158 Bordetella pertussis IgG antistof, se Kighoste (Bordetella pertussis) antistoffer Bordetella pertussis/parapertussis DNA/RNA, se Kighoste (Bordetella pertussis) DNA Borrelia burgdorferi antistoffer (NPU16028/DNK05348) Princip: Indikation: Prøvemateriale: Påvisning af IgG antistoffer mod B. burgdorferi i blod og ved intratekaltest IgM og IgG i spinalvæske ved hjælp af kemiluminiscens assay (CLIA) teknik ved intratekaltest dog hhv. µ-capture og γ-capture ELISA). Antistoffer i blod undersøges ved mistanke om B. burgdorferi infektion i 2. stadium (multipel erythema migrans, Borrelia lymfocytom, neuroborreliose, Borrelia myocarditis eller Borrelia artritis) eller 3. stadium (acrodermatitis chronica atrophicans, kronisk neuroborreliose, kronisk artritis). Antistoffer i blod samt spinalvæske undersøges ved mistanke om neuroborreliose (intratekal test). Det frarådes at foretage serologisk diagnostik ved typisk erythema migrans i 1. stadium, da resultatet ikke har nogen klinisk konsekvens. Gelglas. Til intratekal antistofsyntese (neuroborreliose) indsendes både blod og spinalvæske, udtaget på samme tidspunkt. Sendes samlet på samme rekvisition. SP/Webreq: Undersøgelse: Borrelia antistof, Materiale: serum eller koagelblod. Eller Undersøgelse: Borrelia antistof (Intratekal test), (kan kun bestilles på hospital) Materiale: pakke: Koblet spinalvæske og serum Sundhedsplatformen: Blod Bestilles i best/ord Søgeord; Borrelia (burgdorferi) (være opmærksom på at du er inde i fanebladet; installationslisten) Vælg; Borrelia burgdorferi-ab(liste); P Udfyld relevant felter og signer Gå til opgavelisten og print PTB P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

34 Side 34 af 158 Sundhedsplatformen: Spinalvæske Vælg. Borrelia burgdorferi-ab(liste):pt(cvs/p) Vælg tages af rekvirent. Vælg frekvens en gang Vælg prioritet fremskyndt Accepter og signer Gå til opgavelisten og print PTB. Tidspunkt for prøvetagning: Utensilier: Prøvetagning: Når indikationen er stillet, evt. opfulgt af nye prøver med 2-4 ugers mellemrum til diagnostisk afklaring er nået. Tørglas, til spinalvæske sterilt spidsglas. Venepunktur. Lumbalpunktur. Prøvemængde: 4-5 ml blod (2 ml serum). Minimum 0,6 ml blod (0,3 ml serum). Mindst 2,5 ml spinalvæske. Opbevaring: Forsendelse: I køleskab (4-8 C). Evt. i kølekasse. Ved forsendelse med postvæsenet anvendes forsendelseshylster. Svarafgivelse: 1-3 hverdage efter prøvens modtagelse i KMA. Intratekal test udføres 3 gange ugentlig. Svar angives for antistofundersøgelse af blod som negativ eller positiv for Borrelia antistoffer. Undertiden vil resultatet være en grænseværdi, som kan følges op med en ny prøve efter ca. 2 uger. Som standard bestemmes IgG, hvis prøvematerialet er serum. Ved positiv IgG suppleres med IgM bestemmelse. Svar på undersøgelse for intratekal antistofsyntese angives som en spinalvæske/serum indeks for hhv. IgM og IgG antistoffer mod Borrelia. Positivt referenceindeks er 0, Tolkning: Positivt resultat for IgG antistoffer kan skyldes både overstået og aktiv Borrelia infektion. Samtidig positiv IgM tyder på aktiv infektion, men sygdomsaktivitet kan også være til stede ved negativ IgM og positiv IgG, hvis patienten opfylder de kliniske kriterier for Borrelia infektion. Ved symptomer og fund forenelige med Borrelia infektion i stadie 2 eller 3, vil IgG være positiv hos ca. 100% ved sygdomsvarighed > 6 uger. Ved sygdomsvarighed < 6 uger og negativ IgG kan undersøgelsen evt. gentages efter 2 uger for at påvise serokonversion. Interval for positiv intratekaltest er index på >0,3. Positiv intratekaltest er diagnostisk for neuroborreliose, uanset om index for IgM eller IgG er forhøjet. P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

35 Side 35 af 158 Ved neuroborreliose er intratekaltesten positiv i løbet af 2-6 uger, dvs. undersøgelsen kan være negativ i første sygdomsuge. Intratekal IgG syntese kan fortsætte i årevis efter endt behandling. Intratekal IgM syntese ophører oftest efter ca. 6 mdr. Bemærkninger: Facialisparese hos børn skyldes borreliainfektion i % af tilfældene. De anvendte testmetoder måler antistoffer mod de tre B. burgdorferi undertyper som forårsager borreliose i Europa. Påvisning af IgG antistoffer er ikke nødvendigvis et udtryk for sygdomsaktivitet, men kan være et udtryk for overstået sygdom. Syfilis kan give positive fund. Neuroborreliose er anmeldelsespligtig. P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

36 Side 36 af 158 Bronkoalveolær lavage (BAL) (10011/52010/11601/32010/32032/ 22070/52050/33057/32020/23051) Princip: Sekret ophentet ved skylning af et lungeafsnit i forbindelse med fiberbronkoskopi. Standardundersøgelsen omfatter: Undersøgelse af BAL vælges som en pakke med mulighed for tilvalg af undersøgelser i en supplerende BAL pakke. I standardpakken kan vælges: 1. Mikroskopi, dyrkning og resistens som omfatter undersøgelse for Nocardia og Actinomyces. (10011) 2. Atypisk pneumoni (Legionella, Mycoplasma og Chlamydophila pneumoniae) (52010) 3. Mycobacterium (TB) DNA, dyrkning samt mikroskopi (11601) I den supplerende BAL pakke kan tilvælges: Indikation: 1. Cytomegalovirus (CMV) DNA (32032) 2. Herpes simplex virus (HSV) DNA (32010) 3. Pneumocystis jiroveci (tidl. P. carinii) DNA (22070) 4. Influenzavirus (A+B) virus + Respiratorisk Syncytialvirus (RSV) RNA (52050) 5. Varicella zoster virus (VZV) DNA (32020) 6. Aspergillus galaktomannan antigen (23051) 7. Udvidet luftvejsvirus (33057) Patienter med klinisk/røntgenologisk pneumoni, som ikke ekspektorerer, eller hvor en sandsynlig diagnose ikke er opnået med undersøgelse af ekspektorat, trakeal- eller bronkialsug. Diagnostisk udredning ved pneumoni hos immunsupprimerede patienter, specielt ved mistanke om Aspergillus, Pneumocystis jiroveci eller mykobaterieinfektion. Prøvemateriale: Tidspunkt for prøvetagning: Utensilier: Skyllevæske fra bronkier og alveoler ophentet ved bronkoskopi. Når anden diagnostik ikke har afklaret ætiologien til patientens pneumoni. Sterile spidsglas med skruelåg. Plastflaske 250 ml med skruelåg. Prøvetagning: På Gentofte og Herlev Hospital (Onkologisk og Hæmatologisk afdeling) bestilles undersøgelsen på Lungemedicinsk afdeling Y, Gentofte Hospital. P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

37 Side 37 af 158 Procedure: Først skylles med 20 ml sterilt vand, som opsuges til PCR for Legionella. Derefter skylles med ml sterilt isotonisk saltvand, indtil der er opsuget 80 ml skyllevæske i en steril plastflaske. Dette fordeles med 10 ml i hver af tre spidsglas. Ønskes TB dyrkning eller andre undersøgelser, tages et passende antal ekstra glas. Prøvemængde: En rekvisition pr. prøve, der fremsendes til: Alm. bakteriologi og svampe - 10 ml PCR for Legionella - 10 ml TB mikroskopi - 10 ml Rekvisition: Forsendelse: Svarafgivelse og tolkning: Alle rekvisitioner skal mærkes med "BAL". Patientens grundsygdom og indikation for undersøgelsen skal fremgå af rekvisitionen. Prøven skal meldes til vagthavende mikrobiolog før afsendelse og sendes akut til KMA i kølekasse. Prøven mikroskoperes ved ankomst til KMA og foreløbigt svar afgives. Prøver uden vækst besvares efter 2 døgn. Ved fund af betydende bakterier, besvares prøven efter 2-5 døgn. Fund af lavpatogene bakterier kan have klinisk betydning, specielt hvis de forekommer i renkultur. Patienter med kronisk bronkitis, og patienter som er intuberet eller trakeostomeret, kan være koloniseret i nedre luftveje med svælgflora. Det er derfor altid nødvendigt at sammenholde de mikrobiologiske fund med klinikken. Bemærkninger: Ønskes undersøgelse for mykobakterier, der inkluderer dyrkning og PCR, videresendes prøven fra KMA til Statens Serum Institut. Ønskes undersøgelse for pneumocyster (PCR), fremsendes spidsglas med 10ml BAL. Ønskes undersøgelse for respirationsvejsvirus. P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

38 Brucella antistof (NPU14439) SP/Webreq: Kan kun bestilles på hospital. Undersøgelse: Brucella antistof. Materiale: serum eller koagelblod Side 38 af 158 Brucella DNA/RNA (12142) SP: Kan kun bestilles på hospital. Undersøgelse: Brucella DNA/RNA. Materiale: glandelpodning eller væv Burkholderia pseudomallei DNA/RNA (12144) SP/Webreq: Kan kun bestilles på hospital. Undersøgelse: Burkholderia pseudomallei DNA/RNA. Materiale: glandelpodning eller væv Børneorm (Enterobius vermicularis) (41040) Princip: Prøvemateriale: Mikroskopi for Enterobius vermicularis. Analaftryk med klar cellotape (ikke 3M). SP/Webreq: Undersøgelse: Enterobius vermicularis(børneorm) (mikroskopi) Materiale: analaftryk Indikation: Natlig analkløe. Tidspunkt for prøvetagning: Utensilier: Om morgenen før personen defækerer og vaskes. Objektglas med mat skrivefelt og forsendelseshylster til objektglas. Træspatel. Klar cellotape. P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

39 Side 39 af 158 Prøvetagning: Træspatel, beklædt med klar tape (klæbesiden udad), trykkes mod analåbningen. Tapestykket anbringes herefter på langs på objektglasset med den klæbende side nedad mod glasset (analaftrykket placeres midt på objektglasset). Tapen trykkes forsigtigt fast mod objektglasset med et lille stykke gaze eller vattot. Overskydende tape klippes af, således at det ikke når ud over objektglassets kanter eller dækker skrivefeltet. Glasset mærkes med rekvisitionens selvklæbende nummer, som placeres på tværs over skrivefeltet. Opbevaring: Forsendelse: I køleskab (4-8 C). Sendes i forsendelsesetui til objektglas. Forsendelse med postvæsenet kan anvendes. Svarafgivelse: Prøven undersøges kun på hverdage. Svar afgives samme dag, som prøven modtages i laboratoriet. Tolkning: Mindst 3 negative undersøgelser med 1-2 døgns mellemrum bør foreligge, før børneorm nogenlunde sikkert kan udelukkes. Bemærkninger: Fæces er ikke velegnet til påvisning af Enterobius vermicularis. Ved positivt fund anbefales det, at hele husstanden behandles. Campylobacter antistof Ig (G, M, A) (NPU14452) SP/Webreq: Undersøgelse: vælg campylobacter antistof. Materiale: serum eller koagelblod Candida mannan (antigen og antistof undersøgelse) (NPU27498) SP/Webreq: Kan kun bestilles på hospital. Undersøgelse: candida mannan (antigen og antistofundersøgelse) Materiale: Spinalvæske, serum eller koagelblod P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

40 Side 40 af 158 Chikungunya virus PCR og antistof IgM & IgG (NPU27084/NPU57062) SP/Webreq: Kan kun bestilles på hospital. Undersøgelse: vælg: Chikungunyvirus DNA/RNA og antistof IgM, IgG. Materiale: serum eller koagelblod Sundhedsplatformen: Bestilles i best/ord Søgeord; chikun (være opmærksom på at du er inde i fanebladet; installationslisten) Vælg; Chikungunya-virus-Ab (IgG)P og Chikungunya-virus-Ab (IgM); P Udfyld relevant felter og signer. Gå til opgavelisten og print PTB Chlamydophila pneumoniae antistof IgG & IgM (NPU17003) Denne undersøgelse anbefales erstattet af en PCR-analyse, der er langt mere sensitiv og specifik ved akut sygdom. Send i stedet halspodepind i eswab medie eller luftvejssekret til PRC for pågældende agens. Se Hvidovre Hospitals prøvevejledning SP/Webreq: Undersøgelse: vælg: Chlamydophila pneumoniae antistof. Materiale: serum eller koagelblod Chlamydophila pneumoniae DNA, se Pneumoniudredning (atypisk pneumoni) Chlamydophila psittaci antistof (papegøjesyge) (SSI00371) SP/Webreq: Undersøgelse: vælg: Chlamydophila psittaci antistof (papegøjesyge) Materiale: serum eller koagelblod P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

41 Chlamydia psittaci DNA (52010) Side 41 af 158 Denne undersøgelse indgår i den samlede undersøgelse: pneumoniudredning (atypisk pneumoni) på luftvejssekreter. Se denne. Princip: Indikation: Prøvemateriale: Påvisning af Chlamydia psittaci DNA med PCR-teknik. Atypisk pneumoni, evt. i forbindelse med fuglekontakt. Podemateriale fra svælget Ekspektorat Trakealsekret BAL SP/Webreq: Undersøgelse: Pneumoniudredning (atypisk pneumoni) Materiale: podning Lokalisation: svælg Tidspunkt for prøvetagning: Utensilier: Prøvetagning: Tidligst muligt i sygdomsforløbet. eswab, Ekspektoratdåse i forsendelsescontainer eller trakealsugesæt. Podepinden gnides mod slimhinden i svælget, optimalt nasopharynx, hvorefter den anbringes I transportmediet (hvidt skruelåg) og afknækkes. Ekspektorat, trakealsekret eller BAL tages som beskrevet (trakealsug), eller BAL. Opbevaring: I køleskab ved 4-8 C. Forsendelse: eswab fremsendes i forsendelseshylster, ekspektorat fremsendes i dåse med tilsvarende forsendelsescontainer, trakealsekret og BAL i sterilt spidsglas i forsendelseshylster. Luftvejssekret fremsendes om muligt i kølekasse. Svarafgivelse: 1-2 hverdage efter modtagelsen. Bemærkninger: C. pneumoniae er sjældent årsag til atypisk pneumoni i Danmark, og infektionen er oftest mild. Infektion med C. psittaci (ornithose, psittacose) forudsætter kontakt med syge fugle (typisk papegøjer og kanariefugle, men kan også overføres af andre fuglearter). Ornithose er sjælden i Danmark (20-30 tilfælde årligt). Undersøgelse for C. psittaci på podepind udføres kun, hvis der medfølger kliniske oplysninger om fuglekontakt. P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

42 Side 42 af 158 Chlamydia trachomatis og Neisseria gonorrhoeae DNA (12250) Princip: Indikation: Påvisning af Chlamydia trachomatis og Neisseria gonorrhoeae med genamplifikationsteknik (APTIMA Combo-test). Mænd: Uretrit, epididymit og evt. proctitis og conjunktivitis. Kvinder: Cervicitis, salpingitis, abakteriel cystit hos yngre og evt. conjunktivitis. Inden provokeret bort eller andre intrauterine indgreb, hvor der bør podes fra både urethra og cervix. Nyfødte: Inklusionsconjunktivitis. Spædbørn: Pneumoni efter smitte i fødselsvejen. På baggrund af de mange asymptomatiske infektioner, kan følgende risikofaktorer give anledning til tilbud om undersøgelse: Seksuelt aktive unge under 25 år. Partnerskifte eller flere partnere i de sidste 6 md. Partner med symptomer. Denne undersøgelse erstatter ikke podning til dyrkning for gonokokker. Ved specifik mistanke om gonoré, anbefales podning med eswab til dyrkning for gonokokker samtidigt med APTIMA Combotest. Prøvemateriale: Materiale fra inficeret slimhinde, cervix og urethra hos kvinder, øjne og svælg hos spædbørn, urin, svælg og rectum hos begge køn SP/Webreq: Undersøgelse: Chlamydia og gonokokker DNA/RNA. Materiale: podning eller urin. Lokalisation: cervix, vagina, svælg, rectum, urethra eller øje Utensilier: GEN-PROBE APTIMA Prøvetagningssæt til podning fra mænd og kvinder (unisex): podepind med blåt skaft til prøvetagning fra cervix, urethra, vagina, svælg, rectum og øjne. Medfølgende rensepodepind (hvidt skaft) til cervix hos kvinder. Reagensrør med GEN- PROBE APTIMA prøvetransportmedie. GEN-PROBE APTIMA Prøvetagningssæt til vaginalpodning (Multitest): Podepind og reagensrør med GEN-PROBE APTIMA prøvetransportmedie. GENPROBE APTIMA Prøvetagningssæt til urin: Patienten må ikke have ladet vandet mindre end en time før prøvetagning. First-catch urin opsamles i beholder uden tilsætningsstoffer. Dernæst overføres 2 ml urin til urinbeholder med medfølgende pipette (bemærk de to målelinjer på beholderen, urinvolumen skal være imellem målelinjerne). Se desuden nedenfor. Prøvetagning: Cervix(kvinder): Brug vatpind med hvidt skaft til at fjerne slim fra orificium, hvorefter vatpinden kasseres. P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

43 Side 43 af 158 Podepind med blåt skaft indføres i cervikalkanalen og roteres med et fast tryk mod slimhinden sekunder. Den fjernes, og spidsen placeres i bunden af transportrøret. Skaftet afknækkes, og låget skrues på, så det er tæt lukket. Urethra (kvinder): Podepinden føres ind i urethra og roteres fast mod slimhinden. Videre procedure som ovenfor. Urethra (mænd): Podepinden indføres 2-4 cm ind i urethra og roteres 3-5 sek. Videre procedure som ovenfor. Vagina (kvinder): Indfør podepinden i vagina ca. 5 cm forbi introitus og roter podepinden sekunder. Vær sikker på slimhindekontakt. Øjne (nyfødte): Podepinden gnides mod indersiden af nedre øjenlåg. Videre procedure som ovenfor. Luftveje (spædbørn): Podepinden gnides rundt i svælget og på tonsiller. Videre procedure som ovenfor. Svælg (voksne): Podepinden gnides rundt i svælget og på tonsiller. Videre procedure som ovenfor. Rectum: Kun ved specifikke symptomer Urin: Der bør gå mindst 1 time efter sidste vandladning før prøvetagningen. Urin opsamles uden forudgående afvaskning i en steril beholder. Kun de første ml skal opsamles ( first-catch ), dvs. ikke midtstråleurin. Derefter overføres 2 ml til diluentrøret. Volumen skal være indenfor de to målestreger. Låget skrues på, så det er tæt lukket. Opbevaring: Forsendelse: Tolkning: Efter prøvetagning er holdbarheden højst 30 dage ved stuetemperatur. Sendes i forsendelseshylster. Sensitiviteten af analysen er 99 %, specificiteten %. Metoden kan ikke anvendes til behandlingskontrol. Positivt resultat for Neisseria gonorrhoeae bør altid medføre podning med eswab fra cervix/urethra, svælg og rectum med henblik på dyrkning og resistensbestemmelse. Påvisning af Neisseria gonorrhoeae DNA viser at patienten har gonoré. Et negativt dyrkningsresultat er foreneligt med diagnosen, da dyrkning er mindre sensitiv end DNA-påvisning. Bemærkninger: Ved undersøgelse af børn <15 år, bedes indikation anført. P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

44 Clostridium botulinum (10011) Side 44 af 158 SP/Webreq: Undersøgelse: clostridium botulinum(dyrkning) samt undersøgelse for Clostridium botulinum toksin. Påvisning af neurotoksin fra Clostridium botulinum i patient blod ved indsprøjtning på mus (musetest). Påvisning af toksinproducerende Clostridium botulinum ved dyrkning/pcr kan gøres på fæces, væv, podning eller fødevarerester. Materiale Mærkes med lokalisation. Fuldblod (mindst 3 glas) uden tilsætning eller serum (mindst 5 ml serum). Blodprøve til musetest skal tages snarest muligt efter at diagnosen er blevet stillet eller sandsynliggjort og inden evt. antistof behandling. Væv, sårpodning eller fæces til dyrkning og PCR Prøvetagning Af hensyn til evt. bestilling af forsøgsdyr bør undersøgelsen aftales forud. I åbningstiden (mandag-torsdag kl. 8:00-15:30 og fredag kl. 8:00-15:00) træffes aftale med afdelingen telefon ,. Uden for åbningstiden træffes aftale med Instituttets vagthavende læge på telefon eller gennem omstillingsbordet, telefon Clostridium difficile, se Gastroenteritis, diagnostik Clostridium tetanitoxin antistof (NPU56571) SP/Webreq: Undersøgelse: clostridium tetanitoksin antistof. Materiale: Serum eller koagelblod. Coccidioides antistof (NPU12129) P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

45 Side 45 af 158 SP/Webreq: Kan kun bestilles på hospital. Undersøgelse: vælg: Coccidioides antistof. Coxiella burnetii antistof (Q-fever) (NPU54251) SP/Webreq: Undersøgelse: vælg: Coxiella burnetii antistof (Q-feber) Coxiella burnetii PCR (Q-fever) (12274) SP/Webreq: Kan kun bestilles på hospital. Undersøgelse: Coxiella burnetii DNA/RNA (Q-feber) Materiale: væv eller væske. CPO (carbapenemase-producerende bakterier), screening for (10118) Princip: Indikation: Undersøgelse for CPO (carbapenemase-producerende organismer). Prøven opformeres i et særligt medium, inden udsåning på screeningsplader. Tidligere fået påvist CPO Indenfor de sidste 6 måneder haft husstandslignenden kontakt med CPO-positiv person Indenfor de sidste 6 måneder opholdt sig uden for Norden og fået behandling med antibiotika under opholdet se Sundhedsstyrelsens Vejledning om forebyggelse af spredning af CPO Screening af medpatienter eller i forbindelse med udbrud Prøvemateriale: Podning fra rektum. Derudover podning fra evt. sår eller stomi, urin, såfremt pt. har urinvejskateter, trakealsekret hvis patienten er intuberet og prøver fra lokalisationer, hvor der tidligere er fundet CPO. SP/Webreq: P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

46 Side 46 af 158 Undersøgelse: Carbapenemase-producerende bakterier (CPO) (undersøgelse for) Materiale: Eksem-podning, podning, sår-podning, trakealsekret fra tube eller urin-midtstråle Lokalisation: Vælg Crimean Congo hemorrhagic fever virus DNA/RNA, se Krim-Congovirus PCR og antistof IgM, IgG Cryptococcus antigen (NPU17489/NPU17431) SP/Webreq: Kan kun bestilles på hospital. Undersøgelse: Cryptokok antigen. Materiale: serum/koagelblod eller spinalvæske (NPU17431). Syfilisantistoffer (CSV) fuld undersøgelse (DNK35912) SP/Webreq: Kan kun bestilles på hospital. Undersøgelse: Syfilis antilipide og antireponemale antistoffer (fuld undersøgelse) Materiale: Koblet spinal og serum CVK-spids, se I.V. kateterspids Cytomegalovirus DNA kvantitativ/viral load (NPU28653(serum/32032(andet)) Princip: Indikation: Kommerciel kvantitativ real-time PCR-metode med inhibitionskontrol. Mistanke om CMV-infektion hos immundefekte: Feber, Pneumoni, Retinitis, Hepatitis, Colitis. Medfødte CMV-infektioner Monitering af antiviral behandling P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

47 Side 47 af 158 Prøvemateriale: Minimum 3 ml EDTA-blod eller serum-koagelblod (Kan ikke udføres på heparinblod), urin, fostervand, podning, sputum, spinalvæske, BAL sekret og væv SP/Webreq: Kan kun bestilles på hospital. Undersøgelse: Cytomegalovirus DNA/RNA (kvantitativ) Materiale: vælg type (mange valgmuligheder) Samt evt. lokalisation. Sundhedsplatform: følg vejledning for denne Utensilier: Afhængig af prøvetype. For blodprøver bruges EDTA-glas eller gelglas Prøvetagning: Opbevaring: I køleskab (4-8 C) Forsendelse: Evt. i kølekasse Tolking: Et positivt resultat viser at patienten på prøvetagningstidspunktet er inficeret med CMV. Analysen er kvantitativ i intervallet fra 500 kopier/ml til 10 7 kopier/ml. Ved <500 kopier/ml er analysen kun kvalitativ. Ændring i virus-dna kopiantallet over tid på <0,5 log 10 er ikke klinisk betydende. Påvisning af CMV-DNA i blod sammenholdt med adækvat serologi er diagnostisk for akut CMV-infektion. For immunkompetente personer anbefales det dog kun at tage serologi. Kun ca. 25 % af immunkompentente personer vil være positive indenfor den første måned efter en primær infektion. Reaktivering af CMV kan ske hos immundefekte patienter. Betydning af påvisning af CMV-DNA i luftvejssekreter er ikke kendt og bør ikke rutinemæssigt foretages; undtagelsen er mistanke om CMV-pneumoni hos transplanterede og fortsat immundefekte patienter. Ved mistanke om congenit infektion bør urin og svælgsekret tages indenfor de første 14 dage efter fødslen. P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

48 Cytomegalovirus (CMV) antistoffer (NPU01846) Side 48 af 158 Princip: Indikation: Prøvemateriale: Påvisning af IgM og IgG antistoffer mod CMV med CLIA (Chemiluminescens immunoassay) Bestemmelse af immunstatus. Formodning om aktuel CMV-infektion. Undersøgelse for CMV-antistoffer kan komme på tale ved klinisk mistanke om mononukleose og negativ undersøgelse for Epstein Barr virus eller ved akut hepatitis, hvor mere hyppige årsager er udelukket. Gelglas. SP/Webreq: Undersøgelse: Cytomegalovirus antistof (sygdom?) Materiale: Serum eller koagelblod Sundhedsplatformen: Vælg; cytomegalovirus-ab; P (NPU 01846) Udfyld relevant felter og signer Gå til opgavelisten og print PTB Tidspunkt for prøvetagning: Utensilier: Ved formodning om aktiv infektion: Tidligst muligt i sygdomsforløbet og evt. igen 2 uger senere. Tørglas. Prøvetagning: Venepunktur. Prøvemængde: 4-5 ml blod (2 ml serum). Minimum 1 ml blod (0,5 ml serum). Opbevaring: Forsendelse: I køleskab (4-8 C). Evt. i kølekasse. Ved forsendelse med postvæsenet anvendes forsendelseshylster. Svarafgivelse: 1-3 hverdage efter prøvens modtagelse i KMA. Tolkning: Fund af IgM antistoffer mod CMV kan tyde på aktuel infektion, idet CMV IgM bliver positiv 1-3 uger efter sygdomsdebut. Vedvarende (>1 år) høj IgM titer kan ses hos immunsupprimerede. Ved reaktivering eller reinfektion vil CMV IgM blive positiv hos % af immunsupprimerede patienter, men kun hos få immunkompetente, og vil oftest kun være svagt positiv. Ved reaktivering eller re- P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

