Løsninger til opgaverne den Spm. A: Spm. B Spm. C:
|
|
- Adam Thorsen
- 6 år siden
- Visninger:
Transkript
1 Løsninger til opgaverne den Spm. A: Her er vi i en situation at det eneste der kendes til vores receptor er, at den kan binde en ligand, som vi har til rådighed i en radioaktiv mærket version. For at klone vasopressin receptor cdna må vi anvende expressionskloning i Xenopus oocytter, som angivet i værktøjskassen. Vi må så anvende vores radioaktive vasopressin til at identificere de oocytter, der udtrykker funktionel vasopressin receptor. Så vi må screene os frem til den rigtige cdna klone ved at bruge binding af den radioaktive vasopressin ligand som verifikation af at receptoren er til stede. Spm. B: Vi må lave reverse transkription efterfulgt af PCR. Til reverse transkription kan vi bruge en polydt primer. Som op primer kan vi bruge følgende sekvens: 5 atgctcctggtgtctacc 3 (Tm = 4 x x 8) = 56 o C Som down primer kan vi anvende 5 tcaggagggtgtatccttc 3 (Tm = x 8) = 56 o C. For at klone receptor cdnaet I en vector ville det være smart og påsætte genkendelsessites for restriktionsenzymer i 5 enden af primerne. Spm. C: Her må vi lave overlap extension PCR som angive i værktøjskassen. Vi kan lægge vores primer et sted opstrøms for den kodende region af pre-pro-delen. F. Eks. Helt til venstre: Op-primeren (A) bliver så: 5 caagaagattacaaactatcaa 3 (Tm = 56 o C) Primeren til overgangen mellem pre-pro-delen og vasopressin (B) bliver følgende: 5 ccaggagcattcttttatccaaagatacccct 3 (Tm = 56 o C) Den understregde sekvens er komplementær til den sidste del af pr-pro-delen før spaltningsstedet. Resten er komplementær til den kodende del af starten af vasopressin receptoren. Op-primeren til amplifikation af vasopressin receptor delen (C) bliver følgende: 5 ggataaaagaatgctcctggtgtctacc 3 (Tm = 56 o C) Den understregede sekvens er magen til starten af vasopressin receptor cdna. Den anden del er identisk med sekvensen umiddelbart før pre-pro-spaltningsstedet. Vi kunne også vælge kun at have en hale på den ene primer, f.eks. opprimeren til amplifikation af vasopressin receptor cdna. Halen ville vi så vælge så lang, at den ville have en smeltetemperatur på 56 o C. Down primeren (D) skal være komplementær til slutningen af vasopressin receptor cdna.0 5 tcaggagggtgtatccttc 3 (Tm = 56 o C)
2 Vi foretager nu PCR I et rør med primerne A + B og I et andet rør med primerne C + D. Dernæst anvender vi en lille smule af disse fragmenter som template til en ny PCR reaktion med primerne A + D. Dermed har vi fået fusioneret vores pre-pro-del til vasopressin receptor cdna. Hvis vi vil klone vores fusion kan vi sætte nukleotider for restriktions-enzym-genkendelses-sites i 5 enden af vores to yder primere (A + D) A C B D Spm.D: Springer vi over og vender tilbage til i detaljer i Gentek 2. Men dtet jo klart at plasmidet skal indeholde et replikationsorigin til E. coli (p15a) og et til gær (2μ), samt en selektionsmarkør til E. coli (bla som giver resistens mod beta-lactam antibiotika som penicillin) og en selektionsmarlør til gær (URA3, der koder for et enzym i uracil biosyntesen; gærstammen skal så være ødelagt i sit URA3 gen). Der skal også være en promoter til transkription af vores vasopression cdna). Spm. E + F: Det ville jo være rart at kunne vise, om der akkumulerer er mrna, når nu der ikke akkumulerer noget protein. For at påvise mængden af mrna har vi i hvert fald tre muligheder.vi kunne derfor fremstille et Northern blot med en vasopressin specifik probe og en probe, der rammer et konstitutivt udtrykt gen. Det signal vi opnår med den sidste probe tjener som en normaliserings kontrol. Det
3 betyder, at vi kan normalisere vores signal fra vasopressin mrna til signalet fra vores konstitutivt udtrykte gen. Vi kunne lave RNase protection med en probe specifik for vasopression mrna og en probe specifik for et konstitutivt udtrykt gen. Eller vi kunne lave real time PCR på revers transkriberet mrna. Det sidste ville være det mest kvantitative og nemmeste at lave. Det ville også være rart at vise, om der rent faktisk skete syntese af vores vasopressin receptor protein. Når det ikke akkumulerer kan det jo betyde, at nedbrydningen er hurtigere end syntesen. For at måle syntesen kan vi lave et pulse experiment, hvor vi mærker cellens protein med 35 S-methionin og cystein i kort tid. Ved slutningen af pulsen udtager vi en lille mængde celler, som vi homogeniserer, tilsætter anti-vasopressin-antistof og senere sepharose-kugler coated med protein A (Se under immunoprecipitation i værktøjskassen). Derved laver vi et pull-down forsøg. Det fældede protein-antistof-proteina-sepharose kompleks spindes ned i en centrifuge, vaskes og separeres ved SDS-PAGE. Efter PAGE analyseres gelen ved autoradiografi eller på en FosfoImager. Hvis der sker proteinsyntese vil vi få et radioaktivt bånd på vores gel. En anden mulighed ville være at lave en polysom analyse (se værktøjskassen). Polysomer er mrna dækket af ribosomer. Jo flere ribosomer, der sidder på mrnaet, jo bedre translateret er mrnaet. mrna med 0, 1, 2, 3, 4, 5 o.s.v. ribosomer på kan fraktioners i en sukrosegradient ved ultracentrifugering. Tapper vi nu fraktioner ud af gradienten (som vist i værktøjskassen), kan vi analysere RNA indholdet i de enkelte fraktioner på et Northern blot, RNase protection eller real-time PCR. Er vores vasopressin receptor mrna associeret med mange ribosomer vil det vandre langt ned i gradienten, hvis det er nøgent vil det ikke vandre ned i gradienten. Ud fra positionen i gradienten ved man fra tidligere forsøg, hvor mrna med forskellig antal ribosomer ligger. For at bestemme halveringstiden af vorees vasopressin receptor in vivo kan vi lave et pulse-chase forsøg (se værktøjskassen). Her mærker vi vores celler med 35Smethionin og cystein i en kort periode. I denne periode bliver alle proteiner som er under syntese mærkes (hvis de indeholder cys/met). Efter denne puls periode indleder vi et chase ved at tilsætte et så stort overskud af kold (ikke-radioaktiv) met/cys at der i praksis ikke vil indkorporeres mere radioaktivitet under cellens proteinsyntese. Vi isolerer protein fra celler lige før tilsætning af koldt met/cys og til forskellige tidspunkter derefter. For at bestemme hvor meget radioaktivt mærket vasopressin receptor protein der er i cellen til de forskellige tidspunkter, foretager vi
