datp, dctp, dgtp, dttp, [α 32 P]-dCTP urinstofholdig polyacrylamid gel røntgen film
|
|
- Kaj Madsen
- 7 år siden
- Visninger:
Transkript
1 Opgave 1 Denne opgave omhandler osteoblast differentiering. Osteoblast celler er involveret i opbygning af knoglevæv. Osteoblast celler dannes ud fra såkaldte calvarial celler. For at forstå det molekylære grundlag for osteoblast differentiering ønskes identificeret gener, der er aktive under osteoblast differentiering men inaktive under almindelig proliferativ vækst. Til dette formål er de i Tabel 1 beskrevne komponenter til rådighed. FRCC celler er føtale rotte calvariale celler. Differentieringen af disse celler til osteoblast celler kan kontrolleres in vitro. Det er således muligt in vitro at holde cellerne i en normal proliferativ fase og dernæst inducere dem til at differentiere til osteoblast celler. Proliferative FRCC celler FRCC celler under differentiering til osteoblaster Kit til oprensning af polya mrna poly-dt-a primer 5 AAGCTTTTTTTTTTTTA 3 samling af forskellige 13 nukleotider lange 40 forskellige 13 merer DNA primere revers transkriptase termostabil DNA polymerase nukleotider datp, dctp, dgtp, dttp, [α 32 P]-dCTP urinstofholdig polyacrylamid gel røntgen film Tabel 1: Komponenter der kan anvendes til at identificere gener, der kun er udtrykt under osteoblast differentiering. Den understregede sekvens i poly-dt-a primeren er et HindIII site. [α 32 P]-dCTP er deoxycytosintrifosfat, der er mærket med 32 P i α-positionen. Spm A: Beskriv i tekst og tegning, hvorledes de i Tabel 1 angivne komponenter kan anvendes til at isolere cdna fragmenter der repræsenterer gener, der kun er udtrykt under osteoblast differentiering. 1
2 Spm B: Beskriv i tekst og tegning en alternativ teknik til isolering af cdna repræsenterende gener, der kun er udtrykt under osteoblast differentiering. Resultatet af forsøget med de i Tabel 1 angivne komponenter er blandt andet identifikation af et 313bp cdna fragment. Dette fragment klones i et plasmid og sekventeres. Spm. C: Design et forsøg, der kan verificere, at dette cdna repræsenterer et gen, der kun er udtrykt under osteoblast differentiering Ud fra nukleotidsekvensen af det 313bp lange cdna fragment ønskes isoleret en fuldlængde cdna klon. Spm D: I tekst og tegning ønskes beskrevet to teknikker til fremskaffelse af den fuldlængde cdna klon, som det 313 bp lange fragment er en del af. Nukleotidsekvensen af fuldlængde cdna og primærstrukturen af det tilhørende protein er vist i Figur 1. Proteinet benævnes AJ18-S. Spm. E: Hvilken transkriptionsfaktorfamilie er det ud fra sekvensen i Figur 1 mest sandsynlig, at AJ18-S proteinet tilhører? 2
3 Figur 1: Nukleotidsekvensen af det klonede cdna og primærstrukturen af det fra cdnaet translaterede AJ18-S protein. Elleve aminosyresekvenser karakteristiske for en bestemt familie af transkriptionsfaktorer er understregede med fuldt optrukne linjer. Den første af disse sekvenser starter således ved aminosyre 220. For at undersøge om AJ18-S er i stand til at binde DNA og bestemme hvilken nukleotidsekvens, der genkendes af proteinet, ønskes der fremstillet rekombinant fusionsprotein mellem AJ18-S protein og seks histidiner. De seks histidiner skal sidde i den N-terminale del af AJ18-S. 3
4 bla Den N-terminale del af fusionsproteinet skal således have sekvensen Met-His-His-His-His-His-His- Met-Ala-Val-Asp-Leu-Leu-o.s.v (jævnfør sekvensen i Figur 1). I Figur 2 er vist strukturen af plasmid Express, der skal anvendes til produktion af det rekombinante fusionsprotein. Endvidere er nukleotidsekvensen af to områder af plasmidet vist. Det vides, at ingen af de i Figur 2 viste restriktionsenzymer har genkendelsessites i det DNA fragment, der koder for 6His-AJ18-S proteinfusionen. EcoRI 5' CACACAGAATTCATTAAAGAGGAGAATTAAC 3' EcoRI HindIII 5' GCCAAGCTTAATTAGCTGAGCTTGGAC 3' HindIII SD P IPTG Ori Figur 2: Struktur af plasmid Express. P IPTG, en IPTG inducerbar promotor; SD, Shine-Dalgarno sekvens; Ori, replikationsorigin; Bla, β-lactamase gen der giver ampicillin resistens. Endvidere er vist nukleotidsekvensen omkring EcoRI og HindIII sitene. Genkendelsessekvenserne for de to enzymer er understregede. Spm. F: Beskriv i tekst og tegning hvorledes du vil generere et DNA fragment, der koder for den ønskede His6-AJ18-S fusion og som kan klones i plasmid Express. Sekvenser og orientering af eventuelt anvendte primere skal angives. 4
5 Figur 3 viser en Coomassie farvning af SDS-PAGE separeret total celleprotein fra E. coli indeholdende plasmidet, der koder for His6-AJ18-S fusionen før og efter induction med IPTG. Endvidere er vist et western blot af protein isoleret efter IPTG induktion fremkaldt med henholdsvis anti-aj18-s-antistof og anti-histidin-antistof. Figur 3: SDS-PAGE separeret E. coli protein isoleret før (NI) eller efter (I) induktion med IPTG. Western blot af lane (I) fremkaldt med anti-aj18-s-antistof (AJ) eller anti-histidin-antistof (His). Tallene til venstre angiver, hvortil proteiner med den angivne molekylvægt (målt i kda) er migreret. Spm. G: Hvad viser data i Figur 3? Giv en begrundet forklaring på tilstedeværelsen af to dominerende bånd i lane I og i de to western blots. For at bestemme den DNA sekvens som AJ18-S genkender blev komponenterne i Tabel 2 anvendt. De enkelte trin i selve protokollen er beskrevet i Tabel 3. 5
6 En blanding af TDA primere 5 CGCTCTAGAACTAGTGGATC-N12- ATCGATACCGTCGACCTCGA 3 KS primer 5 TCGAGGTCGACGGTATCGAT 3 SK primer 5 CGCTCTAGAACTAGTGGATC 3 Termoresistens DNA polymerase dntp datp, dctp, dgtp, dttp, [α- 32 P]-dCTP T4 DNA ligase pbluescript kloningsvektor SDS-PAGE geler Nylonmembraner Proteinekstrakt fra E. coli der producerer AJ18- S protein Tabel 2: Komponenter der kan bruges til at bestemme nukleotid-genkendelses-sekvensen for et DNA bindende protein. N, repræsenterer et af de 4 deoxynukleotider der indgår i DNA. TDA primeren består således af en blanding af 4 12 oligonukleotider. [α- 32 P]-dCTP, deoxycytosin-trifosfat mærket med 32 P i α-positionen. 6
