BD BBL Oxi/Ferm Tube II

Transkript

1 BRUGSANVISNING BBL Oxi/Ferm Tube II IA Rev.: April 2007 BD BBL Oxi/Ferm Tube II TILSIGTET BRUG BBL Oxi/Ferm Tube II er et brugsklart identifikationssystem til fermentative, oxidase-positive og til nonfermentative Gram-negative bakterier, der er isoleret fra kliniske prøver. PROCEDURENS PRINCIPPER OG FORKLARING Mikrobiologisk metode. Fermentative, oxidase-positive og nonfermentative, oxidase-positive eller -negative Gram-negative bakterier spiller en rolle som smitstoffer. Denne gruppe bakterier udnytter kulhydrater, først og fremmest ved oxidation og dog sjældent ved fermentering. Organismerne besidder normalt både enzymet catalase, som er i stand til at omdanne brintoverilte til vand og ilt, og enzymet oxidase (cytochrom c- oxidase), der hurtigt oxiderer dimethyl- eller tetramethyl-paraphenylendiamin. Oxidasetesten bruges til at adskille dem fra Enterobacteriaceae, som med undtagelse af Plesiomonas shigelloides er oxidasenegative [Der har i senere tid været fremlagt forslag om at inkludere P. shigelloides i Enterobacteriaceae arten på grund af organismens 16S rrna-sekvensering, og fordi organismen indeholder enterobakterielt almindeligt antigen. 1,2 Tidligere hørte organismen, som er oxidase-positiv, til Vibrionaceae]. Ved hjælp af klassiske biokemiske tests og på et senere tidspunkt en række bekræftende tests til udvalgte organismer, kan identifikationen af klinisk vigtige taksonomiske klassficeringer af nonfermentative, oxidase-positive eller negative og fermentative, oxidase-positive Gram-negative bakterier udføres ved hjælp af BBL Oxi/Ferm Tube II systemet. BBL Oxi/Ferm Tube II er et uafhængigt, inddelt plasticrør, der indeholder tolv forskellige medier til bestemmelse af 14 biokemiske reaktioner. Den vedlagte inokuleringstråd gør det muligt at inokulere alle kamre på én gang fra en enkelt eller fra nogle få enkeltkolonier af et isolat. Derudover kræver systemet brugen af en offline oxidase-test. Efter 48 h -inkubation aflæses resultaterne, og alle positive reaktioner noteres. De opnåede positive reaktioner kontrolleres hurtigt ved hjælp af resultatfelterne (Results Pad) og farvereaktionsoversigten (Color Reaction Chart). De kontrollerede positive tal lægges sammen, og det sammensatte tal lokaliseres derpå i BBL Oxi/Ferm Tube II biokodehåndbogen (Biocode Manual) for at identificere organismerne. Hvor to eller flere organismer er angivet, vises desuden de bekræftende tests, som er nødvendige for den videre identifikation. Følgende flowdiagram viser, hvordan oxidasetesten kan bruges til at skelne mellem bakterierne i Enterobacteriaceae familien og disse fermentative, oxidase-positive og nonfermentative, oxidase-positive eller negative Gram-negative bakterier, og når BBL Oxi/Ferm Tube II eller BBL Enterotube II anvendes: Ren dyrkning på nonselektivt medium Oxidasetest positiv negativ Inokulér BBL Oxi/Ferm Tube II Inokulér BBL Enterotube II Anaerob glukose Glukose Positiv Negativ Positiv Negativ* Aeromonas spp., Plesiomonas shigelloides, Vibrio spp. Achromobacter spp., Alcaligenes spp., Bordetella bronchiseptica, Moraxella spp., Pasteurella spp., etc. Enterobacteriaceae Acinetobacter spp., Stenotrophomonas maltophilia, etc. * Disse arter kan også identificeres med BBL Enterotube II systemet, men det kan være nødvendigt at anvende BBL Oxi/Ferm Tube II som bekræftelse. REAGENSER BBL Oxi/Ferm Tube II Substrater og andre aktive ingredienser (indeholdt i passende fastbase medier) og farvning af ikkeinokulerede medier: IA