49 Side 49 af 158 infektion er IgG titeren forhøjet, og signifikant (2-4 folds) titerstigning kan påvises over 2-4 uger. Grænseværdier, der ligger i gråzoneområde kan være udtryk for tidlig antistofdannelse eller falsk positiv reaktion. Prøven kan evt. gentages efter 2 uger. Hos mange gravide optræder falsk positiv IgM reaktion hyppigere. Mulighederne er således: CMV IgM Negativ < 18 U/ml Positiv 22 U/ml Positiv 22 U/ml Negativ < 18 U/ml CMV IgG Negativ < 12 U/ml Negativ < 12 U/ml Positiv 14 U/ml Positiv 14 U/ml Tolkning ingen aktuel eller tidligere CVM-infektion a) akut primær infektion (tidlig fase) b) kongenit infektion (alder <2 uger) uden maternelle IgG antistoffer a) akut primær infektion b) kongenit infektion (alder <2 uger) med maternelle IgG antistoffer c) reaktivering/reinfektion hos immunsupprimeret person a) tidligere CMV-infektion b) passivt overførte antistoffer (immunglobulinterapi, transfusion, maternelle IgG antistoffer) c) reaktivering/reinfektion hos immunkompetent person Bemærkninger: Ved monitorering af immunsupprimerede patienter for reaktivering af CMV-infektion bør antistofundersøgelse suppleres med enten CMV antigenpåvisning i leukocytter eller med påvisning af CMV DNA i blod ved PCR-undersøgelse (Statens Serum Institut). Ved kongenit CMV-infektion er CMV IgM positiv hos ca. 75 %. For at have diagnostisk værdi skal blodprøven være udtaget indenfor 2 uger efter fødslen. Denguevirus antigen og antistofundersøgelse (DNK35279) Princip: Testen er en immunkromatografisk test, der består af 2 strips, 1 der indeholder anti- NS1 antistoffer i den ene strip og en blanding af rekombineret envelope dengue protiner i den anden strip for at kun ne detektere antistoffer mod alle 4 denguevirus typer P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

50 Side 50 af 158 Indikation: mistanke om denguevirus infektion. Feber, myalgi, luftvejssympto mer, petekkier efter rejse i områder hvor Denguevirus er udbredt. Prøvemateriale: EDTA-blod SP/Webreq: Kan kun bestilles på hospital. Undersøgelse: vælg: Denguevirus antigen Materiale: Blod (EDTA-glas), serum eller koagelblod eller spinalvæske. Sundhedsplatformen: Bestilles i best/ord Søgeord; Dengue (være opmærksom på at du er inde i fanebladet; installationslisten) Vælg; Dengue virus-antigen og antistof; P DNK35279 Udfyld relevant felter og signer Gå til opgavelisten og print PTB Tidspunkt for prøvetagning: Så tidligt som muligt, evt gentaget efter 3 dage Utensilier: EDTA-glas Prøvetagning: venepunktur Prøvemængde: 3-5 ml blod Opbevaring: I køleskab (4-8 C) Forsendelse: Evt i kølekasse Svarafgivelse: Samme dag Tolkning: NS1-antigen positiv tyder på aktuel infektion. IgM positiv tyder på aktuel infektion. IgM negativ kan forekomme tidligt i forløbet af akut infektion. Ved kombination af serologi med NS1 AG fås en samlet sensitivitet på ca 96 %. Analysen kan evt. gentages efter 2-3 dage. Kan suppleres med Denguevirus RNA PCR i blod, der øger sensitiviteten til 99 % ved kombination med serologi, dog kun initialt i infektionen. P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

51 Side 51 af 158 Primær dengue Sekundær dengue Diaréudreding, se Gastroenteritis, diagnostik Dientamoeba fragilis Undersøgelse for parasitten Dientamoeba fragilis er nedlagt pr 1. maj 2017 D. fragilis er en tarmprotozo, som i tidligere, mindre studier har været associeret med mave-tarmsymptomer, bl.a. mavesmerter og diare, ikke mindst hos børn. Den smitter formentlig via fækal-oral transmission, indlejret i æg af børneorm. Nye kliniske studier har ikke vist nogen sammenhæng mellem parasitten og mave-tarm-symptomer overhovedet. Analysen anses for værdiløs eller direkte misvisende i nogle situationer. Undersøgelsen kan indgå i protokoller, som har tilstrækkelig power til yderligere at dokumentere en mulig sammenhæng mellem infektion og symptomer og/eller en klinisk effekt af behandling. I disse sammenhænge må samarbejdes med Statens Serum Institut. Difteritoksin antistof (NPU56572) SP/Webreq: Undersøgelse: Difteritoksin antistof. Materiale: serum eller koagelblod Duodenalsekret (10011/59110) P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

52 Side 52 af 158 Princip: Indikation: Prøvemateriale: Kvantitativ dyrkning, identifikation og følsomhedsbestemmelse af isolerede bakterier og svampe. Malabsorption pga. af bakteriel overvækst i tyndtarmen. Duodenalsekret. SP/Webreq: Undersøgelse: Dyrkning og resistens. Materiale: Sekret. Lokalisation: Fritekst (Her angives: Duodenalsekret) Tidspunkt for prøvetagning: Utensilier: Når patienten er uden antibiotisk behandling. Spidsglas med skruelåg. Prøvetagning: Duodenalsekret. Prøvemængde: Spidsglasset må kun fyldes halvt, 1-2 ml er tilstrækkeligt. Opbevaring: Forsendelse: I køleskab (4-8 o C). Om muligt i kølekasse. Svarafgivelse: Foreløbigt svar afgives 1 døgn efter modtagelse af prøven. Slutsvar efter 2-5 døgn. Tolkning: Hos raske patienter bosiddende i tempererede områder er den øverste del af tyndtarmen enten steril eller indeholder mindre end 10 3 organismer/ml sekret, men lejlighedsvis kan der findes helt op til pr. ml. Bemærkninger: Andre årsager til malabsorption, fx Giardia bør udelukkes. Duodenalsekret til undersøgelse for Giardia (se side35-37) sendes i termobeholder (37 C). Der er dårlig korrelation mellem bakterietallet i tyndtarmen og graden af malabsorption, ligesom terapeutisk udryddelse af bakteriel overvækst ofte ikke følges af bedring af malabsorptionen. Indikation for undersøgelsen bør derfor konfereres med KMAs læger. P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

53 Side 53 af 158 Ebola virus PCR og antistof IgM, IgG UMIDDELBAR ISOLATION HENVENDELSE TIL INFEKTIONSMEDICINSK BAGVAGT PÅ HVIDOVRE HOSPITAL! Ved mistanke om akut hæmorrhagisk feber, tages to prøver en til serologi og en til PCR. Prøven til serologi opbevares under rette sikkerhedsforanstaltninger på hospitalsafdelingen, på køl indtil resultatet på PCR analysen foreligger. Ved negativ PCR, indsendes denne prøve til test for overstået infektion. Prøven til PCR tilsættes blå inaktiveringsbuffer (se ovenfor) og sendes samme dag. Kan prøven ikke sendes samme dag, skal den opbevares på køl (2-8 ) o sendes hurtigst muligt. Her testes for akut Ebola hæmorrhagisk feber. SP/Webreq: Kan kun bestilles på hospital. Undersøgelse: ebola virus DNA/RNA, IgG og IgM antistof. Materiale: PCR: blod tilsat SSIs blå inaktiverinsmedie, kontakt vagthavende SSI tlf eller Serologi: serum koagel blod eller blod i EDTA-glas Echinococcus (mikroskopi) (41020) SP/Webreq: Kan kun bestilles af hospital. Undersøgelse: echinococcus mikroskopi. Materiale: cystevæske Lokalisation: Lever. Hvis anden lokalisation end lever angives dette under de kliniske oplysninger. Echinococcus granulosus antistof (NPU28916) Se Rigshospitalets prøvevejledning SP/Webreq: Undersøgelse: echinococcus antistof. Materiale: Serum eller koagelblod. P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

54 Echinococcus multilocularis antistof (NPU01927) Side 54 af 158 SP/Webreq: Undersøgelse: echinococcus multilocularis. Materiale: Serum eller koagelblod. Ehrlichia antistof (NPU28476) SP/Webreq: Undersøgelse: ehrlichia antistof. Materiale: Serum eller koagelblod. Encephalit udredning, se også Herpes simplex virus 1+2 og Varicella zoster virus (DNA/RNA); CSV (EPC00213) Encephalit-udredning Princip: Undersøgelsen består af 2 undersøgelser, hvor der oftest kun er indikation for at udføre PCR undersøgelsen. Påvisning af HSV 1 og HSV 2 og VZV DNA med PCR-teknik. Intrathekal antistofsyntese påviser index i blod og spinalvæske for specifikke antistoffer rettet mod HSV-1, HSV-2 og VZV, sammenholdt med overordnet IgG og albumin index. Indikation: Prøvemateriale: Viral meningitis, Viral encephalitis. Neonatal herpesinfektion. Der er kun indikation for at supplere med intratkal antistofsyntese, hvis patienten har haft symptomer i mere end 10 dage. Hvis der ikke er leukocytter i spinalvæske, vil der heller ikke blive undersøgt for intrathekal antistofsyntese. Denne vurdering foretages af læge på klinisk mikrobiologisk afdeling. Spinalvæske med samtidigt udtaget blodprøve ved mistanke om encephalitis og meningitis P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

55 Side 55 af 158 SP/Webreq: Undersøgelse: encephalit udredning (HSV + VZV) DNA/RNA Materiale: Pakke koblet spinalvæske og serum. Ved mistanke om neonatal herpes, hvor der ikke er indikation for intrathekal antistofsyntese, anføres dette under de kliniske oplysninger. Sundhedsplatformen: Søg på HSV eller VZV i feltet afgiv ny best./ord.. Af de valgmuligheder der fremkommer vælges: Herpes simplex virus 1+2 og varicella-zoster virus (DNA/RNA); CSV OBS prøven vil primært blive undersøgt for VZV og HSV DNA, selvom analysenavnet ikke indikerer dette. Der laves kun undersøgelse for intrathekal syntese af specifikke Ab. ved særlig indikation, se ovenfor Tidspunkt for prøvetagning: Utensilier: Så tidligt som muligt i sygdomsforløbet. Sterilt spidsglas til spinalvæske, Tørglas til blodprøve. Prøvetagning: Spinalvæske (mindst 1 ml) udtømmes i sterilt spidsglas og sendes uden tilsætning sammen med blodprøve (mindst 5 ml) udtaget i sterilt tørglas. Opbevaring: I køleskab ved 4-8 C. Forsendelse: Evt. i kølekasse. Svarafgivelse: 1-3 hverdage efter modtagelsen. Positivt svar angives som HSVtype 1, HSV type 2 eller VZV påvist. Ved negativt PCR-svar vil det blive angivet på svaret hvis prøven undersøges yderligere for intrathekal antistofsyntes, evt efter klinisk kontakt ved tvivl om indikationen. Svar på intrathekal antistofsyntese efter ca. 1 uge. Tolkning: Ved HSV encephalitis vil PCR være positiv og intratekal antistofsyntese negativ tidligt i forløbet. Ca dage efter symptomdebut vil det være omvendt. Derfor er angivelse af sygdomsvarighed på rekvisitionen afgørende for korrekt prøvebehandling. Bemærkninger: Viral encephalitis kan forårsages af bl.a. HSV, VZV og enterovirus. Ved symptomer foreneligt med encephalitis skal såvel spinalvæske som blodprøve fremsendes til intratekal antistofsyntese for HSV og VZV samt PCR-undersøgelse for enterovirus P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

56 Ekspektorat, trakeal- og bronkialsekret (10011) Side 56 af 158 Princip: Indikation: Prøvemateriale: Mikroskopi, dyrkning, identifikation og følsomhedsbestemmelse af potentielt patogene bakterier og svampe i prøver fra nedre luftveje. Anaerob dyrkning udføres kun, hvis der på rekvisitionen er anført, at det drejer sig om bronkoskopisk aspiration fra formodet lungeabsces eller aspirationspneumoni. Klinisk penumoni: Hoste, ekspektoration, dyspnø og feber med stetoskopisk og/eller røntgenolohisk tegn til pneumoni. Børn med nedre luftvejsinfektion. Akut forværring af kronisk obstruktiv lungesygdom (KOL), kronisk bronkit eller emfysem: Øget purulent ekspektoration og febrilia. Differentialdiagnostisk udredning ved svær progredierende pneumoni med multiorganpåvirkning, eventuelt med hyponatriæmi (Legionella pneumoni). Differentialdiagnostisk udredning ved adult respiratory distress syndrom (ARDS). Differentialdiagnostisk udredning ved mulig aspiration. Sekret fra nedre luftveje frembragt ved hoste eller sug fra trakeal eller bronkier. SP/Webreq: Under materiale: vælg: ekspektorat, trakeal- eller bronkialsekret. Vælg ønsket undersøgelse. Sundhedsplatformen: Bestilles i best/ord Søgeord; dyrkning og resistens (være opmærksom på at du er inde i fanebladet; installationslisten) Vælge herefter Herlev hospital og prøve kategori; luftvej sekreter og herefter ekspektorat Udfyldt alle relevante felter og signer. Gå til opgavelisten og print PTB. Påsæt label fra PTB samt alm. patient label på prøven Tidspunkt for prøvetagning: Utensilier: Før antibiotisk behandling startes. Ekspektoratdåse og forsendelsescontainer (bestilles på to forskellige varenummer) eller trakealsugesæt. P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

57 Side 57 af 158 Prøvetagning: Ekspektorat: Patienten bør instrueres nøje mhp. at opnå egnet materiale. Før prøvetagningen skal munden skylles for evt. madrester. Patienten bør sidde oprejst i sengen eller være stående. Lungerne fyldes med luft og tømmes i et drag, idet der hostes så dybt som muligt, og ekspektoratet spyttes ud i den sterile inderskål. Er mængden utilstrækkelig, kan proceduren gentages eller trakealsugning benyttes. Trakeal- og bronkialsug: Sekretet ophentes ved sugning med kateter fra trakea eller gennem bronkoskop. Det anbefales, at prøvetageren anvender mundbind og sterile handsker. Det er væsentligt, at sugekateteret "kinkes" under indføring og udtagning, således at der udelukkende suges i selve trakea/bronkier. Trakealtubesekret: For at mindske kontaminationen med bakterier fra tuben skal denne suges ren for sekret og evt. efterskylles med sterilt vand. Et nyt sterilt sugekateter nedføres, så spidsen ligger nedenfor tuben, hvorefter der suges. Viskøse sekreter kan løsnes ved at manipulere kateteret, så der udløses en hosterefleks. Prøvemængde: 1-2 ml mukopurulent materiale. Emballering: Ekspektorat: Låget på den sterile inderskål skrues fast, hvorefter inderskålen anbringes i forsendelsescontaineren med tryklåg. Trakeal- og bronkialsug: Ingen særlige krav. Opbevaring: Forsendelse: I køleskab (4-8º C). Om muligt i kølekasse. Forsendelsescontaineren til ekspektorat er godkendt til postforsendelse. Svarafgivelse: Prøven mikroskoperes ved ankomsten til KMA. Foreløbigt prøvesvar afgives, herunder en vurdering af materialets egnethed Prøver uden vækst besvares efter 1-2 døgn. Ved fund af betydende bakterier besvares prøven efter 1-4 døgn. Tolkning: Prøvens validitet vurderes ved direkte mikroskopi af prøven. Hvis der ved mikroskopi ses cylinderepitelceller og leukocytter uden tilblanding af pladeepitel, bedømmes den mikrobiologiske flora i disse strøg. Påviste bakterier vil blive dyrket, identificeret og følsomhedsbestemt. Hvis strøgene er uden bakterier og svampe, er det mindre sandsynligt, at patientens pneumoni skyldes almindelige bakterier eller svampe. Patienter med kronisk bronkit og patienter som er intuberet eller trakeostomeret, kan være koloniseret i nedre luftveje med svælgflora. Det er derfor altid nødvendigt at sammenholde de mikrobiologiske fund med klinikken. P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

58 Side 58 af 158 Bemærkninger: Ønskes der undersøgelse for TB, sendes luftvejssekret til mikroskopi, dyrkning og evt. PCR til KMA, som videresender dette til Statens Serum Institut. Afkrydses særskilt på rekvisition. Bemærk ved PCR og dyrkning for TB/Mykobakterer på Statens Serum Institut, vil der rutinemæssigt også blive lavet mikroskopi. Ønskes undersøgelse for respirationsvejsvirus eller atypisk pneumoni, afkrydses disse undersøgelser. Enterobius vermicularis, se børneorm Entamoeba histolytica antistof (NPU12120) SP/Webreq: Undersøgelse: entamoeba antistof. Materiale: Serum eller koagelblod Enterovirus IgM (NPU12723) SP/Webreq: Undersøgelse: enterovirus IgM (sygdom?) Materiale: Serum eller koagelblod Entero- og parechovirus RNA/DNA, fæces (32065) Der er kun indikation for denne undersøgelse ved mistanke om systemisk enterovirusinfektion, hvor agens ikke er fundet andetsteds. Eller med henblik på overvågning. SP/Webreq: Undersøgelse: enterovirus DNA/RNA Materiale: fæces. Enterovirus RNA (32060) Princip: Påvisning af Enterovirus RNA ved hjælp af PCR-teknik, hos børn < 2 år undersøges tillige for parechovirus. P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

59 Side 59 af 158 Indikation: Prøvemateriale: Viral meningitis Pneumoni hos immunsupprimerede Viral encephalitis Neonatal sepsis Andre symptomer på enterovirusinfektion. Spinalvæske Svælgpodning Trakealsug BAL Nasopharynxsug Vesikelpodning SP/Webreq: Undersøgelse: enterovirus DNA/RNA Materiale: bronkoalveolær lavage (BAL), nasopharynxsekret, slimhinde podning, spinalvæske eller vesikelpodning. Tidspunkt for prøvetagning: Utensilier: Prøvetagning: Opbevaring: Forsendelse: Tidligst muligt i sygdomsforløbet. Sterilt spidsglas til spinalvæske, trakealsug, BAL og nasopharynxsug. eswab til svælg- og vesikelpodning. Fæcesrør med forsendelseshylster til fæces. Spinalvæske (mindst 1 ml) udhentes i forbindelse med lumbalpunktur. Ved svælg- og vesikelpodning anvendes eswab. I køleskab 4-8 C. Prøven må ikke fryses. Hurtigst muligt, gerne i kølekasse. Svarafgivelse: 1-2 hverdage efter modtagelsen. Tolkning: Positivt resultat bør bekræftes som beskrevet nedenfor. Bemærkninger: Viral meningitis skyldes først og fremmest enterovirus. Ved positivt PCR-resultat for enterovirus i spinalvæske, kan resultatet konfirmeres med påvisning af enterovirus DNA i nasopharynxsekret eller svælgpodning ved PCR. Der skal altid sendes faeces til PCR på Statens Serum Institut som led i den centrale overvågning af enterovirusinfektioner. P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

60 Epstein-Barr virus (EBV) antistoffer (NPU14054) Side 60 af 158 Princip: Indikation: Prøvemateriale: Påvisning af IgM og IgG antistoffer mod EBV viralt capsid antigen (VCA) og IgG antistoffer mod EBV nuclear antigen (EBNA) med CLIA (chemiluminescens immunoassay). Klinisk mistanke om mononukleose. Akut hepatitis, hvor mere hyppige årsager er udelukket. Blod (serum) uden tilsætning. SP/Webreq: Undersøgelse: epstein-barr virus antistof (sygdom?) Materiale: Serum eller koagelblod. Sundhedsplatformen: Bestilles i best/ord. Søgeord; EBV (være opmærksom på at du er inde i fanebladet; installationslisten) Vælg; Epstein-Barr-virus-Antistof; P (NPU14054) Udfyld relevant felter og signer. Gå til opgavelisten og print PTB Tidspunkt for prøvetagning: Utensilier: Første blodprøve så tidligt som muligt i sygdomsforløbet. Prøven gentages evt. efter dage. Tørglas. Prøvetagning: Venepunktur. Prøvemængde: 4-5 ml blod (2 ml serum). Minimum 0,6 ml blod (0,3 ml serum). Opbevaring: Forsendelse: I køleskab (4-8 C). Evt. i kølekasse. Svarafgivelse: 1-3 hverdage efter prøvens modtagelse i KMA. Tolkning: Positiv reaktion for IgM antistoffer mod VCA (VCA IgM) er diagnostisk for primær EBV-infektion og ses hos ca. 90 %. IgG antistoffer mod EBNA (EBNA IgG) udvikles 2-8 mdr. efter primær EBV-infektion og samtidig hermed forsvinder IgM antistoffer mod VCA. IgG antistoffer mod VCA og EBNA (EBNA IgG) er påviselige i serum resten af livet. Ca. 20 % af klinisk mononukleose skyldes CMV infektion. Uspecifik IgM-forhøjelse kan ses ved akut infektion med cytomegalovirus (CMV). P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

61 Side 61 af 158 VCA IgM VCA IgG EBNA IgG Tolkning Negativ Negativ Negativ Ikke tidligere EBV-infektion < 20 U/ml < 22 U/ml < 5 U/ml Positiv Negativ/positiv Negativ Tidlig fase i primær EBV-infektion 40 U/ml < 5 U/ml Positiv Positiv Negativ Sen fase i primær EBV-infektion 40 U/ml 22 U/ml < 5 U/ml Negativ Positiv Negativ Tidligere infektion (3-6 mdr. siden) < 20 U/ml 22 U/ml < 5 U/ml Negativ Positiv Positiv Tidligere infektion (>3-6 mdr. siden) < 20 U/ml 22 U/ml 5 U/ml Negativ Negativ Positiv Tidligere infektion (>3-6 mdr. siden) < 20 U/ml < 22 U/ml 22 U/ml Positiv 40 U/ml Positiv 22 U/ml Positiv 22 U/ml Tidligere infektion med falsk positiv IgM eller såkaldt reaktivering (klinisk betydning usikker) Epstein-Barr virus (EBV) DNA Kvant. (NPU29074/32042) Princip: Indikation: Prøvemateriale: Kommerciel kvantitativ real-time PCR-metode med inhibitionskontrol. Mistanke om EBV-associeret lymfom, herunder hæmofagocytisk lymfo-histiocytose (HLH). Monitering af transplanterede patienter i risiko for udvikling af PTLD (Post-Transplant-Lymphoproliferatove-Disease) eller i behandling for dette. Nasofaryngeal carcinom Ved mistanke om akut EBV-infektion (mononucleose) tages serologi, da et positivt resultat ikke er diagnostisk for primær EBV-infektion. 22/24 raske bloddonorer med tidligere EBV-infektion udskilte EBV intermitterende over en 15 mdr. periode. Minimum 3 ml EDTA-blod. (Kan ikke udføres på heparinblod). Biopsi, knoglemarv, urin, fostervand, podning, spinalvæske, BAL sekret og væv SP/Webreq: Kan kun bestilles på hospital. Undersøgelse: Eptein-Barr virus DNA/RNA (kvantitering) Materiale: vælg type (mange valgmuligheder) P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

62 Side 62 af 158 Utensilier: Samt evt. lokalisation. Sundhedsplatform: følg vejledning for denne Afhængig af prøvetype. For blodprøver bruges EDTA-glas eller gelglas Prøvetagning: Opbevaring I køleskab (4-8 C) Forsendelse: Tolkning: Evt. i kølekasse Et positivt resultat viser at patienten på prøvetagningstidspunktet er inficeret med EBV. Reaktivering af EBV kan ske hos immundefekte patienter. Påvisning af EBV-DNA i blod har høj sensitivitet for diagnosen PTLD hos transplantationspatienter mistænkt for denne tilstand, og høj virusmængde øger denne sandsynlighed yderligere. Hos en person uden symptomer på PTLD som er transplanteret inden for det sidste år vil en gentagen påvisning af virusmængden >10.000kopier/ml betyde at personen har stor risiko for PTLD. Betydning af påvisning af EBV-DNA i luftvejssekreter er ikke kendt og bør ikke rutinemæssigt foretages. Fasciola hepatica antistof (NPU27820) SP/Webreq: Kan kun bestilles på hospital. Undersøgelse: fasciola hepatica antistof. Materiale: Serum eller koagelblod Filarioidea antistof (NPU02058) SP/Webreq: Kan kun bestilles på hospital. Undersøgelse: filarioidea antistof. Materiale: Serum eller koagelblod. Flucytosin serum koncentration (NPU19770) P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

63 Side 63 af 158 SP/Webreq: Kan kun bestilles på hospital. Undersøgelse: flucytosin (koncentrationsmåling). Materiale: Serum eller koagelblod. Franciscella tularensis antistof (NPU08038) SP/Webreq: Kan kun bestilles på hospital. Undersøgelse: franciscella tularensis antistof (harepest) Franciscella tularensis DNA (12276) SP/Webreq: Kan kun bestilles på hospital. Undersøgelse: franciscella tularensis DNA/RNA. Materiale: væv eller væske Franciscella tularensis (dyrkning) (10822) SP/Webreq: Kan kun bestilles på hospital. Undersøgelse: franciscella tularensis(dyrkning) Materiale: biopsi eller aspirat m.m. Fæces for orm, æg og cyster, se Gastroenteritis, diagnostik Gardnerella Vaginalis, se vaginalpodning for gær Gastroenteritis, diagnostik (59001) Princip: Indikation: Dyrkning af fæces på selektive substrater med henblik på påvisning af tarmpatogene bakterier, Salmonella, Campylobacter, Shigella eller Yersenia. Clostridium difficile påvises med PCR (genforstærkningsteknik) direkte på fæces. Diaréfremkaldende E. Coli påvises ved hjælp af PCR og dyrkning. Parasitundersøgelsens princip er PCR eller direkte mikroskopi efter behandling med formol-ethylacetat. Virus påvises med PCR eller immunocard. Mistanke om infektiøs diaré hos indlagte patienter P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