7 1) PCR med primer TDA og primer KS i tilstedeværelse af [α- 32 P]-dCTP (primer TDA fungerer også som template) 2) SDS-PAGE separation af proteinekstrakt fra E. coli der producerer AJ18-S efterfulgt af overførsel til nylonmembran og renaturering af det overførte protein i tilstedeværelse af zinkioner. 3) PCR produktet fra punkt et hybridiseres til membranen fra punkt to. Membranen vaskes og bundet DNA visualiseres ved autoradiografi. 4) Det hybridiserede DNA elueres fra membranen og amplificeres med PCR ved hjælp af primer KS og SK. 5) Det amplificerede DNA fra punkt fire hybridiseres til en nylonmembran fremstillet som angivet i punkt to. Membranen vaskes og bundet DNA visualiseres ved autoradiografi. 6) Punkt fire og fem gentages tre gange. 7) Det DNA der er bundet efter sidste hybridisering elueres fra membranen, PCR amplificeres med primer KS og SK, klones i en Bluescript vektor og nukleotidsekvensen bestemmes. Tabel 3: De enkelte trin i en protokol til bestemmelse af den nukleotidsekvens, der genkendes af AJ18-S proteinet. Spm. H: Beskriv, hvorledes den i Tabel 3 viste protokol kan anvendes til at bestemme den nukleotidsekvens, der genkendes af AJ18-S proteinet. Den identificerede nukleotidsekvens viser sig at have stor homologi til en sekvens kaldet OSE2, som genkendes af transkriptionsfaktor Runx2 (også kaldet Osf2). Runx2 mrna og AJ18-S mrna er tilstede på samme tidspunkt under osteoblast differentieringen. For at undersøge samspillet mellem AJ18-S og Runx2 proteinerne in vivo blev der fremstillet de i Figur 4 viste plasmider. 7
8 TATA p6ose2-luc o o o o o o luciferase prunx2 P CMV Runx2 paj18-s P CMV AJ18 psv-β-gal P SV lacz Figur 4: Strukturen af den relevante del af plasmiderne p6ose2-luc, prunx2, paj18-s og psv-β-gal. O, angiver én OSE2 sekvens; TATA, TATA box; P CMV, konstitutiv promotor fra cytomegalovirus; P SV, konstitutiv promotor fra Simian virus. En konstant mængde p6ose2-luc, prunx2 og psv-β-gal blev transficeret i en fibroblast cellelinje C3H10T1/2 sammen med stigende mængder (0,05 1μg) paj18-s plasmid. Luciferase og β-galaktosidase aktiviteterne blev bestemt 48 timer efter transfektion. Resultaterne er vist i Figur 5. 8
9 Figur 5: Resultaterne af transfektion af C3H10T1/2 cellelinjen med p6ose2-luc, prunx2, psv-β-gal og stigende mængde (0,05 1μg) paj18-s plasmid. +/- angiver, hvorvidt der er transficeret med plasmid eller ej. Relative luciferase activity betyder, at aktiviteterne er normaliserede til den aktivitet, der opnås efter transfektion med p6oseluc og psv-β-gal efter korrektion for transfektionseffektivitet ud fra β-galaktosidaseaktiviteterne. Spm I: Hvad viser Figur 5 om AJ18-S og Runx2 proteinernes aktivitet? 9
10 Opgave 2 gc1qr er betegnelsen for et protein, der findes i alle mammale celler. Proteinet interagerer med en lang række forskellige proteiner. Der er isoleret både en human cdna klon og en human genom klon for gc1qr. Spm. A: Beskriv hvorledes du experimentelt kan fastlægge intron-exon strukturen af gc1qr genet. Spm. B: Beskriv i tekst og tegning en metode der kan anvendes til at isolere cdna kloner, der koder for protein, der kan interagere med det humane gc1qr protein. Sekvensen af 1374 nukleotider opstrøms for ATG kodon i gc1qr genet blev analyseret ved hjælp af et computerprogram for at finde potentielle TATA boxe og bindingssites for transkriptionsfaktorer. Resultatet af analysen er vist i Figur 1. 10
11 G1A2 Figur 1: Computeranalyse af nukleotidsekvensen af 1374 nukleotider opstrøms for ATG kodon i gc1qr genet. Positionen af potentielle TATA boxe og transkriptionsfaktorbindingssites er angivet. De første to kodons er angivet med fed skrift. Lokalisering af den komplementære sekvens til primer G1A2 brugt til primerekstension analyse og DNA sekventering er angivet. 11
12 For at undersøge hvilke promotorelementer der er af betydning for promotor-aktivitet, blev der udført primerekstension analyse med den i Figur 1 viste primer G1A2. Resultatet af analysen er vist i Figur 2. G A T C P Figur 2: Primer ekstension analyse på human gc1qr mrna. G,A,T,C angiver resultatet af en sekvensreaktion på en human gc1qr genom klon med primer G1A2. P, angiver resultatet af primerekstension analyse på human gc1qr mrna med primer G1A2. Spm. C: Diskuter ud fra data i Figur 2 hvilke af de i Figur 1 forudsagte promotorelementer, der kan have betydning for gc1qr promotoraktivitet? For at karakterisere promotoren yderligere blev der fremstillet de i Figur 3 viste promotorfusioner. Plasmiderne blev co-transficeret med en vektor til korrektion for transfektionseffektivitet i en human cellelinje. De resulterende luciferase aktiviteter er vist i Figur 3. 12
13 Figur 3: Strukturen af promotor-luciferase fusioner samt de tilhørende luciferase aktiviteter opnået 48 timer efter transfektion af en human cellelinje. Luciferaseaktiviteterne er normaliserede til den aktivitet, der opnås efter transfektion med den anvendte luciferase vektor uden noget gc1qr promotor fragment (Basic). Fuldt optrukne linjer angiver det DNA fragment, der er tilstede i den enkelte fusioner. Pile angiver orienteringen af det indsatte promotor fragment. D.v.s., at promotorfragmentet i ERES1 er i modsat orientering i forhold til promotorfragmentet i ERES2. Alle resultater er normaliserede til samme transfektionseffektivitet. Spm. D: Hvad viser data i Figur 3 omkring aktiviteten af gc1qr promotoren? Spm. E: Begrund ud fra ovenstående analyser om du mener, der er noget specielt ved gc1qr promotoren. 13
Løsninger til opgaverne den Opgave 2 januar 2003 Spm. 1:
Løsninger til opgaverne den 6-9-06 Opgave 2 januar 2003 Spm. 1: Fidusen er her at vi kender den primære struktur af glukoamylasen fra tre forskellige svampe, en ascomycet, en basidiomycet og en zygomycet.