4 immunoprecipitation og adskiller immunoprecipitatet i en SDS holdig poly-akrylamid gel. Iintensiteten i den immunoprecipiterede vasopressin receptor bestemt ved fosfoimage analyse er et mål for, hvor meget af den oprindeligt mærkede receptor, der er tilbage i cellen. Intensiteten i vores vasopressin-receptor bånd plottes i semi-log papir som funktion af tiden efter pulsen. Dette gør vi, da nedbrydning af makromolekyler førlger 1. ordens kinetik. D.v.s. at dn/dt = k d N hvilket giver N(t) = N (t = 0) exp ( k d t). Logaritmeres denne ligning får vi: Log{N(t)/N(t = 0)}= k d t Hvor k d er nedbryningshastigheden. Halveringstiden er den tid der går til halvdelen af proteinet er forsvundet. Det er således tiden mellem 100% protein og 50% protein. Eller mellem 50% og 25%. Sammenhængen mellem kd og t½ kan bestemmes ud fra ovenstående ligning ved at indsætte t = t½ og N(t½) = ½ N(t = 0)
5 Opgave 1juni 1999 Spm. A: Her skal vi klone i en lambda replacement vektor. Vi kan så klone ca. 20 kb i vektoren. Vi skærer det genomiske DNA partielt med Sau3A til vi opnår fragmenter med en gennemsnitsværdi på ca. 20 kb. Disse ligeres til lambdavektorens venstre og højre arme efter skæring med BamHI. DNAet pakkes in vitro og bruges til at inficere en E. coli stamme. Da vi har en cdna klon til rådighed kan vi bruge cdnaet som probe efter mærkning med radioaktivitet eller et kemiloumiscerende stof. Spm. B: Det er smart at bakteriestammen indeholder en lysogen P2 fag, da vi så bortselekterer ikke rekombinante lambda fager, da kun red - gam - fager kan gro på en sådan stamme. Dette er vigtigt da vi ellers ikke kan være sikre på hvor stort vores bibliotek i virkeligheden er (altså hvor stor procent del af de plaqes, der udgør biblioteket der ret faktisk er rekombinante) Spm. C:Hvis vi gerne vil analysere promotoren af vores gen er det vigtigt at undersøge promotoren i en celletype, hvor den er aktiv. Det nytter således ikke at analysere en leverspecifik promotor i en cellelinje fra nyre. Derfor er det vigtigt, at verificere at den cellelinje, man vælger at bruge tillader promotoren at være aktiv. Dette kan undersøges med et Northern blot. 28S proben er taget med for, at man kan normalisere sine resultater (kompensere for om der ikke er sat lige meget RNA i hver brønd på gelen). Spm.D: Her skal vi huske, at det vi genererer ved vores sekvensreaktion er den streng som er komplementær til den viste (DNA polymerasen kan kun sætte nukleotider på en fri 3 ende). Når vi læser sekvensgelen nedefra og op læser vi den komplementære sekvens fra 5 enden mod 3 enden. Sekvensen på gelen indtil primer extensionproduktet giver: 5 GTACATCTGCTCCTGTTTCTAAGAC 3 Den komplementære sekvens (den der er vist i figuren) til den vi har læst på gelen giver: 5 GTCTTAGAAACAGGAGCAGATGTAC 3 Det første G idenne sekvens er således transkrtiptionsstartsitet. Spm.E: Denne metode er i virkligheden 5 RACE. Vi kan lave 5 RACE produktet, sekventere det og sammenligne sekvensen med sekvensen af det genomiske DNA. Herved kan vi bestemme transkriptionsstartsitet.
6 Spm. F: Dette er et eksempel på en klassisk promoteranalyse, hvor vi fusionerer promotoren til et reportergen, som her er luciferase. Aktiviteten af reporterproteinet kan så bestemmes ved at måle den lysmængde som luciferasen udsender. Der er så propertionalitet mellem antal luciferase proteiner og mængden af udsendt lys. Når vi analyserer data som de viste (og alle mulige andre) er det vigtigt at vide, hvor signifikant data er. Vi må derfor tage hensyn til spredningerne på data. Spredningerne på de viste data er nogle steder meget store. Det betyder også,at de eneste der er signifikant forskellige fra vildtypepromotoren er de tre sidste konstruktioner før pgl3-basic. Så de områder,der er vigtige for promoteraktiviteten,må ligge i det,der i figuren hedder untranslated exon. Generelt ved transiente transfektionsforsøg vil man co-transficere med et plasmid der indeholder en konstitutiv promoter fusioneret til et andet reportergen. Grunden hertil er at vi ikke får den samme transfektionseffektivitet hver gang vi transficerer celler. Det vil selvfølgelig gøre det umuligt at sammenlige to forskellige konstruktioners reportergenaktivitet (jo flere celler der optager plasmidet jo højere aktivitet vil vi selvfølgelig få). Da transfektionseffektiviteten for kontrolplasmidet og vores promoter-reporterfusion er den samme, kan vi korrigere for transfektionseffektivitet ved at normalisere til reporteraktiviteten fra vores kontrolplasmid. Spm. G: Et eksempel på et EMSA assay.vi kan se fra den venstre figur, at der findes protein i kerneekstraktet, der kan binde til O1 oligonukleotidet. Vi kan også se at O1 og OC men ikke NT kan udkonkurrere denne binding. Bindingen er altså reversibel. På Figuren til højre kan vi se, at αoct1 proteinet er en del/det hele af dette shiftede kompleks, idet tilsætning af anti-αoct1 antistof forårsager et supershift. Så Oct1 bindingssitet har en potentiel rolle i regulering af hccr2 promotoren. Vi skal huske på at et EMSA assay er et in vitro assay og at binding af et protein til promoten ikke nødvendigvis er det samme, som at proteinet kan aktivere transkriptionen.