2 Medium 1 (Ana-Gluc): Glukose (10,0 g/l), med bromthymol-blåt som ph indikator. Mediet er dækket af voks for at danne anaerobe forhold. Ikke-inokuleret: grønt. Medium 2 (Arginin): Arginin (10,0 g/l), med bromcresol-lilla som ph indikator. Mediet er dækket af voks for at danne anaerobe forhold. Ikke-inokuleret: gult. Medium 3 (Lysin): Lysin (10,0 g/l), med bromcresol-lilla som ph indikator. Mediet er dækket af voks for at danne anaerobe forhold. Ikke-inokuleret: gult. Medium 4 (Laktose/N 2 ): Laktose (20,0 g/l), kaliumnitrat (2,0 g/l) og natriumnitrit (0,5 g/l) sammen med phenol-rødt som ph indikator og dækket af voks for at tillade påvisning af gasdannelse. Ikke-inokuleret: rødt. Medium 5 (Saccharose/Indol): Saccharose (15,0 g/l) og tryptophan (1,2 g/l), med bromthymol-blåt som ph indikator. Ikkeinokuleret: grønt. Medium 6 (Xylose): Xylose (10,0 g/l), med bromthymol-blåt som ph indikator. Ikke-inokuleret: grønt. Medium 7 (Aer-Gluc): Glukose (10,0 g/l), med bromthymol-blåt som ph indikator. Ikke-inokuleret: grønt. Medium 8 (Maltose): Maltose (10,0 g/l), med bromthymol-blåt som ph indikator. Ikke-inokuleret: grønt. Medium 9 (Mannitol): Mannitol (10,0 g/l), med bromthymol-blåt som ph indikator. Ikke-inokuleret: grønt. Medium 10 (PA): Phenylalanin (1,0 g/l) og jernammoniumcitrat (1,0 g/l) i et passende basemedium. Ikke-inokuleret: beige. Medium 11 (Urea): Urinstof (20,0 g/l) med phenol-rødt som ph indikator. Ikke-inokuleret: beige, kan udvise et blegrosa skær. Medium 12 (Citrat): Natriumcitrat (2,0 g/l), med bromthymol-blåt som ph indikator. Ikke-inokuleret: grønt. FORHOLDSREGLER. Kun til professionel brug. Rørene må ikke anvendes, hvis de viser tegn på mikrobiel kontaminering, misfarvning, løsning af voks fra de pågældende medier, udtørring, revner eller andre tegn på nedbrydning. Enhver af følgende tilstande kan interferere med nøjagtigheden af BBL Oxi/Ferm Tube II: dehydrering eller forflydning, løsning af voks fra medieoverflader, enhver ændring af mediets farve fra farverne angivet under Ikke-inokuleret i afsnittet REAGENSER. Læs dokumentet GENEREL BRUGSANVISNING for procedurer til aseptisk håndtering, biologisk risiko og bortskaffelse af det brugte produkt. OPBEVARING OG HOLDBARHED BBL Oxi/Ferm Tube II opbevares efter modtagelse i mørke ved 2 til 8 C i den originale æske indtil ibrugtagningen. Undgå frysning og overophedning. Rørene kan inokuleres op til udløbsdatoen, og inkuberes i de anbefalede inkubationstider. Rør fra åbnede pakninger kan anvendes indtil udløbsdatoen. Åbnede rør skal bruges med det samme. BRUGERKVALITETSKONTROL Inokulér BBL Oxi/Ferm Tube II med de nedenfor viste stammer. Ved indpodning, inkubation og aflæsning følges beskrivelserne i afsnittet Testprocedure. IA

3 Organismer* Ana-Gluc. Arginin Lysin Laktose N Saccharose Indol Xylose Aer-Gluc. Maltose Mannitol Fenyl-alanin Urinstof Citrat Oxidase Typiske biokoder Ac. lwoffii ATCC Aer. hydrophila ± / ATCC 7966 B. bronchiseptica ATCC Br. diminuta ATCC Pl. shigelloides ± / ATCC Ps. aeruginosa ± / ATCC Ps. aeruginosa ATCC St. maltophilia ATCC / / / / * Ac. = Acinetobacter; Aer. = Aeromonas; B. = Bordetella; Br. = Brevundimonas; Pl. = Plesiomonas; Ps. = Pseudomonas; St. = Stenotrophomonas PROCEDURE Vedlagte materialer BBL Oxi/Ferm Tube II. Mikrobiologisk kontrolleret. Resultatfelter (Results Pad), inklusive en farvereaktionsoversigt til BBL Oxi/Ferm Tube II. Materialer, der ikke er vedlagt BBL Oxi/Ferm Tube II Biocode Manual, dokument nummer CM CE. Indole Dropper Reagent (Kovacs reagent), 50 ampuller, kat. nr Oxidase Dropper Reagent, 50 ampuller, kat. nr BD DrySlide Oxidase test (kat. nr , 75 tests) kan også anvendes. Materialer og reagenser til udførelse af de supplerende tests, som nævnt i BBL Oxi/Ferm Tube II Biocode Manual (biokodehåndbog). Prøvetyper BBL Oxi/Ferm Tube II er et biokemisk identifikationssystem. Systemet må ikke anvendes direkte med kliniske præparater. Brug isolater fra passende nonselektive medier (se Testprocedure). BBL Oxi/Ferm Tube II kan bruges til at identificere nonfermentative oxidase-positive eller negative og fermentative, oxidase-positive Gram-negative stave isoleret fra en prøve. Testprocedure Til indpodning af BBL Oxi/Ferm Tube II, anvendes der vækst fra nonselektive medier, såsom BD Columbia Agar with 5% Sheep Blood eller BD Trypticase Soy Agar II with 5% Sheep Blood. Den anvendte dyrkning skal være mindst 18 h gammel, men normalt ikke ældre end 48 h. Kun i meget sjældne tilfælde tager det længere tid for organismerne at danne vækst, der er tilstrækkelig til indpodning. Sørg for, at isolatet, der identificeres med BBL Oxi/Ferm Tube II, er en ren dyrkning fra en Gram-negativ stav. 1. Inden indpodningen af BBL Oxi/Ferm Tube II skal der laves en oxidasetest. Med denne test vil mikrobiologen være i stand til at bestemme, om den pågældende organisme tilhører Enterobacteriaceae eller en oxidativ-fermentativ Gram-negativ stav, og om et BBL Enterotube II eller et BBL Oxi/Ferm Tube II system skal inokuleres. Dryp én til tre dråber Oxidase Dropper Reagent ned på et stykke hvidt filterpapir lagt i låget til en petriskål. Udtag med en plastic podenål en synlig mængde vækst fra en enkelt eller flere identiske kolonier af isolatet fra pladen, der bruges til at tilføre podestoffet til indpodningen af BBL Oxi/Ferm Tube II. Bland podestoffet lidt i pletten med oxidasereagens på filterpapiret, og vent 15 til 30 sec. En mørkeblå til sort farve er tegn på en positiv oxidasereaktion. Brug ikke resultater, der aflæses efter 1 minut! BD DrySlide Oxidase testen kan også benyttes. Følg de vedlagte anvisninger. 2. Klargør et enkelt ark fra kodeblokken til isolatet ved at udfylde arket med patientens navn, prøvenummer og dato. IA

4 3. Skriv resultatet af oxidasetesten på dette ark. 4. Tag et enkelt BBL Oxi/Ferm Tube II rør frem, og skriv patientens navn, prøvenummer og dato på etiketten. 5. Fjern begge hætter. Indpodningstrådens spids findes under den hvide hætte. Uden at holde tråden over en flamme opsamles en velisoleret koloni med spidsen af tråden (figur 1). Stik ikke hul i agaret. 6. Inokulér BBL Oxi/Ferm Tube II ved først at vride tråden og derefter trække tråden tilbage med en drejende bevægelse - gennem alle kamrene (figur 2). 7. Før igen tråden (uden at sterilisere den) ind i BBL Oxi/Ferm Tube II, indtil indkærvningen på tråden ligger ud for røråbningen (figur 3). Trådspidsen skal kunne ses i citratkammeret. Knæk tråden ved indkærvningen ved at bøje den. Den del af tråden, der er tilbage i røret, opretholder de anaerobe forhold, der er nødvendige for at opnå ægte fermentering. 8. Brug den afbrækkede del af tråden til at trykke huller gennem folien over luftåbningerne ind til følgende kamre: sucrose/indol, xylose, aerob glukose (Aer-Gluc), maltose, mannitol, phenyl-alanin, urinstof og citrat (figur 4). Sæt begge hætter på igen. 9. Inkubér ved C i 48 h med BBL Oxi/Ferm Tube II liggende på den flade side eller oprejst. Sørg for at luft kan cirkulere mellem de inkuberede rør. Bemærk, at kammeret med urinstof skal kontrolleres efter 18 til 24 h inkubation, da oplysningerne på dette tidspunkt kan være nødvendige som en bekræftende test ( rapid urease test (hurtig urinstoftest), se BBL Oxi/Ferm Tube II biokodehåndbogen). Resultater Følg nedenstående anvisninger for at identificere isolatet. Oplysninger om udseendet af positive og negative reaktioner findes i tabel Efter 24 h inkubation aflæses kun reaktionen af urinstoftesten. Notér et positivt resultat, som eventuelt vil blive brugt til dette isolat som en supplerende test (rapid urease test). 