Læs mereEn forsker har lavet et cdna insert vha PCR og har anvendt det følgende primer sæt, som producerer hele den åbne læseramme af cdna et:
F2011-Opgave 1. En forsker har lavet et cdna insert vha PCR og har anvendt det følgende primer sæt, som producerer hele den åbne læseramme af cdna et: Forward primer: 5 CC ATG GGT ATG AAG CTT TGC AGC CTT
Læs mereCYP7A1 (0,1 nm) CYP7A1 (0nM) UBIC (0,1 nm)
Opgave 1 Leveren spiller en central rolle i lipid metabolismen og i opretholdelse af lipid homeostasen i hele kroppen. Lipidmetabolismen er fejlreguleret hos blandt andet svært overvægtige personer samt
Læs mereSpm. A: Hvad viser data i Figur 1?
Opgave 1 Leptin er et plasma proteinhormon der primært produceres af og secerneres fra fedtceller (adipocytter). Leptin, der er kodet af ob (obecity) genet, er 16 kda stort. Leptins fysiologiske funktion
Læs mereSpm. B: Hvad viser data i Figur 2?
Opgave 1 Kernereceptorer (nuclear receptors) udgør en familie af ligandaktiverede transkriptionsfaktorer, der regulerer transkription af en række gener, som respons på tilstedeværelse af f.eks.lipofile
Læs mereBesvarelse af opgaverne til den Spm.A: efter TGA TCA Spm. B:
Besvarelse af opgaverne til den 20-9-06 Spm.A: Her vil vi gerne sætte et relativt lille stykke DNA (FLAG) sammen med et relativt stort stykke (PRB1). Det lille stykke er for lille til at vi kan PCR amplificere
Læs mereLøsninger til opgaverne den Spm. A: Spm. B Spm. C:
Løsninger til opgaverne den 12-9-07 Spm. A: Her er vi i en situation at det eneste der kendes til vores receptor er, at den kan binde en ligand, som vi har til rådighed i en radioaktiv mærket version.
Læs mereFigur 1: Strukturelt kort over plasmiderne pyeast og pmamal anvendt til undersøgelse af
Opgave 2 juni 1999 DNA rekombination er vigtig for eukaryote celler i forbindelse med meiosen. Samtidig er rekombination mellem fremmed DNA og endogen DNA essentiel i fremstillingen af transgene organismer
Læs mereRestriktionsenzymer findes Genkendelsessekvens
Restriktionsenzymer Skanning Restriktionsenzymer findes i bakterier (forsvarsmekanisme) IKKE i eukaryote celler 3-5 - 5-3 - Restriktionsenzyme Genkendelsessekvens Palindromisk Otto, Anna, radar Madam I
Læs mereBesvarelse til opgave 1 januar 1999 Spm. A: Spm. B:
Besvarelse til opgave 1 januar 1999 Spm. A: Vi må lave et genomisk bibliotek i en lambdafag, cosmid, BAC eller YAC plasmid. Til dette vil vi skære det genomiske DNA partielt med Sau3A, så vi får stykker
Læs mereOpgave 1 Spm. A: Spm. B:
Opgave 1 Familien af TM7 receptorer (receptorer med 7 transmembrane segmenter) udgør ud fra genomsekvensen den største proteinfamile i C. elegans. Det samme må forventes at gælde i pattedyr. Imidlertid
Læs mereUdarbejdet af Anna-Alexandra Grube Hoppe
METODER - BIOKEMI For medicinstuderende - Panuminstituttet UDARBEJDET AF ANNA-ALEXANDRA GRUBE HOPPE RESTRIKTIONSENZYM ANALYSE (E: 329-330) Restriktionsenzym analyse er en metode, der bruges til at kortlægge
Læs mereAugust Krogh Building Copenhagen University. Universitetsparken 13 2100 Copenhagen OE PAPedersen@aki.ku.dk
Per Amstrup Pedersen Institute of Molecular Biology August Krogh Building Copenhagen University Universitetsparken 13 2100 Copenhagen OE PAPedersen@aki.ku.dk En genteknologisk værktøjskasse. Version 2007
Læs mereTest dit eget DNA med PCR
Test dit eget DNA med PCR Navn: Forsøgsvejledning Formål med forsøget Formålet med dette forsøg er at undersøge jeres arvemateriale (DNA) for et transposon kaldet Alu. Et transposon er en DNA sekvens,
Læs mereVelkommen. Test dit eget DNA med PCR. Undervisningsdag på DTU Systembiologi. Undervisere: Sebastian, Louise og Ana
Velkommen Test dit eget DNA med PCR Undervisningsdag på DTU Systembiologi Undervisere: Sebastian, Louise og Ana Hvem er I? 2 DTU Systembiologi, Danmarks Tekniske Universitet Dagens program 9:00 10:00 Introduktion
Læs mereTest dit eget DNA med PCR
Test dit eget DNA med PCR Forsøgsvejledning Navn: Side 1 af 7 Formål med forsøget Formålet med dette forsøg er at undersøge jeres arvemateriale (DNA) for et transposon kaldet Alu. Et transposon er en DNA
Læs mereFigur 1: A, nukleotidsekvensen af starten og slutningen af RPB1 genet. Initierings- og terminerings
Opgave 2 juni 2004 Eukaryote celler indeholder 3 forskellige RNA polymeraser. Hver RNA polymerase er ansvarlig for transkription af bestemte klasser af gener. Ud fra mutationsanalyse i bagegær (Saccharomyces
Læs mereTest dit eget DNA med PCR
