Studieplan Bioanalyse Semester 3

Transkript

1 OMRÅDET FOR SUNDHEDSUDDANNELSER Studieplan Bioanalyse Semester 3 Bioanalytikeruddannelsen i Odense Efterår 2017

2 Semester 3 Indhold 1. Fagets fokus og emner Lektionsplan Litteraturliste: Fagets læringsudbytter Overordnede læringsudbytter Detaljerede læringsudbytter Studieaktivitetsmodellen Feedback... 14

3 Semester Fagets fokus og emner Fokus for faget bioanalyse er, at den studerende opnår teoretisk viden og praktiske færdigheder inden for eksemplarisk valgte analyser og teknikker, i relation til semestrets andre fag. Bioanalyse er inddelt i nedenstående hovedemner. De behandlede analyse og teknikker er angivet i parentes. Biokemi II (Enzymanalyse) Molekylærbiologiske analyser I (DNA-isolering) Immunkemiske (Immunhistokemi) Histokemi (PAP-farvning)

4 Semester Lektionsplan (Opdateres løbende) Uge Dag Dato 44 Mandag 30/10 Mandag 30/10 Mandag 30/10 Mandag 30/10 Tirsdag 31/10 Torsdag 2/11 Lektion Emne Indhold Aktivitet Litteratur 2-4 Hold Hold Hold Hold Biokemi II Biokemi II Biokemi II Biokemi II Biokemi II Enzymanalyse (Bioanalyse) Måling af P-Basisk phosphatase, Kat.K. K1: Laboratorieøvelse K1: Laboratorieøvelse K2: Journalskrivning + forberede oplæg om egne undersøgelser i øvelsen (foto + tekst) 6 Biokemi II K4: Oplæg fra teams om særlige opgaver ved øvelse i enzymkemi 7 Substratanalyse + Point Of Care Testing (POCT) K1: Forelæsning Dialog og opgaver Litteratur anvendt i forløbet. Oplæg til journalark ligger på Fronter Links til oplysninger vedr. reagens, kalibrator og kontroller til Pentra 400: Pentra ALP cp rack bireagent Calibrator target abx pentra Multical Control target abx pentra n control Control target abx pentra p control I skal nok bruge andre også - dem må I selv findepå Horiba Medical BOR: s. 132 (Måling af substratmængder)

5 Semester 3 5 Torsdag 2/11 8 Biokemi II Enzymatisk måling af substratkoncentrationer Kliniske eksempler glukose Ketoner Kreatinin BIS: Kap. 13 s. 269n-270ø (Enzymes as Reagents) + kap. 14 s m + kap. 12 s. 252n-257m Skandinavisk afprøvning af laboratorieudstyr til primærsektoren(skup) Læs afsnittet: About SKUP Evalueringsrapport fra SKUP vedr. Contour Next: læs s bilag 1 s179.htm Vælg dokument ID: OUH, Undersøgelser udført uden for diagnostisk enhed (standard 2.8.5) Diverse informationer vedr. glukosemåling på Pentra 400 fra Horiba Medical 46 Onsdag 15/ Biokemi II Lipidmetabolisme -oxidation Ketonstoffer Ketogenese Fedtsyresyntese K4: Cooperative learning om lipidmetabolisme (1) kap. 15, s Tirsdag 5/12 Tirsdag 5/ Molekylærbiologiske analyser Molekylærbiologiske analyser 1 DNA-oprensning Isolering af DNA og RNA Fotometrisk kvalitetssikring af isoleret DNA mht. renhed og koncentration Fluorometrisk koncentrationsbestemmelse K1: Undervisning Oplæg og dialog Opgaver Arbejdsark findes i Fronter Opsamling i K4 i lektion 6 i faget kval.udv! (2) Kap. 4 s ø + s ø Link: Nucleic Acid Sample Preparation for Downstream Analyses (GE Healthcare) s ø Link til produktbeskrivelse: Magna Pure LC DNA Isolation Kit 1 (Roche) s Artikel: Noninvasiv prænatal test er et gennembrud inden for prænatal screening (Findes i Fronter). Læs 1. afsnit.