2. Efter 48 h inkubation tolkes alle reaktioner. Med undtagelse af indol aflæses reaktionerne i rækkefølge ved at sammenligne mediernes farve i røret efter inkubation med farverne i farveoversigten på forsiden af kodeblokken - og (senere) med et uinokuleret BBL Oxi/Ferm Tube II, som først har fået stuetemperatur (figur 5). 3. Angiv hvert positivt testresultat, inklusive et positivt urinstofresultat efter 48 h, ved at sætte en ring om tallet neden under det pågældende kammer på resultatfelterne (Results Pad) (figur 6). 4. Test til sidst for dannelse af indol: Anbring BBL Oxi/Ferm Tube II vandret på bordet eller lodret i et stativ med anaerob glukose (Ana-Gluc) nedad. Anvend en kanyle eller den afbrækkede ende af en BBL Oxi/Ferm Tube II-indpodningstråd, eller smelt med en varm indpodningstråd for at udstanse eller smelte et hul på ca. 3-4 mm i diameter i plastfilmen over sucrose/indol kammeret. 5. Føj 3-4 dråber Kovacs-reagens (kat.-nr ) til sucrose/indol kammeret, og tilsæt reagens i kammeret. Lad reagensen komme i kontakt med mediets overflade. En positiv test ses ved, at det tilsatte reagens farves rødt inden for 10 sekunder. Hvis positiv, sættes der ring om det passende tal på arket. 6. Læg tallene med ring sammen, og skriv summen i feltet under pilene (figur 6). 7. De fem tal i disse felter læses som et biokodetal (fx 32303). 8. Find dette femcifrede tal i BBL Oxi/Ferm Tube II biokodehåndbogen. Dette tal bruges til at identificere organismens slægt og/eller art. Kodenummeret i det ovenstående eksempel og i figur 6 henviser til identifikationen af Pseudomonas aeruginosa. 9. Hvis der er vist mere end én organisme bag et profiltal, skal de bekræftende tests beskrevet i biokodehåndbogen udføres, så det er muligt at skelne mellem organismerne. Figur 1 Figur 2 Figur 3 IA

5 Figur 4 Figur 5 Figur 6: BBL Oxi/Ferm Tube II resultatfelter (Results Pad) Tabel 1: Negative og positive reaktioner i BBL Oxi/Ferm Tube II Reaktion Negativ Positiv Særlige bemærkninger KAMMER 1 Anaerob Glukose Arginindihydrolase Grøn, blå Gul Positiv fermentering ses ved et farveskift fra grøn (neutral) til gul (sur). De fleste oxidative-fermentative Gram-negative stave er negative. Grøn eller blå farve regnes for negativt. KAMMER 2 Gul, grå Lilla Decarboxylering af arginin resulterer i dannelse af alkaliske slutprodukter. Dette er vist ved et farveskift i den bromcresol-lilla indikator fra gul (sur) til lilla (alkalisk). Grå er negativ. KAMMER 3 Lysin Decarboxylase Gul Lilla Decarboxylering af lysin resulterer i dannelse af alkaliske slutprodukter. Dette er vist ved et skift i den bromcresol-lilla farve på mediet fra gul (sur) til lilla (alkalisk). Grå er negativ. KAMMER 4 Laktose Rød Gul Fermentering af laktose ses ved et farveskift fra rød (neutral) til gul (sur). De N 2 -gasproduktion Saccharose Grøn, blågrøn eller blå Voksoverlej ring løfter eller separerer Gul fleste oxidative-fermentative Gram-negative stave er negative. Dannelse af nitrogengas ses ved, at voksoverlejringen løfter sig eller separerer fra agarets overflade. Af og til påvises dannelse af nitrogengas også ved, at agaret separerer fra kammervæggen. KAMMER 5 Oxidation af dette kulhydrat ses ved et farveskift fra grøn (neutral) til gul (sur). Grøn eller blå farve regnes for negativt. Indol Farveløs Rød Alle reaktioner fra BBL Oxi/Ferm Tube II skal noteres, inden Kovacs indolreagenset tilsættes. Produktionen af indol fra nedbrydning af tryptophan som følge af det bakterielle enzym tryptophanase påvises ved udviklingen af en lyserød til rød farve, efter at Kovacs reagens er blevet tilsat. Reagenset tilsættes til kammeret efter, at kammeret har været inkuberet i 48 h.* IA