Spm. A: Hvad viser data i Figur 1?
Opgave 1 Leptin er et plasma proteinhormon der primært produceres af og secerneres fra fedtceller (adipocytter). Leptin, der er kodet af ob (obecity) genet, er 16 kda stort. Leptins fysiologiske funktion
Læs mereBesvarelse af opgaverne til den Spm.A: efter TGA TCA Spm. B:
Besvarelse af opgaverne til den 20-9-06 Spm.A: Her vil vi gerne sætte et relativt lille stykke DNA (FLAG) sammen med et relativt stort stykke (PRB1). Det lille stykke er for lille til at vi kan PCR amplificere
Læs mereLøsninger til opgaverne den Opgave 2 januar 2003 Spm. 1:
Løsninger til opgaverne den 6-9-06 Opgave 2 januar 2003 Spm. 1: Fidusen er her at vi kender den primære struktur af glukoamylasen fra tre forskellige svampe, en ascomycet, en basidiomycet og en zygomycet.
Læs mereBesvarelse til opgave 1 januar 1999 Spm. A: Spm. B:
Besvarelse til opgave 1 januar 1999 Spm. A: Vi må lave et genomisk bibliotek i en lambdafag, cosmid, BAC eller YAC plasmid. Til dette vil vi skære det genomiske DNA partielt med Sau3A, så vi får stykker
Læs mereOpgave 1 Spm. A: Spm. B:
Opgave 1 Familien af TM7 receptorer (receptorer med 7 transmembrane segmenter) udgør ud fra genomsekvensen den største proteinfamile i C. elegans. Det samme må forventes at gælde i pattedyr. Imidlertid
Læs mereCYP7A1 (0,1 nm) CYP7A1 (0nM) UBIC (0,1 nm)
Opgave 1 Leveren spiller en central rolle i lipid metabolismen og i opretholdelse af lipid homeostasen i hele kroppen. Lipidmetabolismen er fejlreguleret hos blandt andet svært overvægtige personer samt
Læs mereFigur 1: Strukturelt kort over plasmiderne pyeast og pmamal anvendt til undersøgelse af
Opgave 2 juni 1999 DNA rekombination er vigtig for eukaryote celler i forbindelse med meiosen. Samtidig er rekombination mellem fremmed DNA og endogen DNA essentiel i fremstillingen af transgene organismer
Læs mereEn forsker har lavet et cdna insert vha PCR og har anvendt det følgende primer sæt, som producerer hele den åbne læseramme af cdna et:
F2011-Opgave 1. En forsker har lavet et cdna insert vha PCR og har anvendt det følgende primer sæt, som producerer hele den åbne læseramme af cdna et: Forward primer: 5 CC ATG GGT ATG AAG CTT TGC AGC CTT
Læs meredatp, dctp, dgtp, dttp, [α 32 P]-dCTP urinstofholdig polyacrylamid gel røntgen film
Opgave 1 Denne opgave omhandler osteoblast differentiering. Osteoblast celler er involveret i opbygning af knoglevæv. Osteoblast celler dannes ud fra såkaldte calvarial celler. For at forstå det molekylære
Læs mereSpm. B: Hvad viser data i Figur 2?
Opgave 1 Kernereceptorer (nuclear receptors) udgør en familie af ligandaktiverede transkriptionsfaktorer, der regulerer transkription af en række gener, som respons på tilstedeværelse af f.eks.lipofile
Læs mereAugust Krogh Building Copenhagen University. Universitetsparken 13 2100 Copenhagen OE PAPedersen@aki.ku.dk
Per Amstrup Pedersen Institute of Molecular Biology August Krogh Building Copenhagen University Universitetsparken 13 2100 Copenhagen OE PAPedersen@aki.ku.dk En genteknologisk værktøjskasse. Version 2007
Læs mereBiologi opgave Opsamling: Cellebiologi (Bioanalytiker modul3)
1 Delphine Bonneau Biologi opgave Opsamling: Cellebiologi 1-6 Pelle har spist en kæmpe stor kage, og efterfølgende stiger hans blodsukker. Derfor sender kroppen besked til de endokrine kirtler i bugspytkirtlen
Læs merePCR (Polymerase Chain Reaction): Opkopiering af DNA
PCR (Polymerase Chain Reaction): Opkopiering af DNA PCR til at opkopiere bestemte DNA-sekvenser i en prøve er nu en af genteknologiens absolut vigtigste værktøjer. Peter Rugbjerg, Biotech Academy PCR (Polymerase
Læs mereFigur 1: A, nukleotidsekvensen af starten og slutningen af RPB1 genet. Initierings- og terminerings
Opgave 2 juni 2004 Eukaryote celler indeholder 3 forskellige RNA polymeraser. Hver RNA polymerase er ansvarlig for transkription af bestemte klasser af gener. Ud fra mutationsanalyse i bagegær (Saccharomyces
Læs mereStruktur og funktion af gener
Molekylærbiologi og genetik S4, F2008 f Malene Munk Jørgensen Emne: Struktur og funktion af gener Link: undervisningsplanen for S4-molekylærbiologi og genetik MMJ, VI niversity ollege Bioanalytikeruddannelsen
Læs mereUdarbejdet af Anna-Alexandra Grube Hoppe
METODER - BIOKEMI For medicinstuderende - Panuminstituttet UDARBEJDET AF ANNA-ALEXANDRA GRUBE HOPPE RESTRIKTIONSENZYM ANALYSE (E: 329-330) Restriktionsenzym analyse er en metode, der bruges til at kortlægge
Læs mereVelkommen. Test dit eget DNA med PCR. Undervisningsdag på DTU Systembiologi. Undervisere:
Velkommen Test dit eget DNA med PCR Undervisningsdag på DTU Systembiologi Undervisere: Hvem er I? 2 DTU Systembiologi, Danmarks Tekniske Universitet Hvilke baser indgår i DNA? A. Adenin, Guanin, Cytosin,
Læs mereSide%1%af%14% Eksamen: Bioinformatik It og Sundhed 27 Jan 2011 kl 9-13