Test dit eget DNA med PCR Navn: Forsøgsvejledning Side 1 af 8 Formål med forsøget Formålet med dette forsøg er at undersøge jeres arvemateriale (DNA) for et transposon kaldet Alu. Et transposon er en DNA
Læs mereTest dit eget DNA med PCR
Test dit eget DNA med PCR Navn: Forsøgsvejledning Side 1 af 8 Formål med forsøget Formålet med dette forsøg er at undersøge jeres arvemateriale (DNA) for et transposon kaldet Alu. Et transposon er en DNA-sekvens,
Læs mereOpgave 1 november 2004
Opgave 1 november 2004 Nedenfor er vist nukleotidsekvensen af cdna kodende for eif2α genet fra mus. Serin nummer 51 (S51) kan fosfoyleres af en eller flere eif2α kinaser. For at undersøge den biologiske
Læs mereTest dit eget DNA med PCR
Test dit eget DNA med PCR Navn: Forsøgsvejledning Side 1 af 8 Formål med forsøget Formålet med dette forsøg er at undersøge jeres arvemateriale (DNA) for et transposon kaldet Alu. Et transposon er en DNA-sekvens,
Læs mereGAPDH PCR modul Manual
GAPDH PCR modul Manual Katalog nr. 166-5010EDU explorer.bio-rad.com Kopiering kun tilladt til undervisningsbrug Bemærk: Kittet indeholder temperaturfølsomme dele. Åbn derfor straks kassen og læg de pågældende
Læs mereVelkommen. Test dit eget DNA med PCR. Undervisningsdag på DTU Systembiologi. Undervisere:
Velkommen Test dit eget DNA med PCR Undervisningsdag på DTU Systembiologi Undervisere: Hvem er I? 2 DTU Systembiologi, Danmarks Tekniske Universitet Hvilke baser indgår i DNA? A. Adenin, Guanin, Cytosin,
Læs mereat du trænes i at genkende aminosyrer i en simpel proteinstruktur (pentapeptid = lille protein bestående af 5 (penta) aminosyrer)
Elevvejledning til det Virtuelle Kræftlaboratorium Det Virtuelle Kræftlaboratorium stiller krav til en grundig forståelse af det centrale dogme inden for molekylærbiologien, hvordan DNA oversættes til
Læs merePCR (Polymerase Chain Reaction): Opkopiering af DNA
PCR (Polymerase Chain Reaction): Opkopiering af DNA PCR til at opkopiere bestemte DNA-sekvenser i en prøve er nu en af genteknologiens absolut vigtigste værktøjer. Peter Rugbjerg, Biotech Academy PCR (Polymerase
Læs mereDanmarks Tekniske Universitet
Side 1 of 14 Danmarks Tekniske Universitet Skriftlig prøve, den 21/1-2013 Kursus navn: Kursus nr. 27633 Introduktion til Bioinformatik Tilladte hjælpemidler: Alle "Vægtning" Angivet ved de individuelle
Læs mereStudienummer: MeDIS Exam 2015. Husk at opgive studienummer ikke navn og cpr.nr. på alle ark, der skal medtages i bedømmelsen
MeDIS Exam 2015 Titel på kursus: Uddannelse: Semester: Videregående biokemi og medicinudvikling Bachelor i Medis 5. semester Eksamensdato: 26-01-2015 Tid: kl. 09.00-11.00 Bedømmelsesform 7-trin Vigtige
Læs mereBiologi opgave Opsamling: Cellebiologi (Bioanalytiker modul3)
1 Delphine Bonneau Biologi opgave Opsamling: Cellebiologi 1-6 Pelle har spist en kæmpe stor kage, og efterfølgende stiger hans blodsukker. Derfor sender kroppen besked til de endokrine kirtler i bugspytkirtlen
Læs mereKromosomer med genet: Genotype (= arveformel): RR Rr rr Fænotype (= fremtoning): Rød Rød Hvid
Kromosomer med genet: R R R r r r Genotype (= arveformel): RR Rr rr Fænotype (= fremtoning): Rød Rød Hvid P-generation: Kønsceller: RR rr Meiose R R r r Befrugtning F 1-generation: Meiose Rr Rr Kønsceller:
Læs mereBioteknologi A. Gymnasiale uddannelser. Vejledende opgavesæt 1. Mandag den 31. maj 2010 kl. 9.40-14.40. 5 timers skriftlig prøve
Vejledende opgavesæt 1 Bioteknologi A Gymnasiale uddannelser 5 timers skriftlig prøve Vejledende opgavesæt 1 Mandag den 31. maj 2010 kl. 9.40-14.40 Side 1 af 8 sider pgave 1. Genmodificeret ris Vitamin
Læs mereHOXA9 og CDX2 i relation til leukæmi
HOXA9 og CDX2 i relation til leukæmi Gruppe 5 Kristina Berg, Mathilde Schmidt, Ninette Jensen, Sabrina Wielsøe & Sophie Tolstrup 2. Semesterprojekt, Forår 2013 Roskilde Universitet, Nat. Bach, 2. semester,
Læs mereGenekspression. GENEKSPRESSION side 1
Genekspression 2006 GENEKSPRESSION side 1 Indholdsfortegnelse Kapitel 1... 3 Proteinsyntese... 3 Regulering af gener i E. coli.... 8 Transskription hos eukaryoter... 14 Eukaryot genregulering... 16 Efterbehandlig
Læs mereUndervisningsbeskrivelse fra august 2014
Undervisningsbeskrivelse fra august 2014 Stamoplysninger til brug ved prøver til gymnasiale uddannelser Termin Oktober 2015 Institution Hansenberg Gymnasium Uddannelse Fag og niveau Lærer(e) Hold HTX Bioteknologi
Læs mereOpgave 1 Listeria. mørkviolette bakteriekolonier, se figur 1a. og b. 1. Angiv reaktionstypen for reaktion. 1 vist i figur 1b.