6 Xylose, aerob glu-kose, Maltose, Mannitol Grøn, blågrøn eller blå Gul KAMMER 6, 7, 8, 9 Oxidation af xylose, glukose, maltose og mannitol ses ved et farveskift fra grøn (neutral) til gul (sur). Grøn eller blå farve regnes for negativt. KAMMER 10 PA Beige Lysebrun Phenylalanin (PA) degraderes til phenyl-pyrodruesyre, som danner et brunligt kompleks med jernsalte. Ethvert brunt skær skal tolkes som en positiv reaktion. KAMMER 11 Urinstof Beige Lilla Urease, et enzym, der dannes af en række mikroorganismer, hydrolyserer urinstof til ammoniak, hvilket bevirker, at farven på mediets phenol-røde indikator skifter fra beige (sur) til lyserød eller lilla (alkalisk). Svag rosa farve regnes for negativt. KAMMER 12 Citrat Grøn Blå Denne test påviser organismer, som er i stand til at udnytte citrat i form af dets natriumsalt som eneste kulstofkilde. Organismer, som er i stand til at udnytte citrat, producerer alkaliske metabolitter, som ændrer mediets ph, hvilket resulterer i, at den bromthymol-blå indikators farve skifter fra grøn (neutral) til blå (alkalisk). Ethvert blåt skær skal tolkes som en positiv reaktion. * Kovacs indolreagens kan opløse pyorubin, hvilket forårsager, at der udvikles en rød-brun misfarvning, der ukorrekt kan tolkes som en positiv indolrreaktion. Fejlen kan undgås ved at tilsætte Kovacs reagens under plasticfolien i stedet for direkte på agaret. FUNKTIONSDATA OG PROCEDURENS BEGRÆNSNINGER BBL Oxi/Ferm Tube II er specielt beregnet til identifikation af ikke-kræsne, nonfermentative, oxidasepositive eller -negative og fermentative, oxidase-positive Gram-negative bakterier isoleret fra kliniske prøver. En række publikationer om kvaliteten af systemet henviser til en identifikationsnøjagtighed på 87 til 93 %. 3-5 Procedurerne under Testprocedure skal nøje overholdes for at der fås korrekte identifikationer. Hvis der indhentes kodenumre, som kræver yderligere, bekræftende tests, skal disse udføres som angivet i TILLÆG 2 OG 3 i biokodehåndbogen (Biocode Manual). Funktionsdata Nøjagtighed: En undersøgelse af kvaliteten af 220 tidligere identificerede stammer (inklusive kendte ATCC dyrkninger) blev analyseret ved hjælp af BBL Oxi/ferm Tube II identifikationssystemet. De opnåede resultater var følgende: tre af prøverne var ikke i stand til at give en identifikation med en konkurrerende metode, ti af prøverne var ikke i stand til at give en identifikation med BBL Oxi/Ferm Tube II, seks prøver udviste resultater for identisk slægtsbestemmelse men afvigende art sammenlignet med den konkurrerende metode, og fem prøver udviste afvigende slægtsbestemmelse ved sammenligning med konkurrentmetoden. Disse data angiver en 97 % overensstemmelse mellem de to metoder med hensyn til identifikation af slægt og art. De anvendte prøver er vist i tabel 2 sammen med en angivelse af slægt, art, antal testede stammer og procentdelen af organismer, der gav positive biokemiske reaktioner i hvert kammer på BBL Oxi/Ferm Tube II. IA