Side1af14 Eksamen: Bioinformatik It og Sundhed 27 Jan 2011 kl 9-13 Navn: Studie nummer: Dette eksamenssæt vil også kunne ses som en pdf fil nederst på kursus-hjemmesiden udfor den sidste dag d. 27 Jan
Læs mereRestriktionsenzymer findes Genkendelsessekvens
Restriktionsenzymer Skanning Restriktionsenzymer findes i bakterier (forsvarsmekanisme) IKKE i eukaryote celler 3-5 - 5-3 - Restriktionsenzyme Genkendelsessekvens Palindromisk Otto, Anna, radar Madam I
Læs mereGAPDH PCR modul Manual
GAPDH PCR modul Manual Katalog nr. 166-5010EDU explorer.bio-rad.com Kopiering kun tilladt til undervisningsbrug Bemærk: Kittet indeholder temperaturfølsomme dele. Åbn derfor straks kassen og læg de pågældende
Læs mereTest dit eget DNA med PCR
Test dit eget DNA med PCR Forsøgsvejledning Navn: Side 1 af 7 Formål med forsøget Formålet med dette forsøg er at undersøge jeres arvemateriale (DNA) for et transposon kaldet Alu. Et transposon er en DNA
Læs mereOpgave 1 november 2004
Opgave 1 november 2004 Nedenfor er vist nukleotidsekvensen af cdna kodende for eif2α genet fra mus. Serin nummer 51 (S51) kan fosfoyleres af en eller flere eif2α kinaser. For at undersøge den biologiske
Læs mereTest dit eget DNA med PCR
Test dit eget DNA med PCR Navn: Forsøgsvejledning Formål med forsøget Formålet med dette forsøg er at undersøge jeres arvemateriale (DNA) for et transposon kaldet Alu. Et transposon er en DNA sekvens,
Læs mereTest dit eget DNA med PCR
Test dit eget DNA med PCR Navn: Forsøgsvejledning Side 1 af 8 Formål med forsøget Formålet med dette forsøg er at undersøge jeres arvemateriale (DNA) for et transposon kaldet Alu. Et transposon er en DNA
Læs mereSide 1 af 14. Eksamen: Bioinformatik It og Sundhed 27 Jan 2011 kl 9-13
Side 1 af 14 Eksamen: Bioinformatik It og Sundhed 27 Jan 2011 kl 9-13 Navn: Studie nummer: Dette eksamenssæt vil også kunne ses som en pdf fil nederst på kursus-hjemmesiden udfor den sidste dag d. 27 Jan
Læs mereBiosensor Niveau 1. Teori
Biosensor Niveau 1 Teori Inden du starter... For at kunne forstå teorien som ligger til grund for en biosensor er det vigtigt at du har styr på nogle generelle mikro/molekyler biologiske principper, begreber
Læs mereTest dit eget DNA med PCR
Test dit eget DNA med PCR Navn: Forsøgsvejledning Side 1 af 8 Formål med forsøget Formålet med dette forsøg er at undersøge jeres arvemateriale (DNA) for et transposon kaldet Alu. Et transposon er en DNA-sekvens,
Læs mereSide 1 af 13. Eksamen: Bioinformatik It og Sundhed 27 Jan 2011 kl 9-13
Side1af13 Eksamen: Bioinformatik It og Sundhed 27 Jan 2011 kl 9-13 Navn: Studie nummer: Dette eksamenssæt vil også kunne ses som en pdf fil nederst på kursus-hjemmesiden udfor den sidste dag d. 27 Jan
Læs mereat du trænes i at genkende aminosyrer i en simpel proteinstruktur (pentapeptid = lille protein bestående af 5 (penta) aminosyrer)
Elevvejledning til det Virtuelle Kræftlaboratorium Det Virtuelle Kræftlaboratorium stiller krav til en grundig forståelse af det centrale dogme inden for molekylærbiologien, hvordan DNA oversættes til
Læs mereFaktor V Leiden mutation
Faktor V Leiden mutation Formål: finde ud af om individ har mutation i faktor V Leiden gen (missense: arginin glutamin) Materiale: oprens DNA fra leukocytter Metode: PCR med specifikke primere, oprens,
Læs mereTest dit eget DNA med PCR
Test dit eget DNA med PCR Navn: Forsøgsvejledning Side 1 af 8 Formål med forsøget Formålet med dette forsøg er at undersøge jeres arvemateriale (DNA) for et transposon kaldet Alu. Et transposon er en DNA-sekvens,
Læs mereProtokol for genetisk bestemmelse af ABO blodtyper
Page1 Udarbejdet i samarbejde mellem: Kåre Lehmann, Annabeth Høgh Petersen, Anne Rusborg Nygaard og Jørn M. Clausen Page2 VIGTIGT: SKIFT PIPETTE SPIDSER/TIPS EFTER HVER GANG!! Så undgår du at forurene
Læs mereDNA origami øvelse 2013. DNA origami øvelse
DNA origami øvelse Introduktion I denne øvelse bruger vi DNA origami teknikken til at samle en tavle af DNA med dimensioner på 70 nm x 100 nm. Tavlen dannes af et langt enkeltstrenget DNA molekyle, der
Læs mereTEST 1. Almen Cellebiologi 2004/2005
TEST 1 Almen Cellebiologi 2004/2005 Hvilken af følgende udsagn er forkerte? a) kun planteceller har en cellevæg b) planteceller har microtubuli c) planteceller har chloroplaster d) planteceller har actin
Læs mereDanmarks Tekniske Universitet
Side 1 of 14 Danmarks Tekniske Universitet Skriftlig prøve, den 21/1-2013 Kursus navn: Kursus nr. 27633 Introduktion til Bioinformatik Tilladte hjælpemidler: Alle "Vægtning" Angivet ved de individuelle
Læs mereCellekernen (Nucleus) Sebastian Frische Anatomisk Institut
Cellekernen (Nucleus) Sebastian Frische Anatomisk Institut Cellekernen Cellekernens overordnede struktur kernemembranen/nucleolemma kromatin nucleolus Cellecyklus faser i cellecyklus faser i mitosen Størrelse:
Læs mereSide 1 of 11. Kursus navn: Kursus nr Introduktion til Bioinformatik