Opgave 1 Listeria Bakterien Listeria monocytogenes kan være sygdomsfremkaldende for personer, der i forvejen er svækkede. For at identificere Listeria kan man anvende indikative agarplader. Her udnyttes
Læs mereTo modeller af NDRG2 proteinet: RCSB Protein Data Bank
2009 Roskilde Universitet Naturvidenskabelige Basisstudium 4. Semesters Projekt To modeller af NDRG2 proteinet: RCSB Protein Data Bank Bassam Tawfik Florian Malte Hermann Kenneth Ege Jørgensen Lena de
Læs mereAnalyse af proteiner Øvelsesvejledning
Center for Undervisningsmidler, afdeling København Analyse af proteiner Øvelsesvejledning Formål At separere og analysere proteiner i almindelige fødevarer ved brug af gelelektroforese. Teori Alle dele
Læs mereDanmarks Tekniske Universitet
Side 1 of 17 Danmarks Tekniske Universitet Skriftlig prøve, den 21/1-2013 Kursus navn: Kursus nr. 27633 Introduktion til Bioinformatik Tilladte hjælpemidler: Alle "Vægtning" Angivet ved de individuelle
Læs mereKOMMISSIONENS FORORDNING (EU) / af
EUROPA- KOMMISSIONEN Bruxelles, den 29.5.2018 C(2018) 3193 final KOMMISSIONENS FORORDNING (EU) / af 29.5.2018 om ændring af forordning (EF) nr. 847/2000 for så vidt angår definitionen af udtrykket "lignende
Læs mereProtokol for genetisk bestemmelse af ABO blodtyper
Page1 Udarbejdet i samarbejde mellem: Kåre Lehmann, Annabeth Høgh Petersen, Anne Rusborg Nygaard og Jørn M. Clausen Page2 VIGTIGT: SKIFT PIPETTE SPIDSER/TIPS EFTER HVER GANG!! Så undgår du at forurene
Læs mereBIOTEKNOLOGI HØJT NIVEAU
STUDENTEREKSAMEN 2007 2007-BT-1 BITEKNLGI HØJT NIVEAU Torsdag den 31. maj 2007 kl. 9.00 14.00 Sættet består af 1 stor og 2 små opgaver samt 1 bilag i 2 eksemplarer. Det ene eksemplar af bilaget afleveres
Læs mereAnmeldelse af genteknologiske forskningsprojekter samt genteknologisk storskalaforsøg eller produktion
Anmeldelse af genteknologiske forskningsprojekter samt genteknologisk storskalaforsøg eller produktion Anmeldelse til Arbejdstilsynet efter Arbejdsministeriets bekendtgørelse om genteknolog og arbejdsmiljø
Læs mereBiosensor Niveau 1. Teori
Biosensor Niveau 1 Teori Inden du starter... For at kunne forstå teorien som ligger til grund for en biosensor er det vigtigt at du har styr på nogle generelle mikro/molekyler biologiske principper, begreber
Læs mereProtokol for genetisk bestemmelse af ABO blodtyper
Page1 Udarbejdet i samarbejde mellem: Kåre Lehmann, Annabeth Høgh Petersen, Anne Rusborg Nygaard og Jørn M. Clausen Page2 VIGTIGT: SKIFT PIPETTE SPIDSER/TIPS EFTER HVER GANG!! Så undgår du at forurene
Læs mereNye og traditionelle metoder i planteforædling. Søren K. Rasmussen Institut for Plante- og Jordbrugsvidenskab, 27. september 2016
Nye og traditionelle metoder i planteforædling Søren K. Rasmussen Institut for Plante- og Jordbrugsvidenskab, 27. september 2016 12-10-2016 2 Traditionel forædling Vælge forældrene Krydse forældrene Selektere
Læs mereSide%1%af%14% Eksamen: Bioinformatik It og Sundhed 27 Jan 2011 kl 9-13
Side1af14 Eksamen: Bioinformatik It og Sundhed 27 Jan 2011 kl 9-13 Navn: Studie nummer: Dette eksamenssæt vil også kunne ses som en pdf fil nederst på kursus-hjemmesiden udfor den sidste dag d. 27 Jan
Læs mereDeltagermateriale 43230 OGM. PCR-teknikker 1
Deltagermateriale 43230 OGM PCR-teknikker 1 POLYMERASE KÆDE REAKTION (PCR) Indholdsfortegnelse 04/02 2 af 36 1. INDLEDNING... 4 DNA's opbygning... 5 DNA-replikation.... 7 2. PCR METODEN... 10 PCR en oversigt...