7 Tabel 2: Resultater af funktionsevaluering Antal testet Ana-Gluc. ARG LYS LAC N2 SAC IND XYL Aer-Gluc. MAL MAN PA URE CIT OXI Acinetobacter A. calcoaceticus A. Iwoffii* Achromobacter A. xylosoxidans Aeromonas Aer. hydrophila* Alcaligenes Al. denitrificans* Bordetella B. bronchiseptica Flavobacterium F. species Moraxella M. species Pasteurella P. multo-cida Plesiomonas Pl. shigelloides Pseudomonas and related genera Delftia acidovorans Burkh cepacia Ps. aeruginosa Ps. fluorescens Ps. mendocina Ps. putida Ps. species Ps. stutzeri Ralstonia pickettii St maltophilia Vibrio V. alginolyticus V. parahaemolyticus Forkortelser: A.= Achromobacter; Aer.= Aeromonas; Al.= Alcaligenes; B.= Bordetella; F.= Flavobacterium; M.= Moraxella; P.= Pasteurella; Pl.= Plesiomonas; Burkh.= Burkholderia; Ps.= Pseudomonas; St.= Stenotrophomonas; V.= Vibrio. IA

8 Procedurens begrænsninger BBL Oxi/Ferm Tube II er beregnet til de vedlagte taksonomiske klassificeringer (slægter og arter). Taksonomiske klassificeringer ud over dem, der er angivet i tabel 3, er ikke beregnet til brug med dette system. Profiltal mærket med et L i biokodehåndbogen er opnået med kun et begrænset antal stammer. Sandsynligheden af disse tal er ikke blevet fastlagt. BBL Oxi/Ferm Tube II biokoder kan ikke bruges til at fastlægge fænotypisk identitet blandt isolater fra identiske eller forskelligartede prøver. Biokemiske resultater indhentet ved hjælp af BBL Oxi/Ferm Tube II kan variere fra andre metoder og fra litteraturen. BBL Oxi/Ferm Tube II biokoder kan ikke bruges til at fastlægge fænotypisk identitet blandt isolater fra identiske eller forskelligartede prøver. Identifikation af Gram-negative bakterier skal foretages med hensyntagen til andre egenskaber, som fx prøvens kilde, patientanamnese, koloni- og mikroskopisk morfologi, serologi og antimikrobielle følsomhedsmønstre. Identifikation af sjældne isolater skal gentages, eller der skal testes yderligere for at verificere disse organismers identifikation. Visse arter af organismer kan udvise atypiske biokemiske reaktioner som følge af usædvanlige ernæringskrav eller mutationer og kan derfor være vanskelige at identificere. Visse organismer kan kræve inkubationstider over 48 h, for at en korrekt identifikation kan opnås. På trods af at der i den senere tid har været fremlagt forslag om at inkludere Plesiomonas shigelloides i Enterobacteriaceae på grund af organismens 16S rrna sekvensering og fordi organismen indeholder det enterobakterielle almindelige antigen, inkluderes denne organisme i databasen til BBL Oxi/Ferm Tube II. 1,2 Tabel 3: Oversigt over slægter og arter i BBL Oxi/Ferm Tube II databasen (revision: juli 2003) ORGANISMENS TAKSONOMISKE KLASSIFICERING Acinetobacter baumannii/calcoaceticusa Acinetobacter haemolyticusa Acinetobacter lwoffiia Aeromonas caviae Aeromonas hydrophila Aeromonas veronii bv. sobria Aeromonas veronii bv. veronii Achromobacter xylosoxidans subsp. denitrificans Achromobacter xylosoxidans subsp. xylosoxidans Alcaligenes faecalis Alcaligenes faecalis (odorans) Alcaligenes spp. Bordetella bronchiseptica Brevundimonas diminuta Brevundimonas vesicularis Burkholderia cepacia complex b Burkholderia pseudomallei Chromobacterium violaceum Chryseobacterium indologenes Chryseobacterium meningosepticum Comamonas testosteroni/terrigena Delftia acidovorans Empedobacter brevis Flavobacterium spp Kingella denitrificans Moraxella spp. Myroides odoratus Ochrobactrum anthropi Oligella urethralis IA Tidligere designationer og yderligere oplysninger Acinetobacter calcoaceticus Aeromonas sobria Aeromonas veronii Alcaligenes denitrificans Achromobacter xylosoxidans, Alcaligenes xylosoxidans Alcaligenes odorans Pseudomonas diminuta Pseudomonas vesicularis Burkholderia cepacia, Pseudomonas cepacia Pseudomonas pseudomallei Flavobacterium indologenes Flavobacterium meningosepticum Pseudomonas testosteroni Comamonas acidovorans, Pseudomonas acidovorans Flavobacterium breve Kan inkludere arter med ny slægtsdesignation, fx Myroides, Chryseobacterium, Sphingobacterium, etc. d Kan inkludere Psychrobacter phenylpyruvicus (førhen Moraxella phenylpyruvica) d Flavobacterium odoratum Gruppe Vd Moraxella urethralis