64 Side 64 af 158 Akut diaré med høj feber og/eller påvirket almen tilstand Blodig eller længerevarende diaré Diaré hos svækkede patienter som f.eks. patienter med nedsat immunforsvar og ældre Langvarige abdominale smerter Allergiske manifestationer der giver mistanke om parasitinfektion Abdominale symptomer mere end 14 dage hvis ja hvilke Screening for gastrointastinale parasitter efter udlandsrejse. Kontroldyrkning: Prøvemateriale: Tidspunkt for prøvetagning: Er sjældent indiceret. Undtaget herfra er nogle tilfælde af tyfus-, para-tyfus-, Shigella- og VTEC a) infektioner. Frisk fæces; hvis fæces indeholder blod, slim eller pus, skal dette indgå i prøvematerialet. Dette gælder også for vandig eller flydende fæces. Kvitterede orm eller ormeled sendes i fysiologisk saltvand. Se også orm. Så tidligt som muligt i sygdomsforløbet. Der er med de anvendte følsomme diagnostiske metoder oftest kun indikation for indsendelse af en enkelt fæcesprøve. Er denne negativ, og patienten fortsat syg, indsendes yderligere to prøver opsamlet og dateret på forskellige datoer. Modtages flere fæcesprøver dateret samme dag, undersøges kun en prøve. Det er vigtigt at prøvenummer fra rekvisitionen sættes på prøverøret (det inderste rør). OBS: Bestilles enkeltanalyser under best ord. i SP skal et prøverør per undersøgelse medsendes, bestilles diaréudredning er et prøverør tilstrækkeligt til samtlige undersøgelser. Undersøgelse for Clostridium difficile og norovirus foretages ikke, hvis der foreligger et positivt toksinsvar inden for de seneste 14 dage. Såfremt der indsendes ny prøve efter negativ mikroskopi for parasitter, skrives under anamnese: ekstra prøve til parasitmikroskopi. Standardundersøgelsen omfatter undersøgelse for Salmonella, Shigella, Yersinia enterocolitica, Campylobacter og Aeromonas. Hos indlagte patienter tillige Clostridium difficile. Yderligere undersøgelser sammensættes efter oplysninger på rekvisitionen. P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

65 Side 65 af 158 Standard Undersøgelse Diaréfremkaldende E. coli a) Parasitter PCR f) Parasitter mikroskopi g) Rotaadeno virus Clostridium difficile h) Norovirus (Roskildesyge) Diaré <4 uger X X b) X c) X e) Diaré 4 uger X X X e) Udlandsrejse d) X X X X X c) X e) Synlig blodig diaré X X X c) >3 diarétilfælde i omgivelser udenfor hospital >3 diarétilfælde i omgivelser på hospital X X X X X X X X X X Hospitalsophold indenfor seneste måned X X Immunsuprimeret X X X X Alder >60 år X X Mistanke om norovirusinfektion X a) Diaréfremkaldende E. coli omfatter: Verocytotoxin-producerende E. Coli (VTEC), enteropathogenic E. coli (EPEC), enterotoxigenic E. coli (ETEC), enteroinvasive E. coli (EIEC) og intiminproducerende E. coli. b) Børn < 7 år c) Indlagte børn < 7 år d) Undtagen herfra er Europa, Australien, New Zealand og Japan. e) Hospitaliserede patienter f) Parasit PCR-undersøgelsen omfatter Giardia lamblia, Entamoeba histolytica og Cryptosporidier g) Parasit mikroskopiundesøgelsen omfatter orme, æg og cyster h) Patienter > 2 år I Sundhedsplatformen kan bestilles A. Tarmpatogene bakterier undersøgelse for omfattende dyrkning for Campylobacter, Salmonella, Shigella, Yersinia enterocolitica, Vibrio, Aeromonas og Plesiomonas samt hos børn under 7 år, hos udlandsrejsende og ved blodig diaré tillige diaréfremkaldende E. coli. B. Tarmpatogene virus undersøgelse for omfatter norovirus samt hos børn under 7 år tillige rota/adenovirus. C. Tarmpatogene parasitter undersøgelse for omfatter PCR undersøgelse for Giardie lamblia, Entamoeba histolytica og Cryptosporidier. D. Mikroskopi for parasitter og E. Clostridium difficile undersøgelse for omfatter hvad navnet siger. Vær opmærksom på, at når enkeltanalyser bestilles laves ikke som vanligt undersøgelse for Clostridium difficile på alle indlagte patienter og der kræves en fæcesprøve pr. enkeltanalyse. P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

66 Side 66 af 158 Utensilier: Prøvetagning: Fæcesrør med forsendelsescontainer. Fæces opsamles bedst i et varmedesinficeret bækken. Hvis afføringen ikke er homogen, udvælges prøvematerialet med prøvetagningsskeen fra vandige, løse, slimede, purulente eller blodige afføring. Prøvemængde: Prøverøret fyldes til markeringen "Fyld hertil" (ca. 1/3 af glasset). Dette er vigtigt, da der eller kan være for lidt prøvemateriale til alle diagnostiske undersøgelser. Skruelåget på prøverøret skal strammes og prøverøret anbringes i forsendelseshylsteret. For at undgå smitte til andre personer, må prøverøret ikke forurenes på ydersiden. Rekvisition: I Sundhedsplatformen kan bestilles enkeltanalyser under best ord. eller diaréudredning som udbydes lokalt. Det anbefales at vælge diaréudredning. Bestilles i Webreq, Sundhedsplatform eller SP under diaréudreding. Da arten af undersøgelser bestemmes ud fra en algoritme baseret på de kliniske oplysninger, er det vigtigt at rekvisitionen udfyldes omhyggeligt. Det anbefales tillige at anføre øvrige relevante oplysninger som f.eks. klinisk diagnose og antibiotikabehandling. Promtspørgsmålene sikrer opnåelse af et tilstrækkeligt diagnostisk niveau. Ønskes særlige diagnostiske undersøgelser, som ikke udløses af algoritmen, kan dette anføres under anamnesen Ved gastroenteritis uden diaré anføres dette blot under anamnesen og ordet diaré opfattes herefter som gastroenteritis. Opbevaring: I køleskab (4-8 o C). Forsendelse: Hurtig forsendelse, om muligt i kølekasse. Der bør gå mindre end 1 døgn fra prøvetagning til modtagelsen i KMA. Svarafgivelse: Prøver til undersøgelse for C. difficile fra indlagte patienter, modtaget på KMA inden kl. 20 på alle ugens dage, tilstræbes besvaret samme dag. Øvrige PCR-svar tilstræbes udgivet samme eller følgende hverdag, efter modtagelse af prøven på KMA. Svar for dyrkning af patogene tarmbakterier og mikroskopi for parasitter afgives efter 2-3 hverdage. Tolkning: Negativ prøve udelukker ikke tilstedeværelse af tarmpatogene bakterier hos patienten, idet bakteriepåvisning kan svigte, hvis udskillelsen er sparsom, ophørt eller undertrykt af antibiotika. Bemærkninger: Såfremt den første prøve er negativ, og patienten fortsat har symptomer, tages yderligere 2 prøver fra forskellige datoer, f.eks. to på hinanden følgende dage. P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

67 Side 67 af 158 Resistensbestemmelse af patogene tarmbakterier og tolkning: Vil blive udført i alle tilfælde, hvor det er relevant. Til praksissektoren vil der ikke udgå resistenssvar, idet det som hovedregel ikke er nødvendigt at behandle disse patienter med antibiotika. Følsomheden for de relevante antibiotika kan oplyses ved telefonisk kontakt til afdelingen. Hospitalsafdelingerne vil modtage resistensmønsteret på alle patogene tarmbakterier overfor relevante antibiotika. Giardia trofozoitter, se Duodenalsekret Gonokokker, se Neisseria gonorrhoeae (gonokokker)(dyrkning) og Chlamydia trachomatis og Neisseria gonorrhoeae RNA Gonokok antistof (GAT) Undersøgelse for Gonokok antistof er nedlagt pr 1. marts 2018 Gul feber virus PCR (NPU27081) og antistof IgM, IgG (NPU53357) SP/Webreq: Kan kun bestilles på Hospital. Undersøgelse: Gul feber DNA/RNA, IgG og IgM Materiale: EDTA-blod, Serum eller koagelblod. Haemophilus ducrei (12100) SP/Webreq: Undersøgelse: haemophilus ducreyi DNA/RNA Materiale: podning Lokalisation: genitalier, ydre Haemophilus influenza type b antistof (Hib) (NPU08044) P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

68 Side 68 af 158 SP/Webreq: Undersøgelse: haemophilus influenzae type b antistof. Materiale: Serum eller koagelblod. Hantavirus PCR (NPU27111) og antistof IgM, IgG (NPU29071) SP/Webreq: Kan kun bestilles på hospital. Undersøgelse: hantavirus DNA/RNA, IgG og IgM antistof. Materiale: Blod (EDTA-glas) Helicobacter pylori antigen i fæces (13260) Princip: Indikation: Prøvemateriale: Påvisning af Helicobacter pylori antigen i fæces ved hjælp af ELISA teknik Bl.a. øvre dyspepsi Udredt non-ulcus dyspepsi Patienter i nymedicinering med NSAID Børn med øvre dyspepsi når andre årsager er udelukket Kontrol efter Helicobacter pylori eradikationsbehandling ( 4 uger efter) Fæces SP/Webreq: Undersøgelse: helicobacter pylori antigen Materiale: faeces. Tidspunkt for prøvetagning: Tidligst 2 uger efter ophør af behandling med ulcusmidler, tidligst 4 uger efter ophør af eradikationsbehandling. Utensilier: Fæcesrør med prøvetagningsske og transporthylster Prøvemængde: 5-10 ml fæces Opbevaring: Forsendelse: I køleskab 4-8 ºC i op til 2 døgn Evt. i kølekasse. Ved transport med postvæsenet anvendes fors endelseshylster Svarafgivelse: Undersøgelsen udføres 2 gange om ugen og besvares samme dag P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

69 Side 69 af 158 Tolkning: Svar angives som: Helicobacter antigen påvist eller ikke påvist Bemærkninger: Undersøgelsen er på højde med andre standardmetoder til diagnostik af Helicobacter Pylori infektion, specielt urea breath test (pustetesten), og er bedre end antistofbestemmelse både mht. sensitivitet, specificitet og anvendelighed til kontrol efter gennemført eradikationsbehandling. Vær opmærksom på, at analyserne kan blive negative, hvis prøven tages efter at patienten er opstartet i behandling. To uger efter endt behandling vil H. pylori Ag i faeces og urease-aktiviteten i pusteprøven igen blive positive, hvis bakterien er til stede i ventriklen. Helicobacter pylori antistoffer Analysen er nedlagt pr. 1. maj 2017 Bestemmelse af H. pylori- antistoffer i serum har yderst begrænset værdi. Korrekt diagnostik af aktuel H. pylori-infektion indebærer enten påvisning af H. pyloriantigen i fæces eller påvisning af urease-aktivitet ved pusteprøve Helicobacter pylori, dyrkning fra ventrikelbiopsi, se Væv, knogle og vævsbiopsier Hepatitis A virus (HAV) (NPU17657) Princip: Indikation: Prøvemateriale: Påvisning af IgM og total (IgM + IgG) antistoffer mod HAV med CLIA (Chemiluminescens immunoassay) Prøven analyseres primært for totalantistoffer. Er denne positiv suppleres med IgM analyse) Klinisk mistanke om HAV-infektion. Bestemmelse af immunstatus efter vaccination. Blod (serum) uden tilsætning. SP/Webreq: Undersøgelse: hepatitis A virus antistof (immunstatus) Materiale: Serum eller koagelblod. Tidspunkt for prøvetagning: Utensilier: Diagnostisk undersøgelse ved sygdomsdebut. Tørglas. P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

70 Side 70 af 158 Prøvetagning: Venepunktur. Prøvemængde: 4-5 ml blod (2 ml serum). Minimum 1ml blod (0,5 ml serum). Opbevaring: Forsendelse: I køleskab (4-8 C). Evt. i kølekasse. Svarafgivelse: 1-3 hverdage efter prøvens modtagelse i KMA. Der foretages separat bestemmelse af totale antistoffer (IgG + IgM) mod HAV. Er denne undersøgelse negativ, eller er der kun forlangt immunstatus, foretages ikke yderligere. Er der positivt udfald for total-hav-antistoffer eller grænseværdi ved mistanke om akut HAVinfektion, foretages bestemmelse af IgM antistoffer mod HAV. Ved mistanke om akut HAV-infektion og grænseværdi for IgM anbefales ny prøve om 14 dage. Tolkning: HAV IgM HAV total Tolkning Negativ > 1,1 Ikke HAV-inficeret (eller i inkubationsfasen) Positiv 1,1 Positiv 0,9 Akut eller nylig overstået HAV-infektion Negativ < 0,9 Positiv 0,9 Tidligere HAV-infektion eller vaccineret Hepatitis A virus (HAV) PCR (32150) SP/Webreq: Kan kun bestilles på Hospital. Undersøgelse: hepatitis A virus DNA/RNA Materiale vælg: blod (EDTA-glas) eller fæces Sundhedsplatformen: Bestilles i best/ord. Søgeord; HAV (være opmærksom på at du er inde i fanebladet; installationslisten). Vælg; P Hepatitis A virus-ab gruppe; P. Udfyld relevant felter og signer. Gå til opgavelisten og print PTB P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

71 Hepatitis B virus (HBV) (NPU16105) Side 71 af 158 Princip: Indikation: Prøvemateriale: Påvisning af IgM og IgG antistoffer mod flere HBV-antigener (HBc, HBe, HBs) samt påvisning af HBs og HBe antigen ved såkaldt CLIA (Chemiluminesens immunoassay) Alle prøver undersøges primært for HBsAG, Hbc totalantistof og HBs Ab. Klinisk mistanke om HBV-infektion. Undersøges primært for HBsAg, HBcAb og HbsAb, er en af disse analyser positive, suppleres med HBcIgM og HBeAg og HBeAb. Bestemmelse af immunstatus efter vaccination. Undersøges for HBs AB. Monitorering af behandling. Blod (serum) uden tilsætning. SP/Webreq: Undersøgelse: hepatitis B (antigen- og antistofundersøgelse) Materiale: Serum eller koagelblod. Sundhedsplatformen: Bestilles i best/ord Søgeord; Hepatitis B (være opmærksom på at du er inde i fanebladet; installationslisten) Vælg; Hepatitis B virus-antistof(liste); P (NPU 16105) Der laves altid HbSAb, HbSAg og HbC total Ab. Hvis HbSag eller HbC total Ab er positiv laves endvidere HbC IgM, HbEAb og HbEAg Udfyld relevant felter og signer Gå til opgavelisten og print PTB Tidspunkt for prøvetagning: Diagnostisk undersøgelse ved sygdomsdebut. Se i øvrigt side 58 med kurverover HBV-infektionens forløb. Utensilier: Tørglas. Prøvetagning: Venepunktur. Prøvemængde: 4-5 ml blod (2 ml serum). Opbevaring: Forsendelse: I køleskab (4-8 C). Evt. i kølekasse. P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

72 Side 72 af 158 Svarafgivelse: 3 hverdage efter prøvens modtagelse i KMA. Tolkning: Ved indikationen akut hepatitis vil det være mest rationelt at undersøge for IgM + IgG antistoffer mod HBc antigen (HBc total). Ved positivt udfald undersøges selektivt for IgM antistoffer mod HBc (HBc IgM), tilstedeværelsen af HBs antigen samt antistoffer mod HBs antigen (HBs total). Hvis patienten har positiv reaktion for HBc IgM, drejer det sig om en akut HBV-infektion. Hvis der er negativ HBc IgM ved samtidig positiv HBc totale antistoffer, har patienten en tidligere infektion, som enten er overstået (viser sig ved positiv reaktion for HBs antistoffer) eller blevet kronisk (positiv reaktion for HBs antigen). Isoleret forekomst af HBs antistoffer ses efter tidligere vaccination. Mulige kombinationer af resultater er således: HBc total HBc IgM HBs antigen HBs total (IgG+IgM) Tolkning Negativ Ikke HBV inficeret (eller i inkubationsfasen) Positiv Positiv Positiv/negativ Negativ Akut HBV-infektion Positiv Negativ Positiv Negativ Kronisk HBV-infektion * Positiv Negativ Negativ Positiv Overstået HBV-infektion Negativ Negativ Negativ Positiv Vaccinationseffekt Positiv Negativ Positiv Positiv Kronisk HBV-infektion * Positiv Negativ Negativ Negativ kronisk HBV-infektion kan ikke udelukkes* * Henvises til Infektionsmedicinsk afdeling Supplerende undersøgelse for HBe antigen og HBe antistoffer foretages, når HBs antigen er påvist i blod, idet HBe antigen og antistoffer mod HBe er relateret til infektiøsitet. Positiv reaktion for HBe antigen er udtryk for aktiv HBV-infektion med høj smitsomhed. Positiv reaktion for HBe antistoffer er forbundet med lav smitterisiko, men giver ikke sikkerhed for fravær af smitterisiko. Serokonversion m.h.t. HBe antigen (dvs. positivt resultat for HBe antigen konverteres til positivt resultat for HBe antistoffer) tyder på behandlingsrespons. Det serologiske forløb af Hepatitis B virusinfektioner kan ses i Sundhedsstyrelsens vejledning om hepatitis på adressen: Vejledning for forebyggelse mod hepatitis P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

73 Side 73 af 158 Fig Det ukomplicerede forløb af hepatitis B infektion serologiske forløb under det Figur 2.2. Udvikling af kronisk hepatitis B-infektion med vedvarende HBeAg positivitet Figur 2.3. Udvikling af kronisk hepatitis B-infektion med senere HBeAg til anti- HBe serokonversion P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

74 Side 74 af 158 Hepatitis B virus (HBV), DNA (PCR) kvantitativ (NPU16258) Se Hvidovre Hospitals prøvevejledning SP/Webreq: Undersøgelse: hepatitis B virus DNA/RNA. Materiale: blod (EDTA-glas) Hepatitis B virus (HBV), subtype og resistensbestemmelse. Undersøgelsen er nedlagt på SSI, april 2018 Hepatitis C virus (HCV) (NPU12728) Princip: Indikation: Prøvemateriale: Påvisning af IgG antistoffer mod HCV ved CLIA (chemiluminescens immunoassay) Klinisk mistanke om HCV-infektion (akut hepatitis). Bestemmelse af immunstatus. Blod (serum) uden tilsætning. SP/Webreq: Undersøgelse: hepatitis C virus IgG antistof. Materiale: serum eller koagelblod Sundhedsplatformen: Bestilles i best/ord Søgeord; HCV (være opmærksom på at du er inde i fanebladet; installationslisten) Vælg; Hepatitis C virus Ab (IgG); P Udfyld relevant felter og signer Gå til opgavelisten og print PTB Tidspunkt for prøvetagning: Utensilier: Diagnostisk undersøgelse ved sygdomsdebut. For at udelukke HCVinfektion anbefales ny blodprøve udtaget 2 mdr. senere, hvis første prøve er negativ. Tørglas. Prøvetagning: Venepunktur. P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

75 Side 75 af 158 Prøvemængde: 4-5 ml blod (2 ml serum). Minimum 0,6 ml blod (0,3 ml serum). Opbevaring: Forsendelse: I køleskab (4-8 C). Evt. i kølekasse. Ved forsendelse med postvæsenet anvendes forsendelseshylster. Svarafgivelse: 1-3 hverdage efter prøvens modtagelse i KMA. Tolkning: Positivt ( 1,0) resultat kan betyde, at patienten har eller har haft HCV-infektion. En tredjedel til halvdelen clearer selv deres akutte HCV-infektion. Resten bliver kroniske bærere. Der kan også forekomme falsk positive resultater Positivt fund bør derfor altid følges op med analyse af HCV RNA i blodet og henvisning til specialafdeling. Bemærkninger: IgG antistoffer mod HCV optræder først 1-2 mdr. efter smitte. Ved akut hepatitis kan antistofundersøgelse suppleres med påvisning af HCV RNA i blodet ved kvalitativ PCR. Hepatitis C virus genotypning (NPU57507) Se Hvidovre Hospitals prøvevejledning SP/Webreq: Kan kun bestilles på hospital. Undersøgelse: hepatitis C virus (genotypning) Materiale: blod (EDTA-glas) Hepatitis C virus, RNA (RT-PCR) kvantitativ (NPU16355) Prøven sendes til Aalborg KBA. SP/Webreq: Undersøgelse: hepatitis C virus DNA/RNA (konfirmation) Materiale: blod (EDTA-glas) Hepatitis D virus PCR (NPU20186) OBS! Det er kun relevant at undersøge for hepatitis D, hvis patienten er kendt kronisk inficeret med hepatitis B P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

76 Side 76 af 158 SP/Webreq: Kan kun bestilles på hospital. Undersøgelse: hepatitis D virus DNA/RNA. Materiale vælg: blod (EDTA-glas) eller serum eller koagelblod. Hepatitis D virus antistof HDV (NPU02345) OBS! Det er kun relevant at undersøge for hepatitis D, hvis patienten er kendt kronisk inficeret med hepatitis B SP/Webreq: Undersøgelse: hepatitis D virus antistof. Materiale: serum eller koagelblod Hepatitis E (HEV) RNA PCR (NPU28021/32175) SP/Webreq: Kan kun bestilles på hospital. Undersøgelse: hepatitis E virus DNA/RNA Materiale: biopsi, blod (EDTA-glas) eller fæces Samt evt. lokalisation. Sundhedsplatformen: Bestilles i best/ord Søgeord; Hepatitis E (være opmærksom på at du er inde i fanebladet; installationslisten) Vælg; Hepatitis E virus (RNA); P (NPU28021) Udfyld relevant felter og signer Gå til opgavelisten og print PTB Hepatitis E antistof IgM, IgG (NPU54238) SP/Webreq: Undersøgelse: hepatitis E virus antistof. Materiale: blod (EDTA-glas) eller serum eller koagelblod. P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

77 Herpes simplex virus (HSV) antistof (NPU18834) Side 77 af 158 Princip: Indikation: Prøvemateriale: Påvisning af IgG antistoffer mod HSV ved CLIA (chemiluminescens immuno assay) teknik. Der undersøges for typespecifikke antistoffer (anti HSV. 1, anti HSV. 2) Mistanke om aktiv HSV-infektion (se Tolkning). Bestemmelse af immunstatus. Blod (serum) uden tilsætning Undersøgelse for HSV encephalitis (intratekal antistofsyntese): Gelglas samt spinalvæske. SP/Webreq: Undersøgelse: herpes simplex virus IgG antistof Materiale: serum eller koagelblod. Sundhedsplatformen: Spinalvæske Bestilles i best/ord, Søgeord; HSV VZV (være opmærksom på at du er inde i fanebladet; installationslisten) Vælg HSV+VZV-Ab (IgG)gruppe:Cvs/P Vælg tages af rekvirent. Vælg frekvens en gang Vælg prioritet frem skyndt Accepter og signer Gå til opgavelisten og print PTB. Tidspunkt for prøvetagning: Utensilier: Diagnostisk undersøgelse ved sygdomsdebut. Tørglas. Prøvetagning: Venepunktur. Lumbalpunktur. Prøvemængde: 4-5 ml blod (2 ml serum). Minimum 0,6 ml blod (0,3 ml serum). 0,5 1 ml spinalvæske. Opbevaring: Forsendelse: I køleskab (4-8 C). Evt. i kølekasse. Ved forsendelse med postvæsenet anvendes forsendelseshylster. Svarafgivelse: 1-3 hverdage efter prøvens modtagelse i KMA. Resultatet angives som negativt eller positivt. P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

78 Side 78 af 158 Tolkning: Klinisk herpesinfektion (evt. positiv HSV PCR) kombineret med negativ HSV IgG antistofundersøgelse tyder på primærinfektion. Klinisk herpesinfektion kombineret med positiv HSV IgG antistofundersøgelse tyder på reaktivering (sekundær infektion). Har man kun antistoffer rettet mod en anden type HSV end aktuelt typisk genitalt udbrud er der tale om non-primær herpesinfektion. Herpes simplex virus (HSV) DNA (typespecifik) (32010) Princip: Indikation: Prøvemateriale: Påvisning af HSV 1 og HSV 2 DNA med PCR-teknik. Symptomer på primær eller sekundær herpeslæsion, herunder herpeskeratit. Pneumoni hos immunsupprimerede patienter Neonatal herpes. Vesikelvæske eller podning fra læsioner på hud eller slimhinder. BAL. EDTA-blod. Fra nyfødte med kliniske tegn på neonatal herpes: Podning fra læsioner på hud, svælgpodning, podning fra conjunctiva, eller spinalvæske Fra asymptomatiske nyfødte med relevant eksposition for HSV (NB! prøvetagning tidligst 24 timer efter eksposition/fødsel): som ovenfor, fraset spinalvæske. SP/Webreq: Undersøgelse: herpes simplex virus DNA/RNA Materiale: Bronkoalveolær lavage, podning, eller vesikelvæske. Samt evt. lokalisation. Ved mistanke om encephalit eller meningitis (ikke nyfødte, se ovenfor) vælges undersøgelse: encephalit udredning (HSV + VZV) DNA/RNA. Se denne. Tidspunkt for prøvetagning: Utensilier: Tidligst muligt i sygdomsforløbet, svarende til det vesikulære eller væskende stadie. Virus kan ikke påvises, når læsionerne er skorpedækkede eller indtørrede. eswab til svælg- og vesikelpodning, trakealsekret og BAL. Prøvetagning: Bristede vesikler podes med speciel podepind eswab, som presses eller rulles mod sårets bund. Podepinden anbringes i det medfølgende transportmediuim og afknækkes. P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

79 Side 79 af 158 Materiale fra de dybe luftveje tages i sterilt spidsglas og sendes uden tilsætning. Til encephalitudredning, se Histoplasma antistof Opbevaring: I køleskab ved 4-8 C. Forsendelse: Evt. i kølekasse. Ved forsendelse med postvæsenet anvendes forsendelseshylster. Svarafgivelse: 1-2 hverdage efter modtagelsen. Positivt svar angives som HSVtype 1 eller HSV type 2 påvist. Bemærkninger: Under udredning af neonatal HSV-infektion kan det være relevant at undersøge mor og barn for typespecifikke antistoffer (se Herpes simplex virus (HSV) antistof). Histoplasma antistof (NPU12128) SP/Webreq: Kan kun bestilles på hospital. Undersøgelse: histoplasma antistof. Materiale: serum eller koagelblod HIV 1 og HIV 2 (antigen- og antistofundersøgelse) (NPU19649) Princip: Indikation: Prøvemateriale: Påvisning af IgG antistoffer mod HIV 1 og 2 samt HIV 1 p24 antigen med CLIA (Chelimluminescens immunoassay). Mistanke om HIV-infektion. Blod (serum) uden tilsætning. SP/Webreq: Undersøgelse: HIV 1 og HIV 2 (antigen- og antistofundersøgelse) Materiale: serum eller koagelblod. Sundhedsplatformen: Bestilles i best/ord. Søgeord; HIV (være opmærksom på at du er inde i fanebladet; installationslisten). Vælg; HIV 1+ 2 (Ag +Ab) Udfyld relevant felter og signer. Gå til opgavelisten og print PTB P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

80 Side 80 af 158 Tidspunkt for prøvetagning: Utensilier: Så snart mistanke om HIV-infektion opstår. Tørglas. Prøvetagning: Venepunktur. Prøvemængde: 4-5 ml blod (2 ml serum). Opbevaring: Forsendelse: I køleskab (4-8 C). Evt. i kølekasse. Svarafgivelse: 1-3 hverdage efter prøvens modtagelse i KMA. Prøver på hospitalsindlagte patienter kan dog udføres samme dag efter telefonisk aftale Positivt svar afgives efter konfirmatorisk test. Positivt svar kan tage længere tid, da prøven skal sendes til konfirmatorisk test. Ved hospitalsindlagte patienter vil behandlingsansvarlig klinisk læge dog blive kontaktet telefonisk inden konfirmatorisk test foreligger. Tolkning: Negativt svar udelukker ikke HIV-infektion. Patienten kan være smittet uden endnu at have udviklet antistoffer mod HIV 1 eller HIV 2. Den samtidige detektion af p24 antigen mindsker dog varigheden af det diagnostiske vindue, dvs. perioden med infektion inden påviselige antistoffer. HIV-1 genotypisk resistensbestemmelse (NPU29263) SP/Webreq: Kan kun bestilles på hospital. Undersøgelse: HIV-1 (dyrkning og resistens). Materiale: blod (EDTA-glas) HIV-1 genotypisk tropisme test (SSI00681) SP/Webreq: Kan kun bestilles på hospital. Undersøgelse: HIV-1 (genotypisk tropisme test) Materiale: blod (EDTA-glas) P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