Side 1 of 11 Danmarks Tekniske Universitet Skriftlig prøve, den 22/1-2015 Kursus navn: Kursus nr. 27633 Introduktion til Bioinformatik Tilladte hjælpemidler: Alle "Vægtning" Angivet ved de individuelle
Læs mereDNA origami øvelse DNA origami øvelse
DNA origami øvelse Introduktion I denne øvelse bruger vi DNA origami teknikken til at samle en tavle af DNA med dimensioner på 70 nm x 100 nm. Tavlen dannes af et langt enkeltstrenget DNA molekyle, der
Læs mereAnalyse af proteiner Øvelsesvejledning
Center for Undervisningsmidler, afdeling København Analyse af proteiner Øvelsesvejledning Formål At separere og analysere proteiner i almindelige fødevarer ved brug af gelelektroforese. Teori Alle dele
Læs mereDNA origami øvelse. Introduktion. DNA origami øvelse 3 timer 2018
DNA origami øvelse Introduktion I denne øvelse bruger vi DNA origami teknikken til at samle en tavle af DNA med dimensioner på 70 nm x 100 nm. Tavlen dannes af et langt enkeltstrenget DNA molekyle, der
Læs mereStudienummer: MeDIS Exam 2015. Husk at opgive studienummer ikke navn og cpr.nr. på alle ark, der skal medtages i bedømmelsen
MeDIS Exam 2015 Titel på kursus: Uddannelse: Semester: Videregående biokemi og medicinudvikling Bachelor i Medis 5. semester Eksamensdato: 26-01-2015 Tid: kl. 09.00-11.00 Bedømmelsesform 7-trin Vigtige
Læs mereCaseuge 1.1: Anatomi og fysiologi
Modulplan for modul 1.1, Introduktion til basalfagene, 2017 Vigtigt: Modulplanens læringsmål angiver pensum. I tillæg til læringsmålene for forelæsninger, studiesal, kliniske øvelser og kliniske ophold,
Læs mereVelkommen. Test dit eget DNA med PCR. Undervisningsdag på DTU Systembiologi. Undervisere: Sebastian, Louise og Ana
Velkommen Test dit eget DNA med PCR Undervisningsdag på DTU Systembiologi Undervisere: Sebastian, Louise og Ana Hvem er I? 2 DTU Systembiologi, Danmarks Tekniske Universitet Dagens program 9:00 10:00 Introduktion
Læs mereMenneskets væskefaser
Menneskets væskefaser Mennesket består af ca. 60% væske (vand) Overordnet opdelt i to: Ekstracellulærvæske og intracellulærvæske Ekstracellulærvæske udgør ca. 1/3 Interstitielvæske: Væske der ligger mellem
Læs mereBanan DNA 1/6. Formål: Formålet med øvelsen er at give eleverne mulighed for at se DNA strenge med det blotte øje.
Banan DNA Formål: Formålet med øvelsen er at give eleverne mulighed for at se DNA strenge med det blotte øje. Baggrundsviden: Om vi er mennesker, dyr eller planter, så har alle organismer DNA i deres celler.
Læs mereDanmarks Tekniske Universitet
Side 1 of 17 Danmarks Tekniske Universitet Skriftlig prøve, den 21/1-2013 Kursus navn: Kursus nr. 27633 Introduktion til Bioinformatik Tilladte hjælpemidler: Alle "Vægtning" Angivet ved de individuelle
Læs mereNOD2 ekspression i tarmepitelceller
Roskilde Universitet, Den Naturvidenskabelige Bacheloruddannelse, Hus nr. 14 NOD2 ekspression i tarmepitelceller 2. semesterprojekt - forår 2015 Gruppe 6: Joachim Wittrup Højris Jensen Nicholas Philip
Læs mereUndervisningsbeskrivelse fra august 2014
Undervisningsbeskrivelse fra august 2014 Stamoplysninger til brug ved prøver til gymnasiale uddannelser Termin Oktober 2015 Institution Hansenberg Gymnasium Uddannelse Fag og niveau Lærer(e) Hold HTX Bioteknologi
Læs mereOpgave 1 Slankemidler
Opgave 1 Slankemidler Overvægt er et stigende problem i den vestlige verden, og der er derfor udviklet forskellige slankemidler. Et eksempel på et slankemiddel er Orlistat. Den kemiske struktur af Orlistat
Læs mereSide 1 of 12. Kursus navn: Kursus nr Introduktion til Bioinformatik
Side 1 of 12 Danmarks Tekniske Universitet Skriftlig prøve, den 20/1-2014 Kursus navn: Kursus nr. 27633 Introduktion til Bioinformatik Tilladte hjælpemidler: Alle "Vægtning" Angivet ved de individuelle
Læs mereVEROCYTOTOKSIN-PRODUCERENDE BAKTERIOFAGER I E. COLI
VEROCYTOTOKSIN-PRODUCERENDE BAKTERIOFAGER I E. COLI Specialeprojekt i Biologi-bioteknologi, KU Patricia Espenhain Sørensen 13. juni 2017 RATIONALE Verocytotoxin-producerende E. coli (VTEC) / (STEC) - Vigtig
Læs mereEukaryote mrna Processering
Eukaryote mrna Processering Splicing Capping Poly-adenylering Post-transkriptionel regulering af genexpression Simpel prokaryotisk gen-ekspression Alt RNA bliver syntetiseret af en enkelt RNA-polymerase
Læs mereNr 1. Fra gen til protein
Nr 1 Fra gen til protein Med udgangspunkt i vedlagte illustrationer bedes du besvare følgende: Hvordan er sammenhængen mellem DNA ets nukleotider og proteinets aminosyrer? Beskriv hvad der sker ved henholdsvis
Læs mereBioteknologi A Kommentarer til opgaveformuleringer i opgavesættet 31. maj 2011
Bioteknologi A Kommentarer til opgaveformuleringer i opgavesættet 31. maj 2011 Spørgsmålene i opgavesættene stilles som udgangspunkt i den betydning der fremgår af listen over typeord, som findes på ministeriets
Læs mereOpgave 1 Listeria. mørkviolette bakteriekolonier, se figur 1a. og b. 1. Angiv reaktionstypen for reaktion. 1 vist i figur 1b.