9 Pasteurella multocida Plesiomonas shigelloidesc Pseudomonas aeruginosa Pseudomonas alcaligenes Pseudomonas fluorescens Pseudomonas mendocina Pseudomonas oryzihabitans Pseudomonas putida Pseudomonas spp. Pseudomonas stutzeri Ralstonia pickettii Pseudomonas pickettii Rhizobium (Agrobacterium) radiobacter Agrobacterium tumefaciens Shewanella putrefaciens Pseudomonas putrefaciens Sphingobacterium multivorum Flavobacterium multivorum Sphingomonas paucimobilis Pseudomonas paucimobilis Stenotrophomonas maltophilia Pseudomonas maltophilia, Xanthomonas maltophilia Vibrio alginolyticus Vibrio cholerae Vibrio mimicus Vibrio parahaemolyticus Vibrio vulnificus a Slægten Acinetobacter består af 23 genomarter. Hovedparten af kliniske glukoseoxiderende stammer af Acinetobacter er A. baumannii. De fleste hæmolytiske stammer er A. haemolyticus, og de fleste glukose-negative, ikke-hæmolytiske stammer er A. lwoffii. 6 b Burkholderia cepacia består af ni genomarter. 6 c Plesiomonas shigelloides blev for nylig tildelt til Enterobacteriaceae, selv om organismen er oxidase-positiv. 6 d Der henvises til de respektive kapitler i litteraturhenvisning 6 for detaljer. LITTERATUR 1. Abbott, S.L Klebsiella, Enterobacter, Citrobacter, Serratia, Plesiomonas, and other Enterobacteriaceae. In: Murray, P. R., E. J. Baron, J.H. Jorgensen, M. A. Pfaller, and R. H. Yolken (ed.). Manual of clinical microbiology, 8th ed. American Society for Microbiology, Washington, D.C. 2. Martinez-Murcia, A.J., S. Beniloch, and M.D. Collins Pylogenetic interrelationships of members of the genera Aeromonas and Plesiomonas as determined by 16S ribosomal RNA sequencing: lack of congruence with results of DNA-DNA hybridizations. Int. J. Syst. Bacteriol. 42: Oberhofer, T.R Use of the API 20 E, Oxi/Ferm, and Minitek systems to identify nonfermentative and oxidase-positive fermentative bacteria: seven years of experience. Diagn. Microbiol. Infect. Dis. 1: Sanyal, S.C Evaluation of a test-kit (Oxi/Ferm system) for identification of vibrios. Zbl. Bakteriol. Hyg. A 251: Koestenblatt, E.K., D.H. Larone, and K.J. Pavletich Comparison of the Oxi/Ferm and N/F systems for identification of infrequently encountered nonfermentative and oxidase-positive fermentatitive bacilli. J. Clin. Microbiol. 15: Murray, P. R., E. J. Baron, J.H. Jorgensen, M. A. Pfaller, and R. H. Yolken (ed.) Manual of clinical microbiology, 8th ed. American Society for Microbiology, Washington, D.C. Emballering/Bestilling BBL Oxi/Ferm Tube II Kat. nr rør YDERLIGERE OPLYSNINGER Kontakt den lokale BD repræsentant angående yderligere oplysninger. BD Diagnostic Systems Tullastrasse 8 12 D Heidelberg/Germany Phone: , Fax: Reception_Germany@europe.bd.com IA

10 BD Diagnostic Systems Europe Becton Dickinson France SA 11 rue Aristide Bergès Le Pont de Claix/France Tel: Fax: BD, BD logo, BBL, Trypticase and DrySlide are trademarks of Becton, Dickinson and Company. Oxi/Ferm and Enterotube are trademarks of Becton Dickinson GmbH. ATCC is a trademark of the American Type Culture Collection Becton, Dickinson and Company IA