81 HIV-1 integrase resistens (NPU29920) Side 81 af 158 SP/Webreq: Kan kun bestilles på hospital. Undersøgelse: Human immundefektvirus 1;P Materiale: blod (EDTA-glas) HIV-1 RNA (Viral load) kvantitativ (RT-PCR) (NPU16132) Se Hvidovre Hospitals prøvevejledning SP/Webreq: Kan kun bestilles på hospital. Undersøgelse: Human immundefektvirus (RNA);P Materiale: blod (EDTA-glas) HIV-1 PCR (DNA) kvalitativ (NPU16131) SP/Webreq: Kan kun bestilles på hospital. Undersøgelse: HIV 1 (DNA):Lkcs(B) Materiale: blod (EDTA-glas) HSV, se Herpes simplex virus (HSV) antistof Hudsvampe (dermatofytter) DNA/RNA (22050) Princip: Indikation: Prøvemateriale: Påvisning af svampehyfer og -konidier ved PCR-opformering og efterfølgende smeltepunktsanalyse. Mangeartede kliniske hudlæsioner fra anulære, skællede udslæt til inflammerende elementer med pustuløs follikulit og keriondannelse, intertriginøs maceration og hårtab. Undersøgelsen er den primære ved mistanke om dermatofytose. Se dog også Hudsvampe (dermatofyter) mikroskopi og dyrkning (21030). Hudskæl, hår, skæg og negleskrab (rigeligt, makroskopisk synligt materiale). SP/Webreq: Under undersøgelse: vælg: Hudsvampe (dermatofytter) DNA/RNA. Materiale vælg: Hudskrab, hårstrå eller negl. Samt evt. lokalisation. P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

82 Side 82 af 158 Tidspunkt for prøvetagning: Utensilier: Før start af antimykotisk behandling. Prøvemateriale af hudskæl samt hår og negleskrab dispenseres i Sarstedtrør og forsynes med den lille mærkat fra PTB-rekvisition på langs af røret. Prøvetagning: Hud: Med skarpske eller skalpel skrabes rigeligt med hudskæl fra flere steder af randzonen. Ved sårskorper indsendes den del, der er nærmest rask hud. Hår og skæg: Angrebet hår trækkes ud med pincet. Evt. skæl fjernes fra håret, og hårstubbene under skællene sendes til undersøgelse. Negle: Der skrabes med skarpske fra over- og underside af neglen samt fra neglefalsen. Opbevaring: Stuetemperatur, evt. køleskab. P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

83 Side 83 af 158 Forsendelse: Med prøvetransporten eller med post i almindelig mærket kuvert. Sarstedt rør Rekvisition: Her anføres det anatomiske område materialet stammer fra, og om det er hår eller skrab fra hud eller negle. Svarafgivelse: Der afgives svar på PCR 1-2 hverdage efter at prøven er modtaget. Tolkning: Undersøgelsen kan påvise DNA fra følgende dermatofyter: Trichophyton rubrum T. soudanense T. interdigitale T. mentagrophytes T. tonsurans T. violaceum T. benhamiae T. verrucosum Microsporum canis M. audouinii Epidermophyton floccosum Desuden påvises Candida albicans. Påvisning af en dermatofyt er ensbetydende med at patienten er inficeret med den pågældende svamp. Visse af dermatofyterne er så nært genetisk beslægtede, at de ikke kan skelnes med PCR. Det drejer sig fx om T. rubrum og T. soudanense, hvor prøvematerialet (hudskrab/negleprøve eller hårstrå) sandsynliggør om der er tale om hhv. T. rubrum eller T. soudanense. Dette angives direkte i svaret. Tilstedeværelse af inhiberende faktorer i prøven kan bevirke, at DNA-opformeringen ved PCR ikke finder sted. Undersøgelsen vil da blive besvaret som Ubedømmelig. P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

84 Side 84 af 158 Bemærkninger: Analysen er ved sammenligning med mikroskopi og dyrkning mindst lige så sensitiv ved test af hud og hår, men 20 % mere sensitiv ved test af negle. Utilstrækkeligt prøvemateriale kan medføre falsk negativt svar. Få og sjældent forekommende dermatofyter kan ikke påvises med denne metode (fx T. terestre, T. megninii, T. ajello, M. gypseum og M. cookie). Ved negativt svar på Hudsvampe DNA og fortsat mistanke om dermatofytose bør man derfor indsende ny prøve til Hudsvampe DNA/RNA, respektive Hudsvampe mikroskopi og dyrkning (21030). Ved ønske om behandlingskontrol, eller mistanke om Malassezia furfur benyttes undersøgelse for Hudsvampe (dermatofyter) mikroskopi og dyrkning (21030). Hudsvampe (dermatofyter) DNA/RNA-undersøgelsen er ikke velegnet til behandlingskontrol/undersøgelse for behandlingssvigt, hvor mikroskopi og dyrkning for hudsvampe (se Hudsvampe (dermatofyter) mikroskopi og dyrkning (21030)) bør anvendes. Hudsvampe (dermatofyter) mikroskopi og dyrkning (21030) Princip: Indikation: Prøvemateriale: Påvisning af hudsvampe ved mikroskopi og dyrkning. Malassezia furfur påvises alene ved mikroskopi. Mangeartede kliniske hudlæsioner fra anulære, skællede udslæt til inflammerende elementer med pustuløs follikulit og keriondannelse, intertriginøs maceration og hårtab. Negativ undersøgelse for Hudsvampe (dermatofyt) DNA/RNA og fortsat mistanke om dermatofytose eller svampeinfektion med non-dermatofyt. Behandlingskontrol Mistanke om pityriasis versicolor forårsaget af gærsvampen Malassezia furfur. Hudskæl, hår, skæg og negleskrab (rigeligt, makroskopisk synligt materiale). SP/Webreq: Under undersøgelse: vælg: Hudsvampe (dermatofyt) mikroskopi og dyrkning (21030). Materiale vælg: Hudskrab, hårstrå eller negl. Samt evt. lokalisation. Tidspunkt for prøvetagning: Utensilier: Før start af antimykotisk behandling. Prøvemateriale af hudskæl samt hår og negleskrab i Dermapak (se nedenfor) P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

85 Side 85 af 158 Prøvetagning: Hud: Med skarpske eller skalpel skrabes rigeligt med hudskæl fra flere steder af randzonen. Ved sårskorper indsendes den del, der er nærmest rask hud. Hår og skæg: Angrebet hår trækkes ud med pincet. Evt. skæl fjernes fra håret, og hårstubbene under skællene sendes til undersøgelse. Negle: Der skrabes med skarpske fra over- og underside af neglen samt fra neglefalsen. Opbevaring: Forsendelse: Stuetemperatur. Med prøvetransporten eller med post i almindelig mærket kuvert. Dermapak Rekvisition: Her anføres det anatomiske område materialet stammer fra, og om det er hår eller skrab fra hud eller negle. Svarafgivelse: På hverdage afgives svar på mikroskopi samme dag prøven er modtaget eller senest dagen efter. Dyrkningssvar kan forventes 1-2 uger efter modtagelsen. Dog vil dyrkningstiden på prøver fra hår og hovedbund være op til 3 uger. Tolkning: Negativt svar på mikroskopi og dyrkning kan skyldes utilstrækkeligt prøvemateriale. Et positivt mikroskopisvar er altid signifikant, også ved negativt dyrkningsresultat. Bemærkninger: Resistensbestemmelse af hudsvampe kan ikke udføres, idet der ikke findes en egnet teknik til dette. Ved negative resultater og fortsat mistanke om mykose bør der tages en ny prøve, idet der henvises til korrekt prøvetagning. P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

86 Side 86 af 158 Human herpes virus 6A, 6B, 7 DNA (SV100279) SP/Webreq: Kan kun bestilles på hospital. Undersøgelse: Human herpes virus 6A. Materiale: spinalvæske. Human papillomavirus DNA/RNA (SSI00265) SP/Webreq: Kan kun bestilles på hospital. Undersøgelse: human papillomavirus DNA/RNA Materiale: vælg: biopsi, børstebiopsi eller podning. Samt evt. lokalisation. Princip: Indikation: Prøvemateriale: Påvisning af respiratorisk syncytialvirus (RSV) og influenza A og B med amplifikationsteknik (PCR). RSV: Børn <2 år med hoste og hvæsende respiration, dyspnø og takypnø og immunsupprimerede patienter med nedre luftvejsinfektion. Hyppigst vinter og tidligt forår Influenza A og B: Pludselig temperaturstigning ledsaget af kulderystelser, muskelsmerter, hovedpine, hoste og forkølelsessymptomer. Hyppigst i vinterhalvåret. Sekret fra nasopharynx, trakealsekret, BAL, svælgpodning. SP/Webreq: Undersøgelse: luftvejsvirus DNA/RNA eller udvidet luftvejsvirus. Materiale: bronkialsekret bronkoskopisk ophentet, bronkoalveolær lavage (BAL), ekspektorat, nasopharynxsekret, podning eller trakealsekret. Tidspunkt for prøvetagning: Utensilier: Så tidligt som muligt i den akutte sygdomsfase. Trakealsugesæt. P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

87 Kateter til sugning nr. 6 eller 8. Sterilt, isotonisk saltvand. eswab Side 87 af 158 Prøvetagning: Nasopharynxsug: Kateteret føres gennem næse til nederste del af pharynx. Der suges samtidig med, at katetret trækkes langsomt tilbage. Til slut suges et par ml sterilt fysiologisk saltvand igennem katetret. Trakealsug og BAL. Podning fra svælg eller nasopharynx: Podepinden føres gennem mund eller næsehule til bagsiden af svælg eller næsesvælgrum, hvorefter der gnides med podepinden mod slimhinden. Podepind kommes efterfølgende i E-swabmediet. Prøvemængde: Ca. 2 ml. Opbevaring: Forsendelse: I køleskab (4-8 C). Kort transporttid bør sikres. Forsendelsen bør ske i kølekasse. Ved transport med postvæsenet anvendes forsendelseshylster. Svarafgivelse: Udføres alle ugens dage vinter og tidligt forår. I sommerhalvåret udføres ikke respirationsvirus i weekenden Svar afgives løbende Svartid max 5 timer, ofte hurtigere. Sidste ankomsttid for at få svar samme dag: Hverdage 17:30, weekender 16:30. Ellers er der svar næste morgen på prøver, der kommer ved 19-tiden Tolkning: Positivt svar kan anvendes som: Beslutning om isolation af inficerede patienter (Influenza A/B og RSV). Ætiologisk udredning. Se endvidere Luftvejsvirus udvidet DNA/RNA P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

88 Side 88 af 158 Influenza C Indikation: Infektion med influenza C sker typisk I småbarnsalderen. Der er kun indikation for denne undersøgelse, hos immunsuprimerede patienter med ukendt genese. SP/Webreq: Undersøgelse: Influenza (A&B) og RS virus DNA/RNA Materiale: Bronkialsekret bronkoskopisk ophentet, bronkoalveolær lavage (BAL), ekspektorat, nasopharynxsekret, podning eller trakealsekret. Under anamnesen ønskes: Influenza C Influenzavirus subtypning Alle prøver positive for influenza A sendes altid til overvågning på SSI, hvor der udføres subtype-bestemmelse. Influenzavirus, genotypisk resistens overfor neuramidasehæmmer Kan sendes videre til SSI, ved positivt fund af influenza A og behandlingssvigt efter aftale med KMA. Itraconazol serum koncentration (NPU27331) SP/Webreq: Undersøgelse: itraconazol (koncentrationsmåling) Materiale: serum eller koagelblod P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

89 I.V. kateterspids (10011) Side 89 af 158 Princip: Indikation: Prøvemateriale: Semikvantitativ dyrkning af bakterier og svampe fra kateterspids. Exit-site infektion, evt. med flebit, tunnelinfektion langs tunneleret kateter og Pocket infektion. Bakteriæmi uden kendt fokus hos patient med i.v. kateter eller anden intravaskulær adgangsvej. Ca. 5 cm af den intravenøse kateterspids. SP/Webreq: Undersøgelse: Dyrkning og resistens. Materiale: Kateterspids Lokalisation: Vælg katetertype. Utensilier: Sterilt spidsglas med skruelåg. Prøvetagning: Katetrets indstikssted desinficeres omhyggeligt med 2 x jodsprit 2,5 % SAD liniment, eller hos patienter med jodallergi 2 x klorhexidinsprit 0,5 % i alkohol 70 %. Katetret fjernes aseptisk, og ca. 5 cm af spidsen afklippes ned i sterilt spidsglas. Afklipningsstedet skal ligge mindst ½ cm inden for hudniveau. Ved transporttid over 1-2 timer forsynes spidsglasset med et par dråber sterilt vand for at undgå udtørring. Opbevaring: Forsendelse: I køleskab (4-8º C). Første ordinære transport. Der anvendes kølekasse. Svarafgivelse: Ved vækst af bakterier eller svampe foretages kvantitering. Foreløbigt svar afgives 1 døgn efter modtagelse af prøven. Slutsvar afgives efter 2-5 døgn. Tolkning: Hvis kolonitallet er >15, anses kateterspidsen for koloniseret og som fokus ved fund af samme organisme i blodet. Er kolonitallet <15 er det sandsynligt, at kateterspidsen er kontamineret under fjernelsen. Bemærkninger: Værdien af dyrkning af andre katetertyper end intravenøse katetre er ikke dokumenteret. Japansk encephalit virus PCR og antistof (NPU27117/NPU53365) P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

90 Side 90 af 158 SP/Webreq: Undersøgelse: Japansk encephalitis virus DNA/RNA, IgG og IgM Materiale: spinalvæske og serum JC-polyomavirus (NPU27704) SP/Webreq: Undersøgelse: JC polyomavirus DNA/RNA. Materiale: spinalvæske Kighoste (Bordetella pertussis) antistoffer (NPU13609) Princip: Indikation: Prøvemateriale: Påvisning af IgG antistoffer mod Bordetella pertussis toxin med ELISA-teknik Som for B. pertussis DNA, dvs. mistanke om kighoste, hvor der desuden foreligger negativt PCR resultat og varighed af hoste på mere end 2 uger. Undersøgelsen kan ikke anvendes til børn under 8 år. Gelglas. SP/Webreq: Undersøgelse: Bordetella pertussis IgG antistof (immunstatus) Materiale: serum eller koagelblod. Tidspunkt for prøvetagning: Ved formodning om aktiv infektion med symptomvarighed over 2 uger. Utensilier: Tørglas eller gelglas. Prøvetagning: Venepunktur. Prøvemængde: 4-5 ml blod (2 ml serum). Opbevaring: Forsendelse: I køleskab (4-8º C). Evt. i kølekasse. Ved forsendelse med postvæsnet anvendes transporthylster. Svarafgivelse: Indenfor 1 uge efter modtagelse. P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

91 Side 91 af 158 Tolkning: Svarafgivelse sker i internationale enheder U/ml med angivelse af positiv ( 100 IU/ml), negativ (< 40 IU/ml) eller grænseværdi 40 og < 100 U/ml). Positivt resultat indikerer akut B. pertussis infektion, grænseværdi er et usikkert resultat og bør følges op med ny prøve efter 7-10 dage. Kighoste (Bordetella pertussis) DNA (NPU13609/12145) Princip: Indikation: Prøvemateriale: Påvisning af B. pertussis DNA med PCR-teknik. Paroksysmatiske hosteanfald: Gøende hostestød efterfulgt af kigen. Børn under 6 måneder med apnø-episoder. Persisterende hoste >2 uger hos unge og voksne uden kendt lungesygdom. Podning fra nasopharynx. SP/Webreq: Undersøgelse: Bordetella/parapertussis DNA/RNA Materiale: podning Lokalisation: Næsesvælgrum (nasopharynx) Tidspunkt for prøvetagning: Utensilier: Så tidligt som muligt i sygdomsforløbet og før antibiotisk behandling startes. Bakterietallet falder gradvis under forløbet. Tynd eswab med transportmedium (blåt skruelåg) til alle aldersgrupper. Prøvetagning: Podepinden føres gennem næsen helt ind til nasopharynx og gnides mod bagvæggen. Podepinden afknækkes i transportmediet svarende til knækpunktet. Opbevaring: Forsendelse: Stuetemperatur. ESwab sendes i forsendelseshylster. Bør sendes samme dag prøven er taget. Svarafgivelse: 1-2 hverdage efter modtagelsen. P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

92 Side 92 af 158 Bemærkninger: Kighoste hos børn <2 år er anmeldelsespligtig. PCR kan pålideligt påvise kighostebakterier i ca. 4 uger efter symptomdebut. I senforløbet (dvs. efter 4 uger) af kighosteinfektion kan PCR blive negativ. Diagnosen kan da stilles med antistofpåvisning (se Bordetella pertussis antistoffer). Koncentrationsbestemmelse af antibiotika (NPU19779/NPU19867/NPU19919/NPU19929) Måling af antibiotikakoncentrationen i patienters serum eller andre væsker kan være indiceret i følgende tilfælde: 1. Risiko for toksiske bivirkninger 2. Kritiske niveauer for effekt 3. Risiko for underbehandling I princippet kan koncentrationen af alle antibiotika måles i serum eller andre væsker, men der er sjældent indikation for måling af andre antibiotika end aminoglykosider og glycopeptider. Der er tradition for at måle laveste værdi, C MIN (dal-værdien), for to klasser af antibiotika, nemlig aminoglykosider (gentamicin, netilmicin og tobramycin) og glycopeptider (vancomycin), da begge kan måles ved en kemisk metode på få timer. Målingen er uafhængig af om der gives andre antibiotika samtidig. Prøver til antibiotika koncentrationsmålinger tages bedst om morgen (kl. 8.00), så vil der foreligge et svar om eftermiddagen. Eventuelt før næste dosering. Analysen foretages af Klinisk Biokemisk Afdeling. Prøvemateriale: Minimum 2 ml vene/arterie blod. Dog kan et kapillærglas med blod fra børn også anvendes. Husk dato, klokkeslæt, og oplysninger om sidste dosisstørrelse samt tidspunkt. Analysen bestilles i labka. Aminoglykosider Initial dosering: Gentamicin: ~4-5 mg/kg Ved septisk shock kan dosis evt. øges til ~7 mg/kg Initial dosis gives per vægt, er uafhængig af nyrefunktion, men kun afhængig af patientens vandfase. Ved mistanke om svært usædvanlige væskeforhold, som f.eks. ved meget svær overvægt, ved cirrhose (+/- ascites) og lign., bør den initiale dosis ikke kun udregnes efter vægt. P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

93 Side 93 af 158 Aminoglykosider (gentamicin, netilmicin og tobramycin) er hurtigt baktericidt virkende, og særdeles egnede til kombination med f.eks. β-lactamantibiotikum i den empiriske behandling af sepsis, f.eks. i de første 1-3 døgn af behandlingen. Ved behandling med aminoglykosid ud over 3 døgn bør patienten revurderes mhp. infektionsfokus (herunder dyrkningsfund og resistensmønster) og S-koncentration måles mindst x 2 ugentlig. Effekten af aminoglykosider afhænger af, om man opnår en top-koncentration (C MAX), der er ca. 8 gange bakteriens MIC for aminoglykosider, ca. én gang i døgnet (PK-PDtabel på hjemmeside). Da de toksiske bivirkninger, nefro- og ototoksicitet, ses ved ophobning af aminoglykosider intracellulært i specifikke celler er det vigtigt, at behandlingsvarigheden med disse præparater er så kort som muligt, og at man ikke påbegynder en ny behandling før efter 28 dages pause. Man måler dal-værdier, C MIN, hvilket oplyser om ophobning af stofferne og dermed risiko for toksiske bivirkninger. Anbefalinger og justeringer: 1. Hvis ingen mistanke om væsentlig nyrepåvirkning er der ingen grund til koncentrationsmålinger hvis behandlingsperioden ikke overstiger 3 dage. Der gives samme dosis hver 24. time. 2. Ved påvirket nyrefunktion: blodprøve til koncentrationsmåling tages ca. 16 timer efter dosering, bedst om morgenen, svaret på denne måling forefindes inden næste dosis om eftermiddagen: S-gentamicin: < 0,5 µg/ml (efter ca. 16 timer): Samme dosis gives 24 timer efter sidste dosis. S-gentamicin: 0,5-1 µg/ml: Reducer dosis til ca. 50 %, som gives 24 timer efter sidste dosis. S-gentamicin: > 1 µg/ml: Seponer eller pauser behandlingen med aminoglykosider. Vancomycin Initial dosering: Vancomycin 1 g x 2, iv. dgl. Kan oftest gives uden at det er nødvendigt at måle serum koncentrationer. Vancomycin er et baktericidt virkende glycopeptid antibiotikum, der anvendes til behandling af infektioner forårsaget af Gram-positive bakterier. Effekten af glycopeptider er afhængig af at koncentrationen ikke falder under ca. 8 x MIC. Der er ingen korrelation mellem høje serum vancomycin værdier og nefrotoksiske bivirkninger. Måling af serum vancomycin udføres for at sikre patienten en optimal behandling, dvs. P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

94 Side 94 af 158 at serum vancomycin ikke falder til en værdi under 15 µg/ml. Laveste værdi (dal-værdien) dvs. umiddelbart inden næste dosering, bør være µg/ml. Anbefalinger og justeringer: 1. Måling af serum vancomycin foretages 2-3 gange ugentligt. Næste dosering af vancomycin bør ikke afvente svaret på målingen. 2. Dosis justeres efter måling af dalværdier ved mistanke om uhensigtsmæssigt niveau: S-vancomycin: >20 µg/ml (efter ca. 12 timer), dosis reduceres, eller dosisintervallet forlænges. S-vancomycin: < 15 µg/ml (efter ca. 12 timer), dosis øges, eller dosisintervallet forkortes. 3. Ved påvirket nyrefunktion, bør ikke anvendes flere nyretoksiske stoffer som f.eks. gentamicin, vancomycin og amphotericin B samtidig. Krim-Congovirus PCR (NPU27090) og antistof IgM, IgG (NPU53360) SP/Webreq: Undersøgelse: Crimean Congo hemerrhagic fever virus DNA/RNA IgG og IgM antistof. Materiale: blod (EDTA-glas) eller serum eller koagelblod. Lassa Virus PCR og antistof IgM, IgG (NPU54040/NPU54039) Der skelnes mellem mistanke om akut infektion og serologi til afklaring af overstået infektion SP/Webreq: Kan kun bestilles på hospital. Undersøgelse: Arena virus. Materiale: akut infektion: blod tilsat SSIs blå inaktiverings medie, kontakt vagthavende SSI tlf eller Serologi: serum koagel blod eller blod i EDTA glas Legionella DNA (52010) P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

95 Side 95 af 158 Denne undersøgelse indgår i den samlede undersøgelse: pneumoniudredning (atypisk pneumoni) på luftvejssekreter, der er en samlet PCR-undersøgelse for legionella, mycoplasma pneumoniae, chlamydophila pneumoniae og chlamydiai psitacci. Princip: Indikation: Prøvemateriale: Påvisning af DNA fra L. pneumophila (alle serogrupper) og andre Legionella arter ved hjælp af amplifikatons (genforstærknings) teknik (polymerase chain reaction, PCR). Klinisk mistanke om Legionella infektion, herunder pneumoni hos: Immunsupprimeret patient Patient hjemvendt fra udlandsrejse Patienter, som ikke responderer på behandling med belaktamantibiotika. Sekret fra de dybe luftveje, ekspektorat, trakealsekret eller bronkialskyllevæske (BAL). SP/Webreq: Undersøgelse: Pneumoni-udredning (atypisk pneumoni). Materiale: trakealsekret, ekspektorat, Bronkoalveolær lavage (BAL), bronkialsekret bronkoskopisk ophentet. Tidspunkt for prøvetagning: Utensilier: Prøvetagning: Så tidligt i sygdomsforløbet som muligt, gerne inden antibiotisk behandling iværksættes. Ekspektorat dåse. Trakealsugesæt eller sterilt spidsglas. Som ved almindelig bakteriologisk undersøgelse. Prøvemængde: Mindst 1 ml sekret. Opbevaring: Forsendelse: I køleskab (4-8 C). Evt. i kølekasse. Ved forsendelse med postvæsenet anvendes forsendelseshylster. Svarafgivelse: Undersøgelsen udføres dagligt og 1 gang hver weekend. I sjældne tilfælde indeholder prøverne faktorer, der hæmmer amplifikationsprocessen. Resultatet besvares i så fald som: Prøven ubedømmelig som følge af hæmning. Tolkning: Sensitiviteten af undersøgelsen afhænger af prøvematerialets egnethed. Et negativt svar udelukker derfor ikke infektion, og hvis mistanken om Legionella infektion opretholdes, kan undersøgelsen gentages med optimal prøvetagningsteknik, trakealsug eller BAL. P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

96 Side 96 af 158 Bemærkninger: PCR-analysen bør suppleres med undersøgelse for L. pneumophila antigen i urinen. Legionella infektion er anmeldelsespligtig. Legionella pneumophila (LUT) og pneumokok antigener (PUT) (53300) Princip: Indikation: Prøvemateriale: Påvisning af lipopolysakkarid (LPS) antigen fra L. pneumophila serogruppe 1 i urin med immunkromatografisk metode. Klinisk mistanke om Legionellainfektion, herunder pneumoni hos immunsupprimeret patient eller hos patient efter nylig udlandsrejse. Urin (gerne morgenurin). SP/Webreq: Undersøgelse: Legionella pneumophila antigen i urin (LUT). Materiale: Urin Sundhedsplatformen: Bestilles i best/ord, Søgeord; LUT Vælge herefter Herlev hospital og prøve kategori; urin. Udfyldt alle relevante felter og signer. Gå til opgavelisten og print PTB. Tidspunkt for prøvetagning: Så tidligt som muligt i sygdomsforløbet, evt. gentaget efter 1-2 dage. Utensilier: Prøvetagning: Urinprøvesæt eller sterilt spidsglas. Midtstråleteknik. Prøvemængde: 1-5 ml urin. Opbevaring: I køleskab (4-8 C). Forsendelse: Evt. i kølekasse. Ved forsendelse med postvæsenet anvendes forsendelseshylster. Svarafgivelse: Prøven analyseres og besvares samme dag. I weekenden udføres analysen i dagarbejdstiden. Resultatet angives som negativt eller positivt. P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