Opgave 1 Listeria Bakterien Listeria monocytogenes kan være sygdomsfremkaldende for personer, der i forvejen er svækkede. For at identificere Listeria kan man anvende indikative agarplader. Her udnyttes
Læs mereDNA origami øvelse DNA origami øvelse
DNA origami øvelse Introduktion I denne øvelse bruger vi DNA origami teknikken til at samle en tavle af DNA med dimensioner på 70 nm x 100 nm. Tavlen dannes af et langt enkeltstrenget DNA molekyle, der
Læs mereNye og traditionelle metoder i planteforædling. Søren K. Rasmussen Institut for Plante- og Jordbrugsvidenskab, 27. september 2016
Nye og traditionelle metoder i planteforædling Søren K. Rasmussen Institut for Plante- og Jordbrugsvidenskab, 27. september 2016 12-10-2016 2 Traditionel forædling Vælge forældrene Krydse forældrene Selektere
Læs mereBIOLOGI A-NIVEAU NY ORDNING. Tirsdag den 19. august 2008. Kl. 09.00 14.00 STX082-BIA STUDENTEREKSAMEN AUGUST 2008
STUDENTEREKSAMEN AUGUST 2008 BIOLOGI A-NIVEAU Tirsdag den 19. august 2008 NY ORDNING Kl. 09.00 14.00 Af opgaverne 1, 2, 3 og 4 skal tre og kun tre af opgaverne besvares STX082-BIA Undervisningsministeriet
Læs mere3u BI, terminsprøve (Bio A)
3.u BI, terminsprøve, 2018 MV 3u BI, terminsprøve (Bio A) Torsdag den 12/4, 2018, kl. 9-14. Af opgaverne 1, 2, 3, og 4 skal tre, og kun tre, afleveres Tilladte hjælpemidler: Bøger, kompendier, noter, lommeregner.
Læs mereKOMMISSIONENS FORORDNING (EU) / af
EUROPA- KOMMISSIONEN Bruxelles, den 29.5.2018 C(2018) 3193 final KOMMISSIONENS FORORDNING (EU) / af 29.5.2018 om ændring af forordning (EF) nr. 847/2000 for så vidt angår definitionen af udtrykket "lignende
Læs mereKRIMINALDETEKTIVEN GERNINGSSTEDETS GÅDE PCR
KRIMINALDETEKTIVEN GERNINGSSTEDETS GÅDE Elevvejledning PCR PCR trin for trin PCR involverer en række gentagne cykler, der hver består af følgende tre trin: Denaturering, primer påsætning og forlængelse
Læs mereEksamensspørgsmål til biocu til mandag d. 10. juni 2013
Eksamensspørgsmål til biocu til mandag d. 10. juni 2013 Nr. 1. Fra gen til protein. Hvordan er sammenhængen mellem DNA ets nukleotider og proteinets aminosyrer? Beskriv hvad der sker ved henholdsvis transskription
Læs mereBioteknologi A. Gymnasiale uddannelser. Vejledende opgavesæt 1. Mandag den 31. maj 2010 kl. 9.40-14.40. 5 timers skriftlig prøve
Vejledende opgavesæt 1 Bioteknologi A Gymnasiale uddannelser 5 timers skriftlig prøve Vejledende opgavesæt 1 Mandag den 31. maj 2010 kl. 9.40-14.40 Side 1 af 8 sider pgave 1. Genmodificeret ris Vitamin
Læs mereBioteknologi A. Studentereksamen. Af opgaverne 1 og 2 skal begge opgaver besvares. Af opgaverne 3 og 4 skal en og kun en af opgaverne besvares.