Læs mereNr 1. Fra gen til protein
Nr 1 Fra gen til protein Med udgangspunkt i vedlagte illustrationer bedes du besvare følgende: Hvordan er sammenhængen mellem DNA ets nukleotider og proteinets aminosyrer? Beskriv hvad der sker ved henholdsvis
Læs mereOpgave 1 Slankemidler
Opgave 1 Slankemidler Overvægt er et stigende problem i den vestlige verden, og der er derfor udviklet forskellige slankemidler. Et eksempel på et slankemiddel er Orlistat. Den kemiske struktur af Orlistat
Læs mereRe- eksamen Det hæmatologiske system og immunsystemet. Bacheloruddannelsen i Medicin/Medicin med industriel specialisering
Studienummer: 1 Re- eksamen 2012 Titel på kursus: Uddannelse: Semester: Det hæmatologiske system og immunsystemet Bacheloruddannelsen i Medicin/Medicin med industriel specialisering 2. semester Eksamensdato:
Læs mereDNA origami øvelse DNA origami øvelse
DNA origami øvelse Introduktion I denne øvelse bruger vi DNA origami teknikken til at samle en tavle af DNA med dimensioner på 70 nm x 100 nm. Tavlen dannes af et langt enkeltstrenget DNA molekyle, der
Læs mereFotosyntetisk produktion af hydrogen med genmodificerede mikroorganismer
Fotosyntetisk produktion af hydrogen med genmodificerede mikroorganismer Forskerspirer 2009 Hovedområde: NAT Niels Christian Sanden ncsanden@hotmail.com Forskerkontakt: Poul Erik Jensen Værtsinstitution:
Læs mereDNA origami øvelse. Introduktion. DNA origami øvelse 3 timer 2018
DNA origami øvelse Introduktion I denne øvelse bruger vi DNA origami teknikken til at samle en tavle af DNA med dimensioner på 70 nm x 100 nm. Tavlen dannes af et langt enkeltstrenget DNA molekyle, der
Læs mereDNA origami øvelse 2013. DNA origami øvelse
DNA origami øvelse Introduktion I denne øvelse bruger vi DNA origami teknikken til at samle en tavle af DNA med dimensioner på 70 nm x 100 nm. Tavlen dannes af et langt enkeltstrenget DNA molekyle, der
Læs mere1 Idékatalog til øvelser: Bioanalytikeruddannelsen UCSJ, Parkvej 190, 4700 Næstved
1 Idékatalog til øvelser: Bioanalytikeruddannelsen UCSJ, Parkvej 190, 2 Idékatalog til øvelser: Bioanalytikeruddannelsen UCSJ, Parkvej 190, Indhold Realtime PCR på β-actin... 3 CSI og retsgenetik... 3
Læs mereSide 1 af 13. Eksamen: Bioinformatik It og Sundhed 27 Jan 2011 kl 9-13
Side1af13 Eksamen: Bioinformatik It og Sundhed 27 Jan 2011 kl 9-13 Navn: Studie nummer: Dette eksamenssæt vil også kunne ses som en pdf fil nederst på kursus-hjemmesiden udfor den sidste dag d. 27 Jan
Læs mereFaktor V Leiden mutation
Faktor V Leiden mutation Formål: finde ud af om individ har mutation i faktor V Leiden gen (missense: arginin glutamin) Materiale: oprens DNA fra leukocytter Metode: PCR med specifikke primere, oprens,
Læs mereartus EBV QS-RGQ-kit Ydelsesegenskaber Maj 2012 Sample & Assay Technologies Analysefølsomhed plasma artus EBV QS-RGQ-kit, Version 1,
artus EBV QS-RGQ-kit Ydelsesegenskaber artus EBV QS-RGQ-kit, Version 1, 4501363 Kontroller, om der er nye revisioner med elektronisk mærkning på www.qiagen.com/products/artusebvpcrkitce.aspx inden udførelse
Læs mereDIAGNOSTISKE TEKNIKKER VED PGD (PGT) - MOLEKYLÆRBIOLOGI FOR LÆGER OG ANDRE
DIAGNOSTISKE TEKNIKKER VED PGD (PGT) - MOLEKYLÆRBIOLOGI FOR LÆGER OG ANDRE I N GE SØKILDE P E D E RSEN, K L I N I S K L A B ORATORIEGENETIKER, P H D AFSNIT FOR MOLEKYLÆR DIAGNOSTIK - AAUH PGT ARBEJDSGANG
Læs mereBiotechnology Explorer. Protein Fingerprinting
Biotechnology Explorer Protein Fingerprinting Instruktionsmanual Katalognummer 166-0100EDU explorer.bio-rad.com Delene i dette kit er sendt i seperate æsker. Opbevar proteinstandarderne i fryseren, ved
Læs mereTEST 1. Almen Cellebiologi 2004/2005
TEST 1 Almen Cellebiologi 2004/2005 Hvilken af følgende udsagn er forkerte? a) kun planteceller har en cellevæg b) planteceller har microtubuli c) planteceller har chloroplaster d) planteceller har actin
Læs mereEksamensspørgsmål til biocu til mandag d. 10. juni 2013
Eksamensspørgsmål til biocu til mandag d. 10. juni 2013 Nr. 1. Fra gen til protein. Hvordan er sammenhængen mellem DNA ets nukleotider og proteinets aminosyrer? Beskriv hvad der sker ved henholdsvis transskription
Læs mereMaterialeliste: Ready-to-loadTM DNA prøver til elektroforese. Medfølgende reagenser og tilbehør. Egne materialer