97 Side 97 af 158 Tolkning: Legionella LPS-antigen udskilles i urinen allerede få dage efter sygdomsdebut. Et negativt svar udelukker ikke Legionellainfektion, da analysen kun med sikkerhed påviser LPS fra L. pneumophila serogruppe 1 og ikke andre serogrupper eller Legionella arter, som også kan give livstruende infektion. Ligeledes kan et negativt svar initialt i sygdomsforløbet skyldes forsinket antigenudskillelse, hvorfor undersøgelsen foreslås gentaget efter 1-2 dage, hvis mistanke om Legionella-infektion fastholdes. Bemærkninger: Undersøgelse for L. pneumophila antigen i urinen bør suppleres med undersøgelse af luftvejssekret med Legionella PCR som detekterer DNA fra alle serogrupper af L. pneumophila og alle Legionella arter. Bestilles som pneumoni-udredning (atypisk pneumoni) Legionella pneumophila antistof (LAT) (NPU14591) Denne undersøgelse anbefales erstattet af en PCR-analyse, der er langt mere sensitiv og specifik ved akut sygdom. Send i stedet luftvejssekret til PCR for pneumoniudredning (atypisk-pneumoni) Princip: Indikation: Påvisning af IgM antistoffer mod legionella pneumophila type 1 og type 3 med immunkromatografisk teknik Længerevarende luftvejssymptomer > 2 uger, hvor der er mistanke om legionella infektion SP/Webreq: Undersøgelse: legionella pneumophila antistof (LAT). Materiale: serum eller koagelblod Tidspunkt for prøvetagning: Tolkning: Tidligst 2 uger efter mistanke om legionella infektion. Svaret udgives som positiv eller negative. Positiv prøve tyder på nylig infektion med legionella pneumophile type 1 eller 3. Testen detekterer ikke antistoffer mod andre legionella typer. Ved negativ prøve og fortsat mistanke, kan prøven gentages efter en uge. Leishmania arter antistof (NPU58288) P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

98 Side 98 af 158 SP/Webreq: Kan kun bestilles på hospital. Undersøgelse: leishmania antistof. Materiale: serum eller koagelblod Leptospira DNA/RNA (SSI00065/12102) SP/Webreq: Undersøgelse: leptospira DNA/RNA. Materiale: Blod (EDTA-glas), blod (bloddyrkningskolbe), spinalvæske eller urin midtstråle. Leptospira antistof (Weil) (NPU12657) SP/Webreq: Undersøgelse: leptospira antistof. Materiale: serum eller koagelblod Luftvejsvirus udvidet DNA/RNA (33057) Princip: Indikation: Påvisning af RSV og influenza A og B, Parainfluenzavirus (1-4), humant Metapneumovirus (hmpv), Rhino/enterovirus, Parechovirus Adenovirus, med amplifikationsteknik (PCR). Udvidet undersøgelse ved særlig indikation (): Indikation for udvidet undersøgelse: immunsuppression og/eller kronisk lungesygdom og/eller svær respirationsvejspåvirkning Se i øvrigt Influenza (A&B) og RS-virus DNA/RNA (52050) Alle de nævnte vira kan give øvre eller nedre luftvejsinfektion. RSV ses hos børn <2 år med hoste og hvæsende respiration, dyspnø og takypnø, immunsupprimerede patienter og patienter i risiko for alvorlig influenza med nedre luftvejsinfektion. Hyppigst vinter og tidligt forår. Influenza A og B ses ved pludselig temperaturstigning ledsaget af kulderystelser, muskelsmerter, hovedpine, hoste og forkølelsessymptomer. Hyppigst i vinterhalvåret. Parainfluenzavirus ses hyppigst forår og efterår, hmpv i vinterhalvåret, Rhinovirus især sensommer og efterår. P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

99 Side 99 af 158 Alle respirationsvejsvirus kan give bronchioloitis hos børn. Adenovirus kan være årsag til svær pneumoni, især hos immunsupprimerede patienter, undertiden ledsaget af hepatitis. Adenovirus er desuden hyppig årsag til svær, ofte purulent, konjunktivit. Enterovirus kan udover luftvejsinfektion forsage meningitis, som især hos nyfødte og små børn kan være alvorlig. Prøvemateriale: Sekret fra nasopharynx, trakealsekret, BAL, svælgpodning. Ønskes udvidet undersøgelse, kan dette udføres på samme prøvemateriale. SP/Webreq: Undersøgelse: luftvejsvirus DNA/RNA eller udvidet luftvejsvirus. Materiale: bronkialsekret bronkoskopisk ophentet, bronkoalveolær lavage (BAL), ekspektorat, nasopharynxsekret, podning eller trakealsekret. Tidspunkt for prøvetagning: Utensilier: Så tidligt som muligt i den akutte sygdomsfase. Trakealsugesæt. Kateter til sugning nr. 6 eller 8. Sterilt, isotonisk saltvand. eswab Prøvetagning: Nasopharynxsug: Kateteret føres gennem næse til nederste del af pharynx. Der suges samtidig med, at katetret trækkes langsomt tilbage. Til slut suges et par ml sterilt fysiologisk saltvand igennem katetret. Trakealsug og BAL. Podning fra svælg eller nasopharynx: Podepinden føres gennem mund eller næsehule til bagsiden af svælg eller næsesvælgrum, hvorefter der gnides med podepinden mod slimhinden. Podepind kommes efterfølgende i E-swabmediet. Prøvemængde: Ca. 2 ml. Opbevaring: Forsendelse: I køleskab (4-8 C). Kort transporttid bør sikres. Forsendelsen bør ske i kølekasse. Ved transport med postvæsenet anvendes forsendelseshylster. Svarafgivelse: Svar afgives løbende Svartid max 5 timer, ofte hurtigere. Sidste ankomsttid for at få svar samme dag: Hverdage 17:30, weekender 16:30. Ellers er der svar næste morgen på prøver, der kommer ved 19-tiden. Enterovirus 1-2 hverdage efter modtagelsen i KMA. Tolkning: Positivt svar kan anvendes som: P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

100 Side 100 af 158 Beslutning om isolation af inficerede patienter (Influenza A/B og RSV). Ætiologisk udredning. Malaria (NPU21598) Princip: Indikation: Mikroskopisk undersøgelse for malariaparasitter. Immunkromatografisk undersøgelse. Patienter mistænkt for malaria skal henvises til prøvetagning på hospital. Den immunkromatiske undersøgelse kan ikke stå alene, og er kun et supplement til mikroskopien. Akut undersøgelse: Feber (kontinuerlig, intermitterende eller periodisk), hovedpine, influenzalignende symptomer, evt. diaré eller opkastninger, samt trombocytopeni efter rejse eller ophold i troperne, hvis det er mindre end 3 måneder siden man har forladt malariaområdet, og især hvis man har været i tropisk Afrika. Anæmi, trombocytopeni og splenomegali hos en person med etnisk baggrund fra lande med endemisk malaria. Prøvemateriale: Perifert blod i gelglas (2 udstrygningspræparater og 2 dråbepræparater). Blodprøve i EDTA-glas. SP/Webreq: Kan kun bestilles på hospital. Undersøgelse: plasmodium (mikroskopi) (malaria?) Materiale: pakke (udstrygning og dråbepræparat, husk også EDTAblod) Sundhedsplatformen: Bestilles i best/ord Søgeord; malaria eller plasmodium (være opmærksom på at du er inde i fanebladet; installationslisten) Vælg; Plasmodium (malaria); B(kB) (21598) Udfyld relevant felter og signer Tidspunkt for prøvetagning: Utensilier: Så snart diagnosen mistænkes, en gang dagligt i tre dage. Engangslancet. P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

101 Side 101 af støvfri, rensede objektglas uden ridser og fingeraftryk, med slebne kanter og matteret skrivefelt. Et objektglas med afskårne hjørner til udstrygning. Forsendelsesetui til objektglas. EDTA-glas, minimum 3 ml og blodprøvetagningsudstyr. Prøvetagning: Kvaliteten af præparaterne er helt afgørende for den mikroskopiske undersøgelse. Vejledningen skal derfor følges omhyggeligt. Blod tilsat antikoagulans eller koaguleret fuldblod er ikke egnet til malariamikroskopi. Rekvisitionsnummer anføres med blyant i skrivefeltet på objektglasset. Der skal kun anvendes én rekvisition til de 4 præparater. Huden desinficeres og lufttørres inden punkturen. Med engangslancet prikkes i øreflippen eller lateralt på fingerens yderstykke mellem neglevold og pulpa. Hos små børn kan hælen også anvendes. Første bloddråbe aftørres. Der fremstilles herefter 2 dråbepræparater og 2 udstrygningspræparater: Dråbepræparater: Midt på 2 objektglas anbringes en bloddråbe, der straks spredes med lancetten til et kvadrat på ca. 1 cm 2. Den spredte bloddråbe skal have en tykkelse, så trykt skrift lige netop kan læses igennem præparatet. Udstrygningspræparater: En lille blodmængde opsamles midt på den korte ende af et slebet objektglas med afskårne hjørner. Dette glas bringes i kontakt med præparatglasset i en vinkel på 45, nær den matterede del og således at blodet befinder sig i vinklen mellem de to glas. Vent til dråben har bredt sig til de afskårne hjørner på udstrygnings -objektglasset og udstryg herefter med en jævn, glidende bevægelse. Udstrygningspræparatet skal være tyndt og må ikke nå ud til objektglassets kanter. Blod i EDTA-glas tages på vanlig vis. Emballering: Bemærkning: Opbevaring: Forsendelse: Både dråbe- og udstrygningspræparaterne tørres støvfrit i vandret stilling, før de anbringes i forsendelsesetui, og sendes samtidig med EDTA-glas med blod. Rejseanamnese og evt. malariaprofylakse skal altid angives. Stuetemperatur. Ved akut undersøgelse skal dette ske efter forudgående aftale med vagthavende læge på KMA. Præparaterne, inklusive EDTA-glas, sendes først når såvel udstrygnings- som dråbepræparaterne er helt tørre. Svarafgivelse: Akutte prøver samt positive fund besvares straks telefonisk til en autoriseret patientansvarlig medarbejder. P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

102 Side 102 af 158 Tolkning: Under behandlingen af falciparum malaria skal parasitæmigraden følges dagligt, til negative udstryg foreligger, og igen 7 dage efter behandlingsstart. Klinisk bedring og fald i parasitæmien indtræder sædvanligvis i løbet af behandlingsdøgn. Manglende fald i parasitæmigraden inden for de første døgn eller forekomst af trofozoitter på 7. dagen efter behandlingsstart er ensbetydende med behandlingsresistens, også selv om patienten er velbefindende. Derimod er forekomst af gametocytter på 7. dagen ikke udtryk for resistens. Parasitæmigraden skal ikke følges ved benign malaria, og disse patienter kan udskrives, så snart den kliniske tilstand tillader det. Ved infektion med P. vivax eller P. ovale følges behandlingen op med primakin til behandling af leverfasen i alt 14 dage. Fund af andre blodparasitter i dråbe- eller udstrygningspræparaterne (filaria, trypanosomer, babesia, leishmania) vil også blive meddelt. Hvis malariaundersøgelsen er negativ, og der fortsat er mistanke, må undersøgelsen gentages de 2 følgende dage. Marburg Virus DNA/RNA (NPU27102) IgG og IgM antistof (NPU53363) Ved mistanke om akut hæmorrhagisk feber, tages to prøver en til serologi og en til PCR. Prøven til serologien opbevares under rette sikkerhedsforanstaltninger på hospitalsafdelingerne på køl indtil resultatet på PCR-analysen foreligger. Ved negativ PCR, indsendes denne prøve til test for overstået infektion. Prøven til PCR tilsættes blå inaktiveringsbuffer (se ovenfor) og sendes samme dag. Kan prøven ikke sendes samme dag, skal den opbevares op køl (2 8 C) og sendes hurtigst muligt. Her testes for akut Ebola hæmorrhagisk feber. SP/Webreq: Kan kun bestilles på hospital. Undersøgelse: Marburg virus DNA/RNA, IgG og IgM antistof. Materiale: PCR: blod tilsat SSIs blå inaktiverinsmedie, kontakt vagthavende SSI tlf eller Serologi: serum koagel blod eller blod i EDTA-glas Meningitis PCR (Pneumo- og meningokokker DNA/RNA) (12106) Princip: Påvisning af neisseria meningitidis, streptococcus pneumoniae og haemophilus influenzae med amplifikationsteknik (PCR). P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

103 Side 103 af 158 Indikation: Prøvemateriale: Mistanke om akut bakteriel meningitis, specielt hvis patienten har fået antibiotika forud for prøvetagningen. Spinalvæske i sterilt spidsglas SP/Webreq: Kan kun bestilles på hospital Bestilles i best/ord Søgeord; Vælg; Pneumo- og meningokokker DNA/RNA (bestillingsnr ) Udfyld relevant felter og signer Tidspunkt for prøvetagning: Utensilier: Prøvetagning: Opbevaring: Tidligst muligt i sygdomsforløbet. Sterilt spidsglas med skruelåg Spinalvæsken tages som vanligt. I køleskab ved 4-8 C indtil forsendelse. Svarafgivelse: Køres på alle hverdage, svaret afgives som et kvalitativt svar med DNA for neisseria meningitidis, streptococcus pneumoniae og haemophilus influenzae påvist eller ikke påvist Tolkning: Ved Blodtilblanding af SPV kan der forekomme DNA fra bakterier i SPV, som stammer fra blodtilblandingen. Sensitiviteten af PCR er størst tidligt i sygdomsforløbet. Meningokok antistoffer (MAT) (NPU02891) SP/Webreq: Undersøgelse: neisseria menningitidis antistof (MAT) Materiale: serum eller koagelblod Sundhedsplatformen: Bestilles i best/ord Søgeord; neisseria (være opmærksom på at du er inde i fanebladet; installationslisten) Vælg; Neisseria meningitidis-ab; P (NPU02891) P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

104 Udfyld relevant felter og signer Side 104 af 158 Morbillivirus IgM og IgG antistof (NPU14920) Se Hvidovre Hospitals prøvevejledning SP/Webreq: Undersøgelse: Morbilli virus IgM og IgG antistof (sygdom?) Materiale: Blod (EDTA-glas), blod (bloddyrkningskolbe), spinalvæske eller urin midtstråle. Morbillivirus DNA (NPU18830/NPU18832/32015) SP/Webreq: Undersøgelse: morbilli virus DNA/RNA (mæslinger) Materiale: Blod (EDTA-glas), serum eller koagelblod, podning, spinalvæske eller urin. Ved stærk klinisk mistanke om akut morbilli skal svælgpodning og urin sendes akut med taxa til SSI efter aftale med virologisk vagthavende på SSI tlf Der sendes også serum til morbilli IgG og IgM MRSA (meticillinresistente S. aureus) (12128/10122) Princip: Indikation: Prøvemateriale: Undersøgelse for MRSA. Prøven opformeres i et særligt medium, inden udsåning på screeningsplader. Almindelige følsomme bakterier vil ikke blive påvist ved denne metode. Ønskes dyrkning for almindelige følsomme bakterier sendes podning til almindelig dyrkning og resistens Se MRSA, hygiejnehåndbog på VIP-portalen Podning fra næse, svælg, perineum. Hvis relevant endvidere podning fra sår/bylder, eksem eller psoriasis, intravenøse indstikssteder, perkutane sonder, drænsteder, Urin, hvis pt. Har urinvejskateter, trakealsekret hvis patienten er intuberet, stomi ved hudniveau. P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

105 Side 105 af 158 SP/Webreq: Under undersøgelse: vælg: staphylococcus aureus (MRSA) (dyrkning) eller staphylococcus aureus (MRSA) PCR. Hvis der bestilles PCR laves også dyrkning. Der skal kun bestilles PCR, hvis det har en isolationsmæssig konsekvens for patienten. Materiale vælg: podning FRA næse, svælg og perineum Kan også bestilles som pakke vælg: MRSA-screening. Det er vigtigt for tolkning af svaret at feltet om antibiotika er udfyldt rigtigt. Tidspunkt for prøvetagning: Utensilier: Prøvetagning: Før antibiotisk behandling startes. eswab med podepind. Næse: Podepinden føres gennem det yderste af næsen (cavum nasi) 0,5 1 cm op. Podepinden drejes rundt mod indersiden af begge næsefløje, 5-6 gange, samtidig med at et fast tryk opretholdes. Samme podepind bruges til begge næsebor: Svælg: Podepinden føres henover begge tonsiller med et let tryk Perineum: Podepinden føres henover perineum med et fast tryk. Det er vigtigt at der specifikt bedes om MRSA Opbevaring: Forsendelse: I køleskab (4-8 C). Evt. i kølekasse. Ved forsendelse med postvæsenet anvendes forsendelseshylster. Svarafgivelse: Der må påregnes en svartid på op til 2-4 hverdage efter prøvens modtagelse i KMA Patienter negative med hurtigtest (PCR) for alle indsendte prøver kan afisoleres. Patienter positive for hurtigtest forbliver i isolation. Tolkning: Svaret afgives som vækst/ikke vækst af MRSA. Patienter der har fået antibiotika indenfor den sidste uge inden prøvetagning kan udkomme med falsk negativt dyrkningssvar. Ved vækst af MRSA påføres svaret en resistensbestemmelse. Ved vækst af MRSA vil KMA kontakte rekvirenten med henblik på opfølgning. For hurtigtest svares MRSA påvist/ikke påvist. Der kan i enkelte tilfælde være uoverensstemmelse mellem hurtigtest og dyrkningssvar. I så fald vil dyrkningssvaret være gældende medmindre prøven er taget under antibiotisk behandling. Bemærkninger: Se i øvrigt MRSA, hygiejnehåndbogen, VIP portalen. Link til MRSA, hygiejnehåndbog og sundhedsstyrelsens MRSA vejledning Link til Sundhedsstyrelsens MRSA vejledning MRSA er anmeldelsespligtig. Hvis prøven er positiv for MRSA vil anmeldelsespapirer blive tilsendt fra KMA. P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

106 Side 106 af 158 For særligt udvalgte afdelinger kan undersøgelse for MRSA udføres med PCR teknik. Til denne analyse kræves podning med eswab fra lokalisationer som beskrevet ovenfor. Resultat af analysen besvares som negativt, positiv eller ubedømmeligt og efterfølges altid af en dyrkning for MRSA. Ved ubedømmeligt resultat eller uoverensstemmelse mellem PCR-resultat og dyrkning, som kan forekomme i sjældne tilfælde, må KMA kontaktes for at træffe nærmere aftale om infektionshygiejniske forholdsregler. Mycobacterium (TB) (mikroskopi, PCR og dyrkning) (11601) Princip: Indikation: Prøvemateriale: Påvisning af Mycobakteriearter, herunder M. tuberculosis ved hjælp af specialfarvning, PCR og dyrkning Mistanke om infektion med M. tuberculosis eller andre Mycobacterium arter (se dog bemærkninger under tolkning) Sekret fra nedre luftveje frembragt ved hoste eller sug fra trakea eller bronkier Sundhedsplatformen: bestilles i best/ord Søgeord: TB Vælg Mycobacterium (TB) (mikroskopi for PCR og dyrkning) (11601) Vælg Herlev Vælg prøvemateriale Udfyld alle relevante felter og signer Gå til opgavelisten og print PTB Påsæt label fra PTB samt alm. patientlabel på prøven Tidspunkt for prøvetagning: Utensilier: Prøvetagning: Før antibiotisk behandling startes. Ekspektorat dåse og forsendelsescontainer (bestilles på to forskellige varenumre) eller trakealsugesæt Ekspektorat: Patienten bør instrueres nøje mhp. at opnå egnet materiale. Før prøvetagningen skal munden skylles for evt. madrester. Patienten bør sidde oprejst i sengen eller være stående. Lungerne fyldes med luft og tømmes i et drag, idet der hostes så dybt som muligt, og ekspektoratet spyttes ud i den sterile inderskål. Er mængden utilstrækkelig, kan proceduren gentages eller trakealsugning benyttes. P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

107 Side 107 af 158 Trakeal- og bronkialsug: Sekretet ophentes ved sugning med kateter fra trakea eller gennem bronkoskop. Det anbefales, at prøvetageren anvender mundbind og sterile handsker. Det er væsentligt at suge kateteret "kinkes" under indføring og udtagning, således at der udelukkende suges i selve trakea/bronkier. Trakealtubesekret: For at mindske kontaminationen med bakterier fra tuben skal denne suges ren for sekret og evt. efterskylles med sterilt vand. Et nyt sterilt sugekateter nedføres, så spidsen ligger nedenfor tuben, hvorefter der suges. Viskøse sekreter kan løsnes ved at manipulere kateteret, så der udløses en hosterefleks. Emballering: Opbevaring: Forsendelse: Ekspektorat: Låget på den sterile inderskål skrues fast, hvorefter inderskålen anbringes i forsendelsescontaineren med tryklåg. Trakeal- og bronkialsug: Ingen særlige krav. I køleskab (4-8 C). Om muligt i kølekasse. Forsendelsescontaineren til ekspektorat er godkendt til postforsendelse Svarafgivelse: Prøven mikroskoperes alle hverdage samt lørdag og søndag i dagarbejdstiden og besvares som negativ eller positiv. Tolkning: Positivt fund indikerer tilstedeværelse af Mycobacterium species. Negativt fund udelukker ikke infektion med Mycobacterium spp. Bemærkninger: Undersøgelse foregår på SSI og omfatter både mikroskopi med auraminfarvning, PCR-undersøgelse og dyrkning. Multiresistente bakterier ved udlandsrejser og hospitaler se Udlandsscreening, screening for (multi-) resistente bakterier P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

108 Side 108 af 158 Mycoplasma pneumoniae IgG og IgM antistof (NPU02853) Se Hvidovre Hospitals prøvevejledning Denne undersøgelse anbefales erstattet af en PCR-analyse, der er langt mere sensitiv og specifik ved akut sygdom. Send i stedet halspodning i eswab medie til komb. us. (chlamydophila- og mycoplasma pneumoniae DNA/RNA) eller luftvejssekret til PCR for pneumoni-udredning (atypisk- pneumoni). SP/Webreq: Undersøgelse: mycoplasma pneumoniae IgG og IgM antistof (sygdom?) Materiale: Serum eller koagelblod. Mycoplasma pneu. DNA/Chlamydophila pneumoniae DNA (52010) Denne undersøgelse indgår også i den samlede undersøgelse: pneumoniudrening (atypisk pneumoni) på luftvejssekreter, der er en samlet PCR-undersøgelse for legionella, mycoplasma pneumoniae, chlamydophila pneumoniae og chlamydiai psitacci. Princip: Indikation: Prøvemateriale: Påvisning af Mycoplasma pneumoniae og chlamydophila pneumoniae DNA med PCR-teknik. Atypisk pneumoni. Langvarig hoste. Podemateriale fra svælget Ekspektorat Trakealsekret BAL Nasopharynxsug SP/Webreq: Afhængig af materiale: Undersøgelse: Pneumoniudredning (atypisk pneumoni) Materiale: podning Lokalisation: Næsesvælgrum(nasopharynx) Eller Materiale: trachealsekret, ekspektorat, Bronkoalveolær lavage (BAL), bronkialsekret bronkoskopisk ophentet, Tidspunkt for prøvetagning: Tidligst muligt i sygdomsforløbet. P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

109 Side 109 af 158 Utensilier: Prøvetagning: eswab, Ekspektorat dåse i forsendelsescontainer eller trakealsugesæt. Podepinden gnides mod slimhinden i svælget, optimalt nasopharynx, hvorefter den afknækkes i transportmediet svarende til knækpunktet. Ekspektorat, trakealsekret eller BAL tages som beskrevet eller BAL. Opbevaring: I køleskab ved 4-8 C. Forsendelse: eswab fremsendes i forsendelseshylster. Ekspektorat fremsendes i dåse med tilsvarende forsendelsescontainer. Trakealsekret og BAL i sterilt spidsglas i transporthylster. Luftvejssekret fremsendes om muligt i kølekasse. Svarafgivelse: 1-2 hverdage efter modtagelsen af prøven. Bemærkninger: Infektion med Mycoplasma pneumoniae er næsten altid selvlimiterende. Relevant antibiotisk behandling (makrolid) kan dog afkorte sygdomsvarigheden og (måske) reducere smittespredning. Analysen udføres altid i kombination med chlamydophila pneumoniae DNA/RNA. Se denne. Mykobakterier atypiske PCR (kan udføres på mikroskopipositive og ekspektorater) Er led i standardundersøgelsen for Mykobakterier (TB) (mikroskopi, PCR og dyrkning) Mycoplasma genitalium DNA/RNA (12510) Princip: Indikation: Prøvemateriale: Påvisning af Mycoplasma genitalium ved hjælp af PCR-teknik Symptomer på urethit eller cervicit, hvor undersøgelse for Chlamydia trachomatis og Neisseria gonorrhoea har været negativ. Podning fra cervix og/eller urethra, first-void urin SP/Webreq: Undersøgelse: Mycoplasma genitalium DNA/ Materiale: podning eller urin. Samt evt. lokalisation. P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

110 Side 110 af 158 Utensilier: Til cervix og urethrapodning anvendes APTIMA Unisex Speciment collection kit med podepind og transportmedium, og til urin anvendes urinprøvetagningssæt, APTIMA Urine Speciment collection kit og transporthylster. Opbevaring: Forsendelse: ved stuetemperatur Ved stuetemperatur, ved postforsendelse anvendes transporthylster Svarafgivelse: Undersøgelsen udføres dagligt besvares samme dag. Tolkning: Svar angives som Mycoplasma genitalium påvist eller ikke påvist. Bemærkninger: Ved fund af M. genitalium suppleres undersøgelsen med en PCR-metode til påvisning af makrolidresistens. Resultatet af denne undersøgelse har betydning for valg af behandling, idet resistens indebærer, at standard behandling med azithromycin er uvirksom. Alternativt behandlingsforslag er moxifloxacin 400 mg x 1 i 7 dage. Mycoplasma hominis DNA (12505/NPU29537) Prøvemateriale: EDTA-blod (5 ml) biopsi i E-swab medie eller i sterilt spidsglas med lidt isotonisk saltvand i bunden Pus Spinalvæske i sterilt spidsglas Ledvæske i sterilt spidsglas Mæslinger, se Morbillivirus DNA Neisseria gonorrhoeae (gonokokker)(dyrkning) (10200) Princip: Indikation: Dyrkning for Neisseria gonorrhoeae samt følsomhedsbestemmelse. Mænd: Udflåd fra urethra, dysuri Kvinder: Øget eller ændret vaginalt udflåd, smerter i bækken-regionen, dysuri, pletblødning og metrrhagia. Analudflåd eller perianale smerer (rektal gonoré). Øjenbetændelse hos nyfødte < 1 måned. Smitte og kontaktopsporing (30-50 % asymptomatiske). Prøve- P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