6 Semester 3 6 Onsdag 6/12 1 Molekylærbiologiske analyser 1 Elektroforse Elektroforse og visualisering af DNA K1: Undervisning Oplæg og dialog (2) Kap.5 s m + s. 93m-99n + figur 5.7 Torsdag 7/12 Torsdag 7/12 Fredag 8/12 Fredag 8/12 1-4, 6-7 Hold Hold 2 1-4, 6-7 Hold Hold 1 Molekylærbiologiske analyser 1 DNA-oprensning DNA isolering og kvalitetssikring mht. renhed, mængde og kvalitet Basal molekylærbiologi Det centrale dogme: DNA RNA DNA replikation Molekylærbiologiske analyser 1 Transkription Genregulering Translation DNA-oprensning DNA isolering og kvalitetssikring mht. renhed, mængde og kvalitet Basal molekylærbiologi Det centrale dogme: DNA RNA DNA replikation Transkription Genregulering Translation K1: Laboratorieøvelse Træning af praktiske færdigheder og teoretisk forståelse K2: Arbejdsark - det centrale dogme 1 og Arbejdsark - det centrale dogme 2 (Fronter) Forberedelse til undervisning i celledeling læs det opgivet litteratur K1: Laboratorieøvelse Træning af praktiske færdigheder og teoretisk forståelse K2: Arbejdsark - det centrale dogme 1 og Arbejdsark - det centrale dogme 2 (Fronter) Forberedelse til undervisning i celledeling læs det opgivet litteratur Øvelsesvejledning: Isolering og kvalitetssikring af DNA (Findes i Fronter) Journalark: Isolering og kvalitetssikring af DNA (Findes i Fronter) (3) s (4) s Øvelsesvejledning: Isolering og kvalitetssikring af DNA (Findes i Fronter) Journalark: Isolering og kvalitetssikring af DNA (Findes i Fronter) (3) s (4) s

7 Semester Mandag 11/12 Tirsdag 12/12 Tirsdag 12/12 Tirsdag 12/12 Onsdag 13/12 Onsdag 13/12 1 Fredag 5/1 Fredag 5/1 1-2 Molekylærbiologiske analyser 1 DNA-oprensning DNA isolering og kvalitetssikring mht. renhed, mængde og kvalitet Færdiggørelse af laboratoriejournal Journalen afleveres i Fronter senest d. 15. december Der gives mundtlig feedback på journalen d. 20. december i faget Biomedicin! Øvelsesvejledning: Isolering og kvalitetssikring af DNA (Findes i Fronter) Journalark: Isolering og kvalitetssikring af DNA (Findes i Fronter) Litteratur anvendt i undervisningsforløbet samt udvalgte produktbeskrivelse (Se øvelsensmappen) 1-2 Histokemi PAP-farvning K1: Undervisning Klinisk kompendium i cytologi (lægges på Fronter): s , 6 Histokemi 7 Histokemi K4: Vidensdeling 1-3 Hold Hold 1 Histokemi K1: Laboratorieøvelse Øvelsesvejledning Klinisk kompendium i cytologi (lægges på Fronter): s Histokemi 1 Immunkemiske 2-3 Immunkemiske Immunhistokemi Præparation Endogen aktivitet og epitop demaskering Immunkemisk detektion Kontrolsystemer og fejlfinding K1: Laboratorieøvelse K1: Undervisning Oplæg og dialog Arbejdsark findes i Fronter VYB: s (Læses vha. fokusspørgsmål) Ligger i Fronter. Immunohistochemical Staining Methods Education Guide (DAKO) - CONTROLS. Ligger i Fronter. Læses ifm. K2-aktivitet. Immunohistochemical Staining Methods Education Guide (DAKO) -TROUBLESHOOTING. Ligger i Fronter. Læses ifm. K2- aktivitet. Fredag 5/1 4 Immunkemiske K4: Vidensdeling Dialog om studieopgaver Ukendt primært karcinom/carcinommetastase fra ukendt primærtumor (Infonet region Syddanmark) (Læs følgende afsnit: formål og immunhistokemi) Lungekræft ((Infonet region Syddanmark) (Læs afsnittet om patologi) Supplerende materiale: Link: Immunohistochemical