Elevvejledning 1 Materialeliste: Ready-to-loadTM DNA prøver til elektroforese A B C D E F Plasmid DNA (uskåret) Plasmid skåret med Bgl I Plasmid skåret med Eco RI Lambda DNA (uskåret) Lambda DNA skåret
Læs mereStruktur og funktion af gener
Molekylærbiologi og genetik S4, F2008 f Malene Munk Jørgensen Emne: Struktur og funktion af gener Link: undervisningsplanen for S4-molekylærbiologi og genetik MMJ, VI niversity ollege Bioanalytikeruddannelsen
Læs mereBIOLOGI A-NIVEAU NY ORDNING. Tirsdag den 20. maj 2008. Kl. 09.00 14.00 STX081-BIA STUDENTEREKSAMEN MAJ 2008
STUDENTEREKSAMEN MAJ 2008 BIOLOGI A-NIVEAU Tirsdag den 20. maj 2008 NY ORDNING Kl. 09.00 14.00 Af opgaverne 1, 2, 3 og 4 skal tre og kun tre af opgaverne besvares STX081-BIA Undervisningsministeriet Side
Læs mereDansk resumé for begyndere
Dansk resumé for begyndere Dansk resumé for begyndere Dette afsnit introducerer bakteriel genregulation for enhver uden forudgående kendskab til dette emne. Alle nødvendige, videnskabelige betegnelser
Læs mereSide 1 af 14. Eksamen: Bioinformatik It og Sundhed 27 Jan 2011 kl 9-13
Side 1 af 14 Eksamen: Bioinformatik It og Sundhed 27 Jan 2011 kl 9-13 Navn: Studie nummer: Dette eksamenssæt vil også kunne ses som en pdf fil nederst på kursus-hjemmesiden udfor den sidste dag d. 27 Jan
Læs mereInstitut for Molekylær Biologi
Indholdsfortegnelse INDHOLDSFORTEGNELSE HOLDFORDELING...4 HOLD A...4 HOLD B...5 HOLD C...6 OVERSIGT OVER ØVELSESKURSET...7 LABORATORIEREGLER....8 HYGIEJNE....8 ARBEJDSPLADS...8 SIKKERHEDSREGLER...9 RAPPORTKRAV...11
Læs mere(19) DANMARK (11) DK 176078 B1 +tb (12) PATENTSKRIFT
(19) DANMARK (11) DK 176078 B1 +tb (12) PATENTSKRIFT Patent- og Varemærkestyrelsen (51) Int.C1. 8: C 12 N 7/00 (2006.01) C 12 N 15/00 (2006.01) G 01 N 33/569 (2006.01) (21) Patentansøgning nr: PA 1990
Læs mere3y Bioteknologi A. Lærere TK og JM. Eksamensspørgsmål uden bilag
3y Bioteknologi A Lærere TK og JM Eksamensspørgsmål uden bilag 1: DNA, proteiner og gensplejsning Med inddragelse af de vedlagte bilag samt øvelsen med pglo skal du diskutere og vurdere brugen af DNA og
Læs mereBIOZYMER ØVELSE 2 OPRENSNING AF PROTEINER
BIOZYMER ØVELSE 2 OPRENSNING AF PROTEINER FAGLIG BAGGRUND Det forudsættes, at den grundlæggende teori bag rekombinant protein ekspression og proteinopresning er bekendt. For dette henvises til undervisningsmateriale
Læs mereBioteknologi A. Studentereksamen. Af opgaverne 1 og 2 skal begge opgaver besvares. Af opgaverne 3 og 4 skal en og kun en af opgaverne besvares.
Bioteknologi A Studentereksamen Af opgaverne 1 og 2 skal begge opgaver besvares. Af opgaverne 3 og 4 skal en og kun en af opgaverne besvares. frs111-btk/a-31052011 Tirsdag den 31. maj 2011 kl. 9.00-14.00
Læs mereLigerings- og transformationsmodul inklusiv plasmidoprensning og restriktionsanalyse
Biotechnology Explorer Ligerings- og transformationsmodul inklusiv plasmidoprensning og restriktionsanalyse Katalog nr. 166-5015EDU explorer.bio-rad.com Kopiering kun tilladt til undervisningsbrug Bemærk:
Læs mereANATOMI for tandlægestuderende. Henrik Løvschall Anatomisk afsnit Afd. for Tandsygdomslære Odontologisk Institut Århus Universitet
ANATOMI for tandlægestuderende Henrik Løvschall Anatomisk afsnit Afd. for Tandsygdomslære Odontologisk Institut Århus Universitet CELLEBIOLOGI celleform kubisk celle pladeformet celle prismatisk celle
Læs mereEukaryote celler arbejder
Eukaryote celler arbejder Niveau: 9. klasse Varighed: 5 lektioner Præsentation: I dette forløb skal eleverne arbejde med den eukaryote celle. I forløbet kommer vi omkring funktioner og kemiske processer
Læs mereSide 1 of 11. Kursus navn: Kursus nr Introduktion til Bioinformatik
Side 1 of 11 Danmarks Tekniske Universitet Skriftlig prøve, den 22/1-2015 Kursus navn: Kursus nr. 27633 Introduktion til Bioinformatik Tilladte hjælpemidler: Alle "Vægtning" Angivet ved de individuelle
Læs mereProtein syntese. return
Protein syntese. I artiklen redegøres for principperne i, hvordan octapeptidet SCHTFGDI kan syntetiseres. Som yderligere illustration heraf kan peptidet opbygges og visualiseres i Chem3D-Pro. Herved kan
Læs mereProtein identifikation ved hjælp af Matrix- Assisted Laser Desorption Masse Spektrometri (MALDI-MS).