111 Side 111 af 158 materiale: Podning fra urethra, svælg og rectum. Kvinder podes desuden fra endocervix. Nyfødte podes kun fra øjne. SP/Webreq: Undersøgelse: Neisseria gonorrhoeae (gonokokker)(dyrkning) Materiale: podning Vælg lokalisation. Tidspunkt for prøvetagning: Utensilier: Inden antibiotisk behandling påbegyndes. eswab Vatpind, hvid. Prøvetagning: Urethra: Der bør gå mindst 1 time efter sidste vandladning. Er der ikke synligt pus, indføres podepinden hos mænd 2-3 cm i urethra og roteres mod slimhinden i 5-10 sekunder. Hos kvinder trykkes urethra mod symfysen, og der anvendes samme teknik. Svælg: Der podes fra tonsiller og pharynx posterior. Rectum: Podepinden føres 3 cm ind i analkanalen og roteres i 10 sekunder. Ved fækal kontamination kasseres podepinden, og proceduren gentages. Cervix: Podepinden føres 2 cm ind i cervikalkanalen og roteres forsigtigt fra side til side i 5-10 sekunder. Det er vigtigt, at podepinden ikke kommer i berøring med vaginalslimhinden. Øjne: Pus eksprimeres til mediale øjenkrog og opsamles på podepind, uden at huden berøres. Ved fravær af pus skrabes indersiden af nedre øjenlåg med en hvid podepind. Opbevaring: Forsendelse: I køleskab (4-8 C). Da bakterien er meget sart, skal prøven være KMA i hænde senest et døgn efter prøvetagning. Ved forsendelse med postvæsenet sendes i forsendelseshylster. Må ikke indsendes fredage eller op til en helligdag. Svarafgivelse: Foreløbigt svar afgives et døgn efter modtagelse af prøven. Slutsvar afgives efter 2-5 døgn. Prøver med vækst af gonokokker besvares telefonisk. Bemærkninger: Svælggonoré er sædvanlig asymptomatisk, men podning fra svælg hører med i udredningen og har behandlingsmæssig konsekvens. N. gonorrhoeae kan påvises samtidig med Chlamydia trachomatis ved genamplifikation. Dyrkning og resistensbestemmelse for N. gonorrhoeae er dog fortsat vigtig for at kunne vælge den rigtige behandling og bør altid foretages ved positivt resultat. P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

112 Side 112 af 158 Neisseria meningitidis antistof (MAT), se Meningokok antistoffer Non-gonorrhoisk, non-chlamydia urethrit/cervicit Analysen udgår, idet den splittes op i 3 delanalyser: Mycoplasma genitalum DNA/RNA, Ureaplasma urealyticum og Ureaplasma parvum (DNA) og Mycoplasma hominis DNA. Norovirus, se Gastroenteritis, diagnostik Orm, æg og cyster, se Gastroenteritis, diagnostik Orm (identifikation) (41007) Princip: indsendelse af orm og larver fundet i afføring eller hudpustler til identifikation. SP/Webreq: Undersøgelse: orm (identifikation) Materiale: orm P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

113 Side 113 af 158 Parechovirus, se Enterovirus IgM Parotitisvirus IgG antisstof (immunstatus) (NPU03952) Se Hvidovre Hospitals prøvevejledning SP/Webreq: Undersøgelse: Parotitisvirus IgG antistof (immunstatus) Materiale: Serum eller koagelblod. Parotitisvirus IgM og IgG antistof (NPU17128) Se Hvidovre Hospitals prøvevejledning SP/Webreq: Undersøgelse: parotitisvirus IgM og IgG antistof (sygdom?) Materiale: serum eller koagelblod Parotitisvirus DNA/RNA (NPU28710/NPU28711/32118) SP/Webreq: Undersøgelse: parotitisvirus DNA/RNA Materiale: blod (EDTA-glas), serum eller koagelblod, podning, spinalvæske eller urin. Samt evt. lokalisation Parvovirus B-19 IgM og IgG antistof (NPU58175) Princip: Påvisning af IgM og IgG antistoffer mod parvovirus B-19 med CLIA chemoluminescens immunoassay hhv. Sandwich og indirekte CLIA. Indikation: Mistanke om akut infektion med parvovirus B-19 (erythema infectiosum/lussingesyge), specielt hos gravide med udslæt. Bestemmelse af immunstatus, fx hos gravide, der har været eksponeret for smitte. Udredning i forbindelse med artraligier og anæmitilstande. Akut hepatitis, hvor andre mere hyppige årsager ikke har kunnet påvises. P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

114 Side 114 af 158 Prøvemateriale: Blod (serum) uden tilsætning. SP/Webreq: Undersøgelse: Parvovirus B19 IgM og IgG antistof (sygdom?) Materiale: serum eller koagelblod. Sundhedsplatformen: Bestilles i best/ord. Søgeord; parvovirus (være opmærksom på at du er inde i fanebladet; installationslisten) Vælg; parvovirus-b19-antistof; P (NPU 14061) Udfyld relevant felter og signer. Gå til opgavelisten og print PTB Tidspunkt for prøvetagning: Så tidligt som muligt, evt. efterfulgt af ny undersøgelse efter 1-2 uger. Utensilier: Prøvetagning: Tørglas. Venepunktur. Prøvemængde: 4-5 ml blod (2 ml serum). Minimum 0,6 ml bl od (0,3 ml serum). Opbevaring: Forsendelse: I køleskab (4-8 C). Evt. i kølekasse. Ved forsendelse med postvæsenet anvendes forsendelseshylster. Svarafgivelse: Der må påregnes en svartid på op til 3 hverdage efter prøvens modtagelse i KMA. Tolkning: Parvovirus IgM Parvovirus IgG Tolkning Negativ < 0,9 Negativ < 0,9 Ingen tidligere infektion (ikke immun) eller nyligt smittet Mulig akut infektion Positiv Negativ/positiv Se også bemærkninger nedenfor 1,1 <0,9/ 1,1 Negativ < 0,9 Positiv 1,1 Tidligere infektion (immun) P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

115 Side 115 af 158 Bemærkninger: Ved kombinationen positiv/grænseværdi IgM og negativ IgG anbefales ny blodprøve til antistofbestemmelse efter 2 uger. Specielt for gravide: ved lav positiv IgM ( 1,1 og < 10) og positiv IgG, som kan skyldes uspecifik (falsk positiv) IgM, anbefales ny blodprøve til parvovirus DNA/RNA (EDTA-glas) for at udelukke akut infektion, og ny antistofbestemmelse efter 2 uger. Ved høj positiv IgM ( 10) og positiv IgG skal patienten betragtes som havende en akut parvovirus infektion og henvises til fødestedet mhp løbende ultralydskontrol i graviditeten. Udslæt hos gravide bør altid medføre undersøgelse for både parvovirus og rubellavirus, også selvom der er påvist IgM antistoffer mod parvovirus, idet der kan være tale om enten krydsreaktion eller dobbeltinfektion. Hos immunsupprimerede med parvovirusinfektion kan antistofrespons mangle, og undersøgelse for antistoffer bør suppleres med blodprøve (EDTA-blod) for parvovirus DNA/RNA. Parvovirus DNA/RNA (NPU58172(CSV)/NPU58171(EDTA)/32120(Andet)) Se Rigshospitalets prøvevejledning SP/Webreq: Undersøgelse: parvovirus DNA/RNA Materiale: biopsi, fostervand, knoglemarv, plasma, spinalvæske eller serum eller koagelblod. Plasmodium (mikroskopi) (malaria), se Malaria Plasmodium arter (malaria) antistof IgM, IgG (NPU14921) Kan kun bruges til at påvise mistanke om overstået eller tidligere malaria. Ved mistanke om aktuel malariasygdom bestilles altid plasmodium (mikroskopi) (malaria?) SP/Webreq: Undersøgelse: Plasmodium antistof (malaria) Materiale: serum eller koagelblod. Pneumocystis jiroveci (tidl. carinii) DNA (22070) Princip: Påvisning af Pneumocystis jiroveci DNA med PCR-teknik P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

116 Side 116 af 158 Prøvemateriale: Indikation: Tidspunkt for prøvetagning: Utensilier: Bronkoalveolær lavage (BAL), evt. trachealskret Pneumoni hos patient med nedsat immunforsvar (fx ved neutropeni, efter organtransplantation, eller ved HIV-infektion) Snarest efter at indikation er stillet Sterilt spidsglas Prøvetagning: Se under BAL (s. 23) Opbevaring: Forsendelse: I køleskab (4-8 ºC) Evt. i kølekasse Svarafgivelse: 1-2 hverdage efter modtagelsen. Tolkning: Et positivt svar er foreneligt med klinisk betydende infektion med P. jiroveci. Dog kan et positivt resultat også ses hos ca. 5 % af patienter med pneumoni af andre årsager. SP/Webreq: Kan kun bestilles på Hospital. Undersøgelse: vælg: pneumocystis jiroveci (tidl. Carinii) NA/RNA. Materiale: vælg: bronoalveolær lavage (BAL el. mini-bal), ekspektorat-induceret, mundskyllevæske eller trakealsekret fra tube. Pneumokok antistof (23 valent) (NPU12001) SP/Webreq: Undersøgelse: streptococcus pneumoniae antistof (23 valent) Materiale: serum eller koagelblod Pneumonok antistof (7/13 valent) (NPU54234) SP/Webreq: Undersøgelse: streptococcus pneumoniae antistof (7/13 valent) Materiale: serum eller koagelblod P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

117 Side 117 af 158 Pneumoniudredning (atypisk pneumoni) (52010) Princip: Prøvemateriale: pneumoniudredning (atypisk pneumoni) på luftvejssekreter, er en samlet PCR-undersøgelse for legionella, mycoplasma pneumoniae, chlamydophila pneumoniae og chlamydiai psittaci. Sekret fra de dybe luftveje, ekspektorat, trakealsekret eller bronkialskyllevæske (BAL). Indikation: Klinisk mistanke om infektion med Legionella i, mycoplasma pnemonia, chlamydophila pnemoniae eller chlamydia psittaci, herunder pnemoni hos: Immunsupprimeret patient Patient hjemvendt fra udlandsrejse Patienter, som ikke responderer på behandling med batalaktamantibiotika. Se desuden indikation under de enkelte mikroorganismer. SP/Webreq: Undersøgelse: Pneumoniudredning (atypisk pneumoni). Materiale: trachealsekret, ekspektorat, Bronkoalveolær lavage(bal), bronkialsekret bronkoskopisk ophentet. Sundhedsplatformen: Bestilles i best/ord Søgeord; pneumoni (være opmærksom på at du er inde i fanebladet; installationslisten) Vælg pneumoniudredning (atypisk pneumoni) Vælge herefter Herlev hospital og prøve kategori; ekspektorat Udfyldt alle relevante felter og signer. Gå til opgavelisten og print PTB. Påsæt label fra PTB samt alm. patient label på prøven Tidspunkt for prøvetagning: Utensilier: Prøvetagning: Så tidligt i sygdomsforløbet som muligt, gerne inden antibiotisk behandling iværksættes. Ekspektorat dåse Trakealsugesæt eller sterilt spidsglas. Som ved almindelig bakteriologisk undersøgelse. Prøvemængde: Mindst 1 ml sekret. P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

118 Side 118 af 158 Opbevaring: Forsendelse: I køleskab (4-8 C). Evt. i kølekasse. Ved forsendelse med postvæsenet anvendes forsendelseshylster. Svarafgivelse: Undersøgelsen udføres dagligt og 1 gang hver weekend. I sjældne tilfælde indeholder prøverne faktorer, der hæmmer amplifikationsprocessen. Resultatet besvares i så fald som: Prøven ubedømmelig som følge af hæmning. Tolkning: Sensitiviteten af undersøgelsen afhænger af prøvematerialets egnethed, specielt for legionella infektion. Et negativt svar udelukker derfor ikke infektion, og hvis der er fortsat, er mistanken om atypisk pneumoni kan undersøgelsen gentages med optimal prøvetagningsteknik, trakealsug eller BAL. Podning fra cervix (10011/10200/12250) Princip: Dyrkning for hæmolytiske streptokokker, Staphylococcus aureus, Listeria, Haemophilus influenzae og anaerobe bakterier. Gravide undersøges for hæmolytiske streptokokker, Listeria og Staphylococcus aureus. Ved angivet mistanke om intra uterin infektion, endometrit m.m., undersøges også for andre bakterier inklussive anaerobe bakterier. Dyrkning for Neisseria gonorrhoeae (10200) Ved ønske om påvisning af Neisseriae gonorrhoeae og Chlamydia trachomatis DNA (12250) anvendes APTIMA medie. Indikation: Prøvemateriale: Udflåd, kløe og dyspareunia. Klinisk risiko for gruppe B streptokoksygdom (GBS). o Tidligere fødsel af barn med invasiv GBS. o GBS bakteriuri i aktuelle graviditet. o Præterm fødsel, febrila (>38,5 C) intrapartum, langvarig vandafgang > 24 timer. Mistanke om intrauterin infektion i forbindelse med graviditet. Mistanke om toksisk shock syndrom (TSS) forårsaget af stafylokokker eller streptokokker. Mistanke om endrometrit. Slimhindesekret fra cervikalkanalen. SP/Webreq: Undersøgelse: Dyrkning og resistens. P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

119 Materiale: Podning. Lokalisation: Cervix. Side 119 af 158 Utensilier: eswab Prøvetagning: Materiale fra slimhinden opsamles i eswab. Prøvemængde: Tilstrækkeligt til at fugte podepinden. Opbevaring: Forsendelse: I køleskab (4-8 C). Så vidt muligt i kølekasse. Der bør gå mindre end 1 døgn fra prøvetagning til modtagelsen i KMA, idet hurtig forsendelse er afgørende for et positivt dyrkningsresultat. Svarafgivelse: Foreløbigt svar afgives 1 døgn efter modtagelse af prøven. Slutsvar afgives efter 2-5 døgn. Tolkning: Fund af Staphylococcus aureus er ikke altid udtryk for betydende infektion. Bemærkninger: Der undersøges ikke for Gardnerella vaginalis, da denne bakterie ikke er den ætiologiske agens til bakteriel vaginose, men kun en indikator for ændring af vaginalfloraens sammensætning. Bakteriel vaginose påvises ved opfyldelsen af 3 ud af 4 kriterier: tyndt, hvidligt homogent vaginalsekret påvisning af clue cells vaginalsekret ph >4,5 frigivelse af fiskeagtig lugt ved pådrypning af 10 % KOH Ovennævnte undersøgelser udføres i egen klinik. Poliovirus neutraliserende antistof (NPU17414) SP/Webreq: Kan kun bestilles på hospital. Undersøgelse: poliovirus antistof Materiale: Serum eller koagelblod. Polyomavirus Ki (32252) & Wu (32253) P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

120 Side 120 af 158 Bemærkninger: Klinisk betydning uafklaret. Denne undersøgelse er kun indiceret hos immunsupprimerede patienter, med lungesymptomer med ukendt ætiologi. SP/Webreq: Kan kun bestilles på hospital Undersøgelse: KI-polymavirus DNA/RNA eller WU-polymavirus DNA/RNA. Materiale: nasopharynxsekret, podning eller trakealsekret. Posaconazol serumkoncentration (NPU27459) SP/Webreq: Undersøgelse: posaconazol (koncentrationsmåling) Materiale: blod (EDTA-glas), plasma eller serum eller koagelblod Poxvirus DNA/RNA (32300) SP/Webreq: Undersøgelse: poxvirus DNA/RNA. Materiale: biopsi, podning eller Vesikelvæske. Samt evt. lokalisation. Pus, sårsekret, sekret podning (10011) Princip: Indikation: Prøvemateriale: Dyrkning, identifikation og følsomhedsbestemmelse af potentielt patogene bakterier og svampe. Akut inflammerende traumatiske sår. Cellulit, fasciit. Inflammeret bidsår (hund, kat, hest, menneske) og brandsår. Postoperativ sårinfektion. Kroniske sår (diabetiske, decubitus, ulcus cruris) med inflammation af subkutant væv, fascie, muskel eller knogle. Pus, sårsekret eller vævsvæske. ESwab anvendes kun, hvor det ikke er muligt at fremsende aspireret materiale eller biopsier. Tidspunkt for P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

121 Side 121 af 158 prøvetagning: Utensilier: Før antibiotisk behandling startes. Spidsglas med skruelåg, sterilt. Sprøjte Luer Lock til aspiration af inficeret materiale. Forsendelsesrør til sprøjte. eswab Prøvetagning: Ved større pusmængder aspireres materialet i sprøjte og overføres til sterilt spidsglas. Ved mindre mængder kan materialet forblive i den sprøjte, der anvendtes til aspiration. Sprøjten lukkes med steril lukkeprop og fremsendes i forsendelsesrør. Ved bløddelsinfektion uden pussekretion (cellulit og lign.) kan prøvemateriale opnås på følgende måde: Der udføres huddesinfektion med 2 x jodsprit 2,5 % SAD liniment, eller hos patienter med jodallergi 2 x klorhexidinsprit 0,5 % i alkohol 70 %. Desinfektionsmidlerne skal tørre mellem påføringerne og inden punkturen. Efter desinfektion af indstiksstedet må dette ikke berøres, med mindre man har sterile handsker på. For at undgå jodforbrænding, aftørres jodet med sprit efter prøvetagningen. En sprøjte med kanyle indføres i det inficerede område og 1 ml sterilt saltvand injiceres, hvorefter der aspireres så meget som muligt. Den aspirerede væske sendes i sprøjten som beskrevet ovenfor. Prøvemængde: Så meget materiale som muligt, glasset må dog kun fyldes halvt. Opbevaring: Forsendelse: I køleskab (4-8 o C). Så vidt muligt i kølekasse. Podninger i eswab kan sendes med postvæsenet efter emballering i forsendelsesrør. Svarafgivelse: Foreløbigt svar afgives 1 døgn efter modtagelse af prøven. Slutsvar afgives efter 2-5 døgn. Prøver i relation til dyrebid: Op til 7 døgn. Tolkning: Før antibiotisk behandling startes er det nødvendigt at sammenholde klinikken med de bakterier og svampe, som er dyrket fra den pågældende region. Ved dyrebid bør dyrearten angives præcist på rekvisitionssedlen, idet bidsår fra forskellige dyr er associeret med specielle bakteriearter. Bemærkninger: Ved kroniske sår (decubitus, ulcus cruris) vil overfladepodninger sjældent give relevante mikrobiologiske oplysninger, hvorfor det foreslås at tage stansebiopsier fra sårranden efter rensning af såret. Biopsier fremsendes i spidsglas med et par dråber sterilt vand. P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

122 Side 122 af 158 PUT, se Legionella pneumophila (LUT) og pneumokok antigener (PUT) Q-feber, se Coxiella burnetii antistof (Q-fever) Rabiesvirus antistof (NPU56028) SP/Webreq: Kan kun bestilles på Hospital. Undersøgelse: rabiesvirus antistof Materiale: serum eller koagelblod Rickettsia arter DNA (12300) SP/Webreq: Kan kun bestilles på Hospital. Undersøgelse: Rickettsia DNA/RNA. Materiale: biopsi eller blod(edta-glas) Rickettsia antistof (SSI00354) SP/Webreq: Kan kun bestille på hospital. Undersøgelse: Rickettsia antistof (IgG, IgM) Materiale: Serum eller koagelblod. Rift Valley virus DNA/RNA, IgG og IgM antistof (NPU27099/ NPU 53362) SP/Webreq: Kan kun bestilles på hospital. Undersøgelse: rift valley virus DNA/RNA, IgG og IgM antistof. Materiale: blod (EDTA-glas) eller serum eller koagelblod P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

123 Side 123 af 158 RSV, se Influenza (A&B) og RS virus DNA/RNA Rotavirus, se Gastroenteritis, diagnostik Rubellavirus IgM og IgG antistof (NPU14062) Princip: Påvisning af IgM og IgG antistoffer mod rubellavirus med CLIA (chemo luminescen simmunoassay). Indikation: Mistanke om akut rubellainfektion, fx ved udslæt hos gravide, eller kongenit rubellainfektion. Bestemmelse af immunstatus. Prøvemateriale: Blod (serum) uden tilsætning. SP/Webreq: Undersøgelse: rubella virus IgM og IgG antistof (sygdom?) Materiale: serum eller koagelblod. Tidspunkt for prøvetagning: Diagnostisk undersøgelse ved formodning om akut infektion: Første blodprøve ved sygdomsdebut, næste blodprøve ca. 1 uge senere. I særlige tilfælde derefter ny blodprøve med 2 ugers interval (se Tolkning). Kongenit rubellainfektion: En prøve udtaget snarest efter fødslen (navlesnorsblod eller blodprøve fra barnet selv). Utensilier: Tørglas. Prøvetagning: Venepunktur. Prøvemængde: 4-5 ml blod (2 ml serum). Minimum 1 ml blod (0,5 ml serum). P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

124 Side 124 af 158 Opbevaring: I køleskab (4-8 C). Forsendelse: Evt. i kølekasse. Svarafgivelse: 1-3 hverdage efter prøvens modtagelse i KMA. Tolkning: Positiv reaktion for rubella IgG antistoffer (titer >10 IE/ml): Patienten er immun over for rubellavirus. Negativ reaktion for rubella IgG antistoffer (titer <5 IU/ml): Patienten er ikke immun overfor rubellavirus. Hvis patienten er gravid, tilrådes ny blodprøve ved udgangen af 16. graviditetsuge, og vaccination tilrådes efter afsluttet graviditet. Under rubellaepidemi tilrådes serologisk kontrol hver anden uge indtil udgangen af 16. graviditetsuge. Positiv reaktion for rubella IgM antistoffer: Forenelig med akut rubellainfektion. IgM antistoffer kan sædvanligvis kun påvises 1-2 mdr. efter infektionen, men enkelte personer er vedvarende IgM positive. Bemærkninger: Ved fund af IgM antistoffer mod rubellavirus hos en gravid sørger KMA for videresendelse af blodprøven til IgG antistof aviditetsundersøgelse på Statens Serum Institut til afklaring af, om det drejer sig om end tidligere eller akut infektion. Udslæt hos gravide bør altid medføre undersøgelse for både parvovirus og rubellavirus, også selvom der er påvist IgM antistoffer mod parvovirus, idet der kan være tale om enten krydsreaktion eller dobbeltinfektion. Rubellavirus RNA/DNA (NPU28708/NPU28709/32125) SP/Webreq: Undersøgelse: rubella virus DNA/RNA. Materiale: plasma, urin, podning, spinalvæske eller serum eller koagelblod. Salmonella antistof (enteritidis og typhimurium) (SSI00361) P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

125 Side 125 af 158 SP/Webreq: Undersøgelse: salmonella antistof (enteritidis og typhimurium) Materiale: serum eller koagelblod. Sandfly fever virus DNA/RNA (32025) SP/Webreq: Undersøgelse: Sandfly Toscana virus DNA/RNA Materiale: blod (EDTA-glas), serum eller koagelblod Sandfly fever virus antistof IgM, IgG (SSI00242) SP/Webreq: Undersøgelse: Sandfly Toscana virus antistof IgM, IgG Materiale: blod (EDTA-glas), serum eller koagelblod Schistosoma (bilharziose) antistof (NPU17104) Se Rigshospitalets prøvevejledning SP/Webreq: Undersøgelse: sehistosoma antistof (billharzia) Materiale: serum eller koagelblod. Schistosomiasis (Bilharziose), mikroskopi (41010) Princip: Indikation: Mikroskopi af urin, fæces og rectum biopsier for Schistosoma æg efter opkoncentrering ved sedimentation. Mikroskopi af faeces og snipbiopsier fra rectum Cystitis symptomer, hæmaturi, diaré, mavesmerter og træthed hos personer, der har badet eller haft kontakt med ferskvand i søer eller vandløb i det meste af Afrika, flere øer i det Indiske Ocean, Mellemøsten og det vestlige Asien. Prøvemateriale: Mindst 500 ml urin, evt. døgnurin. SP/Webreq: Undersøgelse: schistosoma (mikroskopi) Materiale: Urin. P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

126 Side 126 af 158 Tidspunkt for prøvetagning: Utensilier: Fra 4-8 uger efter kontakt med inficeret ferskvand. Udskillelsen af æg i urinen er størst i tidsrummet kl og øges ved fysisk anstrengelse. Plastflaske 1l. med skruelåg, Fæcesrør med forsendelsescontainer, spidsglas med fysiologisk saltvand. Prøvetagning: Urin: Lades i bækken, beholder eller direkte i transportflasken. De sidste dråber af urinen medtages, idet de ofte indeholder den største mængde æg. Fæces: Der sendes 3 prøver, som beskrevet under faeces for orm, æg og cyster Symptomer og geografisk anamnese skrives på rekvisitionen. Opbevaring: Forsendelse: I køleskab (4-8 C) i højst 1 time. Hvis prøven ikke når KMA indenfor denne time, tilsættes 5 ml formalin. Urin: Akut transport i kølekasse. Faeces: Som under orme, æg og cyster. Svarafgivelse: 1-2 hverdage efter modtagelse af prøven. Tolkning: Schistosoma æg kan udskilles i årevis efter vellykket behandling Bemærkninger: Hvis der trods mistanke om schistosomiasis ikke findes æg, bør undersøgelsen gentages og evt. undersøges for Schistosoma IFAT antistoffer, som udføres på Statens Serum Institut. Screening for Multiresistente bakterier, Udlandsscreening, se Udlandsscreening, screening for (multi-) resistente bakterier P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

127 Sektionsmateriale (10011) Side 127 af 158 Princip: Indikation: Prøvemateriale: Tidspunkt for prøvetagning: Utensilier: Dyrkning og identifikation af isolerede bakterier og svampe. Infektionsdiagnostisk udredning af dødsårsag. Hjerteblod og væv (lever, milt, nyrer og lunger) samt andre infektionssuspekte områder. Prøvemateriale angives med fritekst. Før udtagning af organblokken. Spidsglas med skruelåg, sterile. Ekspektorat dåser med forsendelsescontainere. Sterile pipetter. Prøvetagning: Prøverne udtages sterilt på følgende måde: Kropshulen åbnes efter huddesinfektion x 2 med jodsprit 2,5 % eller klorhexidinsprit 0,5 % og med anvendelse af sterile handsker og instrumenter. Inden udtagning af organblokken aspireres med sterile pipetter fra hjertet og relevante organer. Aspirat overføres til sterile spidsglas, og vævsprøver overføres til ekspektorat dåser. Lignende teknik anvendes ved fund af fokale infektionsprocesser. Prøvemængde: Spidsglas med aspireret materiale må højst fyldes halvt. Vævsprøver bør ikke være >1 x 1 cm. Opbevaring: Rekvisitionsseddel: Forsendelse: I køleskab (4-8º C). Dødstidspunkt og klinisk problemstilling angives. Fremsendes hurtigst muligt i kølekasse. Svarafgivelse: Foreløbigt svar afgives 1 døgn efter modtagelse af prøven. Slutsvar afgives efter 2-5 døgn. Tolkning: Den beskrevne teknik er den optimale til at undgå kontamination. Ved positive fund må tolkning ske i samråd med KMA. P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