8 Semester Tirsdag 9/1 1-4, 6-7 Hold 1 Immunkemiske Immunhistokemisk farvning K1: Laboratorieøvelse Øvelsen udføres i grupper af 3 personer jf. holdliste for mødetidspunkt. Øvelsesvejledning Øvelsesgrupperne sammensættes d. 3/1 i frokostpausen. Tirsdag 9/1 1-4, 6-7 Hold 2 Immunkemiske Journalskrivning Se journalark i Fronter. Litteratur anvendt i undervisningsforløbet Diverse produktbeskrivelser. Findes i Fronter under Laboratorieøvelser Hver gruppe á 3 personer udformer en journal, der afleveres tirsdag d. 16/1. Der gives skriftlig feedback via Fronter. Onsdag 10/1 1-4, 6-7 Hold 2 Immunkemiske K1: Laboratorieøvelse Øvelsen udføres i grupper af 3 personer jf. holdliste for mødetidspunkt. Øvelsesvejledning Øvelsesgrupperne sammensættes d. 3/1 i frokostpausen.

9 Semester 3 9 Onsdag 10/1 1-4, 6-7 Hold 1 Immunkemiske Journalskrivning Se journalark i Fronter. Litteratur anvendt i undervisningsforløbet Diverse produktbeskrivelser. Findes i Fronter under Laboratorieøvelser Hver gruppe á 3 personer udformer en journal, der afleveres torsdag d. 16/1. Der gives skriftlig feedback via Fronter. Torsdag 11/1 6-8 Immunkemiske Øvelsesgruppen færdiggør journalen. Det er muligt at mikroskopere i B.138. Litteratur anvendt i undervisningsforløbet Diverse produktbeskrivelser. Findes i Fronter under Laboratorieøvelser

10 Semester Litteraturliste: 1. Biokemi. København: Munksgaard; Buckingham L. Molecular Diagnostics - Fundamentals, methods and Clinical Applications. Second Edition. F.A. Davis; Jorde L, Carey, J, Bamshad M. Medical Genetics. 5th Revised edition. Elsevier; 4. Sand O, Sjaastad ØV, Haug E, Bjålie JG. Menneskets anatomi og fysiologi. 3. udg. Gads Forlag; Fagets læringsudbytter 4.1 Overordnede læringsudbytter Viden Den studerende kan: Forklare analyseprincipperne ved fotometrisk bestemmelse af enzymers katalytiske koncentration Forklare det histokemiske princip i en PAP-farvning Forklare analyseprincippet bag samt udførslen og kvalitetssikringen af udvalgte immunkemiske analyser og eksemplificere analyserne kliniske anvendelse Forklare analyseprincipperne bag og udførslen af udvalgte molekylærbiologiske analyser og teknikker samt eksemplificere deres kliniske anvendelse Færdigheder