Bioteknologi A Studentereksamen Af opgaverne 1 og 2 skal begge opgaver besvares. Af opgaverne 3 og 4 skal en og kun en af opgaverne besvares. frs111-btk/a-31052011 Tirsdag den 31. maj 2011 kl. 9.00-14.00
Læs mereProtokol for genetisk bestemmelse af ABO blodtyper
Page1 Udarbejdet i samarbejde mellem: Kåre Lehmann, Annabeth Høgh Petersen, Anne Rusborg Nygaard og Jørn M. Clausen Page2 VIGTIGT: SKIFT PIPETTE SPIDSER/TIPS EFTER HVER GANG!! Så undgår du at forurene
Læs mereHOXA9 og CDX2 i relation til leukæmi
HOXA9 og CDX2 i relation til leukæmi Gruppe 5 Kristina Berg, Mathilde Schmidt, Ninette Jensen, Sabrina Wielsøe & Sophie Tolstrup 2. Semesterprojekt, Forår 2013 Roskilde Universitet, Nat. Bach, 2. semester,
Læs mereGenekspression. GENEKSPRESSION side 1
Genekspression 2006 GENEKSPRESSION side 1 Indholdsfortegnelse Kapitel 1... 3 Proteinsyntese... 3 Regulering af gener i E. coli.... 8 Transskription hos eukaryoter... 14 Eukaryot genregulering... 16 Efterbehandlig
Læs mereStudienummer: MeDIS re-exam 2014
MeDIS re-exam 2014 Course title: Programme: Semester: Videregående biokemi og medicinudvikling Bachelor in Medis 5. Semester Exam date: 25-2-2014 Time: Kl. 9.00 til 11.00 Evaluation form 7-point scale
Læs mereAnmeldelse af genteknologiske forskningsprojekter samt genteknologisk storskalaforsøg eller produktion
Anmeldelse af genteknologiske forskningsprojekter samt genteknologisk storskalaforsøg eller produktion Anmeldelse til Arbejdstilsynet efter Arbejdsministeriets bekendtgørelse om genteknolog og arbejdsmiljø
Læs meremrna-status Verifikation Ved Promoter Varianter
En bachelorafhandling ved Molekylærgenetisk Diagnostisk Afsnit, Rigshospitalet, København. mrna-status Verifikation Ved Promoter Varianter Afprøvning af en ny metode indenfor functional promotor assays
Læs mereBiotechnology Explorer. Protein Fingerprinting
Biotechnology Explorer Protein Fingerprinting Instruktionsmanual Katalognummer 166-0100EDU explorer.bio-rad.com Delene i dette kit er sendt i seperate æsker. Opbevar proteinstandarderne i fryseren, ved
Læs mereDet innate virusforsvar. TLR7, TLR8, TLR9, MDA5, RIG I og type I interferoner
Det innate virusforsvar. TLR7, TLR8, TLR9, MDA5, RIG I og type I interferoner A kursus i teoretisk og immunologi TLR3 og LGP 2 Odense, 13. april 2015 Søren T. Lillevang Klinisk Immunologisk Afdeling Odense
Læs mereDer er to hovedtyper af genhæmningsmedicin: antisenseoligonukleotider (ASO'er) og RNA-interferens (RNAi). Denne artikel handler om RNA-interferens.
Forskningsnyheder om Huntingtons Sygdom På hverdagssprog Skrevet af forskere. Til det globale HS-fællesskab At skyde budbringeren med enkeltstrenget RNA-genhæmning Ny 'enkelt-strenget' RNA-genhæmningsmedicin
Læs mere# Problemet med genetisk ustabilitet
Forskningsnyheder om Huntingtons Sygdom På hverdagssprog Skrevet af forskere. Til det globale HS-fællesskab Et DNA-reparerende protein ændrer stabiliteten af lange CAG-områder i det muterede gen for Huntingtons
Læs mereLNA til behandling af Cancer mammae
LNA til behandling af Cancer mammae LNA as treatment of Cancer mammae Hus 13.1 Gr. 5 Jvaria Afzal, Steffen Thorlund Bertelsen, Troels Godballe, Nanna Søndergaard Jeppesen, Pernille Damgaard Petersen og
Læs mereSommereksamen 2012 Med korte, vejledende svar
1 Sommereksamen 2012 Med korte, vejledende svar Titel på kursus: Uddannelse: Semester: ksamensdato: Tid: Bedømmelsesform Det hæmatologiske system og immunsystemet Bacheloruddannelsen i Medicin/Medicin
Læs mereBiomarkører. Lars P. Nielsen Professor, overlæge Speciallæge i klinisk mikrobiologi, Statens Serum Ins>tut, Biomarkørlaboratoriet. LPN@ssi.
Biomarkører Lars P. Nielsen Professor, overlæge Speciallæge i klinisk mikrobiologi, Statens Serum Ins>tut, Biomarkørlaboratoriet. LPN@ssi.dk Biomarkører Molekyler, som afspejler forekomst og udvikling
Læs mereForsvar mod meldug i byg 8/1-07
Forsvar mod meldug i byg 8/1-07 Meldugsvampens angreb på bygplanten aktiverer en række interessante gener der fungerer i reguleringen af plantens forsvar. Modtagelig David B. Collinge, Michael K. Jensen
Læs mereElevvejledning pglo transformation
Introduktion til transformation Elevvejledning pglo transformation I denne øvelse skal du lære fremgangsmåden ved genetisk transformation. Husk på, at et gen er et stykke DNA, der indeholder informationer
Læs mereMaterialeliste: Ready-to-loadTM DNA prøver til elektroforese. Medfølgende reagenser og tilbehør. Egne materialer
Elevvejledning 1 Materialeliste: Ready-to-loadTM DNA prøver til elektroforese A B C D E F Plasmid DNA (uskåret) Plasmid skåret med Bgl I Plasmid skåret med Eco RI Lambda DNA (uskåret) Lambda DNA skåret
Læs mere(19) DANMARK (11) DK 176078 B1 +tb (12) PATENTSKRIFT
(19) DANMARK (11) DK 176078 B1 +tb (12) PATENTSKRIFT Patent- og Varemærkestyrelsen (51) Int.C1. 8: C 12 N 7/00 (2006.01) C 12 N 15/00 (2006.01) G 01 N 33/569 (2006.01) (21) Patentansøgning nr: PA 1990
Læs meredobbelt strenget DNA hvor de enkelte nukleotider er komplementære. Tm: Smeltetemperaturen for en given DNA sekvensmængde hvoraf 50% er denatureret.