128 Serumkoncentration af antituberkuløse midler Side 128 af 158 SP/Webreq: Kan kun bestilles på hospital Bestilles under det enkelte antituberkuløse middel Materiale: Serum eller koagelblod Serumkoncentration af svampemidler, se Flucytosin serum koncentration, Posaconazol serumkoncentration, Voriconazol serumkoncentration eller Itraconazol serum koncentration) Staphylococcus aureus (MRSA) (dyrkning), se MRSA (meticillinresistente S. aureus) Spinalvæske og hjerneventrikelvæske Dyrkning og Resistens (10011) Princip: Indikation: Prøvemateriale: Mikroskopi og aerob dyrkning med identifikation og følsomhedsbestemmelse af isolerede bakterier og svampe. Spinalvæsker og hjerneventrikelvæsker fra neurokirurgiske patienter dyrkes også anaerobt. Klinisk meningit: Akut opstået hovedpine, påvirket almentilstand, nakke- og rygstivhed, bevidsthedssvækkelse, Kernigs symptom og hos spædbørn spændt frontanelle. Differentialdiagnostisk udredning ved meningoencefalit (Listeria, svampe, TB): Bevidsthedssvækkelse, sukken, smasken, pillen og kranienervepareser. Differentialdiagnostisk udredning ved klinisk encefalit: Akut opstået hovedpine, svimmelhed, kvalme, kramper, bevidsthedssvækkelse, symptomer fra temporal- og pandelap. Mistanke om cerebrospinal shuntinfektion eller kontrol af drænagevæsken for infektion. Mistanke om neuroborreliose. Spinalvæske eller hjerneventrikelvæske. P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

129 SP/Webreq: Undersøgelse: Dyrkning og resistens. Materiale: Spinalvæske. Side 129 af 158 Sundhedsplatformen: Bestilles i best/ord, Søgeord; Spinalvæske (være opmærksom på at du er inde i fanebladet; installationslisten) Accepter og signer Gå til opgavelisten og print PTB. Prøven skal i en gule-plasticpose og ring piccoline for afhentning. Tidspunkt for prøvetagning: Så hurtigt som muligt efter at mistanke om intracerebral infektion er opstået. Utensilier: Sterile spidsglas med skruelåg. Prøvetagning: Der udføres huddesinfektion med 2 x jodsprit 2,5 % SAD liniment eller hos patienter med jodallergi med klorhexidin 0,5 % i alkohol 70 %. Desinfektionsmidlerne skal tørre mellem påføringerne og inden punkturen. Hvis spinalvæsken er blodig, kasseres de første dråber. Herefter opsamles væske til mikrobiologisk undersøgelse og dernæst til Klinisk Biokemisk Afdeling. Prøvemængde: 1-3 ml væske i ét glas til KMA. Opbevaring: I køleskab (4-8º C) indtil forsendelse. Rekvisition: Forsendelse: Husk altid at angive på rekvisitionen, hvis indikationen er meningitis. Det er den rekvirerende afdeling, der har ansvaret for den akutte forsendelse. Inden afsendelse kontaktes vagthavende mikrobiolog og leveringsstedet aftales. Rutinepunkturvæske sendes med første ordinære transport. Ved spinalvæsker fra patienter med formodet viral meningit eller klar spinalvæske afventes svar på celletal, differentialtælling, spinalprotein og spinalglukose. Såfremt disse svar tyder på viral ætiologi (se bemærkninger), kan spinalvæsken eventuelt sendes med første ordinære transport til KMA. P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

130 Side 130 af 158 Svarafgivelse: Svar på akut mikroskopisk undersøgelse meddeles straks telefonisk til en autoriseret patientansvarlig person, og fundets relevans og patientbehandling diskuteres. Vækst i såvel akutte som ikke-akutte prøver meddeles straks telefonisk. Prøver uden vækst besvares efter 3. døgn. Tolkning: Meningitisdiagnosen stille på basis af kliniske symptomer, påvisning af pleocytose i spinalvæsken og evt. dyrkningsresultat. Spinalvæskeforhold hos normale og patienter med meningitis sammenholdt med normale værdier Ætiologi Udseende Celletype, dominerende Celletal x 10 6 /l CSF-glukose Blod-glukose CSF protein Normale værdier 1. leveuge leveuge >5. leveuge + voksne klar klar klar variabel variabel mononukleær <15 <10 < Bakteriel skyet/purulent granulocytær Listeria Skyet blandet > Tuberkuløs klar/skyet mononukleær < Svampe klar/skyet mononukleær > >0.5 Borrelia Enterovirus Herpes simplex virus Varicella zoster virus klar/skyet klar/skyet klar/skyet klar/skyet mononuklæer mononukleær mononukleær mononukleær , <0.5 <0.5 Tidligt i forløbet af bakteriel meningitis kan den dominerende celletype være mononukleær. Bemærkninger: Hvis der ved lumbalpunkturen er mistanke om bakteriel meningitis bør der altid samtidig foretages bloddyrkning og dyrkning fra svælg samt andre potentielle foci og evt. foretages mikroskopi/dyrkning fra petekkier Spinalvæske til undersøgelse for borrelia Spinalvæske til undersøgelse for enterovirus Spinalvæske til undersøgelse for Herpes simplex virus Spinalvæske til undersøgelse for Variella zoster virus Spinalvæske til undersøgelse for TB skal sendes til KMA som videresender prøven til Statens Serum Institut. Ved klinisk biokemisk undersøgelsesresultat tydende på bakteriel meningitis (se ovenstående tabel) og negativt mikroskopi- og dyrkningsfund kan spinalvæsken undersøges med en multiplex PCR for DNA fra de tre hyppigst forekommende ætiologier (S. pneumoniae, N. meningitidis og H. influenzae). P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

131 Side 131 af 158 Streptococcus pneumoniae antistof (23 valent), se Pneumokok antistof (23 valent) Streptococcus pneumoniae antistof (7/13 valent), se Pneumonok antistof (7/13 valent) Streptococcus pneumoniae (pneumokok) antigen i urin (PUT) (53300) Princip: Indikation: Prøvemateriale: Påvisning af polysakkaridantigen fra S. pneumoniae i urin med immunkromatografisk metode. Klinisk mistanke om pneumokokinfektion, fx hvor forudgående antibiotikabehandling af pneumoni, bakteriæmi eller meningitis kan have givet (falsk) negativt dyrkningsresultat Urin SP/Webreq: Undersøgelse: streptococcus pneumoniae antigen i urin(put) Materiale: Urin. Tidspunkt for prøvetagning: Så tidligt som muligt i sygdomsforløbet, evt. gentaget efter 1-2 dage. Utensilier: Prøvetagning: Urinprøvesæt eller sterilt spidsglas. Midtstråleteknik. Prøvemængde: 1-5 ml urin. Opbevaring: Forsendelse: I køleskab (4-8º C). Evt. i kølekasse. Ved forsendelse med postvæsenet anvendes forsendelseshylster. Svarafgivelse: Prøven analyseres og besvares samme dag. I weekenden udføres analysen i dagarbejdstiden. Resultatet angives som negativt eller positivt. Tolkning: Negativt resultat udelukker ikke infektion med pneumokokker. Det kan være nødvendigt med gentagne urinantigen bestemmelser, da den udskilte antigenmængde varierer i sygdomsforløbet. Undersøgelsen er ikke egnet til børn (1-15 år), da alene kolonisering i luftvejene med S. pneumoniae også kan give positivt resultat i denne aldersgruppe. P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

132 Side 132 af 158 Bemærkninger: Undersøgelsen bør altid forudgås af eller suppleres med mikroskopi og dyrkning af relevant prøvemateriale (luftvejssekret, blod eller spinalvæske). Se endvidere under spinalvæske (påvisning af DNA fra S. pneumoniae, N. meningitidis og H. influenzae med PCR). Strongyloides antistof (NPU27819) SP/Webreq: Undersøgelse: strongyloides antistof. Materiale: Serum eller koagelblod. Strongyloides dyrkning (40100) Se Rigshospitalets prøvevejledning SP/Webreq: Undersøgelse: strongloides (dyrkning) Materiale: Faeces Syfilisantistoffer i spinalvæske, se Syfilisantistoffer intratekal syntese Syfilisantistoffer intratekal syntese (DNK35912) SP/Webreq: Undersøgelse: treponema pallidum antistof (intratekal test) Materiale: Pakke koblet spinalvæske og serum. Svælgpodning for ß-hæmolytiske streptokokker (10011) Princip: Indikation: Dyrkning for β-hæmolytiske streptokokker. Akut tonsillit, faryngit: Tonsiller med rødme og/eller belægninger, synkesmerter og feber. Små børn med protraheret øvre luftvejsinfektion med rhinorrhea, suppurative komplikationer og subfebrilia. Smitteopsporing ved recidiverende familieepidemier. Prøve- P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

133 Side 133 af 158 materiale: Podning fra tonsiller og ved tidligere tonsillektomi fra kryptlejer. SP/Webreq: Undersøgelse: Dyrkning og resistens. Materiale: podning. Lokalisation: Svælg Tidspunkt for prøvetagning: Utensilier: Før antibiotisk behandling startes. eswab Prøvetagning: Podepinden gnides fast over begge tonsiller, så eventuelle belægninger tages med. Det er vigtigt kun at berøre det slimhindeområde, der skal undersøges. Opbevaring: Forsendelse: I køleskab (4-8º C). Evt. i kølekasse. Ved forsendelse med postvæsenet anbringes eswab i forsendelseshylster. Svarafgivelse: Slutsvar afgives 1-2 døgn efter modtagelse af prøven. Tolkning: Hverken pneumokokker, hæmofilusarter, andre Gramnegative stave eller stafylokokker giver anledning til halsbetændelse. Bemærkninger: Af de hæmolytiske streptokokker er kun gruppe A (Streptococcus pyogenes) en sikker årsag til tonsilfaryngit. Gruppe C og G er enkelte gange isoleret fra epidemisk optræden af faryngit, hvor anden ætiologi ikke har kunnet påvises. Svælgpodning, andet (10011) Princip: Undersøgelse for Haemophilus influenzae, type b (epiglottit), Corynebacterium diphtheriae (difteri), Neisseria meningitidis (meningokoksygdom) vil kun ske, hvis indikationen er anført på rekvisitionen. Indikation: Prøvemateriale: Symptomer på epiglottit. Symptomer på difteri (faryngit med grålige, fastsiddende membraner, ødem af svælg og hals, svælgparalyse). Meningokoksygdom. Podning fra pharynx og tonsiller. P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

134 Side 134 af 158 Tidspunkt for prøvetagning: Utensilier: Før antibiotisk behandling startes. eswab Prøvetagning: Podepinden gnides fast over tonsillerne, så eventuelle belægninger tages med. Det er vigtigt kun at berøre det slimhindeområde, der skal undersøges. Ved kliniske tegn på epiglottitis må prøvetagning først foregå, når der er sikret frie luftveje. Opbevaring: Forsendelse: I køleskab (4-8º C). Evt. i kølekasse. Ved forsendelse med postvæsenet anbringes eswab i forsendelseshylster. Svarafgivelse: Foreløbigt svar afgives skriftligt 1 døgn efter modtagelse af prøven, dog kun relevante positive svar til praksis. Slutsvar efter 2-5 døgn. Bemærkninger: Undersøgelse for meticillinresistente Staphylococcus aureus (MRSA). Se Hygiejnehåndbogen på VIP-portalen. Ønskes undersøgelse for kighostebakterier, indsendes særlig prøve og rekvisition. Ønskes undersøgelse for gonokokker, indsendes særlig prøve og rekvisition. Yderligere undersøgelse for bakterier og svampe kan komme på tale hos svært immunsupprimerede patienter og hos patienter, hvor der er mistanke om Lemierre s syndrom (nekrobacillose) forårsaget af Fusobacterium necrophorum. Taenia solium antistof (cysticercosis) (NPU27903) SP/Webreq: Undersøgelse: taenia solium antistof (cysticercosis) Materiale: Serum eller koagelblod. Tarmpatogene bakterier, inklusive Clostridium difficile, se Gastroenteritis, diagnostik P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

135 Side 135 af 158 TB, PCR for, se Mycobacterium (TB) (mikroskopi og dyrkning) TBE antistof, se Tick borne encephalitis (TBE) IgG og IgM) TBE DNA/RNA, se Tick borne encephalitis (TBE) DNA/RNA Tetanustoksin antistof, se Clostridium tetanitoxin antistof Tick borne encephalitis (TBE) IgG og IgM (NPU17637) SP/Webreq: Undersøgelse: tick born encephalitis virus (TBE) IgG og IgM Materiale: serum eller koagelblod eller spinalvæske. Tick born encephalitis (TBE) DNA/RNA (NPU27614/NPU27695) SP/Webreq: Undersøgelse: tick bone encephalitis virus (TBE) DNA/RNA Materiale: blod (EDTA-glas) (NPU27614) eller spinalvæske (NPU27695) Toscana virus DNA/RNA, IgG og IgM antistof, se Sandfly fever virus antistof IgM, IgG SP/Webreq: Kan kun bestille på hospital. Undersøgelse: toscana virus IgG og IgM antistof. Materiale: blod (EDTA-glas), spinalvæske eller serum eller koagelblod Toxocara antistof (SSI00377) SP/Webreq: Undersøgelse: toxocara antistof Materiale: Serum eller koagelblod. P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

136 Side 136 af 158 Toxoplasma gondii IgG og IgM antistof (NPU12259) Princip: Indikation: Prøvemateriale: Påvisning af IgM og IgG antistoffer mod T. gondii med CLIA (Chemoluminescens immunoassay). Bestemmelse af immunstatus. Mistanke om kongenit infektion eller reaktivering, fx ved chorioretinitis hos børn og voksne. Mistanke recidiv hos immunsupprimeret patient. Mistanke om akut toxoplasmose. Blod (serum) uden tilsætning. SP/Webreq: Undersøgelse: toxoplasma gondii IgG og IgM antistof (sygdom?) Materiale: Serum eller koagelblod. Tidspunkt for prøvetagning: Utensilier: Prøvetagning: Så tidligt som muligt efter at indikationen er stillet. Ved formodning om akut infektion under graviditet yderligere en prøve udtaget 2 3 uger efter. Tørglas. Venepunktur. Prøvemængde: 4-5 ml blod (2 ml serum). Minimum 1 ml blod (0,5 ml serum). Opbevaring: Forsendelse: I køleskab (4-8 C). Evt. i kølekasse. Ved forsendelse med postvæsenet anvendes forsendelseshylster. Svarafgivelse: 1-3 hverdage efter prøvens modtagelse i KMA. Svaret angives som negativt, tvivlsomt positivt eller positivt for IgM og IgG. Tolkning: Positivt resultat for IgM antistoffer ( 8 AU/ml) tyder på akut infektion med T. gondii. IgM kan dog påvises i op til 12 mdr. efter infektion. Hvis prøven alene har positivt resultat for IgG ( 8,8 AU/ml) drejer det sig om en tidligere infektion. Bemærkninger: I tilfælde af positiv IgG og IgM hos en gravid vil KMA desuden foretage aviditetsbestemmelse af IgG antistof, hvorved smitte for mere eller mindre end 4 mdr. siden kan fastlægges. Ved behov for supplerende undersøgelser på Statens Serum Institut (udredning af smittetidspunkt ved positiv IgM hos en gravid) sørger KMA for at videresende prøven. P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

137 Side 137 af 158 Toxoplasma gondii (nyfødte) (42045) SP/Webreq: Kan kun bestille på hospital. Undersøgelse: vælg: Toxoplasma gondii immunblotting. Til undersøgelse for kongenit infektion, kræves der en serumprøve fra både mor og barn. Under kliniske oplysninger skrives: udredning for kongenit infektion. Mærk prøven med personnr. og samme prøvenr. fra mor og barn. Toxoplasma gondii DNA/RNA (NPU12967/42020) SP/Webreq: Undersøgelse: toxoplasma gondii DNA/RNA. Materiale: spinalvæske eller fostervand Treponema pallidum antistoffer, intratekaltest, se Syfilisantistoffer intrathekal syntese Treponema pallidum antistoffer i spinalvæske, se syfilisantistoffer (CSV) Treponema pallidum antistoffer (syfilis screening) (NPU14097) Princip: Indikationer: Prøvemateriale: Påvisning af antistoffer mod T. pallidum med Chemo luminescens immunoassay (CLIA) teknik. Analysen er en treponemaltest. Klinisk mistanke om syfilis, herunder kongenit infektion, eksposition for syfilis, risikoadfærd samt forebyggelse af medfødt syfilis ved undersøgelser af gravide risikopatienter. Hvis patienten screenes i forbindelse med graviditet, sendes prøven til Blodbanken. Blod (serum) uden tilsætning. SP/Webreq: Undersøgelse: treponema pallidum antistof(syfilis) P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

138 Materiale: Serum eller koagelblod. Side 138 af 158 Tidspunkt for prøvetagning: Utensilier: Prøvetagning: Så tidligt som muligt efter indikationen er stillet. Evt. efterfølgende prøver med 1-4 ugers interval. Tørglas. Venepunktur. Prøvemængde: 4-5 ml blod (2 ml serum). Minimum 0,6 ml blod (0,3 ml serum). Rekvisitionsseddel: Opbevaring: Forsendelse: Det er vigtigt, at indikationen for undersøgelsen anføres, og at man oplyser, om pt. evt. tidligere har fået konstateret syfilis. I køleskab (4-8 C). Evt. i kølekasse. Ved forsendelse med postvæsenet anvendes forsendelseshylster. Svarafgivelse: 1-3 hverdage efter prøvens modtagelse i KMA. Et negativt fund besvares umiddelbart. Ved positiv eller tvivlsom positiv reaktion indsender KMA prøven til konfirmatorisk analyse på KMA, Hvidovre Hospital og besvares endeligt, når svar foreligger herfra. Tolkning: Positivt fund tyder på aktuel eller tidligere syfilis. CLIA-testen kan være negativ i de første sygdomsuger, hvorfor man må gentage undersøgelsen ved negativt resultat, hvis klinisk mistanke om syfilis foreligger. Bemærkninger: Visse autoimmunsygdomme og infektioner med andre (tropiske) treponema-arter (T. pertenue (forårsager yaws), T. carateum (forårsager pinta)) kan give falsk positive reaktioner. Ved udredning af kongenit syfilis (prøver fra neonatalafdeling fra barn og mor) kontaktes vagthavende på KMA for at sikre videresendelse fra KMA til SSI. Treponema pallidum DNA/RNA (12280) SP/Webreq: Undersøgelse: treponema pallidum DNA/RNA. Materiale: biopsi eller sårpodning. Samt lokalisation. P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

139 Side 139 af 158 Trichinella spiralis antistof (SSI00382) SP/Webreq: Undersøgelse: trichinella spiralis antistof. Materiale: Serum eller koagelblod. Trichomonas vaginalis, se Vaginalpodning for gær Trofozoitter af Giardia intestinalis i duodenalsekret (59110) Princip: Direkte mikroskopi for trofozoitstadiet af E. histolytica eller G. intestinalis. Foruden mikroskopi udføres PCR for Giardia, cryptosporidier og entamoeba histolytica. Indikation: Prøvemateriale: Slim og blod i afføringen af mere end 5 dags varighed efter rejse eller ophold i troperne. Slim og blod i afføringen hos et barn adopteret fra lande med høj incidens af E. histolytica (incl. Østeuropa). Diaré og dårlig trivsel hos et barn, hvor PCR af fæces ikke har givet diagnosen (Giardia). Tynd, frisk fæces med blod og/eller slim, pus fra tarmulcerationer (E. histolytica) eller duodenalsekret (G. intestinalis). Der er ikke indikation for at undersøge formet fæces. SP/Webreq: Tidspunkt for prøvetagning: Kan kun bestilles på hospital. Undersøgelse: tarmpatogene parasitter, undersøgelse for Materiale: Aspirat (opsug) Lokalisation: Duodenum Om formiddagen på hverdage. Utensilier: Fæcesrør med forsendelsescontainer. Termobeholder (udlånes af KMA). Prøvetagning: KMA skal underrettes telefonisk, inden prøven tages. Prøven udføres kun på hverdage i dagåbningstiden. Prøvematerialet anbringes i fæcesrøret, som lukkes tæt og anbringes i termobeholderen, som i forvejen er fyldt halvt op med 37 C varmt vand. P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

140 Side 140 af 158 For at undgå smitte til andre personer må fæcesrøret ikke forurenes på ydersiden, og efter påfyldningen skal skruelåget skrues hårdt til, så lækage under transport undgås. Prøvemængde: Fæcesrøret må højst fyldes 1/3. Opbevaring: Forsendelse: Prøven skal fremsendes straks og må ikke opbevares. Prøven skal transporteres ved 37 C i termobeholder, som kan lånes på KMA. Svarafgivelse: Positivt svar afgives straks telefonisk til en autoriseret patientansvarlig medarbejder, skriftligt svar følger. Bemærkninger: Symptomerne ved colitis ulcerosa og akut amøbedysenteri kan ligne hinanden så meget, at en patient med en mulig eksposition altid bør undersøges for infektion med E. histolytica, inden der startes behandling med glukokortikoider. Tropheryma whipplei DNA/RNA (12108) SP/Webreq: Kan kun bestilles på hospital. Undersøgelse: tropheryma whipplei DNA/RNA. Materiale: vævstype. Trypanosoma antistof (NPU17484) SP/Webreq: Undersøgelse: trypanosoma antistof Materiale. Serum eller koagelblod. Udlandsscreening, screening for (multi-) resistente bakterier (10050) Princip: Undersøgelse for MRSA (Methicillin resistente Staphylococcus aureus), VRE (vancomycin-resistente enterokokker), CPO (carbapenemase-producerende organismer) og MR-GNS (Multi-resistente Gram-negative stave). Alle 4 undersøgelser sker ved dyrkning i et opformeringsmedie i et døgn efterfulgt af udsåning P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

141 Side 141 af 158 på screeningsplader. Herudover udføres der hurtigtest (PCR) for MRSA og VRE og evt. CPO. Indikation: Forekomsten af (multi-) resistente bakterier i udenlandske hospitalsmiljøer gør at det ikke længere er nok kun at lede efter MRSA, men man må også lede efter VRE, CPO og MR-GNS i prøver fra patienter der har været indlagt i udlandet. Ifølge den regionale VIP vejledning: Multiresistente bakterier, supplerende infektionshygiejniske forholdsregler skal patienter med fund af MRSA, VRE, CPO og MR-GNS isoleres. Patienter der skal undersøges: Patienter som har været indlagt på hospital udenfor Norden indenfor de sidste 6 måneder. Afgrænsning følger Sundhedsstyrelsen rekommandationer vedr. screening for MRSA, se: Vejledning om forebyggelse af spredning af MRSA. Patienter, som har opholdt sig uden for Norden inden for de sidste 6 måneder og fået behandling med antibiotika under opholdet, screenes kun for CPO (se CPO, screening for), se Sundhedsstyrelsens Vejledning om forebyggelse af spredning af CPO. Beboere på asylcentre skal ved indlæggelse per 1. marts 2018 ikke længere udlandsscreenes, men fortsat MRSA-screenes. Prøvemateriale: Der skal tages tre podninger fra patienten; fra næse, svælg og rectum/stomi. Hvis det skønnes relevant, tages endvidere podninger fra sår, urin, trakealsekret fra intuberet patienter m.fl. Prøvebestilling: SP/Webreq: Under Best/ord bestilles Screening i forbindelse med udlandsophold. Vælg materiale: eksem-podning, podning, sår-podning, trakealsekret fra tube eller urin. - Vælg lokalisation til podning: næse, svælg, rectum, stomi. - Svar på prompt. Tidspunkt for prøvetagning: Utensilier: Hurtigst muligt efter patientens indlæggelse og før antibiotisk behandling startes. eswab med podepind. Prøvetagning: Næse: Podepinden føres gennem det yderste af næsen (cavum nasi) 0,5 1 cm op. Podepinden drejes rundt mod indersiden af begge næsefløje, 5-6 gange, samtidig med at et fast tryk opretholdes. Samme podepind bruges til begge næsebor. Svælg: Podepinden føres henover begge tonsiller med et let tryk Rectum/fæces: Podepinden føres lige indenfor sphinter eller fæces berøres let med podepinden. Det er vigtigt at der ikke kommer for P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

142 Side 142 af 158 meget fæces på podepinden da PCR-reaktionen ellers kan blive hæmmet. Opbevaring: Forsendelse: I køleskab (4-8 C). Med almindelig transport eller med taxa. Svarafgivelse: Modtages prøverne inden kl. 20:00 på hverdage og 18:00 i weekenden og på helligdage kan der forventes svar på MRSA, VRE og evt. CPO hurtig test samme dag. Dyrkningen for de fire bakterier tager 2-4 dage. Patienter negative med hurtigtest for MRSA, VRE og evt. CPO i alle relevante prøver kan afisoleres. Tolkning: Svar på hurtigtest (PCR) afgives påvist/ikke påvist/ubedømmelig. Svar på dyrkningsundersøgelserne angives som vækst/ikke vækst af hver af de fire bakterier (MRSA/VRE/CPO/MR-GS). Patienter der har fået antibiotika indenfor den sidste uge inden prøvetagning kan udkomme med falsk negativt dyrkningssvar. Ved vækst af MRSA/VRE/CPO/MR-GS påføres svaret en resistensbestemmelse og KMA vil kontakte rekvirenten med henblik på opfølgning. Bemærkninger: Se i øvrigt den regionale VIP vejledning: Multiresistente bakterier, supplerende infektionshygiejniske forholdsregler, Sundhedsstyrelsens vejledning om forebyggelse af spredning af MRSAog Vejledning om forebyggelse af spredning af CPO. MRSA og en delmængde af CPO er anmeldelsespligtig og, hvis relevant, vil anmeldelsespapirer blive til sendt fra KMA. Ved tvivl om, hvorvidt patienten skal være isoleret, kan KMA kontaktes for at træffe nærmere aftale om infektionshygiejniske forholdsregler. Ureaplasma urealyticum og Ureaplasma parvum (DNA) (12159) Prøvemateriale: friskladt urin (first void) i spidsglas podning fra urethra/cervix i e-swab medium Urin (10011) Princip: Indikation: Kvantitativ dyrkning med identifikation og følsomhedsbestemmelse af bakterier og svampe. Recidiverende cystit hos kvinder. Pyleonefrit. Urinvejsinfektion hos børn og mænd. Kompliceret urinvejsinfektion med kateter, sten, refluks og >100 P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

143 Side 143 af 158 ml residualurin. Screening for asymptomatiske bakteriuri ved invasive urologiske indgreb, under graviditet, hos børn i manglende trivsel eller efter total fjernelse af et permanent urinkateter. Dette bør ske ved dyrkning, da urinstiks (nitrittest kombineret med leukocytesterasetest) kan være falsk negativ. Prøvemateriale: Midtstråleurin. Urin udtaget ved suprapubisk blærepunktur. Praktiserende læger anbefales semikvantitativ dyrkning på dipslide, eller lignende, og indsendelse af borsyreglas ved positivt dyrkningsresultat. Dyrkning af kateterurin er sædvanligvis kun indiceret, hvis patienten er febril, hvor også bloddyrkning er indiceret. En undtagelse er dog svært neutropene eller immuninkompetente patienter. SP/Webreq: Bestilles i best/ord, Søgeord; dyrkning og resistens. Vælge herefter Herlev hospital og prøve kategori; urin. Udfyldt alle relevante felter og signer. Gå til opgavelisten og print PTB Undersøgelse: Dyrkning og resistens. Materiale: Urin midtstråle Urin fra kateter a demeure Urin fra nefrostomikateter Urin fra nyrepelvis Urin suprapubisk kateter Urin suprapubisk punktur Urin fra bækken (anbefales ikke) Urin engangskaterisation (ren teknik) Urin brickerblære Urin tarmblære Urin (art angives i fri tekst) Tidspunkt for prøvetagning: Utensilier: Morgenurin eller tidligst (2) - 4 timer efter sidste vandladning. Urinprøvesæt. Udvidet undersøgelse af uriner fra praktiserende læger: Borsyreglas (Urinrør). Bestilles hos KMA. P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