11 Semester 3 11 Den studerende kan: Udføre og kvalitetssikre fotometrisk bestemmelse af et eksemplarisk enzyms katalytiske koncentration Identificere og diskutere typiske fejlkilder ved bestemmelse af enzymers katalytiske koncentration Udføre en PAP-farvning Identificere og diskutere typiske fejlkilder ved udførslen af udvalgte immunkemiske teknikker Identificere og diskutere typiske fejlkilder ved udførslen af udvalgte molekylærbiologiske analyser og teknikker 4.2 Detaljerede læringsudbytter (Opdateres løbende) Viden Den studerende kan: Forklare analyseprincipperne ved fotometrisk bestemmelse af enzymers katalytiske koncentration, herunder anvendelse af kalibrator og kontroller Forklare og begrunde valg af reaktionsbetingelser ved enzymanalyser, herunder substratkoncentration, temperatur, cofaktorer, ph og ionstyrke Forklare analyseprincippet ved fotometrisk bestemmelse af substratkoncentrationer ved hjælp af enzymkatalyserede reaktioner. Forklare principperne bag udvalgte metoder til lysering af celler og isolering af DNA og RNA Beskrive principperne bag udvalgte automatiserede systemer til isolering af DNA Beskrive fremgangsmåder til korrekt håndtering og opbevaring af DNA Forklare principperne bag hhv. horisontal gelelektroforese og kapillær gelelekroforese af DNA Beskrive anvendelsen af elektroforese i molekylærgenetiske sammenhænge Eksemplificere og begrund analyseresultater opnået ved gelelekroforese af DNA i relation til den kliniske anvendelse (Indgår også i forbindelse med undervisningsforløbet om PCR) Beskrive den praktiske udførsel af en horisontal gelelektroforse af DNA Beskrive detektionssystemer til visualisering af DNA i forbindelse med elektroforese Forklare analyseprincippet bag immunhistokemi Beskrive detektionssystemer, der anvendes i forbindelse med imunhistokemisk farvning herunder udvalgte polymerforstærkningsteknikker Forklare formålet med det enkelte trin ved udførslen af en immunhistokemisk farvning

12 Semester 3 12 Begrund nødvendige kontroller ved udførslen af en immunhistokemisk farvning Eksemplificere den immunhistokemiske tekniks anvendelsesmuligheder i den kliniske praksis inden for klinisk patologi Færdigheder Den studerende kan: Udføre og kvalitetssikre fotometrisk bestemmelse af basisk fosfatases katalytiske koncentration i en blodprøve, herunder: identificere, anvende og vurdere relevant kalibrering og materiale hertil identificere, anvende og vurdere relevante kvalitetskontroller og materiale hertil Diskutere og vurdere præanalytiske og analytiske forhold af betydning for analysekvaliteten ved bestemmelse af enzymers katalytiske koncentration, herunder identificere, anvende og vurdere materialer ved blodprøvetagning til bestemmelse af enzymers katalytiske koncentration diskutere og vurdere reaktionsbetingelser, der skal være tilstede ved bestemmelse af enzymers katalytiske koncentration Identificere og diskutere typiske fejlkilder ved udførslen af DNA-isolering vha. fast-fase ekstraktion Identificere og diskutere typiske fejlkilder når kvaliteten af isoleret DNA evalueres med hensyn til kvalitet, renhed og mængde vha. elektroforese og spektrofotometri Identificere og diskutere fejlkilder ved immunhistokemi, der kan medføre falsk positive og falsk negative resultater herunder begrund nødvendige kontrolsystemer

13 Semester Studieaktivitetsmodellen Undervisning og vejl. Simulationstræning Feedback Introduktioner mv. Semesterprøver og lign. Studieopgaver Journal-/rapportskrivning Udarbejdelse af oplæg e-læringsopbjekter Evalueringer Kategori 1 Deltagelse af undervisere og studerende initieret af underviser 24 timer Kategori 2 Deltagelse af studerende Initieret af underviser 27 timer Videndeling Opsamling på gr. arb. Vejledning Holdmøde Workshop Kategori 4 Deltagelse af undervisere og studerende initieret af studerende 6 timer Kategori 3 Deltagelse af studerende initieret af studerende 27 timer Egen forberedelse Selvstændig aktivitet Studieteam arb. Litteratursøgning Studiecafé

14 Semester Feedback Feedback fra underviser og medstuderende opnås gennem aktiv deltagelse i dialogbaseret undervisning og vidensdeling. Der gives desuden skriftlig og/eller mundtlig feedback på laboratoriejournalerne.