Titel: Sporadiske DNA mutationer og sensitiviteten af målemetoder. Undertitel: Screening af DNA for sporadiske mutationer stiller store krav til sensitiviteten af de anvendte målemetoder. I en prøve der
Læs mereElektroforese. Navne: Rami Kassim Kaddoura Roman Averin Safa Sarac Magnus Høegh Jensen Frederik Gaarde Lindskov
Elektroforese Navne: Rami Kassim Kaddoura Roman Averin Safa Sarac Magnus Høegh Jensen Frederik Gaarde Lindskov Klasse: 1.4 Fag: Biologi Vejleder: Brian Christensen Skole: Roskilde tekniske gymnasium, Htx
Læs mereForårseksamen 2014. Uddannelse: specialisering. Bacheloruddannelsen i Medicin/Medicin med industriel. Semester: 1. semester
Forårseksamen 2014 Titel på kursus: Uddannelse: specialisering Semester: Introduktion til basalfagene Bacheloruddannelsen i Medicin/Medicin med industriel 1. semester Eksamensdato: 6. januar 2014 Tid:
Læs mereSide 1 of 13. Kursus navn: Kursus nr Introduktion til Bioinformatik
Side 1 of 13 Danmarks Tekniske Universitet Skriftlig prøve, den 20/1-2014 Kursus navn: Kursus nr. 27633 Introduktion til Bioinformatik Tilladte hjælpemidler: Alle "Vægtning" Angivet ved de individuelle
Læs mereSpm. 1.: Hvis den totale koncentration af monomer betegnes med CT hvad er så sammenhængen mellem CT, [D] og [M]?
DNA-smeltetemperaturbestemmelse KemiF2-2008 DNA-smeltetemperaturbestemmelse Introduktion Oligonucleotider er ofte benyttet til at holde nanopartikler sammen med hinanden. Den ene enkeltstreng er kovalent
Læs mereRegnskovens hemmeligheder
Center for Undervisningsmidler, afdeling København Regnskovens hemmeligheder Øvelsesvejledning Formål Et gen for et kræfthelbredende protein er blevet fundet i nogle mystiske blade i regnskoven. Forskere
Læs mere27611 Eksamen Sommer 2007
- Side 1 af 10-27611 Eksamen Sommer 2007 Dette sæt indeholder 4 opgaver. En online version af opgavesættet vil være tilgængeligt fra kursets lektionsplan, under selve eksamen (25. Maj 2007 klokken 9:00
Læs mereDette er en kladde til et genoptryk af Eksperimentel Genteknologi fra 1991. Ideer, rettelser og forslag modtages gerne. Kh Claudia.
Transformation af E.coli K 12 Version 3. marts 2009 (C) Claudia Girnth-Diamba og Bjørn Fahnøe Dette er en kladde til et genoptryk af Eksperimentel Genteknologi fra 1991. Ideer, rettelser og forslag modtages
Læs mereEukaryote celler arbejder
Eukaryote celler arbejder Niveau: 9. klasse Varighed: 5 lektioner Præsentation: I dette forløb skal eleverne arbejde med den eukaryote celle. I forløbet kommer vi omkring funktioner og kemiske processer
Læs mereSide 1 of 12. Kursus navn: Kursus nr Introduktion til Bioinformatik
Side 1 of 12 Danmarks Tekniske Universitet Skriftlig prøve, den 22/1-2015 Kursus navn: Kursus nr. 27633 Introduktion til Bioinformatik Tilladte hjælpemidler: Alle "Vægtning" Angivet ved de individuelle
Læs mereBIOLOGI HØJT NIVEAU. Mandag den 8. august 2005 kl. 9.00-14.00
STUDETEREKSAME AUGUST 2005 2005-6-2 BIOLOGI ØJT IVEAU Mandag den 8. august 2005 kl. 9.00-14.00 Af de store opgaver 1 og 2 må kun den ene besvares. Af de små opgaver 3, 4, 5 og 6 må kun to besvares. STORE
Læs mereBiologien bag epidemien
Biologien bag epidemien Af Niels Kristiansen, biologilærer, Grindsted Gymnasium Sygdomme kan smitte på mange måder. Enten via virus, bakterier eller parasitter. I det følgende vil vi koncentrere os om
Læs merePå jagt efter min far. Edvotec S-49.
På jagt efter min far. Edvotec S-49. Skolekom eller Frederiksen er leverandører Dansk oversættelse Lektor Åse Uttenthal, Vordingborg Gymnasium og HF. Figurer fra Edvotecs vejledning. Oktober 2017, version
Læs mereForsvundet ved oversættelsen? Ny viden om hvordan proteinet for Huntingtons Sygdom dannes Du siger kartoffel. huntingtingenet
Forskningsnyheder om Huntingtons Sygdom På hverdagssprog Skrevet af forskere. Til det globale HS-fællesskab Forsvundet ved oversættelsen? Ny viden om hvordan proteinet for Huntingtons Sygdom dannes Dannelsen
Læs mereStudiespørgsmål til celler og væv
Studiespørgsmål til celler og væv 1. Hvad er en celle og hvad vil det sige, at den har et stofskifte? 2. Tegn en figur af en celle og navngiv, på figuren, de vigtigste organeller. Hvad er navnet på den
Læs mereForårseksamen Titel på kursus: Det hæmatologiske system og immunsystemet Bacheloruddannelsen i Medicin/Medicin med industriel specialisering
Studienummer: 1/10 Forårseksamen 2014 Titel på kursus: Det hæmatologiske system og immunsystemet Uddannelse: Bacheloruddannelsen i Medicin/Medicin med industriel specialisering Semester: 2. semester Eksamensdato:
Læs mereSkriftlig reeksamen august 2017
Studienummer: 1/10 Skriftlig reeksamen august 2017 Titel på kursus: Uddannelse: Semester: Det hæmatologiske system og immunsystemet Medicin og medicin med industriel specialisering 2. semester Eksamensdato:
Læs mereLivets molekylære kode
4. ÅR R. 2 / 2006 Livets molekylære kode -kemi og biologi mødes D livets molekylære kode D findes i alle levende organismer og indeholder koden til organismen informationer, der afgør om organismen er
Læs mere