144 Side 144 af 158 Kateterurin: Sterilt spidsglas med skruelåg, fra praksis dog i borsyreglas. Prøvetagning: Indersiden af urinprøvesættets bæger må ikke berøres. Kvinder: Fugtighedsservietten anvendes til grundig afvaskning af skamlæber og skedeindgang. Lidt af urinen lades i toilettet. Herefter lades urinen i bægeret, indtil det er ca. halvfuldt. Bægerets indhold hældes i reagensglasset, som fyldes halvt. Hætten skrues på igen. Børn, der ikke kan lade vandet på opfordring: Urinen opsamles i plastpose, der hæftes på barnet, efter at genitalier er vasket med rent vand. Posen tilses hver 10. minut for at kontrollere, om der er urin i posen. Mænd: Forhuden føres tilbage, og urinrørsmundingen afvaskes grundigt med fugtighedsservietten. Lidt af urinen lades i toilettet. Herefter lades urinen i bægeret, indtil det er ca. halvfuldt. Bægerets indhold hældes i reagensglasset, som fyldes halvt, og hætten skrues på igen. Prøvemængde: 3-5 ml. Det sterile spidsglas må højst fyldes halvt. Borsyreglas 10 ml. Opbevaring: Forsendelse: Prøven sættes straks i køleskab (4-8 C) i max. 24 timer. I kølekasse. Uafkølet urin fremsendt via postvæsenet undersøges ikke på grund af risiko for sekundær bakteriel opformering under transporten. Borsyreglas kan dog fremsendes med postvæsenet. Svarafgivelse: Foreløbigt svar afgives oftest 1 døgn efter modtagelse af prøven. Slutsvar efter 2-5 døgn. Tolkning: Alle positive fund ved dyrkning af sterilt udtaget urin er signifikant. Signifikansniveau for andre opsamlingsmåder er afhængig af prøvens art og kvalitet samt af patientens diagnose. Dette vil fremgå af det afgivne svar. Bemærkninger: Hos yngre kvinder kan det være vanskeligt at skelne cystit fra vaginit og urogenital klamydiainfektion. I første trimester bør gravide kvinder udredes for asymptomatisk bakteriuri, der øger risikoen for akut pyelonefrit og for tidlig fødsel. Påvises bakteriuri i første trimester, skal urinen kontroldyrkes en gang månedlig under resten af graviditeten. Urin til undersøgelse for TB skal sendes til KMA som videresender prøven til Statens Serum Institut. (Rekvireres som undersøgelse: Mycobacterium dyrkning og DNA/RNA (TB), Materiale: Urin midtstråle) P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

145 Side 145 af 158 Urogenitiale mycoplasmer, se Mycoplasma genitalium DNA/RNA Vaginalpodning for gær (20010) Princip: Indikation: Prøvemateriale: Dyrkning for gær. Ønskes undersøgt for Trichomonas vaginalis skal det anføres på rekvisitionen Udflåd, kløe og dyspareunia. Slimhindesekret fra vagina. SP/Webreq: Undersøgelse: Dyrkning gærsvampe (Trichomonas vaginalis) Materiale: Podning Lokalisation: Vagina Utensilier: eswab Prøvetagning: Materiale fra slimhinden opsamles i eswab. Prøvemængde: Tilstrækkeligt til at fugte podepinden. Opbevaring: Forsendelse: Stuetemperatur. Ved forsendelse med postvæsenet anbringes eswab i forsendelsesrør. Svarafgivelse: Slutsvar afgives 2-4 hverdage efter modtagelse af prøven. Bemærkninger: Gær og T. vaginalis kan også påvises ved direkte mikroskopi af vaginalsekret. Der undersøges ikke for Gardnerella vaginalis, da dyrkning er uspecifik og ikke får behandlingsmæssige konsekvenser. Bakteriel vaginose påvises ved opfyldelsen af 3 ud af 4 kriterier: tyndt, hvidligt homogent vaginalsekret påvisning af clue cells vaginalsekret ph >4.5 frigivelse af fiskeagtig lugt ved pådrypning af 10 % KOH Ovennævnte undersøgelser udføres i egen klinik. Varicella zoster virus (VZV) antistoffer (NPU12275) P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

146 Side 146 af 158 Princip: Påvisning af IgG antistoffer mod VZV med hjælp af Chemoluminescens immuno assay (CLIA) teknik. Indikation: Bestemmelse af immunstatus. For gravide med ukendt immunstatus med relevant eksponering, laves akut undersøgelse. Dette aftales med vagthavende læge på KMA. Mistanke om primær infektion (påvisning af serokonversion) eller reaktivering dvs. zoster. Prøvemateriale: Blod (serum) uden tilsætning SP/Webreq: Bestilles i best/ord Søgeord; Varicella (være opmærksom på at du er inde i fanebladet; installationslisten) Vælg; Varicella Zoster virus Ab (IgG);P (NPU 12275) Udfyld relevant felter og signer Gå til opgavelisten og print PTB Undersøgelse: varicella-zoster virus IgG antistof. Materiale: Serum eller koagelblod. Tidspunkt for prøvetagning: Utensilier: Prøvetagning: Så tidligt som muligt efter symptomdebut. Til evt. opfølgning tages en ny blodprøve efter 2 uger med angivelse af indikation samt oplysning om tidligere prøve. Tørglas. Venepunktur. Prøvemængde: 4-5 ml blod (2 ml serum). Minimum 1 ml blod (0,5 ml serum). Opbevaring: Forsendelse: I køleskab (4-8 C). Evt. i kølekasse. Ved forsendelse med postvæsenet anvendes forsendelseshylster. Svarafgivelse: 1-2 hverdage efter prøvens modtagelse i KMA. Tolkning: Ved primær VZV-infektion optræder serokonversion (skift fra negativt IgG resultat til positivt resultat). Titerbestemmelse udføres ikke, da det har ringe diagnostisk værdi. P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

147 Side 147 af 158 Varicella zoster virus (VZV) DNA (32020) Princip: Indikation: Prøvemateriale: Påvisning af VZV med PCR-teknik. Symptomer på VZV-læsioner på hud eller slimhinder. Pneumoni i forbindelse med primær skoldkoppeinfektion hos voksne. Pneumoni hos immunsupprimerede. Viral encephalitis Se encephalitudredning. Vesikelvæske eller podning fra læsioner på hud eller slimhinder. Trakealsekret. BAL SP/Webreq: Undersøgelse: varicella-zoster virus DNA/RNA. Materiale: vælg: brokoalveolær lavage (BAL), podning, trakealsekret eller vesikelvæske. Samt evt. lokalisation. Ved mistanke om encephalit vælges: encephalit-udredning (HSV+VZV) DNA/RNA. (Se denne) Tidspunkt for prøvetagning: Utensilier: Prøvetagning: Tidligst muligt i sygdomsforløbet, svarende til det vesikulære eller væskende stadium. Virus kan ikke påvises, når læsionerne er indtørrede eller skorpedækkede. eswab til svælg- og vesikelpodning, trakealsekret og BAL. Bristede vesikler podes med podepind eswab, som presses eller rulles mod sårets bund. Podepinden anbringes i det medfølgende transportmedium og afknækkes. Materiale fra de dybe luftveje udtages i sterilt spidsglas og sendes uden tilsætning. Opbevaring: I køleskab ved 4-8 C. Forsendelse: Evt. i kølekasse. Ved forsendelse med postvæsenet anvendes forsendelseshylster. Svarafgivelse: 1 til 3 hverdage efter prøvens modtagelse i KMA. P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

148 Side 148 af 158 Venezuelansk equine encephalitis virus IgG og IgM antistof (NPU53361) SP/Webreq: Undersøgelse: Venezuelan equine encephalitis virus, IgG og IgM Antistof. Materiale: serum eller koagelblod. VRE (vancomycin-resistente enterokokker), screening for (10117) Princip: Indikation: Prøvemateriale: Prøver fra hospitaliserede patienter bliver undersøgt med hurtigtest (PCR til påvisning af vancomycin-resistensgener). Positive prøver dyrkes efterfølgende til påvisning af vancomycin-resistente enterokokker. Hurtigtesten udføres og besvares samme dag, hvis prøven modtages inden kl. 20:00 (hverdag) eller 18:00 (weekend og helligdage). VRE-udbrud på afdelingen. Erkendt udbrud hvor hele afsnit/afdeling screenes, efter aftale med hygiejneorganisationen. Velkomstscreening. Screening af visse patienter ved indlæggelsen, efter aftale med hygiejneorganisationen Anden årsag, som o Medpatient til VRE pos pt o Overflytning fra anden udbrudsafdeling o Tidligere VRE pos patient o Ved direkte overflytning fra andre afdelinger/hospitaler o VRE-status ved udskrivelse Podning fra rectum eller stomi. SP/Webreq: Under Best/ord bestilles Enterokokker (Vancomycinresistente enterokokker) (VRE). Vælg Herlev, Podning og Rectum /Stomi abdomen. Ved prompten vælges i henhold til ovenstående indikationer. Undersøgelse: Vancomycinresistente enterokokker (VRE) (undersøgelse for) Materiale: podning (automatisk valgt), under Lokalisation, vælg: Rectum/Stomi på abdomen. Tidspunkt for prøvetagning: Før antibiotisk behandling startes. P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

149 Side 149 af 158 Utensilier: Prøvetagning: Opbevaring: Forsendelse: eswab. Rectum/fæces: Podepinden føres lige indenfor sphinter eller fæces berøres let med podepinden. Det er vigtigt at der ikke kommer for meget fæces på podepinden da en eventuel PCR-reaktionen ellers kan blive hæmmet. I køleskab (4-8 C). Evt. i kølekasse. Ved forsendelse med postvæsenet anvendes forsendelseshylster. Svarafgivelse: Hurtigtest besvares sammen dag, hvis prøven er ankommet inden kl. 20. Dyrkningssvar tager i gennemsnit 3-4 dage. Patienter negative med hurtigtest (PCR) kan afisoleres, med mindre patienten er kendt med VRE med en positiv prøve indenfor 6 mdr. Patienter positive for hurtigtest skal isoleres. Tolkning: Negativt svar afgives som Ingen vækst af Vancomycin Resistente Enterokokker (VRE). Positivt svar afgives som med Vækst af E. faecalis eller Vækst af E. faecium med følsomhedsbestemmelse og kommentar Vækst af VRE (Vancomycin Resistente Enterokokker). Patienten skal være isoleret ved indlæggelse på hospital. Ved vækst af VRE vil KMA kontakte rekvirenten med henblik på opfølgning. Negative hurtigtest svar afgives som vana gen ikke påvist. Positive hurtigtest svar afgives som vana gen påvist. Bemærkninger: I sjældne tilfælde vil dyrkningsverificerede VRE være forårsaget af vanb positive isolater, dette vil i så fald være angivet som vanb gen påvist. Voriconazol serumkoncentration (NPU27136) SP/Webreq: Kan kun bestilles på hospital. Undersøgelse: voriconazol (koncentrationsmåling) Materiale: Serum eller koagelblod. VZV, se Varicella zoster virus (VZV) DNA VZV-antistof, se Varicella zoster virus (VZV) antistoffer P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

150 Side 150 af 158 Væsker, led-, pleura-, perikardie-, p-dialysevæske, ascites m.m. (10011) Princip: Indikation: Prøvemateriale: Mikroskopi, dyrkning, identifikation og følsomhedsbestemmelse af bakterier og svampe. Symptomer på infektion i den pågældende anatomiske region. Pleura-, perikardie-, peritonealdialysevæske samt ascites. SP/Webreq: Undersøgelse: Dyrkning og resistens. Materiale: Ledvæske/ledvæske i bloddyrkningskolbe Lokalisation vælges (fx albueled) Pleuravæske/Pleuravæske (bloddyrkningskolbe) Peritonealdialysevæske (bloddyrkningskolbe) Acitesvæske/Acitesvæske (bloddyrkningskolbe) Ammemælk Bursavæske lokalisation vælges (fx fri tekst) Cystecæske lokalisation angives i fri tekst Drænvæske lokalisation vælges (fx galdeblære/galdegang) Galde Hæmatom anatomisk lokalisation vælges i fri tekst Fostervand Serom (Lymfe- og sårvæske) anatomisk lokalisation vælges i fri tekst Sæd Væske lokalisation vælges (fx peritoneum, pericardium) Sundhedsplatformen: Bestilles i best/ord Søgeord; dyrkning og resistens (være opmærksom på at du er inde i fanebladet; installationslisten) Vælge herefter Herlev hospital og prøve kategori; væsker og herefter ledvæske, ascitesvæske, pleuravæske eller andet væske Udfyldt alle relevante felter og signer. Gå til opgavelisten og print PTB. Tidspunkt for prøvetagning: Utensilier: Før antibiotisk behandling startes. 1. Sterilt spidsglas med skruelåg. 2. Aerob og anaerob bloddyrkningskolber benyttes til perikardie-, p- dialyse- og Acitesvæske. P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

151 Side 151 af Børnedyrkningskolbe til ledvæsker fra børn 4. Sprøjte 2 ml med Luer Lock Prøvetagning: Omhyggelig aseptisk teknik er helt afgørende. Der udføres huddesinfektion med 2 x jodsprit 2,5 % SAD liniment, eller hos patienter med jodallergi 2 x klorhexidinsprit 0,5 % i alkohol 70 %. Desinfektionsmidlerne skal tørre mellem påføringerne og inden punkturen. Efter desinfektion af indstiksstedet må dette ikke berøres, med mindre man har sterile handsker på. For at undgå jodforbrænding, aftørres jodet med sprit efter blodtagningen. Led-, pleura- og andre væsker: 2-5 ml kommes i spidsglas. Ved meget små prøvemængder, kan ledvæsken undtagelsesvis forblive i den sprøjte, der anvendtes til aspiration (se Abscesmateriale, aspireret pus). Ledvæske fra børn: Der injiceres 0,5 2 ml i børnebloddyrkningskolbe efter desinfektion af membranen med 70% sprit (ikke jodsprit). Perikardievæske, p-dialysevæske og ascites: 5 ml injiceres i bloddyrkningskolbe efter desinfektion af membranen. Et par ml kommes i sterilt spidsglas. NB! Jodsprit må ikke anvendes til desinfektion af membranerne. Prøvemængde: Se under prøvetagning, spidsglasset må kun fyldes halvt. Opbevaring: Forsendelse: Prøvemateriale i spidsglas opbevares i køleskab (4-8º C). Bloddyrkningskolber opbevares som ved bloddyrkninger. Spidsglas sendes i kølekasse, bloddyrkningskolber ukølet. Svarafgivelse: Såfremt der ved mikroskopi påvises bakterier og svampe, vil dette blive meddelt telefonisk til en autoriseret patient-ansvarlig medarbejder. Foreløbigt svar afgives 1 døgn efter modtagelse af prøven. Slutsvar afgives efter 2-5 døgn. P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

152 Væv, knogle og vævs-biopsier (10011) Side 152 af 158 Princip: Indikation: Prøvemateriale: Tidspunkt for prøvetagning: Utensilier: Mikroskopi, dyrkning, identifikation og følsomhedsbestemmelse af isolerede bakterier og svampe. Infektion i subcutis, fascie, muskel, knogle eller organer. Lokaliseret infektion i organ. Purulent artrit. Ulcus duodeni. Petekkialt udslæt ved meningokoksygdom. Vævsprøver udtaget ved kirurgisk indgreb, inkl. hjerteklapper og karproteser. Aspirat fra inficerede områder i organer, fx knoglemarv, lever eller nyre. Biopsi fra sårrand/-bund. Tages efter grundig afvaskning. Vævs- og knoglebiopsier fra knæ- eller hofte-alloplastik infektioner ad modum Kamme (5 biopsier fra det makroskopsk inficerede område med nyt sæt sterile instrument ved hver biopsi). Fistelgange bør undgås. Ledvæsker i sterilt spidsglas, se også Væsker. Ventrikelbiopsi for Helicobacter pylori (se nedenfor). Petekkier til undersøgelse for meningokokker (se nedenfor). Før antibiotisk behandling startes. Utensilievalget afhænger af prøvematerialet. Sprøjte Luer Lock Forsendelsesrør til sprøjte Spidsglas med skruelåg, sterilt. eswab til ventrikelbiopsi. Objektglas og forsendelsesetui. Prøvetagning: Aseptisk teknik. Ved små biopsier og ved forsendelsestid ud over nogle timer bør spidsglasset forsynes med 2-3 dråber sterilt fysiologisk saltvand for at undgå udtørring. Gastroskopisk ophentet biopsier anbringes i et eswab. Det skal fremgå tydeligt af rekvisitionen, at der ønskes undersøgt for Helicobacter pylori. Petekkier Ved bakteriæmi med petekkier, hvor der ikke kan påvises bakterier i spinalvæsken, kan mikroskopi og dyrkning af en petekkie i visse tilfælde give en hurtig bakteriel diagnose. Teknik: Efter desinfektion med hospitalssprit, løftes petekkien med P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

153 Side 153 af 158 steril kanyle og afsnittes med skalpel. Petekkien sendes i et par dråber sterilt fysiologisk saltvand til mikroskopi og dyrkning I tilfælde af specielle undersøgelser eller særlige problemstillinger bør vagthavende mikrobiolog kontaktes. Prøvemængde: Vævsstykker bør ikke være >1 x 1 cm. Kun ét vævsstykke pr. spidsglas. Spidsglas med aspireret materiale fyldes halvt. Opbevaring: Forsendelse: I køleskab (4-8º C). Så vidt muligt i kølekasse. Fremsendes hurtigst muligt. Svarafgivelse: Telefonisk svar til en autoriseret patientansvarlig medarbejder afgives ved prøver mærket hastesvar fra den rekvirerende afdeling samt efter lægeligt skøn. Foreløbigt svar afgives 1 døgn efter modtagelse af prøven. Slutsvar afgives efter 2-5 døgn. Tolkning: Sker i reglen i samarbejde med klinisk mikrobiolog. Bemærkninger: Ved undersøgelse for ventrikelbiopsi for Helicobacter pylori, foretages ikke rutinemæssig følsomhedsbestemmelse, men dette kan rekvireres for amoxicillin, metronidazol, tetracyclin og clarithromycin. West Nile virus DNA/RNA, IgG og IgM antistof (NPU27108/NPU53369) SP/Webreq: Kan kun bestilles på hospital. Undersøgelse: west nile virus DNA/RNA, IgG og IgM antistof. Materiale: Serum eller koagelblod. Yellow fever, se Gul feber virus PCR og antistof IgM, IgG Yersinia enterocolitica 0:3 antistof (NPU13815) Se Hvidovre Hospitals prøvevejledning) SP/Webreq: Undersøgelse: yersinia enterocolitica 0:3 antistof Materiale: Serum eller koagelblod. P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

154 Yersinia pestis DNA (12112) SP/Webreq: Undersøgelse: yersinia pestis DNA/RNA. Materiale: aspirat(opsug)eller væv. Samt evt. lokalisation. Side 154 af 158 Zikavirus antistof (IgG, IgM) (NPU53851) Zika Virus (RNA) (NPU54041) Zoonotisk fugle- og svineinfluenza (32113) SP/Webreq: Kan kun bestilles på hospital. Undersøgelse: influenza DNA/RNA (zoonotiske fugle- og svineinfluenzavirus) Materiale: podning Lokalisation: svælg. P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

155 Øjenpodning (10011) Side 155 af 158 Princip: Dyrkning, identifikation og følsomhedsbestemmelse af isolerede bakterier og svampe. Øjenpodninger fra nyfødte (<1 måned) undersøges rutinemæssigt for gonokokker. Ønskes undersøgelse for Chlamydia trachomati eller Neisseria gonorrhoeae, se Chlamydia trachomatis og Neisseria gonorrhoeae Indikation: Purulent konjunktivit. Keratin (OBS kontaktlinsebrugere). Endoftalmin, posttraumatisk, postoperativ eller endogen. Prøvemateriale: Pus fra conjunctiva/øjet. SP/Webreq: Undersøgelse: Dyrkning og resistens. Materiale: Podning. Lokalisation: Øje. Tolkning: Direkte mikroskopi af øjensekret kan være vejledende for initial diagnostik og behandling. Ved keratit bør viral ætiologi overvejes (herpes simplex, varicella zoster og adenovirus) overvejes. Ved conjunctivitis med negativ bakteriologi, bør adenovirusinfektion overvejes. Bemærkninger: Ved øjenpodninger fra patienter med keratit eller endoftalmi bør diagnosen tydeligt fremgå af rekvisitionen, idet mindre virulente bakterier og svampe kan være årsag til infektion hos disse patienter. Øjenpodning for Chlamydia og Gonokokker (12250) Princip: Indikation: Påvisning af Chlamydia trachomatis og Neisseria gonorrhoeae med genamplifikationsteknik (APTIMA Combo-test). Nyfødte: Inklusionsconjunktivitis. Denne undersøgelse erstatter ikke podning til dyrkning for gonokokker. Ved specifik mistanke om gonoré, anbefales podning med P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

156 Side 156 af 158 eswab til dyrkning for gonokokker samtidigt med APTIMA Combotest. SP/Webreq: Undersøgelse: Chlamydia og gonokokker DNA/RNA. Materiale: podning. Lokalisation: øje Utensilier: GEN-PROBE APTIMA Prøvetagningssæt til podning fra mænd og kvinder (unisex): podepind med blåt skaft til prøvetagning fra cervix, urethra, vagina, svælg, rectum og øjne. Reagensrør med GEN- PROBE APTIMA prøvetransportmedie. GEN-PROBE APTIMA Prøvetagningssæt til vaginalpodning (Multitest): Podepind og reagensrør med GEN-PROBE APTIMA prøvetransportmedie. Ørepodning (10011) Princip: Indikation: Prøvemateriale: Aerob dyrkning, identifikation og følsomhedsbestemmelse af potentielt patogene bakterier og svampe. Anaerob dyrkning udføres kun efter særlig anmodning og begrundelse, fx mastoidit, kronisk otitis media eller hjerneabsces. Akut otitis media i tilslutning til paracentesen. Diagnostisk udredning ved sekretorisk kronisk otitis media. Akut diffus ekstern otit eller malign ekstern otit. Sekret fra mellemøre eller ydre øregang. SP/Webreq: Undersøgelse: Dyrkning og resistens. Materiale: Podning. Lokalisation: Øre (mellemøre), Øre (ydre øre). Tidspunkt for prøvetagning: Utensilier: Før antibiotisk behandling påbegyndes. eswab Prøvetagning: Sekret eller pus opsamles på podepinden. Hvis prøven tages fra mellemøret i forbindelse med paracentesis, bør prøven tages gennem øretragt. Opbevaring: I køleskab (4-8 C). P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

157 Side 157 af 158 Forsendelse: Så vidt muligt i kølekasse. Ved forsendelse med postvæsenet anbringes eswab i forsendelsesrør. Svarafgivelse: Foreløbigt svar afgives 1 døgn efter modtagelse af prøven. Slutsvar afgives efter 2-5 døgn. Tolkning: Et evt. bakteriefund må bedømmes med forsigtighed pga. risiko for tilblanding af normalflora fra tilgrænsende områder. Bemærkninger: Der bør anføres under indikation på rekvisitionen om podningen stammer fra en patient med akut eller sekretorisk otitis media, ekstern otit, malign ekstern otit, og hvorvidt prøven er taget under operation. P:\Klinisk Mikrobiologisk Afdeling M\Dokumenter\Akkreditering\Instrukser\Alment\, Version 41.Docx

158 Bilag 1 Transport af prøver til Klinisk Mikrobiologisk Afdeling (KMA) på Herlev matriklen Servicebygningen, opgang 59, 5.sal PRØVER DER AFHENTES PÅ RUNDER AF PORTØR: Patientprøver til mikrobiologisk afdeling opbevares i afdelingens køleskab til patientprøver eller i umiddelbar nærhed af køleskabet inden afhentning. Prøverne afhentes af portør på følgende runder: Hverdage: Kl Kl. 12 Kl. 17 Sengetårnet etage Akutmodtagelsen Børnemodtagelsen Operationsgangen Sengetårnet etage Akutmodtagelsen Børnemodtagelsen Operationsgangen Ambulatorier og afdelinger i pavillonerne og på 3+4 sal i blok 05 Lørdag/søndag og helligdage: Kl Kl. 12 Kl. 17 Sengetårnet etage Sengetårnet etage Akutmodtagelsen Akutmodtagelsen Børnemodtagelsen Børnemodtagelsen Operationsgangen Operationsgangen Sengetårnet etage Akutmodtagelsen Børnemodtagelsen Operationsgangen Sengetårnet etage Akutmodtagelsen Børnemodtagelsen Operationsgangen PRØVER DER BESTILLES TIL NORMAL AFHENTNING AF PORTØR Prøverne bestilles til normal afhentning (dvs. afhentning indenfor 30 minutter). Afhentning bestilles i CSL (Columna Systematic Logistics). MRSA VRE Udlandsscreening Clostridium difficile Prøver modtaget i KMA senest kl. 20 på hverdage og senest kl. 18 på lørdag/søndag/helligdage svares ud samme dag. Influenza Prøver modtaget i KMA senest kl på hverdage og kl på lørdag/søndag/helligdage svares ud samme dag. Midt april-september: Analyserne laves på hverdage i dagtiden, men ikke lørdag/søndag/helligdage. PRØVER DER BESTILLES TIL HASTE AFHENTNING AF PORTØR Spinalvæske Alle dage mellem kl. 8 og 22: Malariapræparater Akutte prøver skal meldes til vagthavende mikrobiolog på Væv ved klinisk tlf: eller via omstillingen tlf: mistanke om nekrotiserende infek- minutter). Afhentning bestilles i CSL (Columna Systematic Logistics). Prøverne bestilles til haste afhentning (dvs. afhentning indenfor 15 tion Alle dage mellem kl. 22 og 8: Akutte prøver sendes til KMA, Rigshospitalet. Kontakt vagthavende mikrobiolog via omstillingen tlf: Prøverne sendes med taxa, se prøvevejledning for mikrobiologiske prøver. Prøver der skal på køl: Fx: podninger, urin, ekspektorat, fæces, væv, væsker Prøver der skal opbevares ved stuetemperatur: Fx: bloddyrkninger Emballering af prøver: Pakkes i gul plastpose med PTB og placeres i køleskab eller i umiddelbar nærhed af køleskab til patientprøver Ved tvivl kontakt Service og Logistik tlf.: eller KMA prøvemodtagelse tlf.: Bilag til mikrobiologisk prøvevejledning, Klinisk Mikrobiologisk afdeling, Herlev og Gentofte Hospital, april 2019