Teori til elevforløb på Institut for Biokemi og Molekylærbiologi på Syddansk Universitet: Protein identifikation ved hjælp af Matrix- Assisted Laser Desorption Masse Spektrometri (MALDI-MS). Peter Windfeldt
Læs mereVEROCYTOTOKSIN-PRODUCERENDE BAKTERIOFAGER I E. COLI
VEROCYTOTOKSIN-PRODUCERENDE BAKTERIOFAGER I E. COLI Specialeprojekt i Biologi-bioteknologi, KU Patricia Espenhain Sørensen 13. juni 2017 RATIONALE Verocytotoxin-producerende E. coli (VTEC) / (STEC) - Vigtig
Læs mereNDRG2 s Interaction with Api5
Naturvidenskabeligt Basisstudium Roskilde Universitet 2. semesterprojekt Juni 2012 Hus 13.1 NDRG2 s Interaction with Api5 NDRG2 s interaktion med Api5 Gruppe 12: Freya Armstrong Annaleigh Ohrt Fehler Cecilie
Læs mereIdentifikation af CYP2B6 Sekvensvarianter ved Brug af Restriktions analyse
Identifikation af CYP2B6 Sekvensvarianter ved Brug af Restriktions analyse Udarbejdet af: Susan Nørmann Andersen projektperiode: April 2009 Juni 2009 Projekttype: bachelorprojekt Vejledere: Henrik B Rasmussen
Læs mereNOD2 ekspression i tarmepitelceller
Roskilde Universitet, Den Naturvidenskabelige Bacheloruddannelse, Hus nr. 14 NOD2 ekspression i tarmepitelceller 2. semesterprojekt - forår 2015 Gruppe 6: Joachim Wittrup Højris Jensen Nicholas Philip
Læs mereMILJØ DNA FRA EN MIKROBIOLOG S SYNSPUNKT
MILJØ DNA FRA EN MIKROBIOLOG S SYNSPUNKT Lars Hestbjerg Hansen, Head of section EMBI @ENVS DCE 1 I dag: Hvad er e-dnas rolle generelt og i mikrobiologien? Hvad kan vi gøre? Hvordan gør vi? Spørgsmål &
Læs mereSlutrapport. Titel DNA-markører til forældreudvalg
Slutrapport Titel DNA-markører til forældreudvalg Projektansvarlig og deltagere Projektansvarlig: Hanne Grethe Kirk, Landbrugets Kartoffelfond (LKF), Grindstedvej 55, DK-7184 Vandel, tlf. +45 7588 5533,
Læs mereAugust 2016 Outbreak Copyright: Lise Junker Nielsen & Allan Haurballe. Foto og illustrationer: Colourbox Kontakt:
OutBreak 1 August 2016 Outbreak Copyright: Lise Junker Nielsen & Allan Haurballe. Foto og illustrationer: Colourbox Kontakt: lisej@bmb.sdu.dk Undervisningsforløbet og tilhørende forsøg udføres på eget
Læs meretdp 12-7Z (12) PATENTSKRIFT
(19) DANMARK DK 173629 B1 tdp 12-7Z (12) PATENTSKRIFT Patent- og Varemærkestyrelsen (51) Int.C1 7.: C 07 K 141315 A 61 K 39/09 C 12 N 15/31 (21) Patentansøgning nr: PA 1991 01155 (22) Indleveringsdag:
Læs mereProteiners byggesten er aminosyrer
PTEIE G EZYME Proteiners byggesten er aminosyrer Lad os se på den kemiske opbygning af et protein. Proteiner er store molekyler der er opbygget af mindre molekyler, som man kalder aminosyrer. Der findes
Læs mereKRIMINALDETEKTIVEN GERNINGSSTEDETS GÅDE PCR
KRIMINALDETEKTIVEN GERNINGSSTEDETS GÅDE Elevvejledning PCR PCR trin for trin PCR involverer en række gentagne cykler, der hver består af følgende tre trin: Denaturering, primer påsætning og forlængelse
Læs mereNext Generation Sequencing
Next Generation Sequencing For 60 år siden blev DNA opdaget. I øjeblikket afprøver vi NGS, og til sommer kører vi BRCA-gener med den nye metode I år er det 60 år siden, at DNA s struktur blev erkendt,
Læs mereLivets molekylære kode
4. ÅR R. 2 / 2006 Livets molekylære kode -kemi og biologi mødes D livets molekylære kode D findes i alle levende organismer og indeholder koden til organismen informationer, der afgør om organismen er
Læs mere27611 Eksamen Sommer 2007
- Side 1 af 10-27611 Eksamen Sommer 2007 Dette sæt indeholder 4 opgaver. En online version af opgavesættet vil være tilgængeligt fra kursets lektionsplan, under selve eksamen (25. Maj 2007 klokken 9:00
Læs mereDNA origami øvelse DNA origami øvelse
DNA origami øvelse Introduktion I denne øvelse bruger vi DNA origami teknikken til at samle en tavle af DNA med dimensioner på 70 nm x 100 nm. Tavlen dannes af et langt enkeltstrenget DNA molekyle, der
Læs mereReplikation af Vibrio cholerae kromosom II origin, oricii Vc
Replikation af Vibrio cholerae kromosom II origin, oricii Vc [Replication of Vibrio cholerae chromosome II origin, oricii Vc ] Molekylærbiologisk bachelormodulprojekt Roskilde Universitet Efteråret 2009
Læs mereElevvejledning pglo transformation
Introduktion til transformation Elevvejledning pglo transformation I denne øvelse skal du lære fremgangsmåden ved genetisk transformation. Husk på, at et gen er et stykke DNA, der indeholder informationer
Læs mereStabile kloningsvektorer til Vibrio cholerae
Stabile kloningsvektorer til Vibrio cholerae Nat-bas, 2. semester, Forår 2005 Hus 13.2, Gruppe 2: Malene Cohen Henrik Jakobsen Marie Borgvold Larsen Maria Haugaard Rasmussen Nanna Bernstorf Schrøder Vejleder:
Læs mereSide 1 of 12. Kursus navn: Kursus nr Introduktion til Bioinformatik
Side 1 of 12 Danmarks Tekniske Universitet Skriftlig prøve, den 22/1-2015 Kursus navn: Kursus nr. 27633 Introduktion til Bioinformatik Tilladte hjælpemidler: Alle "Vægtning" Angivet ved de individuelle
Læs mere27611 Eksamen Sommer 2008
27611 Eksamen Sommer 2008 Dette sæt indeholder 10 opgaver. En online version af opgavesættet vil være tilgængeligt fra kursets lektionsplan under selve eksamen ( juni 2008 klokken 15:00-19:00). DNA/Protein
Læs mere(19) DANMARK (11) DK 175533 B1 ( 1 2) PATENTSKRIFT. Patent- og Varemærkestyrelsen
(19) DANMARK (11) DK 175533 B1 ( 1 2) PATENTSKRIFT Patent- og Varemærkestyrelsen (51) Int.C1 7.: A 61 K 39/295 A 61 K 39/205 A 61 K 39/285 A 61 K 39/42 C 12 N 15/00 (21) Patentansøgning nr: PA 1985 06062
Læs mereVi går derfor ud fra, at I ved, at DNA molekyler er meget lange molekyler
DNA-profil analyse Indledning DNA-profil analyser eller i daglig tale DNA-fingeraftryk er en metode, der bruges, når man skal finde ud af, hvem der er far et barn, hvis der altså er flere muligheder. Det
Læs mere